Tras ser elegido candidato Presidencial por el partido AD (Accin
Democrtica) el 4 de Diciembre de 1988 vuelve a ganar las elecciones 1988 con un 43,76 % de votos. El 2 de Febrero en su discurso inaugural sealo una series de medidas neoliberales con una carta de intencin con el Fondo Monetario Internacional (FMI) El 16 de Febrero Prez tuvo que tomar una serie de medidas (paquete econmico). 1989 La medida econmica que fue la detonante de la explosin social fue el aumento de la gasolina ya que los transportistas aumentaron el pasaje sin haberse aplicado el aumento de sueldo. A consecuencia el 23 de Febrero estallo el caracazo con protestas del pueblo, con violentos disturbios en los barrios, saqueos y muchos hechos violentos que dejaron 276 muertos y numerosos heridos ,lo cual obligaron a Prez a dar el toque de queda. Tiempo despus hubo un aumento de produccin de crudo lo que causo un alivio momentneo.
El 4 de Febrero el actual presidente Hugo Chvez Fras dirigi junto
con otros seores de las Fuerzas Armadas un Golpe de estado fallido
1992 contra Prez que ayudara a salir de la rendicin militar y su
encarcelamiento. El 27 de Noviembre otro grupo de militares nuevamente intentan acabar con el Gobierno y Prez decreta, por segunda vez en el ao, el Estado de Emergencia en Venezuela.
En Noviembre el fiscal general de la republica dio una solicitud a un
1993 antejuicio en contra de Prez por malversacin de 250 millones.
En agosto Prez es destituido por el Congreso, al tiempo que ramn Velsquez es ratificado como presidente.
1994 La Corte Suprema de Justicia el 8 de mayo ordena la detencin
preventiva de Prez e ingresa en la penitenciara de El Junquito, y el partido accin democrtica expulsa a Prez de sus filas tras casi 50 aos de vida poltica.