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CURSO BSICO
Tr a d u c c i n d e l a
segunda edicin original
John L. Tymoczko
Jeremy M. Berg
Lubert Stryer
Edicin en espaol:
Editorial Revert, S. A., 2014
ISBN: 978-84-291-7603-2
Propiedad de:
EDITORIAL REVERT, S. A.
Loreto, 13-15. Local B
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dos la reprografa y el tratamiento informtico, y la distribucin de ejemplares de ella mediante alquiler o prstamo pblicos,
queda rigurosamente prohibida sin la autorizacin escrita de los titulares del copyright, bajo las sanciones establecidas por las
leyes.
Lubert Stryer posee la Ctedra Winzer de Biologa Celular (en calidad de emrito)
en la Escuela de Medicina y es Catedrtico emrito de Neurobiologa en la Universidad
Stanford, en cuya facultad ha permanecido desde 1976. Se gradu en la Escuela de Me-
dicina de Harvard. El profesor Stryer ha sido galardonado con numerosos premios por
su investigacin sobre las interacciones entre la luz y la vida, incluyendo el premio Eli
Lilly para la Investigacin Fundamental en Qumica Biolgica y el premio al Inventor
ms Destacado, otorgado por la Intellectual Property Owners Association y es miembro
electo de la Academia Nacional de Ciencias y de la Sociedad Filosca Americana. En
2006, se le concedi la Medalla Nacional de la Ciencia. La publicacin de la primera
edicin de Biochemistry, en 1975, revolucion la enseanza de la Bioqumica.
iv
Prefacio
La Bioqumica en su contexto
La Bioqumica, por muy esotrica que pueda parecer por s sola, resulta ms fcil de
comprender si se estudia en un contexto que afecta al estudiante. A lo largo del libro
haremos hincapi en estas conexiones.
En el ndice detallado, que comienza en la pgina xvii, las secciones nuevas se desta-
can como NOVEDAD .
Tcnicas experimentales
En esta nueva edicin, nuestra descripcin de las tcnicas experimentales se ha ac-
tualizado, ampliado e incluido en la versin impresa del libro de texto. El Captulo 5,
Tcnicas en bioqumica de protenas, y el Captulo 41, Tecnologa del DNA recom-
binante, describen las tcnicas ms importantes utilizadas por los bioqumicos en
el pasado, as como las nuevas tecnologas que permiten a los bioqumicos realizar
descubrimientos en los laboratorios de hoy en da.
Aspectos clnicos
En los Aspectos clnicos, los estudiantes ven cmo los con-
Aspecto clnico
ceptos considerados en ese apartado afectan a un aspecto
Mutaciones en el factor de iniciacin 2 provocan un curioso
de una enfermedad o de su curacin. Analizando los con- estado patolgico
Las mutaciones en el factor de iniciacin 2 eucaritico dan lugar a una misteriosa
ceptos bioqumicos en el contexto de una enfermedad, los enfermedad denominada enfermedad de la sustancia blanca evanescente (VWM), en
la que las clulas nerviosas del cerebro desaparecen y son sustituidas por lquido cere-
estudiantes aprenden por qu estos conceptos son relevantes broespinal (Figura 40.13). La sustancia blanca del cerebro est formada fundamen-
talmente por axones nerviosos que conectan la sustancia gris del cerebro con el resto
para la vida humana y qu ocurre cuando la bioqumica se del organismo. La muerte, que sobreviene a causa de la ebre o del coma generali-
zado, puede producirse en cualquier momento en un intervalo comprendido entre
descontrola. Algunos ejemplos de las cuestiones que plan- unos pocos aos y dcadas despus de aparecer la enfermedad. Un aspecto particular-
mente enigmtico de la enfermedad es su especicidad tisular. Es de esperar que una
teamos a lo largo del libro sobre la salud humana incluyen: mutacin en un proceso bioqumico tan importante para la vida como lo es la inicia-
cin de la sntesis de protenas sea letal o que, por lo menos, afecte a todos los tejidos
del organismo. Las enfermedades como la VWM muestran de manera grca que,
aunque se han realizado grandes avances en bioqumica, todava se necesita mucha
s Por qu a algunas personas les duele el estma- ms investigacin para comprender la complejidad de la salud y de la enfermedad.
Aspectos biolgicos y
OH CH3
de comrselo? (p. 242) La solanina es txica para los animales porque inhibe la acetilcolinesterasa, una Figura 22.9 Patatas txicas. Las patatas
expuestas a la luz sintetizan clorofila, lo que
enzima crucial para el control de la transmisin de los impulsos nerviosos. Se cree que
da lugar a patatas verdosas. La luz tambin
s Qu ocurre cuando las algas respiran demasia- la planta sintetiza solanina para disuadir a los insectos de que se coman la patata. La luz
tambin hace que las patatas sinteticen clorola, lo que da lugar a que los tubrculos se
activa una ruta que provoca la sntesis de
solanina, un alcaloide txico. Las patatas
do? (p. 362) vuelvan verdes. Las patatas verdes han estado expuestas a la luz y, por tanto, es probable
que tambin estn sintetizando solanina (Figura 22.9). Por este motivo, es mejor no
fritas hechas con patatas expuestas a la luz
tienen los bordes verdes. [Science Photo
comer patatas verdes ni patatas fritas que tengan los bordes de color verde. Library/Alamy.]
s Por qu se pone duro el pan? (p. 413)
s Por qu no es una buena idea comer patatas fri-
tas verdes? (p. 395)
s Cmo funcionan los herbicidas? (p. 403)
s Por qu las serpientes son unos cazadores tan ecaces? (p. 206)
s Cmo puede una mutacin en una protena mitocondrial alterar el com-
portamiento de los cerdos? (p. 378)
A modo de referencia rpida para los profesores se incluye, en la pgina x, una lista de
todos los Aspectos clnicos y biolgicos.
viii Prefacio
Ejemplos nutricionales
Existen abundantes ejemplos de la relacin subyacente entre la nutricin y la bioqu-
mica. En esta edicin, algunos ejemplos responden a preguntas como estas:
En la pgina xi hay una lista completa de los ejemplos nutricionales incluidos en esta
edicin.
s Problemas para atrevidos es una nueva seccin que exige, adems de hacer
clculos, conocer las estructuras qumicas y los conceptos que resultan difci-
les para la mayora de los estudiantes.
s Los Problemas de interpretacin de datos entrenan a los estudiantes para el
anlisis de datos y la obtencin de conclusiones cientcas.
s Los Problemas de integracin de captulos establecen conexiones entre
conceptos que aparecen en diversos captulos.
Al nal del libro, las Soluciones a los Problemas incluyen, de forma breve, las solucio-
nes a todos los problemas que aparecen al nal de cada captulo. Con mucho gusto,
ofrecemos soluciones ampliadas en el nuevo libro de acompaamiento Student Com-
panion, elaborado por Frank Deis, Nancy Counts Gerber, Richard Gumport y Roger
Koeppe. En la pgina xiii se pueden encontrar ms detalles sobre este complemento.
Prefacio ix
Objetivos de aprendizaje
En clase, los objetivos de aprendizaje se uti- En este captulo analizaremos las propiedades de los diversos niveles de la
lizan de muchas formas distintas. Para ayu- estructura de las protenas. Posteriormente, investigaremos cmo la estructura
primaria determina la estructura tridimensional nal.
dar a reforzar los conceptos clave al tiempo
que el estudiante est leyendo el captulo, 2 Comparar y contrastar los distintos 4.1 Estructura primaria: los aminocidos se unen
hemos marcado estos conceptos con el sm- niveles de estructura de las protenas y
cmo se relacionan entre s.
mediante enlaces peptdicos para formar cadenas
bolo y un nmero. Estos distintivos apa- polipeptdicas
recen en la introduccin de cada seccin, Las protenas son complicadas molculas tridimensionales, pero su estructura tridimen-
sional depende bsicamente de su estructura primaria los polmeros lineales formados
as como en los captulos en los que se pre- por la unin del grupo -carboxilo de un aminocido con el grupo -amino de otro ami-
nocido. El enlace que une los aminocidos en una protena se denomina enlace peptdico
sentan los conceptos clave. Tambin estn (tambin llamado enlace amida). La formacin de un dipptido a partir de dos aminoci-
asociados a algunos problemas del nal de dos va acompaada de la prdida de una molcula de agua (Figura 4.1). En casi todos los
casos, el equilibrio de esta reaccin est desplazado hacia la hidrlisis en lugar de hacia la
cada captulo para ayudar a los estudiantes a sntesis. Por tanto, la biosntesis de enlaces peptdicos requiere un aporte de energa libre.
desarrollar habilidades a la hora de resolver No obstante, los enlaces peptdicos son bastante estables desde el punto de vista cintico
porque la velocidad de hidrlisis es extremadamente baja; en ausencia de catalizador, la
problemas y para ayudar a los profesores a vida media de un enlace peptdico en disolucin acuosa se aproxima a los 1.000 aos.
la hora de evaluar el grado de comprensin
de los estudiantes en relacin con algunos
de los conceptos clave de cada captulo.
Anotaciones al margen
En el libro de texto recurrimos a las anotaciones al margen de varias formas para ayu-
dar a captar la atencin de los estudiantes, resaltar la importancia de la bioqumica en
sus vidas y hacerla ms accesible.
ndice resumido
PARTE I SECCIN 9 Fosforilacin oxidativa 347
EL DISEO MOLECULAR DE LA VIDA Captulo 20 La cadena transportadora de electrones 349
SECCIN 1 La Bioqumica nos ayuda Captulo 21 La fuerza protn-motriz 367
a comprender nuestro mundo 1 SECCIN 10 Las reacciones luminosas
Captulo 1 La Bioqumica y la unidad de la vida 3 de la fotosntesis y el ciclo de Calvin 387
Captulo 2 Agua, enlaces dbiles y la generacin Captulo 22 Las reacciones luminosas 389
de orden a partir del caos 17
Captulo 23 El ciclo de Calvin 407
SECCIN 2 Estructura y composicin
SECCIN 11 Metabolismo del glucgeno
de las protenas 33
y ruta de las pentosas fosfato 421
Captulo 3 Aminocidos 35
Captulo 24 Degradacin del glucgeno 423
Captulo 4 Estructura tridimensional de las protenas 45
Captulo 25 Sntesis del glucgeno 437
Captulo 5 Tcnicas en bioqumica de protenas 67
Captulo 26 La ruta de las pentosas fosfato 451
SECCIN 3 Conceptos bsicos y cintica
SECCIN 12 Metabolismo de los cidos
de las enzimas 91
grasos y de los lpidos 463
Captulo 6 Conceptos bsicos sobre la actividad
Captulo 27 Degradacin de los cidos grasos 465
de las enzimas 93
Captulo 28 Sntesis de los cidos grasos 481
Captulo 7 Cintica y regulacin 105
Captulo 29 Sntesis de lpidos 497
Captulo 8 Mecanismos e inhibidores 125
Captulo 9 La hemoglobina, una protena alostrica 141 SECCIN 13 El metabolismo de las
molculas que contienen nitrgeno 521
SECCIN 4 Carbohidratos y lpidos 155 Captulo 30 Degradacin de aminocidos
Captulo 10 Carbohidratos 157 y el ciclo de la urea 523
Captulo 11 Lpidos 179 Captulo 31 Sntesis de aminocidos 541
SECCIN 5 Membranas celulares, Captulo 32 Metabolismo de nucletidos 555
canales, bombas y receptores 193
PARTE III
Captulo 12 Estructura y funcin de las membranas 195 SNTESIS DE LAS MOLCULAS DE LA VIDA
Captulo 13 Rutas de transduccin de seales 215
SECCIN 14 Estructura de los cidos
PARTE II nucleicos y replicacin del DNA 575
TRANSDUCCIN Y ALMACENAMIENTO DE ENERGA Captulo 33 Estructura de las macromolculas
SECCIN 6 Los inhibidores de las protena que contienen informacin: DNA y RNA 577
quinasas pueden ser eficaces frmacos Captulo 34 Replicacin del DNA 597
anticancerosos 235 Captulo 35 Reparacin y recombinacin del DNA 613
Captulo 14 Digestin: convertir una comida SECCIN 15 Sntesis, maduracin
en compuestos bioqumicos celulares 237 y regulacin del RNA 627
Captulo 15 Metabolismo: conceptos bsicos Captulo 36 Sntesis y regulacin del RNA
y diseo 247 en bacterias 629
SECCIN 7 Gluclisis y Gluconeognesis 269 Captulo 37 Expresin gnica en eucariotas 645
Captulo 16 Gluclisis 271 Captulo 38 Maduracin del RNA en eucariotas 661
Captulo 17 Gluconeognesis 299 SECCIN 16 Sntesis de protenas
SECCIN 8 El ciclo del cido ctrico 315 y tecnologa del DNA recombinante 675
Captulo 18 Preparacin del ciclo 317 Captulo 39 El cdigo gentico 679
Captulo 19 Extraccin de electrones mediante Captulo 40 El mecanismo de la sntesis de protenas 689
el ciclo 329 Captulo 41 Tecnologa del DNA recombinante 709
ndice
PARTE I SECCIN 2 Estructura y composicin
EL DISEO MOLECULAR DE LA VIDA de las protenas 33
SECCIN 1 La Bioqumica nos ayuda Captulo 3 Aminocidos 35
a comprender nuestro mundo 1 Las biomolculas se representarn de dos formas distintas 35
Captulo 1 La Bioqumica y la unidad de la vida 3
3.1 Las protenas se construyen a partir de
un repertorio de 20 aminocidos 36
1.1 Los sistemas vivos necesitan un repertorio limitado La mayora de los aminocidos se presentan en
de tomos y molculas 4 dos formas que son imgenes especulares entre s 36
1.2 Hay cuatro clases principales de biomolculas 5 Todos los aminocidos presentan al menos dos grupos
Las protenas son biomolculas muy verstiles 5 cargados 36
Los cidos nucleicos son las molculas de la clula
3.2 Los aminocidos contienen una amplia gama
que almacenan informacin 6
Los lpidos son una forma de almacenamiento de grupos funcionales 37
de combustible y actan a modo de barrera 6 Los aminocidos hidrofbicos contienen, principalmente,
Los carbohidratos son molculas combustible cadenas laterales hidrocarbonadas 37
y almacenan informacin 7 Los aminocidos polares tienen cadenas laterales que
presentan un tomo electronegativo 39
1.3 El dogma central describe los principios bsicos
Los aminocidos cargados positivamente son hidroflicos 40
de la transferencia de informacin biolgicar 7
Los aminocidos cargados negativamente presentan
1.4 Las membranas delimitan la clula y desempean cadenas laterales cidas 41
funciones celulares 8 Las cadenas laterales ionizables incrementan
Las funciones bioqumicas se encuentran confinadas la reactividad y la formacin de enlaces 41
en los compartimentos celulares 11
Algunos orgnulos procesan y seleccionan protenas
3.3 Los aminocidos esenciales deben obtenerse
e intercambian materiales con el entorno 12 a partir de la dieta 42
Aspecto clnico Fallos en la funcin de los orgnulos Aspecto clnico La ingesta inadecuada de protenas
pueden dar lugar a enfermedades 14 da lugar a estados patolgicos 42
Captulo 2 Agua, enlaces dbiles y la generacin Captulo 4 Estructura tridimensional
de orden a partir del caos 17 de las protenas 45
2.1 Los movimientos trmicos aportan la energa 4.1 Estructura primaria: los aminocidos se unen
para las interacciones biolgicas 18 por medio de enlaces peptdicos para formar
