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LABORATORIO DE GENÉTICA
PRÁCTICA N° 1
TEMA: Técnicas e instrumentos en diagnóstico genético
-Una vez que se ha pesado la agarosa, colocar en un matraz Erlenmeyer junto con los
___ml de buffer
-Calentar en el microondas con intervalos de 10seg hasta que la agarosa se haya
diluido completamente
-Se necesitan 6ul de bromuro de etidio por cada 120ml de buffer, calcule el volumen
de bromuro que se debe añadir en este caso
Preparación de la bandeja
Preparación de cámara
-La cámara debe ser llenada completamente con buffer 1X
-Se retira el mastkin y los peines de la bandeja con el gel ya solido y se coloca en la
cámara de electrforesis
Pre-requisitos teórico
Las técnicas que están disponibles en un momento dado determinan aquello que
podemos conocer, y en ese sentido nuestro conocimiento es contingente de la
disponibilidad de dichas técnicas: conocemos en un sentido fuerte aquello que
podemos "observar" directamente. La Genética clásica infiere las propiedades del
material hereditario, pero no es hasta que se aplican las técnicas moleculares que se
puede determinar finalmente la composición y propiedades químicas de ese
material. Los nuevos desarrollos técnicos facilitan la adquisición de información
previamente inaccesible. El acceso a la secuencia de DNA, por ejemplo, ha generado
una información cualitativamente nueva y exenta de las limitaciones de otras
aproximaciones. Pero el desarrollo de las técnicas moleculares no ha significado una
eliminación de las otras técnicas genéticas. De hecho se ha producido una auténtica
integración de técnicas que permiten integrar, a su vez, los diferentes niveles de lo
genético. La genética del desarrollo o la genética de poblaciones son claros ejemplos
de integración de técnicas de análisis genético con técnicas moleculares. Fue la
integración de los estudios de cruces y la citología la que condujo, a principios de
siglo, a la teoría cromosómica de la herencia
TERAPIA GÉNICA
Las aplicaciones de terapia génica en genética médica son complejas y ese hecho se
debe fundamentalmente a dos causas. La primera se debe a las características de la
especialidad misma. Los cuadros que estudiamos en genética médica son muy
heterogéneos y de expresión temprana en la mayoría de los casos. La patología
genética podemos dividirla en tres grandes grupos.
Las siguientes son las razones más comunes por las que los pacientes acuden a los
servicios de genética:
Técnicas actuales
Una "línea" de ADN bien definida en un gel se llama banda. Cada banda contiene un
gran número de fragmentos de ADN del mismo tamaño que han viajado juntos a la
misma posición. Un fragmento único de ADN (o incluso un pequeño grupo de
fragmentos de ADN) no sería visible por sí mismo en un gel.
Al comparar una banda en una muestra con el marcador de peso molecular,
podemos determinar su tamaño aproximado.
3. PCR en tiempo real
La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en tiempo real es la capacidad de
monitorear el progreso de la PCR a medida que ocurre (es decir, en tiempo real). Por
lo tanto, los datos se recopilan durante todo el proceso de PCR, en lugar de al final
de la PCR. Esto revoluciona por completo la forma en que uno aborda la
cuantificación basada en PCR de ADN y ARN. En la PCR en tiempo real (qPCR), las
reacciones se caracterizan por el punto en el tiempo durante el ciclo cuando se
detecta por primera vez la amplificación de un objetivo en lugar de la cantidad de
objetivo acumulada después de un número fijo de ciclos. Esto se logra incorporando
una molécula fluorescente que se asocia al ADN amplificado, donde el incremento
de esta fluorescencia es la proporcional al incremento de la cantidad de moléculas
de ADN amplificadas en la reacción.
Para la amplificación por PCR en tiempo real además de los reactivos que se
emplean en la PCR punto final, es necesario emplear un fluoróforo. Los fluoróforos
utilizados para seguir la amplificación del ADN durante la PCR en tiempo real pueden
ser de dos tipos: a) fluoróforos con afinidad por el ADN y b) sondas específicas para
fragmentos del ADN, es decir, que sólo emiten fluorescencia cuando se ha
amplificado un fragmento del ADN de interés
5. Micromatrices
POST REQUISITOS
6. Secuenciación
Sanger
1. Preparación de la biblioteca
2. Generación de clusters
3. Secuenciación
4. Análisis de datos
Referencias
Pei Yun Lee, John Costumbrado, and Yong Hoon Kim (2012). Agarose Gel
Electrophoresis for the Separation of DNA Fragments
EJERCICIO 1 (3ptos)
EJERCICIO 1 (4pts)
Utilice el grafico para colocar el peso de las bandas en la columna correspondiente de la tabla
Muestr MIRU2 MIRU4 MIRU MIRU16 MIRU2 MIRU23 MIRU2 MIRU26 MIRU27 MIRU3 MIRU39 MIRU 40
a 10 0 4 1
Peso bp
1 pto
_________________________________________________________________________________________
EJERCICIO 2 (2ptos)
……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………
Señale las bandas que se comparten entre el padre y el niño. Seleccione quién es positivo para la prueba
de paternidad?
……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………
Señale las bandas que se comparten entre la victima, la evidencia y los sospechosos. Quién es el culpable
en la escena del crimen: sospechoso 1 o 2?
……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………
EJERCICIO 3 (1pto)
EJERCICIO 4 (1pt)
INFORME GENETICO
PACIENTE 1:
Se encontró 51 Mb de material genético con variaciones en el número de copias cromosómicas (normal: dos
copias). Se evidencian alteraciones como ganancia y perdida de material genético de tamaño inferior a una
megabase.
Atentamente,
PACIENTE2:
Se encontró 50 Mb de material genético con variaciones en el número de copias cromosómicas (normal: dos
copias). Se evidencian alteraciones como ganancia y perdida de material genético de tamaño inferior a una
megabase.
RESUMEN:
arr(3p12.2,3q22.2,4p15.1,6p22.3,7q11.22,11p11.2,12q15,17q21.2,Xp11.4,Xp11.22,Xq11.1,Xq13.2,Xq22.3)x
2 hmz,arr(3p25.2)x3,(6p21.33)x1,(10q26.3)x3,(14q32.33)x3
Atentamente,
PACIENTE3:
Se encontró 86 Mb de material genético con variaciones en el número de copias cromosómicas (normal: dos
copias). Del resultado cabe resaltar la ganancia de 3p25.3 y sobre todo de 9p24.3 que se interpretaría como
una trisomía parcial del brazo corto del cromosoma 9 lo que explica el fenotipo que presenta la paciente.
RESUMEN: arr(1q25.1,3p12.2,3p11.2,7q21.3,9p21.3,12q11,12q12,14q21.2,20q11.21,Xq23,Xq27.3)x2
hmz,arr(3p25.2)x3,(7p14.1)x1,(9p24.3)x3,(14q11.2)x1,(14q32.3)x3,(Xq26.3)x4
Atentamente,
De los 3 informes presentados, qué paciente posee más variación en el número de copias y por lo tanto má
s anomalías por qué?
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…
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EJERCICIO 5 (2ptos)
Enumerar las bandas que se observan con su respectivo peso. Confirme los pesos de HPV 16, 61 y la
coinfección.
Ejemplo HPV