Instituto Nacional de México

Instituto Tecnológico de Ciudad Guzmán

Alumna: Gutiérrez Padilla Alondra Elizabeth

Biotecnología ambiental U4

Profesora: Ing. Daraly Vázquez Verduzco

Ing. Ambiental 9no Semestre

Investigación: “Biodegradación”
Introducción

La presencia de sustancias nocivas tanto en las aguas, suelo y aire representa actualmente un
problema ambiental, ya que este tipo de compuestos no puede eliminarse con los métodos de
tratamiento convencionales. Debido a que la mayoría de los sistemas de tratamiento basados en
métodos químicos o físicos son costosos y requieren de gran cantidad de energía y reactivos, la
biotecnología ofrece una alternativa de tratamiento. Por ejemplo la eliminación de los colorantes
de los efluentes de la industria textil representa un gran reto ambiental. Existen numerosas
tecnologías para el tratamiento de aguas residuales de la industria textil pero, por la complejidad
de la composición de estas aguas, generalmente se tiene que utilizar dos o más estrategias para
lograr la remoción de los contaminantes. La industria textil consume grandes volúmenes de agua
en sus procesos, por lo que es importante la búsqueda de tecnologías que permitan el reciclaje del
agua residual, o bien, que permitan que el agua pueda ser vertida sin que perjudique al ambiente.
Los procesos biológicos son una opción para el tratamiento de efluentes contaminados. Con este
objetivo, se han obtenido cepas aisladas de entornos contaminados que, por adaptación, han
desarrollado la capacidad de biodegradar los contaminantes presentes. También se ha conseguido
identificar las enzimas involucradas en la degradación de colorantes y desarrollar tecnologías
utilizando dichas enzimas. Las estructuras químicas de los colorantes resultan a menudo
demasiado complejas para utilizar un tratamiento simple, por lo que generalmente seutilizan
consorcios microbianos con la capacidad de degradar colorantes obteniendo altas eficiencias de
depuración. Muchos de estos consorcios no están completamente caracterizados y se desconoce
el mecanismo por el cual se lleva a cabo la degradación. El desarrollo de estas tecnologías se basa
en técnicas convencionales, sin tomar en cuenta que la actividad biodegradativa de un grupo de
organismos no depende de una sola especie, sino que generalmente es resultado de la acción
conjunta de la diversidad metabólica presente en el medio. Es por esto que el desarrollo de las
ciencias como la metagenómica, constituyen un paso importante para conocer aspectos claves
sobre los microorganismos involucrados en el proceso de biodegradación, así como para encontrar
nuevas enzimas, nuevos metabolismos y nuevos microorganismos capaces de metabolizar los
colorantes

Desarrollo

4.1 Concepto de la biodegradación y factores que intervienen en el proceso

La biodegradación, también conocida como descomposición orgánica, es el proceso mediante el

cual un conjunto de desechos orgánicos se descompone producto de la acción de agentes
externos, como bacterias, hongos y protozoos. En otras palabras, es un mecanismo que simplifica
una sustancia o materia a sus elementos químicos más básicos, enmarcándose como un evento
natural y no contaminante. De acuerdo con el material que se esté manejando o estudiando, los
factores y condiciones ambientales bajo las que pueden ceder sus moléculas, depende de la
estabilidad de las mismas, además de las enzimas que desprendan los agentes biológicos
degradadores.

La principal razón por la que ocurre la biodegradación es por la necesidad de continua renovación
y reproducción de los microorganismos que llevan a cabo el proceso. Estos extraen todos los
elementos que emplearan para producir energía la creación de nuevos tejidos y sustancias, como
los aminoácidos. A partir de esto, surgen una serie de ventajas para el ambiente, puesto que son
eliminadas ciertas sustancias que pueden ser nocivas tanto para los seres vivos, como para todo
aquello que conforma el medio de existencia.