2.2 Las interacciones bioqumicas tienen lugar cadenas polipeptdicas 46
en una disolucin acuosa 18 Cada protena tiene una secuencia de aminocidos
2.3 Las interacciones dbiles son importantes nica, especificada en los genes 47
propiedades bioqumicas 20 Aunque las cadenas polipeptdicas son flexibles,
Las interacciones electrostticas se producen existen restricciones conformacionales 48
entre cargas elctricas 20 4.2 Estructura secundaria: las cadenas polipeptdicas
Los puentes de hidrgeno se forman entre un tomo se pueden plegar para dar lugar a estructuras
electronegativo y el hidrgeno 21 regulares 50
Las interacciones de van der Waals dependen La hlice alfa es una estructura enrollada
de la asimetra transitoria de las cargas elctricas 21 estabilizada por puentes de hidrgeno intracatenarios 50
Los enlaces dbiles permiten establecer interacciones Las hojas beta se estabilizan mediante puentes
de forma repetida 22 de hidrgeno entre hebras polipeptdicas 51
2.4 Las molculas hidrofbicas se agrupan entre s 22 Las cadenas polipeptdicas pueden cambiar
La formacin de membranas est impulsada de direccin formando giros de 180 y bucles 53
por el efecto hidrofbico 23 Las protenas fibrosas proporcionan soporte
El plegamiento de las protenas est impulsado estructural a clulas y tejidos 53
por el efecto hidrofbico 24 NUEVO Aspecto clnico Defectos en la estructura
Los grupos funcionales presentan propiedades del colgeno dan lugar a estados patolgicos 55
qumicas especficas 24
4.3 Estructura terciaria: las protenas hidrosolubles
2.5 El pH es un parmetro importante
se pliegan formando estructuras compactas 55
de los sistemas bioqumicos 26
La mioglobina ilustra los principios de la estructura
Una pequea fraccin del agua se ioniza 26
terciaria 55
Un cido es un donador de protones mientras
La estructura terciaria de muchas protenas se puede
que una base es un aceptor de protones 27
Los cidos tienen distinta tendencia a ionizarse 27 dividir en unidades funcionales y estructurales 57
Los tampones oponen resistencia a los cambios de pH 28 4.4 Estructura cuaternaria: mltiples cadenas
Los tampones son esenciales en los sistemas biolgicos 29 polipeptdicas se pueden ensamblar para formar
NUEVO Preparar tampones es una tarea frecuente en el laboratorio 30 una nica protena 57
xvi
ndice xvii
4.5 La secuencia de aminocidos de una protena 6.3 La energa libre es una funcin termodinmica
determina su estructura tridimensional 58 til para comprender las enzimas 96
Las protenas se pliegan mediante la estabilizacin El incremento de energa libre aporta informacin
progresiva de intermediarios en vez de mediante sobre la espontaneidad pero no sobre la velocidad
bsquedas aleatorias 59 de una reaccin 96
NUEVO Algunas protenas estn intrnsecamente desestructuradas El incremento de energa libre estndar de una reaccin
y pueden existir en mltiples conformaciones 60 est relacionado con la constante de equilibrio 97
Las enzimas alteran la velocidad de la reaccin pero
Aspecto clnico Algunas enfermedades neurolgicas no el equilibrio de la reaccin 98
estn relacionadas con el plegamiento defectuoso y la
6.4 Las enzimas facilitan la formacin del estado
agregacin de protenas 61
de transicin 99
Captulo 5 Tcnicas en bioqumica de protenas 67 El primer paso de la catlisis enzimtica es la formacin
5.1 El proteoma es la representacin funcional de un complejo enzima-sustrato 100
del genoma 68 Los centros activos de las enzimas poseen algunas
5.2 La purificacin de una protena es el primer caractersticas comunes 100
La energa de la unin entre una enzima y su sustrato
paso para comprender su funcin 68 es importante para la catlisis 101
Las protenas se pueden purificar gracias a sus Los anlogos de los estados de transicin son potentes
distintas propiedades qumicas 69 inhibidores de las enzimas 101
Para purificarlas, las protenas tienen que ser extradas
de la clula 69 Captulo 7 Cintica y regulacin 105
Las protenas se pueden purificar en funcin de su 7.1 La cintica es el estudio de las velocidades
solubilidad, de su tamao, de su carga o de de reaccin 106
su afinidad hacia un ligando 70 7.2 El modelo de Michaelis-Menten describe
Las protenas se pueden separar y visualizar mediante la cintica de muchas enzimas 107
electroforesis en gel 72 Aspecto clnico Los cambios en la K M pueden tener
Un protocolo de purificacin se puede evaluar consecuencias fisiolgicas 108
de forma cuantitativa 75 Los valores de KM y Vmx se pueden determinar
5.3 Para purificar y caracterizar protenas de varias formas 109
se utilizan tcnicas inmunolgicas 76 Los valores de KM y Vmx son caractersticas
La centrifugacin es una tcnica que permite importantes de las enzimas 109
separar protenas 76 El cociente Kcat /KM es una medida de la eficiencia
cataltica 110
El ensayo que detecta la presencia del complejo estradiol-
La mayora de las reacciones bioqumicas incluyen
receptor consiste en una centrifugacin en gradiente 77
mltiples sustratos 111
Se pueden generar anticuerpos contra protenas especficas 78
Es posible preparar de forma sencilla anticuerpos
7.3 Las enzimas alostricas son catalizadores
monoclonales con prcticamente cualquier tipo y sensores de informacin 112
Las enzimas alostricas se regulan mediante los productos
de especificidad que deseemos 79
de las rutas que se encuentran bajo su control 112
El receptor de estrgenos se puede purificar
Las enzimas reguladas alostricamente no se ajustan
mediante inmunoprecipitacin 81
a la cintica de Michaelis-Menten 114
Se pueden detectar y cuantificar protenas mediante Las enzimas alostricas dependen de cambios en
un ensayo por inmunoabsorcin ligado a enzimas 82 la estructura cuaternaria 114
La transferencia Western permite detectar protenas que Molculas reguladoras modulan el equilibrio R m T 116
han sido previamente separadas por electroforesis en gel 82 El modelo secuencial tambin puede explicar los efectos
5.4 La determinacin de la estructura primaria facilita alostricos 116
el estudio de la funcin de las protenas 84 Aspecto clnico La prdida de control alostrico
Las secuencias de aminocidos ofrecen informacin puede dar lugar a estados patolgicos 117
de diversa ndole 86 7.4 Las molculas de enzima se pueden estudiar
NUEVO de una en una 117
SECCIN 3 Conceptos bsicos y cintica Captulo 8 Mecanismos e inhibidores 125
de las enzimas 91 8.1 Existen muchas enzimas, pero utilizan unas
Captulo 6 Conceptos bsicos sobre la actividad pocas estrategias bsicas 125
de las enzimas 93 8.2 La actividad enzimtica se puede modular mediante
6.1 Las enzimas son catalizadores potentes la temperatura, el pH y molculas inhibidoras 126
La temperatura incrementa la velocidad de
y muy especficos 93
las reacciones catalizadas por enzimas 126
Las enzimas proteolticas ilustran el intervalo
La mayora de las enzimas tienen un pH ptimo 127
de especifidad enzimtica 94 Las enzimas se pueden inhibir mediante molculas
NUEVO Existen seis clases principales de enzimas 94 especficas 128
6.2 Muchas enzimas necesitan cofactores Los inhibidores reversibles se pueden distinguir
para llevar a cabo su actividad 95 gracias a sus cinticas 129
xviii ndice
Los inhibidores irreversibles se pueden utilizar La celulosa, un componente estructural de las
para trazar el mapa del centro activo 131 plantas, est formada por unidades de glucosa 165
Aspecto clnico La penicilina inactiva de forma 10.3 Los carbohidratos se unen a protenas
irreversible una enzima clave de la sntesis de para formar glicoprotenas 167
la pared celular bacteriana 132 Los carbohidratos se pueden unir a los residuos
8.3 La quimotripsina ilustra los principios bsicos de asparagina, serina o treonina de las protenas 167
de la catlisis y de la inhibicin 134 Aspecto clnico La hormona eritropoyetina
La serina 195 es necesaria para la actividad es una glicoprotena 168
de la quimotripsina 134 Los proteoglicanos, formados por polisacridos y
El mecanismo de la quimotripsina tiene lugar protenas, tienen importantes funciones estructurales 168
en dos etapas conectadas a travs de Aspecto clnico Los proteoglicanos son
un intermediario unido de forma covalente 135 componentes importantes del cartlago 169
El papel cataltico de la histidina 57 se demostr
Las mucinas son glicoprotenas que forman
mediante marcaje por afinidad 136 parte del moco 170
La serina forma parte de una trada cataltica
que incluye a la histidina y al cido asprtico 136 Aspecto biolgico Los grupos sanguneos se basan
en los patrones de glicosilacin de las protenas 171
Captulo 9 La hemoglobina, una protena
Aspecto clnico La falta de glicosilacin puede
alostrica 141
dar lugar a estados patolgicos 172
9.1 La hemoglobina muestra un comportamiento 10.4 Las lectinas son protenas que se unen
cooperativo 142
a carbohidratos de forma especfica 172
9.2 La mioglobina y la hemoglobina se unen Las lectinas promueven la interaccin entre clulas 173
al oxgeno por los grupos hemo 142
Aspecto clnico Las lectinas facilitan el desarrollo
Aspecto clnico La obtencin de imgenes por resonancia embrionario 173
magntica funcional pone de manifiesto las regiones del
Aspecto clnico El virus de la gripe se une
cerebro que procesan la informacin sensorial 144
a residuos de cido silico 173
9.3 La hemoglobina se une al oxgeno de forma
cooperativa 144 Captulo 11 Lpidos 179
9.4 Un regulador alostrico determina la afinidad 11.1 Los cidos grasos son una importante fuente
de la hemoglobina hacia el oxgeno 146 de combustibles 180
Los cidos grasos varan en la longitud de
Aspecto clnico La afinidad de la hemoglobina la cadena y en el grado de saturacin 181
hacia el oxgeno se ajusta para adaptarse a El grado y el tipo de insaturacin son
las necesidades del entorno 146 importantes para la salud 182
Aspecto biolgico Las adaptaciones de la hemoglobina 11.2 Los triacilgliceroles constituyen la forma
permiten el transporte de oxgeno en ambientes extremos 147 de almacenamiento de los cidos grasos 183
Aspecto clnico La anemia falciforme es una enfermedad 11.3 Los lpidos de las membranas son de tres tipos 184
causada por una mutacin en la hemoglobina 147 Los fosfolpidos son los lpidos de membrana
9.5 Los iones hidrgeno y el dixido de carbono ms abundantes 184
promueven la liberacin del oxgeno 149 Los lpidos de membrana pueden incluir carbohidratos 186
Los esteroides son lpidos con funciones diversas 186
SECCIN 4 Carbohidratos y lpidos 155 Aspecto biolgico Las membranas de los
extremfilos estn formadas por lpidos que
Captulo 10 Carbohidratos 157 contienen enlaces ter y cadenas ramificadas 187
10.1 Los monosacridos son los carbohidratos Los lpidos de membrana contienen una regin
ms sencillos 158 hidroflica y una regin hidrofbica 187
Muchos de los azcares ms frecuentes Algunas protenas se modifican por la unin
son molculas cclicas 159 covalente de grupos hidrofbicos 188
Aspecto clnico La formacin de hemiacetales Aspecto clnico El envejecimiento prematuro
cclicos origina un nuevo carbono asimtrico 161 puede ser el resultado de la incorrecta unin de
Los monosacridos se unen a alcoholes y un grupo hidrofbico a una protena 189
aminas mediante enlaces glicosdicos 162
NUEVO Aspecto biolgico Los glucosinolatos protegen SECCIN 5 Membranas celulares,
a las plantas y aaden sabor a nuestra dieta 163 canales, bombas y receptores 193
10.2 Los monosacridos se unen para formar
Captulo 12 Estructura y funcin de
carbohidratos complejos 163
Enzimas especficas son responsables las membranas 195
del ensamblaje de los oligosacridos 163 12.1 Los fosfolpidos y los glicolpidos forman bicapas 196
La sacarosa, la lactosa y la maltosa son Aspecto clnico Se pueden formar vesculas lipdicas
los disacridos ms frecuentes 164 a partir de fosfolpidos 197
El glucgeno y el almidn son formas Las bicapas lipdicas son muy impermeables
de almacenamiento de la glucosa 165 a los iones y a la mayora de las molculas polares 197
ndice xix
12.2 La fluidez de la membrana se controla Algunos receptores contienen dominios de la tirosina
mediante la composicin de cidos grasos quinasa en sus estructuras covalentes 224
y el contenido de colesterol 198 Ras pertenece a otra clase de protenas G sealizadoras 226
12.3 Las protenas desempean la mayora 13.4 El metabolismo en su contexto: la sealizacin
de los procesos que tienen lugar en la membrana 199 de la insulina regula el metabolismo 226
Las protenas se asocian con la bicapa El receptor de la insulina es un dmero que se cierra
lipdica de varias formas 199 en torno a una molcula de insulina unida 227
Aspecto clnico La asociacin de la prostaglandina Una vez activada, la quinasa del receptor de
H2-sintasa I con la membrana explica los efectos la insulina inicia una cascada de quinasas 227
de la aspirina 201 La sealizacin de la insulina finaliza gracias
a la accin de las fosfatasas 228
12.4 Los lpidos y muchas protenas de membrana
13.5 El ion calcio es un mensajero citoplasmtico
difunden lateralmente en el plano de la membrana 201
ubicuo 228
12.5 Una de las principales funciones de las
13.6 Defectos en las rutas de transduccin de seales
protenas es la de actuar como transportadores 202
En muchas clulas, la ATPasa de Na+ K+ es pueden provocar enfermedades 229
un importante sistema de bombeo 203 Aspecto clnico La conversin de proto-oncogenes
Aspecto clnico La digital inhibe la bomba en oncogenes desbarata la regulacin del crecimiento
de Na+ K+ bloqueando su desfosforilacin 204 celular 229
Aspecto clnico La multirresistencia a frmacos pone Aspecto clnico Los inhibidores de las protena
de relieve la importancia de una familia de bombas de quinasas pueden ser eficaces frmacos anticancerosos 230
membrana con dominios de unin al ATP 204
Aspecto clnico La ictiosis arlequn es una dramtica PARTE II
consecuencia de una mutacin en una protena TRANSDUCCIN Y ALMACENAMIENTO
transportadora de tipo ABC 205 DE ENERGA
Los transportadores secundarios utilizan un
gradiente de concentracin para impulsar SECCIN 6 Los inhibidores de las protena
la formacin de otro gradiente 205
Los canales especficos pueden transportar iones
quinasas pueden ser eficaces
rpidamente a travs de las membranas 206 frmacos anticancerosos 235
NUEVO Aspecto biolgico Las serpientes de cascabel Captulo 14 Digestin: convertir una comida en
venenosas utilizan canales inicos para generar compuestos bioqumicos celulares 237
