Busqueda Eficiente de

Información Biomédica

Dr. Guillermo Goldfarb

Informática Médica
Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez
 ¿Cómo buscamos información biomédica?

La humanidad ha generado en los pasados 30 años

más información que la producida en los últimos 5000,
y dicho conocimiento se duplica cada 5 años .
2003
(Wurman, R., Facts, statistics and the anxiety syndrome.

Lancet, 1991. 337: p. 37-38.)

Radiología Digital

P e t a b y t e s
Registros Médicos
Electrónicos
40,000 BCE
Cardiología digital
pinturas cavernas 3500
herram. huesos
escritura 0 C.E.
papel 105
1450
imprenta 1870
electricidad, telefono
transistor 1947
computacion1950
Fin de los1960s
Internet 1993
La Web
1999
2003
Fuente: UC Berkeley, School of Information Management and Systems.

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 PUBMED: Uso

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PUBMED: Quién busca?

Público General
30%

Profesionales Investigadores
Médicos
36%
34%

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Anualmente se publican 20.000 journals y 17.000 nuevos libros.
Para leer todo lo de posible importancia en el ámbito de la
medicina, se necesitaría leer 6000 artículos por día.
(Arndt, K.A., Information excess in medicine. Overview, relevance to
dermatology, and strategies for coping. Arch Dermatol, 1992. 128(9): p.
1249-56 )

Como hacemos?!
Tarde o temprano, todos los
profesionales de todas las disciplinas,
tendremos que desempeñarnos como
profesionales de la información.
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 Profesionales de la Información?
Debemos capacitarnos
en el uso de las nuevas
herramientas para
mejorar nuestra chance
de mantenernos
actualizados,
balanceando el esfuerzo
y el tiempo invertido en
la búsqueda con la
validez y relevancia de la
información obtenida.

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 Estrategia: Medicina Basada en la
Evidencia (MBE)
1. Formulación de una pregunta a partir del
problema clínico que presenta el paciente
2. Búsqueda de la literatura (Medline,
colaboración Cochrane)
3. Lectura crítica de la bibliografía (validez)
4. Análisis de los resultados
5. Aplicabilidad en los pacientes
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Formulación de la pregunta:
De esta primer etapa depende:
• Cantidad
• Especificidad
• Calidad de la Información

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Tipos de preguntas
• Básicas
• Generales
• Amplias
• Básicas
• Cuál es el gérmen más frecuente en
OMA, cómo se diagnostica el reflujo
gastroesofágico, qué es una
convulsión febril simple
• Conviene utilizar un libro de texto!

• Avanzadas
• Específicas
• Focalizadas
• Dirigidas
• Tratan sobre la condición de un
paciente, característica de un
problema, intervenciones y
resultados
• Bases de datos actualizadas

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 Cómo Estructurar la pregunta? (PICO)
Control
tratamiento, examen
factor de riesgo, tiempo

Paciente Resultado (Outcome)

enfermedad y/o mortalidad, diagnóstico
característica calidad de vida

Intervención
tratamiento, examen
factor de riesgo, tiempo
.
Richardson WS, Wilson MC, Nishikawa J, et al. ACP J Club 1995 Nov/Dec;123:A12-3
 Dónde Buscamos?
Pirámide de las 5s

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Pueden acceder a los distintos recursos
desde guti.gob.ar/links
Niveles de evidencia y grados de
recomendación
Grado de Nivel de
Intervenciones
recomendación evidencia
1a Revisión sistemática de RCTs
A
1b Un ensayo randomizado controlado
2a Revisión sistemática de cohortes
2b Cohorte individual
B Revisión sistemática de estudios caso-
3a
control
3b Caso-control individual
C 4 Series de casos

D 5 Opinión de expertos sin análisis crítico

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Como buscar?
•Elija conceptos
•Encuentre las palabras claves
adecuadas y tradúzcalas al
ingles
•Combinen los términos con
– AND
– OR
– NOT
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Operadores lógicos
AND – OR - NOT

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“La base de literatura médica más
conocida y consultada”

http://www.pubmed.org
http://pubmed.gov
MEDLINE
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 Características:
– Contiene más de 19 millones de referencias a artículos de
publicaciones periódicas de todo el mundo en el ámbito de la
biomedicina.

