Se denomina tambin

traduccin porque el
lenguaje
de
cidos
nucleicos es traducido a
lenguaje
de
aminocidos.

BIOSNTESIS DE PROTENAS
Proceso celular mediante el que se sintetiza
una protena a partir de sus aminocidos
constituyentes, utilizando RNA mensajero
como molde.
Tiene lugar en el citoplasma,
concretamente, en los ribosomas.
Paul Zamecnik

ms

Los aminocidos son activados mediante

la unin con tRNAs especficos

BIOSNTESIS DE PROTENAS
La biosntesis de protenas requiere:
mRNA. Acta como molde. En el caso de eucariotas, ha de
ser transportado desde el ncleo hasta el citoplasma.
Aminocidos. Son utilizados en forma de aminoacil-tRNAs.
Es decir, cada aminocido se une a una molcula de tRNA
especfica de ese aminocido.
tRNAs
tRNAs. Transportan los aminocidos y traducen la
secuencia nucleotdica del mRNA a la secuencia de
aminocidos de la protena.
Ribosomas. Son estructuras que proporcionan el entorno
adecuado para la sntesis. Estn formados por RNA y
3
protenas.

CARACTERSTICAS GENERALES
Los mRNAs se traducen en sentido 5-3.
Las protenas se sintetizan en sentido Nt-Ct.
Cada aminocido de la protena est codificado por un
triplete de nucletidos en el mRNA, triplete que se denomina
codn.
Cada codn del mRNA se empareja con otro triplete de bases
existente en el tRNA que transporta el aminocido
correspondiente. Este triplete del tRNA se denomina
anticodn.

CODIGO GENETICO CONTINUO Y

SIN SOLAPAMIENTO
Una vez que ha comenzado la traduccin en un codn AUG, el
resto de los codones se traducen en direccin 55-3
3 de manera
continua y sin solapamiento.
Cdigo no solapante

Cdigo solapante

MARCOS O PAUTAS DE LECTURA

En un cdigo de tripletes sin solapamiento, todos los mRNAs

tienen tres ppautas de lectura ppotenciales.
La secuencia de aminocidos codificada por cada una de las
tres pautas es distinta.

DESCIFRADO DEL CDIGO GENTICO

Polinucletido
fosforilasa

n UDP
UUUUUU (n) + n Pi

Marshall Niremberg
Premio Nobel, 1968

Poli(U) Poli-Phe

UUU Phe

Poli(A) Poli-Lys

AAA Lys

Poli(C) Poli-Pro

CCC Pro

DESCIFRADO DEL CDIGO GENTICO

Marshall Niremberg
Premio Nobel, 1968

DESCIFRADO DEL CDIGO GENTICO

Gobind Khorana
Premio Nobel, 1968

10

CDIGO GENTICO

Es la relacin entre
la secuencia de
nucletidos en el
DNA o en el RNAm
maduro
y
la
secuencia
de
aminocidos en la
protena.

11

CDIGO GENTICO

12

CARACTERSTICAS DEL CDIGO GENTICO

Es un cdigo de tripletes.
No es solapante.
Carece de puntuacin.
Es degenerado.
No es ambiguo.
Es universal (casi).
13

DEGENERACIN DEL CDIGO GENTICO

Existen 64 codones diferentes.

61 codifican aminocidos y 3 de
ellos son codones de parada.
Puesto que slo hay 20
aminocidos, esto supone que
d los
l aminocidos
i id estn

casii todos
codificados por ms de un
triplete: degeneracin del
cdigo.
14

Traducir la siguiente secuencia de RNA en las tres

pautas de lectura

5-AUGUCUGAUUCGCUAUAUCAUCCAUCGAGUU
mRNA
AUGUCUGAUUCGCUAUAUCAUCCAUCGAGUU
Pauta 1 M S D S L N H P S S
Pauta 2 C L I R Y I I H R V
Pauta 3
V * F A I S S I E

15

Qu secuencias de DNA codificaran los siguientes

pptidos?

a)MWMWW
b)MDNCEQH
c)MARGLPS

16

1. Activacin de los aminocidos

tRNA
Aminoacil tRNA sintetasas

2. Sntesis de la cadena polipeptdica

Ribosomas
Etapas: - Iniciacin
- Elongacin
- Terminacin

3. Plegamiento y modificaciones posttraduccionales

17

Componentes del aparato traduccional

-Factores proteicos:
Met

tRNAs:
adaptadores

-IFs, EFs, RFs.