una imagen trmica 206 14.1 La digestin prepara las biomolculas grandes
La estructura del canal de iones potasio desvela para ser utilizadas por el metabolismo 238
los fundamentos de la especificidad inica 207 14.2 Las proteasas digieren las protenas
La estructura del canal de iones potasio explica
a aminocidos y pptidos 238
su elevada velocidad de transporte 208
14.3 Los carbohidratos de la dieta se digieren
Captulo 13 Rutas de transduccin de seales 215 por la alfa-amilasa 240
13.1 La transduccin de seales depende de circuitos 14.4 La digestin de los lpidos se complica por
moleculares 216 su hidrofobicidad 241
13.2 Protenas receptoras transmiten informacin Aspecto biolgico Los venenos de serpiente
al interior de la clula 217 digieren desde fuera hacia dentro 242
Los receptores con siete hlices transmembrana
cambian de conformacin en respuesta a la unin
14.5 El metabolismo en su contexto: la sealizacin
NUEVO celular facilita la homeostasis calrica 243
de ligandos y activan las protenas G 217
La unin de ligandos a los receptores 7TM da lugar El cerebro juega un papel fundamental en
a la activacin de protenas G 218 la homeostasis calrica 243
Las protenas G activadas transmiten seales Las seales del tracto gastrointestinal inducen
unindose a otras protenas 219 la sensacin de saciedad y facilitan la digestin 244
El AMP cclico estimula la fosforilacin de muchas La leptina y la insulina regulan el control a largo
protenas diana mediante la activacin de plazo de la homeostasis calrica 244
la protena quinasa A 219 Captulo 15 Metabolismo: conceptos bsicos
Las protenas G se reinician a s mismas de forma y diseo 247
espontnea mediante la hidrlisis de GTP 220 15.1 El metabolismo se compone de multitud
Aspecto clnico El clera y la tosferina se deben de reacciones interconectadas 248
a una alteracin de la actividad de las protenas G 221 El metabolismo consta de reacciones que producen
La hidrlisis del fosfatidilinositol bisfosfato por parte de energa y de reacciones que requieren energa 249
la fosfolipasa C genera dos mensajeros secundarios 222 Una reaccin favorable desde el punto de vista
13.3 Algunos receptores dimerizan en respuesta a la termodinmico puede impulsar una reaccin
unin de ligandos y reclutan a las tirosina quinasas 223 desfavorable 249
La dimerizacin de receptores puede dar lugar 15.2 El ATP es la moneda universal de la energa libre 250
al reclutamiento de la tirosina quinasa 223 La hidrlisis del ATP es exergnica 250
xx ndice
La hidrlisis del ATP impulsa el metabolismo Aspecto clnico La galactosa es muy txica
desplazando el equilibrio de las reacciones si falta la transferasa 286
acopladas 251
16.4 La ruta glucoltica est sometida a un control
El elevado potencial de transferencia de fosforilos
del ATP da lugar a diferencias estructurales muy riguroso 287
entre el ATP y los productos de su hidrlisis 252 En el msculo, la gluclisis se regula mediante
El potencial de transferencia de fosforilos es una retroinhibicin para satisfacer las necesidades
importante forma de transformacin de energa de ATP 287
celular 253 En el hgado, su versatilidad bioqumica
se encarga de regular la gluclisis 288
Aspecto clnico El ejercicio recurre a varios Una familia de transportadores permite
mtodos para generar ATP 254
a la glucosa entrar y salir de las clulas animales 291
15.3 La oxidacin de combustibles carbonados
Aspecto clnico El cncer y el ejercicio afectan
es una importante fuente de energa celular 255
a la gluclisis de forma similar 292
La oxidacin del carbono va acompaada de
una reduccin 255 16.5 El metabolismo en su contexto: la gluclisis
Los compuestos con un elevado potencial de ayuda a las clulas beta del pncreas
transferencia de fosforilos pueden acoplar a detectar la glucosa 293
la oxidacin del carbono a la sntesis de ATP 256
15.4 Las rutas metablicas presentan multitud Captulo 17 Gluconeognesis 299
de aspectos recurrentes 257 17.1 Se puede sintetizar glucosa a partir
Los transportadores activados son un ejemplo del de precursores distintos de los carbohidratos 300
diseo modular y de la economa del metabolismo 257 La gluconeognesis no es exactamente
Aspecto clnico La falta de pantotenato activado la inversa de la gluclisis 300
da lugar a problemas neurolgicos 260 La conversin de piruvato en fosfoenolpiruvato
comienza con la formacin de oxalacetato 302
Muchos transportadores activados se generan
El oxalacetato es enviado al citoplasma y se
a partir de vitaminas 261
convierte en fosfoenolpiruvato 304
15.5 Los procesos metablicos se regulan, La conversin de fructosa 1,6-bisfosfato en fructosa
principalmente, de tres maneras 263 6-fosfato y ortofosfato es una reaccin irreversible 304
Se controla la cantidad de enzima 263 La generacin de glucosa libre es un punto
Se regula la actividad cataltica 264 de control importante 305
Se controla la accesibilidad de los sustratos 264 Para sintetizar glucosa a partir de piruvato se
consumen seis grupos fosforilo con un elevado
SECCIN 7 Gluclisis y potencial de transferencia 305
Gluconeognesis 269 17.2 La gluconeognesis y la gluclisis se regulan
de forma recproca 306
Captulo 16 Gluclisis 271 La carga energtica determina qu ruta es
16.1 La gluclisis es una ruta de conversin ms activa, la gluclisis o la gluconeognesis 306
de la energa 272 En el hgado, el equilibrio entre la gluclisis y la
La hexoquinasa atrapa la glucosa en la clula gluconeognesis es sensible a la concentracin
e inicia la gluclisis 272 de glucosa en la sangre 307
La fructosa 1,6-bisfosfato se genera a partir
Aspecto clnico En la diabetes de tipo 2,
de la glucosa 6-fosfato 274
la insulina no consigue inhibir la gluconeognesis 309
El azcar de seis tomos de carbono se rompe
en dos fragmentos de tres tomos de carbono 275 Los ciclos del sustrato amplifican las seales
La oxidacin de un aldehdo impulsa la formacin metablicas 309
de un compuesto con un elevado potencial de 17.3 El metabolismo en su contexto: los precursores
transferencia de fosforilos 276 formados por el msculo son utilizados por otros
Se forma ATP mediante la transferencia rganos 310
de fosforilos a partir del 1,3-bisfosfoglicerato 277
Se genera otro ATP durante la formacin del piruvato 278
Durante la conversin de glucosa en piruvato SECCIN 8 El ciclo del cido
se forman dos molculas de ATP 279 ctrico 315
16.2 El metabolismo del piruvato regenera el NAD+ 279
Las fermentaciones son una forma de oxidar el NADH 279 Captulo 18 Preparacin del ciclo 317
En ausencia de oxgeno, las fermentaciones 18.1 La piruvato deshidrogenasa forma
proporcionan energa til 282
acetil-coenzima A a partir de piruvato 318
16.3 La fructosa y la galactosa se convierten La sntesis de acetil-coenzima A a partir de piruvato
en intermediarios de la gluclisis 283 requiere tres enzimas y cinco coenzimas 319
Aspecto clnico Muchos adultos sufren intolerancia Conectores flexibles permiten que la lipoamida
a la leche por una insuficiencia de lactasa 285 se mueva entre centros activos distintos 321
ndice xxi
18.2 El complejo piruvato deshidrogenasa se El flujo de electrones a travs de la cadena transportadora
regula por medio de dos mecanismos 323 de electrones crea un gradiente de protones 353
Aspecto clnico Una regulacin defectuosa La cadena transportadora de electrones es un conjunto
de la piruvato deshidrogenasa da lugar a de reacciones de oxidacinreduccin acopladas 354
la acidosis lctica 324 20.3 La cadena respiratoria consta de bombas
NUEVO Aspecto clnico La intensificacin de de protones y una conexin fsica con el ciclo
la actividad de la piruvato deshidrogenasa del cido ctrico 357
quinasa facilita el desarrollo del cncer 325 NUEVO Los electrones de alto potencial del NADH se
Aspecto clnico La interrupcin del metabolismo incorporan a la cadena respiratoria a travs
del piruvato es la causa del beriberi 325 de la NADH-Q oxidorreductasa 357
El ubiquinol es el punto de entrada de los electrones
Captulo 19 Extraccin de electrones
procedentes del FADH2 de las flavoprotenas 358
mediante el ciclo 329 Los electrones fluyen desde el ubiquinol al citocromo c
19.1 El ciclo del cido ctrico consta de dos etapas 330 a travs de la Q-citocromo c oxidorreductasa 359
19.2 La primera etapa oxida dos tomos de carbono El ciclo Q canaliza los electrones desde un
para conseguir electrones de alta energa 330 transportador de dos electrones hacia un
La citrato sintasa forma citrato a partir de transportador de un electrn y bombea protones 359
oxalacetato y acetil-coenzima A 330 La citocromo c oxidasa cataliza la reduccin
El mecanismo de la citrato sintasa evita reacciones del oxgeno molecular a agua 360
no deseadas 331 Aspecto biolgico La zona muerta: demasiada
El citrato se isomeriza a isocitrato 332 respiracin 362
El isocitrato se oxida y se descarboxila a
Los derivados txicos del oxgeno molecular
alfa-cetoglutarato 332
como el radical superxido se neutralizan
La descarboxilacin oxidativa del alfa-cetoglutarato
por medio de enzimas protectoras 363
forma succinil-coenzima A 333
19.3 La segunda etapa regenera el oxalacetato Captulo 21 La fuerza protn-motriz 367
y recoge los electrones de alta energa 333 21.1 Un gradiente de protones impulsa la sntesis
A partir de la succinil-coenzima A se genera de ATP 368
un compuesto con un elevado potencial de La ATP sintasa est formada por una unidad
transferencia de fosforilos 333 que canaliza los protones
La succinil-coenzima A sintetasa transforma y por una unidad cataltica 369
un tipo de energa bioqumica en otro 334
El flujo de protones a travs de la ATP sintasa
La oxidacin del succinato regenera el oxalacetato 335
da lugar a la liberacin del ATP fuertemente unido 370
El ciclo del cido ctrico produce electrones con un
La catlisis rotativa es el motor molecular
elevado potencial de transferencia, un nuclesido
trifosfato y dixido de carbono 335 ms pequeo del mundo 371
El flujo de protones en torno al anillo c impulsa
19.4 El ciclo del cido ctrico est regulado 338
la sntesis de ATP 371
El ciclo del cido ctrico se controla en varios puntos 338
El ciclo del cido ctrico es una fuente de precursores 21.2 Las lanzaderas permiten el movimiento
biosintticos 339 a travs de las membranas mitocondriales 373
El ciclo del cido ctrico tiene que ser capaz Los electrones del NADH citoplasmtico
de reponerse rpidamente 339 entran en las mitocondrias gracias a lanzaderas 374
NUEVO Aspecto clnico Defectos en el ciclo La entrada del ADP a las mitocondrias est
del cido ctrico contribuyen al desarrollo del cncer 340 acoplada a la salida del ATP 375
Los transportadores mitocondriales permiten
19.5 El ciclo del glioxilato permite a plantas y
el intercambio de metabolitos entre el citoplasma
bacterias convertir las grasas en carbohidratos 340
y las mitocondrias 376
SECCIN 9 Fosforilacin oxidativa 347 21.3 La respiracin celular est regulada
por la necesidad de ATP 376
Captulo 20 La cadena transportadora de La oxidacin completa de la glucosa produce
electrones 349 aproximadamente 30 molculas de ATP 376
20.1 En eucariotas, la fosforilacin oxidativa La velocidad de la fosforilacin oxidativa
tiene lugar en las mitocondrias 350 est determinada por la necesidad de ATP 378
Las mitocondrias estn rodeadas por una doble NUEVO Aspecto biolgico El desacoplamiento
membrana 350 regulado da lugar a la generacin de calor 379
Aspecto biolgico Las mitocondrias son Aspecto clnico La fosforilacin oxidativa se puede inhibir
el resultado de un proceso endosimbitico 351 en muchos puntos 380
20.2 La fosforilacin oxidativa depende Se est descubriendo un nmero cada vez mayor
de la transferencia de electrones 352 de enfermedades mitocondriales 381
El potencial redox es una medida del potencial La transmisin de energa por medio de gradientes de
de transferencia electrnica de un electrn 352 protones es un concepto clave de la bioenergtica 382
xxii ndice
SECCIN 10 Las reacciones luminosas 23.2 El ciclo de Calvin se regula por el entorno 414
de la fotosntesis La tiorredoxina desempea un papel clave
y el ciclo de Calvin 387 en la regulacin del ciclo de Calvin 414
La rubisco tambin cataliza una reaccin oxigenasa
Captulo 22 Las reacciones luminosas 389 improductiva 415
22.1 La fotosntesis tiene lugar en los cloroplastos 390 En las plantas tropicales, la ruta C4 acelera
Aspecto biolgico Los cloroplastos, al igual la fotosntesis concentrando el dixido de carbono 416
que las mitocondrias, surgieron a partir de El metabolismo cido de las crasulceas permite
un proceso endosimbitico 391 el crecimiento en ecosistemas ridos 418
22.2 La fotosntesis transforma la energa de
la luz en energa qumica 391
En la mayora de los sistemas fotosintticos, SECCIN 11 Metabolismo del glucgeno
la clorofila es el principal aceptor de luz 392 y ruta de las pentosas
Los complejos captadores de luz intensifican fosfato 421
la eficiencia de la fotosntesis 393
Aspecto biolgico En las patatas, la clorofila Captulo 24 Degradacin del glucgeno 423
sugiere la presencia de una toxina 395 24.1 La descomposicin del glucgeno requiere
22.3 Dos fotosistemas generan un gradiente varias enzimas 424
de protones y NADPH 395 La fosforilasa escinde el glucgeno liberando
El fotosistema I utiliza la energa de la luz para glucosa 1-fosfato 424
generar ferredoxina reducida, un potente reductor 396 Para descomponer el glucgeno tambin se
El fotosistema II transfiere electrones al fotosistema I necesita una enzima desramificante 425
y genera un gradiente de protones 397 La fosfoglucomutasa convierte la glucosa
El citocromo bf conecta el fotosistema II al fotosis 398 1-fosfato en glucosa 6-fosfato 426
La oxidacin del agua restablece el equilibrio El hgado contiene glucosa 6-fosfatasa, una enzima
de oxidacin-reduccin y aporta protones hidroltica que no se encuentra en el msculo 426
al gradiente de protones 398
22.4 Un gradiente de protones impulsa 24.2 La fosforilasa se regula mediante interacciones
la sntesis de ATP 400 alostricas y fosforilacin reversible 427
La ATP sintasa de los cloroplastos se parece mucho La fosforilasa del msculo se regula por la carga
a la de las mitocondrias 400 energtica intracelular 428
El flujo cclico de los electrones a travs del La fosforilasa del hgado produce glucosa para
fotosistema I da lugar a la produccin que sea utilizada por otros tejidos 428
