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zoylavaca
Bioquímica
1º Grado en Veterinaria
Facultad de Veterinaria
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Zoyla Vaca del Campo
BLOQUE I
BIOQUÍMICA
ESTRUCTURAL
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Zoyla Vaca del Campo
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Zoyla Vaca del Campo
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
1 INTRODUCCIÓN
La célula es la unidad básica de la vida. Es el elemento de menor tamaño que puede considerarse
vivo. Está constituida por una membrana plasmática, citoplasma y orgánulos (en la célula
eucariota).
Primarios: C, O, H, N, Ca y P
Secundarios: Cl, S, K, Na y Mg
Oligoelementos: Fe, Cu, Zn, I, Mn, Cr, Zr…
El método de Lewis permite explicar de forma simple algunos enlaces; postula que los elementos
que se sitúan próximos a los gases nobles tienen tendencia a captar, ceder o compartir electrones
hasta completar los ocho electrones que caracterizan a los gases nobles.
Según esta regla del octeto, los átomos son más estables cuando consiguen ocho electrones en la
capa de valencia – sean pares solitarios o compartidos – mediante un enlace covalente.
Hay algunas excepciones. El hidrógeno tiene un solo electrón en su capa de valencia, la cual
puede aceptar como máximo dos electrones; por eso, sólo puede compartir su electrón con un
átomo formando un único enlace. Por otra parte, los átomos no metálicos a partir del tercer periodo
pueden formar “octetos expandidos”; es decir, pueden contener más de ocho electrones en su capa
de valencia, por lo general, colocando los electrones extra en subniveles.
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Las biomoléculas están formadas por cadenas hidrocarbonadas con uno o varios grupos
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La presencia de grupos funcionales en las biomoléculas proporciona sitios reactivos, donde dichas
moléculas van a unirse a otras o a reaccionar y transformarse.
Los grupos funcionales de las moléculas proveen a las enzimas de los “sitios de ataque” donde la
enzima convertirá un sustrato en un producto.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Los sitios reactivos van a portar centros nucleófilos o electrófilos:
Centros nucleófilos (atracción por el núcleo): son grupos ricos en electrones y pueden
tener carga negativa, pares de electrones no enlazantes o “pares solitarios”, o poseer una
densidad electrónica típica de dobles enlaces. Estos sitios atacarán a grupos cargados
positivamente.
Centros electrófilos (atracción por electrones): tienen por las cargas negativas, es decir,
ricas en electrones, debido a su carencia de electrones en capa de valencia.
Dado que las reacciones bioquímicas tienen lugar siempre en un medio acuoso (bien el citoplasma
o el medio extracelular), este tipo de reacciones van a ser determinantes para la formación de
polímeros, es decir, de las macromoléculas como polisacáridos, lípidos, proteínas y ácidos
nucleicos.
Otro tipo de reacción característica que tiene lugar en la célula es aquella en la que se transfieren
los electrones de un sustrato a otro; son las reacciones denominadas de oxidación – reducción o
redox. La mayoría de las reacciones que tienen lugar durante el metabolismo celular implican esta
transferencia de electrones. Para ello, siempre serán necesarios dos reactivos, uno que cede
electrones y el otro que los acepta. En las moléculas biológicas esta transferencia de electrones se
realiza habitualmente en forma de átomos de hidrógeno, ya que un átomo de hidrógeno contiene
un electrón.
En las biomoléculas los procesos redox de transferencia de electrones tienen lugar en los átomos
de carbono. La forma más reducida de un átomo de carbono será la que esté saturada con cuatro
hidrógenos, como en el metano, mientras que la más oxidada será el dióxido de carbono.
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Los niveles de oxidación del carbono se pueden evaluar fácilmente contando el número de enlaces
que establece el carbono con el hidrógeno (estando más reducido) o con el oxígeno (es decir,
cuanto más reducida esté la sustancia), por lo que durante el proceso de oxidación se desprenderá
gran cantidad de energía.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
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Reservados todos los derechos.
4 LAS INTERACCIONES DÉBILES DETERMINAN LA FUNCIÓN DE
LA MOLÉCULA
Las interacciones débiles pueden ser de naturaleza electrostática o hidrofóbica. Las primeras
incluyen los puentes de hidrógeno, los puentes salinos (enlace iónico) y las fuerzas de Van der
Waals.
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electrostático (entre cargas opuestas), también denominadas puente salino.
Además, aquellos grupos funcionales que se comportan como ácidos o bases, es decir, que tengan
la capacidad de ceder un protón al medio o de captarlo, van a presentar una carga real (un electrón
de más o de menos del que le corresponde al átomo neutro), lo que los convierte en un ion. Los
iones, en solución acuosa, pueden atraerse o repelerse según la carga que porten.
Debido a que la capacidad que tiene un ácido de ceder o de captar protones depende de la
concentración de H+ que haya en la solución en la que se encuentra, los grupos ácidos o básicos
no siempre van a estar en su forma ionizada. Entre los grupos funcionales que se comportan como
Este tipo de dipolos temporales se están formando continuamente entre moléculas en solución y
no es necesario que las moléculas sean polares. Puede establecerse, por lo tanto, un dipolo
temporal en un enlace covalente no polar. Su constante movimiento y redistribución de los
electrones en la molécula produce cambios complicados y fluctuantes en su atracción o repulsión.
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tendencia de expulsar el agua de su entorno debido a su repulsión (insolubilidad) con los grupos
polares del agua.
Las interacciones hidrofóbicas son fundamentales en biología como en las membranas lipídicas.
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número de átomos de H). Como consecuencia, las biomoléculas son ricas en energía ya
que para sintetizarlas a partir de CO2 (C muy oxidado) y H2O los organismos consumen
energía que queda acumulada en el compuesto reducido.
2. Muchas biomoléculas presentan esteroisomería que puede ser ser de dos tipos:
a. Esteroisomería geométrica. Es debida a la presencia en la molécula de algún
elemento que produce rigidez, como un doble enlace.
b. Esteroisomería óptica. Esto sucede cuando en la molécula hay algún átomo de
C asimétrico, esto es, con los cuatro sustituyentes distintos. Por cada átomo de C
asimétrico presente en la molécula, existen 2 estroisómeros ópticos ó
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Las interacciones débiles que establece una molécula de agua con las de su alrededor se realizan
mediante puentes de hidrógeno. Gracias a este tipo de interacción se vana disolver muchas
moléculas biológicas en este medio.
La formación y la rotura de los puentes de los puentes de hidrógeno entre las moléculas de agua
es constante a la temperatura fisiológica (37˚C).
Los tampones son sistemas acuosos que tienden a amortifuar los cambios que se producen en el
pH cuando se añaden pequeñas cantidades de ácido (H+) o de base (OH-). Estos sistemas tampón
están constituidos por un ácido débil y su base conjugada, o bien por una base débil y su ácido
conjugado. Cuando la concentración de ambas especies es similar, entonces el sistema tiene una
gran capacidad amortiguadora.
El principal tampón biológico intracelular es el tampón fosfato, que presenta un pKa de 6,86 y,
por tanto, es capaz de resistir los cambios de pH entre 5,6 y 7,9.
H2PO4- ↔ H+ + HPO42-
El principal tampón sanguíneo es el sistema de tampón bicarbonato, compuesto por el ácido débil
carbónico y la base conjugada bicarbonato.
H2CO3 ↔ H+ + HCO3-
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6.4 ÓSMOSIS
La ósmosis es el movimiento del agua a través de una membrana semipermeable debido a una
diferencia de presión osmótica. Este es un factor muy importante en la vida de la mayoría de las
células porque la membrana plasmática es más permeable al agua que a la mayor parte del resto
de moléculas pequeñas, iones y macromoléculas.
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Aminoácidos y enlace peptídico
1 INTRODUCCIÓN
Los aminoácidos son un grupo heterogéneo de moléculas que poseen unas características
estructurales y funcionales comunes. Existen 20 aminoácidos diferentes especificados en el
código genético (Recuadro 6 – 1), aunque hay otros aminoácidos menos frecuentes que se forman
por modificaciones enzimáticas posteriores al proceso de traducción. En las células estos 20
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Además de ser las unidades estructurales de las proteínas, existen aminoácidos que son
intermediarios de ciertas rutas metabólicas, como la citrulina y la ornitina en el ciclo de la urea.
Otros son precursores de muchas sustancias biológicas que contienen nitrógeno.
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2 AMINOÁCIDOS
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Excepto en la glicina, el carbono α tienen cuatro sustituyentes distintos, por lo que es un centro
quiral. Así, los aminoácidos se pueden presentar orientados en el espacio de dos formas diferentes
que son imágenes especulares no superponibles denominadas enantiómeros.
Los aminoácidos que forman las proteínas solo pertenecen a las formas del enantiómero L, aunque
se desconoce el motivo por el que se ha elegido esta forma durante la evolución.
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CARACTERÍSTICAS DE SU CADENA LATERAL
La unión covalente de los aminoácidos para formar las proteínas hace que los grupos funcionales
amino y carboxilo de todos los aminoácidos, excepto el primero y el último, se vean modificados
debido a la formación del enlace peptídico. Por este motivo, en los polipéptidos la naturaleza
química de la cadena lateral de los aminoácidos es la que va a condicionar su solubilidad en agua,
su reactividad y el tipo de interacciones no covalentes que se pueden establecer.
Las cadenas laterales de los diferentes aminoácidos pueden ser de naturaleza hidrofóbica (apolar),
polar sin carga, o pueden presentar carga a determinados valores de pH (véase fig. 6 – 3).
Los aminoácidos polares sin carga son: Ser, Thr, Tyr, Asn y Gln. Los tres primeros tienen en
común la presencia de un grupo hidroxilo, aunque hay que destacar el carácter aromático de la
Tyr. La Ser es con frecuencia uno de los aminoácidos fundamentales en la catálisis enzimática,
debido a su actuación como reactivo nucleófilo. Gln y Asn se caracterizan por la presencia de un
grupo amida que les confiere su reactividad.
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Los aminoácidos ionizables a pH fisiológico son: Glu, Asp, Lys, Arg e His. Los dos primeros
poseen un grupo carboxilo que se encuentra ionizado en su forma aniónica a pH fisiológico (-
COO-) y los tres últimos poseen grupos funcionales con carácter básico por lo que pueden captar
protones del medio adquiriendo carga positiva. Tanto la Lys como la Arg se encuentran ionizadas
a pH fisiológico; y la His con un grupo imidazol con un pKa de 6, solo estará cargada en un cierto
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porcentaje de moléculas a este pH. Como se estudiará más adelante, también la Cys y Tyr pueden Reservados todos los derechos.
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2.3 LOS AMINOÁCIDOS PRESENTAN CARÁCTER ÁCIDO Y BÁSICO
Los aminoácidos presentan un grupo amino con carácter básico (aceptor de protones) y un grupo
carboxilo con carácter ácido (dador de protones). Como a pH fisiológico los aminoácidos se
encuentran en su forma de ion dipolar, en realidad el carácter ácido lo presenta el grupo amino
Para comprender la importancia biológica de esre carácter y sus principales consecuencias vamos
a analizar el comportamiento del aminoácido más sencillo, la Gly, cuando se realiza una curva de
titulación (Fig. 6 – 5). A un pH muy ácido ambos grupos funcionales se encuentran protonados y
la forma predominante es NH3+ - CH2 – COOH. Por lo tanto, esta molécula puede perder dos
protones, el del grupo carboxilo y el del grupo NH3+, que es ahora un ácido conjugado.
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llegar a un valor en el que la concentración de las formas NH3+ - CH2 – COOH y NH3+ - CH2 –
COO- sea igual. Si recordamos la ecuación de Henderson – Hasselbalch, este es el valor en el que
pH = pKa. En el caso de la Gly este valor es de 2,34 para el grupo carboxilo (pK1). Si se sigue
aumentando el pH llegará un momento en el que se empiecen a perder los protones del grupo
NH3+ (pK2 de 9,6 para la Gly).
Entre ambos valores habrá un valor de pH en el que al forma dominante sea el ion dipolar (NH3+
- CH2 – COO-). Este valor de pH se denomina punto isoeléctrico (pI), ya que la carga neta de la
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molécula es cero. En aminoácidos sin cadena lateral ionizable el valor del pI coincide con la media
Los aminoácidos con cadenas laterales con grupos ionizables tienen curvas de titulación más
complejas con tres valores de pKa. Los puntos isoeléctricos de los aminoácidos con un grupo
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ácido en su cadena lateral se calcularán como la media aritmética de los dos pKa de los grupos
ácidos que están implicados en los equilibrios de la molécula con carga neta cero (ion dipolar).
Por el mismo razonamiento, en el caso de los aminoácidos con cadena lateral con carácter básico,
el punto isoeléctrico se calculará como la media aritmética de los pKa de los grupos básicos
(Fig.6–6).
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2.5 MODIFICACIONES QUÍMICAS DE LOS AMINOÁCIDOS EN LAS
PROTEÍNAS
Además de los 20 aminoácidos determinados por el código genético, existen otros aminoácidos
que sufren modificaciones después de estar incorporados en la cadena polipeptídica. Estos
aminoácidos “no estándares” a veces tienen un papel biológico importante.
3 EL ENLACE PEPTÍDICO
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el átomo de H y el grupo carbonilo en el mismo lado del eje, y
trans, con ambos átomos en posiciones alternas. La posición
trans es la que se da de forma mayoritaria en las proteínas.
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Proteínas
4 NIVELES ESTRUCTURALES DE LAS PROTEÍNAS
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En las condiciones celulares, las proteínas se encuentran en
unas conformaciones limitadas que son las más estables
desde el punto de vista energético (menor energía libre de
Gibbs). Estas disposiciones espaciales, en las que son
capaces de desempeñar su función, se denominan
conformaciones nativas y manifiestan los cambios que se
producen ante la unión de determinadas moléculas.
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La asociación entre subunidades está estabilizada por fuerzas de atracción no covalentes y puede
incluir uniones disulfuro covalentes entre las distintas subunidades, como ocurre en moléculas
como las inmunoglobulinas.
Considerando los niveles de organización de las proteínas, estas se suelen clasificar en dos
grandes grupos: globulares y fibrosas. Las primeras se caracterizan por tener una forma esférica,
ser solubles en medios acuosos y presentar diferentes estructuras secundarias en una misma
molécula. Las proteínas fibrosas suelen presentar una única estructura secundaria, se disponen en
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forma de largas hebras y son insolubles en agua.
Se trata de una estructura helicoidal con un enrollamiento dextrógiro. Cada giro incluye 3,6
residuos por vuelta, lo que produce que los aminoácidos que están a una distancia de tres o cuatro
residuos se encuentren espacialmente muy cercanos, mientras que los que se encuentran a una
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distancia de dos residuos se sitúen en lados opuestos. La hélice se encuentra estabilizada por la
formación de puentes de hidrógeno intracatenarios que se forman entre un grupo carbonilo de un
enlace peptídico de un residuo n y el –NH del enlace peptídico de un residuo que ocupa la posición
n + 4. Así, todos los grupos –NH y –C=O del esqueleto peptídico, excepto el N terminal y el C
terminal, quedan unidos por este tipo de enlaces.
Los enlaces por puente de hidrógeno crean una conexión en el conjunto de la hélice que hace que
se transmita el dipolo característico del enlace peptídico a lo largo del eje longitudinal de toda la
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molécula, lo que proporciona una carga parcial positiva en el extremo amino terminal y una carga
parcial negativa en el extremo C terminal.
Las cadenas laterales de los aminoácidos se disponen hacia el exterior de la hélice evitando
interferencias estéricas con el esqueleto polipeptídico. La presencia de Pro en la α – hélice es
poco frecuente, por dos circunstancias especiales: su cadena lateral cíclica produce un
acodamiento en esta estructura que no es compatible con la hélice, y el enlace peptídico en el que
participa la Pro carece del grupo –NH para la formación del enlace de hidrógeno intracatenario.
Los aminoácidos que más aparecen en la hélice son: Ala, Leu, Glu y Met.
Un ejemplo en el que esta estructura es mayoritaria (un 75% de α hélice) se encuentra en una
proteína encargada de almacenar hierro: la ferritina.
Una proteína fibrosa con estructura de α hélice es la queratina, el componente principal del pelo,
las plumas, las uñas, los cuernos y las células muertas de la epidermis.
La α hélice puede formarse con L o D aminoácidos pero nunca con una mezcla.
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Hay dos tipos de láminas β, dependiendo de la orientación que presentan las hebras que la
componen. Si todas las hebras se disponen con la misma orientación de sus grupos amino y
carboxilo terminales, se denominan láminas β paralelas. Si, por el contrario, se disponen de forma
alternada, se trata de láminas β antiparalelas, y, aunque son semejantes, presentan ciertas
características diferenciales.
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Las estructuras secundarias se agrupan formando motivos que dan lugar a estructuras globulares
o dominios.
En la célula en proceso de plegamiento ocurre durante y después de que las proteínas son
sintetizadas en los ribosomas. En algunos es facilitado por unas proteínas denominadas
chaperonas, que interaccionan con las cadenas parcialmente plegadas o plegadas de forma
defectuosa facilitando que lo hagan de la forma correcta.
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sales o agentes como el ion guanidinio también puede afectar a las interacciones electrostáticas.
Uno de los agentes desnaturalizantes que se utiliza con más frecuencia es la urea puesto que
compite en la formación de enlaces de puentes de hidrógeno. Las interacciones hidrofóbicas se
verán alteradas por sustancias que puedan establecer interacciones de la misma naturaleza con los
residuos, como son los disolventes apolares o los detergentes.
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demuestra que toda la información necesaria para que se produzca el plegamiento se encuentra
en la secuencia de aminoácidos de la proteína.
7 ESTRUCTURA CUATERNARIA
En algunas ocasiones se asocian varias cadenas proteicas para formar una proteína multimérica.
En ella las cadenas individuales se denominan subunidades y pueden ser iguales
(homomultímeros) o distintas (heteromultímeros). En ambos casos las cadenas tienen su
estructura tridimensional característica. La disposición tridimensional de estas subunidades
Las proteínas son moléculas complejas que desempeñan funciones muy variadas en los seres
vivos. Existen proteínas estructurales como el colágeno o las proteínas integrales de membrana,
proteínas de transporte y almacenamiento como la hemoglobina, proteínas implicadas en
funciones tan importantes como la contracción muscular, proteínas con función de defensa como
los anticuerpos y proteínas que participan en la recepción y transmisión de señales. Además, hay
que destacar a las proteínas con función catalítica: las enzimas.
En la mayoría de los casos, la función de las proteínas depende de su interacción reversible con
otras moléculas denominadas ligandos, que pueden ser moléculas de pequeño tamaño, o incluso,
otras proteínas. Cuando una proteína interacciona con un ligando pueden producirse cambios en
su estructura tridimensional de mayor o menor magnitud. Estos cambios de conformación pueden
desencadenar efectos fisiológicos importantes debido a que producen modificaciones en la
actividad de la proteína en cuestión.
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La unión de los ligandos a las proteínas se realiza en lugares específicos denominados sitios de
fijación o de unión. Una proteína puede tener varios sitios de fijación para diferentes ligandos que
serán específicos.
8.1 EL COLÁGENO
El colágeno es la proteína con función estructural más abundante en los vertebrados. Está presente
en el tejido conjuntivo de huesos, dientes, cartílagos, tendones y córnea del ojo, y en tejidos
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epiteliales en los que desempeña un papel estructural como proteína extracelular. Existen
numerosos tipos de colágeno que se asocian de forma variada formando diferentes agregados
moleculares.
El colágeno forma un armazón de microfibrillas, que sostiene la estructura de todos los órganos
y vísceras del organismo.
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9.1 HOMOPROTEÍNAS
Están constituidas exclusivamente por aminoácidos. En base a la predominancia de estos, y por
lo tanto a su solubilidad en agua se clasifican en:
Protaminas. Pequeño tamaño molecular. Ricas en aminoácidos básicos Arg y Lys. Son
solubles en agua y no coagulan por el calor. Se unen fuertemente a los ácidos nucléicos
Histonas. Pequeño tamaño molecular. Ricas en aminoácidos básicos Arg y Lys. Son
solubles en agua y no coagulan por el calor. Se unen fuertemente a los ácidos nucleicos.
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Globulinas. Precipitan con SO4(NH4) al 50%. Coagulan con el calor, y algunos son
insolubles en agua. Presentan los 20 a.a. proteinógenos con abundancia de glutamina y
asparragina. Dentro de este grupo se incluyen las Inmunoglobulinas, la Miosina del
músculo, y - globulinas etc.
Albúminas. Son solubles en agua y en soluciones salinas muy diluidas, precipitan en
sulfato amónico al 50%. Coagulan con el calor. Presentan poca glicina. En este grupo se
incluyen la Seroalbúmina, Lactoalbúmina y Ovoalbúmina.
