CURSO SERUM-RESIDENTADO

Químico Farmacéutico

Expositor: Q.F. CHRISTOPHER

WILLIAMS CARDENAS HINOJOSA
ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DE LAS
PRINCIPALES BIOMOLÉCULAS
• Composición química de los seres vivos. Principales biomoléculas:
aminoácidos, azúcares, lípidos, bases y nucleóticos. Grupos
funcionales. Isomería. Propiedades físico – químicas del agua.
Solubilidad de las biomoléculas. Interacciones débiles en los sistemas
acuosos. Regulación del pH en los fluidos biológicos. Soluciones
tampón. Principales tampones biológicos.
IMPORTANCIA DEL METABOLISMO

• La bioquímica ayuda a entender cómo funciona el organismo y a

mejorar su funcionamiento mediante la nutrición y el ejercicio físico.
• Los ciclos alimentación/ayuno marcan la dirección de las vías
metabólicas.
BIOQUÍMICA: DEFINICIÓN Y
PRINCIPIOS
• La Bioquímica es la ciencia que estudia los seres vivos a nivel
molecular mediante técnicas y métodos físicos, químicos y biológicos.
BIOQUÍMICA
COMPOSICIÓN DE LOS SERES VIVOS
• Solamente unos 30 elementos químicos, de los más de 90 presentes
en la naturaleza son, esenciales para los seres vivos.
• La mayoría tienen un número atómico bajo, por debajo de 34.
• Los más abundantes son: H, O , C, N (estos cuatro constituyen más del
95 % de la masa celular), P , S, Na , K, Cl (3 % de la masa celular)
• Oligoelementos: Fe, Mn, Mg, Zn, Mo, Se, etc. (> 0,01% de la biomasa).
Imprescindibles para la actividad de ciertas proteínas.
EL CARBONO
• Poco abundante en la corteza terrestre (0,027%). Se encuentra puro
(grafito, diamante) y combinado formando sales (carbonatos).
• Su importancia radica en su presencia en los seres vivos.
• Hace 150 años se le denomino compuesto orgánico.
• Gran facilidad para enlazarse con otros átomos pequeños. Forma enlaces
sencillos, dobles y triples.
• El dióxido de carbono es un componente secundario de la atmosfera.
Contribuye al llamado efecto invernadero. Es la fuente de C para todas las
moléculas orgánicas halladas en los organismos.
• El monóxido de carbono (CO) es un gas tóxico porque interfiere en la
capacidad de la hemoglobina de unirse al oxigeno.
BIOMOLÉCULAS
• La mayoría son compuestos
orgánicos (esqueleto carbonado).
• Los C pueden formar cadenas
lineales, ramificadas y circulares.
• Al esqueleto carbonado se le
añaden grupos de otros átomos,
llamados grupos funcionales.
• Las propiedades químicas vienen
determinadas por los grupos
funcionales.
GRUPOS FUNCIONALES EN QUÍMICA
ORGÁNICA
PRINCIPALES GRUPOS FUNCIONALES

• Hidroxilo
• Carbonilo
• Carboxilo
• Amino
• Sulfhidrilo
• Fosfato
NIVELES DE COMPLEJIDAD DE LAS
BIOMOLÉCULAS

• Moléculas sencillas: metabolitos y unidades estructurales (glucosa,

piruvato, ácidos grasos).

• Macromoléculas: ácidos nucleicos, lípidos, proteínas, polisacáridos.

ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL
• Estereoquímica: Distribución de
los átomos de una molécula en
el espacio tridimensional.
• Estereoisómeros: moléculas que
contienen loa mismos enlaces
químicos peo con diferente
configuración o distribución
espacial.
ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL
Isómeros estructurales

Isómeros geométricos

Enantiómeros
CONFIGURACIÓN MOLECULAR
• Relación espacial entre los grupos
sustituyentes de un C. Viene
definida por la presencia de dobles
enlaces o centros quirales. La única
manera de cambiar la configuración
es mediante la rotura de enlaces
covalentes.
CONFORMACIÓN MOLECULAR