de ATP en lugar de NADPH 401 La fosforilasa quinasa se activa mediante fosforilacin
La absorcin de ocho fotones da lugar a y mediante iones calcio 429
la formacin de una molcula de O2 , Aspecto clnico La enfermedad de Hers se
dos de NADPH y tres de ATP 402 debe a una insuficiencia de fosforilasa 430
Los componentes de la fotosntesis se disponen 24.3 La adrenalina y el glucagn son una seal
de forma muy ordenadad 402
de que hay que descomponer glucgeno 430
Aspecto biolgico Muchos herbicidas inhiben Las protenas G transmiten la seal para que se inicie
las reacciones luminosas de la fotosntesis 403 la descomposicin del glucgeno 430
La descomposicin del glucgeno se tiene que
Captulo 23 El ciclo de Calvin 407 desactivar rpidamente cuando sea necesario 432
23.1 El ciclo de Calvin sintetiza hexosas NUEVO Aspecto biolgico El agotamiento de
a partir de dixido de carbono y agua 407 la reserva de glucgeno coincide con la sensacin
El dixido de carbono reacciona con la ribulosa de cansancio 432
1,5-bisfosfato
para formar dos molculas de 3-fosfoglicerato 408 Captulo 25 Sntesis de glucgeno 437
Las hexosas fosfato se sintetizan a partir de
25.1 El glucgeno se sintetiza y se degrada
fosfoglicerato y se regenera la ribulosa 1,5-bisfosfato 409
Para elevar el dixido de carbono al nivel de una mediante rutas distintas 437
hexosa se utilizan tres molculas de ATP y La UDP-glucosa es una forma activada de la glucosa 438
dos molculas de NADPH 412 La glucgeno sintasa cataliza la transferencia
Aspecto biolgico Una erupcin volcnica de glucosa desde la UDP-glucosa a una
puede afectar a la fotosntesis en todo el mundo 412 cadena creciente de glucgeno 438
En las plantas, el almidn y la sacarosa son Una enzima ramificante forma enlaces alfa-1,6 439
las principales La glucgeno sintasa es la enzima reguladora clave
reservas de carbohidratos 412 de la sntesis de glucgeno 440
Aspecto biolgico Por qu se pone duro El glucgeno es una eficaz forma de almacenar
el pan: el papel del almidn 413 glucosa 440
ndice xxiii
25.2 El metabolismo en su contexto: 27.3 Los cuerpos cetnicos son otra fuente
la descomposicin y la sntesis del glucgeno de combustible procedente de las grasas 473
se regulan de forma recproca 441 La sntesis de cuerpos cetnicos tiene lugar
La protena fosfatasa 1 revierte los efectos en el hgado 473
reguladores que ejercen Los animales no pueden convertir los cidos
las quinasas sobre el metabolismo del glucgeno 441 grasos en glucosa 474
La insulina estimula la sntesis de glucgeno 27.4 El metabolismo en su contexto: el metabolismo
desactivando la glucgeno sintasa quinasa 443 de los cidos grasos es una fuente de
Aspecto clnico En el hgado, el metabolismo conocimiento sobre diversos estados fisiolgicos 475
del glucgeno regula el nivel de glucosa en la sangre 443 La diabetes puede dar lugar a la produccin excesiva de
Aspecto clnico Las enfermedades relacionadas cuerpos cetnicos, algo que puede provocar la muerte 475
con el almacenamiento del glucgeno En condiciones de ayuno prolongado, los cuerpos
se pueden entender en trminos bioqumicos 445 cetnicos son una fuente de combustible
fundamental 476
Captulo 26 La ruta de las pentosas fosfato 451
Captulo 28 Sntesis de cidos grasos 481
26.1 La ruta de las pentosas fosfato genera NADPH
y azcares de cinco tomos de carbono 451 28.1 La sntesis de cidos grasos tiene lugar en
Durante la conversin de glucosa 6-fosfato en ribulosa tres etapas 482
5-fosfato se generan dos molculas de NADPH 452 El citrato transporta grupos acetilo desde
La ruta de las pentosas fosfato y la gluclisis estn las mitocondrias al citoplasma 482
conectadas mediante la transcetolasa y la El NADPH que se necesita para la sntesis
de cidos grasos procede de varias fuentes 483
transaldolasa 452
La formacin de malonil-CoA es el paso comprometido
26.2 El metabolismo en su contexto: la gluclisis para la sntesis de cidos grasos 483
y la ruta de las pentosas fosfato se controlan La sntesis de cidos grasos consta de una serie de
de forma coordinada 451 reacciones de condensacin, reduccin,
La velocidad de la ruta de las pentosas fosfato deshidratacin y reduccin 484
se controla mediante el nivel de NADP 456 La sntesis de palmitato necesita 8 molculas
El destino de la glucosa 6-fosfato depende de las de acetil-CoA, 14 molculas de NADPH y
necesidades de NADPH, ribosa 5-fosfato y ATP 456 7 molculas de ATP 486
NUEVO En los animales, los cidos grasos se sintetizan
26.3 La glucosa 6-fosfato deshidrogenasa disminuye
mediante un complejo enzimtico multifuncional 486
el estrs oxidativo 451 Aspecto clnico Los inhibidores de la cido
Aspecto clnico La insuficiencia de glucosa graso sintasa pueden ser frmacos tiles 487
6-fosfato deshidrogenasa provoca una anemia Aspecto clnico Un pequeo cido graso
hemoltica causada por medicamentos 459 que provoca grandes problemas 487
Aspecto biolgico En determinadas circunstancias,
28.2 Enzimas complementarias alargan e introducen
una insuficiencia de glucosa 6-fosfato
insaturaciones en los cidos grasos 488
deshidrogenasa confiere una ventaja evolutiva 460
Enzimas unidas a membrana generan cidos grasos
insaturados 488
SECCIN 12 Metabolismo de los cidos Las hormonas eicosanoides se sintetizan a partir
grasos y de los lpidos 463 de los cidos grasos poliinsaturados 488
Aspecto clnico La aspirina ejerce sus efectos modificando
Captulo 27 Degradacin de los cidos grasos 465
covalentemente una enzima clave 489
27.1 Los cidos grasos se metabolizan en tres etapas 465 28.3 La acetil-CoA carboxilasa es un regulador
NUEVO Los triacilgliceroles se hidrolizan por medio
clave del metabolismo de los cidos grasos 489
de lipasas estimuladas por hormonas 466
La acetil-CoA carboxilasa se regula mediante
Antes de su oxidacin, los cidos grasos se unen
las condiciones celulares 489
a la coenzima A 467 La acetil-CoA carboxilasa se regula mediante
Aspecto clnico Si los cidos grasos no entran diversas hormonas 490
en las mitocondrias surgen estados patolgicos 468
La oxidacin de los cidos grasos genera
28.4 El metabolismo en su contexto: en el hgado,
acetil-CoA, NADH y FADH2 469 el etanol altera el metabolismo energtico 491
La oxidacin completa de palmitato genera Captulo 29 Sntesis de lpidos:
106 molculas de ATP 470 almacenamiento de lpidos,
27.2 La degradacin de cidos grasos insaturados de fosfolpidos y de colesterol 497
y de cidos grasos de cadena impar requiere 29.1 El fosfatidato es un precursor de los lpidos
pasos adicionales 471 de reserva y de muchos lpidos de membrana 497
Para la oxidacin de cidos grasos insaturados El triacilglicerol se sintetiza a partir del fosfatidato
se necesitan una isomerasa y una reductasa 471 en dos pasos 498
Los cidos grasos de cadena impar generan La sntesis de fosfolpidos necesita precursores
propionil-CoA en el ltimo paso, la tiolisis 473 activados 498
xxiv ndice
Los esfingolpidos se sintetizan a partir de ceramida 500 NUEVO Aspecto biolgico La hibernacin plantea
Aspecto clnico Los ganglisidos sirven problemas a la hora de eliminar el nitrgeno 529
como lugar de unin para los patgenos 501 Aspecto biolgico La urea no es la nica
Aspecto clnico La interrupcin del metabolismo forma de deshacerse del exceso de nitrgeno 530
lipdico da lugar al sndrome de distrs respiratorio 30.3 Los tomos de carbono de los aminocidos
y a la enfermedad de Tay-Sachs 501 degradados aparecen en los principales
NUEVO En el metabolismo de los lpidos, la cido fosfatdico
intermediarios metablicos 530
fosfatasa es una enzima reguladora clave 502
El piruvato es un punto de entrada al metabolismo 531
29.2 El colesterol se sintetiza a partir El oxalacetato es otro punto de entrada
de acetil-coenzima A en tres etapas 503 al metabolismo 532
La sntesis de colesterol comienza con El alfa-cetoglutarato tambin es otro punto
la sntesis de mevalonato 503 de entrada al metabolismo 532
El escualeno (C30) se sintetiza a partir de La succinil coenzima A es un punto de entrada
seis molculas de isopentenilpirofosfato (C5) 504 para varios aminocidos no polares 533
Para formar colesterol, el escualeno adopta Los aminocidos de cadena ramificada generan
estructuras cclicas 505 acetil-coenzima A, acetoacetato
29.3 La regulacin de la sntesis de colesterol o succinil-coenzima A 533
tiene lugar a varios niveles 506 Para degradar los aminocidos aromticos
se necesitan oxigenasas 534
29.4 Las lipoprotenas transportan colesterol La metionina se degrada a succinil-coenzima A 536
y triacilgliceroles por todo el organismo 508 Aspecto clnico Errores congnitos
Las lipoprotenas de baja densidad desempean del metabolismo pueden alterar la degradacin
un papel decisivo en el metabolismo del colesterol 509 de aminocidos 536
Aspecto clnico La ausencia del receptor de LDL
da lugar a la hipercolesterolemia y a la ateroesclerosis 510 Captulo 31 Sntesis de aminocidos 541
Aspecto clnico Las HDL parecen proteger 31.1 El complejo nitrogenasa fija el nitrgeno 542
contra la ateroesclerosis 512 El cofactor hierro-molibdeno de la nitrogenasa
29.5 El colesterol es el precursor de las hormonas se une al nitrgeno atmosfrico y lo reduce 543
esteroideas 512 El ion amonio se incorpora a los aminocidos
Las sales biliares facilitan la absorcin de lpidos 512 a travs del glutamato y la glutamina 543
Las hormonas esteroideas son molculas seal 31.2 Los aminocidos se sintetizan a partir de
fundamentales 512 intermediarios de las principales rutas 544
La vitamina D se sintetiza a partir del colesterol Los seres humanos pueden sintetizar algunos
gracias a la energa de la luz solar 513 aminocidos pero tienen que conseguir otros
Aspecto clnico La vitamina D es necesaria a partir de la dieta 545
para el desarrollo de los huesos 513 Algunos aminocidos se pueden sintetizar mediante
Aspecto clnico Los andrgenos se pueden utilizar para sencillas reacciones de transaminacin 545
mejorar de manera artificial el rendimiento de los atletas 514 Serina, cistena y glicina se sintetizan a partir
Los tomos de oxgeno se incorporan a los esteroides del 3-fosfoglicerato 546
por medio de citocromo P450 monooxigenasas 515 El tetrahidrofolato transporta unidades
El metabolismo en su contexto: el etanol tambin monocarbonadas activadas 546
se procesa mediante el sistema citocromo P450 515 La S-adenosilmetionina es el principal donador
de grupos metilo 547
Aspecto clnico Los niveles elevados de
SECCIN 13 El metabolismo de homocistena estn correlacionados
las molculas que con la enfermedad vascular 548
contienen nitrgeno 521 31.3 La retroinhibicin regula la biosntesis
de aminocidos 549
Captulo 30 Degradacin de aminocidos
El punto de regulacin suele ser el paso comprometido 549
y ciclo de la urea 523 Las rutas ramificadas necesitan una sofisticada
30.1 La eliminacin del nitrgeno es el primer paso regulacin 549
de la degradacin de aminocidos 524
Mediante la desaminacin oxidativa del glutamato, los Captulo 32 Metabolismo de nucletidos 555
grupos alfa-amino se convierten en iones amonio 524 32.1 Panormica general de la biosntesis
Los tejidos perifricos transportan nitrgeno al hgado 525 de nucletidos y su nomenclatura 556
30.2 En la mayora de los vertebrados terrestres, 32.2 Una vez ensamblado el anillo de pirimidina,
los iones amonio se convierten en urea 526 se une al azcar ribosa 557
El ciclo de la urea est conectado con El CTP se forma mediante la aminacin del UTP 558
la gluconeognesis 528 Las quinasas convierten los nuclesidos
Aspecto clnico El metabolismo en su contexto: monofosfato en nuclesidos trifosfato 559
la hiperamonemia se debe a defectos congnitos NUEVO Las bases pirimidnicas se reciclan mediante
del ciclo de la urea 529 rutas de recuperacin 559
ndice xxv
32.3 El anillo de purina se ensambla sobre 33.3 Las dobles hlices del DNA pueden adoptar
la ribosa fosfato 560 mltiples formas 585
El AMP y el GMP se forman a partir del IMP 560 El DNA-Z es una doble hlice levgira en la que los
NUEVO In vivo, las enzimas de la ruta para la sntesis grupos fosforilo del esqueleto se disponen en zigzag 586
de purinas se asocian entre s 560 Los surcos mayor y menor estn revestidos
Las bases se pueden reciclar mediante rutas por grupos que forman puentes de hidrgeno
de recuperacin 562 especficos para cada secuencia 587
El DNA de doble hebra se puede enrollar sobre
32.4 Los ribonucletidos se reducen a s mismo generando estructuras superenrolladas 587
desoxirribonucletidos 563
33.4 El DNA eucaritico est asociado
El timidilato se forma mediante la metilacin
del desoxiuridilato 563
a protenas especficas 589
Los nucleosomas son complejos formados
Aspecto clnico Algunos frmacos anticancerosos por DNA e histonas 589
muy eficaces bloquean la sntesis de timidilato 564 El DNA eucaritico se enrolla alrededor
32.5 La biosntesis de nucletidos se regula de las histonas formando nucleosomas 590
mediante retroinhibicin 565 Aspecto clnico Los daos en el DNA pueden
La biosntesis de pirimidinas se regula mediante inhibir el crecimiento de las clulas cancerosas 592
la aspartato transcarbamilasa 565 33.5 El RNA puede adoptar estructuras complejas 592
La sntesis de nucletidos de purina se controla
en varios puntos mediante retroinhibicin 566
Captulo 34 Replicacin del DNA 597
La sntesis de desoxirribonucletidos se controla mediante 34.1 Las polimerasas replican el DNA 598
la regulacin de la ribonucletido reductasa 566 La DNA polimerasa cataliza la formacin de enlaces
fosfodister 598
32.6 Alteraciones en el metabolismo de los nucletidos NUEVO La especificidad de la replicacin est determinada
pueden dar lugar a estados patolgicos 567 por la complementariedad de las bases 600
Aspecto clnico La prdida de la actividad NUEVO La separacin de las hebras del DNA requiere
adenosina desaminasa provoca la inmunodeficiencia helicasas especficas y la hidrlisis del ATP 600
combinada grave 568 Las topoisomerasas preparan el DNA para su
Aspecto clnico Niveles elevados de urato desenrollamiento 602
en el suero inducen la gota 568 Aspecto clnico La topoisomerasa bacteriana
Aspecto clnico El sndrome de Lesch-Nyhan es una diana teraputica 602
es una dramtica consecuencia de las mutaciones Muchas polimerasas comprueban las bases
en una enzima de las rutas de recuperacin 569 recin aadidas y escinden los errores 603
NUEVO Aspecto clnico La insuficiencia de cido flico 34.2 La replicacin del DNA est muy coordinada 604
