Deseamos sugerir una estructura para la sal del ácido desoxirribonucleico (ADN).

Esta estructura
tiene nuevas características que son de considerable interés biológico. Pauling y Core y ya han
propuesto una estructura para el ácido nucleico. Ellos amablemente hicieron su manuscrito
disponible para nosotros antes de la publicación. Su modelo consta de tres cadenas
entrelazadas, con los fosfatos cerca del eje de la fibra y las bases en el exterior. En nuestra
opinión, esta estructura no es satisfactoria por dos razones: (I) Creemos que el material que
proporciona los diagramas de rayos X es la sal, no el ácido libre. Sin los átomos de hidrógeno
ácidos, no está claro qué fuerzas mantendrían la estructura unida, especialmente porque los
fosfatos cargados negativamente cerca del eje se repelen entre sí. (2) Algunas de las distancias
de van del 'Waals parecen ser demasiado pequeñas. Fraser (en la prensa) también sugirió otra
estructura de tres cadenas. En su modelo, los fosfatos están en el exterior y las bases en el
interior, unidos entre sí por enlaces de hidrógeno. Esta estructura como se describe está
bastante mal definida, y por esta razón no comentaremos sobre ella. Queremos presentar una
estructura radicalmente diferente para la sal del ácido nucleico desoxirribosa. Esta estructura
tiene dos cadenas helicoidales, cada una enrollada alrededor del mismo eje (ver
diagrama). Hemos hecho las suposiciones químicas habituales, a saber, que cada cadena
consiste en grupos diéster de fosfato que unen residuos de desoxirribofuranosa ~ D con
enlaces 3 ', 5'. Las dos cadenas (pero no sus bases) están relacionadas por una díada
perpendicular al eje de la fibra. Ambas cadenas siguen hélices diestras, pero debido a la díada
las secuencias de los átomos en las dos cadenas corren en direcciones opuestas. Cada cadena
se asemeja vagamente piel "de Berg 'No.1 modelo; Es decir, t él bases están en el interior de la
hélice y los fosfatos en el exterior La configuración del azúcar y los átomos de cerca que está
cerca de Furberg' configuración estándar ', el azúcar es aproximadamente perpendicular a la
base adjunta es un residuo en cada cadena cada 3 · 4 A. en la dirección z . Hemos asumido un
ángulo de 36 ° entre los residuos adyacentes en la misma cadena, de modo que la estructura se
repite después de 10 residuos en cada cadena, es decir, después de 34 A. La distancia de un
átomo de fósforo desde el eje de la fibra es 10 A. Como Los fosfatos están en el exterior, los
cationes tienen fácil acceso a ellos. La estructura es abierta, y su contenido de agua es bastante
alto. Con un menor contenido de agua, esperaríamos que las bases se inclinen para que la
estructura se vuelva más compacta. La característica novedosa de la estructura es la forma en
que las dos cadenas se mantienen unidas por las bases de purina y pirimidina. Los planos de las
bases son perpendiculares al eje de la fibra . Se unen en pares, y una base única de una cadena
está unida por hidrógeno a una base única de la otra cadena, de modo que las dos se encuentran
juntas con coordenadas z idénticas. Una de las parejas debe ser una purina y la otra una
pirimidina para que se produzca la unión. Los enlaces de hidrógeno se hacen de la siguiente
manera: posición de purina 1 a posición de pirimidina 1; posición de purina 6 a posición de
pirimidina 6. Si se supone que las bases solo aparecen en la estructura en las formas
tautoméricas más plausibles (es decir, con las configuraciones de ceto en lugar de enol), se
encuentra que solo se pueden unir pares específicos de bases juntos Estos pares son: adenina
(purina) con timina (pirimidina) y guanina (purina) con citosina (pirimidina). ~
En palabras ther, si una adenina forma un miembro de un par, en cualquiera de las cadenas, a
continuación, en estos supuestos el otro miembro debe ser timina; Del mismo modo para la
guanina y la citosina. La secuencia de bases en un solo cl1ain no parece estar restringida de
ninguna manera. Sin embargo, si solo se pueden formar pares específicos de bases, se deduce
que si se da la secuencia de bases en esa cadena, entonces la secuencia en la otra cadena se
determina automáticamente. Se ha encontrado experimentalmente 3 ,. que la proporción de
las cantidades de adenina a timina y la proporción de guanina a citosina son siempre muy
cercanas a la unidad para el ácido nucleico desoxirribosa. Probablemente sea imposible
construir esta estructura con un azúcar ribosa en lugar de desoxirribosa, ya que el átomo de
oxígeno adicional haría un contacto de van del 'Waals demasiado cerca. Los datos de rayos X5 •
6 publicados anteriormente sobre el ácido nucleico de la desoxirribosa son insuficientes para
una prueba rigurosa de nuestra estructura. Por lo que sabemos, es más o menos compatible con
los datos experimentales, pero debe considerarse no probado hasta que se haya comprobado
para obtener resultados más exactos. Algunos de estos se dan en las siguientes
comunicaciones. No teníamos conocimiento de los detalles de los resultados presentados allí
cuando derivamos nuestra estructura, que se basa principalmente pero no completamente en
datos experimentales publicados y argumentos estereoquímicos . No se ha observado nuestro
aviso de que el pareado específico que hemos sugerido de forma indirecta sugiere un posible
mecanismo de copia del material genético. Los detalles completos de la estructura, incluidas las
condiciones asumidas en su construcción, junto con un conjunto de coordenadas para los
átomos, se publicarán en otra parte. Estamos muy en deuda con el Dr. Jerry Donohue por sus
constantes consejos y críticas, especialmente sobre distancias interatómicas. También nos ha
estimulado el conocimiento de la naturaleza general de los resultados experimentales no
publicados e ideas del Dr. MHF Wilkins, el Dr. Franklin y sus compañeros de trabajo en King's
College, Londres. Uno de nosotros (JDW) recibió ayuda de una beca de
la Fundación Nacional para la Parálisis Infantil.