Existen dos formas en las que el proceso de biodegradación puede ser realizado: con presencia
de oxígeno (aérobica), en donde se liberan componentes como dióxido de carbono y agua,
resultando mayor rendimiento energético; en ausencia de oxígeno, dando como resultado una
oxidación incompleta. Un ejemplo de biodegradación es el observado en masas de agua; estas
pueden tener materia orgánica tanto autóctona, como alóctona. En el primer caso, se trata de
diversos cadáveres de organismos acuáticos, además de las excreciones de algas y plantas
acuáticas; en el último, son todos aquellos elementos, como ramas, hojas, frutos y polen, que son
arrastradas por el viento y la corriente de las aguas, siendo estos los que están en cuerpos de
aguas dulces (Sáenz, 2017)

Factores que intervienen en el proceso

(Ortega, 2012)

4.2.1 Biodegradación de celulosa

(Aqp, 2015)

Biodegradación de hemicelulosa

Las paredes celulares vegetales pueden considerarse como un sistema de dos fases como
comprende un matriz hidrata y una fase organizada de fibrilla dentro de esta se encuentra la
hemicelulosa, la hemicelulosa es un polisacárido as abundante en plantas es soluble en Alcalá y
está estrechamente relacionado con la celulosa está compuesta por unidades de glucosa,
galactosa, manosa, y principalmente xilosa, esta se encuentra en los residuos de cascarilla de
arroz, bagazo de caña, desechos cítricos y subproductos de plátano pero estos residuos pueden
ser utilizados como materia prima para la obtenencion de productos con valor agregado a través
de microrganismos productos que son amigables con el medio ambiente, es decir obtendremos
productos xilosa a partir de residuos agrícolas ricos en hemicelulosa a través de una degradación
enzimática micro bacteriana dicha hemicelulosa obtenida se utilizara para obtener etanol
(Alquichire, 2013)

4.3 Biodegradación del petróleo y derivados

La biodegradación de petróleo en los ecosistemas es compleja. Depende de las características de

la mezcla dehidrocarburos, de los factores ambientales que regulan la actividad biológica y de la
naturaleza de la comunidadmicrobiana. También se ve afectada por la temperatura a la que se
produzca la degradación y la luz que haya. Se havisto que la tasa de descomposición es mayor para
los hidrocarburos saturados, seguido por los aromáticos de bajo peso molecular, mientras que los
aromáticos de alto peso molecular exhiben tasas muy bajas de descomposición.La descomposición
microbiana del petróleo y de sus derivados es de considerable importancia económica y
ambiental.El petróleo es una rica fuente de materia orgánica y los hidrocarburosque contiene son
rápidamente a tacables pordiferentes microorganismos en condiciones aeróbicas. Noresulta
extraño, por tanto, que en contacto con aireylahumedad sea atacado por los microorganismos.En
determinadas circunstancias, como el almacenado en grandes tanques, el crecimiento microbiano
no es deseable.Sin embargo, en otras situaciones, como cuando se produce algún vertido de
petróleo su utilización por losmicroorganismos es deseable, e incluso, puede ser estimulada
añadiéndoles nutrientes orgánicos.Los efectos ecotóxicos de un producto petrolífero
(combustibles, aceites lubricantes, fluidos hidráulicos, ceras, asfaltos,etc.), pueden ser muy graves
por actuar en todos los niveles de organización biológica: desde los componentessubcelulares
hasta los niveles superiores del ecosistema. Por este motivo es necesario contar con
microorganismosque degraden los hidrocarburos que forman el petróleo, con lo que se consigue
que la contaminación y los efectostóxicos del petróleo en el medio sean menores.La
descomposición del petróleo es similar ala descomposición enzimática de algunos productos
naturales como lignina,celulosa y diferentes lípidos.En este hecho se basa la importancia para la
eliminación de petróleo y de otros contaminantes.En ciertos hongos superiores se ha comprobado
que el complejo enzimático de las ligninasas es eficiente en ladegradación de hidrocarburos
aromáticos y otros contaminantes producidos por el
hombre. Aunque hay gran variedad de microorganismos que biodegradan el petróleo y que notod
os los microorganismosdegradan el mismo tipo de hidrocarburos, el método que utilizan para
realizar este proceso es similar en todos ellos.En la bioquímica de la degradación del petróleo se
destaca la importancia de la función que desempeñan las enzimasoxigenasas en la introducción de
átomos de oxigeno en el hidrocarburo, lo que permite que haya posteriores
procesosbioquímicos.Se ha demostrado que una gran variedad de bacterias (incluyendo algunas
cianobacterias), diversos mohos ylevaduras, así como determinadas algas verdes pueden oxidar
hidrocarburos aeróbicamente. Es muy frecuente lacontaminación a pequeña escala por petróleo
en ecosistemas acuáticos y terrestres debido tanto a actividadeshumanas como a causas
naturales. Existen diversas comunidades microbianas capaces de utilizar hidrocarburos
comodonadores de electrones. El metano, el hidrocarburo mas sencillo, es degradado por un
grupo especializado debacterias, las bacterias metanotróficas; pero estos microorganismos no
pueden crecer con hidrocarburos de mayor numero de carbonos.Los microorganismos oxidadores
de hidrocarburos crecen sobre la superficie del petróleo y la actividad es más extensasi las
condiciones ambientales como temperatura y nutrientes inorgánicas (principalmente nitrógeno y
fósforo) son lasadecuadas. Dado que el petróleo es insoluble en aguay menos denso, flota y forma
manchas en su superficie. Lasbacterias oxidadotas de hidrocarburos pueden atacar las gotículas
insolubles de petróleo y a menudo pueden verse engrandes cantidades sobre ellas. La acción de
dichas bacterias lleva a la descomposición del petroleo y a la dispersiónde la mancha.De la
eliminación de vertidos de petroleo, los microorganismos actúan oxidando el petroleo a CO2.
Cuando seproducen grandes vertidos las fracciones de hidrocarburos volátiles se evaporan
rapadamente, quedando loscomponentes aromáticos y alifáticos de cadena larga para que sean
eliminados por los organismos.De la gran cantidad de microorganismos capaces de degradar el
petróleo destacan las bacterias y los hongos.Dentro de las bacterias hay gran cantidad de géneros
capaces dedescomponer u oxidar los hidrocarburos que formanel petróleo como por ejemplo los
géneros