provoca defectos al nacer, como la espina bfida 569 En Escherichia coli, la replicacin del DNA
comienza en un nico lugar 604
PARTE III La primasa sintetiza un RNA cebador que permite
SNTESIS DE LAS MOLCULAS DE LA VIDA dar comienzo a la sntesis de DNA 604
Una hebra del DNA se sintetiza de forma continua
SECCIN 14 Estructura de los cidos y la otra hebra se sintetiza de forma fragmentada 605
nucleicos y replicacin La replicacin del DNA requiere polimerasas
del DNA 575 con elevada procesividad 605
La hebra conductora y la hebra retardada
Captulo 33 Estructura de las macromolculas se sintetizan de forma coordinada 606
que contienen informacin: DNA y RNA 577 La sntesis de DNA es ms compleja en
33.1 Un cido nucleico est formado por bases eucariotas que en bacterias 608
unidas a un esqueleto azcar-fosfato 578 Los telmeros son estructuras singulares localizadas
El DNA y el RNA se diferencian en el azcar en los extremos de los cromosomas lineales 608
que contienen y en una de las bases 578 Aspecto clnico Los telmeros se replican
Los nucletidos son las unidades monomricas mediante la telomerasa, una polimerasa
de las cidos nucleicos 579 especializada que tiene su propio molde de RNA 609
Las molculas de DNA son muy largas y tienen Captulo 35 Reparacin y recombinacin
direccionalidad 580 del DNA 613
33.2 Las hebras de los cidos nucleicos pueden 35.1 La replicacin del DNA puede generar errores 614
formar una estructura de doble hlice 581 Aspecto clnico Algunas enfermedades
La doble hlice se estabiliza mediante puentes genticas se deben a la extensin de
de hidrgeno y el efecto hidrofbico 581 repeticiones de tres nucletidos 614
La doble hlice facilita la transmisin precisa Las bases se pueden daar por agentes oxidantes,
de la informacin hereditaria 583 por agentes alquilantes y por la luz 615
Meselson y Stahl demostraron que la replicacin 35.2 Los daos en el DNA se pueden detectar
es semiconservativa 583 y reparar 617
Las hebras de la doble hlice se pueden separar En el DNA, la presencia de timina en lugar de uracilo
de manera reversible 585 permite reparar las citosinas desaminadas 619
xxvi ndice
Aspecto clnico Muchos tipos de cncer Las secuencias intensificadoras pueden estimular
se deben a una reparacin defectuosa del DNA 619 la transcripcin en lugares de inicio situados
Aspecto clnico Muchos posibles carcingenos a miles de bases de distancia 649
se pueden detectar gracias a sus efectos Aspecto clnico Un uso inapropiado de
mutagnicos en bacterias 620 los intensificadores puede provocar cncer 650
35.3 La recombinacin del DNA desempea Multitud de factores de transcripcin interaccionan
NUEVO importantes funciones tanto en la replicacin con los promotores e intensificadores eucariticos 650
como en la reparacin 621 NUEVO Aspecto clnico Se pueden generar clulas
Los cortes en ambas hebras se pueden reparar madre pluripotentes inducidas introduciendo cuatro
mediante recombinacin 621 factores de transcripcin en clulas diferenciadas 650
La recombinacin es importante para diversos 37.3 La expresin gnica se regula mediante
procesos biolgicos 622 hormonas 651
Los receptores hormonales nucleares poseen
SECCIN 15 Sntesis, maduracin y una estructura de dominios similar 651
regulacin del RNA 627 Los receptores hormonales nucleares reclutan
Captulo 36 Sntesis y regulacin del RNA coactivadores y correpresores 653
en bacterias 629 Aspecto clnico Los receptores de hormonas
esteroideas son la diana de algunos medicamentos 653
36.1 El RNA celular se sintetiza mediante RNA
37.4 La acetilacin de histonas da lugar
polimerasas 629
Los genes representan las unidades transcripcionales 630 a la remodelacin de la cromatina 654
NUEVO La RNA polimerasa est formada por mltiples El metabolismo en su contexto: la acetil-CoA
subunidades 631 desempea un papel fundamental en la regulacin
de la transcripcin 654
36.2 La sntesis del RNA consta de tres etapas 631 Las desacetilasas de histonas contribuyen
La transcripcin se inicia en los lugares promotores
a la represin de la transcripcin 656
del DNA molde 631
Las subunidades sigma de la RNA polimerasa Captulo 38 Maduracin del RNA en eucariotas 661
reconocen los lugares promotores 632 38.1 El RNA ribosmico maduro se genera mediante
Las hebras de RNA crecen en sentido 5S 3 633 la escisin de una molcula precursora 662
La elongacin tiene lugar en las burbujas de 38.2 El RNA de transferencia se procesa de
transcripcin que se desplazan a lo largo
forma intensiva 662
del DNA molde 634
Una horquilla de RNA seguida de varios residuos 38.3 El RNA mensajero se modifica y experimenta
de uracilo pone fin a la transcripcin de una serie de cortes y empalmes 663
algunos genes 634 En los precursores del mRNA, unas secuencias
La protena rho ayuda a terminar la transcripcin localizadas al final de los intrones especifican
de algunos genes 635 los lugares de corte 664
Despus de la transcripcin, los precursores del RNA de En los espliceosomas, los RNA pequeos nucleares
transferencia y del RNA ribosmico se escinden y se catalizan la maduracin de los precursores del mRNA 665
modifican qumicamente 636 Aspecto clnico Las mutaciones que afectan a la
Aspecto clnico Algunos antibiticos inhiben la maduracin del pre-mRNA provocan enfermedades 666
transcripcin 637 Aspecto clnico La mayora de los pre-mRNA humanos
36.3 El opern lac ilustra el control de la expresin pueden madurar de formas alternativas para producir
gnica en bacterias 638 protenas diferentes 667
Un opern est formado por elementos reguladores La transcripcin y la maduracin del mRNA
y por genes que codifican protenas 638 estn acopladas 667
La unin a ligandos puede inducir cambios NUEVO Las correcciones en el RNA cambian las protenas
estructurales en las protenas reguladoras 639 codificadas por el mRNA 668
Se puede estimular la transcripcin mediante protenas 38.4 El RNA puede funcionar como un catalizador 669
que entran en contacto con la RNA polimerasa 639
NUEVO Aspecto biolgico Muchas clulas SECCIN 16 Sntesis de protenas
bacterianas liberan seales qumicas que regulan la y tecnologa del DNA
expresin gnica en otras clulas 640 recombinante 675
NUEVO Algunos RNA mensajeros detectan directamente
las concentraciones de algunos metabolitos 640 Captulo 39 El cdigo gentico 675
39.1 El cdigo gentico conecta la informacin de
Captulo 37 Expresin gnica en eucariotas 645
los cidos nucleicos con la de las protenas 676
37.1 Las clulas eucariticas poseen tres tipos El cdigo gentico es, prcticamente, universal 676
de RNA polimerasas 646 Las molculas de RNA de transferencia tienen
37.2 La RNA polimerasa II necesita una regulacin un diseo comn 677
compleja 648 Algunas molculas de RNA de transferencia
El complejo proteico TFIID inicia el ensamblaje reconocen ms de un codn debido al balanceo
del complejo de transcripcin activo 649 de las bases emparejadas 679
ndice xxvii
La sntesis de protenas grandes requiere La sntesis de protenas comienza en ribosomas que se
que la frecuencia de los errores sea baja 680 encuentran libres en el citoplasma 701
39.2 Los aminocidos se activan unindose Las secuencias seal identifican las protenas que tienen
al RNA de transferencia 680 que ser translocadas a travs de la membrana del retculo
Los aminocidos se activan primero mediante endoplasmtico 701
adenilacin 681 40.6 La sntesis de protenas se regula mediante
Las aminoacil-tRNA sintetasas poseen lugares para la diversos mecanismos 702
activacin de los aminocidos con gran capacidad El uso del RNA mensajero est sujeto a regulacin 702
discriminatoria 682 La estabilidad del RNA mensajero tambin
La correccin de errores por parte de las aminoacil-tRNA se puede regular 703
sintetasas aumenta la fidelidad de la sntesis de Los RNA pequeos pueden regular la estabilidad
protenas 682 del RNA mensajero y su utilizacin 703
Las sintetasas reconocen los bucles del anticodn
y los tallos aceptores de las molculas de RNA de Captulo 41 Tecnologa del DNA recombinante 709
transferencia 682 41.1 La gentica inversa permite la sntesis de cidos
39.3 Un ribosoma es una partcula de ribonucleoprotena nucleicos a partir de una secuencia de protena 709
que consta de dos subunidades 683 La secuencia de una protena nos conduce a
Los RNA ribosmicos desempean un papel central la secuencia del cido nucleico correspondiente 710
en la sntesis de protenas 683 Se pueden sintetizar sondas de DNA mediante
El RNA mensajero se traduce en direccin 5A3 684 mtodos automatizados 710
41.2 La tecnologa del DNA recombinante ha
Captulo 40 El mecanismo de la sntesis
revolucionado todos los aspectos de la biologa 711
de protenas 689
Las enzimas de restriccin cortan el DNA
40.1 La sntesis de protenas descodifica generando fragmentos especficos 712
la informacin del mRNA 689 Los fragmentos de restriccin se pueden separar
Los ribosomas tienen tres lugares de unin y visualizar mediante electroforesis en gel 712
a molculas de tRNA que conectan las Las enzimas de restriccin y la DNA ligasa son
subunidades de 30S y de 50S 690 herramientas clave para formar molculas de
La seal de inicio es AUG (o GUG) precedida DNA recombinante 713
de varias bases que se emparejan con el RNA
ribosmico de 16S 690
41.3 Los genes eucariticos se pueden manipular
La sntesis de protenas bacteriana comienza con una precisin considerable 714
con el formilmetionil-RNA de transferencia 691 El DNA complementario obtenido a partir del mRNA
Durante la formacin del complejo de iniciacin se puede expresar en clulas husped 714
de 70S, el formilmetionil-tRNAf se sita en El cDNA del receptor de estrgenos se puede identificar
el lugar P del ribosoma 692 mediante una bsqueda en una biblioteca de cDNA 715
Los factores de elongacin suministran Se pueden explorar las bibliotecas de DNA
los aminoacil-tRNA al ribosoma 692 complementario en busca de las protenas
sintetizadas 716
40.2 La peptidiltransferasa cataliza la sntesis
A partir de la digestin del DNA genmico
de enlaces peptdicos 693
se pueden clonar genes especficos 717
La formacin de un enlace peptdico va seguida
El DNA se puede secuenciar mediante la terminacin
de una translocacin
de los tRNA y del mRNA, impulsada por el GTP 693 controlada de la replicacin 717
La sntesis de protenas finaliza mediante factores Aspecto clnico y biolgico Los mtodos de
de liberacin que leen los codones Stop 695 secuenciacin de ltima generacin permiten la rpida
40.3 Las bacterias y los eucariotas difieren en determinacin de la secuencia completa de un genoma 719
la iniciacin de la sntesis de protenas 696 Mediante la reaccin en cadena de la polimerasa
Aspecto clnico Mutaciones en el factor de iniciacin es posible amplificar enormemente secuencias
2 provocan un curioso estado patolgico 697 de DNA seleccionadas 720
40.4 Diversas biomolculas pueden inhibir Aspecto clnico y biolgico La PCR es una
la sntesis de protenas 698 poderosa tcnica para el diagnstico mdico, la
Aspecto clnico Algunos antibiticos inhiben medicina forense y los estudios de evolucin molecular 722
la sntesis de protenas 698 NUEVO Los niveles de expresin gnica se pueden analizar
de forma exhaustiva 722
Aspecto clnico En eucariotas, la toxina de la
difteria bloquea la sntesis de protenas inhibiendo Apndices A1
la translocacin 699 Glosario B1
Aspecto clnico La ricina modifica de forma letal Soluciones a los problemas C1
el RNA ribosmico de 28S 700
ndice alfabtico D1
40.5 Los ribosomas unidos al retculo endoplasmtico
NUEVO sintetizan protenas de membrana y protenas
que van a ser secretadas 700
SECCIN 1
1
La agricultura, tambin, est utilizando la bioqumica para desarrollar herbicidas y
pesticidas ms eficaces y ms seguros para el medio ambiente, y para crear mediante
ingeniera gentica plantas que sean, por ejemplo, ms resistentes a los insectos.
En esta seccin aprenderemos algunos de los conceptos fundamentales sobre los que
se estructura el estudio de la bioqumica. Comenzamos con una introduccin sobre las
molculas de la bioqumica, seguida de una visin general de la unidad fundamental de
la bioqumica y de la propia vida: la clula. Por ltimo, estudiamos los enlaces reversibles
dbiles que propician la formacin de estructuras biolgicas y permiten las interacciones
entre molculas que hacen posible la vida.
2
C A P T U L O 1 La Bioqumica
y la unidad de la vida
U no de los principales objetivos de la bioqumica, uno que ha sido logrado con ro-
tundo xito, consiste en comprender qu signica, a nivel molecular, estar vivo.
Otro objetivo trata de ampliar estos conocimientos hasta el nivel de organismo es
decir, de comprender los efectos de las manipulaciones moleculares sobre la clase de
vida que desarrolla un organismo. Por ejemplo, comprender cmo funciona a nivel
molecular la hormona insulina ilustra cmo controla el organismo los niveles de com-
bustible en su sangre. Con frecuencia, este tipo de conocimiento facilita la comprensin
de los estados patolgicos como, por ejemplo, la diabetes, que aparece cuando la sea-
lizacin de la insulina deja de funcionar. A su vez, este conocimiento puede ser una
fuente de ideas sobre cmo poder tratar la enfermedad.
Durante ms de un siglo, la bioqumica ha sido un rea de investigacin activa.
Se ha aprendido mucho sobre cmo manipulan la energa y la informacin diversos
organismos. Sin embargo, uno de los resultados ms fascinantes de la investigacin
bioqumica ha sido la constatacin de que, desde el punto de vista bioqumico, to-
dos los organismos tienen mucho en comn. A nivel molecular, los organismos son
extraordinariamente uniformes. A esta observacin se la denomina frecuentemente
la unidad de la bioqumica pero, en realidad, ilustra la unidad de la vida. En 1954, el
bioqumico francs Jacques Monod condens esta idea en la frase Todo lo que ha
resultado ser cierto en [la bacteria] E. coli tambin debe ser verdad en los elefantes.
Esta uniformidad pone de maniesto el hecho de que todos los organismos de la Tie-
rra han surgido a partir de un ancestro comn. En las primeras etapas de la evolucin
de la vida surgi un conjunto de procesos bioqumicos esenciales, comn a todos los
3
4 1 La Bioqumica y la unidad de la vida
organismos. La diversidad de la vida en el mundo moderno se ha generado mediante
procesos evolutivos que han actuado sobre este conjunto de procesos a lo largo de
millones o incluso miles de millones de aos.