• Posición de los átomos en el

espacio resultante de la rotación
alrededor de enlaces simples y sin
que implique rotura de enlaces
covalentes
LAS ESTRUCTURAS DE LAS BIOMOLÉCULAS ESTÁN
DEFINIDAS POR SU CONFIGURACIÓN Y
CONFORMACIÓN
• La estructura tridimensional de las biomoléculas (combinación de
configuración y conformación) es clave para sus interacciones
biológicas.
• Ejemplp: uniones enzima – sustrato y hormona receptor
• Cristalografía de rayos X
• En el citoplasma las moléculas están disueltas o asociadas con otros
componentes celulares.
LAS INTERACCIONES ENTRE BIOMOLÉCULAS
SON ESTEREOESPECÍFICAS

HEXOQUINASA D - GLUCOSA
IMPORTANCIA DE LA BIOQÚÍMICA EN LAS
CIENCIAS DE LA SALUD
• Todas las enfermedades (excepto las
traumáticas), tienen un componente
molecular.
• Los modernos método de diagnóstico y
las nuevas terapias han sentado las
bases de la Patología molecular.
EJEMPLOS DE ENFERMEDADES MOLECULARES
• Enfermedades de origen hereditario (hemofilia, anemias hemolíticas).
• Grandes enfermedades somáticas (diabetes, cáncer).
• Enfermedades de etiología exógena (infecciones, déficits de
vitaminas).
• Enfermedades neurológicas (esquizofrenia, enfermedades
neurodegenerativas)
AVANCES EN PATOLOGÍA MOLECULAR
• Las lesiones moleculares que originan la anemia falciforme, fibrosis
quística, hemofilia y otras enfermedades genéticas han sido determinadas
a nivel bioquímico.
• Se han identificado algunos de los mecanismos moleculares que
contribuyen al desarrollo del cáncer (entre ellos, mutaciones en algunas
enzimas del CTC).
• Diseño racional de nuevos fármacos, por ejemplo, inhibidores de enzimas
necesarios para la replicación o el ciclo vital de los virus, como el VIH, o
inhibidores de protein-kinasas como anticancerosos.
• Bacterias y otros organismos pueden usarse como factorías para producir
proteínas de gran valor, como la insulina y estimuladores del desarrollo de
células sanguíneas.
DIAGNÓSTICO
• Modificaciones del pH de fluidos biológicos (orina y sangre) reflejo de
una patología.
• Detección de microorganismos (bacterias y virus) mediante ensayos
enzimáticos, moleculares (proteínas y ADN) e inmunológicos
(anticuerpos).
• Prevención y diagnóstico de malformaciones congénitas por análisis
de células fetales.
• Detección de marcadores de células tumorales.
• El agua es el medio biológico de la tierra y, posiblemente, de otros
planetas también.
• El agua es el disolvente de la vida.
IMPORTANCIA DEL AGUA PARA LOS SERES
VIVOS

• Adaptación de los organismos vivos al medio acuoso y

aprovechamiento de las propiedades del agua.
• El agua constituye el 60 % del peso total de nuestro organismo.
COMPARTIMENTOS LÍQUIDOS EN EL
ORGANISMO DE UN VARÓN MEDIO (70 Kg)

• Agua corporal total (40 litros)

• 25 litros de liquido intracelular
• 15 litros de líquido extracelular.

• Liquido extracelular (15 litros)

• 10 litros de líquido intersticial
• 5 litros de sangre.
EL AGUA ES EL DISOLVENTE DE LA VIDA
• Baña nuestras células
• Disuelve y transporta compuestos en la sangre.
• Proporciona un medio para el transporte de moléculas al interior de
la célula y por los compartimentos celulares.
• Separa las moléculas cargadas.
• Disipa el calor.
• Participa en las reacciones químicas.
PROPIEDADES DEL AGUA

