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Manual Bioquimica para Reimpresos
Manual Bioquimica para Reimpresos
Universidad de Antioquia
Facultad de Química Farmacéutica
Departamento de Farmacia
Primera edición
Medellín, 2014
CONTENIDO
MANUAL DE LABORATORIO DE BIOQUÍMICA
UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
FACULTAD DE QUÍMICA FARMACÉUTICA
DEPARTAMENTO DE FARMACIA
LABORATORIO DE BIOQUÍMICA Y TOXICOLOGÍA
5-324
Pág.
INTRODUCCIÓN 4
OBSERVACIONES GENERALES 5
Normas de bioseguridad en el laboratorio 5
Reglamento interno del laboratorio 5
Normas para el trabajo en el laboratorio 5
Manejo y disposición de los residuos 6
Equipo de protección personal (EPP) 7
Primeros auxilios 8
EQUIPOS DE LABORATORIO 10
PRÁCTICA # 1 Bases de datos y herramientas estadísticas 14
PRÁCTICA # 2 Espectrofotometría y curva de calibración 17
PRÁCTICA # 3 Cuantificación de proteínas: método de Bradford 21
PRÁCTICA # 4 Actividad enzimática: Tirosinasa 23
PRÁCTICA # 5 Fosfatasa alcalina I 29
PRÁCTICA # 6 Fosfatasa alcalina II 32
PRÁCTICA # 7 Actividad enzimática: Fosfolipasa A 2 35
PRÁCTICA # 8 Fermentación alcohólica: Glucólisis anaerobia 38
PRÁCTICA # 9 Electroforesis de proteínas en geles de poliacrilamida 42
INTRODUCCIÓN
MANUAL DE LABORATORIO DE BIOQUÍMICA
UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
FACULTAD DE QUÍMICA FARMACÉUTICA
DEPARTAMENTO DE FARMACIA
LABORATORIO DE BIOQUÍMICA Y TOXICOLOGÍA
5-324
No se deben arrojar residuos sólidos, papeles, servilletas por las pocetas, al piso o a
las mesas de trabajo, desecharlos en forma adecuada y en los recipientes asignados
para tal fin:
Color Caneca Tipo de Residuo Clasificación
Muestras y material
Roja Riesgo Químico y Biológico
contaminado
Protección ocular
Las gafas de seguridad deben ofrecer una buena protección frontal y lateral.
Son de uso permanente durante toda la práctica.
Protección pulmonar
Las mascarillas individuales, deben contener el adsorbente adecuado al tipo de
sustancia que se va a manipular y se deben portar cuando sea necesario.
Ropa de protección
La bata de laboratorio está diseñada para proteger la ropa y la piel de las
sustancias químicas que pueden derramarse o producir salpicaduras. Es de
obligatorio uso.
Primeros auxilios
Quemaduras
Para la atención de pequeñas quemaduras producidas por material caliente,
como lo son los baños maría, las placas o mantas de calentamiento , etc. Se
debe efectuar primero un lavado con abundante agua fría en la zona afectada
durante 10-15 minutos. Luego del lavado se debe aplicar una crema o pomada
indicada para estas lesiones, como lo es la Sulfadiazina de Plata (Sulfaplata ®) la
cual se encuentra en el botiquín de primeros auxilios del laboratorio.
Las quemaduras más graves y que comprometan mucho tejido epitelial se debe
proceder con el lavado con agua fría sobre el tejido afectado y remitir
inmediatamente al servicio medico para recibir atención especializada.
Cortes
Si durante el desarrollo de las practicas se presenta algún corte, este se debe
lavar inmediatamente con agua y jabón desinfectante y se debe cubrir con un
apósito indicado, si la hemorragia persiste se debe acudir inmediatamente al
servicio medico.
Incendios
Evacuar inmediatamente el laboratorio, por pequeño que sea el fuego, para
esto utilizar la salida principal o por la salida de emergencia si la principal está
bloqueada. Avisar a todos los compañeros de trabajo sin que se cree pánico y
conservando siempre la calma.
o Fuego leve
Si el fuego es pequeño y localizado, apagar utilizando extintor adecuado,
arena, o cubriendo el fuego con recipientes de tamaño adecuado que lo
ahogue. Retirar los productos químicos inflamables que estén cerca del
fuego. No utilice nunca agua para extinguir fuego provocado por
inflamación con un disolvente.
o Fuegos alto
Aislar el fuego. Utilizar los extintores adecuados: el de CO2 para
incendios de gases (tipo A) y el de agua a presión con CO2 en solución,
para sólidos y líquidos.
