Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

Practica Análisis de Secuencias para ALFA HEMOGLOBINA de Reptiles,

Aves y Mamíferos.
Comparación de secuencias para alfa hemoglobina.
1. ¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca
“alpha hemoglobin”?
R// Aparecen 7.275 resultados de secuencias en la base de datos de UniProt.
2. Los animales que se van a usar para Reptil: Lagartija (Lizard), Camaleón
(Chameleon).
¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Lizard alpha
hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Lizard alpha hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 16 resultados.
Secuencia 1: Organismo Varanus albigularis (White-throated monitor) (Varanus
exanthematicus albigularis)
>sp|P18981|HBA2_VARAL Hemoglobin subunit alpha-2 OS=Varanus albigularis
OX=8558 PE=1 SV=2
VLTEDDKNHVKGLWAHVHDHIDEIAADALTRMFLAHPASKTYFAHFDLSPDNAQI
KAHGK
KVANALNQAVAHLDDIKGTLSKLSELHAQQLRVDPVNFGFLRHCLEVSIAAHLHD
HLKAS
VIVSLDKFLEEVCKDLVSKYR

¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Turtle alpha

hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Turtle alpha hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 38 resultados.
Secuencia 2: Organismo Caretta caretta (Loggerhead sea turtle)
>sp|Q10732|HBA_CARCR Hemoglobin subunit alpha-A OS=Caretta caretta
OX=8467 GN=HBAA PE=1 SV=1
VLSSGDKANVKSVWSKVQGHLEDYGAETLDRMFTVFPQTKTYFSHFDVHHGST
QIRSHGK
KVMLALGDAVNHIDDIATALSALSDKHAHILRVDPVNFKLLSHCLLVVVARHHPTLF
TPD
VHVSLDKFMGTVSTVLTSKYR

3. Los animales que se van a usar para Aves: Cuervo (Crow) y Búho (Owl).
¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Crow alpha
hemoglobin”?
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

R// Cuando se hace la búsqueda de “Crow alpha hemoglobin” en la base de datos

UniProt, aparecen 8 resultados.
Secuencia 1: Organismo Corvus cornix (hooded crow)
>tr|I1Y912|I1Y912_9CORV Hemoglobin subunit alpha-A OS=Corvus cornix
OX=181096 PE=2 SV=1
MVLSPNDKSNVKAVFGKIGGQAEEYGAETLERMFVTYPQTKTYFPHFDLGKGSA
QVKGHG
KKVAAALVEAANHIDDIAGALSKLSDLHAQKLRVDPVNFKLLGQCFLVVVACHNPS
LLTP
EVHASLDKFLCAVGTVLTAKYR

¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Owl alpha

hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Owl alpha hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 10 resultados.
Secuencia 2: Organismo Athene cunicularia (Burrowing owl) (Speotyto cunicularia)
>tr|A0A663N1S5|A0A663N1S5_ATHCN Hemoglobin subunit alpha-A OS=Athene
cunicularia OX=194338 GN=LOC113485608 PE=3 SV=1
MVLSANDKTNVKGVFAKIGGHAEEYGAETLERMFATYPQTKTYFPHFDLSHGSA
QIKAHG
KKVAAALVEAVNHIDDIAGALSKLSDLHAQKLRVDPVNFKLLGHCFLVVMAIHHPA
ALTP
EVHASLDKFLCAVGNVLTAKYR

4. Los animales que se van a usar para para Mamíferos: Vaca (Cow) y
Caballo (Horse).
¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Cow alpha
hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Cow alpha hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 7 resultados.
Secuencia 1: Organismo Hydrodamalis gigas (Cow)
>tr|A0A481WNT7|A0A481WNT7_HYDGI Hemoglobin subunit alpha
OS=Hydrodamalis gigas OX=63631 GN=HBA PE=3 SV=1
MVLSAEDKTNVKTFWGKLGAHTAEYGGEALERMFLSFPTTKTYFPHFDMKHDSD
QIKAHG
KKVADALTRAVGHLDDLPGTLSELSDLHAHKLRVDPINFKLLSHCLLVTLSGHLPE
DFTP
PVHASLDKFLSNVSTVLTSKYR
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Horse

alpha hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Horse alpha hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 31 resultados.
Secuencia 2: Organismo Equus caballus (Horse)
>sp|P01958|HBA_HORSE Hemoglobin subunit alpha OS=Equus caballus
OX=9796 GN=HBA PE=1 SV=2
MVLSAADKTNVKAAWSKVGGHAGEYGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLSHGSA
QVKAHG
KKVGDALTLAVGHLDDLPGALSNLSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLSTLAVHLPN
DFTP
AVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR

