¿ESTAMOS DETECTANDO SARS-CoV-2 EN AGUAS RESIDUALES POR ENCIMA DE NUESTRAS POSIBILIDADES?

Salamanca como caso de estudio

Ángel Emilio. Martínez de Alba1, María Eugenia Morán-Diez1, Juan Carlos García-Prieto2, Juan García-Bernalt Diego3, Pedro Fernández-Soto3, Esteban Serrano León4, Victor
Monsalvo García4, Marta Casao Maestre4, María Belén Rubio1, Rosa Hermosa1, Antonio Muro4, Manuel García-Roig2 y Enrique Monte1
1Instituto
de Investigación en Agrobiotecnología (CIALE), Departamento de Microbiología y Genética, Universidad de Salamanca, Villamayor, Salamanca, España. 2Centro de Investigación y Desarrollo Tecnológico del Agua
(CIDTA), Universidad de Salamanca, Salamanca, España. 3Grupo de investigación en enfermedades infecciosas y tropicales (e-INTRO), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca-Centro de Investigación de
Enfermedades Tropicales de la Universidad de Salamanca (IBSAL-CIETUS), Facultad de Farmacia, Universidad de Salamanca, Salamanca, España. 4Aqualia, 11130 Chiclana de la Frontera, Cádiz, España.

Marcadores reflejo de la actividad humana están presentes en las aguas residuales y su monitoreo es una herramienta útil para determinar la presencia de
enfermedades infecciosas en una población. Su análisis en busca de la presencia del RNA de SARS-CoV-2 podría ser una buena aproximación para su cuantificación en
una población con el fin de generar información que guíe a los expertos a la hora de implementar pautas de control de la actual pandemia. Se han publicado numerosos
estudios centrados en proporcionar herramientas fiables y robustas para detectar, predecir y prevenir brotes de SARS-CoV-2, pero ¿realmente lo son?

OBJETIVOS
1. Evaluar la fiabilidad, solidez de los límites de detección y especificidad de los protocolos de detección de SARS-CoV-2 actualmente utilizados en aguas residuales.
2. Valorar la eficacia y posible implementación en una población como Salamanca.

MATERIALES Y MÉTODOS RESULTADOS Y DISCUSIÓN

Se recogieron un total de 27 muestras de aguas residuales en la estación depuradora
de Salamanca y en 6 estaciones de bombeo de su área metropolitana. Se llevó a cabo
un análisis bacteriológico y, previamente a la extracción de RNA, se realizó una
concentración química de las muestras para la absorción de trazas virales.
Las curvas de calibración generadas a partir de un RNA de SARS-CoV-2 sintético
han permitido examinar las limitaciones de las técnicas para el cribado masivo. Los
resultados muestran que por debajo de 10 copias/𝜇𝜇L el porcentaje de artefactos
puede llegar al 100%. Estos valores pueden variar dependiendo de la región del
genoma del virus utilizada como diana de amplificación.

Teniendo en cuenta estas limitaciones, el análisis de las muestras confirmó la

La detección y la cuantificación del RNA genómico del SARS-CoV-2 se realizó presencia del virus en todas ellas. Además, los valores de su cuantificación
mediante RT-qPCR y/o RT-LAMP. mostraron una tendencia similar al perfil generado por los casos clínicos
notificados por la autoridad.

CONCLUSIONES
Si bien la presencia o ausencia del virus puede determinarse eficazmente, su cuantificación puede verse comprometida cuando la concentración del virus es demasiado
baja. Se cuestiona dónde está el límite para una estimación precisa de las copias de RNA genómico viral y de su cuantificación.

Financiación: Junta de Castilla y León. Proyectos SA270P18 y SA094P20. Cofinanciación con Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) “Una manera de hacer Europa”. Consejería de Educación de la Junta de Castilla y
León (COV20EDU/00657). Contrato predoctoral cofinanciado por Universidad de Salamanca y Banco Santander.