-Energa,
Energa regulacin

-GTP.
-GTPasas: eIF2, eEF1a, eEF2, eRF3

U-A-C

Ribosomas:

-Factores de intercambio: eEF1bg

banco de trabajo
catlisis

-GAP (activadores de GTPasa): eIF5

mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3
18

Jos Mara Prez Freije

Iniciacin

Met

Elongacin

Gly

Met

U-A-C
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

U-A-C C-C-A
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

19

Elongacin

20

Elongacin

Met

Met
Gly

Ala

Gly

U-A-C C-C-A
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

C-C-A C-G-A
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

21

Elongacin

22

Elongacin

Met

Met
Gly

Gly

Ala

C-C-A C-G-A
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

23

Ala

Lys

C-G-A U-U-U
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

24

Elongacin

Elongacin

Met

Met
Gly

Ala

Gly
Lys

C-G-A U-U-U
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

Ala

Lys

U-U-U
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

25

26

Terminacin

Terminacin
Met
Gly

Met
Gly

Ala

Ala

Lys -COO-

Lys

U-U-U
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

27

U-U-U
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

28

Terminacin
Met
Gly

Ala

Lys -COO-

U-U-U
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

29

1. Activacin de los aminocidos

tRNA
Aminoacil tRNA sintetasas

2. Sntesis de la cadena polipeptdica

Ribosomas
Etapas: - Iniciacin
- Elongacin
- Terminacin

3 Pl
3.
Plegamiento
i
y modificaciones
difi
i
posttraduccionales

30

Activacin de los aminocidos

aa

Unin de los aminocidos a sus tRNAs especficos

1. Activacin del grupo carboxilo

U-A-C

anticodn
nti dn

2. Asigna una etiqueta nucleotdica a los aminocidos:

interpretacin del cdigo gentico
Aminoacil-tRNA sintetasas

Aminocido + tRNA + ATP + H2O aa-tRNA + AMP + PPi

31

10

ESTRUCTURA DE LOS tRNAS

3

A
C
C
5 Pu

pG

Existe un tRNA especfico para cada

aminocido.

Brazo
aminocido Diseo estructural comn:

RNA de unos 80 nucletidos

Brazo
TC

Brazo D
Pu

C
G

G*
G A

T C

muchos nucletidos modificados posttranscripcionalmente

muchos nucletidos inusuales: inosina,
seudouridina, ribotimidina.

El extremo 5 est fosforilado y

generalmente es G (pG).
El extremo 3 tiene el hidroxilo libre.

Posicin de
balanceo

Py
U

Pu

Brazo
anticodn

Anticodn

La secuencia del extremo 3 es CCA.

El aminocido se va a unir al extremo
3-OH.
32

ESTRUCTURA DE LOS tRNAS

3

A
C
C
5 Pu

pG

Brazo
aminocido

C
G

G*
G A

Posicin de
balanceo

Brazo aminocido
5
3
3

Brazo
TC

Brazo D
Pu

Brazo
TC

Py
U
5

Pu
3

T C

Brazo
anticodn

Anticodn

Brazo D

Brazo
anticodn

Anticodn
33

11

INTERACCIN CODN-ANTICODN

Las dos 1as bases del codn se

emparejan de forma estndar,
segn las leyes de WatsonCrick, con las dos ltimas
bases del anticodn.

34

HIPTESIS DEL BALANCEO DE LA

3 BASE DEL CODN
Pero en cuanto a la interaccin entre la 3 base del codn y la
11 del anticodn, son posibles varias combinaciones:
1 base del anticodn
C
A
U
G
I (inosina, purina)

3 base del codn

G
U
A G
U C
U, C A
35

12

1 base del anticodn

C
A
U
G
I (inosina, purina)

3 base del codn

G
U
A G
U C
U, C A

36

ESTRUCTURA GENERAL DE LOS AMINOACIL-tRNA

Extremo 3 del tRNA
Adenina

Grupo
aminoacilo

Brazo
aminocido
Brazo D

Brazo
TC
Brazo
anticodn

El aminocido queda
unido
mediante
un
enlace ster al extremo 3
del tRNA.
37

13

Aminoacil-tRNA sintetasas
Clase II

Clase I

2
2

Arg, Cys,
Gln, Glu,
Ile, Leu,
Met, Trp,
Tyr, Val

Clase I

Clase II
Ala, Asn,
Asp, Gly,
His, Lys,
Phe, Pro,
Ser, Thr
38

Reaccin de activacin de los

aminocidos
Aminocido
1. Activacin

ATP
PPi

2 Pi

Aa-AMP
2 Transferencia
2.