5. Alineamiento de secuencias en CLUSTALW

tr|I1Y912|I1Y912_9CORV
tr|A0A663N1S5|A0A663N1S5_ATHCN
sp|Q10732|HBA_CARCR
tr|A0A481WNT7|A0A481WNT7_HYDGI
sp|P01958|HBA_HORSE
sp|P18981|HBA2_VARAL
MVLSPNDKSNVKAVFGKIGGQAEEYGAETLERMFVTYPQTKTYFPHFDLG
MVLSANDKTNVKGVFAKIGGHAEEYGAETLERMFATYPQTKTYFPHFDLS
-VLSSGDKANVKSVWSKVQGHLEDYGAETLDRMFTVFPQTKTYFSHFDVH
MVLSAEDKTNVKTFWGKLGAHTAEYGGEALERMFLSFPTTKTYFPHFDMK
MVLSAADKTNVKAAWSKVGGHAGEYGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLS
-VLTEDDKNHVKGLWAHVHDHIDEIAADALTRMFLAHPASKTYFAHFDLS
**: ** :** :.:: : : ..::* *** .* :****.***:

tr|I1Y912|I1Y912_9CORV
tr|A0A663N1S5|A0A663N1S5_ATHCN
sp|Q10732|HBA_CARCR
tr|A0A481WNT7|A0A481WNT7_HYDGI
sp|P01958|HBA_HORSE
sp|P18981|HBA2_VARAL
KGSAQVKGHGKKVAAALVEAANHIDDIAGALSKLSDLHAQKLRVDPVNFK
HGSAQIKAHGKKVAAALVEAVNHIDDIAGALSKLSDLHAQKLRVDPVNFK
HGSTQIRSHGKKVMLALGDAVNHIDDIATALSALSDKHAHILRVDPVNFK
HDSDQIKAHGKKVADALTRAVGHLDDLPGTLSELSDLHAHKLRVDPINFK
HGSAQVKAHGKKVGDALTLAVGHLDDLPGALSNLSDLHAHKLRVDPVNFK
PDNAQIKAHGKKVANALNQAVAHLDDIKGTLSKLSELHAQQLRVDPVNFG
.. *::.***** ** *. *:**: :** **: **: *****:**

tr|I1Y912|I1Y912_9CORV
tr|A0A663N1S5|A0A663N1S5_ATHCN
sp|Q10732|HBA_CARCR
tr|A0A481WNT7|A0A481WNT7_HYDGI
sp|P01958|HBA_HORSE
sp|P18981|HBA2_VARAL
LLGQCFLVVVACHNPSLLTPEVHASLDKFLCAVGTVLTAKYR
LLGHCFLVVMAIHHPAALTPEVHASLDKFLCAVGNVLTAKYR
LLSHCLLVVVARHHPTLFTPDVHVSLDKFMGTVSTVLTSKYR
LLSHCLLVTLSGHLPEDFTPPVHASLDKFLSNVSTVLTSKYR
LLSHCLLSTLAVHLPNDFTPAVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR
FLRHCLEVSIAAHLHDHLKASVIVSLDKFLEEVCKDLVSKYR
:* :*: :: * :.. * .*****: * . *.:***

A. ¿Cuántos aminoácidos se mantienen iguales en las 6 secuencias de α

hemoglobina/β hemoglobina de su alineamiento?

R// Al alinear las 6 secuencias en CLUSTALW, y contar los asteriscos debajo de

cada secuencia, se determina que se mantienen iguales 57 aminoácidos en las alfa
hemoglobinas.

B. ¿Qué porcentaje de los aminoácidos están conservados en todas las 6 α

hemoglobina/β hemoglobina?
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

R// Los aminoácidos iguales en las 6 secuencias son 57, siendo estos los
conservados, las secuencias miden entre 142 AA y 141 AA (las dos primeras miden
141), si calculamos el porcentaje de conservación nos da un 40.1%.

C. ¿Se presentaron regiones específicas de la secuencia α hemoglobina/ β

hemoglobina que están especialmente conservadas?

R// Las regiones específicas conservadas, son aquellas donde se ven 3 o más
aminoácidos seguidos uno del otro, al comparar las 6 secuencias en CLUSTALW,
vemos que hay 7 regiones especialmente conservadas.