– Indiza citas desde 1946 hasta hoy.

– Citas de más de 5200 publicaciones periódicas en 37 idiomas

– 50% de las mismas fueron originalmente publicadas en E.E.U.U.

– El 86% tiene como idioma de origen el inglés

– El 76% de las citas posee resúmenes escritos por los autores.

– Aproximadamente 8,000 referencias son ingresadas

semanalmente a la base (400,000 al año aproximadamente).

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http://pubmed.gov
Para qué un vocabulario controlado?
En medicina, hay muchas formas de decir lo mismo…

• Pirexia
• Fiebre
• Hipertermia
• Temperatura corporal FIEBRE
mayor de 38°C
• Elevación anormal de
la temperatura corporal
– Qué significa:
Medical Subject Headings

– Vocabulario médico y científico de terminología controlada

de la NLM para sus diferentes bases.

– Vocabulario autorizado tanto para la indización como para la

recuperación de las citas en las bases de la NLM.

– Los descriptores tratan de representar los conceptos

principales tratados en las citas.

– Se trata que cada concepto este representado por un solo

descriptor.

– Se actualiza y revisa anualmente.

Acceso al MeSH

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 MeSH Database

• Es una interfaz de búsqueda exclusiva

para palabras clave.
• Permite limitar la búsqueda de acuerdo
a subencabezados
• Punto de partida recomendado cuando
la búsqueda por texto libre no entrega
los resultados esperados!!

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MeSH – Estructura jerárquica
- All MeSH Categories
- Diseases Category
- Respiratory Tract Diseases
- Bronchial Diseases
- Bronchitis
- Bronchiolitis
- Bronchiolitis, Viral

Definición: An acute inflammatory disease of the lower

RESPIRATORY TRACT, caused by paramyxoviruses, occurring
primarily in infants and young children; the viruses most
commonly implicated are PARAINFLUENZA VIRUS TYPE 3;
RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS, HUMAN; and
METAPNEUMOVIRUS.
Year introduced: 1967
 MeSH: subencabezados
• Divisiones o facetas temáticas que se relacionan en
forma lógica con cada encabezado para darle mayor
especificidad a la indexación.
• Muy útiles para limitar la búsqueda cuando se
recuperan muchas citas.
Ej.: Bronchiolitis, Viral - Subheadings
 Le recomiendo ver ahora
alguno de los tutoriales sobre
uso del MeSH!
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/meshtutorial/introduction/index.html

https://youtu.be/uyF8uQY9wys

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 Página de resultados

8 5
6 7
1
3
2

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Filtros más utilizados en PubMed

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PubMed: Related Information
• PubMed compara las palabras
del título, abstract y MeSH de
cada cita, las coincidencias son
guardadas en un set
precalculado

• Se muestran por un ranking de

relevancia, con la cita de origen
al principio

• Orienta en la búsqueda si no se
encuentra lo términos
adecuados

• Usarla siempre al encontrar la

cita que mejor representa lo que
se busca
PubMed: Herramientas y otros recursos

Permiten realizar búsquedas específicas.

Se accede a ellas desde la página de inicio del PubMed
• MeSH Database (palabras claves)
• Journals in NCBI Database (publicaciones)
• Single Citation Matcher (citas)
• Clinical Queries (filtros metodológicos)
• Linkout (links al texto completo)
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 PubMed

En resúmen...
• Seleccione 1 o 2 términos claves de la
pregunta estructurada
• Realice la búsqueda por texto libre o…
• Seleccione el término MeSH que mejor
defina los conceptos
• Combine con los operadores lógicos
adecuados (AND, OR, NOT)
• Limite por humanos, grupo etáreo, idioma
y tipo de publicación

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 Ahora a realizar las actividades!
Espero sus comentarios en el foro
del módulo ;-)

Dr. Guillermo Goldfarb