Universidad Autónoma de Guerrero

Facultad de Ciencias Químicas Biológicas

Programa Educativo de Biotecnología

PROYECTO DE CIENCIAS ÓMICAS

Lipidómica

Estudiantes:
Gaytán Serna Elissa, Hernandez Ortega Jhonatan, Leyva Mateos Karla Michelle,
Pérez Bacho Danna Isabel, Rodríguez Romero Angel

Dra. Eduardo Castañeda Saucedo

Lugar y fecha: Chilpancingo de los Bravo, 7de Junio de 2023.

 Lipidómica
Introducción
Los lípidos son un grupo diverso de moléculas orgánicas importantes que
desempeñan múltiples funciones en los procesos biológicos. Además de su papel
en el almacenamiento de energía, los lípidos son componentes cruciales de las
membranas celulares y actúan como reguladores y señalizadores en diversas vías
biológicas (Ahmed et al, 2023). La lipidómica es una rama de las ciencias ómicas
que se enfoca en el análisis y la cuantificación exhaustiva de los lípidos en los
sistemas biológicos. Utilizando técnicas analíticas avanzadas como la
espectrometría de masas y la cromatografía, la lipidómica permite a los
investigadores comprender la composición, estructura, metabolismo e
interacciones de los lípidos en células, tejidos y organismos (Ochoa 2006).
Debido a esto, el artículo “Principles and practice of lipidomics” proporciona una
introducción a las estrategias metodológicas utilizadas en la lipidómica,
centrándose en técnicas basadas en espectrometría de masas. También aborda el
procesamiento y análisis de datos, que es una parte importante del flujo de trabajo
en dicha rama. Se destaca que la lipidómica es un campo multidisciplinario que
requiere la colaboración de diversos especialistas para lograr avances
significativos, incluidos médicos, técnicos, químicos analíticos, bioinformáticos y
bioquímicos clínicos (Vaz et al, 2014). Con estos hallazgos que nos ofrece la
lipidómica, los investigadores buscan comprender los perfiles y la dinámica de los
lípidos en diferentes muestras biológicas y explorar alteraciones en esos perfiles
en condiciones como trastornos metabólicos, enfermedades neurodegenerativas,
enfermedades cardiovasculares y cáncer. Esto proporciona información clave para
el descubrimiento de fármacos y el diseño de estrategias de tratamiento
personalizado (Ahluwalia et al, 2022).

Desarrollo
El experimento de lipidómica tiene una serie de pasos desde el diseño
experimental, con el objetivo de comprender la composición lipídica y su función
en los sistemas biológicos. Cada paso requiere una cuidadosa planificación y
ejecución para garantizar resultados confiables y significativos. Es necesario
considerar y controlar diversos factores que pueden influir en los resultados, como
la variabilidad técnica y biológica, y la calidad de los datos obtenidos. Además, la
utilización de enfoques bioinformáticos adecuados es fundamental para visualizar
y analizar los datos de lipidómica de manera efectiva.

Para realizar la categoría de los lípidos nos basaremos en el “mapa de los lípidos”
el cual los clasifica en: ácidos grasos, glicerolipidos, glicerofosfolipidos, lípidos de
esteroles, lípidos de prenol, sacarolipidos y policetidos. Todos los lípidos se
subdividen en categorías principales y su rol biológico; los ácidos grasos están
clasificados en ácidos grasos y sus conjugados (ácidos grasos insaturados y
ácidos grasos epoxidicos) su función en el organismo es que son la fuente
principal de energía. Por otro lado, los glicerolipidos están subdivididos en
monoradilgliceroles y monoalquigliceroles; su rol principal en los organismos es
que son los mensajeros en la transducción de señales. Los glicerofosfolipidos se
subdividen en glicerofosfoinositoles y glicerofosfatos; son el mayor componente de
las bio-membranas. Los lípidos de estroles están clasificados en esterol
(colesterol y sus derivados) esteroides y ácidos biliares, su función principal es la
señalización y componer parte de las bio-membranas.
Los lípidos de prenol son producidos vía ácido mevalonico y se subdividen en
isoprenoides, quinones e hidroquinoides, son precursores principales en lípidos
esteroles y funcionan como anclajes en las membranas de las proteínas. Para
finalizar los sacarolipidos describen compuestos en los cuales los ácidos grasos
están enlazados a un esqueleto de azúcar y están subdivididos en
acilaminoazucares (mono, di, triacilaminoazucares) y estos lípidos funcionan en
donde el esqueleto de glicerol se ha sustituido por un azúcar.

