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Resumen
La humanidad siempre ha experimentado el impacto de los microorganismos, más
obviamente a través de su capacidad para causar enfermedades devastadoras. Durante la
gran mayoría de la historia humana, desconocíamos su presencia, y mucho menos los
procesos microbianos fundamentales a los que debemos nuestra existencia: desde la
producción de energía por nuestros antiguos endosimbiontes bacterianos (las mitocondrias)
hasta la generación de oxígeno en nuestra atmósfera. . A pesar de su sorprendente
abundancia global (∼10 30 células) y su contribución sustancial a la biomasa total del
planeta tierra ( Whitman et al. 1998 ; Kallmeyer et al. 2012), nuestra incapacidad para ver
estas pequeñas formas de vida envolvió su diversidad casi ilimitada en el misterio. No fue
sino hasta el siglo XVII, con las cuidadosas observaciones e informes de Anton van
Leeuwenhoek, que nos dimos cuenta de este mundo previamente invisible que nos
rodeaba. Hoy, sabemos que hay más bacterias viviendo en nuestro tracto intestinal que
estrellas en la galaxia de la Vía Láctea (y que superan con creces a todas las personas que
alguna vez han vivido). También sabemos ahora que prosperamos debido a su soporte
metabólico. Aunque menos del 1% de las bacterias se pueden cultivar fácilmente en el
laboratorio ( Amann et al. 1995 ), la versatilidad bioquímica entre estas pequeñas criaturas
supera la de las plantas, animales y hongos combinados ( Pace 1997 ).
Las ilustraciones de Anton van Leeuwenhoek en una carta a la Royal Society de Londres a
fines del siglo XVII proporcionan uno de los primeros registros de la forma de células
bacterianas ( Dobell 1960) Visto a través de una sola lente, Leeuwenhoek fue pionero en
estudios del microbioma humano, describiendo bacilos móviles, cocos y espiroquetas que
encontró en raspados tomados de entre sus dientes (y los dientes de otros). Este triunfo fue
posible gracias a una curiosidad incomparable, construcción de lentes e iluminación
excepcional. La estructura celular simple y la naturaleza vítrea de la mayoría de las
bacterias no teñidas vistas con un microscopio óptico generaron poco interés en la biología
celular bacteriana, con la excepción de los objetos de contraste inusual, como las
endosporas descritas por Robert Koch y las cianobacterias maravillosamente coloridas y
grandes. La naturaleza bacteriana de este último solo se apreció a fines del siglo XX ( Oren
2004) En su mayor parte, las bacterias fueron vistas como "bolsas de enzimas" primitivas
hasta la década de 1990, cuando finalmente comenzó a surgir la complejidad de la
estructura subcelular bacteriana y los reguladores de la reproducción celular. Las
herramientas y los reactivos desarrollados para la biología de las células eucariotas (p. Ej.,
Manchas de ADN, membranas y etiquetas de proteínas fluorescentes), una vez aplicadas a
las células bacterianas, revelaron ideas sorprendentes, incluidos los patrones de localización
específicos e incluso dinámicos de las proteínas, y la precisión de la organización
cromosómica.
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TAMAÑO BACTERIANO
Bacillus subtilis , Staphylococcus aureus, Escherichia coli y Caulobacter crescentus , los
modelos principales para la biología celular bacteriana, son más o menos típicos en tamaño,
con volúmenes de células individuales entre .40.4–3 µm 3 (o 0.4–3.0 femtolitros; femtolitro
o fL es igual a 10 −15 L). Las ultramicrobacterias marinas de vida libre, apropiadamente
llamadas Candidatus Actinomarina minuta, tienen un volumen celular promedio ∼1% del
de E. coli (0.013 µm 3 , rango 0.6 × 10 −2 a 2.4 × 10 −2 fL). En el otro extremo del
espectro, Thiomargarita namibiensis que habita en sedimentos marinos., la "perla de azufre
de Namibia", es un organismo esférico con un volumen de ocho órdenes de magnitud más
que el de E. coli (∼750 µm de diámetro, volumen 2.2 × 10 8 fL o 0.22 µL). Tiomargarita es
ligeramente más grande que un ojo de Drosophila ( Schulz et al. 1999 ) y lo
suficientemente grande como para ser visto por el ojo humano ( Fig. 1 ). Una mirada más
cercana a Thiomargarita revela una vacuola llena de líquido ubicada en el centro, que
ocupa aproximadamente el 98% del volumen celular y es un depósito de nitrato utilizado
para alimentar la oxidación de sulfuro. Incluso cuando se tiene en cuenta la vacuola
intracelular, una gran célula de Thiomargarita tiene un tremendo biovolumen para soportar
(∼4.4 × 10 6Florida). Epulopiscium spp., Simbiontes intestinales de ciertos peces cirujanos
marinos, son las bacterias heterotróficas más grandes conocidas. Estas células en forma de
cigarro tienen hasta 600 µm × 80 µm con un volumen citoplasmático activo de ∼2 ×
10 6 µm 3 o 0.02 µL ( Angert et al. 1993 ). A diferencia de Thiomargarita , las células
de Epulopiscium no contienen vacuolas de almacenamiento u otras inclusiones inertes
( Fig. 1 ). La diferencia de tamaño entre Candidatus Actinomarina minuta y estos gigantes
es equivalente a la diferencia entre un ratón y el Empire State Building ( E. colipodría estar
representado por una pequeña mofeta o un conejo en esta escala). Remitimos al lector
a Niklas (2015) , en el que analiza cómo las características de la celda y el factor de
geometría tienen en cuenta el tamaño de la celda.
