Replicación semiconservativa: cada hebra parental es utilizada como

molde en el proceso de replicación o síntesis de una nueva hebra, esto

es ejecutado por dna polimerazas, en dirección `5  ´3 .
En bacterias se reconocen al menos 3 tipos de DNA polimeraza (I,II,II)
Gen estructural: gen que otorga la capacidad catalítica, es decir la capacidad de unir un nucleótido con otro.
(no se preguntaran las sub unidades)
Procesividad: que tan eficiente es la polimeraza, al compararla con la pol. I, II y III, esta ultima es la mas eficiente por lo
tanto esta es la principal que esta implicada en el proceso de replicación, las otras dos participan en procesos adyacentes o
equivalentes de apoyo a la polimeraza III.
Entonces cunado se hable re plicacion se tiene que hablar de la DNA polimeraza III.
La procesividad es la cantidad de nucleótidos que puede unir la polimeraza antes de caerse (soltarse).
Todas estas polimerasas tienen actividad exonucleasas 3`  ´5 (producto de unas subunidades) esto significa que cuando la
dna polimerasa va sintetizando 5´ ´3 y pega un nucleótido mal, no podrá seguir avanzando , entonces que hace?
Retrocede 3´  ´5 para sacar el nucleótido que pego mal, sin embargo no tiene actividad exonucleasa 5´ ´3.
La única que tiene exonucleasa 5´ ´3 es la DNA polimeraza I y esta tiene como función eliminar el Primer (partidor).
¿que recordar del cuadro anterior?
• Que son 3 polimerasas
• Son diferentes en la cantidad de enzimas que la componen
• En su procesividad (que es distinta)
• Su capacidad exonucleasa, solo la DNA I tiene actividad ´5  ´3

¿Qué sucede si tengo una bacteria con la DNA polimerasa I mutada?

R: no se elimina NINGUN primer, recordar que existirá una hebra líder con 1
primer y una hebra rezagada con 3500 millones de primer.
DNA girasa: una topoisomerasa clase II
DNA a: Proteina que se una a la región rica en
adenina y timina y permite la separación de las
hebras.
Helicasa: permite que se cargue la polimerasa
Proteinas de unión a simple hebra
Primasas
Polimerasa I
Ligasa

Dna polimerasa III: no tiene solo la función de

despolimerización, si no que también tiene
varias subunidades con distintas actividades
catalíticas.
(subunidades nombradas en el recuadro rojo)
• La sub unidad (alfa) es la que tiene la
actividad polimeraza, correctora ´3  ´5 y
una proteína que permite la estabilización
de la estructura. Esta sub unidad alfa esta
representada en los core (amarillos).
• Entonces en cada una de las hebras que se
esta copiando pasa por estos core.
• Y en morado se tiene la Dna helicasa que va
permitiendo la apertura al romper los
puentes de hidrogeno.

No se preguntara en la prueba
los nombres de las
subunidades, es solo para
entender.
Esta primasa sintetiza una
secuencia corta entre 10 y 12
nucleótidos para generar este
´3 OH libre, el cual será
reconocido por la polimerasa
III y comenzar a elongar
Lo que hace la helicasa es ir avanzando
para permitir la separación de la doble
hebra, rompiendo los puentes de
hidrogeno que la estabilizan, esto es lo
que permite la formación de la horquilla
de replicación.
• Se tiene la dna polimeraza III
que esta sintetizando en
ambos frentes (ya sea en la
hebra líder o rezagada)
• La primaza que esta
sintetizando los partidores
• Proteinas de unión a simple
hebra
• Tanto la hebra líder como la
rezagada tienen Primer
(partidor de RNA) el cual debe
ser eliminado y reemplazado
por DNA y esto es tarea de la
DNA pol. I.
Esto va avanzando en la
dirección contraria a la cual
se sintetiza el fragmento: se
avanza, se sintetiza el
fragmento y luego
retrocede.

Lo que hace el dna

polimeraza I es reclutarse, se
come al partidor por
actividad exonucleasa -
´5 ´3 es decir que saca los
nucleótidos en esa dirección
y por ultimo la dna ligasa
une los nucleótidos de DNA,

Se genera el enlace
fosfodiéster para dejar un
solo fragmento
Esto quiere decir que
ocurre en ambas hebras,
en sentidos opuestos
generando una estructura
Se tienen dos horquillas
avanzando en sentidos
opuestos, una por la hebra
líder y otra por la hebra
rezagada
La síntesis bidireccional del dna
circular permite que esto sea
mas eficiente, que se amas
rápido. La dna III tiene una
procesividad de 1000 nucleótidos
por segundo, entocnes para una
E. coli que tiene 4 millones de
pares de bases esto en
condiciones optimas de
crecimiento (nutrientes,
temperatura optima) se tendrá
una replicación optima en unos
40 minutos.
Antes de que la bacteria se separe,
ya esta replicando el genoma
nuevamente y esto optimiza el
proceso de crecimiento y me
permite dividir la celula ahora en
40min en vez de una hora.
Son todas las enzimas vistas hasta ahora,
conjugadas en una estructura. Se le
denomina complejo multiproteico.
Además de la dna pol. III el replisoma va
a tener otros componentes enzimáticos
como la dna girasa, la helicasa, la
primasa y protenias SSB.
Se puede visualizar la estructura que
afirma las 2 DNA pol. III

Posiblemente se tenga que

identificar y explicar la función de
cada una de estas proteínas en la
prueba.
No se va a preguntar, pero las
polimerasas requieren del
cofactor magnesio.
Si se hace una reacción de PSR y
se olvida de agregar el magnesio
entonces la polimerasa no
funcionara.

El magnesio tiene valencia

positiva lo que permite
interactuar con uno de los
electrones del grupo fosfato
entrante y permite el movimiento
del electrón para facilitar el
enlace a la cadena creciente.
Y el otro magnesio interactúa con
el pirofosfato para facilitar su
salida.
Entonces estos dos iones de
valencia positiva facilitan la
reacción de enlace entre un
nucleótido que entra y la cadena
naciente.
La dna pol. III tendrá forma de
palma de una mano, en donde la
palma será el sitio de actividad
catalítica y el dna va pasando por
ese lugar
Esta presente en la misma polimerasa y
su funcion es corregir el mal
apareamiento de un nucleótido
retrocediendo, lo saca y avanza.
Transcripción
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