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Eva Palacios Muñoz
Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix”
15.- Aminoácidos proteicos: Estructura general. Carácter anfótero. Clasificación según la cadena lateral: apolar, polar sin carga y polar con carga (ácida o básica). Aminoácidos
esenciales (concepto).
2. 3. 1. PROTEÍNAS: Biomoléculas (macromoléculas) orgánicas más abundantes de la materia viva, compuestas por C, H, O y N. Son polímeros de más de 50 aminoácidos.
AMINOÁCIDOS (aa): Son los componentes de las proteínas. Son moléculas sencillas, no hidrolizables
DEFINICIÓN Compuestos orgánicos sencillos de bajo peso molecular. Sólidos, cristalinos, de elevado punto de fusión y solubles en agua.
Tienen actividad óptica y son anfóteros.
COMPOSICIÓN Bioelementos C, H, O y N
QUÍMICA Fórmula general H2N-CHR-COOH
ESTRUCTURA Contienen varios grupos unidos por 1 grupo carboxilo,
enlace covalente a un átomo de C- 1 grupo amino y
una cadena lateral o grupo R
CLASIFICACIÓN Según formen parte Aminoácidos Según su Polar Neutros Sin más grupos carboxilos Glicina (Gly)
de las proteínas o no proteicos grupo R ni amino. Dan enlace de H
(20) Ácidos Con grupos -COOH Aspártico y glutámico
Básicos Con grupos –NH2 Lisina, asparagina e histidina
Apolar Cadena Alifáticos (lineales) Ala (alanina),Val, Leu, Ile, Met,
(no polares o hidrocarbonada Trp,
hidrofóbicos) Aromáticos (con ciclos Phe (fenilalanina),
derivados del benceno) Pro (prolina)
Aminoácidos Algunos son intermediarios en reacciones metabólicas
no proteicos (150)
PROPIEDADES Isomería El C- es Presentan actividad Dextrógiros (+)
asimétrico óptica Levógiros (-)
Hay 2 configuraciones D Pueden ser + o - Grupo -NH2 a la derecha
o estereoisómeros L Pueden ser + o - Grupo -NH2 a la izquierda
(la mayoría)
Comportamiento Son anfóteros en Pueden ionizarse En medio ácido Se comporta como base Los grupos amino captan H+,
químico disolución acuosa. como ácidos y/o bases quedando como –NH3+
(regulan el pH) según sea el pH En medio básico Se comporta como ácido Los grupos carboxilo liberan H+,
quedando como –COO-
En medio neutro Se comporta como ácido Se ionizan doblemente, apareciendo
y base a la vez un zwitterion o forma dipolar
iónica:
+H3N-CHR-COO-
Punto isoeléctrico Es el valor de pH para el cual un determinado aminoácido no
tiene carga eléctrica neta
Aminoácidos No pueden ser Deben ingerirse en la En el hombre son 8 Fenilalanina Isoleucina Metionina
esenciales sintetizados por dieta Leucina Treonina Valina
los animales Lisina Triptófano
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ISOMERÍA
CON O SIN CARBONOS EJEMPLOS ESTEREOISÓMEROS
ASIMÉTRICOS (C*) (configuraciones)
Sin C* Gly (glicina) No hay configuraciones
Con un C*- alfa Casi todos los aminoácidos Hay 2 configuraciones (L y D) Todos loa aminoácidos que forman parte de las
proteínas son de forma L
Con 2 C* Ile (isoleucina) y Trh (treonina)
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PEPTIDOS:
Polímeros hidrolizables que por hidrólisis (reacción contraria al enlace peptídico) total originan aminoácidos
DEFINICIÓN Compuestos formados por la unión de aminoácidos (residuos) por enlace peptídico
CLASIFICACIÓN Según el nº de aa Oligopéptidos Contienen de 2 a 9 residuos Dipéptidos
Tripéptidos
Polipéptidos Contienen más de 10 residuos
CARACTERES Presentan 2 extremos N-terminal Amino terminal Se empiezan a numerar los residuos por este
extremo.
