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Conceptos BÁSICOS:
Estructura PRIMARIA.
Estructura SECUNDARIA.
POLARIDAD QUÍMICA.
COMPLEMENTARIDAD
MOLECULAR.
ESTABILIZACIÓN POR
UNIONES DÉBILES ( P de H)
Condensación varía con
ETAPA del ciclo.
De NUCLEOSOMA hasta el
cromosoma MITÓTICO.
HISTONAS.
En este capítulo veremos desde el empaquetamiento del DNA, con las distitnas proteínas a las que se asocia, tanto las
HISTONAS, como las NO HISTONAS (Condensinas EJ).
Bueno, esta cromatina va a tener distintos niveles de organización, en los cuales vamos a profundizar.
Partiremos de la idea de que en INTERFASE, vamos a encontrar la condensación del DNA en forma de FIBRA DE 30 nM.
Ahora el DNA, le da dos vueltas (147 pares de bases) al nucleosoma, para luego estar separado cada uno por DNA
espaciador. Pero ¿Esto varía o es estático?
SI FUERA ESTÁTICO, solamente este DNA espaciador sería transcribible, por lo tanto, debe ser capaz de sufrir
modificaciones, así que esta estructura es DINÁMICA.
El nucleosoma va a estar ensamblándose y desensamblnadose todo el tiempo para poder realizar la transcripción, y esta
movilidad y desensamblaje se da de forma muy rápida y eficiente, pero ¿Sucede de forma espontánea? NO, esto sucede
gracias a PROTEÍNAS, conocidas como COMPLEJOS REMODELADORES DE LA CROMATINA.
En realidad NO ES UNA PROTEÍNA, es un
COMPLEJO con una gran variedad de
subunidades con distintas FUNCIOENS:
ESPECÍFICAS.
Suceden por el agregado o
retiro de grupos en las
COLAS DE LAS HISTONAS.
SUCEDEN POR PROTEÍNAS
ESPECÍFICAS.
ATRAEN OTRAS
PROTEÍNAS, para ser
ASOCIADAS
Pero cabe remarcar que estas modificaciones van a ser un MECANISMO DE REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA, debido
a que según la modificación de la cola de la histona, de misma forma que estos cambios SE TRANSMITEN A LA
DESCENDENCIA CELULAR, a la hora de DIVIDIRSE, y la CÉLULA HIJA TENDRÁ ESTE PATRÓN DE MODIFICACIOENS.
Ahora, con las modificaciones COVALENTES, NO MODIFICO EL DNA, SINO LAS PROTEÍNAS ASOCIADAS A ESTE.
Por ejemplo, tengo una proteína asociada, y mi gen Y está ACTIVO, pero modifico esta proteína, haciendo que se
condense la cromatina, lo que obtengo es que mi GEN QUEDA EXACTAMENTE IGUAL, ahora cuando las células se
dividan, y su expresión depende del estado de las proteínas asociadas, mis células hijas van a tener este gen Y como
INACTIVO, debido a la modificación de las PROTEÍNAS ASOCIADAS, CON MI GEN EXACTAMENTE IGUAL.
¿Pero esto es también HERENCIA GÉNICA? NO, porque mis genes quedan iguales, lo que se modifica son las PROTEÍNAS
ASOCIADAS, así que esta es la HERENCIA EPIGENÉTICA.
Si, cuando nos referimos a las CÉLULAS HIJAS, por medio de DIVISIÓN MITÓTICA. Por ejemplo, si una célula intestinal
sufre una modificación en una histona, y cambia su expresión de un gen, cuando se divida, las DOS CÉLULAS HIJAS, van a
respetar este patrón de expresión, teniendo las mismas modificaciones en sus PROTEÍNAS ASOCIADAS, así veremos un
PATRÓN DE HERENCIA EPIGENÉTICA.
Pero, ¿Por qué dijimos que NO SE TRANSMITE A LA DESCENDENCIA? Bueno, cuando hablamos de DESCENDENCIA para
referirnos a hijos de individuos, en los cuales entran en juego las CÉLULAS GERMINALES, esto no se transmite! Las células
germinales, los óvulos y espermatozoides borran estos cambios, así el nuevo organismo hereda la información genética
sin estas modificaciones EPIGENÉTICAS, sin embargo se está descubriendo que esto no es algo tan absoluto, y algunos
cambios EPIGENÉTICOS SE HEREDAN.
Su UBICACIÓN será:
Por DEBAJO DE LA
LÁMINA NUCLEAR.
PERINUCLEOLAR.
Igual, no es necesario
mermorizar esto, ya que en la
imagen de la izquierda ,se ve
como se puede identificar con
ese color tan OSCURO, casi
NEGRO, a diferencia de la
EUCROMATINA.
