Matriz de distancias

una matriz de distancias es una matriz cuyos elementos representan las distancias entre los
puntos, tomados por pares, de un conjunto. Se trata, por lo tanto, de una matriz simétrica de
tamaño NxN (dado un conjunto de N puntos en el espacio euclídeo). Cada elemento de una
matriz de distancias es más pequeño cuanto más cercanos se encuentren los puntos.
Ejemplo:
La matriz de distancias podría ser:

Estos datos pueden ser vistos de forma gráfica como un mapa de calor. En la siguiente
imagen, el negro denota una distancia de 0, representando el blanco la distancia máxima:

En bioinformática se usan las matrices de distancias para representan estructuras de proteínas de

una forma independiente de las coordenadas, además de como distancias de emparejamiento
entre dos secuencias. Son usadas en alineamientos tanto estructurales como de secuencias, y en la
determinación de las estructuras de las proteínas en RMN (resonancia magnética nuclear) o
cristalografía de rayos X.