Coronavirus situación actual

Las infecciones por coronavirus de múltiples orígenes se han extendido hasta la

fecha en todo el mundo, causando enfermedades respiratorias graves.

Se han identificado siete coronavirus que infectan a los humanos: HCoV-229E,

HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARS-CoV, MERS-CoV y SARS-CoV-2. 
- Entre ellos, SARS-CoV y MERS-CoV causaron brotes en 2002 y 2012,
respectivamente.
- SARS-CoV-2 (COVID-19) es el más recientemente descubierto.
Ha creado un brote mundial severo a partir de finales de 2019, que lleva a la fecha
a más de 4 millones de casos en todo el mundo. Los virus son genéticamente
simples, pero muy diversos. Sin embargo, los brotes recientes de SARS-CoV y
MERS-CoV, y el brote en curso de SARS-CoV-2, indican que aún queda un largo
camino por recorrer para identificar y desarrollar tratamientos terapéuticos
específicos.
En 2018, el Comité Internacional de Taxonomía de Virus dividió los Coronaviridae
en Orthocoronavirinae ySubfamilias de Letovirinae .
 De acuerdo con los objetivos del huésped, los coronavirus también se
pueden dividir en coronavirus humanos y animales. Muchas enfermedades
en animales domésticos están relacionadas con los coronavirus animales,
como el coronavirus respiratorio canino, que causa enfermedad respiratoria
en los perros.
 Los coronavirus humanos altamente patógenos pertenecen a la subfamilia
Coronavirinae de la familia Coronaviridae .
 En particular, el SARS-CoV-2 actualmente está causando una epidemia
mundial.
Hay dos loci genéticos que son sitios de variación en el SARS-CoV. Uno de estos
sitios está ubicado en el gen de la proteína espiga (S). El segundo sitio principal
de variación es el marco de lectura abierta del gen accesorio ORF8.
En MERS-CoV, los principales sitios de variación se encuentran en los genes S,
ORF4b y ORF3. 2 Las principales diferencias en la secuencia del gen S del SARS-
CoV-2 son tres inserciones cortas en el dominio N-terminal y cambios en cuatro de
los cinco residuos clave en el motivo de unión al receptor. 9 9Las organizaciones
del genoma y la expresión génica son similares para todos los coronavirus. ORF1a
/ b, ubicado en el extremo 5 ', codifica 16 proteínas no estructurales (NSP)
(llamadas NSP1 – NSP16); otros ORF en el extremo 3 'codifican proteínas
estructurales, incluidas las proteínas S, envoltura (E), membrana (M) y
nucleocápside (N).