D. ¿Hubo aminoácidos que aparecieron con mayor frecuencia en las regiones

conservadas de la proteína que en las regiones no conservadas? ¿de ser así,
que aminoácidos fueron? Haga uso de la tabla de referencia con el código de
asignación de aminoácidos.

R// De las 7 regiones conservadas, la Lisina se repite 5 veces en cada secuencia

de las regiones conservadas. En la región no conservada el aminoácido que más
se repite es la Alanina 10 veces.

E. Si encontró aminoácidos conservados con mayor frecuencia en su reporte

de alineamiento, ¿De qué tipo eran, polar, no polar o con alguna carga
específica?
1
En los aminoácidos conservados fue la Leucina (L) el que más se encuentra,
siendo de tipo no polar.

6. Hacer una tabla con los porcentajes obtenidos en CLUSTALW cuando se

comparan las secuencias.
Especie Varanus Caretta Corvus Athene Hydrodamalis Equus
albigularis caretta cornix cunicularia gigas caballus
Varanus 100 50.3546 51.773 57.4468 55.3191 56.7376
albigularis
Caretta 50.3546 100 66.6667 68.7943 63.8298 68.0851
caretta
Corvus cornix 51.773 66.6667 100 87.3239 63.3803 69.0141

Athene 57.4468 68.7943 87.3239 100 67.6056 72.5352

cunicularia
Hydrodamalis 55.3191 63.8298 63.3803 67.6056 100 81.6901
gigas
Equus 56.7376 68.0851 69.0141 72.5352 81.6901 100
caballus
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

A. ¿Puede identificar que secuencias de α hemoglobina/β hemoglobina son

similares entre los organismos?

R// Los organismos que sean sus hemoglobinas más similares, son los que tendrán
un porcentaje en la tabla más altos, y como se expresa en la tabla las secuencias
de α hemoglobina más similares serán las de Athene cunicularia y Corvus cornix
que tienen 87.3% de similitud.

B. ¿Qué le permite inferir acerca de las posibles relaciones evolutivas entre

estas especies?

R// Se puede inferir que como existe un porcentaje de similitud entre todas las
especies, demuestra que todos deben tener un ancestro en común de una α
hemoglobina, que con el tiempo la evolución los fue alejando poco a poco, aunque
aún se pueden encontrar regiones conservadas que demuestran lo anterior
mencionado.

C. ¿Qué especies están más cercanas evolutivamente y cuáles tienen un

ancestro común más cercano?

R// La especies más cercanas evolutivamente y que tienen un ancestro en común

más cercano son Athene cunicularia y Corvus cornix que tienen 87.3% de similitud.

D. ¿Qué especies son más distantes y tienen un ancestro común?

R//La especies más distantes pero que tienen un ancestro en común son Varanus
albigularis y Caretta caretta que tienen un 50.3% de similitud.

7. EL árbol filogenético puede representar el grado de relación entre especies

a partir de datos de similitud de secuencias (como en la tabla). Estos, unen las
especies más cercanas en “ramas” y la distancia de dichas “ramas”
corresponde a la distancia evolutiva. ¿tiene el árbol resultante concordancia
con los resultados de los análisis de la tabla de similitud? Explique su análisis.
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

R// El árbol resultante si tiene similitud con la tabla obtenida anteriormente, en este
se puede observar como hay un punto de origen para la hemoglobina que a pesar
de que ahora estén algo distintas en cuanto a los aminoácidos que las componen,
aun así guardan relación, como el cuervo y el búho que son los que más porcentaje
de similitud tienen, y por ende se ven tan cercanos en el árbol en la parte inferior
del árbol, o el lagarto y la tortuga, que son los más alejados en el árbol, lo cual se
refleja en la tabla, porque son los de menor porcentaje de similitud.

Practica Análisis de Secuencias para BETA HEMOGLOBINA de Reptiles,

Aves y Mamíferos.
Comparación de secuencias para alfa hemoglobina.
1. ¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “beta
hemoglobin”?
R// Aparecen 6.650 resultados de secuencias en la base de datos de UniProt.
2. Los animales que se van a usar para Reptil: Lagartija (Lizard), Camaleón
(Chameleon).
¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Lizard alpha
hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Lizard beta hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 13 resultados.
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