Achrornobacter, Acinetobacter, Actinomyces, Alcaligenes, Arthrobacter,Bacillus, Beneckea,

Brevebacterium, Coryneformes, Erwinia, Flavobacterium, Klebsiella, Lactobacillus,
Leumthrix,Moraxella, Nocardia, Peptococcus, Pseudomonas, Sarcina, Spherotilus,
Spirillum, Streptomyces, Vibrio, Xanthomyces 

 De todos estos géneros vamos a hablar de los siguientes porque son los que tienen mayor
importancia en labiodegradación del petróleo:-

Pseudomonas: 

 Es un género de bacilos rectos o ligeramente curvados, Gram negativos, oxidasa positivos,
catalasa positivos yaeróbicos estrictos aunque en algunos casos pueden utilizar el nitrato como
aceptor de electrones. No pueden formar esporas.Este género es uno de los más proclives a la
degradación de compuestos orgánicos, como son los hidrocarburos queforman el petróleo,
especialmente cepas de las especies

Pseudomonas putida o Pseudomonas aeruginosa 

.El amplio potencial catabólico de los componentes del género viene dado en muchos casos por la
presencia dedeterminantes plasmídicos y transposones autotransmisibles. La ubicuidad de las
bacterias del género

Pseudomonas 

ysu capacidad para explotar una amplia variedad de nutrientes refleja un sistema de adaptación al
medio ambiente queno encuentra parangón en las bacterias de otros géneros.Las cepas de la
especie

Pseudomonas Putida 

sólo pueden degradar los hidrocarburos aromáticos que forman elpetróleo. Las cepas de la
especie

Pseudomonas aeruginosa 

es capaz de crecer en combustibles como queroseno o gasóleo, yaque es un microorganismo

capaz de nutrirse a partir de hidrocarburos, causando estragos de corrosión microbiana, ycreando
una gelatina oscura que a veces se identifica inadecuadamente con un alga.-

Flavobacterium: 

 Es un género bacteriano perteneciente al grupo de las flavobacterias organotrofas, es decir que se
alimentan de todode tipo de compuestos orgánicos entre los que se encuentran los hidrocarburos.
Este género se alimentaprincipalmente de alcanos y alquenos. Se trata de bacilos aerobios,
inmóviles y Gram negativos.-

Nocardia: 

 Es un género de bacterias Gram-positivas que se encuentran en suelos de todo el mundo ricos en
materia orgánica.Son capaces de degradar hidrocarburos cuya cadena no es muy larga en
condiciones aeróbicas. Son catalasa-positivas y con forma de coco.-

Bacillus: 