Figura 1.
Bacterias gigantes A la izquierda hay una cadena de células Thiomargarita namibiensis . En esta
imagen de campo brillante, se pueden ver gránulos de azufre en el citoplasma. El panel de
la derecha muestra una célula Epulopiscium excepcionalmente grande con dos grandes
descendientes internos. Barras de escala, 100 µm.
¿Qué limita el tamaño de las células bacterianas? Las células más pequeñas necesitan un
volumen suficiente para acomodar recursos genéticos adecuados para apoyar el estilo de
vida de la célula ( Koch 1996 ). La célula también debe contener la maquinaria básica
necesaria para expresar esos genes, así como las proteínas y productos bioquímicos para
mantener su metabolismo y reproducción celular. La racionalización genómica y
metabólica se observa en simbiontes intracelulares obligados, patógenos y orgánulos que
han renunciado a las capacidades metabólicas porque el huésped abastece esas necesidades
( McCutcheon y Moran 2012 ; Wernegreen 2012 ). La pérdida de genes para detectar el
cambio ambiental y responder a esas contingencias puede permitir una reducción sustancial
del genoma pero no siempre una reducción correspondiente en el tamaño celular.
La estructura y la función de todas las células grandes parecen estar limitadas por los
límites de difusión ( Schulz y Jorgensen 2001 ). Los encuentros con nutrientes, la
eliminación de desechos y el movimiento oportuno de biomoléculas dentro de la célula para
apoyar las necesidades metabólicas afectan la capacidad de una gran bacteria para
sobrevivir en su entorno. La compartimentación de las funciones celulares, el tráfico
facilitado por proteínas motoras a través de una red citoesquelética compleja, la expansión
de los recursos genómicos y la adquisición de endosimbiontes que se convirtieron en
orgánulos generadores de energía han sido reconocidos por el avance del tamaño y la
complejidad de las células eucariotas. ( Angert 2012 ).
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EL PROBLEMA DE LA DIFUSIÓN
La identificación de bacterias gigantes requirió un nuevo examen de las creencias
arraigadas sobre el tamaño máximo de células bacterianas. Para todas las células, el
crecimiento y la reproducción están limitados por la velocidad de la comunicación química
y la disponibilidad de nutrientes para alimentar el metabolismo. La difusión es el
movimiento aleatorio tridimensional de una molécula. Para el movimiento de moléculas
dentro de una célula, es el medio de transporte más eficiente en una distancia corta de unas
pocas micras. Incluso una proteína grande puede atravesar de manera confiable esta
distancia en el citoplasma en mucho menos de un segundo. Por lo tanto, una biomolécula
sintetizada o que ingresa a una bacteria típica tiene una alta probabilidad de que alcance su
sitio de actividad casi instantáneamente. Pero teniendo en cuenta una pequeña distancia por
nuestra escala, a través de un espacio de un milímetro, aproximadamente la longitud de
un epulopisciocélula y una fracción de la circunferencia de Thiomargarita : el transporte
difusivo se vuelve muy poco confiable. Una molécula pequeña como el oxígeno a
temperatura ambiente normalmente tardaría aproximadamente una hora en difundirse 1 mm
( Schulz y Jorgensen 2001 ). Del mismo modo, la adquisición de nutrientes se basa en la
difusión y captura de moléculas en la superficie de una célula. En consecuencia, las células
de vida libre tienden a ser pequeñas, con una gran área de superficie en relación con su
volumen citoplasmático, de modo que la captura de nutrientes, en bajas concentraciones,
puede satisfacer las necesidades metabólicas de la célula. La forma y la función de la celda
han sido sometidas a estas restricciones. A modo de comparación, E. coli tiene una relación
de área de superficie a volumen de ∼3.7 µm 2 a 1 µm 3, mientras que
la célula Thiomargarita más grande tiene una relación superficie-volumen de 8.2 ×
10 −3 µm 2 a 1 µm 3 . Claramente, estas bacterias grandes están doblando las reglas.