Prolaminas. Son solubles en alcohol. Contenido muy elevado en prolina, ácido glutámico
9.2 HETEROPROTEÍNAS
Están constituidas por una parte proteica a la que se encuentra unida una parte no proteica
denominada grupo prostético. En base al grupo prostético se clasifican en:
Fosfoproteínas. Son proteínas que llevan unidas de forma covalente una o varias
moléculas de ácido fosfórico. La unión tiene lugar a nivel del grupo –OH de residuos de
serina, treonina o tirosina. Son muy solubles en soluciones ácidas. Presentan un carácter
marcadamente ácido. Al someterlas al calor coagulan y pierden el fosfato. Un ejemplo es
la Caseína de la leche.
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covalentemente. Son normalmente proteínas de transporte que actúan transportando
lípidos en la sangre y en la linfa. Un ejemplo son los Quilomicrones que actúan
transportando los triglicéridos ingeridos en la dieta. Nucleoproteínas. Formadas por una
parte proteica y un ácido nucleico. Las proteínas suelen ser normalmente del tipo
protaminas o histonas. Un ejemplo son los Ribosomas, en los que el ácido nucleico es el
ARN.
Hemoproteínas. Llevan como grupo prostético el grupo Hemo que es una
Ferroprotoporfirina. Un ejemplo es la Hemoglobina (transportadora de oxígeno) o el
Citocromo c (de la cadena de transporte electrónico).
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1 INTRODUCCIÓN
Los hidratos de carbono o sacáridos son moléculas biológicas simples en cuanto a su composición
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química, sin embargo desarrollan funciones vitales fundamentales. La denominación de hidratos
de carbono se debe a que la mayoría de ellos responde a la fórmula estequiométrica (CH2O)n, si
bien algunos pueden estar modificados conteniendo otros grupos como fosfato, sulfato o amino.
Las unidades monoméricas de los hidratos de carbono son los monosacáridos; la unión de dos
monosacáridos forma los disacáridos. Cuando se unen pocas unidades monosacáridas se
denominan oligosacáridos y polisacáridos cuando se unen muchos monómeros.
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2 MONOSACÁRIDOS
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La principal característica de los monosacáridos es que responden a la fórmula (CH2O)n,
encontrándose n en un rango de 3 a 7. Químicamente los monosacáridos son polihidroxialdehídos
o polihidroxiacetones. Su clasificación se basa atendiendo al grupo carbonilo (C=O=, es decir, si
este grupo es un aldehído (aldosas) o bien una cetona (cetosas).
Existen muchos monosacáridos de importancia biológica, pero sin duda la glucosa es la más
importante; es la más abundante en la naturaleza, y el que juega un papel central en el metabolismo
celular, además de ser el monosacárido principal en la mayoría de los polisacáridos. Otras
aldohexosas importantes son la galactosa y la manosa. Entre las cetohexosas la más abundante es
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GENERALIDADES
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– 3).
denominan epímeros. Para que en la célula de un epímero se convierta en otro (por ejemplo, una
glucosa en galactosa), se tiene que romper y formar un nuevo enlace, por lo que es necesaria que
esta reacción esté catalizada por una enzima.
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Así, una molécula de seis carbonos con cuatro centros quirales, al adoptar la forma ciclada,
presentará un quinto centro quiral en el carbono que proviene del grupo carbonilo (C – 1 si es
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aldehído y C – 2 si proviene de una cetona), pudiendo ahora adoptar dos posibles configuraciones.
Las aldohexosas y las heptosas adoptan una forma de anillo de seis vértices y se conocen como
piranosas, por analogía a la molécula de pirano. Las cetosas de seis carbonos y las aldosas de
cinco adoptan la forma de un anillo de cinco miembros y se denominan furanosas, por analogía
al furano.
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La representación de los anillos según la proyección de Haworth simula un anillo plano para las
formas pirano y furano. Sin embargo, debido a la estructura tetraédrica del carbono, estas
estructuras cíclicas adoptan conformaciones más estables termodinámicamente, denominadas
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conformación en silla.
CRITERIOS:
Configuración frente a conformación: para que una molécula cambie de configuración se debe
romper alguno de sus enlaces covalentes. Pasar de un enantiómero a otro requiere un cambio de
disposición de los sustituyentes del centro quiral mediante el cambio de un enlace covalente. Sin
embargo, para pasar de una conformación a otra no es necesario romper ningún enlace covalente.
Son adaptaciones de la molécula en el espacio.
1. AZÚCARES ÁCIDOS. Se
2.4 DERIVADOS DE LOS
obtienen por oxidación y asea
MONOSACÁRIDOS
química o enzimática.
En los monosacáridos se encuentran diferentes grupos
funcionales que pueden realizar diversas reacciones 2. AZÚCARES
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3. Puede existir la oxidación de los dos carbonos de los extremos, y entonces aparece la forma
aldárica, con dos grupos carboxilos.
Las lactonas son una forma ciclada, pero en este caso mediante un enlace éster.
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DESOXIAZÚCARES
Otra forma reducida de los monosacáridos son los desoxiazúcars, donde se ha sustituido un grupo
OH por un H. El desoxiazúcar más importante es la β – D – 2 – desoxirribosa, por ser el azúcar
presente en los nucleótidos que forman el ADN.
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2.4.3 AMINOAZÚCARES
Cuando se produce la sustitución del grupo OH del C – 2 de un carbohidrato por una amina (-
NH2) se obtiene un aminoazúcar. La D – glucosamina y la D – galactosamina son aminoazúcares
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3 OLIGOSACÁRIDOS
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denomina monocarbonílico. Este enlace a su vez puede designarse como monocarbonílico α o β
en función de la configuración del carbono anomérico que participa en la unión de los dos
monosacáridos.
Por otra parte, si la unión entre los dos monosacáridos se realiza aportando ambos azúcares su –
OH del carbono anomérico se producirá un enlace dicarbonílico.
En la célula, el enlace O – glucosídico está catalizado por diferentes enzimas, de acuerdo con los
azúcares que intervengan en la reacción. Las enzimas distinguen no solo el tipo de azúcar, si no
también el tipo de anómero. Una vez enlazado un anómero, por ejemplo α – D – glucosa a un
Sin embargo, en el enlace dicarbonílico, la unión de los dos carbonos anoméricos imposibilita
que el disacárido siga extendiéndose, perdiendo también su poder reductor. Otro tipo de enlace
glucosídico es el que tiene lugar entre el grupo hidroxilo del carbono anomérico y una amina
cualquiera. En este caso se formará un enlace N – glucosídico. Los nucleótidos son moléculas de
gran importancia biológica en las que intervienen este tipo de enlace, donde se produce la unión
entre una amina de la base nitrogenada a un – OH del carbono anomérico de la ribosa o de la
desoxirribosa.
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Las proteínas también pueden establecer uniones covalentes de este tipo con los azúcares. Para
establecer un enlace O – glucosídico, la proteína debe aportar al enlace un grupo hidroxilo de
alguno de los radicales de sus aminoácidos.
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El disacárido más abundante en la naturaleza es la sacarosa, formada por la unión entre la glucosa
y la fructosa mediante enlace α (1 →β2); es decir, ambos azúcares aportan al enlace los carbonos
anoméricos, formando un enlace dicarbonílico, y quedando en consecuencia el disacárido sin
poder reductor, o azúcar no reductor. La sacarosa es la forma en la que los hidratos de carbono
son transportados por las plantas y nos resulta familiar ya que es el azúcar de mesa común.
Nomenclatura
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escribe:
1º.- Nombre del primer monosacárido que participa en el enlace con el C anomérico acabado en
el sufijo IL. Se inserta el vocablo furano o pirano (furanosil o piranosil) en el nombre de cada
monosacárido para distinguir entre estructuras con anillos de 5 o 6 elementos. Se especifica
también la configuración de ese primer C anomérico con o .
2º.- A continuación se indica el número de los átomos de C entre los que se establece el enlace,
conectados con una flecha y entre paréntesis.
4º.- Se nombra el último monosacárido acabado en: -OSA Oligosacárido reductor -OSIDO
Oligosacárido no reductor
4 POLISACÁRIDOS
Sin embargo, en este apartado los clasificaremos según la función que desempeñan en la
naturaleza: función de reserva energética o por la capacidad de formar estructuras.
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ramificaciones cada 24 – 30 residuos. La ramificación se produce por la posibilidad de una
glucosa de establecer mediante un enlace α (1→6) otro enlace glucosídico con una cadena de
glucosas.
La mayoría de las células vegetales sintetizan almidón, que se almacena en gránulos, pero es
especialmente abundante en la patata, arroz y semillas.
La celulosa que forma la pared de las células vegetales y la quitina que forma el exoesqueleto de
los artrópodos (como los insectos y los crustáceos) son homopolisacáridos que forman estructuras
insolubles, siendo muy abundantes en la naturaleza.
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La celulosa está formada por polímeros lineales de glucosas unidas por enlaces β (1→4); la quitina
es prácticamente igual, pero difiere en que la glucosa está N – acetilada en el carbono 2. Ambos
polímeros son lineales y la disposición en el espacio de los anillos de pirano, unidos por enlaces
β (1→4), experimenta una rotación de 180º con respecto a las moléculas vecinas, produciendo
una estructura extendida de largas fibras de celulosa.
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Forma parte de la pared celular de varias especies de algas. En el laboratorio se emplea como
soporte para los cultivos celulares y también para preparar “geles de agarosa” que sirven como
soporte para electroforesis sobre todo de ADN aunque también de proteínas.
Las pectinas son polisacáridos que forman parte también de la pared celular de las células
vegetales, junto con la celulosa y otros componentes. El componente principal es el ácido D –
galacturónico.
Los glúcidos se pueden unir a la cadena polipeptídica mediante dos tipos de enlaces:
Enlace N – glucosídico. El glúcido se une a través del N del grupo amida a la cadena
lateral R de un residuo de Asn de la proteína.
Enlace O – glucosídico. El glúcido se une a través del grupo –OH de la cadena lateral R
de residuos de Ser o Thr de la proteína.
4.3.1 PROTEOGLUCANOS
Son estructuras formadas por la asociación de unos heteropolisacáridos, llamados
glucosaminoglucanos (GAG), y proteínas.
En general los GAG son heteropolisacáridos formados por unidades disacáridas unidas por
enlaces alternos y repetidos La unidad está formada por una hexosamina (normalmente N –
acetilglucosamina o N – acetilgalactosamina), siendo el otro monosacárido que forma parte de
esta unidad un ácido urónico, normalmente D – glucorónico o L – idurónico.
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Algunos presentan grupos sulfatos esterificados, lo que aumenta las cargas negativas. Esta
naturaleza ácida provoca una disposición en el espacio muy extendida de las grandes cadenas de
polisacáridos para disminuir así la repulsión de sus cargas negativas. En la matriz extracelular los
GAG se suelen unir covalentemente a proteínas formando proteoglucanos.
Los glucosaminoglucanos forman parte, junto con proteínas, de la matriz extracelular, que es el
material gelatinoso que rellena los huecos entre las células. Esta sustancia mantiene unidas las
células, y forma un medio poroso para la difusión del O2 y los nutrientes hacia las células
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individuales.
El ácido hialurónico es uno de los principales GAG de la matriz extracelular y forma grandes
masas moleculares, superiores a un millón de dalton. Además, ocupa un gran volumen, debido al
alto contenido de moléculas de agua que contiene, unidas por puentes de hidrógeno a los grupos
OH y por atracción electrostática por los grupos ácido del glucorónico. Son moléculas muy largas
formadas por hasta 50.000 repeticiones del disacárido: D – glucorónico y N – acetil – D –
glucosamina en el caso del ácido hialurónico; en los sulfatos de condroitina está formado por Ac.
D – glucorónico y N – acetil – D – galactosamina.
4.3.2 GLUCOPROTEÍNAS
Hay muchas proteínas, tanto en membrana como solubles en el medio intracelular y extracelular,
con diferentes funciones, que llevan como grupos prostéticos oligosacáridos y polisacáridos
unidos de forma covalente a la parte proteica. Estos glúcidos se caracterizan porque pueden ser
estructuras tanto lineales como ramificadas, por estar formadas por muchos monosacáridos y
derivados diferentes, porque se combinan enlaces tipo y y porque varían las posiciones entre
las que se establecen los enlaces. En resumen, son estructuras muy variadas y como consecuencia
son moléculas informativas.
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Monosacárido 6C Aldohexosa Glucosa Sí
Cetosa 3C Cetotriosa Dihidroxiacetona
Cetona 4C Cetotetrosa Eritrulosa
5C Cetopentosa Ribulosa
6C Cetohexosa Fructosa
UNIDAD TIPO DE EJEMPLOS FUENTE DE ORIGEN PODER
ENLACE REDUCTOR
O – glucosídico Lactosa Leche
monocarbonílico Maltosa Cereales Sí
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célula. Lo que se utiliza como combustible metabólico son los ácidos grasos, estos
compuestos son muy reducidos (carbono unido a muchos hidrógenos, por lo que cuando
se oxidan se libera mucha energía). Los ácidos grasos se suelen almacenar en forma de
un tipo de lípidos denominados triglicéridos.
Función estructural. Otros tipos de lípidos forman parte de estructuras que sirven para dar
sujeción, forma, protección… a los organismos. En este grupo se incluyen los lípidos que
forman las bicapas de las membranas biológicas (fosfoglicéridos y esfingolípidos) y
también las ceras.
2 CLASIFICACIÓN
Los lípidos son moléculas orgánicas insolubles en agua. Una de sus propiedades más importantes
es la hidrofobicidad. Según su estructura, los lípidos se pueden clasificar en:
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3 ÁCIDOS GRASOS
Son el principal componente de los lípidos saponificables. Son ácidos carboxílicos de cadena
larga con un único grupo carboxílico y una “cola” hidrocarbonada no polar. Los ácidos grasos
difieren unos de otros en la longitud de la cadena y en la presencia, número y posición de dobles
enlaces.
La mayor parte de los ácidos grasos presentes en los sistemas biológicos contienen un número par
La cola hidrocarbonada puede estar saturada si solo contiene enlaces simples (todos los C están
saturados con H), o insaturada si posee uno o más enlaces dobles. Estos últimos son los más
abundantes. Además, los dobles enlaces en los ácidos grasos poliinsaturados están separados entre
sí por, al menos, un grupo metileno (es decir, son no conjugados).
– CH = CH – CH = CH – CH = CH – – CH = CH – CH2 – CH = CH –
Conjugados No conjugados
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Las posiciones de los dobles enlaces se especifican por exponentes que siguen la letra delta (∆).
Por ejemplo, el ácido oleico, que tiene 18 átomos de carbono y es insaturado (doble enlace entre
C – 9 y C – 10) → 18: 1 ∆9. Un ácido graso de 20 carbonos con dos dobles enlaces, uno entre C
– 9 y C – 10, y otro entre C – 12 y C – 13, se designa como 20:2 ∆9.12.
Existe otra nomenclatura utilizada cada vez más en alimentación que se denomina sistema omega.
El sistema omega (ɷ) para la nomenclatura de los ácidos grasos toma como referencia el grupo
metilo terminal de la molécula (carbono más alejado del carboxilo, al que se le asigna la letra ɷ)
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y a la posición únicamente del primer doble enlace contando desde el grupo – CH3 terminal. Así,
un ácido graso ɷ - 3 tiene su primer doble enlace entre los carbonos 3 y 4, y un ácido graso ɷ - 6
tiene el primer doble enlace entre los carbonos 6 y 7, contando siempre desde el extremo – CH3.
El consumo de grandes cantidades de este tipo de ácidos grasos se ha asociado con una
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Los ácidos grasos saturados presentan gran flexibilidad, por lo que cuando se empaquetan tienden
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a establecer la conformación más estable, que es la forma totalmente extendida, en la que los
impedimentos estéricos entre átomos vecinos están reducidos al mínimo. En los ácidos grasos
insaturados, un doble enlace cis provoca un giro en la cadena hidrocarbonada.
Prostaglandinas
Su nombre procede de la glándula prostática, donde se aislaron por primera vez. Todas las
prostaglandinas tienen una estructura básica de 20 átomos de C denominada Ácido prostanoico.
Cinco de los C forman un ciclopentano, y el resto 2 cadenas alifáticas, R1 y R2.
Todas las prostaglandinas llevan además un grupo –OH en el C15, todas son moléculas
insaturadas, presentan uno, dos o tres dobles enlaces en R1 y R2, y diferentes sustituyentes en el
anillo de ciclopentano. Los diferentes tipos de prostaglandinas se diferencian en los sustituyentes
del anillo de ciclopentano, y se designan con una letra mayúscula (PGA, PGB, C, D, E, F, G, H,
I...). Las prostaglandinas de tipo I se diferencian algo en la estructura y se conocen también como
prostaciclinas. Al mismo tiempo, dentro de cada tipo, y de acuerdo con el número de
instauraciones que haya en las cadenas R1 y R2 se describen tres series de prostaglandinas,
ejemplo: PGE1 , PGE2 y PGE3 .
Tromboxanos
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Leucotrienos
Se llaman así porque fueron aislados por primera vez a partir de los leucocitos, aunque los enzimas
que catalizan su síntesis se encuentran también en el pulmón, corazón, cerebro y bazo.
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Se sintetizan a partir del ácido araquidónico, pero por una vía que no tiene nada en común con la
síntesis de prostaglandinas y tromboxanos. Estructuralmente se caracterizan por ser moléculas
lineales (no hay ciclos en su estructura) y presentar tres dobles enlaces conjugados.
4 ACILGLICEROLES
Los acilglicéridos son ésteres constituidos por el alcohol glicerol y ácidos grasos (tanto saturados
como insaturados), y se forman mediante una reacción de condensación denominada
esterificación. Una molécula de glicerol (o glicerina, son equivalentes en la nomenclatura) puede
reaccionar con hasta tres moléculas de ácidos grasos, puesto que tiene tres grupos hidroxilo.
Según el número de ácidos grasos que aparezcan esterificados, los acilglicéridos pueden ser de
tres tipos:
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Los triacilglicéridos (triglicéridos) funcionan como almacén de energía en las células,
constituyendo reservas de energía mucho más eficaces que los hidratos de carbono. Las grasas y
los aceites que se encuentran en plantas y animales son en gran medida mezclas de triglicéridos.
GRASAS NEUTRAS
Son TG sólidos a temperatura ambiente porque llevan una elevada proporción de ácidos grasos
saturados. Ejemplo: mantequilla, manteca de cerdo, grasa de buey (el componente principal de
este último es la triestearina).
Son TG líquidos a temperatura ambiente porque llevan una elevada proporción de ácidos grasos
insaturados. Ejemplo: los aceites vegetales como el de oliva, maíz, etc. (Contienen una elevada
proporción de ácidos grasos insaturados cuya ingesta elevada está relacionada con un descenso
en los niveles de colesterol en sangre, sobre todo los 3 y 6)
5 CERAS
Son ésteres de ácidos grasos de cadena larga (de 14 a 36 átomos de carbono ), saturados o
insaturados, con alcoholes de cadena larga.
Las ceras realizan diversas funciones en la naturaleza, que tienen que ver con su hidrofobicidad
y su consistencia.
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6 LÍPIDOS DE MEMBRANA
6.1 FOSFOGLICÉRIDOS
Todos los fosfoglicéridos tienen un precursor común: el
ácido fosfatídico. (Imagen de la derecha)
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Los fosfoglicéridos, también denominados
fosfoacilglicéridos o glicerofosfolípidos, están constituídos
por dos ácidos grasos esterificados al primer y segundo – OH
del glicerol. El tercer grupo – OH está unido por un enlace
fosfodiéster a un ácido fosfórico, un grupo de cabeza muy
polar o cargado (X).
Todos los fosfoglicéridos poseen dos colas no polares aportadas por los dos ácidos grasos de
cadena larga, generalmente uno saturado (C16 o C18 en la posición C – 1 del fosfoglicérido).
El carácter anfipático
de los fosfoglicéridos
hace que sean
constituyentes
fundamentales de las
membranas
biológicas.
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6.2 ESFINGOLÍPIDOS
Una segunda clase importante de componentes de la membrana es la de los esfingolípidos.
También tienen una cabeza polar y dos colas apolares, pero a diferencia de los fosfoglicéridos, no
contienen glicerol. Están formados por el aminoalcohol (18C) de cadena larga esfingosina, una
molécula de un ácido graso de cadena larga y un grupo polar en la cabeza, que puede ser un
alcohol o un azúcar. (Figura 3 – 5)
Cuando se une un ácido graso por un enlace amida al – NH2 del C – 2 de la esfingosina, se obtiene
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
una ceramida. La ceramida es la unidad estructural fundamental común de todos los
esfingolípidos.
Existen varias clases de esfingolípidos, todos ellos derivados de la ceramida, pero que difieren en
sus grupos de cabeza:
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7 LÍPIDOS ISOPRENOIDES
A partir de ciertos terpenos (que se forman a partir del isopreno, una unidad de cinco carbonos.
Actúan como pigmentos, hormonas y agentes defensivos) se forman algunas vitaminas
liposolubles, como las vitaminas A, E o K, tratadas al final del presente capítulo.
Esteroides
o Esteroles
o Ácidos y sales biliares
o Hormonas esteroideas
Vitaminas liposolubles
o Vitamina D
o Vitamina A
o Vitamina K
o Vitamina E
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Los esteroides se encuentran presentes en la mayoría de las células eucariotas. Difieren unos de
otros en el número y posición de los dobles enlaces, localización de los sustituyentes, etc.