• Elevado calor específico y de

vaporización.
• Elevada conductividad térmica.
• Máxima densidad a 4 ° C.
• Cohesión. Elevada tensión
superficial
ENLACES POR PUENTE DE HIDROGENO
EL AGUA COMO DISOLVENTE
• Compuestos polares no cargados: son solubles, debido a los puentes
de H en los que participan otros átomos electronegativos como O o N.
• Compuestos iónicos: son solubles
• Compuestos lipídicos: se asocian entre sí alejados del agua.
• Moléculas anfipáticas: forman micelas.
• Los gases apolares (agua y dióxido de carbono) se disuelven mal en
agua.
• Los gases NH3, NO y H2S son solubles en agua.
EL AGUA DISUELVE SALES CRISTALINAS
HIDRATANDO SUS IONES
EL AGUA
• El agua es una molécula polar, forma puentes de H consigo misma y con
otros solutos. El agua es un buen disolvente para moléculas polares y
solutos cargados.
• Los compuestos no polares se disuelven mal en agua.
• En contacto con ese líquido forman micelas.
• La interacciones o enlaces débiles son fundamentales para el plegamiento
de macromoléculas como ácidos nucleicos y proteínas.
• Algunas sustancias hidrófilas no se disuelven realmente en el agua.
Grandes moléculas o estructuras del citoplasma no se disuelven sino que
forman un coloide (suspensión estable de partículas sólidas en un liquido)
TEORÍA CELULAR

• Todas las formas de vida nacen de una o más células.

• Las células se producen solamente de células preexistentes.
• La célula es la forma de vida más pequeña.
CARACTERÍSTICAS UNIVERSALES DE LAS
CELULAS
• Todas las células guardan la información en un mismo código lineal
(DNA).
• Todas las células usan la misma molécula intermediaria (RNA) para
transcribir la información heredada.
• Todas las células usan proteínas en la catálisis.
• Las células requieren energía para replicar su información y para las
funciones metabólicas.
• Todas las células están rodeadas por una membrana por la que pasan
los nutrientes.
LA HIPÓTESIS DEL MUNDO RNA
Un RNA con actividad replicasa podría
ser considerada la primera molécula
de la vida.
Los RNA catalíticos (ribozimas)
primitivas deben haber presentado
una alta tasa de error - rápida
evolución.
RNA dirige la síntesis de proteínas.
El DNA se transforma en la molécula
de almacenamiento de la información
(es más estable).
La proteínas toman las funciones
catalíticas (son más versátiles).
IMPORTANTE SALTO EVOLUTIVO