tRNA
AMP

Aa-tRNA
39

14

Especificidad de las aminoacil tRNA

sintetasas
La especificidad de la traduccin depende de las
aminoacil-tRNA sintetasas. En el ribosoma no se
comprueba la identidad del aminocido unido al tRNA.
Especificidad de aminocido
Especificidad de tRNA
40

Especificidad de aminocido
Selectividad Aminocido
(10-2)
Aa-AMP

Aa + AMP

Aa-tRNA

Aa + tRNA

Correccin
de errores

(10-4)
41

15

Reconocimiento de los tRNAs

-Mutagnesis de tRNAs
-Estructura 3-D
Brazo aceptor

Brazo anticodn

Gln tRNA sintetasa

42

Reconocimiento del tRNAAla

3

76

5
5

tRNAAla

3 G U 70

3
60

10

76

5
1
3 G U 70

20

5
30

40

10

66
13
43

16

Estructura general de los ribosomas

tRNAs
50S
30S

mRNA
44

Estructura de los ribosomas a alta

resolucin
50S

protenas

30S

tRNA

anticodon

Salida del
pptido

RNA
45

17

Composicin de los ribosomas

Procariotas
70S

18 nm

Eucariotas
80S
23 nm

Subunidad 50S

Subunidad 60S

RNA 23S (3.2 kb)

50S

RNA 5S (0.12 kb)

RNA 28S (4.7 kb)

60S

RNA 5S (0.12 kb)

36 protenas (L1-L36)

RNA 5.8S (0.16 kb)

49 protenas (L1-L49)
(L1 L49)

Subunidad 30S
RNA 16S (1.54 kb)
21 protenas (S1-S21)

Subunidad 40S
30S

40S

RNA 18S (1.9 kb)

33 protenas (S1-S33)
46

Estructura y funcin de los rRNAs

Funcin estructural
Armazn del ribosoma
Posicionamiento de mRNAs

Funcin cataltica
Peptidil transferasa
(el ribosoma es un ribozima)
rRNA 16S
47

18

Sntesis ribosomal de la cadena

polipeptdica
mRNA: 5

Protenas: NH3+

COO-

Etapas:
1 Iniciacin
1.
2. Elongacin
3. Terminacin

48

Iniciacin de la sntesis de protenas

Ensamblaje de componentes
Seleccin del codn de iniciacin (AUG)
Regulacin
Regulacin
AUG iniciador: tRNAiMet
AUG internos: tRNAMet

Bacterias: formil-metionina (fMet)

N10-f-THF

Met +

tRNAfMet

THF

Met-tRNA
Met
tRNAfMet

Met-tRNA sintetasa

fMet tRNAfMet
fMet-tRNA
transformilasa

Eucariotas:
Citosol: Met (2 tRNA)
Mitocondrias y cloroplastos: fMet
49

19

INICIACIN

El codn de iniciacin AUG va a

ser
reconocido
por
un
formilmetionil-tRNA
en
procariotas y por metionil-tRNA en
eucariotas Este tRNA iniciador,
eucariotas.
iniciador
denominado tRNAf es distinto del
que transporta las metioninas en
posiciones internas de la protena,
denominado tRNAm.
50

Iniciacin: diferencias entre

procariotas y eucariotas
Procariotas

Eucariotas

mRNA
Mensajeros policistrnicos
Secuencia de Shine-Dalgarno

mRNA
Mensajeros monocistrnicos
cap y poliA

SD AUG

SD AUG

3F
Factores
t
sd
de iiniciacin
i i i

cap

AUG

AAAAAA

10 Factores
F t
d
de iiniciacin
i i i

51

20

Iniciacin de la traduccin en procariotas

IF-1

IF-3

Subunidad
30S
3
S

fMet

SD AUG

IF-2

IF-1

SD AUG

P IF-1

Secuencia de Shine-Dalgarno

fMet

GDP

IF-2-GTP

mRNA

P IF-1

IF-3

fMet

IF-3

mRNA
5

IF-2-GTP

AUG

Subunidad
50S

AA

Codn de iniciacin mRNA

(5) G A U U C C U A G G A G G U U U G A C C U A U G C G A G C U U U U A G U (3)
--- --- --- --- --- --- ---

rRNA 16S

U C CUCCA
C
U
U
A
A
OH
G . . . OH-5
3

Sitio P
52

Traduccin en polirribosomas
circulares eucariotas
40S

eIF3
60S

eIF4E
cap
5 no codificante

eIF4G PAB
eIF4A

AAAAAAAA

3 no codificante

53

21

Mecanismos alternativos de
iniciacin en eucariotas: IRES
IRES: Sitios internos de
entrada
d d
dell ribosoma
b