Comenzaremos nuestro estudio de la bioqumica centrndonos en los aspectos
comunes. Examinaremos las molculas y los componentes moleculares utilizados por
todas las formas de vida y, posteriormente, consideraremos las normas que gobiernan
cmo se accede a la informacin biolgica y cmo se transmite de una generacin
a la siguiente. Por ltimo, ofreceremos una visin general de la unidad fundamental
de la vida la clula. Esto es slo el principio. A medida que vayamos explorando
los fundamentos qumicos de la vida nos encontraremos una y otra vez con todas las
molculas y estructuras que se ven en este captulo.
Tabla 1.1 Composiciones qumicas expresadas como porcentaje del nmero total de tomos
Composicin en
Elemento Seres humanos (%) Agua de mar (%) Corteza terrestre (%)
Hidrgeno 63 66 0,22
Oxgeno 25,5 33 47
Carbono 9,5 0,0014 0,19
Nitrgeno 1,4 <0,1 <0,1
Calcio 0,31 0,006 3,5
Fsforo 0,22 <0,1 <0,1
Cloro 0,03 0,33 <0,1
Potasio 0,06 0,006 2,5
Azufre 0,05 0,017 <0,1
Sodio 0,03 0,28 2,5
Magnesio 0,01 0,003 2,2
Silicio <0,1 <0,1 28
Aluminio <0,1 <0,1 7,9
Hierro <0,1 <0,1 4,5
Titanio <0,1 <0,1 0,46
Los dems <0,1 <0,1 <0,1
Nota: A causa del redondeo, los porcentajes totales no suman el 100%.
Fuente: Tomado de E. Frieden, The chemical elements of life, Sci. Am. 227(1), 1972, p. 54.
1.2 Biomolculas 5
que los combustibles que impulsan mquinas, reaccionan con el oxgeno para producir
dixido de carbono y agua. Cuando se trata de combustibles biolgicos, esta reaccin,
denominada combustin, proporciona la energa necesaria para impulsar el funciona-
miento de la clula. Para hacernos una idea de por qu el carbono es particularmente
idneo para la vida, comparmoslo con el silicio, su pariente ms cercano entre los ele-
mentos naturales. En la corteza terrestre, el silicio es mucho ms abundante que el car-
bono (ver la Tabla 1.1) y, al igual que el carbono, puede formar cuatro enlaces covalen-
tes una propiedad crucial a la hora de construir molculas grandes. Sin embargo, los
enlaces carbono-carbono son ms fuertes que los enlaces silicio-silicio. Esta diferencia
en la fortaleza del enlace se traduce en dos consecuencias importantes. En primer lugar,
se pueden construir molculas grandes utilizando un esqueleto de enlaces carbono-car-
bono debido a la estabilidad de estos enlaces. En segundo lugar, se libera ms energa
cuando se produce la combustin de enlaces carbono-carbono que cuando el silicio re-
acciona con el oxgeno. Por tanto, las molculas basadas en el carbono son materiales de
construccin ms robustos y son mejores combustibles que las molculas basadas en el
silicio. Incluso despus de haber sido sometido a combustin, el carbono ofrece una ven-
taja frente al silicio. El dixido de carbono se disuelve fcilmente en agua y puede existir
en forma de gas; por tanto, permanece en los circuitos bioqumicos, es emitido por un
tejido o por un organismo para ser utilizado por otro tejido o por otro organismo. Por el
contrario, el silicio es prcticamente insoluble tras reaccionar con el oxgeno. Cuando se
ha combinado con el oxgeno, queda permanentemente fuera de la circulacin.
Otros elementos desempean un papel esencial en los sistemas vivos parti-
cularmente el nitrgeno, el fsforo y el azufre. Adems, algunos oligoelementos son
absolutamente imprescindibles para una serie de procesos vitales a pesar de estar pre-
sentes en cantidades diminutas en comparacin con el oxgeno, hidrgeno y carbono.
A medida que avancemos en nuestro estudio de la bioqumica iremos viendo el uso
especco que se da a estos elementos.
1.2 Hay cuatro clases principales de biomolculas 1 Describir las clases fundamentales
de biomolculas y comentar las diferencias
Los sistemas vivos contienen un conjunto de biomolculas abrumador. Sin embargo, que hay entre ellas.
estas biomolculas se pueden dividir en tan slo cuatro clases: protenas, cidos nu-
cleicos, lpidos y carbohidratos.
1 2 3
Figura 1.1 Plegamiento de protenas. La estructura tridimensional de una protena viene dictada
por la secuencia de aminocidos que componen la protena.
6 1 La Bioqumica y la unidad de la vida
NH2 catalizadores agentes que incrementan la velocidad de una reac-
2 O N cin qumica sin verse ellos mismos afectados de forma permanen-
O O
te. Los catalizadores de naturaleza proteica se denominan enzimas.
H2 N
P P P C N Todos y cada uno de los procesos que tienen lugar en los sistemas
O
O O O O vivos dependen de las enzimas.
O O O N
Figura 1.4 Las propiedades duales de los lpidos. (A) Una parte de una molcula lipdica es
hidroflica; la otra parte es hidrofbica. (B) En agua, los lpidos pueden formar una bicapa,
constituyendo una barrera que separa dos compartimentos acuosos.
1.3 El dogma central describe los principios bsicos 2 Enumerar las etapas del dogma
central
de la transferencia de informacin biolgica
En todas las clulas, el procesamiento de la informacin es bastante complejo. La
complejidad aumenta a medida que las clulas se encuentran formando parte de los
tejidos y a medida que los tejidos se convierten en parte integrante de los organismos.
El esquema que describe el procesamiento de la informacin a nivel de la expresin
de los genes fue propuesto por primera vez en 1958 por Francis Crick.
Replicacin
Transcripcin Traduccin
DNA 999999: RNA 999999: Protena
Crick denomin a este esquema el dogma central: la informacin uye desde el DNA
al RNA y, posteriormente, a la protena. Adems, el DNA se puede replicar. Los aspec-
tos bsicos de este dogma son ciertos pero, como se ver ms adelante, este esquema
no es tan simple como se indica en la gura.
1.4 Orgnulos 9
(A) Bicapa de la membrana (B)
Hay dos tipos bsicos de clula: las clulas eucariticas y las clulas procariticas
(Figura 1.10). La principal diferencia entre las dos es la existencia de compartimentos
rodeados de membrana en eucariotas y la ausencia de este tipo de compartimentos en
procariotas. Las clulas procariticas, ejemplicadas por la bacteria del intestino huma-
no Escherichia coli, tienen una estructura relativamente sencilla. Estn rodeadas por dos
Lisosoma
Mitocondria
Membrana externa Membrana interna Nucleoide
(plasmtica)
Retculo endoplasmtico 1 m
Aparato de Golgi
Mitocondria
Ncleo
Lisosoma
Membrana interna (plasmtica)
Pared celular
Espacio periplsmico
Membrana externa
Retculo
endoplasmtico
rugoso Vescula de secrecin
Figura 1.10 Clulas procariticas y eucariticas. Las clulas eucariticas presentan ms estructura interna que las
clulas procariticas. Los componentes del interior de una clula eucaritica y de forma particularmente notoria, el
ncleo, estn delimitados por membranas. [Micrografas: (A) Biology Pics/Science Source (B) tomado de P. C. Cross y K. L.
Mercer, Cell and Tissue Ultrastructure: A Functional Perspective (W. H. Freeman and Company, 1993), p. 199] Diagramas: (A y B)
Tomados de H. Lodish y col., Molecular Cell Biology, 6 ed. (W. H. Freeman and Company, 2008), p. 3].
10 1 La Bioqumica y la unidad de la vida
membranas separadas por el espacio periplsmico. Aunque los seres humanos estn
formados por 100 billones de clulas, somos portadores de un nmero an mayor de
clulas tanto en nuestro interior como sobre nuestra supercie. En la mayora de los
casos, nuestra actitud en relacin con nuestros colegas procariticos es la de vive y
deja vivir. Por ejemplo, los procariotas que viven en nuestros intestinos nos ayudan
durante el proceso de digestin. En otros aspectos, los procariotas son los responsables
de que nuestras vidas sean ms agradables. Diversos procariotas nos suministran nata,
yogur y queso. No obstante, los procariotas tambin pueden causar una amplia gama
de enfermedades.
Independientemente del tipo de clula eucaritica o procaritica, animal o
vegetal son dos las caractersticas bioqumicas mnimas que constituyen una clula:
debe haber (1) una barrera que separe la clula de su entorno y (2) un interior que
diera qumicamente del entorno y que albergue la bioqumica de la vida. La barre-
ra se denomina membrana plasmtica y el material bsico intracelular se denomina
citoplasma.
Mitocondria
Vacuola Vacuola
Cloroplasto
Membrana
plasmtica
Pared celular
Cloroplasto
Figura 1.12 Una clula vegetal (A) Fotomicrografa de una clula de una hoja. (B) Diagrama de
una clula vegetal tpica. [(A) Biophoto Associates/Photo Researchers.]
1.4 Orgnulos 11
Membrana plasmtica
Ribosoma
Figura 1.15 La mitocondria. En el panel B, la matriz mitocondrial se muestra en color azul claro
[(A) Keith R. Porter/Photo Researchers.]
Aspecto clnico
Fallos en la funcin de los orgnulos pueden dar lugar a enfermedades
Muchos estados patolgicos surgen a causa del mal funcionamiento de diversos org-
Figura 1.21 Un lisosoma. Micrografa de un nulos. Por ejemplo, la hipercolesterolemia familiar, una enfermedad en la que nios
lisosoma durante el proceso de digestin de con edades tan tempranas como 6 aos mueren de ataques al corazn, se debe a
una mitocondria (M) y de otros materiales
una endocitosis inecaz del colesterol presente en la sangre. Los elevados niveles de
celulares. [Biophoto Associates/Science Source].
colesterol resultantes dan lugar a ataques al corazn. La enfermedad de Tay-Sachs,
que se caracteriza por debilidad muscular, demencia y muerte a edades tempranas,
normalmente antes de los 3 aos, es el resultado de un funcionamiento incorrecto de
los lisosomas. A medida que avancemos en nuestro estudio de la bioqumica repasa-
? PREGUNTA RPIDA 2 Cite tres
orgnulos o estructuras que se pueden
remos estas enfermedades y examinaremos muchas otras.
encontrar en las clulas vegetales pero no en La organizacin celular es una muestra del elevado contenido de informacin de la
las clulas animales. clula. Pero este breve repaso slo ha raspado la supercie del procesamiento de infor-
macin que debe llevarse a cabo para construir algo tan sosticado como una clula. En
el resto de este libro de texto examinaremos las rutas bioqumicas de la energa y de la
informacin que contribuyen a la construccin y al mantenimiento de los sistemas vivos.
Resumen
1.1 Los sistemas vivos necesitan un repertorio limitado de tomos y molculas
En los seres vivos, el oxgeno, el hidrgeno y el carbono constituyen el 98% de sus to-
mos. El hidrgeno y el oxgeno son los que predominan por la gran cantidad de agua
que contienen pero en todas las biomolculas, el tomo ms frecuente es el carbono.
1.2 Hay cuatro clases principales de biomolculas
Las protenas, cidos nucleicos, lpidos y carbohidratos constituyen las cuatro
clases principales de biomolculas. Las protenas son las ms verstiles y desem-
pean una funcin especialmente destacada cuando actan como enzimas. Los
cidos nucleicos son, fundamentalmente, molculas que contienen informacin:
el DNA es la informacin gentica de la mayora de los organismos, mientras que
el RNA desempea diversas funciones, incluyendo la de servir de conexin entre
el DNA y las protenas. Los lpidos sirven de combustible y para formar mem-
branas. Los carbohidratos son las principales molculas combustible y tambin
desempean un papel en las interacciones clula-clula.
1.3 El dogma central describe los principios bsicos
de la transferencia de informacin biolgica
El dogma central de la biologa establece que el DNA se replica para formar
nuevas molculas de DNA. El DNA tambin se puede transcribir para formar
RNA. Una parte de la informacin almacenada en forma de RNA, el denomi-
nado RNA mensajero, se puede traducir a protenas.
1.4 Las membranas delimitan la clula y desempean funciones celulares
Las membranas, formadas por bicapas lipdicas, son cruciales para establecer fron-
teras entre las clulas y su entorno y para jar lmites entre regiones internas de
multitud de clulas. Desde el punto de vista estructural hay dos tipos distintos
de clula: las clulas eucariticas y las clulas procariticas. Las clulas eucariticas
se caracterizan por un complejo conjunto de compartimentos intracelulares ro-
deados de membrana denominados orgnulos. El ncleo es el orgnulo ms gran-
de y alberga la informacin gentica de la clula. Otros orgnulos desempean
funciones en la transformacin de la energa, en el procesamiento y secrecin de
protenas y en la digestin. Por el contrario, las clulas procariticas son ms pe-
queas y menos complejas y carecen de compartimentos rodeados de membrana.
Problemas 15
Trminos clave
unidad de la bioqumica (p. 3) transcripcin (p. 8) cloroplastos (p. 12)
protenas (p. 5) traduccin (p. 8) retculo endoplasmtico (RE) (p. 12)
cidos nucleicos (p. 6) membrana (p. 8) Aparato de Golgi (p. 13)
nucletidos (p. 6) bicapa lipdica (p. 8) grnulos de secrecin (de zimgeno)
cido desoxirribonucleico (DNA) (p. 6) eucariotas (p. 9) (p. 13)
cido ribonucleico (RNA) (p. 6) procariotas (p. 9) exocitosis (p. 13)
lpidos (p. 6) membrana plasmtica (p. 10) endosomas (p. 13)
carbohidratos (p. 7) citoplasma (p. 10) endocitosis (p. 13)
glucgeno (p. 7) citoesqueleto (p. 10) fagocitosis (p. 13)
dogma central (p. 7) ncleo (p. 11) lisosomas (p. 13)
replicacin (p. 8) mitocondria (p. 12)
Problemas
1. E. coli y los elefantes. Qu se quiere decir mediante la ex- 12. Funcin y estructura. Asigne cada funcin al orgnulo co-
presin unidad de la bioqumica? Cules son las implicacio- rrespondiente.
nes de la unidad de la bioqumica?
(a) Retculo endoplasmtico 1. Lugar donde se encuentra
2. Similares, pero no iguales. Describa las diferencias estruc- la mayor parte del DNA
turales entre el DNA y el RNA. 1 de la clula
(b) Retculo endoplasmtico
3. Polmeros. Qu diferencias hay entre la estructura poli- liso 2. Lugar donde se oxida el
mrica de las protenas y la del glucgeno? 1 combustible
(c) Retculo endoplasmtico 3. Separa el interior de la
4. Una creencia ocial. Dena el dogma central de la biolo- rugoso clula del exterior
ga. 2
(d) Aparato de Golgi 4. Transporta sustancias
5. Procesamiento de la informacin. Dena replicacin, bioqumicas importantes
transcripcin y traduccin en relacin con el dogma central. al interior de la clula
(e) Vesculas de transporte
2 5. Membrana con
6. Acelera. Qu es una enzima? 1 (f) Grnulos de secrecin
ribosomas adheridos
6. Lugar donde se produce
7. Complejas y no tan complejas. Qu diferencias hay entre la fotosntesis
clulas eucariticas y clulas procariticas? 3 (g) Endosoma 7. Contiene enzimas
8. Un rgano diminuto? Qu es un orgnulo? 3 (h) Lisosoma digestivas
8. Destinadas a fusionarse
9. Doble cobertura. Qu orgnulos estn rodeados por dos (i) Mitocondria
con la membrana
membranas?