Secuencia 1: Organismo Varanus albigularis (White-throated monitor) (Varanus

exanthematicus albigularis)
>sp|P18993|HBB1_VARAL Hemoglobin subunit beta-1 OS=Varanus albigularis
OX=8558 GN=HBB1 PE=1 SV=2
VHWTAEEKQLICSLWGKIDVGLIGGETLAGLLVIYPWTQRQFSHFGNLSSPTAIAG
NPRV
KAHGKKVLTSFGDAIKNLDNIKDTFAKLSELHCDKLHVDPTNFKLLGNVLVIVLADH
HGK
EFTPAHHAAYQKLVNVVSHSLARRYH

¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Turtle alpha

hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Turtle beta hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 2 resultados.
Secuencia 2: Organismo Caretta caretta (Loggerhead sea turtle)
>sp|Q10733|HBB_CARCR Hemoglobin subunit beta OS=Caretta caretta OX=8467
GN=HBB PE=1 SV=1
THWTAEERHYITSMWDKINVAEIGGESLARMLIVYPWTQKFFSDFGNLTSSSAIM
HNVKI
QEHGKKVLNSFGSAVKNMDHIKETFADLSKLHCETLHVDPENFKLLGSILIIVLAMH
FGK
EPTPTWQAAWQKLVSAVAHALTLQYH

3. Los animales que se van a usar para Aves: Cuervo (Crow) y Búho (Owl).
¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Crow beta
hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Crow beta hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 1 resultados.
Secuencia 1: Organismo Corvus cornix (hooded crow)
>tr|A0A0A7RPF7|A0A0A7RPF7_9CORV Beta-globin subunit OS=Corvus cornix
OX=181096 GN=HBB PE=2 SV=1
MVQWTAEEKQLITGLWGKVNVAECGGEALARLLIVYPWTQRFFASFGNLSSPTAI
IGNPK
VQAHGKKVLTSFGEAVKNLDNIKNTFSQLSELHCDKLHVDPENFRLLGDILIIVLAA
HFG
KDFSPDCQAAWQKLVRVVAHALARKYH

¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Owl beta

hemoglobin”?
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

R// Cuando se hace la búsqueda de “Owl beta hemoglobin” en la base de datos

UniProt, aparecen 14 resultados.
Secuencia 2: Organismo Athene cunicularia (Burrowing owl) (Speotyto cunicularia)
>tr|A0A663M2S4|A0A663M2S4_ATHCN Hemoglobin subunit beta OS=Athene
cunicularia OX=194338 GN=LOC113476021 PE=3 SV=1
MVHWTAEEKQLITGLWGKVNVAECGAEALARLLIVYPWTQRFFASFGNLSSPTAI
SGNPM
VRAHGKKVLTSFGEAVKNLDNIKKCFAQLSKLHCDKLHVDPENFRLLGDILIIVLAA
HFA
KDFTPECQAAWQKLVRVVAHALARKYH

4. Los animales que se van a usar para para Mamíferos: Vaca (Cow) y
Caballo (Horse).
¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Cow beta
hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Cow beta hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 10 resultados.
Secuencia 1: Organismo Hydrodamalis gigas (Cow)
>tr|A0A481WPM8|A0A481WPM8_HYDGI Hemoglobin subunit beta/delta
OS=Hydrodamalis gigas OX=63631 GN=HBB PE=3 SV=1
MVHLTADEKALITGLWSKVNVKEYGGEALGRLLVVYPWTQRFFEHFGDLSSASA
VMHNSK
VQTHSXXXXASXXXGLKHLDNLNSAFAELSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVL
ARHLG
KEFSPQAQAAYQKVVAGVANALAHKYH

¿Cuantas secuencias de alfa hemoglobina aparecen cuando se busca “Horse beta

hemoglobin”?
R// Cuando se hace la búsqueda de “Horse beta hemoglobin” en la base de datos
UniProt, aparecen 24 resultados.
Secuencia 2: Organismo Equus caballus (Horse)
>sp|P02062|HBB_HORSE Hemoglobin subunit beta OS=Equus caballus OX=9796
GN=HBB PE=1 SV=1
VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLSNPGA
VMGNPKV
KAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVVVLA
RHFGK
DFTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