Fuego corporal
Si se genera fuego sobre ti en tu ropa, pide ayuda inmediatamente, estírate
sobre el suelo y comienza a rodar sobre ti mismo, si el fuego continua la
persona que te este auxiliando te debe cubrir con una manta o cobija con el fin
de ahogar el fuego o trasladarte a la ducha de seguridad para extinguirlo con
agua y si se requiere se debe retirar su ropa, siempre y cuando no se encuentre
adherida a su piel, si es así utilizar una tijera y cortar la no adherida. No se debe
utilizar el extintor directamente sobre la persona y se debe acudir
inmediatamente al servicio medico.
EQUIPOS DE LABORATORIO
MANUAL DE LABORATORIO DE BIOQUÍMICA
UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
FACULTAD DE QUÍMICA FARMACÉUTICA
DEPARTAMENTO DE FARMACIA
LABORATORIO DE BIOQUÍMICA Y TOXICOLOGÍA
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Baño María
Estufa de Secado
Balanza Analítica
pH-Metro
Centrifuga
El uso de las bases de datos en el mundo académico es más común día a día, sin
embargo muchos estudiantes no tienen éxito en sus búsquedas, ya sea por
desconocimiento de los buscadores o por imprecisión en las palabras claves utilizadas.
En esta práctica se darán conceptos básicos sobre el uso de las bases datos a las que
nuestra biblioteca tiene acceso.
Science Direct
Springer
Pubmed
EBSCO
Y otras más.
La estadística es una herramienta valiosa que debe ser aprovechada por personas que
trabajan en diferentes aéreas. En ciencias biológicas la estadística nos ayuda a
establecer diferencias entre tratamientos, concentraciones, tiempos, ensayos,
estándar y muestras, entre otras. Adicionalmente ésta ciencia es de gran apoyo al
momento de discutir los resultados obtenidos experimentalmente, sin embargo
muchas personas no conocen los análisis que deben ser realizados a sus datos y mucho
menos la interpretación de los mismos. Por esta razón en esta práctica se darán
nociones del uso de Excel en algunos análisis estadísticos simples, así como la
interpretación de los mismos.
PRÁCTICA # 2 ESPECTROFOTOMETRÍA Y CURVA DE
CALIBRACIÓN
Objetivos
Aspectos Teóricos
Cuando una molécula absorbe radiación visible, sus electrones se excitan y pasan a
un nivel de energía mayor, sin embargo los electrones también pueden caer a niveles
de menor energía y pueden emitir radiación electromagnética. Cuando un haz de luz
incide sobre un cuerpo traslúcido (ej. una solución), una parte de esta luz es absorbida
por el cuerpo, y el haz de luz restante atraviesa dicho cuerpo. La absorbancia es la
cantidad de luz absorbida, mientras que la transmitancia es la cantidad de luz que
logra pasar el cuerpo. A mayor cantidad de luz absorbida, mayor será la absorbancia
del cuerpo, y menor cantidad de luz será transmitida por dicho cuerpo.
Materiales:
Espectrofotómetro
Celdas para el Espectrofotómetro
Tubos de ensayo
Vaso de precipitados
Frasco lavador
Reactivos:
TUBO BLANCO 1 2 3 4 5 6 7
Dilución 0 1/1 1/2 1/4 1/8 1/16 1/32 1/64
Solución
0 4 0 0 0 0 0 0
Patrón (ml)
Cantidad de
solución 0 0 2 2 2 2 2 2
anterior (ml)
Solución salina
4 0 2 2 2 2 2 2
(ml)
Concentración
(mol/l)
Absorbancia
obtenida
Residuos
Bibliografía
Objetivo
Aspectos Teóricos
Materiales
Espectrofotómetro.
Celdas para espectrofotómetro.
Agitador.
Micropipeta 100–1000 µl.
Reactivos
Tubo 1 2 3 4 5 6 7
Dilución (v/v) 1/1 1/2 1/4 1/8 1/16 1/32 1/64
Concentración (µg/100µL) 100 50 25 12.5 6.25 3.12 1.56
Prepare una serie tubos en los cuales depositará 200 µL de cada una de las
diluciones preparadas, posteriormente adicione 3 ml del reactivo Azul de
Coomasie, deje en reposo por 5 min en la oscuridad y lea Absorbancia a 595
nm contra un blanco correctamente preparado.
Preguntas
Bibliografía
Bradford MM. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram
quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Analyt.
Biochem. 1976; 72: 248-254.
Spector, T. Refinement of the Coomassie Blue method of protein quantitation.
A simple and linear spectrophotometric assay for <0.5 to 50 μg of protein.
Analyt. Biochem. 1978; 86: 142-146.
