15/9/22, 13:55 Análisis integrativo de la red miRNA-mRNA en la retinopatía de gran altitud mediante análisis bioinformático - MindMeister Mapa Mental

Análisis integra… Actualiza Ahora Invitar

Mal agudo de montaña AMS

entidad clinica del mal agudo de

incluye Edema pulmonar de altura HAPE
altura AAI

Edema cerebral de altura HACE

Causada por incapacidad de

adaptarse a la deficiencia aguda a grandes alturas
de oxigeno

Fuga de los vasos retinianos

perifericos

Hemorragias retinianas
INTRODUCCION Retinopatia de Altura HAR
Manifiesta principalmente
Vasos retinianos tortuosos

Encontró correlación Edema del disco optico

estadísticamente significativa entre
HAR y HACE
Edema macular

miARN pueden regular muchos BP

Incidencia 79% en aumento

biomarcadores candidatos de HAR 8 genes centrales

Patogenia no esta clara

Regulo significativamente los

FOS en situaciones de gran altitud
cultivos en hipoxia
hipoxia es la razón principal del
Estudios actuales
cambio fisiopatológico ACE, EDN1, ACYP2, RTEL1 y
Reducir el daño tisular y promover Genes relacionados
VEGF
tolerancia inmunitaria HAR manifestación ocular de AAI DISCUSION
IL10

Sirve como biomarcador en HAR Expresión de miARN GSE90500

Se obtuvieron de la base de datos
GEO
en condiciones de hipoxia a gran Causada por trastorno de Hemorragias retinianas a gran Expresión de ARNm GSE75665
altura microcirculacion retiniana altura y fuga vascular
Fuente de datos
Plataforma de GPL18058 Datos de RNA-seq de GSE905000
en explorar los DE-miRNA y DEG
de HAR
1 ESTUDIO Datos de micromatrices de
Plataforma GPL11154
GSE75665
Análisis bioinformáticos integrales Establecer la red miRNA-mRNA

Identificar miARN expresado

Estudio identifico Conclusión Identificacion del miARN diferencialmente entre AMS y ni
expresado diferencialmente y del Utilizo herramienta en linea GEO2R muestras de sangre AMS
Análisis integrativo de la
ARNm expresado diferencialmente
271 regulados al alza red miRNA-mRNA en la Valor P<0.01
Expresaron diferencialmente entre
los grupos AMS y no AMS
retinopatía de gran
535 regulados a la baja DE-ARNm altitud mediante análisis TargetScan
Identificacion del DE-mRNA y el
Total 807 genes
DE-miRNA bioinformático
8 regulados al alza Utilizo 3 herramientas de
Predecir los mRNA objetivo de DE-miRNA miRDB
16 DE-miRNA Herramienta en linea GEO2R prediccion
8 regulados a la baja La prediccion de genes diana DE-miRNA
DIANA-microT

122 DE 5652 Objetivos DE-miRNA

regulados al alza Construyo la red reguladora
Software Cytoscape
miRNA-mRNA

37 de 9857 Objetivos DE-miRNA

regulados a la baja Construcción de la red de Grados de conectividad se
Métodos estadísticos de red
interacción proteína - proteína calcularon
Red miARN-ARNm
Elimino 1 duplicado RESULTADOS
Adquirieron de Cell Systems
Corporations
196 pares miARN-ARNm al alza
MATERIALES Y METODOS
240 pares de miARN-ARNm
Red reguladora miARN-ARNm Suero bovino fetal al 20%
44 pares de miARN-ARNm a la entotal
baja
FSF basico 3ng/ml

Contiene 59 nodos y 99 Cultivaron en medio M199

interacciones Heparina 10 unidades/ml
Red PPI de los DEG objetivo

8 genes centrales Estreptomicina/peinicila al 1% a

37°C
Células endoteliales
Establecimiento del modelo de
9 DE-miRNA al alza microvasculares de la retina
Validación de genes hub en celda HAR Gases anaeróbicos 94%
humana HRMEC
modelos de células HAR
8 genes centrales para qRT-PCR
5% CO2
Modelo de hipoxia Cultivo celular En camara de modelo de hipoxia
1% O2

Durante 12h

95% de aire
Grupos de control Cultivaron
5% CO2

Mapa Mental
PCR cuantitativa en tiempo real Utilizo reactivo TRIzol Extraer ARN total

Analizaron prueba t de Student de

dos colas
Análisis estadístico Resultados
P < 0.05 mostraba una diferencia
estadística

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