5. Alineamiento de secuencias en CLUSTALW

tr|A0A0A7RPF7|A0A0A7RPF7_9CORV
tr|A0A663M2S4|A0A663M2S4_ATHCN
sp|Q10733|HBB_CARCR
sp|P18993|HBB1_VARAL
tr|A0A481WPM8|A0A481WPM8_HYDGI
sp|P02062|HBB_HORSE
MVQWTAEEKQLITGLWGKVNVAECGGEALARLLIVYPWTQRFFASFGNLS
MVHWTAEEKQLITGLWGKVNVAECGAEALARLLIVYPWTQRFFASFGNLS
-THWTAEERHYITSMWDKINVAEIGGESLARMLIVYPWTQKFFSDFGNLT
-VHWTAEEKQLICSLWGKIDVGLIGGETLAGLLVIYPWTQRQFSHFGNLS
MVHLTADEKALITGLWSKVNVKEYGGEALGRLLVVYPWTQRFFEHFGDLS
-VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLS
.: :.:*: : .:*.*:: *.*:*. :*::*****: * **:*:

tr|A0A0A7RPF7|A0A0A7RPF7_9CORV
tr|A0A663M2S4|A0A663M2S4_ATHCN
sp|Q10733|HBB_CARCR
sp|P18993|HBB1_VARAL
tr|A0A481WPM8|A0A481WPM8_HYDGI
sp|P02062|HBB_HORSE
SPTAIIGNPKVQAHGKKVLTSFGEAVKNLDNIKNTFSQLSELHCDKLHVD
SPTAISGNPMVRAHGKKVLTSFGEAVKNLDNIKKCFAQLSKLHCDKLHVD
SSSAIMHNVKIQEHGKKVLNSFGSAVKNMDHIKETFADLSKLHCETLHVD
SPTAIAGNPRVKAHGKKVLTSFGDAIKNLDNIKDTFAKLSELHCDKLHVD
SASAVMHNSKVQTHSXXXXASXXXGLKHLDNLNSAFAELSELHCDKLHVD
NPGAVMGNPKVKAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVD
.. *: * :: *. * .::::*::: *: **:***:.****

tr|A0A0A7RPF7|A0A0A7RPF7_9CORV PENFRLLGDILIIVLAAHFGKDFSPDCQAAWQKLVRVVAHALARKYH
tr|A0A663M2S4|A0A663M2S4_ATHCN PENFRLLGDILIIVLAAHFAKDFTPECQAAWQKLVRVVAHALARKYH
sp|Q10733|HBB_CARCR PENFKLLGSILIIVLAMHFGKEPTPTWQAAWQKLVSAVAHALTLQYH
sp|P18993|HBB1_VARAL PTNFKLLGNVLVIVLADHHGKEFTPAHHAAYQKLVNVVSHSLARRYH
tr|A0A481WPM8|A0A481WPM8_HYDGI PENFRLLGNVLVCVLARHLGKEFSPQAQAAYQKVVAGVANALAHKYH
sp|P02062|HBB_HORSE PENFRLLGNVLVVVLARHFGKDFTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
* **:***.:*: *** * .*: :* :*::**:* *:::*: :**
A. ¿Cuántos aminoácidos se mantienen iguales en las 6 secuencias de α
hemoglobina/β hemoglobina de su alineamiento?

R// Al alinear las 6 secuencias en CLUSTALW, y contar los asteriscos debajo de

cada secuencia, se determina que se mantienen iguales 52 aminoácidos en las alfa
hemoglobinas.

B. ¿Qué porcentaje de los aminoácidos están conservados en todas las 6 α

hemoglobina/β hemoglobina?

R// Los aminoácidos iguales en las 6 secuencias son 52, siendo estos los
conservados, las secuencias miden entre 147 AA y 146 AA (tres y tres), si
calculamos el porcentaje de conservación nos da un 35.5%.

C. ¿Se presentaron regiones específicas de la secuencia α hemoglobina/ β

hemoglobina que están especialmente conservadas?

R// Las regiones específicas conservadas, son aquellas donde se ven 3 o más
aminoácidos seguidos uno del otro, al comparar las 6 secuencias en CLUSTALW,
vemos que hay 5 regiones especialmente conservadas.

D. ¿Hubo aminoácidos que aparecieron con mayor frecuencia en las regiones

conservadas de la proteína que en las regiones no conservadas? ¿de ser así,
que aminoácidos fueron? Haga uso de la tabla de referencia con el código de
asignación de aminoácidos.
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

R// De las 5 regiones conservadas, la Leucina se repite 5 veces en cada secuencia

de las regiones conservadas. En la región no conservada el aminoácido que más
se repite es la Alanina 11.5 veces.

E. Si encontró aminoácidos conservados con mayor frecuencia en su reporte

de alineamiento, ¿De qué tipo eran, polar, no polar o con alguna carga
específica?

