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BIOINFORMÁTICA: BÚSQUEDA DE UN ARTÍCULO CIENTÍFICO;

ESTRUCTURA Y FUNCIONES DE LOS ÁCIDOS NUCLÉICOS

Parada Rincón Diana Carolina 1611401; Alvarado Vega Kelly Valentina 1611414;
Sepúlveda Contreras Natalia 16114331

INTRODUCCIÓN

La Bioinformática es el uso de herramientas computacionales que permiten analizar,

depurar y agilizar el manejo de grandes cantidades de información genética y predecir en

algunos casos las funciones de genes y proteínas con base en evidencia experimental de

secuencias o procesos similares. A su vez, la bioinformática parte de datos encontrados

experimentalmente (Barraza, 2007).

Además, la bioinformática organiza los datos permitiendo a los investigadores acceder a la

información existente y publicar nuevos datos a medida que éstos se producen. Por otra parte,

está siendo utilizada en muchos y heterogéneos campos: desde la medicina molecular a los

estudios evolutivos, de la terapia génica a el desarrollo de fármacos y hasta se aplica en

estudios de cambio climático y muchos otros. Algunas de las aplicaciones prácticas más

importantes son: encontrar homólogos, es decir, la búsqueda de similitudes entre diferentes

moléculas y diseño de fármacos (Coronado, 2013).

Así mismo, una actividad Bioinformática son las bases de datos (BD) que almacenan,

organizan y gestionan gran cantidad de datos biológicos. Cada BD debe disponer de un motor

de búsqueda que permita localizar rápidamente la información. Las BD deben ser accesibles a

través de Internet y contar con un diseño intuitivo que facilite su uso (Juanma, 2018). De

modo que, en Biología Molecular las principales bases de datos a consultar son: para

nucleótidos (EMBL, Genbank y DDBJ), Proteínas (Swissprot, Trembl), Literatura (PubMed),

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Estudiantes de Ingeniería Biotecnológica de la Universidad Francisco de Paula Santander
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Taxonomía (NCBI) y visualización de estructuras (PDB), en donde la mayoría de ellas se

actualizan automáticamente cada 24 horas (Alonso, 2003).

Por lo tanto, el objetivo de este artículo fue realizar una consulta detallada en las diferentes

bases de datos de Biología molecular con el propósito de encontrar un artículo acorde a la

temática de estructura y funciones de los ácidos nucleicos.

METODOLOGÍA

En la práctica de laboratorio que se realizó, en primer lugar, se dio una breve introducción

de los aspectos más importantes de bioinformática, en donde se mencionaron algunas revistas

científicas como: Journal Industrial, Microbiology & Biotechnology; por otro lado, se

nombraron los tipos de artículos, como son: los artículos científicos de investigación y los

artículos de revisión o Review. Por último, se enunciaron algunas bases de datos, en las

cuales se filtran artículos científicos dependiendo de las palabras claves que se digiten, en

donde se debe tener en cuenta que la información consultada se encuentra en inglés.

Seguidamente se dio inicio a la búsqueda del artículo científico dependiendo del tema que

a cada grupo de laboratorio se le asignó, en el caso de este grupo de laboratorio el tema

asignado fue: Estructura y funciones de los ácidos nucleicos; dicho tema puede abarcar un

gran número de información y/o artículos, por lo que se especificó como búsqueda la

siguiente: Mutaciones del ADN.

Luego, se consultó en bases de datos como son: PUBMED mostrado en la Figura 1,

EMBL o EBI search evidenciado en la Figura 2, NCBI señalado en la Figura 3, por último, se

indagó en Google Académico indicado en la Figura 4. El artículo escogido es denominado:

Structures and stability of simple DNA repeats from bacteria (Estructuras y estabilidad de

repeticiones simples de ADN de bacterias), presentado en la Figura 5.

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Las figuras mencionadas en el párrafo anterior son mostradas a continuación:

Figura 1. Búsqueda en la base de datos PUBMED.