Destacan los siguientes:
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Colesterol. Es el principal esteroide en los tejidos animales. Es anfipático, con una parte
polar (– OH en el C – 3) y una parte no polar (núcleo esteroideo y cadena lateral del C –
17 con ocho átomos de carbono) (Fig. 3 – 11).
Se encuentra en las membranas de células animales y constituye típicamente del 30 al
40% de los lípidos de membrana. En los mamíferos es el precursor metabólico de otros
esteroides como hormonas y ácidos biliares. Si se esterifica con ácidos grasos se convierte
en no polar.
Ácidos biliares. Actúan como detergentes en el intestino, emulsionando las grasas de la
dieta para hacerlas más accesibles a las enzimas digestivas. Son más solubles que el
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7.2 VITAMINAS LIPOSOLUBLES
Las vitaminas son esenciales para el buen funcionamiento del organismo. No pueden ser
sintetizadas por el ser humano y otros vertebrados, por lo que tienen que tomarse en la dieta. Las
vitaminas liposolubles son las que se disuelven en grasas y aceites, y se consumen junto con
alimentos que contienen grasas. Son las vitaminas A, D, E y K. Dos de ellas (D y A) son
precursores hormonales.
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Participa en el ciclo visual, tanto en la visión en blanco y negro (intensidad de luz baja)
como en la visión en color (intensidad de luz elevada). Forma parte (como retinal) de los
receptores lumínicos.
Funcionando como una hormona de naturaleza lipídica, participa en la diferenciación y
el desarrollo de los epitelios, de la piel y del hueso, y en el desarrollo embrionario.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
7.2.2 VITAMINA D
Las diversas formas de vitamina D son derivados de esteroles. La vitamina D2 (ergocalciferol) se
produce de forma no enzimática en la piel de los animales mediante la acción fotolítica de la luz
ultravioleta sobre el esterol vegetal ergosterol, mientras que la vitamina D3 (colecalciferol),
estrechamente relacionada, se produce en la piel a partir del 7 – dihidrocolesterol mediante una
reacción fotoquímica desencadenada por la luz solar.
Las vitaminas D2 y D3 no son biológicamente activas, pero ciertas enzimas del hígado y los
Entre las fuentes de vitamina D destacan la yema de huevo, el atún, el hígado y los cereales, así
como los suplementos añadidos a la leche y mantequilla.
7.2.3 VITAMINA E
Dentro de este término se incluye un grupo de lípidos estrechamente relacionados (α, β, γ, y δ -
tocoferoles), entre los cuales el más abundante es el α – tocoferol. Los tocoferoles son
antioxidantes biológicos, al ser capaces de reaccionar con las formas más reactivas del oxígeno y
otros radicales libres. Gracias a su anillo aromático fija, y por tanto elimina, radicales libres de
oxígeno como anión superóxido o el anión peróxido.
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Estos pueden atacar a los ácidos grasos insaturados presentes en los lípidos de membrana
oxidándolos, lo que conlleva fragilidad celular. Los tocoferoles se encuentran en los huevos, los
aceites vegetales y el germen de trigo, también en frutos secos y vegetales verdes.
7.2.4 VITAMINA K
Esta vitamina participa en la carboxilación de los residuos de ácido glutámico de algunas de las
proteínas involucradas en la coagulación sanguínea. Así, participa en la formación de la
protrombina activa, una proteína del plasma sanguíneo esencial para la formación de coágulos.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La protrombina es una enzima proteolítica que rompe enlaces peptídicos de la proteína sanguínea
fibrinógeno, convirtiéndola en fibrina, la proteína que mantiene unidos los coágulos de sangre.
La vitamina K1 (filoquinona) se encuentra en las hojas de las plantas verdes mientras que la
vitamina K2 (menoquinona) es sintetizada por las bacterias de la flora intestinal de vertebrados.
Su carencia es rara en humanos: solo se da en lactantes que padecen enfermedades hemorrágicas.
La vitamina K está formada por una estructura cíclica, la neftoquinona, a la que se une una cadena
lateral de varias unidades de isopreno.
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Reservados todos los derechos.
8 LIPOPROTEÍNAS
Las lipoproteínas son unas estructuras complejas que sirven para transportar los lípidos por el
organismo, a nivel sanguíneo y linfático.
Existen distintos tipos de lipoproteínas: quilomicrones (QM), VLDL (lipoproteínas de muy baja
densidad), IDL (lipoproteínas de densidad intermedia), LDL (lipoproteínas de baja densidad) y
HDL (lipoproteínas de alta densidad).
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9 MEMBRANAS BIOLÓGICAS
Lípidos
o Fosfoglicéridos
o Esfingolípidos
o Esteroles (colesterol en células animales)
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Proteínas
o Proteínas integrales. Atraviesan la bicapa lipídica.
o Proteínas periféricas. Se mantienen unidas de forma más débil a la zona externa
o interna de la membrana.
Glúcidos
o Unidos de forma covalente a lípidos y a las proteínas
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ribonucleico (ARN), las principales moléculas participantes en el almacenamiento y la
descodificación de la información genética.
Los nucleótidos y los ácidos nucleicos también desempeñan papeles estructurales y catalíticos en
la célula.
En la célula existen diversas clases de ARN, tres de ellos fundamentales: los ARN ribosómicos
1 LOS NUCLEÓTIDOS
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Las bases nitrogenadas son moléculas planas, aromáticas, heterocíclicas, que derivan de la purina
o de la pirimidina. Las bases púricas más comunes son la adenina (A) y la guanina (G). Ambas
aparecen tanto en el ADN como en el ARN. Las bases pirimidínicas principales sin la citosina
(C), el uracilo (U) y la timina (T) (Fig. 5 – 1). La citosina se encuentra en ambos tipos de ácidos
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nucleicos, pero la timina solo aparece en el ADN y el uracilo únicamente en el ARN.
Las bases se unen a una pentosa (mediante el N – 1 en las pirimidinas y el N – 9 en las purinas),
a través de un enlace N – β – glucosídico con el C’ – 1 de la pentosa. A los átomos de las pentosas
de los nucleótidos se les añade el signo prima (‘) para distinguirlos de los átomos de las bases
nitrogenadas. En los ribonucleótidos, la pentosa es la D – ribosa, mientras que en los
desoxirribonucleótidos el azúcar es la 2’ – desoxi – D – ribosa. Ambos tipos de pentosa se
encuentran en forma β. El compuesto resultante de la unión de una base más la pentosa es un
nucleósido.
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nucleótidos y ácidos nucleicos. Segundo, son moléculas prácticamente planas.
3. Son moléculas bastante hidrofóbicas.
4. Los grupos carbonilo y los átomos de N, tanto de los anillos como de los grupos amino,
participan en la formación de enlaces puentes de H entre las bases. A y T (en el ADN) o
U (en el ARN) se unen mediante 2 enlaces puentes de H. G y C se unen mediante 3
enlaces puentes de H.
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1.3 NUCLEÓTIDOS CÍCLICOS
En las células también aparecen nucleótidos con grupos fosfato en posiciones diferentes del
carbono 5’, como los ribonucleósidos 2’ – 3’ – monofosfato cíclicos y los ribonucleósidos 3’ –
monofosfato, que son productos finales de la hidrólisis del ARN. Otros ejemplos son la adenosina
– 3’, 5’ – monofosfato cíclico (AMPc) y la guanosina – 3’, 5’ – monofosfato cíclico (GMPc).
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Los nucleótidos pueden unirse unos a otros para formar el ADN o ARN. La unión se realiza
mediante “puentes” de grupos fosfato, en los cuales el grupo – OH en la posición 5’ de un
nucleótido está unido al grupo – OH del siguiente mediante un enlace fosfodiéster (Fig. 5 – 6).
De esta forma, los esqueletos de los ácidos nucleicos consisten en residuos de fosfato y pentosa,
quedando las bases nitrogenadas como grupos laterales unidos al esqueleto.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Todos los enlaces fosfodiéster tienen la misma orientación a lo largo de la cadena, con lo cual
cada cadena lineal de ácido nucleico tiene una polaridad especifica y extremos 5’ y 3’
diferenciados. El residuo terminal cuyo C – 5’ no está unido a otro nucleótido se conoce como
extremo 5’, mientras que el residuo terminal cuyo C – 3’ no está unido a otros nucleótidos se
llama extremo 3’.
El modelo de Watson y Crick para el modelo tridimensional del ADN tiene las siguientes
La doble hélice de ADN se mantiene unida por dos tipos de fuerzas: los enlaces de hidrógeno
entre los pares de bases complementarias y las interacciones de apilamiento de las bases.
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4 ESTRUCTURA TERCIARIA DEL ADN
El ADN Z supone una mayor desviación de la forma B. Es una hélice levógira. Contiene 12 pares
de bases por vuelta y la estructura es más delgada y alargada. Las cadenas del ADN adoptan un
plegamiento en zigzag.
El ADN presenta una estructura terciaria, que consiste en que la fibra de 20 ˚A se halla retorcida
sobre sí misma, formando una especie de superhélice. Esta disposición se denomina ADN
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La unión con Histonas genera la estructura denominada nucleosoma. Cada nucleosoma está
compuesto por una estructura voluminosa, denominada core, seguida por un eslabón o ”Linker”.
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El core está compuesto por un octámero de proteínas, Histonas, denominadas H2A, H2B, H3 y
H4. Cada tipo de histona se presenta en número par. Esta estructura está rodeada por un tramo de
ADN que da una vuelta y 3/4 en torno al octámero. El Linker está formado por un tramo de ADN
que une un nucleosoma con otro y una histona H1. El conjunto de la estructura se denomina fibra
de cromatina de 100˚A. Tiene un aspecto repetitivo en forma de collar de perlas, donde las perlas
serían los nucleosomas, unidos por los linker. El ADN debe encontrarse más compacto en el
núcleo de los espermatozoides. En este caso, el ADN se une a proteínas de carácter más básico,
denominadas Protaminas. El ADN se enrolla sobre estas proteínas, formando una estructura muy
compacta, denominada estructura cristalina del ADN.
El ADN de un gen se transcribe para producir una molécula de ARN que es complementaria con
el ADN. La secuencia de ARN es entonces traducida a la secuencia correspondiente de
aminoácidos para formar una proteína.
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contiene un ARNr 16S y 21 proteínas distintas. La subunidad 50S contiene dos ARNr,
de 5S y 23S, y 36 proteínas distintas. La subunidad pequeña de los eucariotas contiene
un ARNr 18S, mientras que la grande contiene tres tipos de moléculas de ARNr, 5S,
5’8S y 28S.
ARN de transferencia (ARNt). Transporta los aminoácidos en forma activada al
ribosoma para la formación de enlaces peptídicos a partir de la secuencia codificada por
el ARNm molde.
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En el ARNt se establecen puentes de hidrógeno intracatenarios y se forman pares de
bases A – U y G – C similares a los del ADN. La molécula puede dibujarse como una
estructura de trébol. Las porciones de la molécula unidas por puentes de hidrógeno se
denominan tallos, y las otras, bucles. Algunos de estos bucles contienen bases
modificadas.
El brazo del aminoácido puede llevar un aminoácido específico unido por su grupo
carboxilo al grupo hidroxilo 2’ o 3’ del residuo A del extremo 3’ del ARNt. El brazo
anticodón contiene el anticodón que permite el apareamiento específico con los codones
del ARNm en el proceso de traducción. El brazo D contiene dihidrouridina (D) y el brazo
ARNs de interferencia, ARN antisentido, ARN largo no codificante. Son moléculas de ARN que
regulan la expresión génica. Algunas contienen secuencias complementarias a regiones
específicas de ARNm, se unen a él provocando su degradación o evitando su traducción, otras se
unen a genes en el ADN.
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Algunas de las moléculas de ARNr catalizan la formación del enlace peptídico; moléculas de
ARN nucleares pequeñas forman parte de las ribonucleoproteínas nucleares pequeñas, estructuras
que catalizan la eliminación de intrones y el empalme de los exones
Algunos virus almacenan la información genética en moléculas de ARN, en algunos casos incluso
bicatenario.
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CELULAR
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2.
METABOLISMO
CONCEPTOS
76
DE
Y COOMUNICACIÓN
Zoyla Vaca del Campo
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Zoyla Vaca del Campo
TEMA 6. INTRODUCCIÓN AL
METABOLISMO
Definición
Concepto de metabolismo y rutas metabólicas
Bioenergética
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Catabolismo y anabolismo
El papel del ATP en los procesos metabólicos
Estado energético de la célula
1 DEFINCIÓN
El metabolismo es el conjunto de reacciones que permiten cubrir las necesidades vitales de las
células y del organismo.
Obtención de energía necesaria para realizar las funciones del organismo a partir de los
nutrientes.
Obtención de las moléculas precursoras o sillares (monómeros) necesarias para la
formación de las macromoléculas (polímeros) endógenas, a partir de la degradación
de macromoléculas exógenas que se ingieren con los nutrientes.
Formación o síntesis de las macromoléculas endógenas (polisacáridos, lípidos,
proteínas, ácidos nucleicos, etc.) partiendo de las moléculas precursoras. Este proceso
suele requerir energía.
Síntesis y degradación de biomoléculas con funciones especializadas, como pueden
ser vitaminas u hormonas.
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Esta generalidad da idea de la importancia de las rutas metabólicas, puesto que su estudio y
comprensión permite entender el funcionamiento básico y común a gran parte de los seres vivos.
Las rutas metabólicas centrales representan un ejemplo coordinado de estrategias de regulación y
economía celular.
En general, las rutas implicadas en el metabolismo se suelen dividir en dos fases: las llamadas
rutas catabólicas o catabolismo y las denominadas rutas anabólicas o anabolismo. Ambos tipos
de rutas ocurren simultáneamente en las células, con una regulación independiente. El conjunto
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de ambas constituye el metabolismo, y están interconectadas por moléculas transportadoras.
Las moléculas transportadoras almacenan la energía en una forma que sea fácil de intercambiar.
Pueden hacerlo a través de un grupo químico fácil de transferir, como el grupo fosforilo; o a través
de electrones, con gran actividad energética. La ventaja de estas moléculas transportadoras es que
difunden rápidamente por la célula, de manera que pueden transportar energía contenida en sus
enlaces desde el lugar en que se han originado al lugar en el que se va a requerir su acción.
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grasos o azúcares –, se sintetizan moléculas más complejas – como ácidos nucleicos, proteínas,
polisacáridos o lípidos –.
Esta fase sintetizadora suele requerir importantes cantidades de energía, ya sea en forma de
nucleótidos trifosfato (ATP, GTP) o como moléculas con poder reductor (FADH2, NADH y
NADPH) que proceden de las rutas catabólicas.
El anabolismo también implica una serie de rutas metabólicas que permiten la fijación de energía
y carbono desde fuentes que no son compuestos orgánicos. Entre estas rutas destaca la
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fotosíntesis, un complejo proceso por el que se fija la energía de la luz y el CO2 en compuestos
orgánicos, concretamente azúcares.
En general, se puede afirmar que el anabolismo es divergente; a partir de una serie limitada de
moléculas intermediarias o precursoras se genera una gran cantidad de macromoléculas y de
naturaleza muy dispar.
Las dos grandes vías del metabolismo celular, catabolismo y anabolismo, están necesariamente
conectadas a través de moléculas con funciones muy definidas. Por un lado las vías se conectarán
La ruta anfibólica por excelencia es el ciclo de Krebs que constituye un nexo de unión entre
catabolismo y anabolismo. Esto quiere decir que puede servir tanto para el anabolismo como para
el catabolismo, en función de como se emplee.
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Los diferentes mecanismos que controlan la actividad de cualquier ruta metabólica, es decir, la
regulación, pueden ocurrir a diversos niveles:
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También se puede generalizar esta compartimentalización a nivel tisular, de tal manera
que los diferentes tejidos se especializan y hay determinados procesos metabólicos que
se dan únicamente en algunos tejidos. Al hablar de compartimentalización celular hay
que destacar la actuación de las isoenzimas.
o La existencia de compartimentalización permite el principio de máxima
economía:
En un compartimento hay mayores concentraciones de sustratos y
enzimas.
Se impide la competencia de varias enzimas por un sustrato.
4 BIOENERGÉTICA
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Por otra parte, una molécula con enlaces fosfoanhídrido tiene menor resonancia que sus productos
de hidrólisis. La forma estable resonante (por ejemplo, el P) refleja el grado de deslocalización de
los electrones en la molécula y la gran variedad de formas que puede adoptar esta molécula,
teniendo además un alto grado de libertad o entropía, lo que hace este estado más favorable (Fig.
10 – 10a).
HIDRÓLISIS ORTO – FOSFOROLÍTICA DEL ATP
En la célula, además, la forma
resonante del fosfato se acompleja ATP + H2O → ADP + Pi
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con cationes, lo que provoca aún
HIDRÓLISIS PIRO – FOSFOROLÍTICA DEL ATP
más un alto grado de estabilización
de las cargas. ATP + H2O → AMP + PPi
El ATP va a ser, por lo tanto, la moneda de intercambio energético entre reacciones favorables y
desfavorables. Cuando una reacción no es favorable energéticamente se puede acoplar a otra muy
favorable, como es la hidrólisis del ATP, haciendo que la suma de ambas libere energía. Si, por
el contrario, se da una reacción muy favorable y se acopla a otra reacción desfavorable (como la
síntesis de ATP), la energía liberada se podrá aprovechar para este fin y no se desperdiciará solo
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La glutamina es, por lo tanto, muy abundante en la circulación, pues sirve como una forma de
transporte inocua del amoníaco, que el tóxico, hacia el hígado y el riñón.
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4.3 CARGA ENERGÉTICA
Informa del estado energético de la célula o tejido en un momento dado.
Aumento de la CE = aumento
vía utilizadora de ATP =
aumento velocidad relativa
Disminución de CE = aumento
vía generadora de ATP =
disminución velocidad relativa
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La principal ventaja de las enzimas frente a los catalizadores inorgánicos es que actúan en
condiciones suaves de pH y temperatura, con una gran eficiencia y, además, de forma muy
específica y regulable.
Eficiencia. Los enzimas son muchos más eficientes que los catalizadores químicos. A
concentraciones muy pequeñas (del orden de M) aceleran mucho más la velocidad de
una reacción que cualquier catalizador químico.
Especificidad. Cada enzima actúa sobre un determinado sustrato, o en algún caso un
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Transferasas Transfieren un grupo químico funcional de una
molécula a otra. Las quinasas catalizan la
transferencia de un grupo fosfato a otra molécula
desde un nucleótido.
Hidrolasas Transfieren un grupo – OH desde el agua a otro
sustrato. Catalizan reacciones de hidrólisis.
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Para nombrarlas, se puede utilizar el nombre tradicional, que suele obtenerse añadiendo el sufijo
“– asa” al nombre del sustrato o al tipo de reacción que catalizan. Pero existe un nombre
sistemático que indica más detalles sobre la reacción. Cada enzima se designa con las letras E.C,
con un subíndice de cuatro números.
Ejemplo:
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Nombre sistemático: Fructosa – 6 – fosfato: ATP – 1 – fosfotransferasa
Las enzimas (E) tienen un papel fundamental: acelerar las reacciones biológicas actuando sobre
sustratos (S) específicos que se van a transformar en el producto (P) de la reacción
(E + S → E + P). Esta función, esencial para los seres vivos, la consiguen gracias a que poseen
una estructura tridimensional característica, el centro activo, con un entorno químico adecuado
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Las enzimas aceleran las reacciones químicas creando vías alternativas de menor energía de
activación y lo hacen fundamentalmente por dos mecanismos:
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2.2 LAS INTERACCIONES EN EL COMPLEJO ENZIMA – SUSTRATO
SON ÓPTIMAS EN EL ESTADO DE TRANSICIÓN
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3 ESTUDIOS CINÉTICOS: FACTORES QUE AFECTAN A LA
VELOCIDAD DE REACCIÓN
La actividad de todos los enzimas se ve afectada por determinados factores como la concentración
de sustrato, la temperatura y el pH.
3.3 TEMPERATURA
El aumento de la temperatura conduce a un aumento de la velocidad de reacción, que tiene un
límite cuando se sobrepasa la temperatura de desnaturalización de la enzima, lo que conlleva una
pérdida de su función.
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4 REGULACIÓN ENZIMÁTICA
En la célula existe la necesidad de coordinar la actuación de muchas enzimas en aquellas vías que
se desarrollan de forma secuencial, es decir, donde el producto de una reacción es el sustrato de
la siguiente. En estos sistemas existen una o varias enzimas que tienen un mayor efecto sobre la
velocidad global del proceso y se denominan enzimas reguladoras.
Estas enzimas pueden cambiar su actividad como respuesta a ciertas modificaciones y suelen ser
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las que catalizan la primera de las reacciones de la secuencia, puesto que la regulación de la ruta
en las últimas etapas supondría un gasto innecesario.