Las mutaciones en SARS-CoV-2 se han convertido en un tema de investigación

candente. Las proteínas de superficie de SARS-CoV y BatCoV-RaTG13, los
precursores potenciales de murciélagos más cercanos de SARS-CoV-2, tienen 76
y 97% de identidad de secuencia, respectivamente, a la de SARS-CoV-2.
En comparación con el del SARS-CoV, la superficie antigénica del SARS-CoV-2
es muy divergente en comparación con otros CoV. Desde que comenzó su brote a
fines de 2019, el SARS-CoV-2 ha adquirido mutaciones en todo su genoma, y ya
hay cientos de cepas de virus distribuidas en todo el mundo.
Según GISAID.org, a partir del 8 de mayo, había 16.004 secuencias completas del
genoma disponibles, y el clado S del árbol del genoma completo contiene el grupo
más grande de virus, lo que indica que las mutaciones en ORF8-L84S son más
frecuentes. La resolución temporal supone una tasa de sustitución de nucleótidos
promedio de 5 × 10 −4sustituciones por sitio por año. En base a estas mutaciones,
los investigadores encontraron que el SARS-CoV-2 se puede dividir en dos
subtipos.
La historia de SARS-CoV, MERS-CoV y SARS-CoV-2
El primer caso de SARS se descubrió en Foshan, China, en noviembre de 2002. 6
Las infecciones ocurrieron por contacto directo o indirecto con pacientes.
Para julio de 2003, el SARS-CoV se había extendido a más de 30 países, 12
causando 8096 casos reportados y 774 muertes. Después de eso, no se
detectaron infecciones adicionales y se declaró la pandemia de SARS.
El SARS-CoV se aisló por primera vez de las civetas de palma del Himalaya
(HPC) de un mercado de animales vivos en Guangdong, China. 12 , 14 Otros
animales, como los perros mapache ( Nyctereutes procyonoides ), junto con
trabajadores humanos del mismo mercado, también mostraron evidencia de
infección viral. 12Múltiples estudios han demostrado que los reservorios de varios
coronavirus, incluidos los virus tipo SARS-CoV y MERS-CoV, eran murciélagos.
Aunque las civetas de palma podrían haber sido anfitriones intermediarios del
SARS-CoV, 16 investigadores a menudo concluyeron que no había evidencia de
que estos animales fueran las fuentes principales de SARS-CoV, y que los virus
no pueden circular directamente en las civetas de la palma en la naturaleza.
MERS-CoV se encontró por primera vez en 2012 en una muestra de pulmón de un
paciente de 60 años que murió de insuficiencia respiratoria en Jeddah, Arabia
Saudita. El 15 de septiembre de 2012, se aisló un tipo similar de virus llamado
coronavirus humano de un paciente con infección respiratoria grave.
Desde 2012 hasta el 15 de enero de 2020, el número total de casos de infección
por MERS-CoV confirmados por laboratorio notificados globalmente a la
Organización Mundial de la Salud (OMS) fue de 2506, con 862 muertes asociadas,
que abarca 27 países
MERS-CoV se identificó a partir de la saliva de un paciente con neumonía aguda e
insuficiencia renal en Jeddah (KSA). MERS-CoV puede detectarse en las
secreciones del tracto respiratorio, así como en las heces, el suero y la orina.
A finales de diciembre de 2019, se informaron los primeros grupos de pacientes
con neumonía causada por el SARS-CoV-2 en Wuhan, China. 27 El número
básico de reproducción de SARS-CoV-2 es de aproximadamente 2.2, lo que indica
que cada paciente propagaría la infección en promedio a 2.2 personas. 28 La
transmisión de SARS-CoV-2 de persona a persona se produjo rápidamente, y los
síntomas atípicos durante la etapa inicial pueden ser una desventaja adicional. 29
Además, la infección humana podría haber comenzado meses antes del anuncio
oficial del brote.
Sin embargo, la tasa de mortalidad del SARS-CoV-2 es menor que la del SARS 33
, con un riesgo de mortalidad estimado del 2%. 34 El SARS-CoV-2 se aisló por
primera vez de muestras clínicas utilizando células epiteliales de las vías
respiratorias humanas y las líneas celulares Vero E6 y Huh-7. 27 Los enfoques
para evaluar los viriones incluyen el aislamiento de muestras del tracto respiratorio
inferior 35 y células epiteliales de las vías respiratorias humanas libres de
patógenos humanos infectadas artificialmente.
SARS-CoV, MERS-CoV y SARS-CoV-2 plantean importantes desafíos para la
salud mundial, causando infecciones en grandes partes del mundo. El SARS-CoV
se encontró en 30 países y el MERS-CoV en 27 países, mientras que el SARS-
CoV-2 se encontró en 213 países antes del 8 de mayo de 2020
Análisis epidemiológico y síntomas de SARS, MERS y enfermedad por
coronavirus 2019 (COVID-19)
Las manifestaciones clínicas del SARS incluyen hipoxia, cianosis, fiebre alta (por
encima de 38 ° C), respiración acelerada o síndrome de dificultad respiratoria y
dificultad para respirar. Las radiografías muestran cambios en los pulmones en
diversos grados. La definición de caso de la OMS (2003) incluye lo siguiente: (1)
fiebre superior a 38 ° C o antecedentes de la misma en los últimos 2 días, (2)
evidencia radiológica de nuevos infiltrados compatibles con neumonía, (3)
escalofríos, tos, malestar general , mialgia o antecedentes conocidos de
exposición, y (4) prueba positiva para SARS-CoV mediante uno o más ensayos.
Alrededor del 81% de los pacientes infectados solo desarrollan síntomas leves,
con neumonía leve o sin neumonía. 14 y 5% son estado grave y crítico,
respectivamente.