Estructura molecular de los ácidos nucleicos de desoxipentosa
MIENTRAS que las propiedades biológicas del ácido nucleico de la desoxipentosa sugieren una
estructura molecular que contiene una gran complejidad, los estudios de difracción de rayos X
que se describen aquí (cf. Astburyl ) muestran que la configuración molecular básica es muy
simple. El propósito de esta comunicación es describir, de manera preliminar, parte de la
evidencia experimental de la configuración de la cadena del polinucleótido como espiral, y que
existe en esta forma cuando está en el estado natural. Una cuenta más completa de la obra se
publicará en breve. La estructura del ácido nucleico de la desoxipentosa es la misma en todas
las especies (aunque las relaciones de base de nitrógeno se alteran significativamente) en las
nucleoproteínas, extraídas o en las células, y en los nucleados purificados. El mismo grupo lineal
de cadenas polinucleotídicas puede agruparse en paralelo de diferentes maneras para dar
material cristalino -3, semicristalino o paracristalino . En todos los casos, la fotografía de
difracción de rayos X consta de dos regiones, una determinada en gran medida por el espaciado
regular de los nucleótidos a lo largo de la cadena, y la otra por los espaciamientos más largos de
la configuración de la cadena. La secuencia de diferentes bases de nitrógeno a lo largo de la
cadena no se hace visible. Paracristalino orientado El ácido nucleico
de desoxipentosa ('estructura B' en la siguiente comunicación de Franklin y Gosling)
proporciona un diagrama de fibra como se muestra en la Fig. Yo (cf. ref 4). Astbury sugirió que
el fuerte 3 · 4-A. La reflexión correspondió a la repetición del internucleótido a lo largo del eje
de la fibra. Los "-" líneas de capa de 34 A. Sin embargo, no se deben a una repetición de una
composición de polinucleótidos, pero para repetir la configuración de la cadena, lo que hace de
difracción fuertes como las cadenas de nucleótidos tienen una densidad mayor que el agua
intersticial La ausencia de reflexiones. en o cerca del meridiano, inmediatamente sugiere una
estructura helicoidal con un eje paralelo a la longitud de la fibra .
Difracción por Helices
Se puede demostrar "(también Stokes, no publicado) que la distribución de la intensidad en el
patrón de difracción de una serie de puntos igualmente espaciados a lo largo de una hélice está
dada por los cuadrados de las funciones de Bessel. Una hélice continua uniforme da una serie
de capas de líneas de espaciado correspondientes al paso de la hélice, la distribución de
intensidad a lo largo de la capa de n-ésima línea es proporcional al cuadrado de J n, la función
de Bessel de orden n. Una línea recta puede extraerse aproximadamente a través de los
máximos más interna de cada Bessel flUlction y el origen. el ángulo de esta línea hace con el
ecuador es aproximadamente igual al ángulo entre un elemento de la hélice y el eje de hélice.
Si una unidad se repite n veces a lo largo de la hélice hay será una reflexión meridional (J 0 2) en
la línea de la capa n. La configuración helicoidal produce bandas laterales en esta frecuencia
fundamental, siendo el efecto 5 reproducir la distribución de intensidad sobre t se originó
alrededor del nuevo origen, en la línea de la capa n, corroponando a C en la
Fig. Ahora analizaremos brevemente en términos físicos algunos de los efectos de la forma y el
tamaño de la unidad de repetición o del nucleótido en el patrón de difracción. Primero, si el
nucleótido consiste en una unidad que tiene simetría circular alrededor de un eje paralelo al eje
helicoidal, todo el patrón de difracción se modifica por el factor de forma del
nucleótido. Segundo, si el nucleótido consiste en una serie de puntos en un radio en los ángulos
rectos al eje helicoidal, las fases de radiación dispersadas por hélices de un diámetro diferente
que pasan por cada punto son las mismas. La suma de las funciones de Bessel correspondientes
refuerza el interior.