Existen varios mecanismos mediante los que se modula su actividad. Las enzimas alostéricas se
unen de forma reversible no covalente a pequeñas moléculas que regulan su actividad. Otras
enzimas sufren modificaciones covalentes que pueden ser reversibles o irreversibles,
produciéndose cambios en su función (enzimas modulados covalentemente).
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5 COFACTORES ENZIMÁTICOS: IONES METÁLICOS Y
COENZIMAS
Numerosas enzimas utilizan cationes metálicos como cofactores (tabla 8 – 2). Estos cationes
tienen diferentes funciones dependiendo de la enzima concreta. Por ejemplo, las quinasas no son
activas en ausencia de Mg2+.
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Biotina (H) Biocitina Transferencia de grupos carboxilo
(piruvato carboxilasa, acetil – CoA,
carboxilasa…)
Tiamina (B1) Pirofosfato de tiamina Transferencia de grupos aldehído
por descarboxilación oxidativa
(piruvato deshidrogenasa, α –
cetoglutarato deshidrogenasa…)
Piridoxina (B6) Fosfato de piridoxal Transferencia de grupos amino
(transaminasas)
6 INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
Existen cierto tipo de moléculas, denominadas inhibidores, que ralentizan o detienen las
reacciones enzimáticas.
Los inhibidores pueden ser de dos tipos en función del tipo de enlace con el que se unan a la
enzima. Los inhibidores irreversibles se unen al centro activo de la enzima mediante enlaces
covalentes, bloqueándola permanentemente.
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Los inhibidores reversibles son moléculas que se unen a la enzima mediante interacciones no
covalentes, más o menos estables, de forma reversible. Dependiendo del tipo de inhibidor se
pueden diferenciar tres tipos de inhibición reversible (Figura 8 – 20).
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se consigue mediante cambios conformacionales del receptor inducidos por la unión con su
agonista específico. Ocurre en tres fases: recepción → transducción → respuesta.
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inmune diferencian entre células propias y células ajenas o invasoras. También son capaces de
reconocer si una célula ha sido infectada por un virus, ya que dicha célula presentará unas
moléculas específicas en su membrana que así se lo indicarían.
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De este modo, distinguimos tres fases durante la transducción de señales:
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CITOPLASMÁTICOS
Ligeras diferencias estructurales en los ligandos que se unen al receptor pueden desencadenar
efectos opuestos: los ligandos que al unirse activan al receptor reciben el nombre de agonistas,
mientras que los que lo bloquean impidiendo responder a otras señales se llaman antagonistas.
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usan otras proteínas para verificar su transmisión de la señal (las proteínas G).
El cambio de estructura que sufre el receptor activa su dominio intracelular, con lo que adquiere
la capacidad de unirse y activar las proteínas G heterotriméricas (figura 9 – 4a).
Todos los receptores de esta familia presentan una estructura común con siete dominios
atravesando la membrana, un domino extracelular N – terminal y un dominio intracelular C –
terminal. Las proteínas G están constituidas por tres subunidades (α, β y γ) que forman un trímero
asociado a la cara citosólica de la membrana, mediante la unión covalente de ácidos grasos.
Existen cientos de receptores acoplados a proteínas G que participan en procesos tan diversos
como la percepción sensitiva (vista, gusto y olfato), la liberación de ácidos gástricos en la
digestión o el desarrollo de los caracteres sexuales secundarios.
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Los receptores acoplados a proteínas G son fosforilados e inactivados por quinasas específicas,
receptores con actividad tirosina quinasa son desfosforilados e inactivados por fosfatasas
específicas, y los canales iónicos suelen estas programados para cerrarse al poco tiempo de
abrirse.
Adenilato ciclasa. Son proteínas de membrana que catalizan la formación de AMP cíclico
(AMPc) a partir de ATP. Su activación es inducida por algunas proteínas Gα aunque
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también puede estar influida por otros factores como el Ca2+ o los dímeros βγ. El AMPc
es también un segundo mensajero que se moverá libremente por el citosol activando
a su principal diana, la quinasa de la familia PKA. Esta quinasa fosforila distintas
proteínas en residuos de serina y treonina, regulando su actividad.
Otra diana del AMPc es un canal iónico que permite el paso del Na+ iniciando el impulso
nervioso. Este tipo de canal se encuentra exclusivamente en las células del epitelio
olfativo y junto a ellos hay cientos de receptores acoplados a proteínas G.
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MODO DE ACCIÓN DE LA TOXINA DEL CÓLERA
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TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES A PROTEÍNAS G E IMPLICACIÓN DE
FOSFOLIPASA C
Las fosfolipasas son enzimas que se encuentran insertadas en la membrana y cortan
enlaces dentro de las moléculas de fosfolípidos. Existen varias familias, pero la única
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3. Receptores intracelulares
CALMODULINA
Es una proteína ampliamente distribuida y muy conservada. Se puede encontrar tanto en células
Se han descrito varios tipos de receptores con actividad enzimática, como pueden ser receptores
con actividad guanilato ciclasa (producen GMPc) o con actividad fosfatasa, pero los más
abundantes y, por tanto, mejor conocidos, son los receptores con actividad tirosina quinasa.
Dentro de este grupo encontramos a los receptores de factores de crecimiento y otros como pueden
ser el receptor de la insulina.
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El receptor de la insulina está presente en prácticamente
todos los tejidos de mamíferos. Es un receptor con
actividad tirosina quinasa, formado por dos subunidades
α extracelulares y dos subunidades β transmembrana que
presentan un dominio citosólico con actividad tirosina
quinasa.
Las rutas que inician las IRS son muy parecidas a las iniciadas por otros receptores con actividad
tirosina quinasa. Por ejemplo, IRS – 1 fosforilada se une y activa a PI3K y esta activa a PKB. Una
de las acciones de PKB es incrementar el número de transportadores de glucosa (GLUT 4) en la
membrana de células musculares y tejido adiposo. En ausencia de insulina el número de
transportadores GLUT 4 en membrana se reduce y la mayoría se encuentran en vesículas
citoplasmáticas. PKB dispara los mecanismos para que estas vesículas se fundan con la membrana
y aumente el número de transportadores GLUT 4.
IRS – 1 también sirve de anclaje para Grb2, con lo que se inicia la ruta Grb2/SOS/Ras/Raf/MEK1
y MEK2/ERK1 y ERK2. Las tirosinas fosforiladas en el receptor sirven de punto de unión a otras
proteinas como Grb-2. Esta se une a un polipeptido rico en Pro denominado Sos el cual se une a
Ras que se encuentra anclada a la membrana y que es una proteina G pequeña. Tiene unido
GDP que al activarse cambia por GTP y se inician a continuación una serie de fosforilaciones
hasta verificarse la respuesta fisiológica adecuada a la señal.
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Algunos receptores son transportadores de iones. También conocidos como canales iónicos
regulados por unión a ligando. En este caso el mecanismo de transmisión de la señal es más
sencillo: la unión del ligando provoca la apertura del canal y el consiguiente movimiento de iones.
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DIFUSIÓN
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Receptores de Olor: Transducción a través de proteínas G
+ 2+
Canal Na /Ca : Simporte
2+ -
Canal Ca /Cl : Simporte
+ 2+
Canal Na /Ca : Antiporte
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BLOQUE 3. METABOLISMO
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Todas las reacciones del metabolismo están estrechamente relacionadas e interconectadas de tal
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manera que la separación entre catabolismo y anabolismo es una separación, más que nada,
formal. En las células, ambas fases se desarrollan simultáneamente en el tiempo y en el espacio,
si bien esa separación formal permite una mejor y más sencilla comprensión del metabolismo.
Cada ruta catabólica y anabólica está formada por numerosas reacciones enzimáticas consecutivas
que, además, permiten la interconexión con otras rutas distintas.
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CONEXIONES DE LA CADENA DE TRANSPORTE ELECTRÓNICO Y LA
FOSFORILACIÓN OXIDATIVA CON LAS RUTAS METABÓLICAS CENTRALES
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y se indican las principales funciones y rutas metabólicas que se originan en cada uno de estos
orgánulos o compartimentos.
Cabe destacar el citoplasma o citosol donde se originan la glucólisis, la síntesis de ácidos grasos
o las fermentaciones. También debe resaltarse la mitocondria, en cuya matriz se produce el ciclo
de Krebs (ruta central del metabolismo, de gran importancia porque en ella confluyen las rutas
metabólicas de las principales biomoléculas tales como los hidratos de carbono, los lípidos y los
compuestos nitrogenados, principalmente aminoácidos) y en cuya membrana se produce la
cadena transportadora de electrones y la fosforilación oxidativa (rutas de suma importancia en la
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Las rutas centrales del metabolismo intermediario, ciclo de Krebs y cadena transportadora de
electrones, están estrechamente relacionadas con el desarrollo evolutivo desde los organismos
anaerobios a los organismos aerobios.
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aminoácidos, habitualmente se divide en tres etapas:
3 EL CICLO DE KREBS
El ciclo de Krebs (también denominado ciclo del ácido cítrico o ciclo de los ácidos tricarboxílicos)
es una ruta metabólica que forma parte de lo que se conoce como la respiración celular típica de
los organismos aeróbicos. El ciclo de Krebs, como se ha comentado anteriormente, es parte de la
vía catabólica que realiza a la oxidación de las moléculas de acetil – CoA provenientes de
monosacáridos, ácidos grasos y aminoácidos hasta producir CO2, liberando gran cantidad de
energía química, sobre todo en forma de poder reductor que, gracias a la cadena transportadora
de electrones y de la fosforilación oxidativa, será utilizada en la síntesis de ATP.
El acetil – CoA suele venir de la β – oxidación de los ácidos grasos o del piruvato, a través de la
descarboxilación oxidativa. El piruvato suele originarse como producto de la glucólisis, o bien
como consecuencia de la actuación de las transaminasas.
Aparte de este papel catabólico, el ciclo de Krebs también presenta una parte anabólica, ya que
proporciona precursores para muchas rutas biosintéticas de diferentes biomoléculas como, por
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El hecho de que varios intermediarios del ciclo de Krebs sean base para formar diversas
biomoléculas tiene un papel importantísimo a nivel celular, ya que permite interconectar las
principales rutas metabólicas de los hidratos de carbono, de los lípidos y de los aminoácidos.
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El piruvato procedente de la glucólisis es una molécula que todavía retiene bastante energía
química y que puede ser empleada para obtener una cantidad sustancial de ATP. Para ello, el
piruvato debe oxidarse por completo. El primer paso es una descarboxilación de una molécula de
acetil – CoA, la cual posteriormente se degradará en el llamado ciclo de Krebs produciendo mucha
energía. Este proceso de eliminación de un átomo de carbono se conoce como descarboxilación
oxidativa del piruvato y lo realiza un complejo multienzimático, conocido como piruvato
deshidrogenasa, compuesto por cienco coenzimas y tres enzimas o actividades enzimáticas
distintas:
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La eficacia del ciclo a partir del acetato es del 46% de la energía de oxidación total. Parte de la
energía la utiliza la célula para producir calor y otra parte se conserva en forma de ATP.
Acetil – CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2 H2O → 2CO2 + 3 NADH + 3 H+ + FADH2 + GTP + CoA – SH
El GTP se puede utilizar como fuente de energía en determinadas reacciones, o bien se puede
aprovechar para sintetizar ATP a través de la siguiente reacción catalizada por la nucleósido
difosfoquinasa: GTP + ADP ↔ GDP + ATP. 1 acetil – CoA → 12 ATP.
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En relación con el ciclo de Krebs se puede deducir que todos los compuestos indicadores de un
elevado estado energético van a actuar como inhibidores del flujo a través del ciclo. Aquellos
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compuestos que sugieren situaciones de débil potencial energético actuarán como activadores de
las enzimas reguladoras del ciclo.
La regulación del ciclo de Krebs sucede principalmente a dos niveles (figura 12 – 6):
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3.3 REACCIONES ANAPLERÓTICAS Y CARÁCTER ANFIBÓLICO
Gran cantidad de rutas catabólicas convergen
en el ciclo de Krebs, como muestra la figura
12 – 7. Estas reacciones, que tienen su origen
en el metabolismo de los hidratos de carbono,
de los lípidos y sobre todo en el metabolismo
de los aminoácidos, tienen gran importancia a
la hora de reponer los intermediarios del ciclo.
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Las reacciones que generan dichos intermediarios se conocen como reacciones anapleróticas. La
reposición de un intermediario, teniendo en cuenta que es un ciclo cerrado, lleva a la larga a la
reposición de cualquier intermediario que falte. Las reacciones anapleróticas permiten que el ciclo
continúe funcionando, a pesar de que diversos intermediarios sean utilizados para la síntesis de
distintas biomoléculas, tal y como se verá posteriormente.
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ciclo de Krebs (malato y oxalacetato) a partir del piruvato (procedente normalmente de la
glucólisis).
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En relación con el ciclo del ácido cítrico se puede deducir que todos los compuestos indicadores
de un elevado estado energético van actuar como inhibidores del flujo a través del ciclo, mientras
que aquellos que sugieren situaciones de débil potencial energético actuaran como activadores
de las enzimas reguladoras del ciclo.
INHIBICION
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ACTIVACION
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Los electrones involucrados en las oxidaciones celulares no pasan directamente a oxígeno, sino
que sufren un proceso de oxidación – reducción secuencial a través de determinados centros rédox
(complejos mitocondriales) para finalmente reducir el oxígeno a agua.
Este proceso, por el cual se transfieren los electrones desde las biomoléculas del alimento hasta
el oxígeno, suele denominarse respiración aerobia o respiración celular. En este proceso, una serie
de protones se transfieren desde la matriz mitocondrial hacia el espacio intermembrana de la
mitocondria, de modo que se crea un gradiente de protones (gradiente electroquímico). Este
gradiente resultante sirve para impulsar la síntesis de ATP, a partir de ADP y Pi, a través de la
llamada fosforilación oxidativa.
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los complejos I y II.
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El tránsito de los electrones a través de los complejos se produce en orden creciente de afinidad
electrónica, transfiriendo los electrones desde las coenzimas más reducidas hasta el oxígeno,
aceptor final de los electrones.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
membrana, que pasa los electrones del FADH2 a la ubiquinona.
Complejo III (citocromo bc1 o complejo ubiquinona – citocromo c oxidorreductasa).
Acopla la transferencia de electrones desde la ubiquinona al citocromo c.
Complejo IV (citocromo c oxidasa). Es la última etapa de la cadena de transporte
electrónico de la respiración y conduce los electrones desde el citocromo c hasta el último
aceptor de los electrones, el oxígeno, que se reduce a agua.
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CONCEPTOS CLAVE
La cadena transportadora de electrones aprovecha los electrones del NADH + H+ y del FADH2
para crear un gradiente electroquímico, generando una fuerza protón – motriz.
Los electrones del NADH + H+ se transfieren a través de los complejos I, III y IV hasta el oxígeno.
Los electrones de las moléculas de FADH2 son transferidos a través de los complejos I, II y IV
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
hasta el oxígeno.
El NADH + H+ transfiere una media de 10H+ al especio intermembrana mientras que el FADH2
transfiere una media de 6 H+.
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La ATP sintasa es una de las estructuras más complejas de la membrana mitocondrial: contiene
dos subestructuras principales (F0 y F1), cada una con una función determinada.
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membrana mitocondrial interna que permite la translocación de
protones desde el espacio intermembranal mitocondrial hacia la
matriz mitocondrial. A diferencia de la ATP sintasa, que ‘acopla’
la translocación de protones a la síntesis de ATP, la termogenina
cataliza el aparente desaprovechamiento del paso de protones a
través de la membrana mitocondrial interna. Se denomina proteína
desacopladora porque ‘desacopla’ el gradiente de protones de la
generación de ATP por parte de la ATP sintasa, mecanismo
regulado hormonalmente.
1. La cadena respiratoria mitocondrial, por ser la respiración la principal fuente de energía (bajo
la forma de ATP) de las células vivientes en un medio aerobio donde se produce aniones
superóxido O2- y radicales libres oxigenados muy peligrosos.
2. Los neutrófilos y macrófagos poseen enzimas como las proteasas y nucleasas que generan
peróxido de hidrógeno, radicales superoxido e hidroxilo, cuyo fin es destruir elementos extraños.
5. Los rayos X y g generan radicales libres mediante la lisis del agua contenida en los tejidos
expuestos y conducen, en presencia de oxigeno, a la formación de aniones superoxido y de
radicales hidroxilo, los tejidos más involucrados son la piel y sobretodo el ojo por estar expuestos
directamente y por la intensidad del metabolismo.
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Preferentemente se forman en situación de elevados cocientes ATP/ADP. En estas condiciones
aumenta la presión parcial de oxígeno y el grado de reducción de los transportadores redox de los
complejos I, II y III.
Estructura y vulnerabilidad de las membranas celulares. La acción se centra sobre los dobles
enlaces de las cadenas de ácidos grasos insaturados.
Los radicales libres son particularmente dañinos para las proteínas que contengan un grupo
sulfidrilo (SH). Este es el caso de numerosas enzimas celulares y proteínas de transporte, que
pueden por esta vía, ser oxidadas e inactivadas. De este ataque de los radicales libres sobre las
proteínas, resultan graves alteraciones del metabolismo celular. Las proteínas que constituyen el
tejido conjuntivo (microfibrillas de colágeno, ácido hialurónico) son igualmente sensibles a la
acción de los radicales libres.
Los ácidos nucleicos son particularmente sensibles a la acción de los radicales libres: El sitio de
acción es el seno de la molécula del ADN (entre las bases púricas y pirídicas) que con lleva a la
ruptura de éstas y las mutaciones correspondientes.
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Otros enzimas capaces de producir superóxido son la xantina oxidasa, NADPH oxidasa y
citocromo p450. El peróxido de hidrógeno es producido por una amplia variedad de enzimas
incluidas monooxigenasas y oxidasas.
Todas las formas de vida mantienen un entorno reductor dentro de sus células. Este entorno
reductor es preservado por las enzimas que mantienen el estado reducido a través de un constante
aporte de energía metabólica. Desbalances en este estado normal redox pueden causar efectos
tóxicos a través de la producción de peróxidos y radicales libres que dañan a todos los
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componentes de la célula, incluyendo las proteínas, los lípidos y el ADN.
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
o Zinc: Es un potente antioxidante natural ya que es un componente de la enzima
antioxidante superoxidodismutasa, Aumenta la absorción de la vitamina A,
Interviene en el normal crecimiento y desarrollo durante el embarazo, la niñez y la
adolescencia, Ayuda a mantener las percepciones de los sentidos del olfato y del
gusto, Ayuda a mantener las funciones oculares normales.
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El malato, dentro de la mitocondria, se oxida por la malato deshidrogenasa, que utiliza NADH +
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H+ como cofactor, para generar de nuevo oxalacetato.
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1 INTRODUCCIÓN
Las principales fuentes de ácidos grasos en los mamíferos son las grasas consumidas en las dietas,
las grasas almacenadas como triglicéridos en el tejido adiposo y las grasas sintetizadas en un
órgano que se transfieren a otro (como por ejemplo en el hígado a partir de los hidratos de
carbono).
Para que se produzca la correcta asimilación de los lípidos, estos deben ser hidrolizados por
distintas enzimas digestivas intestinales hasta formar compuestos anfipáticos, que sí podrán
atravesar las membranas celulares, principalmente a nivel del yeyuno. Pero previamente a la
digestión enzimática, debe producirse la emulsión de las grasas por acción de las sales biliares,
las cuales facilitan la digestión.
Debido a la actividad detergente de las sales biliares, las grandes gotas lipídicas de la dita se
transforman en numerosas gotitas de pequeño tamaño (micelas), consiguiendo aumentar
enormemente la superficie; esto facilita la actuación de las enzimas digestivas. La emulsión
de las grasas se ve favorecida por los movimientos peristálticos intestinales. Las sales biliares se
sintetizan en el hígado y se almacenan en la vesícula biliar hasta su utilización tras la ingesta de
grasas de la dieta.
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Sobre los fosfolípidos actúa la fosfolipasa A2, liberando un ácido graso y un acil lisofosfolípido;
mientras que, sobre los esteres de colesterol, interviene la colesterol esterasa, rindiendo colesterol
y ácidos grasos.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Todos estos compuestos anfipáticos son asimilados por los enterocitos y, de igual manera que se
ha descrito con los triglicéridos, en su interior se regeneran los lípidos iniciales. Para poder ser
transportados al resto del organismo, los lípidos no pueden estar en forma libre, sino que deben
constituir un complejo estable uniéndose a las apoproteínas para originar las llamadas
lipoproteínas. En el intestino se origina, principalmente, un tipo de lipoproteína denominada
quilomicrón, que es liberado a la linfa.
3 LIPOPROTEÍNAS
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Se diferencian principalmente por su densidad y tamaño, de modo que su nombre deriva de esta
propiedad. Las diferencias de densidad permiten su aislamiento fácilmente mediante técnicas de
ultracentrifugación o de electroforesis (fig. 13 – 4).