Lo que se dice es que la HÉTEROCROMATINA tiene un efecto conocido como EFECTO DE POSICIÓN.
Supongamos que tenemos un gen en la EUCROMATINA, y cambia de POSICIÓN de una de estas formas:
Se acerca a la HÉTEROCROMATINA.
Se pasa a ubicar en la HÉTEROCROMATINA.
Vemos el GEN WHITE, que le da el pigmento ROJO a los ojos de la MOSCA. Vemos que está EL GEN WHITE,
una barrera de DNA, y luego tenemos la HÉTEROCROMATINA. ¿Qué es lo que sucede?
Tenemos el
GEN.
ELEMENTO DE BARRERA.
NUCLEOSOMAS CON
MODIFICACIONES
COVALENTES QUE
ATRAEN OTRAS
PROTEÍNAS.
Acá vemos como las distintas modificaciones que sufren las HISTONAS, van a ser vitales para este proceso de
REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA.
¿Cómo ocurrió este efecto de posición? Por una TRANSLOCACIÓN, en la que dejó a la EUCROMATINA, cerca de la
HÉTEROCROMATINA, así se puede ver la idea de un mosaico en este órgano, variando la zona de inactivación en las
distintas células.
Los fenómenos de COMPACTACIÓN y
DESCOMPACTACIÓN, para ACTIVAR o
DESACTIVAR la expresión de genes se da
gracias a diferentes MODIFICACIONES
COVALENTES en las proteínas ASOCIADAS
AL DNA, las HISTONAS, y son
modificaciones de CARÁCTER QUÍMICO.
Acetilación – Desacetilación.
Metilación – Desmetilación.
Fosforilación – Desfosforilación.
Ubiquitinización.
El NUCLEOSOMA cuando se tiene que ver su modificiación y su nivel de compactación, no se va a identificar el estado por
una ÚNICA MODIFICACIÓN en un NUCLEOSOMA, y este conjunto forma un CÓDIGO leído por distintas proteínas, que se va a
adaptar por COMPLEMENTARIDAD MOLECULAR.
Una modificación MUY ESTUDIADA, es la METILACIÓN DE LAS COLAS DE HISTONAS H3, en la Lys 9. Acá entra en juego una
proteína llama HP1, la cual tiene un DOMINIO, que le permite reconocer la COLA TRIMETILADA, viendo la importancia de este
juego de encastre o complementaridad molecular.
Las colas Metiladas atraen a una proteína llamada HP1, y esta proteína tiene un DOMINIO que reconoce secuencias que dan
lugar a la HETEROCROMATIZACIÓN DE LA CROMATINA, y acá tenemos a un grupo de dominios proteicos particular, los
CROMODOMINIOS.
Son DOMINIOS que se unen al nucleosoma, cuando reconocen modificaciones covalentes. Luego de la unión de una HP1, se
van a unir más, oligomerizándose.
Ahora, también hay proteínas que se pueden unir a HISTONAS MODIFICADAS, permitiendo que se mantenga LAXA la
cromatina, los BROMODOMINIOS.
Bueno, la unión de HP1, tiene un efecto colaborativo podríamos decir, ya que cuando esta interacción sucede, se ve que van a
ser atraídas más HITONAS METIL TRANSFERASAS, para que aumente el grado de metilación.
HISTONA MODIFICACIÓN
EN COLA
HISTONA.
ACETILACIÓN DESCONDENSACIÓN. BROMODOMINIOS
.
Igual, las modificaciones covalentes que sufren las histonas, NO SON LAS ÚNICAS MODIFICACIONES, valga la redundancia,
hay una gran cantidad de variantes de los nulceosomas.
Con esto vemos que las histonas y los complejos que forman, los nucleosomas, no son meras proteínas estructurales como si
la columna de un edificio se tratara, y su única función fuera la de un soporte a la hora de condensar la cromatina, sino que
tiene una gran variedad de funciones, tanto por las modificacioens que sus colas pueden, de mismo modo que las distintas
isoformas van a ser cruciales para distintos mecanismos génicos desde la reparación como la segregación, entre otros.
Bueno, los nucleosomas van a presentar
variantes:
Modificaciones COVALENTES.
VARIANTES DE HISTONAS (Distintas
ISOFORMAS)
EL COMPLEJO LECTOR, va a atraer distintas proteínas. Esta misma proteína del COMPLEJO LECTOR, puede poseer
cromodominios o bromodominios según su función.