• Si el RNA esta encerrado dentro de un compartimiento, la proteína

sintetizada queda restringida para su uso propio.
LOS PROCARIONTES
GENERALIDADES
• Las primeras células aparecieron en la Tierra hace unos 3.800 millones de años. El
ambiente era cálido y reductor, la atmósfera no tenía O2 y estaba compuesta por
CO2, nitrógeno, hidrógeno y vapor de agua. Los primeros microorganismos deben
haber sido termófilos, anaerobios obligados, fotosintetizadores y/o
fermentadores.
• Al cabo de 1.500 millones de años, aparecieron las cianobacterias, que mediante
la fotosíntesis enriquecieron en O2 la atmósfera del planeta. Mil millones de años
más tarde aparecieron los primeros eucariontes.
• Como consecuencia de la fotosíntesis, las condiciones ambientales cambiaron: la
absorción del CO2 atmosférico disminuyó el efecto invernadero y el O2 liberado
oxidó la
• corteza mineral y elevó la concentración atmosférica de ese gas al 21% actual. Los
procariontes se diversificaron enormemente y colonizaron todo tipo de
ambientes, aun los más extremos.
LOS PROCARIONTES PERTENECEN A DOS
REINOS: LAS EUBACTERIA Y ARQUEBACTERIAS
EL HABITAT DE LOS PROCARIONTES
• Los representantes del dominio Bacteria han colonizado hábitats muy
diversos: aguas dulces y salobres, zonas calientes y frías, terrenos fangosos,
fisuras de rocas, sedimentos marinos y el aire. Algunos se alojan como
comensales, parásitos o simbiontes en distintos órganos de animales muy
diversos, o persisten asociados con raíces y tallos de plantas, con hongos
(líquenes) y protozoos.
• Los integrantes de Archaea pueden habitar ambientes con condiciones
extremas o moderadas. Algunos toleran temperaturas superiores a 100 °C
(hipertermófilos) o inferiores a 0 °C (psicrófilos), concentraciones salinas
muy superiores a las del
• agua del mar (halobacterias) y pH extremos. Pueden ser aerobios o
anaerobios, estrictos o facultativos. Algunos son metanogénicos y habitan
sedimentos marinos, de agua dulce y de pantanos.
CARACTERISTICAS DE BACTERIAS Y ARCHEAS
• La longitud de las células procariontes varía de unas décimas a varias
centenas de micrómetros; su volumen es menor al micrómetro
cúbico. La alta relación superficie volumen favorece el intercambio de
nutrientes y productos de excreción entre el citoplasma y el medio
que rodea a la célula. La respiración y la fotosíntesis tienen lugar
sobre la membrana plasmática o sobre sus invaginaciones.
• Las formas celulares de los integrantes de Bacteria son diversas:
esferas pequeñas (cocos), ovoides (cocobacilos), cilindros rectos
(bacilos), espiraladas y alargadas (espirilos y espiroquetas), bastones
curvos (vibriones) y filamentos. Las formas más frecuentes de los
representantes de Archaea son los bacilos y los cocos.
• En la célula procarionte se puede diferenciar el citoplasma, la
envoltura y los apéndices externos. El citoplasma contiene el material
genético (DNA), los ribosomas e inclusiones. La envoltura está
formada por la membrana plasmática, la pared celular y la cápsula.
Son apéndices externos los flagelos, las fimbrias y los pili.
• Los procariontes poseen un cromosoma formado por una única molécula
circular de DNA de doble cadena, que se encuentra libre en el citoplasma.
Puede haber además una o más moléculas pequeñas de DNA, también
circular (plásmidos).
• Una célula procarionte puede tener 10.000 ribosomas agrupados en
polirribosomas a lo largo de moléculas de mRNA. La diferencia más
importante entre los ribosomas de Bacteria y Archaea, que sustenta su
separación en dos dominios diferentes, se encuentra en la secuencia de
bases nitrogenadas de sus fracciones de RNA 16S.
• Las inclusiones son gránulos formados por glucógeno, lípidos, polifosfatos,
azufre o pigmentos fotosintéticos.
• La membrana plasmática de los miembros de Bacteria es similar a la de los
eucariontes, pero no posee colesterol ni otros esteroides. En los
integrantes de Archaea, la membrana puede ser una bicapa si los lípidos se
unen a un solo glicerol, o una monocapa más rígida si se unen a un glicerol
por cada extremo. En ningún caso poseen colesterol.
EUCARIONTES
CARACTERISTICAS
• Las células eucariontes, en general, son más grandes y complejos que las
células procariontes, y sus genomas también son más grandes y complejos.
• El tamaño mayor se acompaña por diferencias radicales en la estructura
celular y la función. Muchas clases de células eucariontes forman
organismos multicelulares.
• Por definición, las células eucariontes mantienen su DNA en un