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
En los capilares de estos tejidos la enzima lipoproteína lipasa plasmática ataca a los triglicéridos,
hidrolizándolos en glicerol y ácidos grasos, que son asimilados por las células tisulares,
principalmente adipocitos y miocitos, gracias a que reconocen a la apo C – II, típica de los
El glicerol y los ácidos grasos entran por difusión simple a las células de los tejidos periféricos y
son utilizados para formar triglicéridos y almacenar así grandes cantidades de energía. De esta
forma se produce el transporte de los triglicéridos de la dieta (triglicéridos exógenos) hasta los
tejidos.
Los restos de los quilomicrones que quedan tras la actuación de la lipoproteína lipasa plasmática
se conocen como quilomicrones remanentes, pobres en triglicéridos pero no en fosfolípidos y
apoproteínas; estos restos son retirados por el hígado, suministrándose así fosfolípidos, colesterol,
ácidos grasos y aminoácidos al tejido hepático.
Con las VLDL ocurre un proceso similar, aunque estas lipoproteínas suelen ser de origen hepático
y transportan los triglicéridos propios del organismo, sintetizados a nivel hepático (TG
endógenos).
La actuación de la lipoproteína lipasa sobre las VLDL origina igualmente glicerol y ácidos grasos
que serán asimilados por los tejidos. Además, se generan las IDL o VLDL remanentes, que son
ricas en colesterol. Estas lipoproteínas residuales son retiradas igualmente por el hígado, que las
usa como fuente de fosfolípidos, colesterol y aminoácidos. Estas IDL se pueden enriquecer aun
más en colesterol por la acción de la proteína transportadora de colesterol esterificado (CETP),
que actúa a nivel sanguíneo, provocando que las IDL se transformen en LDL, que son una forma
de transporte de colesterol a los tejidos.
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Las LDL son retiradas por las células de los tejidos periféricos a través de transportadores
específicos que reconocen la apo B – 100, apoproteínas constitutivas de las LDL.
Por último, a nivel sanguíneo, también aparecen las HDL, que tienen un origen principalmente
hepático y sirven para recoger el exceso de colesterol depositado en los tejidos periféricos y
transportado al hígado. De la misma manera, esta lipoproteína interviene intercambiando
apoproteínas y colesterol esterificado con las demás lipoproteínas, principalmente las LDL.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
4 METABOLISMO DE LOS ÁCIDOS GRASOS
4.1 LIPÓLISIS
La lipólisis es el mecanismo de movilización de los lípidos que se encuentran almacenados como
reservorio de energía. Esta movilización sucede cuando hay una deficiencia del aporte energético
o cuando se ayuna.
Estos lípidos acumulados en forma de triglicéridos se encuentran en forma anhidra, como gotitas
de grasa, en el citoplasma de las células adiposas.
El primer paso para su catabolismo es la hidrólisis, por medio de la triglicérido lipasa intracelular,
que origina como productos los componentes de los triglicéridos: glicerol y tres ácidos grasos.
La enzima triglicérido lipasa actúa bajo una estrecha regulación hormonal: el glucagón y la
adrenalina potencian su actividad, favoreciendo la lipólisis al fosforilar a la triglicérido lipasa a
través de la proteína quinasa A dependiente de AMPc; mientras que la insulina, al potenciar una
fosfatasa que desfosforila la triglicérido lipasa, bloquea la lipólisis.
Los ácidos grasos salen del adipocito y se unen en la sangre a la albúmina. Esta proteína
plasmática (que también se conoce como VHDL, lipoproteína de muy alta densidad) transporta
típicamente de dos a cuatro moléculas de ácidos grasos, si bien puede llegar a transportar hasta
seis.
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Estos ácidos grasos movilizados llegan, transportados por la albúmina, hasta los tejidos que
requieran energía; típicamente, el hígado, el músculo cardíaco y el músculo esquelético. (Fig. 13
– 6).
En estos tejidos, los ácidos grasos serán oxidados en una vía metabólica muy importante,
denominada β – oxidación, para producir grandes cantidades de energía.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
actuación secuencial de la glicerol quinasa, enzima no presente en los adipocitos, y la glicerol –
3 – fosfato deshidrogenasa (véase fig. 13 – 6). La dihidroxiacetona fosfato suele entrar en la
gluconeogénesis a nivel hepático, aunque también puede seguir la vía glucolítica, sirviendo para
la producción de energía, sobre todo si los niveles de glucagón o adrenalina son elevados,
situación habitual cuando se origine la lipólisis.
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La β – oxidación tiene lugar en la matriz mitocondrial, por lo tanto es necesario que el ácido graso
penetre en el órganulo. Así, se puede dividir la oxidación de los ácidos grasos en tres fases:
La primera fase implica la activación del ácido graso esterificándose con la CoA a
expensas del ATP.
La segunda fase supone la entrada en la mitocondria, gracias a un transporte mediado por
carnitina.
La tercera fase será la β – oxidación propiamente dicha, degradándose el ácido graso a
moléculas de acetil – CoA.
Esta transformación está catalizada por la acil – CoA sintetasa: en un primer paso, la enzima
produce la adenilación del ácido graso formando el acil adenilato, que permanece unido a la
enzima, y el pirofosfato; posteriormente, el ácido graso se transfiere a la molécula de CoA,
formando Acetil – CoA, con la consiguiente liberación de AMP.
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Sin embargo, las largas moléculas de acil – CoA no pueden entrar en la mitocondria, al no poder
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
atravesar su membrana interna. Logran penetrar ayudadas por un sistema de lanzadera (fig. 13
– 8): el ácido graso se transfiere a un transportador denominado carnitina para formar un
intermediario, acil – carnitina, gracias a la acción de la carnitina acil transferasa – I. La acil –
carnitina puede atravesar las membranas mitocondriales debido a la presencia de un transportador
específico: la carnitina acil – carnitina translocasa, que se localiza en la membrana interna
mitocondrial.
Este mecanismo de transporte al interior mitocondrial tiene como finalidad mantener aisladas las
moléculas de CoA de la mitocondria de las del resto de la célula, de tal manera que la relación
existente entre CoA libre y la acil – CoA o acetil – CoA sirve como indicador del nivel energético
de las mitocondrias y permite un mejor control del gasto metabólico.
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Una vez dentro de la matriz mitocondrial, las moléculas de acil – CoA comienzan propiamente el
proceso degradativo de la β – oxidación. Este proceso se basa en cuatro pasos que se repiten
consecutivamente hasta que toda la molécula de acetil – CoA ha sido degradada en moléculas de
acetil – CoA, que, finalmente, entrarán en el ciclo de Krebs produciendo más energía. Los cuatro
pasos que se repiten en el ciclo son (Fig. 13 – 9):
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
una molécula con poder reductor, FADH2 y originando una molécula de enoil – CoA.
2. Hidratación. La molécula de enoil – CoA se transforma en un hidroxiacil – CoA mediante
la incorporación de una molécula de agua por acción de la enoil – CoA hidratasa: el OH
procedente de la molécula de agua se introduce en la posición β, y el H se introduce en la
posición α.
3. Deshidrogenación. Gracias a la hidroxiacil – CoA deshidrogenasa se oxida la molécula
hasta una molécula de cetoacil – CoA, oxidando el grupo hidroxilo a un grupo ceto. Esta
oxidación sirve para reducir una molécula de NAD+ a NADH + H+.
4. Ruptura tiólica. Catalizada por una tiolasa y con una intervención de una molécula de
Por cada dos carbonos se genera un Acetil – CoA. 1 Acetil – CoA produce 12 ATP + 1 vuelta
produce 5 ATP más.
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Para proceder a la síntesis de ácidos grasos se requiere disponibilidad de poder reductor NADPH
+ H+, que se obtiene de la ruta de las pentosas fosfato y de la actuación de la enzima málica.
Además se necesitan suficientes moléculas de acetil – CoA citoplasmáticas, pues la síntesis de
los ácidos grasos tiene lugar en el citoplasma, por lo cual las moléculas de acetil – CoA tienen
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
que salir de la mitocondria, donde se generan a partir del piruvato.
Como las moléculas de acetil – CoA no pueden atravesar las membranas de la mitocondria,
recurren a un transporte con citrato y piruvato como vía de salida, transporte conocido como ciclo
del piruvato – citrato (Fig. 13 – 10).
La formación del malonil – CoA es el paso clave de regulación, regulación que principalmente
tiene lugar a nivel hormonal. La insulina potencia la biosíntesis de lípidos mediante la activación
de la enzima, por un mecanismo vía fosfatasas que desfosforila la acetil – CoA carboxilasa. Por
el contrario, el glucagón inhibe la biosíntesis de los lípidos, ya que fosforila la enzima acetil –
CoA carboxilada, quedando en su estado inactivo.
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Reservados todos los derechos.
El balance de la biosíntesis del ácido palmítico, precursor de todos los demás ácidos grasos, sería
el siguiente:
Una vez formado el ácido palmítico, distintas desaturasas del retículo endoplasmático liso,
enzimas que introducen dobles enlaces de forma específica en un determinado carbono, y distintas
elongadas, enzimas que introducen dos átomos de carbono en un ácido graso a partir de acetil –
CoA, en la mitocondria, o malonil – CoA, en el retículo endoplásmico liso, comienzan la
transformación del ácido palmítico en los demás ácidos grasos que se necesitan, tal y como se
muestra en la figura 13 – 12.
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Reservados todos los derechos.
5 CUERPOS CETÓNICOS
Los cuerpos cetónicos, acetoacetato, hidroxibutirato y acetona, son sustancias que se producen a
partir del acetil – CoA en las mitocondrias del tejido hepático cuando la velocidad de la β –
oxidación supera a la velocidad de oxidación en el ciclo de Krebs, por ejemplo, en situaciones de
ayuno.
Estos compuestos, que se pueden distribuir a través del sistema circulatorio por todos los tejidos,
sirven como fuente de energía para el corazón, el músculo y otros tejidos. Así, favorecen un ahorro
de glucosa, glucosa que es fundamental para otra serie de tejidos que dependen más estrechamente
de este hidrato de carbono para obtener energía como, por ejemplo, el cerebro y los glóbulos rojos.
Incluso si se produce un ayuno muy prolongado pueden ser utilizados por el cerebro como fuente
de energía alternativa a la glucosa.
5.1 CETOGÉNESIS
El proceso de creación de los cuerpos cetónicos se conoce como cetogénesis. Básicamente
consiste en la condensación de dos moléculas de acetil – CoA por acción de una tiolasa, formando
el acetoacetil – CoA.
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
CoA y en acetoacetato, el primer cuerpo cetónico, por
acción de la hidroximetilglutaril – CoA liasa. El
acetoacetato es el precursor de los demás cuerpos
cetónicos que existen en el organismo.
El hidroxibutirato se oxida a acetoacetato, originando NADH + H+, que será utilizado para
producir ATP mediante la fosforilación oxidativa en la cadena transportadora de electrones. El
acetoacetato se unirá a CoA formando, gracias a la enzima cetoacil – CoA transferasa, una
molécula de acetoacetil – CoA. La escisión del acetoacetil – CoA por una tiolasa rendirá dos
moléculas de acetil – CoA que se degradarán posteriormente en el ciclo de los ácidos
tricarboxílicos, generando una gran cantidad de energía (Fig. 13 – 14 a). La acetona, debido a que
ha perdido un átomo de carbono, se suele aprovechar transformándose en ácido láctico vía
formación de porpanodiol (Fig. 13 – 14 b), aunque también originando ácido fórmico y ácido
acético (Fig. 13 – 14 c).
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6 BIOSÍNTESIS DE LÍPIDOS
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Esta fase comienza por un mecanismo análogo a la síntesis de cuerpos cetónicos, por lo que a
partir de tres moléculas de acetil – CoA se obtiene una molécula de hidroximetilglutaril – CoA
(HMG – CoA).
Posteriormente el grupo carboxilo del HMG, que está formando un tioéster con la coenzima A,
se reduce a aldehído y después a un alcohol. El NADH + H+ es el agente reductor en las dos etapas
de la reacción, originando el mevalonato. La reacción de reducción está catalizada por la HMG –
CoA reductasa y es la etapa limitante de la síntesis de colesterol. La enzima está muy regulada y
es una diana farmacológicamente importante.
Estas unidades de isopreno activadas son las moléculas claves en la biosíntesis de gran número
de moléculas, entre ellas el colesterol y los terpenos.
Tercera etapa. Ciclación del escualeno a lanosterol (C30) y conversión final a colesterol
(C27).
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
donde se une al SER del gen de la HMG – CoA reductasa. Cuando aumenta la
concentración de colesterol se bloquea la liberación proteolítica de SREBP y se degrada
la que existe en el núcleo. Estos dos hechos detienen la transcripción de los genes de la
vía biosintética del colesterol.
La velocidad de la traducción del ARNm de la reductasa se inhibe por metabolitos no
esteroles derivados del mevalonato, así como por el colesterol de la dieta.
La degradación de la reductasa está controlada de modo riguroso, de tal manera que la
cantidad de enzima se puede regular de una a 200 veces. La degradación se estimula por
Las estatinas activan sobre la HMG – CoA reductasa y se reduce de forma competitiva, parcial y
reversible.
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Los primeros seres vivos no necesitaron del oxígeno para vivir, son los organismos aerobios
estrictos. Cuando apareció el oxígeno como producto de la fotosíntesis, algunas células
adquirieron la capacidad de utilizar el oxígeno como último aceptor de los electrones en el proceso
de oxidación.
En todos los casos las células han seleccionado a la glucosa como el óptimo elemento energético
susceptible de oxidación.
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1 GLUCÓLISIS
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La glucólisis puede considerarse como el proceso oxidativo de la glucosa, bien mediante su
degradación hasta generar piruvato o bien mediante su fermentación para dar ácido láctico,
La glucólisis es la forma más rápida de conseguir energía para una célula y, en el metabolismo de
los carbohidratos, generalmente es la primera vía de combustión.
El tipo de glucólisis más común y más conocida es la vía de Embden – Meyerhoff. La ruta se
encuentra estructurada en 10 reacciones (según Ignacio, 11) enzimáticas que permiten la
transformación de una molécula de glucosa a dos moléculas de piruvato, mediante un proceso
catabólico. Son 11 reacciones catalizadas por enzimas individuales.
Todos los intermediarios (excepto glucosa y piruvato) se encuentran fosforilados, con el fin de
impedir su traslado a otros compartimentos celulares. La fosforilación de los intermediarios
permite:
Clásicamente la glucólisis se divide en dos fases: la fase preparativa (según Ignacio, fase de
activación o cebado) y la fase de beneficios o de rendimiento energético (fase de producción neta
de energía) (Fig. 11 – 3).
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1.2 LAS 10 REACCIONES DE LA GLUCÓLISIS
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reversible y está catalizada por la enzima gliceraldehído – 3 – fosfato deshidrogenasa.
Constituye el primer paso de la fase de beneficios, paso que se repetirá más tarde con la
molécula de dihidroxiacetona, que, por acción de la triosa fosfato isomerasa, se
convertirá en una nueva molécula de gliceraldehído – 3 – fosfato.
7. Primera fosforilación a nivel de sustrato. En esta reacción se produce la síntesis de una
molécula de ATP, gracias a la transferencia de un grupo fosfato desde el 1,3 –
bisfosfoglicerato hasta un ADP, liberando ATP y 3 – fosfoglicerato. La enzima que
cataliza esta reacción es la fosfoglicerato quinasa y la reacción es reversible. Desplaza la
reacción anterior.
Teniendo en cuanta estos procesos, la ecuación global o balance de la glucólisis y de cada una de
las fases sería:
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energéticas de la célula están satisfechas. Esta regulación controla la cantidad de glucosa que será
aprovechada por la célula, si bien el hígado, además de la hexoquinasa, presenta la glucoquinasa,
enzima que permite al hígado almacenar una mayor cantidad de glucosa. Esto permite ajustar el
metabolismo y la función del hígado a la hora de mantener los niveles de glucemia y su papel de
reservorio de glucosa.
La fosfofructoquinasa – 1 (PFK – 1) está activada por fructosa – 2,6 – bisfosfato y AMP (un
indicador de baja producción de energía), inhibiéndose por citrato, ATP y H+. Los protones son
un control para prevenir un posible daño por un incremento de la concentración de ácido, ya que
el producto final de la glucólisis puede originar fácilmente ácido láctico, que podría ser causa de
una acidosis metabólica. La fructosa – 2,6 – bisfosfato se produce por la acción de la
fosfofructoquinasa – 2 (PFK – 2/FBPasa – 2), que es una enzima controlada por la acción de la
insulina y el glucagón, lo cual permite un control hormonal de la glucolisis.
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Para poder transferir ese " poder reductor " generado en el citosol hasta la cadena transportadora
de electrones existen en las células de mamífero dos sistemas de lanzadera de solutos que permiten
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la transferencia de pares de electrones y protones (pares de átomos de hidrógeno) bien
directamente hasta la cadena transportadora, bien hasta la matriz mitocondrial.
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o Glutamato transaminasa 1
(citosólica)
Los transportadores (antiportadores) se
o Glutamato transaminasa 2
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denominan:
(mitocondrial)
o Malato deshidrogenasa 1 o Transportador mitocondrial de
(citosólica) aspartato – glutamato
o Transportador mitocondrial de
oxoglutarato
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Esto se debe a que las mitocondrias tienen gran afinidad por el ADP y cuando estas obtienen
oxígeno tienden a elevar el cociente ATP/ADP estimulando la CD y FO (que no sé que es).
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2 GLUCONEOGÉNESIS
Esta ruta comparte una serie de reacciones con la glucólisis, concretamente los pasos reversibles,
La gluconeogénesis es una ruta que se lleva a cabo únicamente en el hígado y en la corteza renal.
Ocurre principalmente en el citosol o citoplasma de la célula, si bien el primer paso de esta ruta,
la formación de oxalacetato a partir de piruvato, se da en el interior del retículo endoplasmático.
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Reservados todos los derechos.
1. Síntesis de fosfoenolpiruvato.
La conversión del piruvato en fosfoenolpiruvato requiere dos reacciones catalizadas por sendas
enzimas: la piruvato carboxilasa, que cataliza la conversión de piruvato en oxalacetato; y la
fosfoenolpiruvato carboxiquinasa, que cataliza la conversión de oxalacetato en fosfoenolpiruvato.
La primera enzima, la piruvato carboxilasa, requiere el gasto de una molécula de ATP para fijar
un nuevo átomo de carbono, procedente del CO2, para generar oxalacetato, proceso que exige
biotina como cofactor enzimático.
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Esta es una reacción hidrolítica por la cual se elimina el grupo fosfato en posición 1 de la fructosa
por acción de la enzima fructosa – 1,6 – bisfosfatasa.
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3. Formación de glucosa a partir de glucosa – 6 – fosfato.
Esta es una reacción hidrolítica por la cual se libera el grupo fosfato en posición 6 de la glucosa
por la acción de la glucosa – 6 – fosfatasa. La enzima solo se encuentra en el retículo
endoplasmático del hígado y de la corteza renal.
Tampoco en esta reacción se regenera ATP, pero se obtiene Pi. La glucosa originada en esta ruta
se libera a la sangre para ser aprovechada por otros tejidos que la necesiten, ayudando de esta
manera a mantener unos niveles estables de glucosa en sangre.
La regulación de dos enzimas que catalizan pasos opuestos a través de los mismos factores genera
lo que se conoce como ciclo de sustrato. Este sistema permite una coordinación muy precisa de
ambas rutas, de tal manera que el mismo factor que está activando una ruta, a su vez está
inhibiendo la ruta opuesta, por lo tanto, el control de las dos rutas es muy preciso y se minimiza
el gasto energético a pesar de que ambas enzimas estén funcionando al mismo tiempo.
Hay que destacar que la glucosa – 6 – fosfatasa es activada por la glucosa – 6 – fosfato; la fructosa
– 1,6 – bisfosfatasa se inhibe por la fructosa – 2,6 – bisfosfato y AMP, y está potenciada por el
citrato; mientras que el ADP es un inhibidor de la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa y de la
piruvato carboxilasa.
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2.4 SUSTRATOS GLUCONEOGÉNICOS
Como se ha comentado anteriormente para la glucólisis, existen varias moléculas distintas que
pueden ser precursores de la síntesis de glucosa gracias a la ruta gluconeogénica. Destacan entre
estos sustratos principalmente cuatro: el ácido láctico, el glicerol, la alanina y el piruvato.
Así, el ácido láctico, que se genera en cantidades importantes en diversas células que no poseen
mitocondrias (como, por ejemplo, los eritrocitos) o que presentan en determinados momentos
unas bajas concentraciones de oxígeno (como puede suceder en el músculo durante el ejercicio
intenso), se libera y transporta por vía sanguínea hasta el hígado.
En este órgano se transforma en piruvato, que servirá para la síntesis de nuevas moléculas de
glucosa, liberadas después a la sangre para que sean aprovechadas por esas células sin
mitocondrias o con carencias de oxígeno.
Este proceso, conocido como Ciclo de Cori (figura 11 – 8a), permite compartir el gasto metabólico
entre diversos tejidos y el hígado.