1
En los aminoácidos conservados fue la Leucina (L) el que más se encuentra,
siendo de tipo no polar.
6. Hacer una tabla con los porcentajes obtenidos en CLUSTALW cuando se
comparan las secuencias.
Especie Varanus Caretta Corvus Athene Hydrodamalis Equus
albigularis caretta cornix cunicularia gigas caballus
Varanus 100 61.6438 71.9178 58.2192 61.6438
albigularis 72.6027

Caretta 61.6438 100 68.4932 67.8082 54.1096 54.7945

caretta
Corvus cornix 72.6027 68.4932 100 91.8367 64.6259 69.863

Athene 71.9178 67.8082 91.8367 100 61.9048 67.8082

cunicularia
Hydrodamalis 58.2192 54.1096 64.6259 61.9048 100 70.5479
gigas
Equus 61.6438 54.7945 69.863 67.8082 70.5479 100
caballus

A. ¿Puede identificar que secuencias de α hemoglobina/β hemoglobina son

similares entre los organismos?

R// Los organismos que sean sus hemoglobinas más similares, son los que tendrán
un porcentaje en la tabla más altos, y como se expresa en la tabla las secuencias
de α hemoglobina más similares serán las de Athene cunicularia y Corvus cornix
que tienen 92% de similitud.

B. ¿Qué le permite inferir acerca de las posibles relaciones evolutivas entre

estas especies?

R// Se puede inferir que como existe un porcentaje de similitud entre todas las
especies, demuestra que todos deben tener un ancestro en común de una β
hemoglobina, que con el tiempo la evolución los fue alejando poco a poco, aunque
aún se pueden encontrar regiones conservadas que demuestran lo anterior
mencionado.
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

C. ¿Qué especies están más cercanas evolutivamente y cuáles tienen un

ancestro común más cercano?

R// La especies más cercanas evolutivamente y que tienen un ancestro en común

más cercano son Athene cunicularia Corvus cornix que tienen 92% de similitud.

D. ¿Qué especies son más distantes y tienen un ancestro común?

R//La especies más distantes pero que tienen un ancestro en común son
Hydrodamalis gigas y Caretta caretta que tienen un 54% de similitud.

7. EL árbol filogenético puede representar el grado de relación entre especies

a partir de datos de similitud de secuencias (como en la tabla). Estos, unen las
especies más cercanas en “ramas” y la distancia de dichas “ramas”
corresponde a la distancia evolutiva. ¿tiene el árbol resultante concordancia
con los resultados de los análisis de la tabla de similitud? Explique su análisis.

R// El árbol resultante si tiene similitud con la tabla obtenida anteriormente, en este
se puede observar como hay un punto de origen para la hemoglobina que a pesar
de que ahora estén algo distintas en cuanto a los aminoácidos que las componen,
aun así guardan relación, como el cuervo y el búho que son los que más porcentaje
de similitud tienen, y por ende se ven tan cercanos en el árbol en la parte inferior
del árbol, o el lagarto y la tortuga, que son los más alejados en el árbol, lo cual se
refleja en la tabla, porque son los de menor porcentaje de similitud.
Yoselin Bolívar, Hansel Martinez e Ivan Sanchez

8. Una forma de evaluar la validez del árbol filogenético es compararlo con

árboles construidos a partir de secuencias de otras proteínas. Compare los
resultados de sus análisis con su compañero el cual debió haber hecho el
análisis con la β hemoglobina. ¿el árbol resultante a partir de la secuencia de
la α hemoglobina concuerda con el creado a partir de la β hemoglobina?
¿son las longitudes relativas de las ramas iguales?
Comparando los arboles filogenéticos tanto para alfa como beta hemoglobina, se
puede observar que si se concuerdan los resultados, como se explicó
anteriormente, la especie de búho y la de cuervo, son los que tienen un porcentaje
más alto, lo que significa que son evolutivamente muy similares, y si es así, debería
esperarse que tanto la alfa hemoglobina como la beta hemoglobina, tuvieran un
porcentaje alto en ambas tablas, y por ende en ambos arboles deberían verse
cercanos en las ramas, cosa que si se evidencia.
Demostrando que las longitudes relativas son iguales o similares, y que si
concuerdan ambos arboles filogeneticos.
Bibliografía
1
IUPAC-IUBMB Joint Commission on Biochemical Nomenclature. "Nomenclature
and Symbolism for Amino Acids and Peptides". Recommendations on Organic &
Biochemical Nomenclature, Symbols & Terminology etc. Retrieved 2007-05-17.