compartimiento interno llamado NÚCLEO. La envoltura nuclear, una doble
capa de membrana, rodea al núcleo y separa al DNA del citoplasma.
• Las células eucariontes poseen citoesqueleto, un sistema de proteínas
filamentosas que atraviesan el citoplasma y forman, junto a muchas otras
proteínas que se unen a ellas, un “sistema de vigas, cuerdas, y motores”
que da a la célula la resistencia mecánica, controla su forma y guía su
movimiento.
• Características principales de las células eucariontes
TEORÍA ENDOSIMBIÓTICA
• Cloroplastos y mitocondrias son de tamaño similar a las bacterias (procariotes).
• Las mitocondrias son pequeños organelos ubicados en el citoplasma, rodeados
por una doble membrana, que captura O2 y aprovecha la energía obtenida de la
oxidación de azúcares para producir la mayor parte del ATP que utiliza la célula.
• Ambos tienen una doble membrana, un remanente de un evento endosimbiótico.
• Ambos tiene DNA circular y similitud genética con las bacterias.
• Ambos tienen sus propios ribosomas y maquinaria de síntesis proteica.
• Ambos tienen una organización bioquímica similar.
• Se acepta que las mitocondrias se generaron a partir de bacterias libres capaces
de metabolizar el O2 (aeróbicas), que fueron incorporadas por una célula
eucarionte ancestral anaeróbica.
LA SIMBIOSIS BACTERIANA CON UN EUCARIOTA PRIMITIVO
SERÍA LA PRINCIPAL ETAPA EN LA EVOLUCIÓN DE LA CÉLULA
EUCARIOTA
• 1980, Lynn Margulis, Teoría de la
• Endosimbiosis:
• Hace 1500 - 700 millones de años, un
• procariota grande o quizás un primitivo
• eucariota fagocitó o rodeo a un
pequeño procariota.
• El organismo grande y el pequeño
entraron en una simbiosis en la cual
ambos se beneficiaron.
El organismo grande pudo haber ganado un excedente de ATP, provisto por la
"protomitocondria" o un excedente de azúcar provisto por el "protocloroplasto",
y haber provisto al endosimbionte pequeño de un medio ambiente estable con
nutrientes.
• El origen de la mitocondria. Una célula eucarionte ancestral ingirió
una ancestro bacteriano de la mitocondria, iniciando una relación
simbiótica.
EUCARIONTES TIENEN GENOMA HIBRIDO
• La información genética de los eucariontes tiene un origen híbrido, del eucarionte ancestral
anaeróbico y de la bacteria que fue adoptada como simbionte.
• La mayor parte de la información se almacena en el núcleo, pero una pequeña parte permanece
en la mitocondria, y en el caso de las plantas en los cloroplastos.
• El DNA de la mitocondria y del cloroplasto puede ser separado del DNA nuclear y analizado
individualmente mediante secuenciación.
• El genoma de las mitocondrias y cloroplastos es una versión reducida del genoma
• bacteriano correspondiente, carece de genes de funciones esenciales. Por ejemplo, en una célula
humana, el genoma de la mitocondria consiste de sólo 16.569 pares de bases y codifica para 13
proteínas, 2 componentes del RNA ribosomal y 22 RNAs de transferencia.
• Los genes que faltan de las mitocondrias y cloroplastos no se encuentran perdidos, de hecho,
muchos de ellos se han movido desde el genoma simbionte al DNA de la célula huesped.
• El DNA nuclear en humanos contiene muchos genes que codifican para proteínas que son
esenciales en la mitocondria; en plantas, el DNA nuclear también contiene muchos genes que
codifican para proteínas esenciales para el cloroplasto.
EL GENOMA EUCARIONTE ES GRANDE Y ES RICO EN
DNA REGULATORIO
• Eucariontes no solo tienen más genes
que los procariontes, también tiene más
DNA que no codifica para proteínas. El
genoma humano contiene 1.000 veces
más pares de nucleotidos que el
genoma de una bacteria típica, 20 veces
más genes y cerca de 10.000 veces más
DNA no codificante (98,5% del genoma
humano es no codificante, al contrario
del 11% de posee E. coli).
Un muy simple circuito de regulación
• El DNA no codificante tiene importantes génica: un gen regula su propia expresión
funciones, en particular en regular la por la unión de su proteína a su propia
expresión de genes adyacentes. región regulatoria.
RESUMEN
Regulación de la expresión génica en
eucariotas
Regulación transcripción:
•Interacción elementos cis y factores trans
•Elementos cis: promotores, intensificadores (enhancers) y silenciadores
•Factores trans: factores de transcripción con dos dominios. Unión DNA e
Inicio transcripción (algunos deben unirse antes a la RNA pol)
•Dominios unión al DNA (diferentes clases)
•Motivo dedo de zinc
•Motivo hélice-giro-hélice
•Motivo cremallera de leucina
•Motivo puños de cobre