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El glicerol, que es un producto de la degradación de los lípidos (lipólisis), puede ser utilizado para
formar glucosa gracias a la gluconeogénesis y a las enzimas glicerol quinasa y glicerol – 3 –
fosfato deshidrogenasa. Estas enzimas transforman el glicerol en dihidroxiacetona fosfato a través
de una oxidación que requiere NAD+.
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de los más importantes es la alanina, que, gracias a la actividad de las enzimas aminotransferasas,
se convierte fácilmente en piruvato, y este, a su vez, en alanina.
Este proceso origina un ciclo similar al Ciclo de Cori, denominado ciclo de la glucosa – alanina
(figura 11 – 8b), que permite transformar el piruvato en alanina y transportarla desde los tejidos
al hígado para que este sintetice piruvato de nuevo, que dará glucosa, a la vez que permite
transportar el nitrógeno de forma segura por la sangre, para posteriormente eliminarlo en forma
de urea (lo veremos en el tema de metabolismo de los compuestos nitrogenados).
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Entre las rutas catabólicas que se resumen en la figura 11 – 9, destacan principalmente dos: las
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fermentaciones (láctica y alcohólica) y la descarboxilación oxidativa del piruvato. Ambas rutas
trabajan junto con la glucólisis para optimizar la utilización de la glucosa. La utilización anabólica
del piruvato en la gluconeogénesis ya se ha estudiado anteriormente.
Los dos principales tipos de oxidaciones incompletas, es decir, que no terminan en la producción
de CO2, son la fermentación láctica y la alcohólica, ambas con gran importancia no solo a nivel
bioquímico, sino también a nivel industrial.
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Esta reacción permite regenerar la cantidad suficiente de NAD+ para que la glucólisis siga
funcionando, al menos durante un período corto de tiempo en aquellas situaciones en las cuales
el suministro de oxígeno se va reduciendo, como en las células musculares que se contraen
rápidamente y presentan una demanda energética elevada.
La reducción del piruvato a lactato ocurre en las células animales y vegetales y, especialmente,
en muchos microorganismos. La fermentación láctica tiene una gran importancia industrial ya
que está implicada en la elaboración de una gran cantidad de productos derivados principalmente
de la leche, como yogures y quesos, con un gran valor comercial.
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que lo oxida originando el acetil – CoA.
Dihidrolipoil deshidrogenasa (6 dímeros). Ayuda en la regeneración de las lipoamidas,
para lo cual requiere como cofactor FAD, que las oxida.
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La obtención de poder reductor en el citoplasma, en forma de NADPH + H+, que es un
agente reductor necesario para infinidad de reacciones anabólicas (como la síntesis de
ácidos grasos o el mantenimiento del estatus redox citosólico), además de ser un
antioxidante muy potente de gran utilidad en células con un elevado riesgo de daño
oxidativo como, por ejemplo, los eritrocitos.
La obtención de diversos monosacáridos de longitud entre tres y siete átomos de carbono.
Uno de los más importantes es la ribosa – 5 – fosfato, necesaria para la síntesis de
nucleótidos, base de los ácidos nucleicos, los nucleótidos trifosfato y gran cantidad de
cofactores enzimáticos. Otro glúcido importante que se origina en esta ruta es la eritrosa
La fase oxidativa de la ruta de las pentosas fosfato consta de tres reacciones (Fig. 11 – 12a). En
ellas, una molécula de glucosa – 6 – fosfato va a sufrir una oxidación originando 6 –
fosfogluconolactona, que será hidrolizada a 6 – fosfogluconato, el cual sufrirá una
descarboxilación oxidativa rindiendo ribulosa – 5 – fosfato. En esta fase es en la que se produce
la generación de poder reductor, formándose dos moléculas de NADPH + H+: una, en el primer
paso catalizado por la glucosa – 6 – fosfato deshidrogenasa; y otra, en el último catalizado por la
6 – fosfogluconato deshidrogenasa.
En esta fase participan una serie de enzimas tales como isomerasas y epimerasas, aunque las
enzimas encargadas de transferir fragmentos de carbono son las transcetolasas y transaldolasas.
El azúcar que cede los carbonos es siempre una cetosa, mientras que el azúcar aceptor es siempre
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una aldosa. Las transcetolasas transfieren dos átomos de carbono y el aldehído aceptor se
convierte en un alcohol, que adquiere configuración L. La reacción requiere pirofosfato de
tiamina, que actúa como transportador intermediario. Las transaldolasas transfieren tres átomos
de carbono y el aldehído aceptor se convierte en un alcohol, que adquiere configuración D.
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El efecto Warberg se refiere al hecho de que las células cancerosas, de una forma que parece poco
lógica, prefieren la fermentación como fuente de energía en vez de una vía mitocondrial más
eficiente como la fosforilación oxidativa.
En los tejidos normales, las células pueden usar la fosforilación oxidativa, que genera 36 ATP o
glucólisis anaeróbica, que le da 2 ATP. Anaeróbico significa “sin oxígeno” y glucólisis significa
“quemar glucosa”. Con una misma molécula de glucosa, puede obtener 18 veces más energía
usando oxígeno en la mitocondria en comparación con la glucólisis anaeróbica. Los tejidos
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normales solo usan esta vía menos eficiente en ausencia de oxígeno, p. ej. los músculos durante
un esprint. Esto crea el ácido láctico que causa la “quemazón muscular”.
En los organismos unicelulares como las bacterias existe una presión evolutiva para reproducirse
y crecer mientras haya nutrientes disponibles. Piensa en una célula de levadura en un trozo de
pan. Crece como loca. La levadura sobre una superficie seca como una encimera permanece
inactiva. Hay dos factores muy importantes para el crecimiento. No solo necesitas energía para
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crecer, sino también los componentes básicos. Piensa en una casa de ladrillo. Necesitas obreros,
pero también ladrillos. Del mismo modo, las células necesitan los elementos básicos (nutrientes)
para crecer.
Por lo general, en el caso de los organismos multicelulares hay muchos nutrientes flotando
alrededor. La célula del hígado, por ejemplo, encuentra muchos nutrientes por todos lados. El
hígado no crece porque solo absorbe estos nutrientes cuando es estimulado por factores de
crecimiento. En la analogía de la casa, hay muchos ladrillos, pero el capataz les ha dicho a los
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obreros que no construyan. Así que no se construye nada.
Una teoría es que tal vez la célula cancerosa está utilizando el efecto Warburg para no solo generar
energía, sino también el sustrato necesario para crecer. Para que una célula cancerosa se divida,
necesita muchos componentes celulares, necesita componentes básicos como el acetil-CoA, que
pueden convertirse en otros tejidos como aminoácidos y lípidos.
Solo en células tumorales: Es el incremento de consumo de glucosa hacia lactato, por lo tanto
para compensar la necesidad energética del crecimiento celular también acelera la fase oxidativa
de la ruta de las pentosas fosfato.
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5.1 GLUCOGENOGÉNESIS
La síntesis de glucógeno se produce normalmente después de la ingestión, sobre todo si la dieta
es rica en carbohidratos, pues en esos momentos habrá una gran cantidad de glucosa en sangre
procedente de la dieta.
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Esta glucosa será almacenada tanto en el tejido muscular como en el tejido hepático en forma de
glucógeno. El tejido hepático será el que se encargue de acumular la mayor cantidad de glucosa
en forma de glucógeno, debido a la presencia de la glucoquinasa, enzima que permite almacenar
gran cantidad de glucosa en los tejidos en forma de glucosa – 6 – fosfato. Al contrario que la
hexoquinasa, presente en los demás tejidos, esta enzima hepática no se inhibe por la glucosa – 6
– fosfato, lo que le permite introducir una mayor cantidad de glucosa dentro de las células
hepáticas.
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5.2 GLUCOGENÓLISIS
Para la degradación del glucógeno, se necesitan fundamentalmente dos enzimas:
La glucógeno fosforilasa, cuyo papel será eliminar las moléculas de glucosa de los
extremos no reductores de tal forma que va recortando las cadenas lineales de glucógeno.
La glucógeno fosforilasa rompe los enlaces O – glucosídicos α(1→4), liberando
moléculas de glucosa – 1 – fosfato.
La enzima desramificante, cuyo papel es eliminar los puntos de ramificación. Para ello,
esta enzima cuenta con dos actividades: una actividad glucosil transferasa, que transfiere
la cadena moléculas de glucosa con enlaces O – glucosídicos α(1→4) a una cadena central
de glucógeno mediante un enlace O – glucosídico α(1→4), dejando únicamente una
molécula de glucosa que tiene un enlace O – glucosídico α(1→6); y, por otra parte, una
actividad glucosidasa, que eliminará el enlace O – glucosídico α(1→6) liberando una
molécula de glucosa. (Fig. 11 – 15).
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5.3 REGULACIÓN HORMONAL DEL METABOLISMO DEL
El AMPc es un mensajero secundario que activa una serie de quinasas encargadas de fosforilar la
glucógeno fosforilasa y a la glucógeno sintasa. La glucógeno fosforilasa fosforilada es la forma
activa de la enzima, mientras que la glucógeno sintasa fosforilasa es inactiva, de tal forma que el
glucagón y la adrenalina, al favorecer las formas fosforiladas, impiden la síntesis de glucógeno y
favorecen la degradación del mismo. La insulina, por el contrario, no incrementa los niveles de
AMPc y, por tanto, en su presencia, no se activa la quinasa que fosforilará las enzimas del
metabolismo del glucógeno.
Así, la insulina potencia la síntesis de glucógeno e inhibe la degradación del mismo, al contrario
de lo que sucedía con la adrenalina y el glucagón.
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Metabolismo del grupo hemo
Síntesis de aminoácidos con funciones específicas
Se transformarán en esqueletos carbonados (α – cetoácidos) con destino al ciclo del ácido cítrico,
mientras que el amonio se degrada dado que es tóxico.
2 DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS
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La digestión de las proteínas exógenas en el tracto digestivo tiene un papel clave para generar
aminoácidos libres (Fig. 14 – 2). La entrada de proteínas en el estómago estimula la mucosa
gástrica, que secreta la hormona gastrina. La gastrina estimula la secreción de HCl y pepsinógeno.
Una vez desnaturalizada la proteína, comienza la hidrólisis proteica, mediante rotura de enlace
peptídico. En dicha fase se degradan las proteínas desnaturalizadas hasta dar péptidos, dipéptidos
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y aminoácidos libres, que son las únicas formas que pueden absorber las células epiteliales del
intestino.
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cascada de activaciones. Cada una de estas formas activas rompe únicamente determinados
enlaces de la proteína a degradar, de tal forma que solo el conjunto de todas ellas produce la
degradación total de dicha proteína.
La pepsina hidroliza parcialmente las proteínas de la dieta. A nivel estomacal también interviene
la renina, proteasa que actúa sobre las caseínas de la leche permitiendo su digestión, por lo que se
Estas enzimas intestinales degradan las proteínas y los grandes péptidos procedentes del estómago
hasta obtener pequeños fragmentos de péptidos (oligopéptidos de cuatro a seis aminoácidos) y
algunos aminoácidos libres.
Los contenidos ácidos del estómago pasan al intestino delgado, el pH ácido del estómago
desencadena la secreción de la hormona secretina a la sangre. La secretina estimula al páncreas
para producir bicarbonato y neutralizar el pH ácido.
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Importante de aquí saber cual es el proenzima y que enlaces rompe.
La correcta eliminación del grupo amino de los aminoácidos es muy importante, pues es
relativamente fácil que dicho compuesto acabe formando amoníaco en el organismo. El amoníaco
es un tóxico potencialmente peligroso para los seres vivos cuando se acumula y origina
hiperamonemia. El amoníaco se hace especialmente tóxico para el cerebro por diferentes motivos:
Interfiere con el intercambio iónico a través de las membranas. El ion amonio presenta
carga y es muy pequeño, por lo que actúa interfiriendo en los potenciales de membrana.
Esto causa grandes daños en el cerebro, ya que las neuronas son células que dependen del
potencial de membrana para su correcto funcionamiento.
Bloqueo del ciclo de Krebs. El amonio, en presencia de α – cetoglutarato, produce
glutamato (Glu), retira dicho intermediario del ciclo de Krebs y, en consecuencia, origina
una grave interferencia metabólica.
El amonio, en presencia del glutamato (generado por el mismo ion amonio), produce
glutamina y su acúmulo puede causar edema cerebral.
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Para la separación del grupo amino, todos los aminoácidos sufren una reacción de transaminación,
que forma un nuevo aminoácido y un nuevo cetoácido; finalmente, todos los grupos amino se
transfieren al α – cetoglutarato, formando glutamato, que es eventualmente la única molécula que
suele ser objeto de una desaminación oxidativa rápida. Ambas reacciones, transaminación y
desaminación, que se verán a continuación, son esenciales en el metabolismo de los aminoácidos.
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3.1 TRANSAMINACIÓN
Las transaminasas o aminotransferasas son enzimas muy importantes en la degradación y también
en la síntesis de aminoácidos. Existe una gran variedad de transaminasas, prácticamente una por
cada aminoácido. Las transaminasas usan como cofactor piroxidal fosfato, derivado de la
vitamina B6.
Ambas transaminasas tienen un papel clave en el transporte y eliminación de los grupos amino,
tal y como se estudiará más adelante. Su medición en sangre sirve de diagnóstico de enfermedades
hepáticas, ya que sus niveles sanguíneos aumentan si se produce daño hepático.
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3.2 DESAMINACIÓN
La mayoría de los aminoácidos son desaminados por transaminación, formándose siempre
glutamato. La pérdida del grupo amino del glutamato así formado se produce gracias a la acción
de la glutamato deshidrogenasa, enzima muy importante a nivel hepático que cataliza la siguiente
reacción (figura 14 – 4) de desaminación oxidativa:
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Como consecuencia, se libera en forma de amonio el nitrógeno recogido de todos los grupos
amino de todos los aminoácidos. El amonio se genera principalmente en el hígado, y en el hombre
se elimina habitualmente a través del ciclo de la urea. Pero existen varias estrategias de
eliminación del nitrógeno de los animales, que permite clasificarlos en tres grupos:
Aunque la mayoría de los aminoácidos se degradan en el hígado, algunos son desaminados e otros
tejidos por transaminación. Una vez que el grupo amonio se encuentra en el glutamato, se
transferirá, a través de la GPT/ALT, a una molécula de piruvato, procedente de la glucólisis, para
formar alanina.
Este aminoácido sale a la sangre sirviendo de medio de transporte inocuo del grupo amino, de tal
forma que viaja por el torrente sanguíneo sin que se produzca un incremento de amonio. La
alanina es retirada de la sangre por el hígado, el cual a través de su GPT/ALT forma glutamato y
piruvato.
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El piruvato puede ser aprovechado en el hígado para formar nuevas moléculas de glucosa gracias
a la gluconeogénesis. Este proceso se conoce como el ciclo de la glucosa – alanina (véase figura
11 – 8b) y supone un mecanismo indirecto de transporte al hígado del grupo amino de los
aminoácidos metabolizados en otros tejidos, para que sea excretado como urea.
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Reservados todos los derechos.
La glutamina posee dos átomos de nitrógeno, a diferencia de la mayoría de los aminoácidos que
poseen uno solo. Esta característica convierte a la glutamina en una molécula ideal para colaborar
en el transporte de nitrógeno a través del cuerpo.
La glutamina es, por lo tanto, muy abundante en la ciruclación, pues sirve como una forma de
transporte inocua del amoníaco, que es tóxico, hacia el hígado y el riñón (figura 14 – 5). La
glutamina y la alanina transportan más de la mitad del nitrógeno del organismo. La glutamina se
encuentra en grandes cantidades en los músculos del cuerpo (casi un 60% del total de
aminoácidos), siendo fundamental para la eliminación del nitrógeno procedente del tejido
muscular.
Además, la glutamina en el riñón ejerce un papel importante en las células del túbulo renal,
interviniendo en la síntesis de amoníaco, que es empleado por el rión como un tampón urinario,
de tal forma que colabora en la estabilización del pH urinario y sanguíneo.
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3.3 EL CICLO DE LA UREA
Los animales ureotélicos, como el hombre, eliminan el nitrógeno de los aminoácidos en forma de
urea en la orina, de tal modo que el nitrógeno ureico representa el 80% del total de nitrógeno
excretado. La molécula de urea presenta dos átomos de nitrógeno, y se forma por un mecanismo
cíclico denominado ciclo de la urea.
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La arginina formada a partir del argininosuccinato posee el carbono y los dos grupos amino
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necesarios para formar la urea. Por la acción de la enzima arginasa, se produce urea y ornitina,
que se introduce en la mitocondria para comenzar un nuevo ciclo. Finalmente, la urea será
eliminada del organismo vía renal.
La arginasa es una enzima exclusivamente hepática, por lo que el ciclo de la urea solo se da
íntegro en el tejido hepático, rindiendo urea. En otros tejidos como rión, hígado e intestino, este
ciclo se puede utilizar, además, para la síntesis del aminoácido arginina.
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4 LA BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS
Para formar el anillo pirrólico se tienen que condensar dos moléculas de δ – ALA, y gracias a una
enzima deshidratasa se forma el porfobilinógeno. Cuatro porfobilinógenos reaccionan en una
desaminación mediante la porfobilinógeno desaminasa, dando un tetrapirrol lineal, que se va
reciclando para generar uroporfirinógeno III.
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Finalmente, se orina el grupo hemo por unión de un átomo de hierro, mediante la ferroquelatasa
(figura 14 – 10).
Las porfirinas son coloreadas y absorben luz en el espectro UV visible. Son estructuras comunes
tanto a la síntesis de clorofila en las platas, como a la síntesis de la vitamina B12 y de la
hemoglobina en animales.
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El grupo hemo es un grupo prostético que forma parte de diversas proteínas, entre las que destaca
la Hemoglobina, consiste en un ion Fe2+ (ferroso) contenido en el centro de un gran heterociclo
orgánico llamado Porfirina, hecho de cuatro grupos pirrólicos unidos entre sí por medio de
puentes metino. No todas las porfirinas contienen hierro, pero una fracción sustancial de las
metaloproteínas que contienen el núcleo porfirina, poseen el grupo hemo como grupo prostético;
estas proteínas se conocen como hemoproteínas. El grupo hemo es principalmente conocido por
formar parte de la hemoglobina, el pigmento rojo de la sangre, pero también se encuentra en un
gran número de otras hemoproteínas biológicamente importantes tales como la mioglobina,
citocromos, catalasa, y la óxido nítrico sintetasa endotelial.
El proceso enzimático que lleva a la producción del grupo hemo, se llama apropiadamente
porfirinosintesis ya que todos los intermediarios son tetrapirroles se clasifican químicamente
como porfirinas.
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El proceso se encuentra altamente conservado en todos los seres vivos. En humanos, esta vía
metabólica sirve casi exclusivamente para la síntesis del hemo. En otras especies, además produce
sustancias similares tales como la cobalamina (Vit B12).
La vía se inicia con la síntesis de ácido aminolevulínico (dALA o δALA) a partir de glicina y de
succinil-CoA proveniente del TCA. La enzima limitante de velocidad en esta reacción, la ALA
sintetasa, se encuentra regulada negativamente por la concentración de glucosa y hemo. Los
mecanismos de inhibición de la ALAs por hemo o hemina se produce por medio de la disminución
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de la estabilidad de la síntesis de mRNA y por la disminución de la incorporación de ARNm en
la mitocondria. Este mecanismo tiene una importancia terapéutica, la infusión de arginato de
heme o hematina y glucosa puede abortar los ataques de porfiria intermitente aguada en pacientes
con un error innato del metabolismo en este proceso. Y funciona reduciendo la transcripción de
la ALA sintasa.
Aunque todas las células precisan del grupo hemo para funcionar adecuadamente, los órganos
principalmente involucrados en la síntesis del hemo son el higado (en el cual la síntesis de hemo
es altamente variable, dependiendo del contenido global de hemo del organismo) y la médula osea
La degradación del grupo heme comienza dentro de los macrófagos del bazo, los cuales remueven
los eritrocitos senescentes de la circulación. En un primer paso, el grupo hemo se convierte en
biliverdina, por la enzima hemooxigenasa (HMOX).
Se utiliza NADPH como agente reductor, se introduce oxígeno a la reacción y se libera monóxido
de carbono (CO), mientras que el hierro que se libera de la molécula lo hace en la forma de ion
férrico (Fe3+). El monóxido de carbono actúa como mensajero celular y tiene alguna función en
la vasodilatación.
Adicionalmente, la degradación del heme parece ser una respuesta evolutivamente muy
conservada al estrés oxidativo. Brevemente, cuando una célula es expuesta a radicales, se produce
una rápida inducción de la expresión de la HMOX1 la cual es una hemo oxigenasa de respuesta
al estrés. Esta isoenzima cataboliza a los grupos hemo. La razón por la cual las células podrían
aumentar exponencialmente su capacidad de degradar el grupo hemo en respuesta al estrés
oxidativo todavía permanece poco clara, pero parece formar parte de una respuesta citoprotectora
que limita los efectos deletéreos del hemo libre.
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o La melatonina, que también regula el sueño y la vigilia.