Ahora, como este es un lector, va a leer, y por lo tanto va a reconocer ¿Qué reconoce? Combinaciones específicas de
modificaciones en los nucleosomas
Cuando el complejo lee y atrae otras PROTEÍNAS que atrae otras proteínas para modificar a las histonas, y por lo
tanto modificar al nucleosoma, así llegamos a ver como este complejo lector, a parte de ‘leer el código de histonas’
modifica al atraer otras proteínas que regulan la expresión, por eso decimos que es un complejo que lee y escribe,
así lo vemos como COMPLEJO LECTOR – ESCRITO.
El complejo LECTOR – ESCRITOR se
llama así porque cuando hay un código
por las modificaciones de las histonas, lo
que tenemos es una proteína que va a
leer estas, luego, esta misma proteína
va a reclutar otras con la capacidad de
modificar a los nucleosomas, siendo
este el ESCRITOR, así la señal va a
difundirse a lo largo del cromosoma,
difundiendo estos cambios
El mecanismo asociado al PORO NUCLEAR, se asocia al DNA, y evita la progresión de la señal expansiva, Se ANCLA AL
PORO y FRENA LA PROPAGACIÓN, evitando que siga la propagación.
Otro mecanismo es la asociación al DNA y a los NUCLEOSOMAS SIGUIENTES, de esta forma se evita que las proteínas
que marcarían los nucleosomas, así estos no se marcan y se frena la propagación.
El último caso estudiado es el de una PROTEÍNA BARRERA, que remueve lo que la proteína escritora agregó.
HÉTEROCROMATINA CENTROMÉRICA.
HÉTEROCROMATINA
PERICENTROMÉRICA.
Hay otras secuencias iguales de DNA en un cromosoma, pero no van a dar lugar a que se forme un centrómero, porque la
formación de este no depende de forma exclusiva de las secuencias de DNA, sino también de las PROTEÍNAS ASOCIADAS
El EMPAQUETAMIENTO en le
HTEROCROMATINA también se va a
heredar, se va a necesitar un complejo
LECTOR ESCRITOR REMODELADOR,
para que tenga las mismas
modificaciones que las de la HEBRA
MADRE.
Con lo visto, podemos hablar afirmar
que la heterocromatina no es igual en
todas sus zonas, sino que van a difererir
para las distintas funciones
estructurales que pueden tener.
Tenemos la existencia de la
HETEROCROMATINA con la proteína
HP1, también existe la que posee el
complejo POLYCOMP, de misma forma
que hay partes con ambos complejos, o
sin alguno de estos.
Un ejemplo son estos cromosomas especiales de las glándulas salivales de la mosca, llamados POLITÉNICOS, que al
verse en el microscopio se lo ve como bandas ‘negritas’ que son zonas de heterocromatina, y bandas blancas, que eran
eucromatina.
Bueno, luego se hizo el agregado de sondas fluorescentes, se marcó con ROJO el DNA, y con verde las HISTONAS
MODIFICADAS. Marcando la acetilación y DIMETILACIÓN, que se vio que sucede en las zonas de HETEROCROMATINA
más compactada, viendo de esta forma como las acetilaciones y dimetilaciones en el mismo aminoácido, da lugar a
diferentes funciones modificaciones.
En la imagen en la que vemos a los distintos
cromosomas unidos a sondas fluorescentes de
distintos colores, vemos que los cromosomas
fuera de la etapa de división están separados en
zonas específicas, ¿Qué quiere decir esto?
¿Cómo se inactiva esto? Los nucleosomas tienen una H2A UBIQUITINIZADA, la H3 y H4 HIPOACETILIZADA, METILADA LA
HISTONA H3, y hay un CENTRO INACTIVADOR del CROMOSOMA X, que codifica para un RNA que dirige la inactivación
del CROMOSOMA X, este RNA al expresarse comienza el empaqutamiento del cromosoma.
Esto es un control de GENES EPIGENÉTICO, en el que tengo dos genes idénticos, pero uno se expresa y el otro no.
Un claro ejemplo de esto es en los gatos TRICOLOR, ¿Por qué? Por el mosaico del cromosoma X. En los gatos da lugar
para el color del pelo. En los gatos macho, el cromosoma X tiene información para el color NEGRO o ROJO, y en la
HEMBRA, hay un cromosoma X de la madre, y del padre. Si se inactivan en el estado de UNA CÉLULA, el gato va a tener
un ÚNICO COLOR, pero cuando se inactiva luego de varias divisiones, hay células que van a tener el pigmento rojo, y
otros el negro.
¿Cómo llegamos a los genes homólogos? Por duplicación y por divergencia! La divergencia es que se dupliquen, se
formen dos especies distintas, y que luego muten.
Así llegamos como de una Tubulina ancestral, hasta las tubulinas de distintos organismos.