Figura 3.
Histograma del tamaño de las células de Escherichia coli durante el crecimiento en medio rico en
nutrientes. El tamaño de las celdas de tipo salvaje (negro) está restringido dentro de un estrecho
rango doble. El gráfico está sesgado ligeramente hacia la izquierda debido al mayor número de
células recién nacidas, consecuencia de la fisión binaria. Los mutantes de biosíntesis de UDP-
glucosa ( pgm :: kan) (líneas discontinuas) son más pequeños que los de tipo salvaje en
promedio; sin embargo, el tamaño de estas celdas está restringido de manera similar dentro de un
rango doble. (Datos cortesía de Norbert Hill.)
Al igual que los eucariotas, las bacterias inician y finalizan una ronda de replicación de
ADN para cada evento de división. Sin embargo, a diferencia de los eucariotas, la
replicación del ADN, la segregación cromosómica y el ensamblaje de la maquinaria de
división no son eventos discretos, sino que se superponen en mayor o menor grado
dependiendo de la tasa de crecimiento ( Fig. 4 ).
Figura 4.
Representación circular del ciclo celular en células bacterianas de rápido crecimiento (tiempo de
duplicación de masa <60 min). Tenga en cuenta que la replicación y el crecimiento del ADN son
más o menos constantes, una consecuencia de la replicación de múltiples equipos. Una nueva ronda
de replicación se inicia solo una vez por ciclo. Al menos una ronda de replicación debe terminarse
antes de la división. Aunque la maquinaria de división se ensambla mucho antes de la citocinesis (el
anillo FtsZ existe durante aproximadamente el 90% del tiempo de duplicación de masa en células
cultivadas en un medio muy rico), la constricción en sí misma toma solo unos pocos minutos.
Es importante destacar que, a tasas de crecimiento rápidas respaldadas por condiciones
ricas en nutrientes, las bacterias pueden mantener períodos de interdivisión de menos de la
mitad del tiempo requerido para la replicación de su ADN cromosómico. Por ejemplo, E.
coli puede duplicarse en masa y dividirse en tan solo 20 min; sin embargo, incluso en
condiciones ideales, la replicación de todo el cromosoma E. coli de 4 Mb tarda
aproximadamente 60 minutos. Las células que crecen rápidamente resuelven este conflicto
aparente sintetizando constantemente el ADN e iniciando nuevas rondas de replicación
antes de completar la antigua. Dichas células pueden tener 4, 8 o incluso 16 horquillas de
replicación en curso ( Yoshikawa et al. 1964 ; Cooper y Helmstetter 1968) Aunque el inicio
se restringe a una vez por ciclo de división, solo se necesita completar una ronda de
replicación antes de la división. Dentro de un solo ciclo de división, los eventos de
iniciación y terminación, por lo tanto, no corresponden necesariamente a la misma
bifurcación de replicación.
PENSAMIENTOS CONCLUYENTES
Al igual que con nuestra apreciación de los papeles vitales y diversos que juegan las
bacterias en los ciclos biogeoquímicos de la tierra, apenas estamos comenzando a
comprender las fuerzas moleculares y físicas que gobiernan el tamaño de las bacterias. La
catalogación de la naturaleza diversa de la vida bacteriana, tanto en términos físicos como
metabólicos, y la caracterización de los aspectos más manejables de su fisiología ha llevado
a avances en nuestra comprensión no solo de las bacterias, sino también de los aspectos
fundamentales de la biología comunes a todas las formas de vida.
Significativamente, los mecanismos que han estado implicados en el control del tamaño
celular en eucariotas, incluida la endoreduplicación (revisado en Lee et al. 2009 ), la
señalización de nutrientes (revisado en Davie y Petersen 2012 ) y, por supuesto, el control
del ciclo celular (ver revisiones) por Jorgensen y Tyers 2004 ; Goranov y Amon 2010 )
están repitiendo temas en el control del tamaño de las células bacterianas. Anticipamos que
la aplicación de técnicas, tanto las probadas como las verdaderas (p. Ej., El increíble poder
de la genética microbiana), y las nuevas (p. Ej., Microfluídica [ Wang et al. 2012 ], análisis
de imágenes de alto rendimiento [ Cabeen et al. 2009 ; Russell et al. 2013 ], y
metabolómica unicelular [Zenobi 2013 ]) revelará información sobre el control del tamaño
celular en bacterias que se aplican a todos.