Gentica 2015/2016 GRUPO A

Bloque 13. Genmica

Bloque 13A. Genmica estructural
Genmica estructural y funcional. Mapas fsicos. Estrategias de secuenciacin.. Bioinformtica.
La Genmica es la rama de la Gentica que tiene como objetivo la caracterizacin molecular
sistemtica de los genomas. El anlisis genmico es importante porque ofrece una visin general de
la arquitectura gentica de un organismo y a la vez facilita la obtencin de informacin bsica y
aplicada sobre su biologa. El anlisis genmico parte normalmente de tcnicas de menor resolucin
para avanzar hasta tcnicas de mayor poder de resolucin. En la mayor parte de los casos, y sobre
todo en el caso de los grandes y complejos genomas de eucariotas superiores, el anlisis genmico se
inicia con la elaboracin de mapas genticos y/o fsicos.
El mapeo gentico emplea tcnicas genticas para construir mapas que contienen la posicin de
genes y otras caractersticas de la secuencia del genoma en cuestin. Las tcnicas genticas incluyen
cruzamientos experimentales o, en el caso de los seres humanos, el anlisis de genealogas. El mapeo
fsico emplea tcnicas de Biologa Molecular para examinar directamente las molculas de ADN que
constituyen el genoma, con el mismo objetivo: construir mapas que incluyan la posicin de diversas
caractersticas de la secuencia del genoma. Los mapas fsicos y los mapas genticos se complementan
entre s de forma que proporcionan un marco de trabajo a partir del cual puede obtenerse la secuencia
completa de un genoma.
Las dos estrategias bsicas empleadas para la secuenciacin de genomas son la secuenciacin de
clones al azar (tambin denominada secuenciacin de genoma completo por "escopetazo" o
"perdigonada", whole-genome shot-gun sequencing) y la secuenciacin de clones ordenados (tambin
denominada "clon a clon"). Cada una de estas estrategias tiene sus ventajas y sus limitaciones, y en
algunos casos se emplean estrategias hbridas con componentes de ambas.

Bloque 13B. Genmica funcional

Transcriptmica y protemica.
El anlisis genmico no se limita a obtener la secuencia completa de ADN de un organismo, sino
que tambin persigue comprender qu contiene un genoma y cul es su funcin. Estos son los
objetivos principales de la denominada Genmica Funcional. La localizacin de los genes en un
genoma se denomina anotacin, y se lleva a cabo mediante combinacin de tcnicas bioinformticas
y experimentales. Una vez localizados los genes de un genoma ha de determinarse su funcin, y para
ello de nuevo se emplea una conjuncin de anlisis informticos y experimentales. Entre los primeros
destaca la deteccin de genes homlogos en otros organismos mediante bsquedas en bases de datos.
Adems de localizar cada uno de los genes de un genoma y determinar su funcin, la genmica
funcional se propone comprender cmo opera el genoma en conjunto, especificando y coordinando
los distintos procesos bioqumicos que tienen lugar en la clula y el organismo. Los estudios de
actividad global del genoma analizan el transcriptoma y el proteoma, ambos sintetizados y
mantenidos por el genoma. El transcriptoma consiste en todos los ARNm presentes en una clula en
un momento determinado. El proteoma es el producto final de la expresin del genoma y comprende
todas las protenas de una clula en un momento determinado.
En el estudio del transcriptoma juegan un papel relevante las micromatrices de ADN (DNA
microarrays), que consisten en micromuestras de ADN dispuestas en formaciones ordenadas sobre
un soporte rgido, normalmente un "chip" de cristal del tamao de un portaobjetos de microscopio.
La hibridacin del chip de ADN con muestras de ARN obtenidas de distintos tipos celulares o en
distintas condiciones fisiolgicas permiten determinar qu genes se transcriben y en qu momento.
El estudio del transcriptoma proporciona informacin sobre qu genes estn activos en una clula
en un momento dado, pero no da una indicacin exacta sobre las protenas presentes. La metodologa
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para caracterizar el contenido en protenas de una clula est basada en una combinacin de
electroforesis y espectrometra de masas. En primer lugar las protenas de la muestra a estudiar se
resuelven en un gel bidimensional, y cada protena individual se extrae del gel y se digiere con una
proteasa. El resultado es una mezcla de pptidos que a continuacin se analiza mediante una versin
de espectrometra de masas denominada "matrix-assisted laser desorption ionization time-off-flight"
(MALDI-ToF). La comparacin de los datos de los pptidos detectados con los de una base de datos
que contenga los que codifica el genoma en cuestin proporciona la identificacin ms probable de
cada protena. El anlisis protemico se complementa mediante el estudio de las interacciones entre
distintas protenas.
Bibliografa bsica
Pierce, B. A. (2011). Fundamentos de Gentica. Conceptos y Relaciones, Editorial Mdica
Panamericana, Madrid.
Pierce, B. A. (2009). Gentica: un enfoque conceptual, 3 edn, Editorial Mdica Panamericana,
Madrid.
Klug, W. S., Cummings, M. R., and Spencer, C. A. (2006). Conceptos de Gentica, 8 Edicin.
Prentice Hall Iberia, Madrid.
Griffiths, A. J. F., Miller, J. H., Suzuki, D. T., Lewontin, R. C., and Gelbart, W. M. (2002). Gentica,
7 Edicin (3 Edicin en Espaol) (Madrid, Interamericana McGraw-Hill).
Griffiths, A.J.F., Gelbart, W.M., Miller, J.H. & Lewontin, R.C. (2000). Gentica Moderna. McGrawHill - Interamericana, Madrid.
Snustad, D. P., Simmons, M. J. and Jenkins, J. B. (1997) Principles of Genetics, John Wiley & Sons
Inc., New York.
Tamarin, R.H. (1996). Principios de Gentica . Editorial Revert S.A., Barcelona.
Bibliografa complementaria
Brown, T. A. (2008). Genomas, 3 edn, Editorial Mdica Panamericana.
Strachan, T. and A. P. Read (2006). Gentica Humana, McGraw Hill Interamericana, Madrid.
Luque, J. and Herrez, A. (2001) Texto ilustrado de Biologa Molecular e Ingeniera gentica:
conceptos, tcnicas y aplicaciones en ciencias de la salud, Ediciones Harcourt S.A., Madrid.
Lau, N. C. and Bartel, D. P. (2003) Interferencia de ARN. Investigacin y Ciencia, 325 (Octubre), 613.
Friend, S. H. and Stoughton, R. B. (2002) Micromatrices de ADN. Investigacin y Ciencia, 307
(Abril).

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