El experimento de lipidómica comienza con el diseño experimental, donde se

establece la pregunta biológica que se desea responder, considerando el control
de variables no deseadas, como el bloqueo de muestras. Procede a la recolección
de muestras, donde se selecciona el tipo de tejido o muestra biológica relevante y
se recopilan siguiendo un protocolo estandarizado. Las muestras recolectadas se
someten a procesos de extracción de lípidos, que pueden incluir extracción
líquido-líquido o extracción en fase sólida, dependiendo del tipo de lípidos que se
deseen analizar. La adquisición de datos por medio de las técnicas de
espectrometría de masas permite identificar y cuantificar los lípidos presentes en
la muestra por medio de la medición de masas y cargas. Una vez obteniendo los
datos, se aplican las técnicas de preprocesamiento, como la corrección de
isótopos, normalización de los datos, permitiendo obtener la lista de lípidos
detectados y sus niveles de abundancia. Finalmente llevando al análisis de datos
donde se utilizan enfoques estadísticos y bioinformáticos para comparar las
muestras y realizar interpretaciones biológicas. El análisis estadístico puede incluir
pruebas de hipótesis y análisis multivariados. Además, se pueden utilizar
herramientas bioinformáticas para asignar identidades a los lípidos detectados y
explorar las vías metabólicas y las redes biológicas asociadas.

El análisis de los datos arrojados posterior a la secuenciación de lípidos resulta

difícil de manejar debido a que existe una diversidad de variables que podrían ser
objeto de análisis, si bien establece de primera instancia lo que se va analizar es
primordial, los lípidos están involucrados tantas reacciones metabólicas que
resulta difícil enfocarse en solo una de sus funciones , además de que es
importante señalar que la concentración de muestra es determinante para su
análisis, por lo que se recomienda realizar experimentos piloto, y si el experimento
consta de un gran número de muestras es importante incluir muestras que sirvan
como control de la calidad (de la demás muestras) en el estudio.
Es importante señalar que la secuenciación del liposoma se debe en gran medida
a los espectrómetros de masa de alta resolución, que permiten discriminar entre
lípidos con estructura y masa similares además de ser capaces de identificar
especies isoméricas e isobáricas
Si bien para la estandarización de la identificación de los lípidos se ha hecho
grandes avances, las bases de datos aun no utilizan secuenciaciones de lípidos
encontrados de manera natural, mas bien crean una versión análoga que
cuantifica las respuestas iónicas de los lípidos.

Referencias

Ahluwalia K., Ebright B., Chow K., Dave P., Mead A., Poblete R., Louie S.G.,
Asante I. (2022) Lipidomics in Understanding Pathophysiology and Pharmacologic
Effects in Inflammatory Diseases: Considerations for Drug Development.
Metabolites. 12(4):333. doi: 10.3390/metabo12040333. PMID: 35448520; PMCID:
PMC9030008.

Ahmed S., Shah P., Ahmed O. (2023) Bioquímica, Lípidos. StatPearls

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK525952/

Ochoa B. (2006) La lipidómica, una nueva herramienta al servicio de la salud.

Gaceta Médica de Bilbao. 103(3) DOI: 10.1016/S0304-4858(06)74534-6

Vaz F., Pras-Raves M., Bootsma A., Kampen A. (2014). Principles and practice of
lipidomics. Journal of inherited metabolic disease. 38. 10.1007/s10545-014-9792-
6.