Figura 2. Consulta en la base de datos EMBL.

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Figura 3. Búsqueda en la base de datos NCBI.

Figura 4. Consulta en Google Académico.

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Figura 5. Artículo científico seleccionado.

Una vez encontrado el artículo con la denominación free (libre o gratis), se abrió el link
del artículo y se seleccionó la opción de pdf, en donde se descargó el archivo para su
posterior traducción y lectura.

RESULTADOS

Para iniciar la búsqueda de los artículos en las diferentes bases de datos ya mencionada,

fue determinar la palabra clave. Como el tema base de la investigación fue “Estructura y

funciones de los ácidos nucleidos”; al ser un tema muy extenso se decidió enfocarse en las

mutaciones del ADN, por ello la palabra clave fue “DNA mutations”, y se prosiguió a la

búsqueda en las diferentes bases de datos.

Se seleccionaron 5 artículos referentes al tema:

Structures and stability of simple DNA repeats from bacteria - Figura 6.

Prenatal diagnosis of fetuses with increased nuchal translucency by genome sequencing

análisis - Figura 7.
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Evaluation of sexual function and microtesticular sperm extraction in men with mosaic

Turner síndrome - Figura 8.

RNA Secondary Structure Motifs of the Influenza A Virus as Targets for siRNA-Mediated

RNA Interference - Figura 9.

Rare copy number variants in the genome of Chinese female children and adolescents with

Turner síndrome - Figura 10.

Aunque el artículo 3 “RNA Secondary Structure Motifs of the Influenza A Virus as

Targets for siRNA-Mediated RNA Interference” es sobre ARN y no ADN, sigue siendo parte

del tema de la investigación, por ello se decidió escogerlo.

Estos 5 artículos fueron escogidos, ya que su tema es interesante y corresponde al tema de

la investigación; pero de estos 5 artículos solo se decidió el artículo 1 “ Structures and

stability of simple DNA repeats from bacteria” al ser un artículo actual publicado el 22 de

enero del 2020, su tema abarca al tema de la investigación y como tal hace mayor énfasis a

Biología molecular.

Figura 6. Articulo 1 - Structures and stability of simple DNA repeats from bacteria
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Figura 7. Artículo 2 - Prenatal diagnosis of fetuses with increased nuchal translucency by

genome sequencing análisis

Figura 8. Artículo 3 - Evaluation of sexual function and microtesticular sperm extraction in

men with mosaic Turner síndrome
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Figura 9. Artículo 4 - RNA Secondary Structure Motifs of the Influenza A Virus as Targets
for siRNA-Mediated RNA Interference

Figura 10. Artículo 5 - Rare copy number variants in the genome of Chinese female children
and adolescents with Turner síndrome

Anexo del articulo seleccionado.

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CONCLUSIONES

A partir de la base de datos NCBI (Centro Nacional para la Información Biotecnológica)

y utilizando como motor de búsqueda PubMed (Public- MEDLINE) se obtuvo el articulo

científico Structures and stability of simple DNA repeats from bacteria utilizando las palabras

claves del Tema Nº3 estructura y funciones de los ácidos nucleicos. A su vez, se investigaron

las demás bases de datos relacionadas con la Biología Molecular y se logró obtener una

mayor habilidad en su uso.

REFERENCIAS

Coronado Zamora, M. (2013). Retrieved 3 March 2020, from

https://bioinformatica.uab.cat/genetica_tfg/bioinformaticaabast/Qu%C3%A9_es.htm

Juanma, B. (2018). Retrieved 3 March 2020, from

http://www.ehu.eus/biofisica/juanma/bioinf/pdf/intro.pdf

Barraza, C. (2007). Bioinformática | NHGRI. Retrieved 3 March 2020, from

https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Bioinformatica

Alonso, R. (2003). Retrieved 3 March 2020, from

http://www.pdg.cnb.uam.es/cursos/Complutense/Complutense2003/pages/03_Dbs/CursoVera

no2003BDs.pdf