Derivados del glutámico (glutamato),
o GABA (o ácido γ – aminobutírico), que interviene en la transmisión del impulso
nervioso, es el principal neurotransmisor inhibitorio cerebral.
Derivados de la tirosina.
o Catecolaminas. Como DOPA, dopamina, noradrenalina y adrenalina, implicadas
en la transmisión del impulso nervioso.
o Melaninas rojas y negras.
o Hormonas tiroideas, T3 y T4.
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4.1.2.2 SÍNTESIS DE SEROTONINA
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BLOQUE 4.
BIOLOGÍA MOLECULAR.
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1 RAQUERIMIENTOS DE LA REPLICACIÓN
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Energéticos. Se trata de un proceso que requiere el aporte de energía, puesto que ambas
hebras deben separarse, y el desenrollamiento también induce a su vez enrollamientos
negativos que generan tensiones de torsión que han de suprimirse.
Fiabilidad. Se requiere un sistema que realice un proceso de copia dirigido no solo durante
la copia, sino también que debe darse un acoplamiento al ciclo de división celular.
2 REPLICACIÓN EN EUCARIOTAS
La síntesis de las cadenas nuevas se realiza en dirección 5’→ 3’, es decir, la reacción es un ataque
del hidroxilo de la posición 3’ sobre el fosfato del 5’ del nucleótido entrante.
Está muy favorecida por interacciones no covalentes. Cada nucleótido está mantenido por el
enlace fosfodiéster y por los enlaces de hidrógeno de su pareja de molde. También, el apilamiento
de las bases o “stacking” es favorable para la reacción.
A.Kornberg (1955) purificó la ADN polimerasa I, enzima que caliza el 90% de la actividad en E.
coli. Se requieren dos factores esenciales:
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capaz de adicionar una ADN polimerasa antes de disociarse.
En cuanto a la precisión de las ADN polimerasas: En E. coli se comete un error cada 109 - 1010
nucleótidos. Como el cromosoma tiene 4,7 x 106 pares de basas, se deduce que debe haber un
error cada 100 a 1000 replicaciones.
Las ADN polimerasas poseen actividad exonucleasa 3’ → 5’ que le sirve para realizar una doble
comprobación de cada nucleótido después de ser adicionado. Si se ha introducido un nucleótido
incorrecto la translocación de la polimerasa a la siguiente posición para recibir un nuevo
nucleótido se inhibe. La actividad exonucleasa 3’ → 5’ elimina el nucleótido mal introducido y
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La ADN polimerasa I tiene las dos mismas funciones descritas para la ADN polimerasa II, pero,
además, presenta actividad exonucleasa 5’→3’. Esta nueva actividad exonucleasa permitirá que
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la propia enzima retire el primer de ARN que la primasa ha añadido y rellene este hueco con
desoxirribonucleótidos recién sintetizados, ya que tiene también actividad polimerasa 5’→3’ y
correctora de pruebas (exonucleasa 3’→5’). Por lo tanto, parece que la función de la ADN
polimerasa I es la de retirar los primers y rellenar los huecos.
Como ya se ha comentado, el ADN circular bacteriano tiene un único origen de replicación. Esta
secuencia, denominada ori C, consta de un mínimo de 245 pares de bases. En E. Coli se han
identificado varias secuencias imprescindibles para que se inicie la replicación: cinco repeticiones
de una secuencia de nueve pares de bases llamada caja Dna A, donde se unirá específicamente la
proteína iniciadora Dna A, tres secuencias de 13 pares de bases ricas en A y T y varios sitios
GATC.
La unión de varias copias de la proteína iniciadora DnaA requiere el gasto de ATP y provoca la
apertura de la doble hélice facilitando la incorporación de nuevas proteínas participantes.
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Tras la unión de DnaA se unen al ADN las proteínas helicasa (DnaB) y el cargador de la helicasa
(DnaC). Seis copias de DnaB están asociadas a seis copias de DnaC y cada una de estas esta unida
a una molécula de ATP. El papel de DnaC es permitir la unión de DnaB a la cadena sencilla de
ADN, entonces se hidroliza el ATP y DnaC sale del complejo. La función de DnaB es romper los
puentes de hidrógeno de la doble hélice y así abrir la burbuja de replicación. En cada horquilla de
replicación hay un hexámero de DnaB que unido a la hebra discontinua avanza en direcciones
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opuestas (figura 17 – 8).
Las bandas separadas volverían a unirse, si no fuera porque las proteínas de unión a cadena
sencilla (SSBP) se unen rápidamente a las bandas sencillas impidiendo su rellenamiento. Otra
enzima necesaria para la apertura de la hélice es la ADN girasa, una topoisomerasa que relaja la
tensión que se va acumulando por la apertura de la horquilla. La enzima rompe la cadena de ADN,
libera la tensión y sella de nuevo la cadena.
Una vez que DnaB inicia su movimiento se asocia a ella la enzima pimasa o Dna G, la cual es una
ARN polimerasa que se encarga de sintetizar un cebador o primer de ARN. Este pequeño
fragmento de 10 a 12 ribonucleótidos aporta el 3’ – OH sobre el que la ADN polimerasa
comenzará a incorporar el resto de desoxirribonucleótidos (figura 17 – 10).
La cadena continua solo requerirá una vez la acción de DnaG; sin embargo, la cadena retrasada
necesitará que DnaG añada un primer cada vez que comience un nuevo fragmento de Okazaki.
La cadena que debe crecer en dirección 3’→5’ también sigue creciendo la síntesis en dirección
5’ → 3’, sin embargo, lo hace en pequeños fragmentos rellenando los espacios de la horquilla
“marcha atrás”. La cadena o hebra que crece sin interrupción en dirección 5’→3’ se denomina
hebra líder o continua, mientras que la que crece mediante pequeños fragmentos, llamados de
Okazaki, se denomina cadena retrasada o hebra discontinua. En cada burbuja de replicación habrá
dos horquillas, cada una con una banda continua y otra discontinua.
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A medida que se desplaza el primosoma obliga a intervalos a que la Primasa sintetice un corto
cebador de RNA al que se adiciona a continuación dNTP por medio de la ADN pol III.
Las direcciones de acción de la primasa y la ADN pol III son opuestas al movimiento del
primosoma. Estos fragmentos reciben el nombre de FRAGMENTOS de OKAZAKI.
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La separación de las hebras ocasionada por la progresión de la helicasa conlleva la aparición de
superenrollamientos positivos por delante de la horquilla. Si se tratase de un ADN lineal y corto
el superenrollamiento se podría eliminar por simple rotación de la hélice en sentido contrario, lo
que no es posible en ADNs circulares ni en los eucariotas.
Las topoisomerasas alivian la tensión torsional sin modificar otros aspectos de la estructura. Estas
enzimas también intervienen en procesos de recombinación y posiblemente de transposición.
Topoisomerasas I:
Cuando el fragmento de Okazaki está completo se elimina el cebador de ARN por medio de la
actividad exonucleasa 5’→ 3’ de la ADN pol I. La mella es sellada por la ADN ligasa.
Terminación
Como el ADN procariota es circular, las dos horquillas de replicación terminan por encontrarse
en la región que se conoce como sitio de terminación (Ter). Sobre esta secuencia se unen las
proteínas Tus, que interfieren con las helicasas parando así la replicación. Otras enzimas,
topoisomerasa IV y recombinasa, se encargan de separar los dos cromosomas.
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3 DIFERENCIAS SIGNIFICATIVAS EN LA
REPLICACIÓN DEL ADN EN EUCARIOTAS
Los orígenes de replicación de los organismos eucariotas presentan secuencias muy variadas,
todas son ricas en A – T, debido al menor número de puentes de hidrógeno que deben romperse.
El complejo multiproteico ORC se une a las secuencias y comienza a abrir la hélice. Como ya se
ha descrito, un gran número de enlaces débiles hace que la doble hélice sea muy estable, sin
embargo, estas enzimas consiguen romper fácilmente estas pequeñas secuencia.s
Las células eucariotas tienen miles de orígenes de replicación con el fin de poder replicar todo el
genoma en un tiempo adecuado. No obstante, el uso de muchos orígenes crea un problema de
coordinación de la replicación. Todo el genoma se debe replicar de forma precisa una sola vez en
cada ciclo celular, de modo que ningún gen se quede sin replicar y ninguno lo haga más de una
vez. Para lograr esta precisión durante la replicación del ADN, es necesario dividir este proceso
en dos pasos distintos.
En el primer paso, los orígenes reciben una aprobación para iniciar la replicación. Este paso se
produce en un momento inicial del ciclo celular, cuando un factor permisivo de la replicación se
une a un origen. En el segundo paso, las proteínas de iniciación producen la separación de las
cadenas de ADN y el comienzo de la replicación en cada origen aprobado. La clave está en que
las proteínas de iniciación solo actúan en los orígenes aprobados. A medida que las horquillas de
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replicación se alejan del origen, el factor permisivo se desprende y deja el origen en estado “no
aprobado”, por lo que no puede reiniciarse la replicación hasta que se renueve el permiso. Para
asegurar que el proceso solo se desarrolle una vez en cada ciclo celular, el factor permisivo
únicamente puede actuar una vez que la célula terminó la mitosis y antes de la activación de las
proteínas de iniciación.
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replicación es más lenta.
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En las células somáticas de la mayoría de los tejidos adultos NO existe actividad telomerásica.
Solo está presente en las células germinales, en tejidos fetales y en ciertas células madre. La
telomerasa, sin embargo, está presente en todas las células en proliferación, en especial en las
células tumorales, contribuyendo por tanto a la proliferación continua de los tumores. Se propone
a la inhibición de la actividad telomerasa como un principio terapéutico.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
En ausencia de telomerasa, a medida que las células se van dividiendo y envejeciendo, sufren un
proceso de constante acortamiento de sus telómeros. Cuando se llega a un punto de acortamiento
total que afecta a la afirmación codificante y se ve afectada la información y la célula muere. Es
como un reloj biológico celular.
Las moléculas de ADN son irremplazables, pues solo hay una o dos copias de ADN, mientras que
4.1 MUTACIONES
Como se ha comentado en el apartado anterior, la replicación de las largas moléculas de ADN es
un proceso complejo y muy regulado. La ADN polimerasa solo se equivocan 1 de cada 107 bases
añadidas, gracias a su capacidad correctora.
Sin embargo, los errores en el ADN no solo pueden ser ocasionados por una falta de fidelidad
durante el proceso de replicación, sino que el material genético, aun estando protegido en el
núcleo de la molécula eucariota, sufre daños a lo largo de su vida. Por ello existe una gran
maquinaria celular encargada de revisar el material genético y reparar todos los daños que vaya
detectando. Solo en algunos casos estos sistemas de reparación fallan, y entonces los errores
permanentes se fijan como mutaciones. Una mutación es un cambio heredable en la información
genética.
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El genoma de una célula acumula millares de lesiones durante 24 horas, pero debido a los
mecanismos de reparación del ADN menos de una lesión cada 1000 se transforma en una
mutación.
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cambios espontáneos. A pesar de ello, la tasa de mutación permanece considerablemente baja
gracias a la eficiencia con la que se repara el ADN.
La tabla 17 – 4 recoge cuatro mecanismos generales de la reparación del ADN, que se comentan
a continuación:
La discriminación de la hebra se basa en la acción de una enzima llamada Dam metilasa que
metila ADN en la posición N6 de todas las adeninas presentes en la secuencia 5’GATC.
Inmediatamente después de la replicación hay un corto periodo de tiempo en el que la hebra molde
está metilada y la nueva no. Después se metila la secuencia 5’GATC de la hebra nueva, siempre
que no se necesite una reparación
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Este mecanismo de reparación es complejo. En los seres humanos participan muchos genes.
Primero, un complejo de enzimas (ABC excinucleasas) examina el ADN buscando distorsiones
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en su configuración tridimensional. Cuando se detectan, otras proteínas SSB estabilizan las
cadenas separadas. Después se corta el esqueleto azúcar – fosfato de la cadena dañada a ambos
lados de la lesión y se elimina una parte de la cadena dañada; la ADN polimerasa I rellena el
hueco y la ADN ligasa lo sella. Fallos de este tipo de sistema de reparación aumenta el riesgo de
padecer cáncer.
El dímero de timina es el enlace covalente entre dos residuos de timina adyacentes dentro de una
molécula de ADN, muchas veces catalizado por la radiación ultravioleta o por agentes químicos
mutagénicos, puede ser producto de la acción de un clastógeno.
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La proteína MutL se fija a la secuencia 5’GATC, es una proteína interfase que se localiza entre
MutH y MutL – S formando un trímero.
MutH actúa como endonucleasa con especificidad de secuencia cortando por el lado 5’ de la G
en GATC, marcando la hebra que habrá que reparar. Se degrada la hebra en dirección 3’ – 5’
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hasta la desaparición por acción de una ADN helicasa, SSB y exonucleasa I. A continuación, se
sintetiza la nueva hebra por acción de la ADN polimerasa I y la ADN ligasa.
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En la transcripción se requiere un molde de ADN y un complejo aparato proteico que se encarga
de sintetizar la molécula final, el ARN en este caso, utilizando determinados materiales de
construcción, los ribonucleótidos.
En el momento que se inicia el proceso de replicación del ADN, todas las moléculas de la célula
se replican a la vez, y lo hacen una sola vez durante todo el ciclo celular. La síntesis de ARN, por
el contrario, es un proceso altamente selectivo, ya que no todos los genes van a transcribirse a la
vez durante la vida de la célula.
La célula debe detectar el momento en que necesita transcribir un determinado mensaje, y lo hará
1 LA MAQUINARIA DE TRANSCRIPCIÓN
Las enzimas encargadas de la síntesis de cualquier ARN son las llamadas ARN polimerasas. Estas
enzimas tienen en común con las ADN polimerasas que a partir de un molde de ADN sintetizan
una cadena de nucleótidos en sentido 5’→3’ y requieren Mg2+ y Zn2+.
La RNA polimerasa cataliza el ataque nucleofílico del grupo 3’-OH de la cadena creciente de
RNA al átomo de fósforo en posición 5’ del ribonucleótido trifosfato que conduce a la formación
de un nuevo enlace fosfodiéster y a la liberación de pirofosfato.
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En eucariotas se han identificado varios tipos de ARN polimerasas pero las células procariotas
poseen un único tipo de ARN polimerasa, que es una enzima compleja formada por varias
subunidades.
Como dirección de escritura del ADN se adoptó por convenio el sentido 5’→3’. Asimismo,
cuando se trata de cadenas dobles de ADN la cadena superior se escribe 5’→3’ y la inferior
3’→5’. Teniendo en cuenta la definición de gen, el origen se toma como punto donde comienza
la transcripción y terminación por el punto donde se acaba.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La transcripción comienza en el extremo 5’ y finaliza en el 3’ terminal. El desplazamiento sobre
el gen es 5’→3’ y se denomina avance. Por lo que la cadena inferior es la cadena molde en la
transcripción, por lo que la cadena superior del ARN tiene la misma secuencia de ARN a
diferencia de los uracilos.
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2 TRANSCRIPCIÓN EN PROCARIOTAS
Las enzimas encargadas de transcribir los genes deben reconocer alguna señal en el cromosoma
que indique donde comienza y donde termina el mensaje. La unidad de transcripción de un gen
consta de tres regiones: un promotor, una secuencia codificante y una señal de terminación.
Existen secuencias en el ADN que sirven de señal de comienzo para que la ARN polimerasa se
fije a una de las dos hebras de ADN: son los promotores. Estas secuencias están presentes en una
posición inmediatamente anterior a la región codificante y son las secuencias de ADN a las que
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
se ensamblan los complejos de transcripción.
De la misma forma. La enzima debe recibir una señal que le indique donde termina el mensaje.
La señal de terminación se transcribe y, solo después de ser copiada, la maquinaria de
transcripción deja de transcribir el mensaje.
Dado que la transcripción de cada gen u operón se inicia independientemente, tanto en bacterias
como en eucariotas hay muchos diferentes. Los promotores se encuentran en el extremo 5’
terminal del lugar de iniciación de la transcripción.
Normalmente el primer nucleótido que se transcribe es una purina. En la región -10 respecto del
origen, la mayoría de los genes poseen una secuencia próxima a TATAAT, que se denomina caja
TATA o de Prinbnow.
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Reservados todos los derechos.
Los genes cuyos promotores se ajustan exactamente a la secuencia de consenso son muy pocos.
En particular el ajuste a la caja TAT es muy débil.
Otras secuencias promotoras como las de los operones de ARNr se parecen mucho a la secuencia
de consenso y se transcriben eficazmente. Estas secuencias sugieren que la secuencia de consenso
es una descripción del promotor más eficaz de la holoenzima ARN polimerasa.
La RNA polimerasa se une a una región del DNA que contiene la caja TATA y la región -35. La
secuencia protegida es de unos 70 pares de bases desde la posición -50 hasta la +20, lo que
concuerda con el tamaño de la holoenzima RNApol.
La enzima se une preferentemente a una cara de la doble hélice e interacciones con varios
nucleótidos de los surcos mayores. Estas interacciones son preferentes en las regiones -10 y -35.
La distancia de 17 pares de bases entre estas dos regiones coincida con dos vueltas de DNA.
Para que se produzca la interacción simultánea con las dos regiones con secuencia consenso la
molécula de DNA se debe retorcer de un modo similar a como lo hace el DNA sobre las histonas
para formar el nucleosoma.
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2.1.1 INICIACIÓN
La ARN polimerasa (figura 18 – 4) es una enzima multimérica que se asocia al ADN y se desliza
a lo largo de la molécula en busca de la secuencia promotora. La capacidad para reconocer a esta
secuencia reside en una de sus subunidades, llamada factor sigma (σ). Este factor permite que la
ARN polimerasa se una con mayor afinidad al ADN, entonces desarrolla un tramo corto de la
doble hélice y comienza la transcripción, incorporando el nucleótido en posición +1. Una vez que
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se han sintetizado los primeros nucleótidos, la subunidad σ ya no es necesaria y se suelta de la
maquinaria de transcripción. La subunidad σ disminuye la afinidad de la polimerasa por las
secuencias no promotoras y al mismo tiempo aumenta la afinidad por los promotores específicos.
2.1.2 ELONGACIÓN
El primer nucleótido de un ARN tiene tres fosfatos unidos a la posición 5’ y formará un enlace
fosfodiéster 3’→5’ con el segundo ribonucleótido.
La propia enzima irá desenrollando la doble hélice de ADN a medida que va avanzando la
maquinaria, formando una burbuja de transcripción de unos 18 nucleótidos. La doble hélice de
ADN volverá a cerrarse a medida que se va realizando la copia de ARN.
Durante la transcripción se formarán tramos de hélices híbridas entre ARN sintetizado y ADN
molde con una estructura secundaria intermedia entre la hélice A y B del ADN.
La ARN polimerasa continuará la transcripción del gen hasta que, en su recorrido, encuentre una
señal de terminación. La ARN polimerasa es una enzima “procesiva” es decir, que cataliza varios
ciclos de la misma reacción catalítica (formación de un enlace fosfodiéster) sin disociarse del
sustrato o del molde tras cada reacción catalítica. Esto es muy importante ya que dicha enzima
podrá catalizar cientos de reacciones de unión de un ribonucleótido a la cadena naciente sin
separarse del molde y sin necesidad, por tanto, de comenzar de nuevo.
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La proteína que se une en primer lugar es NusA que se une a la ARN polimerasa e impide que se
reasocie el factor sigma.
La ARN polimerasa está en contacto con una región de ADN de una longitud aproximada de 30
pared durante la etapa de la síntesis de ARN. Los 18 pares de bases de AND están desarrollados
o fundidos de forma que la cadena molde queda expuesta a la enzima.
Además 12 nucleótidos de la cadena molde están apareados con el ARN recién sintetizado para
formar una hélice mixta ARN – ADN. Forma una única rosca de hélice.
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Reservados todos los derechos.
2.1.3 TERMINACIÓN
Una vez que la ARN polimerasa ha copiado la secuencia de terminación que indica el final del
mensaje, la ARN polimerasa se descuelga del ADN finalizando la transcripción del ARN. Este
proceso requiere la colaboración de determinados factores proteicos, como el factor rho (ρ) de
bacterias:
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ARNm recién formado del complejo ternario del que forma parte (ARN pol + ARN +
ADN)., valiéndose para ello de la energía obtenida de la hidrólisis de ATP. No forma una
estructura de horquilla como los terminadores independientes del factor Rho.
o El factor Rho está presente en el citosol como un hexámero. Es una ATPasa muy
activa con elevada afinidad por RNA monocatenario y que además puede actuar
como una helicasa RNA-DNA.
Ambas formas de terminación pueden explicarse como una desestabilización de la doble hélice
híbrida ARN – ADN, que deja libre el ARN recién sintetizado.
Existen diferentes ARN polimerasas según la naturaleza del ARN que se transcribe, es
decir, existe una gran especialización, de manera que cada enzima solo va a sintetizar un
tipo específico de ARN.