•Hormonas esteroides

•Remodelamiento de la cromatina por proteínas y activación génica

•Metilación del DNA

•Regulación postranscripcional
•Procesamiento alternativo
•iRNA
59
Regulación de la expresión génica en eucariotas

Regulación transcripción:
•Interacción
elementos cis y
factores trans

60
Regulación de la expresión génica en
eucariotas
Regulación transcripción:
•Interacción elementos cis y factores trans
•Elementos cis: promotores, intensificadores (enhancers) y
silenciadores

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Regulación de la expresión génica en
eucariotas
Regulación transcripción:
•Interacción elementos cis y factores trans
Factores trans: factores de transcripción con dos dominios. Unión DNA e
Inicio transcripción (algunos deben unirse antes a la RNA pol)
•Dominios unión al DNA (diferentes clases)
Motivo dedo de zinc Motivo hélice-giro-hélice
Motivo cremallera de leucina Motivo puños de cobre

62
Regulación de la expresión génica en
eucariotas

63
Regulación de la expresión génica en
eucariotas
Regulación transcripción:
•Interacción elementos cis y factores trans
•Factores trans: factores de transcripción con dos
dominios. Unión DNA e Inicio transcripción (algunos deben
unirse antes a la RNA pol)

•Hormonas esteroides

64
Regulación de la expresión génica en eucariotas

Regulación transcripción:

Remodelamiento de la cromatina
por proteínas y activación génica:
código de las histonas (colas de
histonas cuyos residuos de lisina
pueden modicarse mediante la
unión de grupos acetilo y metilo)

65
Regulación de la expresión génica en eucariotas
Regulación transcripción:
•Metilación del DNA en las regiones reguladoras de un gen que
se hereda (herencia epigenética)-> Impronta parental (Parental
imprinting)

Metiltransferasa

Citosina Metil-Citosina

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Regulación de la expresión génica en eucariotas
Regulación transcripción:
•Regulación postranscripcional
•Procesamiento alternativo

•RNA interference, microRNAs (miRNA)

Procesamiento alternativo
67
Regulación de la expresión génica en eucariotas
Regulación transcripción:
•Regulación postranscripcional
•Procesamiento alternativo
•RNA interference, microRNAs (miRNA)

microRNAs

68
CITOCROMO P450

El nombre del citocromo P450 proviene del hecho que estás

son proteínas celulares (cito) coloreadas (cromo), con un
pigmento que absorbe luz a una longitud de onda de 450
nanómetros

• El CYP450 es el principal responsable del metabolismo

oxidativo de xenobióticos, comprende una gran familia de
hemoproteínas presentes en numerosas especies, de las que
ya se han identificado más de 2000 isoformas. Todos los
CYP450 se nombran siguiendo un criterio común, en función
de la similitud en su secuencia del ácido desoxirribonucleico
FUNCIONES DEL CITOCROMO P450

Funciones detoxificadoras, eliminando sustancias

exógenas , es decir sustancias que no son sintetizadas
en el propio organismo. Esto se logra agregando
grupos funcionales, hidrosolubles a compuestos de
carácter lipofilico.

En algunos organismos sirve como mecanismo de

defensa ante el ataque de alcaloides tóxicos de
plantas y les aporta, por lo tanto, un alimento
abundante que no es apetecible por otros organismos.
CITOCROMO P450

• El citocromo p450 da defensa a las sustancias químicas

extrañas que, a través del sistema enzimático del
citocromo P450 (CYP450) se encarga de eliminar y
neutralizar aquellos compuestos químicos que acceden
al organismo y no forman parte de la composición
habitual de éstos, conocidos como xenobióticos;
algunos de ellos son de origen natural, destacando las
micotoxinas y los alcaloides, pero la mayoría de éstos
son compuestos sintéticos
 GENERALIDADES
• Este sistema se encuentra presente en diferentes tejidos como el
riñón, pulmón, piel, intestino, corteza adrenal, testículos, placenta y
otros, pero es particularmente activo en el hígado. Además de
participar en el metabolismo de sustratos de naturaleza exógena
como drogas, pesticidas, procarcinógenos, anestésicos, solventes
orgánicos, entre muchos otros, el CYP participa en el metabolismo
de sustratos endógenos de importancia biológica como colesterol,
ácidos biliares, hormonas esteroidales y ácidos grasos. En los
mamíferos, el CYP se encuentra presente en la mitocondria y en
diversos tipos de membranas celulares, siendo particularmente
abundante en el retículo endoplásmico liso (microsomas). La
denominación citocromo P450 proviene de la característica de que
esta hemoproteína en su forma reducida y unida a monóxido de
carbono, presenta un máximo de absorbancia a los 450 nm6.
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