(j) Cloroplasto plasmtica
10. Perforada. En qu se diferencia la membrana nuclear de (k) Ncleo 9. Forma frecuente de la
otras membranas? membrana citoplasmtica
(l) Membrana plasmtica
11. Una estrategia de salida. Trace la ruta que conduce a la 10. Lugar donde se aaden
formacin de una protena de secrecin desde su gen hasta su carbohidratos a las
exocitosis por parte de la clula. protenas
11. Facilita la comunicacin
entre el retculo
endoplasmtico rugoso y
el aparato de Golgi
12. Procesa sustancias
qumicas exgenas
C A P T U L O 2 Agua, enlaces dbiles
y la generacin de orden
a partir del caos
H
H CH3
O H N
N H O
N N
N
N H N N H
N N N N
35
40 3 Aminocidos
enlace OH son atrados por el tomo de oxgeno, hacindolo parcialmente negativo,
lo que, a su vez, convierte al hidrgeno en parcialmente positivo. Se puede considerar
la serina como una versin de la alanina que tiene un grupo hidroxilo unido al grupo
metilo, mientras que la treonina parece una valina en la que un grupo hidroxilo ocupa
el lugar de uno de los grupos metilo de la valina. La tirosina es parecida a la fenilala-
nina pero contiene un grupo hidroxilo hidroflico unido al gran anillo aromtico. Los
grupos hidroxilo de la serina, treonina y tirosina los hacen ms hidroflicos (les gusta el
agua) y reactivos que sus respectivos homlogos no polares alanina, valina y fenilalani-
na. La cistena es, desde el punto de vista estructural, similar a la serina pero contiene
La lisina es un aminocido esencial
un grupo sulfhidrilo, o tiol (SH), en lugar del grupo hidroxilo. El grupo sulfhidrilo es
(p. 42), lo cual quiere decir que los seres mucho ms reactivo que un grupo hidroxilo y a pH ligeramente bsico puede perder un
humanos no pueden sintetizar lisina y protn para formar un grupo tiolato reactivo. Una pareja de grupos sulfhidrilos que se
deben obtenerla a partir de la dieta. En encuentren muy cerca puede formar enlaces disulfuro enlaces covalentes que resul-
animales de experimentacin sometidos tan particularmente importantes a la hora de estabilizar algunas protenas, tal y como se
a una dieta basada en cereales, la ver en el Captulo 4. Adems, el conjunto de aminocidos polares incluye la asparagina
ingesta insuficiente de lisina increment y el glutamato, que contienen una carboxamida terminal.
la ansiedad provocada por el estrs.
Recientes estudios sugieren que esta Los aminocidos cargados positivamente son hidroflicos
respuesta a la carencia de lisina tambin
Centramos ahora nuestra atencin en los aminocidos que contienen cadenas late-
podra producirse en los seres humanos.
rales cargadas positivamente que hacen que estos aminocidos sean muy hidroflicos
(Figura 3.5). La lisina y la arginina poseen largas cadenas laterales que terminan en
grupos que estn cargados positivamente a pH neutro. La lisina acaba en un grupo
amino y la arginina en un grupo guanidinio. Observe que los grupos R de la lisina y
NH2
+
de la arginina presentan caractersticas duales las cadenas carbonadas constituyen
C un esqueleto hidrocarbonado parecido al del aminocido leucina, pero la cadena ter-
H2N NH2 mina con una carga positiva. Esta combinacin de caractersticas contribuye a la gran
Guanidinio variedad de propiedades qumicas de estos aminocidos.
N La histidina contiene un grupo imidazol, un anillo aromtico que tambin puede
H C H estar cargado positivamente. Con un valor de pKa cercano a 6, el grupo imidazol de la
C
histidina es nico en el sentido de que en las proximidades del pH neutro puede estar sin
N C
H H carga o cargado positivamente, en funcin de su entorno local (Figura 3.6). De hecho, la
Imidazol histidina se encuentra frecuentemente en los centros activos de las enzimas, donde el ani-
llo imidazol puede unir o liberar protones en el transcurso de las reacciones enzimticas.
H2N +
C NH2
NH3+
HN
H2C CH2
CH2
H2C H
H2C CH2 H N
H C
CH2 C C H
H
C
+H N
3 COO N
+H N
3 COO
+
H2N NH2 H
NH3+ C C
+H N
3 COO
CH2 NH
H
CH2 CH2 N H H
CH N N
HC HC + HC
CH2 CH2 CH CH
N C +
CH2 CH2 CH2 N C
H N C
H
+H N
3 C COO +H N
3 C COO +H N
3 C COO CH2 CH2
H H+ H
H H H C C
N C N C
Lisina Arginina Histidina H H
(Lys, K) (Arg, R) (His, H) O O
Figura 3.5 Aminocidos cargados positivamente. Figura 3.6 Ionizacin de la histidina. En las
proximidades del pH fisiolgico, la histidina puede
unirse a protones o liberarlos.
3.2 Los 20 aminocidos 41
Los aminocidos cargados negativamente presentan cadenas laterales cidas El glutamato monosdico (GMS), que es
Los dos aminocidos que pertenecen a este grupo, el cido asprtico y el cido glu- glutamato con sodio unido a un grupo
tmico, poseen cadenas laterales cidas que habitualmente se encuentran cargadas cido, se utiliza frecuentemente como
negativamente en las condiciones intracelulares (Figura 3.7). A menudo, estos ami- un intensificador del sabor. De hecho,
nocidos se denominan aspartato y glutamato para enfatizar la presencia de la carga el sabor del glutamato y del aspartato
negativa en sus cadenas laterales. En algunas protenas, estas cadenas laterales aceptan (denominado umami, que procede de
la palabra japonesa exquisitez) es uno
protones, lo que neutraliza la carga negativa. A menudo, esta capacidad es importante
de los cinco sabores primarios; los otros
desde el punto de vista funcional. El aspartato y el glutamato estn relacionados con
son: dulce, cido, amargo y salado.
la asparagina y a la glutamina ya que, en estos ltimos, la carboxamida ocupa el lugar
que en la primera pareja ocupan los grupos carboxlicos.
Las cadenas laterales ionizables incrementan ? PREGUNTA RPIDA Cite tres
aminocidos que estn cargados
la reactividad y la formacin de enlaces positivamente a pH neutro. Cite tres
Siete de los 20 aminocidos tirosina, cistena, arginina, lisina, histidina, cido asprtico aminocidos que contengan grupos
y cido glutmico presentan cadenas laterales fcilmente ionizables. Estos siete ami- hidroxilo.
nocidos son capaces tanto de formar enlaces inicos como de donar o aceptar protones
O
para facilitar las reacciones. La capacidad de donar o aceptar protones se denomina ca-
tlisis cido-base y es una importante reaccin qumica para muchas enzimas. Veremos O C O
la importancia de la histidina como catalizador cido-base cuando estudiemos la qui- O C H2C
motripsina, una enzima que digiere protenas, en el Captulo 8. La Tabla 3.1 muestra los H CH2 H CH2
equilibrios y los valores de pKa para la ionizacin de las cadenas laterales de estos siete C C
+H
3N COO +H
3N COO
aminocidos.
O O
Tabla 3.1 Valores tpicos del pKa de los grupos ionizables de las protenas C
O O
Grupo cido Base pKa tpico C CH2
CH2 CH2
O O
Grupo -carboxilo terminal 3,1 +H
3N C COO +H
3N C COO
C H C
O O H H
Aspartato Glutamato
O O (Asp, D) (Glu, E)
cido asprtico 4,1
cido glutmico C H C
Figura 3.7 Aminocidos cargados
O O
negativamente.
H
N N
Histidina + 6,0
N N
H H
+ H
Grupo -amino terminal N N 8,0
H H
H H
H
Cistena S S 8,3
H
Tirosina O O 10,9
+ H
Lisina N N 10,8
H H
H H
H H
H + N H H N
Arginina N C N C 12,5
N H N H
H H
Nota: los valores de pKa dependen de la temperatura, de la fuerza inica y del microentorno del grupo
ionizable.
42 3 Aminocidos
Tabla 3.2 Conjunto bsico de 20 aminocidos
No esenciales Esenciales
Alanina Histidina
Arginina Isoleucina
Asparagina Leucina
Aspartato Lisina
Cistena Metionina
Glutamato Fenilalanina
Glutamina Treonina
Glicina Triptfano
Prolina Valina
Serina
Tirosina
Aspecto clnico
La ingesta inadecuada de protenas da lugar a estados patolgicos
Un ejemplo de la importancia de los aminocidos en la dieta (ingeridos habitual-
mente en forma de protenas) es el kwashiorkor, una forma particular de malnutri-
cin. Esta enfermedad se deni por vez primera en la dcada de 1930 en Ghana.
En la lengua Ga, un dialecto ghaniano, kwashiorkor signica enfermedad del nio
desplazado; es decir, la enfermedad que surge cuando un nio es destetado a causa
del nacimiento de un hermano. Es una forma de malnutricin que aparece cuan-
do la ingesta de protenas es insuciente. Los sntomas iniciales de la enfermedad
son un letargo generalizado, irritabilidad y un crecimiento atroado. Si se trata lo
sucientemente pronto, los efectos de la enfermedad son reversibles. Sin embargo,
si no se corrige a tiempo, muchos sistemas siolgicos no consiguen desarrollarse
adecuadamente, incluyendo el cerebro. Por ejemplo, los nios padecern diversas en-
fermedades infecciosas porque sus sistemas inmunitarios, formados por multitud de
protenas diferentes, no se pueden construir de modo que funcionen de forma apro-
piada. Anlogamente, la falta de protenas impide el desarrollo completo del sistema
nervioso central, lo que da lugar a la aparicin de problemas neurolgicos.
La caracterstica ms frecuente de un nio que padece kwashiorkor es un vientre
grande y protuberante (Figura 3.8). El vientre grande no es una seal de un exceso
de caloras sino de un edema, otra consecuencia de la falta de protenas. El edema es
la hinchazn que resulta del exceso de agua en los tejidos. Una cantidad insuciente
Figura 3.8 Nio que padece kwashiorkor.
de protena en la sangre del nio distorsiona la normal distribucin del agua entre el
Observe la tripa hinchada. Esta hinchazn
(edema) se debe a la acumulacin de plasma y los capilares circundantes. Aunque lo que ms se nota es el vientre hincha-
lquido en los tejidos porque no hay do, es frecuente que las extremidades de un nio que padece kwashiorkor tambin
suficientes protenas en la sangre. estn hinchadas. Estos nios enfermos ofrecen una imagen abrumadora de la crucial
[Stephen Morrison/epa/Corbis.] importancia de las protenas para la vida.
Problemas 43
Resumen
3.1 Las protenas se construyen a partir de un repertorio de 20 aminocidos
Las protenas son polmeros lineales de aminocidos. Cada aminocido consta
de un tomo de carbono tetradrico central unido a un grupo amino, a un
grupo cido carboxlico, a una cadena lateral caracterstica y a un tomo de
hidrgeno. Estos centros tetradricos, a excepcin del de la glicina, son quirales;
en la protenas solo hay ismeros l. Todas las protenas naturales se construyen
a partir del mismo conjunto de 20 aminocidos.
3.2 Los aminocidos contienen una amplia gama de grupos funcionales
Las cadenas laterales de estos 20 materiales de construccin varan enormemente
en su tamao, forma y presencia de grupos funcionales. En funcin de las pro-
piedades qumicas de las cadenas laterales, los aminocidos se pueden clasicar
de la siguiente forma: (1) cadenas laterales hidrofbicas glicina, alanina, valina,
leucina, isoleucina, metionina, prolina y los aminocidos aromticos fenilalanina
y triptfano; (2) aminocidos polares serina, treonina, tirosina, asparagina y
glutamina; (3) aminocidos cargados positivamente lisina, arginina e histidi-
na; y (4) aminocidos cargados negativamente cido asprtico y cido glut-
mico.
3.3 Los aminocidos esenciales deben obtenerse a partir de la dieta
La mayora de los microorganismos son capaces de fabricar los 20 aminocidos
a partir de molculas ms sencillas. A pesar de que los seres humanos pueden
fabricar 11 aminocidos, hay nueve que tienen que ser aportados por la dieta.
Estos nueve aminocidos se denominan aminocidos esenciales porque son
necesarios para un crecimiento y desarrollo saludables.
Trminos clave
cadena lateral (grupo R) (p. 36) ion dipolar (zwitterin) (p. 36) aminocidos esenciales (p. 42)
aminocido l (p. 36)
Problemas
1. Mensaje oculto. Traduzca la siguiente secuencia de ami- 2. Identicar. Examine los siguientes cuatro aminocidos.
nocidos al cdigo de una letra: Glu-Leu-Val-Ile-Ser-Ile-Ser- Cules son sus nombres, sus abreviaturas de tres letras y sus
Leu-Ile-Val-Ile-Asn-Gly-Ile-Asn-Leu-Ala-Ser-Val-Glu-Gly- smbolos de una letra?
Ala-Ser.
COO COO
COO COO
+ + + +
H2N CH H3N CH H3N CH H3N CH
CH2
OH
+
NH3
A B C D
C A P T U L O 9 La hemoglobina,
una protena alostrica
141
142 9 La hemoglobina, una protena alostrica
Y (fraccin saturada)
parcial del oxgeno es de 159 torr. En los 0,8
0,8
66%
0,6
0,4
Figura 9.2 La cooperatividad aumenta
la liberacin de oxgeno por parte de la 0,2
hemoglobina. Gracias a la cooperatividad
entre los lugares de unin al O2, la 0,0
hemoglobina libera ms O2 a los tejidos 0 20 50 100 150 200
del que liberara la mioglobina. pO2 (torr)
Y (fraccin saturada)
oxgeno. Cmo se incrementa la anidad de la hemoglobina fetal hacia el oxgeno? 0,8
de la madre
El gen de la globina que expresan los fetos diere del expresado por los seres
0,6
humanos adultos; los tetrmeros de hemoglobina fetal incluyen dos cadenas y
dos cadenas . El 72% de la secuencia de aminocidos de la cadena es idntico al de 0,4 El O2 fluye desde la
la cadena . Un cambio digno de mencin es la sustitucin de la histidina 143 situa- oxihemoglobina
da en el lugar de unin al 2,3-BPG, que en la cadena ha sido reemplazada por un 0,2
de la madre hacia la
residuo de serina. Este cambio elimina dos cargas positivas (una por cada cadena) del desoxihemoglobina del feto
lugar de unin al 2,3-BPG y reduce la anidad del 2,3-BPG por la hemoglobina fetal. 0,0
0 50 100
La reduccin en la anidad hacia el 2,3-BPG signica que la anidad de la hemoglobi-
pO2 (torr)
na fetal para unirse al oxgeno es mayor que la de la hemoglobina adulta de la madre
(Figura 9.11). Esta diferencia en la anidad hacia el oxgeno permite que el oxgeno se Figura 9.11 Afinidad de los glbulos rojos
transera ecientemente desde los glbulos rojos de la madre a los del feto. fetales hacia el oxgeno. La afinidad de los
glbulos rojos fetales hacia el oxgeno es
mayor que la de los glbulos rojos de la
madre porque la hemoglobina fetal no se
Aspecto biolgico une al 2,3-BPG tan bien como lo hace la
Las adaptaciones de la hemoglobina permiten el transporte hemoglobina materna.