PRÁCTICA # 4 ACTIVIDAD ENZIMÁTICA: TIROSINASA
Objetivo
Aspectos Teóricos
Las enzimas son los catalizadores de los sistemas biológicos, son altamente
específicas y se recuperan al final de cada ciclo de reacción. En general son de carácter
proteico pero también se conocen algunos RNAs con propiedades catalíticas. Estos
catalizadores tienen parámetros enzimáticos como Km y Vmax, sin embargo estos
varían de acuerdo al sustrato y la concentración de enzima. La forma más adecuada de
cuantificar la actividad enzimática es medir la cantidad de producto que se forma por
unidad de tiempo. Sin embargo, tal actividad se ve influenciada por el pH y la
temperatura del microambiente donde ocurre la reacción, la concentración de
sustrato y coenzimas o cofactores, entre otras.
Todas las enzimas tienen condiciones óptimas de catálisis, es decir un pH, temperatura
y fuerza iónica del medio a las cuales la enzima cataliza la reacción de la forma más
eficiente posible. Sin embargo, los cambios de pH en el ambiente donde ocurre la
reacción pueden provocar que las cadenas laterales de los aminoácidos del sitio activo
se protonen o desprotonen lo que provocaría una perdida en la capacidad de la enzima
para llevar a cabo la reacción.
HO
O HO
COOH
COOH
HO NH
CO2 NH NH
O HO
Dopa crome, 420 nm
O
O
N
NH
O
O
O
N
O
M elanina
Reactivos y Equipos
Sección Experimental
Extracción de la enzima.
Nota: Los datos de 1.0 ml debe tomarlos del ensayo de Medida de la actividad
enzimática.
pH
Absorbancia
3.0 7.2 10.0
Tiempo(seg)tubo
0.0
20
40
60
80
100
120
150
180
Nota: Los datos de pH 7.2 debe tomarlos del ensayo de Medida de la actividad
enzimática.
Absorbancia
2°C 25°C 37°C
Tiempo(seg)tubo
0.0
20
40
60
80
100
120
150
180
Nota: Los datos de 25°C debe tomarlos del ensayo de Medida de la actividad
enzimática.
Preguntas
Bibliografía
Objetivo
Aspectos Teóricos
OPO3-- OH
H2O
Enz
--
HPO3 NO2
NO2
PNPP PNP
Este sustrato es incoloro pero por hidrólisis se libera el p-Nitrofenol (PNP), que es
amarillo y absorbe a = 410 nm, lo cual posibilita “seguirlo”
espectrofotometricamente. Este es el principio fundamental de esta práctica.
En resumen:
Reactivos
Sección experimental
Tubo 1 2 3 4 5 Blanco
Dilución PNP 10-4M 2 ml
1/1 1/2 1/4 1/8 1/16
Volumen final 2 ml Glicina
Fosfato de sodio 0.5M 1 1 1 1 1 1
-4
Sln de ZnCl2 610 M 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Absorbancia
Concentración PNP
Nota:
Bibliografía
Bessey O, Lowry O, Brock MJ. A method for the rapid determination of alkaline
phosphatase with five cubic millimeters of serum. J. Biol. Chem. 1946; 164: 321-
329.
PRÁCTICA # 6 FOSFATASA ALCALINA II
Objetivo
Sección experimental
Tubo 1 2 3 4 5 Blanco
PNPP Volumen 2 ml
1/1 1/2 1/4 1/8 1/16
final 2 ml Glicina
Sln. ZnCl2 610-4M
0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
(ml)
Absorbancia
Tubo 1 2 3 4 5 Blanco
PNPP Volumen 2 ml
1/1 1/2 1/4 1/8 1/16
final 2 ml glicina
Inhib.0.510-2M 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Sln. ZnCl2 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Preguntas
Nota:
Bibliografía
Objetivos
Cuantificar la actividad de una enzima que actua en una interfase lípido:agua.
Utilizar la técnica de extracción líquido:líquido para separar uno de los
productos de la reacción.
Aspectos Teóricos
Figura 1. Reacción catalizada por las PLA2. Liberación de un ácido graso desde la posición sn-2 de un
glicerofosfolípido.
Las PLA2s de venenos de serpiente pertenecen a los grupos IA, IIA y IIB. Estas
proteínas inducen diversos efectos, entre los cuales se incluyen neurotoxicidad pre y/o
posináptica, miotoxicidad local y/o sistémica, anticoagulación, cardiotoxicidad,
modulación de la agregación plaquetaria, actividades hemolítica, edematizante e
hipotensora y daño directo en órganos como el riñón, pulmón e hígado (2). Aunque es
claro que no todas las PLA 2s de venenos de serpiente tienen la capacidad de inducir
todos los efectos mencionados.
Materiales
Baño María.
Micropipetas (10-100, 100-1000) l.
Pipetas volumétricas 2 ml, 5 ml.
Plancha de agitación y calentamiento.
Reactivos
Sección Experimental
Calcular los Eq-g de ácidos grasos generados con base en los µl de NaOH gastados,
por unidad de tiempo y de masa de enzima. Expresar los resultados en actividad
enzimática Eq/min/mg Enzima.