 Es un género de bacterias en forma de bastón y Gram positiva. El género

Bacillus 

pertenece a la División Firmicutes.Son aerobios estrictos o anaerobios facultativos. En condiciones

estresantes forman una endoespora de situacióncentral, que deforma la estructura de la célula.
Dicha forma esporulada es resistente a las altas temperaturas y a losdesinfectantes químicos
corrientes.La mayoría de especies dan positivo a la prueba de la catalasa y son saprofitas. Viven en
el suelo, agua del mar y ríos,aparte de alimentos que contaminan con su presencia. Aunque
generalmente son móviles, con flagelos peritricos,algunas especies son inmóviles.La especie del
género Bacillus que puede degradar hidrocarburos para obtener nutrientes se denomina

Bacillus circulans.

 Dentro de los hongos también hay muchos géneros que son capaces de degradar petróleo para
obtener nutrientes(

Allescheria, Aspergillus, Botrytis,

Candida, Cephalosporium, Cladosporium, Cunninghamella, Debaromyces, Fusarium,Gonytrichum,
Hansenula, Helmintrosporium, Mucor, Oidiodendrum, Paecylomyses, Phialophora,
Penicillium,Rhodosporidium, Rhodotorula, Saccharomyces, Saccharomycopisis, Scopulariopsis,
Sporobolomyces, Torulopsis,Trichoderma, Trichosporon 

, etcétera.) pero los más importantes son :-

Aspergillus: 

 El

Aspergillus 

es un género de alrededor de 200 hongos (mohos), y es ubicuo, es decir, que puede vivir en todos
loslugares.Los hongos se pueden clasificar en dos formas morfológicas básicas: las levaduras y las
hifas.El Aspergillus es un hongo filamentoso (compuesto de cadenas de células, llamadas hifas), el
tipo de hongos opuesto alas levaduras, éstas últimas compuestas de una sola célula redondeada.
El hábitat natural del
Aspergillus 

son el heno yel compostaje. Aunque al ser microorganismos oportunistas y ubicuos pueden vivir
en otros medios como en zonasdonde hay petróleo y utilizar los hidrocarburos que lo componen
como fuentes de carbono, es decir, como nutrientes.-

Saccharomyces 

:El género

Saccharomyces 

incluye muchos tipos diferentes de levaduras y forma parte del reino de los hongos. Laincapacidad
para utilizar nitratos y la capacidad de fermentar varios carbohidratos son las características típicas
de los

Saccharomyces 

. Para poder realizar esas fermentaciones necesita carbono que obtiene entre otros métodos
mediantela degradación de hidrocarburos que forman parte del petróleo y de sus derivados.-

Penicillium: 

 Es un género del reino Fungi, es decir, el reino de los hongos. Tiene entre 100 y 150 especies,
entre las que seencuentran algunas que poseen las enzimas necesarias para poder obtener
carbono mediante la degradación de loshidrocarburos del petróleo.Las especies de

Penicillium 

son reconocidas por su denso cepillar como las estructuras del espora-cojinete. Losconidióforos
son simples o ramificados y son terminados por los racimos de fialides en forma de botella.Las
esporas (conidios) se producen en cadenas secas de las extremidades de los fialides, con la espora
más joven enla base de la cadena, y son casi siempre verdes. La ramificación es una característica
importante para identificar especie del

Penicillium 

.El

Penicillium 

es un género grande y encontrado casi por todas partes, y siendo comúnmente el género de
hongos másabundante en suelos. La fácil proliferación de los

Penicillium 

en los alimentos es un problema. Algunas especiesproducen toxinas y pueden hacer el alimento no

comestible o aún peligroso. Aunque todos los géneros de hongos y bacterias citados con
anterioridad son capaces de degradar el petróleo porqueposee las enzimas necesarias para ello,
las que tienen mayor importancia son las bacterias, especialmente las cepasde la especie

Pseudomonas (Tejeda, 2013)