Aspecto clnico
La anemia falciforme es una enfermedad causada
por una mutacin en la hemoglobina
En 1904, James Herrick, un mdico de Chicago, examin a un estudiante de estomatolo-
ga negro de 20 aos que haba sido ingresado en el hospital con ebre y tos. El paciente
se senta dbil y mareado y le dola la cabeza. Durante aproximadamente un ao haba
tenido palpitaciones y dicultad para respirar. En el examen mdico, el paciente pareca
normal salvo por el hecho de que su corazn estaba sensiblemente agrandado y tena una
anemia considerable.
El frotis sanguneo del paciente contena unos glbulos rojos atpicos, que
Herrick describi como con forma de hoz (Figura 9.13). Poco despus de la publi-
cacin de la descripcin de Herrick se descubrieron otros casos de esta enfermedad,
denominada anemia falciforme. De hecho, la anemia falciforme no es una enferme-
dad rara, ya que su incidencia entre los negros es de alrededor de un 4 por 1.000.
En el pasado, sola ser una enfermedad mortal, a menudo antes de los 30 aos, como
resultado de infecciones, fallo renal, fallo cardiaco o trombosis.
La anemia falciforme se transmite genticamente. Los pacientes con anemia fal-
ciforme poseen dos copias del gen anormal (son homocigticos). La descendencia que Figura 9.13 Glbulo rojo falciforme.
recibe un alelo anormal de uno de los padres y un alelo normal del otro tienen el rasgo Micrografa que muestra un glbulo rojo
falciforme. Normalmente, estas personas heterocigticas no presentan los sntomas. falciforme junto a glbulos rojos con
Solo el 1% de los glbulos rojos de la circulacin venosa de un heterocigoto son fal- la forma normal.
ciformes, a diferencia del 50% en el caso de un homocigoto. [Eye of Science/Photo Researchers.]
147
SECCIN 4
Carbohidratos
y lpidos
Captulo 10:
Carbohidratos
L os carbohidratos y los lpidos, junto con las protenas y los cidos nucleicos,
constituyen las cuatro clases principales de biomolculas. Ya hemos visto las
protenas, poniendo especial nfasis en su papel como enzimas. Aunque los carbohidratos
y los lpidos desempean un variado conjunto de funciones en los sistemas vivos, su
funcin como combustible es la ms obvia. Esta funcin resulta evidente para cualquiera
que examine la informacin nutricional de las etiquetas de los envases de alimentos. En
estas etiquetas, a los lpidos se les denomina grasas, por razones que se descubrirn en
el Captulo 11.
Los carbohidratos y los lpidos proporcionan la energa para impulsar todos los
procesos bioqumicos que tienen lugar en el interior de una clula o de un organismo.
Captulo 11: Su papel como combustible es de una importancia tan grande que el sabor y la textura
Lpidos
de estas molculas proporciona placer gustativo y el comportamiento de la mayora
de los animales, incluyendo a los seres humanos, est orientado hacia la bsqueda
de alimentos ricos en lpidos y carbohidratos. Por razones que se comentarn en
captulos posteriores, los lpidos aportan mucha ms energa utilizable por gramo
que los carbohidratos. Sin embargo, la mayora de los organismos mantienen
reservas de ambos tipos de combustible. Por qu tener dos fuentes de combustible
si una de ellas es mucho ms rica en energa? La respuesta es que todos los lpidos
necesitan oxgeno para producir energa biolgicamente aprovechable. Aunque los
carbohidratos pueden liberar energa cuando reaccionan con el oxgeno, tambin
pueden liberar energa cuando escasea el oxgeno, como ocurre en el caso de los
msculos de la pierna de un corredor que est haciendo un sprint para llegar a la
meta o en el caso de una bacteria que est creciendo en un ambiente sin oxgeno.
155
Por tanto, el uso de lpidos y carbohidratos como combustibles aporta flexibilidad
bioqumica para satisfacer las diversas necesidades biolgicas de un organismo.
Los carbohidratos y los lpidos tambin desempean importantes funciones
estructurales. Por ejemplo, los carbohidratos aportan la fuerza de las paredes celulares
vegetales mientras que los lpidos son ubicuos en su papel como componentes de
la membrana. De hecho, carbohidratos y lpidos se pueden unir para formar unos
componentes particulares de las membranas denominados glicolpidos. Por ltimo, estas
dos clases de biomolculas desempean funciones esenciales en las rutas de transduccin
de seales.
En el Captulo 10 estudiaremos las propiedades bioqumicas de los carbohidratos,
resaltando otras funciones, adems de su papel como combustibles. En el Captulo
11 haremos lo mismo con los lpidos, prestando especial atencin a las propiedades
hidrofbicas de estas molculas.
156
C A P T U L O 10 Carbohidratos
157
158 10 Carbohidratos
R C H R C R O H O H
CH2OH C C
Aldehdo Cetona
O C H C OH HO C H
CH2OH
CH2OH CH2OH
Dihidroxiacetona D-Gliceraldehdo L-Gliceraldehdo
(una cetosa) (una aldosa) (una aldosa)
A menudo, los monosacridos y otros La dihidroxiacetona se denomina cetosa porque contiene un grupo ceto, mientras que el
azcares se representan mediante gliceraldehdo se denomina aldosa porque contiene un grupo aldehdo. Se dice que son
proyecciones de Fischer. Recordemos triosas (tri- signica tres, haciendo referencia a los tres tomos de carbono que contie-
del Captulo 3 que, en la proyeccin nen). Anlogamente, los monosacridos simples con cuatro, cinco, seis o incluso siete
de Fischer de una molcula, los tomos tomos de carbono se denominan tetrosas, pentosas, hexosas y heptosas, respectivamente.
unidos a un tomo de carbono Quizs los monosacridos que nos resultan ms familiares sean las hexosas glucosa y
asimtrico mediante enlaces horizontales fructosa. La glucosa es una fuente de energa esencial para prcticamente cualquier for-
se encuentran por delante del plano de ma de vida. La fructosa se utiliza habitualmente como un edulcorante que una vez en el
la pgina y los unidos mediante enlaces
interior de la clula se convierte en derivados de la glucosa.
verticales se encuentran por detrs
Los carbohidratos pueden existir en una enorme variedad de formas isomricas
del plano.
(Figura 10.1). La dihidroxiacetona y el gliceraldehdo son ismeros constitucionales
porque tienen frmulas moleculares idnticas pero dieren en la forma en que se
disponen sus tomos. Los estereoismeros son ismeros que se diferencian por la or-
ISMEROS EPMEROS
Tienen la misma frmula Difieren en uno de sus tomos
molecular pero estructuras distintas de carbono asimtricos
CHO CHO
ISMEROS CONSTITUCIONALES ESTEREOISMEROS H C OH HO C H
Difieren en el orden en que estn dispuestos los tomos Los tomos est dispuestos
en el mismo orden pero difieren HO C H HO C H
O H en su ordenamiento espacial
C CH2OH H C OH H C OH
H C OH C O H C OH H C OH
ENANTIMEROS DIASTEREOISMEROS
ANMEROS
Son imgenes especulares no superponibles Ismeros que no son imgenes especulares
Ismeros que difieren en un nuevo tomo de
O H O H CHO CHO carbono asimtrico que se forma al cerrarse el anillo
C C
HO C H H C OH CH2OH CH2OH
H C OH HO C H O O OH
H C OH HO C H
CH2OH CH2OH H C OH H C OH OH OH
D-Gliceraldehdo L-Gliceraldehdo
H C OH H C OH HO OH HO
(C3H6O3) (C3H6O3)
CH2OH CH2OH OH OH
D-Altrosa D-Glucosa -D-Glucosa -D-Glucosa
(C6H12O6) (C6H12O6) (C6H12O6) (C6H12O6)
Anlogamente, una cetona tambin puede reaccionar con un alcohol para for-
mar un hemicetal.
O HO OR
C + HOR C
R R R R
Cetona Alcohol Hemicetal
El grupo ceto del C-2 de la forma de cadena abierta de una cetohexosa, como la
O
fructosa, puede formar un hemicetal intramolecular reaccionando bien con el gru-
po hidroxilo del C-6 para formar un hemicetal cclico de seis tomos, o bien con
el grupo hidroxilo del C-5 para formar un hemicetal cclico de cinco tomos (Fi-
Furano
gura 10.4). El anillo de cinco tomos se denomina furanosa por su parecido con el
furano.
1
O CH2OH 6
HOH2C
2C OH HOH2C CH2OH
H 5C 1 O
Figura 10.4 Formacin de furanosas. HO C H CH2OH
3 OH H HO
La forma de cadena abierta de la fructosa se = H
H C OH 4C C
cierra sobre s misma formando un anillo de H OH
4 3C 2
cinco tomos cuando el grupo hidroxilo del HO O
H C OH H OH H
C-5 ataca al C-2 del grupo cetona para 5
Aspecto clnico
La formacin de hemiacetales cclicos origina un nuevo carbono asimtrico
Hemos visto que los carbohidratos pueden contener muchos tomos de carbono asi-
mtricos. Cuando se forma un hemiacetal cclico se crea un centro de asimetra adicio-
nal, lo que da lugar a otro tipo de diastereoismero en los azcares que se denominan
anmeros. En el caso de la glucosa, el C-1 (el tomo de carbono carbonilo de la forma
de cadena abierta) se convierte en un centro de asimetra. Por tanto, se pueden formar
dos anillos: -d-glucopiranosa y -d-glucopiranosa (ver la Figura 10.3). En el caso de
los azcares de tipo d representados mediante las proyecciones de Haworth con la orien-
tacin estndar, tal y como se muestra en la Figura 10.3, la designacin indica que el
grupo hidroxilo unido al C-1 se encuentra por debajo del plano del anillo; indica que se
encuentra por encima del plano del anillo. El tomo de carbono C-1 se denomina tomo
de carbono anomrico y las formas y se denominan anmeros. Una mezcla de glucosa
en equilibrio contiene aproximadamente un tercio de anmeros , dos tercios de an-
meros y <1% de la forma de cadena abierta.
Como los ismeros y de la glucosa se encuentran en un equilibrio que pasa por
la forma de cadena abierta, la glucosa posee algunas de las propiedades qumicas de los
aldehdos libres, como la capacidad para reaccionar con agentes oxidantes. Por ejemplo,
la glucosa puede reaccionar con el ion cprico (Cu2+).
O H O OH
C C
CH2OH H C OH H C OH
2+ +
Cu Cu Cu2O
H O OH
H HO C H HO C H
OH H H2O, HO
HO H H C OH H C OH
H OH
H C OH H C OH
CH2OH CH2OH
Las disoluciones de ion cprico (tambin llamadas disoluciones de Fehling) nos pro-
porcionan un sencillo test para detectar la presencia de azcares como la glucosa. Los
azcares que reaccionan se denominan azcares reductores; los que no reaccionan se
denominan azcares no reductores. Con frecuencia, los azcares reductores pueden re-
accionar de manera no especca con otras molculas. Por ejemplo, al ser un azcar
reductor, la glucosa puede reaccionar con la hemoglobina par formar hemoglobina
glucosilada. Los cambios en la cantidad de hemoglobina glucosilada pueden utilizarse
para monitorizar la ecacia de tratamientos contra la diabetes mellitus, una enfer-
medad que se caracteriza por niveles elevados de glucosa en la sangre (Captulo 25).
HOH2C CH2OH HOH2C Como la hemoglobina glucosilada, tambin denominada hemoglobina A1c,
OH
O O
permanece en la circulacin, la cantidad de hemoglobina modicada corres-
H HO H HO
ponde a la regulacin a largo plazo varios meses de los niveles de glucosa.
H OH H CH2OH En las personas que no son diabticas, menos del 6% de la hemoglobina se
O
H CH2OH CH2OH C H
H O H HO O OH O OH H3C NH O COO
H H C OH
CH3 H H R R =
H HO OH H OH H H H H C OH
HO OH H H HO H H OH
CH3 CH3 CH2OH
OH H H HN H HN OH H
C C
O O
-L-Fucosa -D-Acetilgalactosamina -D-Acetilglucosamina cido silico
(Fuc) (GalNAc) (GlcNAc) (N-Acetilneuraminato)
CH2OPO32
O O CH2OPO32
C
OH
HO C H
HO OH
Figura 10.7 Monosacridos modificados. Los monosacridos se pueden modificar OH H
mediante la adicin de sustituyentes (mostrados en color rojo) distintos de los
Glucosa 6-fosfato Dihidroxiacetona
grupos hidroxilo. Con frecuencia, estos carbohidratos modificados se expresan (G6P) fosfato
sobre las superficies celulares. (DHAP)
162
10.2 Carbohidratos complejos 163
do los carbohidratos se unen entre s para formar largos polmeros o cuando se
unen a protenas. Adems, el tomo de carbono anomrico de un azcar puede
estar unido a un tomo de nitrgeno de un grupo amino para formar un enlace
N-glicosdico. Los carbohidratos tambin pueden formar un enlace ster con fos-
fatos, una de las modicaciones ms importantes del metabolismo de los carbohi-
dratos. Por ejemplo, la fosforilacin de la glucosa es esencial cuando la glucosa se
metaboliza para producir ATP (Captulo 16). La Figura 10.7 muestra ejemplos de
carbohidratos modicados.
Aspecto biolgico
Los glucosinolatos protegen a las plantas y aaden sabor a nuestra dieta
Para defenderse de los herbvoros, las plantas, especialmente las del orden Brassi-
cales, producen una clase de glicsidos especial que se denominan glucosinolatos.
Cuando se hidroliza el glicosinolato se libera isotiocianato, con lo que se genera
un sabor cido que desanima a un insecto a seguir comiendo. El glicosinolato se
almacena separado de la enzima que lo activa, la mirosinasa; pero al daarse el
tejido, la enzima y el sustrato se combinan y se produce la reaccin de hidrlisis.
OH
Glucosinolato Isotiocianato
O O
CH2OH
O CH2OH
HN HN
OH O
XH + HO O O O + HO O O
O OH O
P P N P P N
OH O HO X O
O O O O OH O O O O
OH OH OH OH
UDP-glucosa UDP
H OH H OH
Figura 10.12 Ramificacin del glucgeno. Dos cadenas de molculas de glucosa unidas por
enlaces -1,4-glicosdicos se conectan mediante un enlace -1,6-glicosdico, con lo que se genera
una ramificacin. Los enlaces -1,6-glicosdico de este tipo se forman, aproximadamente, cada
10 unidades de glucosa, lo que convierte al glucgeno en una molcula muy ramificada.
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