caminos del DNA a la protena La evolucin del concepto de gen 1. A partir de la dcada de 1940, el concepto de gen evolucion desde la formulacin "un gen: una enzima" a "un gen: una cadena polipeptdica". Sin embargo, ninguna de estas definiciones se ajusta por completo al concepto actual de gen. El flujo de informacin dentro de la clula 2. El "dogma central de la biologa", definido en 1957 por Francis Crick, establece que la informacin gentica fluye en el siguiente sentido: DNA RNA protenas. Esto es verdad en la mayora de los casos; sin embargo, el material gentico de algunos virus est formado por RNA que luego es usado como molde para producir DNA. El cdigo gentico 3. El cdigo gentico consiste en la asignacin de tripletes de nucletidos (codones) en el RNA mensajero (mRNA) a cada uno de los aminocidos que formarn una cadena polipeptdica. 4. Existen 64 combinaciones posibles de codones. El cdigo es redundante, porque los 20 aminocidos usualmente presentes en los seres vivos son codificados por 61 de estas combinaciones. Los tres codones restantes actan como seales de terminacin de la traduccin. 5. Con muy pocas excepciones, el cdigo gentico es el mismo en casi todos los seres vivos. Fig. 10-4. El cdigo gentico
(a) Los 20 aminocidos que comnmente constituyen las
protenas. (b) El cdigo gentico consiste en 64 combinaciones de tripletes (codones) y sus aminocidos correspondientes. Los codones que se muestran aqu son los que puede presentar la molcula de mRNA. De los 64 codones, 61 especifican aminocidos particulares. Los otros 3 codones son seales de detencin, que determinan la finalizacin de la cadena polipeptdica. Dado que los 61 tripletes codifican para 20 aminocidos, hay codones "sinnimos" como, por ejemplo, los 6 tripletes diferentes que incorporan leucina (la mayora de los sinnimos, como se puede ver, difieren slo en el tercer nucletido). Sin embargo, la afirmacin inversa no es vlida: cada codnespecifica solamente un aminocido. La transcripcin: del DNA al RNA 6. La transcripcin es el proceso de sntesis de RNA a partir de DNA. Sigue el mismo principio de apareamiento de bases que la replicacin del DNA, pero se reemplaza la timina por el uracilo. En cada transcripcin, slo una de las cadenas del DNA se transcribe. La RNA polimerasa cataliza la adicin de ribonucletidos al extremo 3 de la cadena de RNA, de modo que esta ltima es antiparalela a la cadena molde de DNA. Fig. 10-6. Transcripcin del DNA En la regin del promotor, punto de unin de la enzima RNA polimerasa, la doble hlice de DNA se abre y, a medida que la RNA polimerasa avanza a lo largo de la molcula de DNA, se separan las dos cadenas. Los ribonucletidos, que constituyen los bloques estructurales, se ensamblan en la direccin 5' a 3' a medida que la enzima lee la cadena molde de DNA. Ntese que la cadena de RNA recin sintetizada es complementaria, no idntica, a la cadena molde a partir de la cual se transcribe; su secuencia, sin embargo, es idntica a la cadena codificante de DNA (no transcrita), excepto por un detalle: en el RNA, la timina (T) se reemplaza por uracilo (U). El RNA recin sintetizado se separa de la cadena molde de DNA. 7. La RNA polimerasa no necesita un cebador para iniciar la sntesis. Se une al DNA en una secuencia especfica, el promotor, que define el punto de inicio de la transcripcin y su direccin. 8. En los procariontes, el proceso de transcripcin contina hasta que la polimerasa encuentra una secuencia que constituye la seal de terminacin. En los eucariontes, el proceso termina cuando el RNA es cortado en una secuencia especfica. Al finalizar la transcripcin, la RNA polimerasa se detiene y libera la cadena molde de DNA y el mRNA sintetizado. 9. En los eucariontes, los transcritos primarios sufren diversas modificaciones durante la transcripcin. Entre ellas se encuentran la adicin del CAP, la poliadenilacin y el splicing. Este ltimo proceso consiste en el corte y la eliminacin de ciertas secuencias, los intrones, y el posterior empalme de las secuencias restantes, los exones. Slo los exones forman parte del mRNA maduro. Un mismo transcrito primario puede ser procesado por splicing de distintas maneras. Este empalme alternativo permite que una molcula de mRNA inmadura pueda originar diferentes molculas de mRNA maduro. Fig. 10-8. Procesamiento del mRNA en eucariontes La informacin gentica codificada en el DNA se transcribe a una copia de RNA (transcripto primario). Esta copia se modifica en forma cotranscripcional con la adicin del casquete 5' (CAP), el corte de los intrones y el empalme de los exones (splicing) y, finalmente con la adicin de la cola de poliA. A ambos extremos del mensajero hay secuencias no traducibles, denominadas extremos 5UTR (regin no traducible que abarca desde el CAP hasta el codn de iniciacin) y extremos 3UTR (regin no traducible que abarca desde el codn de terminacin hasta la cola de PoliA). En esta figura, el splicingse produce luego de la adicin de la cola de poli-A, sin embargo, muchas veces el proceso de corte y empalme ocurre antes de que haya concluido la transcripcin. El mRNA maduro luego se dirige al citoplasma, donde se traduce a protenas. 