C-terminal Carboxilo terminal
FUNCIONES Hormonal Oxitocina
Insulina
Glucagón
Transportadora Glutatión Transporta aminoácidos hacia el exterior de las células
Antibióticos Valinomicina
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17.- Niveles de organización de las proteínas: estructura primaria (secuencia de aminoácidos), secundaria (α-hélice y β-laminar), terciaria (enlaces que estabilizan la estructura,
proteínas globulares y fibrosas) y cuaternaria (hemoglobina).
2. 3. 3. PROTEÍNAS: La forma de las proteínas, responsable de su función, se debe a su secuencia (orden de aa en la cadena) y organización tridimensional o estructura.
ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS: Disposición en el espacio de las moléculas proteicas. La estructura primaria determina la secundaria y la terciaria.
TIPOS DE PROTEÍNAS QUE LAS DEFINICIÓN TIPOS CARACTERES TIPO DE ENLACES QUE EJEMPLOS
ESTRUCTURAS PRESENTAN ESTABILIZAN
PRIMARIA Todas Secuencia de aminoácidos La secuencia de una proteína
de la proteína se escribe como los péptidos
(desde el extremo N- terminal
al extremo C-terminal)
SECUNDARIA Proteínas filamentosas Disposición de la secuencia hélice Se forma por enrollamiento Enlaces o Entre 2 aa: el –
(sin estructura terciaria) de aminoácidos o estructura helicoidal de la estructura puentes de H CO de un aa y
y segmentos de muchas primaria en el espacio primaria. intracatenarios el –NH2 del 4º
proteínas globulares. (3,6 aa/ vuelta) aa
Hélice de colágeno Se forma por enrollamiento No se pueden formar fácilmente Colágeno (asociación de 3
helicoidal de la estructura los puentes de H intracatenarios, hélices)
primaria, pero es más debido a la abundancia de aa con
alargada R de gran tamaño (Prolina e
(3 aa/ vuelta) hidroxiprolina)
Conformación o Cadena en zig-zag Puentes de H Entre cadenas Proteínas filamentosas como
lámina plegada (conservan su estructura intercatenarios (No hay la .- queratina de la seda o
primaria) puentes de H fibroína.
intracatenarios)
TERCIARIA ¡Sólo presentan estructura Disposición de la estructura Tramos hélice o La forma globular permite su Enlaces entre los radicales R de Proteínas globulares como las
terciaria las proteínas secundaria de un rectos lámina plegada solubilidad en agua y los aa por: globulinas
globulares! polipéptido disoluciones salinas y, por
(plegamiento sobre sí “Codos” Sin estructura tanto, sus funciones Covalente Débiles:
mismo para adoptar forma determinada biológicas. fuerte:
globular). Puente Puentes de H
Dominios estructurales:
combinaciones de -hélice o disulfuro Fuerzas de Van
der Waals.
lámina plegada
Interacciones
estables, globulares, que son
iónicas e
monómeros de varias
hidrofóbicas.
proteínas globulares.
CUATERNARIA ¡Sólo la presentan las Unión de varias cadenas Unión débil de Puentes de H Dímeros 2 protómeros
proteínas complejas! polipeptídicas (subunidades protómeros Fuerzas de Van tetrámeros Hemoglobina,
o protómeros) para formar der Waals polímeros Cápsida viral
un complejo proteico.
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PROTEÍNAS FILAMENTOSAS
ALFA- Cys 22% Puentes disulfuro Se estiran cuando hélice Duras y frágiles Cuernos, uñas
QUERATINAS 10-14% transversales entre se calientan Las cadenas peptídicas se Haces de Blandas y flexibles Piel, pelo y lana
cadenas polipeptídicas (pelo...). hallan retorcidas o macrofibrillas-
adyacentes Forma estirada es arrolladas de forma fibrillas más delgadas-
inestable diferente (al estirar la lana haces paralelos de
Puentes de H y el pelo, se parecían a la filamentos proteicos
intracatenarios queratina)
BETA- No contienen Cys No poseen puentes No se estiran Lámina plegada Fibroína de la seda
QUERATINAS disulfuro transversales cuando se calientan Hilo de arañas
Escamas, garras y picos de reptiles y
Puentes de H aves
intercatenarios
COLÁGENO Prolina e Triple hélice Tendones: haces paralelos- estructuras
Hidroxiprolina Las fibrillas de colágeno muy resistentes; pero poca o nula
se hallan dispuestas de capacidad de estiramiento.
modo diferente según sea
la función:
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18.- Propiedades de las proteínas: solubilidad, des y renaturalización. Clasificación de las proteínas (holo y heteroproteínas) y función de las mismas
(transportadora, reserva, estructural, enzimática, hormonal, defensa, contráctil).