Cincuenta y cuatro secuencias de proteína de pico filtradas de cada secuencia de

codificación de coronavirus se agruparon usando el programa CLANS (Análisis de
secuencias de análisis de clúster) en el sitio web de MPI Bioinformatics Toolkit.
Cada punto coloreado representa la secuencia de la proteína espiga de cada
coronavirus. Los puntos en el mismo color significan que son del mismo género, y
cada línea muestra la similitud de dos secuencias, con líneas más oscuras que
indican mayor similitud ( valores E más bajos). La familia Coronaviridae incluye los
siguientes géneros: Alphacoronavirus (coloreado en verde); Betacoronavirus
(rojo); Virus gammacoronavirus (naranja) y Deltacoronavirus (azul). Los SARS-
CoV, MERS-CoV y SARS-CoV-2 indicados pertenecen al género de
Betacoronavirus
Patogenia del SARS-CoV, MERS-CoV y SARS-CoV-2

Se cree que el mecanismo patogénico del SARS-CoV incluye dos partes: el virus
daña directamente a las células objetivo y la subsiguiente disfunción del sistema
inmune conduce a una lesión indirecta. 42 El SARS-CoV se propaga a través de la
transmisión de gotitas y contactos y por la ruta fecal-oral. A través de la inhalación
de gotas, el virus ingresa al tracto respiratorio e invade las células epiteliales. La
infección y la replicación del virus y los cambios inflamatorios locales contribuyen
al daño del tejido pulmonar. Posteriormente, el SARS-CoV infecta las células
inmunes circulantes y residentes. Las células clave en este paso consisten
principalmente en células T y macrófagos. Los virus son transportados a otros
órganos, incluidos los órganos linfoides secundarios, por estas células inmunes
circulantes. 42El SARS-CoV se parece al VIH porque ambos virus atacan a las
células inmunes y causan inmunodeficiencia.
El SARS-CoV causa daño pulmonar principalmente al inhibir la función de ACE2.
El virus se une a ACE2 a través de la proteína espiga, regulando negativamente
su función y contribuyendo a la lesión pulmonar. ACE2 es un componente
importante del sistema renina-angiotensina (RAS).
Diagnóstico y terapia.
Además de las manifestaciones clínicas, el diagnóstico definitivo y la confirmación
de una infección por coronavirus requieren pruebas específicas. Los criterios para
el diagnóstico de SARS de la OMS incluyen (1) fiebre superior a 38 ° C o
antecedentes de la misma en los últimos 2 días, (2) evidencia radiológica de
nuevos infiltrados compatibles con neumonía, (3) escalofríos, tos, malestar general
, mialgia o antecedentes conocidos de exposición, y (4) pruebas positivas para al
menos un ensayo
Las pruebas de ácido nucleico, como las pruebas de PCR en tiempo real, se
usaron principalmente para detectar virus en la etapa temprana del brote de
SARS-CoV-2, aunque este enfoque requiere un tiempo relativamente largo y no es
propicio para acelerar el diagnóstico o aplicación a escala. Por lo tanto, se pueden
usar kits alternativos de diagnóstico rápido para el SARS-CoV-2. Por ejemplo, el
kit de detección de oro coloidal utiliza muestras de suero, plasma o sangre
completa para detectar anticuerpos IgM / IgG para el diagnóstico el séptimo día de
infección o el tercer día después del inicio y requiere solo 15 minutos. El kit de
detección de ácido nucleico para seis virus respiratorios, incluido el SARS-CoV-2 y
el virus de la influenza A, utiliza chips amplificadores termostáticos para el
diagnóstico.
Agentes terapéuticos
Todos los pacientes deben ser tratados de forma aislada. 53 Según estudios previos, se
pueden desarrollar medicamentos para inhibir la entrada celular. Se han investigado
varias estrategias para identificar antivirales específicos dirigidos a la proteína S, incluidos
los nAbs dirigidos a MERS-RBD que bloquean la unión viral, los inhibidores peptídicos
dirigidos a S2 para prevenir la formación del núcleo de fusión y moléculas pequeñas sin
mecanismos definidos.