10. En el ciliado de agua dulce Tetrahymena, el intrn inmaduro acta comocatalizador de la escisin, produciendo un empalme autocataltico. A este RNA con funcin de enzima se lo llama ribozima. La traduccin: del RNA al polipptido 11. La traduccin es la conversin de la secuencia de nucletidos del RNA en la secuencia de aminocidos de un polipptido. En este proceso participan los mRNA, los RNA ribosmicos (rRNA) y los RNA de transferencia(tRNA). 12. Los ribosomas estn formados por rRNA y protenas. Cada uno est formado por dos subunidades de diferente tamao que, adems, en los procariontes son ms pequeas que en los eucariontes. 13. El mRNA y el tRNA iniciador se unen a la subunidad ribosmica menor. Luego se les une la subunidad mayor y cataliza la unin peptdica entre aminocidos. En la subunidad mayor existen tres sitios a los que se une el tRNA: el sitio A (aminoaclico), el sitio P (peptidlico) y el sitio E (de salida). 14. Los tRNA son molculas pequeas, con una estructura secundaria semejante a la hoja de un trbol, que presentan dos sitios de unin. Uno de ellos es el anticodn, que se aparea con el codn del mRNA. El otro sitio, ubicado en el extremo 3, se acopla a un aminocido particular en forma muy especfica. As, los tRNA permiten la alineacin de los aminocidos de acuerdo con la secuencia de nucletidos del mRNA. 15. El grupo de enzimas aminoacil-tRNA sintetasas catalizan la unin entre el aminocido y el tRNA y forman el complejo aminoacil-tRNA. Este complejo se une a la molcula de mRNA, apareando el anticodn con el codn del mRNA en forma antiparalela. As, el tRNA coloca al aminocido especfico en su lugar. El enlace entre el aminocido y el tRNA se rompe cuando se forma el enlace entre el aminocido recin llegado y el ltimo de la cadena polipeptdica en crecimiento. 16. En los procariontes, el proceso de traduccin comienza antes de que haya finalizado el de transcripcin. En los eucariontes, ambos procesos estn separados en el tiempo y en el espacio: la transcripcin ocurre en elncleo y la traduccin, en el citoplasma. 17. Tanto en procariontes como en eucariontes, la sntesis de polipptidos ocurre en tres etapas: iniciacin, elongacin y terminacin. 18. Hacia el final del mRNA hay un codn que acta como seal de terminacin. No existe ningn tRNA que tenga un anticodn que se aparee con este codn. Existen, en cambio, factores de liberacin que se unen al codn de terminacin y provocan la separacin del polipptido y el tRNA. Finalmente, las dos subunidades ribosmicas tambin se separan. Fig. 10-13. Sntesis de un polipptido en procariontes (a) Iniciacin. La subunidad ribosmica ms pequea (menor) se une al extremo 5' de una molcula de mRNA. La primera molcula de tRNA, que lleva el aminocido modificado fMet, se acopla con el codn iniciador AUG de la molcula de mRNA. La subunidad ribosmica ms grande (mayor) se ubica en su lugar, el complejo tRNA-fMet ocupa el sitio P (peptidlico). El complejo de iniciacin ahora est completo. (b) Elongacin. Un segundo tRNA, cargando su aminocido correspondiente, valina en este caso, se coloca en el sitio A y su anticodn se acopla con el mRNA. Para que el aminoacil-tRNA ingrese en el sitio A debe unirse antes a una protena llamada factor de elongacin, que en su forma activa est unida al GTP. Al aparearse el tRNA con el mRNA, se dispara lahidrlisis del GTP por parte del factor de elongacin, que luego se disocia, lo cual permite que el aminoacil-tRNA permanezca unido por un corto perodo al mRNA. A continuacin se forma un enlace peptdico entre los dos aminocidos reunidos en el ribosoma. Al mismo tiempo, el enlace entre el primer aminocido y su tRNA se rompe. El ribosoma se mueve entonces a lo largo de la cadena de mRNA en direccin 5' a 3'. El segundo tRNA, con el dipptido unido, se mueve desde el sitio A al sitio P y el primer tRNA pasa al sitio E y luego se desprende del ribosoma. Un tercer aminoacil-tRNA, que en este caso porta el aminocido fenilalanina, se coloca en el sitio A y se forma otro enlace peptdico. La cadena peptdica naciente siempre est unida al tRNA que se est moviendo del sitio A al sitio P y el tRNA entrante que lleva el siguiente aminocido siempre ocupa el sitio A. Este paso se repite una y otra vez hasta que se completa el polipptido.(c) Terminacin. Cuando el ribosoma alcanza un codn de terminacin (en este ejemplo, UGA), el sitio A es ocupado por factores de liberacin que hacen que la cadena polipeptdica se escinda del ltimo tRNA y que las dos subunidades del ribosoma se disocien. 19. Las protenas "chaperonas" ayudan a las cadenas polipeptdicas a plegarse. Finalizado este proceso, las nuevas protenas viajan al medio extracelular o a los distintos compartimientos celulares, segn el tipo de seales que posean.
Una redefinicin de las mutaciones
20. Una mutacin es un cambio en la secuencia o en el nmero de nucletidos en el DNA de una clula. Slo las mutaciones que ocurren en los gametos se transmiten a la descendencia. Las mutaciones puntuales implican la sustitucin de un nucletido por otro. La adicin o la sustraccin (delecin) de nucletidos provoca el corrimiento del marco de lectura y, por consiguiente, la aparicin de una protena nueva que casi siempre resulta defectuosa.
Una revisin del concepto de gen
21. Actualmente se considera que un gen es un segmento de DNA que se encuentra a continuacin de un promotor y que puede ser transcrito por una RNA polimerasa, originando un RNA funcional.