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Desnaturalización Pérdida de su configuración Reversible Cambios de: Rotura de los enlaces Disminuye su solubilidad: Coagulación por calor de la
espacial característica (de su (renaturalización) -pH que mantienen las precipitan clara del huevo:
forma nativa y adopción de una -Concentración estructuras
forma al azar) debido a agentes - Temperatura secundarias (a veces), Proteínas globulares
físico-químicos y, pérdida de su Irreversible agitación terciarias y Pierde su forma nativa (la más (ovoalbúmina, etc)--
actividad. molecular cuaternarias estable) y pasa a forma filamentosa Proteínas filamentosas
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Clasificación de las proteínas (holo y heteroproteínas) y función de las mismas (transportadora, reserva, estructural, enzimática, hormonal, defensa,
contráctil).
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Sus funciones más importantes son la estructural y enzimática; pero también transporte, almacenamiento, movimiento, reserva, defensa, protección, recepción y transmisión de
estímulos, regulación hormonal y control del crecimiento y diferenciación.
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FUNCIONES EJEMPLOS
ESTÁTICAS ESTRUCTURAL A nivel celular Glucoproteínas de membrana
Microtúbulos del citoesqueleto, cilios y flagelos
Histonas
A nivel histológico Queratina, elastina, colágeno.
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19.- Concepto de Biocatalizador. Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática
(concentración de sustrato, Tª, pH, inhibidores y cofactores). Las vitaminas: Definición, clasificación (hidrosolubles y liposolubles) y función como
coenzimas.
ENZIMAS:
¿Se consumen? No se consumen durante la reacción, sino que se recuperan intactas al final del proceso.
Cantidad necesaria Se requieren cantidades muy pequeñas para acelerar la reacción.
DIFERENCIAS Especificidad - Son muy específicas Actúan sólo en una reacción determinada, (para cada sustrato y para
cada reacción)
Tª a la que actúan - Actúan a Tª ambiente Se desnaturalizarían a altas temperaturas
Actividad - Son muy activas Aumentan la velocidad de la reacción hasta más de un millón de veces
(mucho más que los catalizadores no biológicos)
Peso molecular - Tienen un peso --
molecular muy elevado
TIPOS DE BIOCATALIZADORES
TIPOS COMPOSICIÓN QUÍMICA PROPIEDADES ¿LOS PODEMOS SINTETIZAR ¿CÓMO ES SU ACTUACIÓN
(SOLUBILIDAD) LOS ANIMALES? SÍNTESIS?
ENZIMAS Proteínas globulares Solubles en agua, Sí, son sintetizadas por el Como cualquier Catalizan de forma específica
difunden fácilmente en los organismo proteína, pues van determinadas reacciones
líquidos orgánicos. codificadas bioquímicas uniéndose a la
genéticamente molécula a transformar (S)
ARN (ribozimas) - - -
VITAMINAS Glúcidos o lípidos sencillos Hidrosolubles y No, hay que obtenerlas en la dieta _ Actúan como coenzimas
liposolubles
HORMONAS Proteínas o esteroides, Sí Son sintetizadas en Son mensajeros químicos.
generalmente. glándulas endocrinas y Sólo actúan en su órgano
Derivados de aminoácidos o de vertidas al medio blanco o diana (receptores
ácidos grasos interno (sangre) específicos)
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Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª,
pH, inhibidores y cofactores).
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2. ENZIMAS. CENTRO ACTIVO: Región de la enzima que se une al sustrato y que suele ser una depresión en la superficie de la E
CARACTERÍSTICAS DEL CENTRO ACTIVO
TAMAÑO ESTRUCTURA CONSTITUCIÓN
Muy pequeño Tridimensional, con forma de hueco Aminoácidos que quedan próximos debido a plegamientos de la cadena polipeptídica
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Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª,
pH, inhibidores y cofactores).