cap

Iniciacin independiente de cap

Estructuras diversas

40S
eIF3
AAAAAAAAAAA
eIF4G PAB

IRES

Permiten mRNAs policistrnicos

eIF4A

60S
AUG

54

Elongacin

Met

Gly

U-A-C C-C-A
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

55

22

Elongacin

Met
Gly

U-A-C C-C-A
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

56

Elongacin
- 3 Factores de elongacin
- 2 GTP/ciclo
Met
Gly

U-A-C C-C-A
mRNA 5....-A-U-G-G-G-U-G-C-U-A-A-A-U-A-A.....3

57

23

Elongacin en procariotas
aa2

fMet

GDP

aa2

Tu-GTP
GTP

H
C=O
NH
R1-C-H
O=C
O
C
O

GTP

Ts

E UAC
AUG
P AA

Pi

fMet

aa2
E
AUG

EF-G

EF-G

GDP

GTP

fMet

aa2
E

AA

..

NH2
R2-C-H
O=C
O

fMet aa2

Tu-GDP

Tu-GTP

E UAC
AUG
P AA

Sitio E
E Sitio
Sitio
SitioPP Sitio
SitioAA

UAC
AUG
P

AA
58

Factores de elongacin
Bacterias

Eucariotas

GTPasa

EF-Tu

eEF-1

Intercambio
GDP/GTP

EF-Ts

eEF-1

Traslocasa

EF-G

eEF-2

59

24

Terminacin de la traduccin en procariotas

-COO-

UAG
AA

E
P

UAG
AA

RF3
GTP GDP

UAG

A
P A

EF-G
EF-G

GDP

IF-3
IF-3

UAG

P AA

GTP

UAG

P AA

60

Antibiticos inhibidores de la traduccin

Cloranfenicol

Inhibe la peptidil transferasa en ribosomas 70S

Cicloheximida

Inhibe la peptidil transferasa en ribosomas 80S

Eritromicina

Impide translocacin del ribosoma, se une a 50S

Puromicina

Terminacin prematura. Anlogo de aa-tRNA

Tetraciclina

Elongacin. Une 30S, impide unin de aa-tRNA

Estreptomicina
Gentamicina,
Iniciacin: impiden la entrada de fMet-tRNA.
Kanamicina,
Elongacin: errores de lectura. Efecto bactericida
61
Neomicina

25

Eficacia del aparato traduccional

Escherichia coli :
100 residuos: 5 segundos
90% de la energa dedicada a biosntesis
20.000 ribosomas
100 000 molculas
100.000
l l de
d IFs,
F EFs
EF y RFs
RF
200.000 molculas de tRNA

62

PLEGAMIENTO
Durante o tras su sntesis, la
cadena polipeptdica va
adoptando progresivamente
su conformacin nativa y
funcional.
En
este
plegamiento participan unas
protenas
denominadas
chaperones.

63

26

MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
Eliminacin en la mayora de los
casos de la formilmetionina en
i
d la
l metionina
i i
procariotas
y de
iniciadora en eucariotas en el
extremo N-t.
Fosforilacin de ciertos residuos
de Ser, Thr y Tyr en algunas
protenas.

64

MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
Carboxilacin de algunos residuos de Glu en ciertas protenas.

65

27

MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
Unin de grupos lipdicos (isoprenilacin, palmitoilacin,
miristoilacin)

66

MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
Glicosilacin (adicin de glcidos) de residuos de Asn
mediante enlaces N
N-glicosdicos
glicosdicos o de residuos de Ser o Thr
mediante enlaces O-glicosdicos.
Formacin de puentes disulfuro.
Modificacin proteoltica. Algunas protenas, como la
insulina, la tripsina, la quimotripsina, se sintetizan como
precursores inactivos, y han de ser procesadas
proteolticamente para dar sus formas activas, ms
pequeas.
67

28

Envo de protenas al Retculo Endoplsmico

68

Pptidos seal

69

29

Ruta de secrecin proteica

70

Envo de protenas al Ncleo

71

30