4.5 Biorremediacion de metales y otros contaminantes inorgánicos

Una planta metalófita o hiperacumuladora es una planta capaz de crecer en el suelo o agua con
grandes concentraciones de metales pesados y se caracterizan por extraer el metal a través de sus
raíces y concentrarlo hasta niveles extremadamente altos en sus tejidos (Chaney et al, 2007). Estas
plantas presentan un rápido crecimiento, amplios rangos de adaptación climática y la capacidad de
absorber grandes volúmenes de agua (en relación con otras especies), lo que les permite manejar
grandes cantidades de contaminantes disueltos, así como limitar la cantidad de agua que escapa
más allá de la zona contaminada y que limita la dispersión de la contaminación (Maiti et al, 2004;
Kavamura y Esposito, 2010). Las metalófitas son plantas que pueden acumular metales de 100 a
500 veces más que otras especies, alcanzando niveles de remoción hasta del 100% (Chaney et al,
2007). Más de 400 especies vegetales han sido identificadas como hiperacumuladoras, incluidas
300 especies que acumulan Ni y algunas que tienen la capacidad de acumular Cd, Cu, Pb y Zn (Li et
al, 2003, Ücüncü et al., 2013). Varios estudios indican que este tipo de vegetación puede
almacenar en promedio 100 μg/g (0.01 % peso seco) de Cd y As; 1000 μg/g (0.1 % peso seco) de
Co, Cu, Cr, Ni y Pb; y 10.000 μg/g (1.0 % peso seco) de Mn (McGrath et al, 2001; Padmavathiamma
y Li, 2007; Paz-Fereira et al, 2014). El desarrollo de adaptaciones fisiológicas y bioquímicas por
parte de las plantas incluyen el control en la acumulación del contaminante en las raíces y la
traslocación de éste a los diferentes órganos vegetativos (McGrath et al, 2001; Padmavathiamma y
Li, 2007; Ücüncü et al, 2013). Estos procesos de bioacumulación permiten transformar los
contaminantes en productos menos tóxicos o no tóxicos, minimizando su exposición en el
ambiente (Favas et al, 2012; Dos Santos y Lenzi, 2000; Mane et al, 2011). Las plantas pueden
inmovilizar los metales en sus vacuolas para evitar la translocación a la parte aérea, siendo
consideradas como el lugar de mayor acumulación de metales pesados en células vegetales. La
compartimentalización de las vacuolas es efectiva controlando la distribución y concentración de
iones de metales, debido a que las otras partes de la célula no tienen acceso a los iones metálicos
peligrosos y de esa forma la planta no se afecta (Wu et al, 2010). La habilidad de acumular metales
pesados varía significativamente entre especies, cada una desarrolla diferentes mecanismos para
transformar los iones, según sus características morfológicas, fisiológicas y genéticas (Saleth, 2012;
Kavamura y Esposito, 2010; Akpor y Muchie, 2010; Borker et al, 2013; Swain et al, 2014).
Numerosas especies fitorremediadoras se encuentran taxonómicamente dentro de los órdenes
Brassicales, Asterales, Solanales, Poales, Malpighiales, Fabales, Caryophyllales y Rosales (Paz-
Ferrerira et al, 2014). La familia Brassicaceae es de especial interés, ya que incluye plantas
hiperacumuladoras que no son palatables, lo que puede reducir los procesos de bioacumulación
de metales en la cadena alimenticia durante los procesos de fitoextracción (Navari-izzo y
Quartaccim, 2001). Las plantas hiperacumuladoras han desarrollado sus propios mecanismos para
protegerse frente al estrés por metales.

Conclusión

Los metales pesados se consideran unos de los contaminantes más tóxicos en el ambiente por
tener efectos nocivos a nivel de toda la cadena trófica, en especial el Cd, Cr y Hg son relevantes
debido su persistencia y toxicidad. En la actualidad existen diversas técnicas de tipo fisicoquímico
utilizadas para el tratamiento de estas sustancias, las cuales han mostrado algunas deficiencias y
efectos secundarios a largo plazo. Por esta razón la implementación de otro tipo de tecnologías
que involucren seres vivos con capacidades metabólicas especiales han emergido generando
resultados prometedores en procesos de biotransformación. Algunos microorganismos y plantas
cuentan con diferentes mecanismos bioquímicos para contrarrestar la toxicidad de los metales
pesados. En la presente revisión se abordan dichos mecanismos, se nombran algunas especies de
organismos destacadas y se hace un esbozo acerca de algunas aproximaciones de ingeniería
genética con el objetivo de mejorar las capacidades biorremediadoras de estas especies

Referencias Bibliográficas

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