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Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª,
pH, inhibidores y cofactores).
Ecuación de Michaelis-Menten V = Vmáx . (S)/ KM + (S) Esta ecuación permite calcular la velocidad de la reacción en función de las
distintas concentraciones del S
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Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª,
pH, inhibidores y cofactores).
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INHIBIDORES ENZIMÁTICOS
TIPOS DE TIPOS DE EFECTO CLASES DE INHIBIDORES ¿SE UNE EL I AL EFECTOS EJEMPLO
INHIBIDORES ENLACE I-E SOBRE EL CENTRO ACTIVO (REVERSIBLES) CENTRO ACTIVO
¿Alteran su ¿Permanece el efecto? (según compitan o no con el S) DEL E?
estructura?
Irreversibles o Unión fuerte Sí Sí, el veneno se fija - SÍ Inutiliza a la E El ión cianuro
venenos covalente permanentemente al permanentemente (inhibe a la
centro activo del E citocromoxidasa
de la respiración
aerobia)
Reversibles Unión débil No No, sólo se impide Competitivos Compiten con el S Disminuyen la Sulfamidas
no covalente temporalmente el (conformación espacial velocidad de la
funcionamiento similar al S) reacción
normal del E No competitivos No compiten con el S (se No Complejo E-S Impiden la separación _
unen en otra zona del E) de E-S y formar el P
Otra zona del E Impiden el acceso del _
S al centro activo
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La actividad enzimática se puede regular de forma general por variaciones de pH, Tª, etc. ; pero a veces se necesita un control más específico, mediante: efectores alostéricos y
modificaciones covalentes.
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III. Hidrolasas Hidrólisis Introducen grupos Esterasas Lipasas Énlace éster Grasa + agua = glicerina + 3 ácidos grasos
(rotura de sustratos –OH y -H (ácido + alcohol) (Esterasa)
diversos mediante Fosfatasas Glucosa- 6- fosfato = glucosa + fosfato
el agua) Carbohidrasas Sacarasa Glucosídicos
Amilasa
Peptidasas Tripsina Peptídicos
Pepsina
Nucleasas
IV. Liasas Soldadura o rotura Adición de grupos Aminasas Adición de –NH2 a un doble
de S sin agua. funcionales (-NH2, enlace
CO2, H2O,…) a Carboxilasas Adición de –COO a un doble Acido pirúvico = acetaldehído + CO2
moléculas que enlace (Piruvato descarboxilasa)
tienen un doble Hidratasas Adición de H2O a un doble Ácido fumárico + H2O = ácido málico
enlace. enlace
V. Isomerasas Isomerización o transformación de Gliceraldehído- 3- fosfato =
moléculas en sus isómeros Dihidroxiacetona –3- fosfato
(Fosfotriosa isomerasa)
VI. Sintetasas o Síntesis de moléculas con hidrólisis de Acetil- CoA = Malonil- CoA
ligasas ATP (ATP --> ADP + P)
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ENZIMAS ALOSTÉRICAS:
DEFINICIÓN Son las que pueden adoptar dos formas estables diferentes, permitiendo la autorregulación de la actividad enzimática (por el S y el P)
Estructura Cada protómero del E Hay cooperativismo o efecto Permite regulación La unión del S al centro activo de una de las subunidades, facilita la unión del S
cuaternaria alostérico tiene centro/ s cooperativo entre las subunidades más rápida y con a los centros activos de otras subunidades.
(están formadas regulador/ es (allí se menor cantidad de (El cambio de conformación de este protómero o transición alostérica,
por varias puede unir un ligando o activadores e inhibidores. se transmite instantáneamente a los otros protómeros, activándolos)
subunidades) activador)
Cinética Es diferente a las demás E: es una sigmoide (no hipérbola) -> Cambio muy grande en la velocidad de reacción (“ley del todo o nada”).