Resultados
Preguntas
Bibliografía
Dole VP. A relation between non-esterified fatty acids in plasma and the
metabolism of glucose. J. Clin. Invest 2000; 35, 150-154.
Kini RM. Excitement ahead: structure, function and mechanism of snake venom
phospholipase A2 enzymes. Toxicon. 2003.42: 827-840.
Schaloske RH, Dennis EA. The phospholipase A2 superfamily and its group
numbering system. Biochim Biophys Acta. 2006; 1761: 1246-1259.
PRÁCTICA # 8 GLUCÓLISIS ANAEROBIA: FERMENTACIÓN
ALCOHÓLICA
Objetivos
Determinar las diferentes velocidades en la fermentación de mono, di y
polisacáridos.
Determinar el efecto de la concentración del azúcar en el proceso de
fermentación.
Comprobar la inhibición de la ruta metabólica ocasionada por el NaF.
Aspectos Teóricos
Glucosa
2Piruvato
Sin O2 Sin O2
O2
2Acetil CoA
Materiales
Tubos de ensayos.
Beakers.
Baño María.
Manguera.
Agujas de jeringa.
Probeta 25ml.
Tapones para tubos de ensayo.
Soporte universal.
Reactivos
Levadura fresca al 10%.
Glucosa al 10% y 30%.
Fructosa al 30%.
Sacarosa al 30%.
Almidón al 1%.
NaF 0.1M.
Agua destilada.
Sección Experimental
Tape el tubo de ensayo con un tapón de caucho, agite y atraviese el tapón con
la aguja de jeringa desechable.
Nota: La probeta se llena con agua, se tapa con el dedo pulgar, se invierte y se
sumerge en el beaker con agua. La probeta debe contener agua, hasta donde termine
la marcación.
Glucosa Glucosa
Glucosa Glucosa Fructosa Sacarosa Almidón
10% con 10%con
Carbohidrato 1% 10% 10% 10% 1%
agua NaF
Tubo 1 Tubo 2 Tubo 3 Tubo 4 Tubo 5
Tubo 6 Tubo 7
Volumen
Residuos
Los residuos obtenidos no son considerados peligrosos, dispóngalos por el desagüe.
Resultados
Preguntas
Bibliografía
Movak M, Strehaiano, P, Moreno M, Goma G. Alcoholic fermentation: On the
inhibitory effect of ethanol. Biotechnol. Bioeng. 1981; 23: 201-211.
David Nelson, Michael Cox. Lehninger Principios de Bioquímica. Quinta Edición.
Ediciones Omega S.A. Barcelona, España. 2009. Traducción de: David Nelson,
Michael Cox. Lehninger Principles of Biochemistry. Fifth edition. W.H. Freeman
Company. New York, United States. 2009.
PRÁCTICA # 9 ELECTROFORESIS DE PROTEÍNAS EN GELES DE
POLIACRILAMIDA
Objetivo
Comprender e identificar los conceptos básicos, teóricos y prácticos, relacionados
con la separación de proteínas a través del método de electroforesis
Aspectos Teóricos
Las proteínas presentan una carga eléctrica neta si se encuentran en un medio que
tenga un pH diferente al de su punto isoeléctrico y por eso tienen la propiedad de
desplazarse cuando se someten a un campo eléctrico. La velocidad de migración es
proporcional a la relación entre las cargas de la proteína y su masa. Cuanto mayor
carga por unidad de masa más rápida será la migración.
En esta práctica se pretende separar las proteínas del suero fetal bovino tanto en
condiciones desnaturalizantes como reducidas.
Materiales
Cámara de electroforesis vertical y accesorios.
Micropipetas de 20, 200 y 1000 µL.
Gradillas de plástico.
Reactivos
Solución de poliacrilamida al 12% .
Buffer Tris-HCL 1,5 M pH= 8,8 .
Buffer Tris-HCL 0,5M pH= 6,8.
Dodecilsulfato de sodio (SDS) al 10% .
Persulfato de amonio (APS) al 10% recién preparado.
N,N,N',N'-Tetrametiletilendiamina (TEMED solución stock).
Agua destilada.
Buffer de muestra.
Azul de coomasie R-250.
Agente Fijador.
Agente decolorante.
Sección experimental
COMPONENTE CANTIDAD
Agua desionizada 1500 µl
Buffer superior 630 µl
SDS 33 µl
Acrilamida/ bisacrilamida 330 µl
TEMED 5 µl
Persulfato de amonio 20 µl
o Separar los vidrios que contienen el gel con cuidado. Sacar el gel y eliminar
la parte del gel espaciador.
Preguntas
Cuál es la influencia de:
o El pH del gel de apilamiento sobre la calidad de las bandas.
o La concentración de monómero en el gel de separación sobre la
capacidad para diferenciar dos proteínas con pI muy parecidos.
Bibliografía