Existen tres clases de ARN polimerasas, denominadas I, II y III. Todas poseen dos
subunidades grandes y entre 12 – 15 subunidades pequeñas. Estas subunidades grandes
son homólogas con las b y b’ de la ARN polimerasa de E.coli. Las subunidades pequeñas
son similares a las subunidades de la E. coli.
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o En eucariotas los genes nucleares son transcritos por tres RNA polimerasas, pero
además hay que contar con las polimerasas mitocondriales y las de cloroplastos
si es en vegetales.
El control de la iniciación es un proceso mucho más regulado en eucariotas, ya que los
genes están muy distanciados y existen muchos tramos de ADN con elementos
reguladores. Estos elementos reguladores son secuencias donde se unirán factores de
transcripción adicionales, conocidos como factores de transcripción específicos por
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diferenciarlos de los factores de transcripción generales. La ARN polimerasa II, a
diferencia de la ARN polimerasa procariota, no es capaz de iniciar la transcripción si solo
está acompañada de los factores de transcripción generales.
Los diferentes ARNm se transcriben generalmente por la acción de la ARN polimerasa
II. Se pueden generalizar dos tipos de promotores eucarióticos para esta polimerasa en
función de sus regiones reguladoras.
o Caja TATA (TATAAAA) localizada entre 25 o 30 pares de bases antes del sito
de inicio del ARNm en eucariotas superiores. La distancia es mayor en levaduras.
Es el punto de unión de TFIID que se requiere para la unión de la ARN
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Factores de transcripción generales.
2.2.1 INICIACIÓN
Los factores de transcripción generales (denominados RFIIA, TFIIB, TFIID, etc.) se unen al
2.2.2 ELONGACIÓN
Posteriormente al inicio de la transcripción se produce la fosforilación de una porción de la ARN
polimerasa por otros factores (TFIIH), lo que permite que la ARN polimerasa deje de unirse
fuertemente al promotor y continue la transcripción del gen: se produce un cambio
conformacional den la ARN polimerasa debido a la fosforilación del extremo C – terminal de la
enzima, que es catalizada por la subunidad del factor de transcripción TFIIH con la actividad
quinasa.
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proteínas son los factores que adicional el cap en el extremo 5’ del ARNm, factores de
poliadenilación y factores de splicing (corte de intrones y empalme de exones), que se describirán
más adelante.
2.2.3 TERMINACIÓN
Este proceso es poco preciso en los organismos eucariotas, ya que no hay señales de terminación
exactas o consenso, tan y como ocurre en procariotas. La ARN polimerasa sigue la transcripción
del gen incluso en la secuencia de no codificante de la porción 3’. Posteriormente el ARN ya
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separado de la cadena de ADN será procesado por otras enzimas que modifican el extremo 3’.
Una vez descolgada la ARN poliimerasa fosforilada de la cadena de AND, se eliminarán los
grupos fosfato mediante una fosfatasa, que dejará preparada de nuevo a la enzima para iniciar una
nueva ronda de transcripción.
Los ARN transcritos en eucariotas van a sufrir una serie de modificaciones en el proceso de
maduración que dejarán preparado el ARN para ser exportado al citoplasma, donde podrá realizar
su función, dependiendo del tipo de ARN del que se trate.
Los extremos 3’ terminales de las moléculas maduras de RNA se originan por procesamiento no
por la terminación de la transcripción.
Solo se conocen tres RNA polimerasas eucarioticas que responden a un agrupamiento de Timinas
sobre la cadena no molde, sin existir sistemas palindrómicos.
La cola de poli(A) es importante para la exportación nuclear y la estabilidad del ARNm. La cola
es acortada a lo largo del tiempo, y cuando es demasiado corta, el ARNm es enzimáticamente
degradado. Sin embargo, en algunos tipos de células, el ARNm con colas poli(A) cortas es
guardado para su posterior activación mediante una re-poliadenilación en el citosol. En contraste,
cuando la poliadenilación ocurre en las bacterias, ésta promueve la degradación del ARN. Este es
también el caso de algunas moléculas de ARN no codificante en eucariotes.
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Incluso los ARN que expresan sus funciones como tales moléculas (ARNr, ARNt y ARN de
interferencia) necesitan este proceso de maduración.
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Un transcrito primario o pre – ARNm (copia exacta de la secuencia de ADN), antes de convertirse
en un ARNm, va a sufrir una modificación se sus extremos 5’ y 3’ con el fin de incrementar su
estabilidad e impedir su degradación (figura 18 – 7):
Adición del cap: la primera modificación que sufre un pre – ARNm se realiza
simultáneamente a la transcripción. A medida que se va descolgando el extremo 5’ del
ARN de la doble hélice de ADN se añade un nucleótido modificado (7 – metil –
guanosina) que hace la función de caperuza o cap. Esta modificación tiene gran
importancia en la iniciación de la síntesis de proteínas.
Una vez modificados sus extremos, o incluso de forma simultánea, el pre ARNm seguirá su
proceso de maduración en el núcleo, en una etapa denominada splicing, donde se retirarán las
secuencias no codificantes (intrones) dejando únicamente las secuencias codificantes (exones)
unidas. Este ARN sin intrones y con el cap en el extremo 5’ y la cola de poli (A) en el 3’ será
exportado al citoplasma como ARNm maduro.
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Se conoce como traducción el conjunto de procesos bioquímicos que transforman la información
codificada en el ARNm maduro en proteínas activas.
1 CÓDIGO GENÉTICO
Para poder descodificar un lenguaje de cuatro letras (A, C, G, T) y convertirlo en un lenguaje con
20 letras (aminoácidos), resultaba evidente la idea de que las cuatro letras de los ácidos nucleicos
debían ser leídas en grupos.
Crick acuñó el término “código degenerado” tomándolo prestado de la física cuántica, que
describe de esta manera los múltiples estados físicos con un mismo significado. Experimentos
posteriores demostraron que los nucleótidos se leen en grupos de tres en tres (siendo cada grupo
o triplete un codón) y que cada una de las posibles combinaciones se explica porque varios
codones dan lugar al mismo aminoácido: el código genético es redundante pero no es ambiguo
porque ningún codón codifica dos aminoácidos diferentes.
El código genético es universal, es decir, es el mismo para todas las especies, aunque se ha
encontrado alguna excepción, principalmente en el ADN mitocondrial, con diferentes
correspondencias entre determinados codones y aminoácidos.
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2 SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
Son enzimas que catalizan la unión covalente entre el extremo 3’ – OH del ARNt (que siempre
corresponde a una A) y el grupo α – COOH del aminoácido que va a carga. Esta reacción, que
sería energéticamente desfavorable, debe acoplarse a la hidrólisis de una molécula de ATP. La
reacción final sería la siguiente:
En realidad, se produce en dos pasos sucesivos: primero, la activación del aminoácido como
aminoacil – AMP liberando 1 PPi del enlace fosfoanhídrido, y posteriormente la unión de esye
aminoácido activado al extremo 3’ – OH del ARNt mediane la liberación de AMP.
Un aminoacil tRNA sintetasa no solo ha de ser específica para un solo aminoácido sino también
para un cierto tRNA. La discriminación entre varias docenas de tRNA es importante para la
fidelidad global de la síntesis de la proteína como la distinción de los aminoácidos. “El segundo
código genético”.
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2.2 LOS RIBOSOMAS SON MÁQUINAS DE TRADUCIR MENSAJES
Los ribosomas son complejos formados por ARN y proteínas. Cada ribosoma consta de dos
subunidades (la grande y la pequeña), cada una con un número y clase de ARNr correspondiente,
La subunidad grande cataliza la formación del enlace peptídico que une a los aminoácidos entre
sí formando una cadena polipeptídica. El ribosoma tiene tres sitios que pueden ser ocupados por
ARNt:
El sitio A (de aminoácidos), donde solo podrá unirse un aminoacil – ARNt, es decir, un
ARNt portando un único aminoácido.
El sitio P (de péptido), donde entrará el peptidil – ARNt, molécula de ARNt con el péptido
naciente unido.
Y el sitio E (de exit), donde encajará el factor de liberación o terminación.
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bacterias se denomina región Shine – Dalgarno, y es una secuencia consenso que delimita el
comienzo de la región codificante. En eucariotas requiere la ayuda de factores de iniciación que
reconocen el extremo cap del ARNm.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
completamente erróneo. La pauta o marco de lectura correcta debe estar marcada por el codón de
iniciación.
La subunidad pequeña 40S del ribosoma debe reconocer el cap en el extremo 5’ del
ARNm.
Existe una secuencia próxima al AUG de iniciación, denomina secuencia Kozak, cuya
función es ayudar a los factores de iniciación de la traducción a encontrar el AUG.
Participa la cola de poli (A), que parece intervenir en el plegamiento del ARNm
favoreciendo la unión del ribosoma al extremo 5’.
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2. Formación del enlace peptídico. En la formación del primer enlace peptídico encontramos
en el sitio P del ribosoma al ARNt inciador (Met – ARNt en eucariotas o formil – Met –
ARNt en procariotas). Si ya se han formado otros enlaces anteriormente, encontramos en
el sitio P al peptidil – ARNt, que es la cadena de aminoácidos sintetizada, unida al último
ARNt entrante (Figura 18 – 14a). En los dos casos tenemos un grupo carboxilo unido al
ARNt del sitio P (el grupo carboxilo de Met/ formil – Met o el grupo carboxilo terminal
de la cadena de aminoácidos). Este grupo carboxilo se separa del ARNt del sitio P y forma
un enlace peptídico con el grupo amino del aminoácido entrante, que se encuentra unido
a otro ARNt en el sitio A (Fig 18 – 14b). la catalización de este enlace peptídico la lleva
Los pasos descritos en la elongación a repetir sucesivas veces hasta que el mensaje con el codón
de terminación proporcione la señal para finalizar la síntesis de proteínas.
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Reservados todos los derechos.
A partir tanto de células eucariotas como procariotas se pueden aislar grandes agrupamientos de
10 a 100 ribosomas que son muy activos en la síntesis de proteínas. Estos agrupamientos se llaman
Polisomas, y se pueden fragmentar por la acción de enzimas como la ribonucleasa. La hebra
conectora es mRNA que es traducida simultáneamente por muchos ribosomas próximos unos a
los otros.
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Su incapacidad de inhibir la síntesis de proteínas en eucariotas da idea de las diferencias entre los
procesos en procariotas y eucariotas.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
A del ribosoma en donde puede participar en la formación del enlace peptídico. El producto de
esta reacción en lugar de ser translocado al sitio P, se disocia del ribosoma produciendo la
terminación prematura de la cadena.
Hasta el 50% de proteínas eucariotas el grupo amino del residuo amino-terminal es acetilado
después de la traducción. Los residuos carboxilo-terminales también están a veces modificados.
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7 CARBOXILACIÓN DE PROTEÍNAS
En restos de ácido
glutámico y
aspártico.
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9 GLICOSILACIÓN
Los residuos afectados son restos de ácido aspártico, mediante enlaces N-glucosídico, o serina o
treonina, mediante enlaces O- glucosidicos.
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11 MODIFICACIONES PROTEOLÍTICAS
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Muchas proteínas se sintetizan como precursores de gran longitud que son inactivos y que después
por cortes proteolíticos generan las proteínas activas: Ej.: Insulina o enzimas digestivas.
Las proteínas ya plegadas se pueden entrecruzar posteriormente mediante enlaces del tipo puentes
disulfuro entre restos de cisteína de ambas cadenas.
El elemento más importante en los sistemas de destino es una corta secuencia de aminoácidos en
el extremo amino de un polipéptido recién sintetizado, denominado péptido señal.
Este péptido dirige a una proteína a su localización específica dentro de la célula y se elimina
cuando la proteína ha alcanzado su lugar de destino.
Se ha determinado más de 100 secuencias señal en este grupo de proteínas, con distintas
longitudes (13 o 36 residuos) pero todas poseen una secuencia con aminoácidos hidrofóbicos,
entre 10 y 15 restos.
Además, poseen uno o más aa. cargados positivamente y una corta secuencia en el C-terminal
relativamente polar y con cadenas laterales cortas.
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El oligosacárido núcleo se forma por adición sucesiva de unidades de monosacárido. Los primeros
pasos (1,2) tienen lugar en la cara citosólica del retículo endoplásmico (RE). La translocación
desplaza el oligosacárido incompleto a través de la membrana. Los precursores que aportan
residuos de manosa y glucosa adicionales al oligosacárido en formación en la luz del RE son
derivados del dolicol fosfato. El oligosacárido núcleo es transferido del dolicol fosfato a un
residuo de Asn de la proteína en la luz del RE.
El dolicol fosfato es liberado translocado y el pirofosfato vuelve a estar en la cara citosólica del
RE (8).
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Recordemos que las proteínas realizan diversas funciones como son: la señalización, defensa,
división celular, metabolismo y, la importante en este caso, la expresión genética.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
La regulación o control de la expresión génica trata de las reglas y mecanismos que determinan
que en cada célula solo se expresen unos genes específicos. Sin duda se trata de un complejo
sistema de control, pues dado que todas las células poseen la misma carga genética procedente
del mismo cigoto. Sin embargo, cada tejido va a expresar unos genes específicos que codifican
proteínas que van a realizar una determinada función.
¿Cómo controla la célula, o un organismo pluricelular, cuándo debe expresar unos genes y no
otros?
Tanto en bacterias como en los organismos eucariotas toda la información génica está contenida
en el ADN; sin embargo, se puede diferenciar los genes estructurales de los reguladores. Los
genes estructurales tienen un papel esencial en el metabolismo o formación de estructuras de la
célula.
Dentro de los genes estructurales podemos encontrar el grupo de genes constitutivos que son
aquellos que son fundamentales para las funciones vitales de la célula, por tanto, se expresarán de
manera constitutiva en todos los tejidos de un organismo.
Por otro lado, encontramos los genes reguladores, cuyos productos (tanto ARN como proteínas)
tienen la función de controlar la expresión de estos genes estructurales, específicos o constitutivos.
Así, dentro de los genes que se expresan o reprimen ante ciertas señales distinguimos: los genes
regulables, los genes inducibles y los genes represibles o reprimibles.
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1. Control pretranscripcional.
2. Control de la transcripción.
3. Control del procesao del ARNm.
4. Transporte de ARNm al citoplasma.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
5. Estabilidad del ARNm.
6. Control traduccional de la expresión génica.
7. Control sobre la estabilidad de las proteínas y modificaciones post – traduccionales de las
proteínas.
La eucromatina es menos compacta y se corresponde con regiones del genoma que están
disponibles para la transcripción.
La heterocromatina se corresponde con regiones del genoma fuertemente compactas y
que pueden estar inaccesibles al aparato de transcripción.
Las histonas pueden ser modificadas en su extremo N – terminal y las distintas modificaciones
que sufren producen distinta compactación de la cromatina, activando o reprimiendo la expresión
de genes. La unión en el ADN de proteínas activadoras de la transcripción recluta a las enzimas
encargadas de modificar a las histonas para que la cromatina sea transcripcionalmente activa, es
el caso de enzimas acetilasas.
Las acetilaciones se producen en los residuos de lisina de los extremos amino – terminales de las
histonas, reduciendo la carga positiva y por lo tanto su afinidad de unión al ADN cargado
negativamente. La desacetilación provoca el efecto contrario.
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1.1.2 METILACIÓN DEL ADN
La metilación de restos de citosina, especialmente en sitios promotores, dificultan la transcripción.
Las metilaciones se producen en secuencias que se agrupan en “islas” ricas en GC, con frecuencia
dentro o cerca de regiones reguladoras de la transcripción.
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Se relaciona con la velocidad de inicio de la transcripción y elongación. Se resume en el control
de cuándo y cómo se transcribe un gen.
Promotores de la transcripción.
Presencia de secuencias potenciadoras de la transcripción o enhancers.
Interacción de proteínas activadores e inhibidoras que se unen a secuencias específicas
del ADN.
Un promotor es una secuencia reconocida por la ARN polimerasa para comenzar la transcripción.
Se encuentra inmediatamente antes de los genes estructurales.
Los promotores más frecuentes son del tipo CAAT y TATA, denominados motivos o cajas.
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Son secuencias del DNA que pueden localizarse corriente arriba o abajo del gen a regular situadas
a miles de pares de bases con respecto al promotor.
Las zonas de ADN sobre las cuales se ejercen acciones activadoras son llamadas potenciadoras o
enhancers. En términos generales una secuencia reguladora potenciadora regula la frecuencia con
la que se realiza el proceso transcripcional.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Para un mismo gen pueden existir varias secuencias reguladoras como también puede darse la
existencia de acciones opuestas (silenciadores de la transcripción).
Los ARN polimerasas de células eucariotas no hacen contacto directo con el ADN promotor, sino
que son reclutados hacia este por complejos de proteínas específicas para cada tipo de ARN
polimerasa. Por ejemplo, TFIID para la ARNpol II.
Este conjunto conformado por ADN, factores de transcripción generales y ARN polimerasa II se
denomina complejo de transcripción basal y actúa como objeto de activación o represión
transcripcional por acción de proteínas regulatorias específicas de tejido.
Una vez iniciada la transcripción, la velocidad del movimiento de la RNA polimerasa puede
reducirse e incluso detenerse por periodos breves. Se asume que esto tiene que ver con el
encuentro de la polimerasa con determinadas secuencias del ADN llamadas “piedras del camino”
por su cualidad de detener la polimerasa. Se sabe que determinados factores de transcripción
favorecen el paso de la enzima por estos sitios y otros provocan la liberación del aparato de
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
sintetizada.
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En la mayor parte de los casos, la diferencia entre los productos de splicing alternativo sobre un
mismo ARN difieren en regiones claves que pueden afectar a la proteína en propiedades como:
la compartimentalización, el tipo de ligando al que se unirá, la afinidad con que lo hará y si es una
enzima su actividad catalítica.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
SPLICING ALTERNATIVO:
En el ser humano este es el caso de las apoproteínas B100 y B48. Ambas son codificadas por el
mismo gen y contienen en el ARNnh los mismos exones e intrones. Cuando el gen se expresa en
el hepatocito, el ARNnh no sufre ningún tipo de modificación y el RNAm procesado se traduce
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
certeza, los estudios actuales sugieren que la célula puede controlar que un ARNnh sea o no
procesado. Este es el caso de la porción proteica de una ribonucleoproteína, la U1A.
Cuando ésta se expresa en cantidades altas se puede ligar a su propio ARNnh e inhibir su
poliadenilación de modo que el mensajero resultante tiene baja estabilidad y disminuye así su tasa
de expresión
La longitud de la cola de poli A está directamente relacionada con la estabilidad citosólica del
ARNm y esto se asocia a la protección que ejerce esta secuencia al competir con el resto de la
cadena por la unión a nucleasas citosólicas. La cola de poli A se halla ligada a una proteína
llamada “Proteína de Enlace de Poli A” (PEPA) que protege a la secuencia de la acción de
nucleasas generales y la sensibiliza para nucleasas específicas de poli A. A medida que estas
nucleasas actúan, la cola de poli A se acorta hasta que ya no puede ligar a PEPA y el ARNm se
vuelve susceptible a las nucleasas generales y es rápidamente degradado.
Como ejemplo de estos transcriptos hallamos a la mayoría de los ARNm para factores de
crecimiento (caracterizados por una vida media muy corta).
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Existe un control general, global o inespecífico de la traducción ejercido sobre los factores del
complejo de traducción. Por otro lado, se conocen casos específicos o control particular de la
traducción de ciertos ARNm.
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1.6.1 CONTROL GENERAL DE LA TRADUCCIÓN
Todos los ARNm celulares tienen 5’-cap con la guanosina metilada y esa estructura aumenta
la traducción. Cuando por alguna razón de disposición espacial del extremo 5’ del ARN el cap
no queda disponible para su interacción con los factores de iniciación la traducción disminuye su
velocidad. Puede controlarse también la actividad de los factores de iniciación. La actividad de
estos factores se controla por fosforilación. Esta fosforilación a su vez responde a diversos
estímulos que pueden ser fisiológicos (factores activadores de cascadas de quinasa) o
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Los mecanismos que controlan la estabilidad proteica no están bien comprendidos, aunque se
sabe que en las proteínas que en el extremo amino terminal son ricos en metionina, serina, alanina,
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
treonina, valina y glicina son estables por más de 20hs en cambio los que son ricos en fenilalanina,
ácido aspártico, lisina y arginina tienen una vida menor a 5’. Esto se llama “Regla del Extremo
N”. Las últimas secuencias mencionadas se llamas “Secuencias PEST” y son altamente sensibles
al reconocimiento por ubiquitina y con ello su degradación por el proteasoma.
Algunos mensajeros codifican para poliproteínas. Éstas son productos transitorios que se escinden
en varias proteínas, cada una con estructura y función diferente. Un ejemplo de poliproteína es el
Todas estas modificaciones pueden ser controladas por señales internas (pH intracelular, actividad
de chaperonas moleculares) o externas (cascadas de quinasa que controlan fosforilaciones).
Cualquier problema en estas modificaciones post-traduccionales puede desencadenar alteraciones
en la fisiología de la célula.
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No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Reservados todos los derechos.
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Conceptos:
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expresión génica.
transcripción,
traducción
y
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