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1. VITAMINAS LIPOSOLUBLES
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2. VITAMINAS HIDROSOLUBLES
NOMBRES COENZIMA FUNCIÓN BIOLÓGICA Y BIOQUÍMICA AVITAMINOSIS FUENTE
C (Acido ascórbico) Antioxidante (contrarresta la formación de Escorbuto Kiwi, guayaba, fresa, naranja, pimiento rojo,
(Antiescorbútica) nitrosaminas cancerígenas) Infecciones respiratorias brécol, perejil.
Coenzima en la síntesis de colágeno (crecimiento y
reparación tejidos).
Mejora el sistema inmunitario (previene y mejora el
resfriado).
Favorece la absorción del Fe
B1 (Tiamina,) Pirofosfato de tiamina Ayuda al funcionamiento del sistema nervioso, Beri-beri,(Polineuritis) y Levadura de cerveza, germen de trigo, soja
(Antineurítica) (Descarboxilasas : transferencia de músculos y corazón. otros trastornos nerviosos (envolturas de cereales y legumbres), pan y
(Antiberibérica), vit. grupos aldehído en el metabolismo de arroz integral, frutos secos sin tostar.
del estado de ánimo glúcidos y lípidos)
B2 (Riboflavina) FAD y FMN (Deshidrogenasas: Ayuda al crecimiento y a la reproducción. Dermatitis (piel, boca, Levadura de cerveza, almendras, germen de
transferencia de H+ y e- en la Favorece el buen estado de piel, cabellos y uñas. labios). Seborrea. trigo,
respiración celular) Queso, huevos, champiñones, leche, legumbres,
castañas, etc.
(Su necesidad aumenta con el estrés). (Las
bacterias intestinales evitan grandes
deficiencias).
B3 (Niacina) NAD+ y NADP+ (Deshidrogenasas: Indispensable en salud del sistema nervioso. Pelagra (dermatitis, diarrea y Levadura de cerveza y germen de trigo, frutos
(Antipelagrosa) metabolismo de glúcidos y proteínas. Favorece el sistema digestivo. demencia) secos (cacahuetes) harina integral de trigo,
(Oxidaciones y respiración celular) Mejora el cutis. leche, carne
B5 Coenzima A (imprescindible en Detoxificador. Desórdenes de la piel En casi todos:
(Acido pantoténico) metabolismo celular: transporte de Formación de ácidos grasos, hormonas y anticuerpos. (dermatitis) yema de huevo, cereales integrales, germen de
grupos acilos oxidación de ácidos Antiestrés. Alteraciones nerviosas y trigo, frutos secos.
grasos y pirúvico) circulatorias (anemia).
B6 (Piridoxina) Fosfato de piridoxal (Transaminasas: Imprescindible en la fabricación de anticuerpos y Anemia, dermatitis Levadura de cerveza, germen de trigo, salvado
transferencia de grupos amino en el glóbulos rojos y en la síntesis de ácidos nucleicos. seborreica y trastornos del de trigo, levadura de pan, frutos secos, plátano,
metabolismo de aminoácidos). Ayuda a prevenir varias enfermedades nerviosas y de aparato digestivo. carne, vegetales, legumbres y cereales.
piel. (Bacterias intestinales)
B8 Biocitina (Carboxilasas: transferencia Desarrollo de glándulas sexuales, sebáceas y Dermatitis, caída del pelo Levadura de cerveza, yema de huevo, frutas
(Vit H, Biotina) de grupos carboxilos) sudoríparas. Anemia. frescas, frutos secos, leche, arroz integral.
B9 (Acido fólico) Acido tetrahidrofólico (síntesis de Antianémica. Anemia. Insomnio. Levadura, germen y salvado de trigo, escarola,
bases nitrogenadas de ADN y ARN) Formación de glóbulos rojos Depresión del sistema cereales, brécol, endibias, espárragos, col,
inmunitario. boniato y frutos secos.
B12 (Cobalamina) Coenzima B12 Formación de glóbulos rojos. Anemia perniciosa y daños Carne, pescado y lácteos, levadura, huevos,
(Antiperniciosa) (metabolismo de ácidos nucleicos) Síntesis de neurotransmisores. cerebrales, ulceraciones en la algas.
boca.
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