TEMA 1. INTRODUCCIÓN.

ESTUDIO SISTEMÁTICO DE LAS

BACTERIAS

1. Taxonomía bacteriana
El estudio sistemático de las bacterias no es más que la descripción de grupos de bacterias en un
orden lógico basándose en la taxonomía. La taxonomía es la ciencia de clasificación biológica, que
comprende tres partes independientes pero relacionadas:

· Identificación. Trata de determinar a qué taxón

pertenece un aislado particular1. Este es el lado práctico TAXONOMÍA DE ESPECIE
de la taxonomía; es un conjunto de técnicas. (Nombre latinizado y en cursiva)

1º: en mayúscula y representa el

· Clasificación. Es la ordenación de los seres vivos en
género.
grupos o taxones en función de semejanzas o parentesco
evolutivo. 2º: en minúscula y es el epíteto de
la especie.
· Nomenclatura. Se les asigna nombres a los grupos
taxonómicos de acuerdo con normas establecidas y al
sistema binomial.

1
Se pretende caracterizar el aislado.
2. Esquema de los cinco reinos de Whittaker (1969)
El sistema de los 5 Reinos de Whittaker no es un esquema filogenético, pero ha sido el sistema de
clasificación más aceptado de las últimas décadas. Este se ordena según las semejanzas
estructurales, y sigue al menos 3 criterios:

· Tipo celular: procariotas o eucariotas.

· Nivel de organización: unicelular o multicelular.

· Tipo nutricional: fotoautótrofos, heterótrofos (por

ingestión o absorción).

El Reino Monera se encuentra en la base de este esquema y se

trata de seres vivos con las siguientes características:
- Células procariotas
- Unicelulares
- Nutrición por absorción (fotosíntesis o quimiosíntesis)
- Reproducción asexual
- Pueden ser móviles o inmóviles

3. Relojes o cronómetros moleculares2

Las secuencias de ácidos nucleicos y proteínas van cambiando a lo largo del tiempo y por ello
pueden funcionar como relojes evolutivos. Un reloj molecular asume las siguientes premisas:

- Los cambios en la secuencia de nucleótidos se acumulan de forma proporcional al tiempo

transcurrido.

- Dichos cambios, por lo general, son neutrales y no interfieren con la función génica.

- Estos cambios suceden al azar.

SECUENCIAS DE MACROMOLÉCULAS PARA DETERMINAR

RELACIONES FILOGENÉTICAS
E. Zuckerkandl y L. Pauling (1962-65)
“La cantidad de diferencias en la secuencia de aminoácidos de la
Hemoglobina entre linajes diferentes encaja con la tasa evolutiva basada en
la evidencia fósil.”
Conclusión: la distancia evolutiva entre 2 organismos puede determinarse
por diferencias en las secuencias de macromoléculas homólogas.

3.1. Características de un buen reloj molecular

 La molécula debe estar universalmente distribuida.
 Ha de poseer constancia funcional.
 Altamente conservada (la tasa de cambio lenta permite detectar relaciones evolutivas
lejanas).
 Longitud de la secuencia suficiente para que refleje verdaderas relaciones evolutivas.

2
La hemoglobina o citocromo C no son universales y cambian en tiempos cortos; no es un buen marcador.
4. ARNr 16S
 Buen reloj molecular
 Universalmente distribuida
 Constancia funcional: siempre ha servido para lo mismo a lo
largo de la historia de la evolución
 Altamente conservado: las regiones que varían son las que
tienen estructuras secundarias
 Longitud de la secuencia suficiente para reflejar verdaderas
relaciones evolutivas
 Para secuencias de identidad: separa los dominios en grupos, géneros u especies
 Estructura primaria
- Muy conservada
- Variable
 Estructura secundaria
- Similar en todos los organismos
- Acotada por su función en la síntesis de proteínas (función ancestral)

5. Tinciones filogenéticas

5.1. Técnica FISH (Fluorescence In Situ Hibridation)

Sirve para hacer tinciones filogenéticas. Consiste en añadir un fluoróforo. Se obtiene un trozo de
ADN con secuencia complementaria al 16S de E.Coli (por ejemplo).
Sirve para bacterias imposibles de cultivar en laboratorio y distinguir bacterias en mezclas
bacterianas.
6. Árbol filogenético universal
En 1977, Woese descubre las Arqueobacterias gracias a las secuencias del ARNr 16S, en concreto,
a un catálogo de oligonucleótidos del ARNr 16S.

Es por esto por lo que, en 1990, Woese y sus colaboradores proponen 3 Dominios para clasificar a
los seres vivos: 2 procarióticos y 1 eucarióticos.

Un domino es una definición que engloba taxones en

un rango más alto, es decir, está por encima de un reino.

· 2 dominios. De organismos Procariotas

· 1 dominio. Llamado Eukarya (plantas, animales,

hongos y protistas)

(*)
En 1987, Woese presentó la primera clasificación filogenética de los Procariotas

7. Dominio Bacteria
 Hay 80 filos aprox.
 Muchos filos muy pequeños o definidos únicamente por secuencias (ambientales)
 Hay unos 35 filos cultivados
 Casi el 90% de las Bacterias está representado en 4 filos
 Algunos linajes ya están identificados fenotípicamente (ej: espiroquetas y cianobacterias)
 Mayoría de filos sin coherencia fenotípica
- Proteobacterias: son una mezcla de fisiologías, y casi todas están conocidas
 Los orgánulos Eucarióticos se originaron a partir del dominio Bacteria
- Las mitocondrias surgieron de Proteobacterias; ancestro de las Rickettsias
- Los cloroplastos se originaron a partir de las Cianobacterias3

3
Ambos con fotosíntesis oxigénica.
8. Dominio Archaea
 Mayoría extremófilos (termófilos, halófilos o metanógenas)
 Crenarcheota (Thermoproteus + Pyrodictium + Pyrolobus)  Hipertermófilos
- Ramas cortas
- Cerca de la raíz
 Euryarchaeota  Metanógenas + Halófilos extremos + Acidófilos + Hipertermófilos
 Nuevos linajes, más recientes

9. Características de los tres dominios

- La pared de Archaea no contienen peptidoglicano; pueden tener pseudomureína, compuesta por

ácido N-acetil-talosaminúrico, pero nunca por ácido murámico.
- Los Eukarya tienen una pared de celulosa o quitina.