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PROFESOR ENRIQUE GONZALEZ CLASE 2

REGULACIN DE LA
EXPRESIN GENICA.
Hay
distintos
genes,
los
constitutivos o housekepping
para funciones basales de la clula,
protenas
que
desarrollan
y
necesitan si o si, estos no van a ser
regulados
porque
siempre
se
necesitan activos
Hay un segundo grupo que son los
de expresin regulada, que son
genes que dependen de las
situaciones que se encuentran los
organismos, se
expresan
bajo
alguna
demanda,
cuando
se
necesitan, son importantes porque
son los que permiten a la clula;
responder a las condiciones que
cambian fuera de esta los permiten
acomodarse, estos se expresan bajo
ciertas seales.
Hay miles de mecanismos de
regulacin, pero todos tienen cosas
en comn, se habla de un grupo de
organismos
que
regulan
la
transcripcin, donde la decisin es
si se transcribe o no se transcribe,
este es muy eficiente porque
sintetizar protenas es un proceso
que tiene un costo energtico
elevado. Por consiguiente, si no
necesito producir la protena se
corta de raz y corto la etapa uno
del proceso de expresin gnica, la
transcripcin.
La regulacin de la expresin gnica
esta ejercida a travs de elementos
regulatorios adicionales. Un gen
como el primero de la imagen sera
un gen housekepping, ya que no
presenta
regulacin,
pero
el
segundo si lo est por estos
elementos regulatorios llamados
elementos cis, porque es una

secuencia adyacente al gen que

regulo. Este es un target, una
secuencia blanco.
Este es el blanco de un elemento
trans, que generalmente es una
protena, el cual se une al elemento
cis, y el efecto de esa unin puede
ser de dos tipos. Positiva, por ende
se une el elemento trans y se activa
la transcripcin, siendo el elemento
trans el activador, que con la
interaccin de los dos elementos
activa la transcripcin, en los libros
se observara como up-regulation,
si por el contrario este elemento
trans es un represor y se une al
elemento cis, producto de esa
interaccin se apaga o tambin
llamado
down-regulation,
entonces la regulacin est hecha a
travs de modular la transcripcin si
el gen se transcribe o no, esto por la
interaccin de un elemento trans
con cis.
En
las
bacteria
se
tiene
particularidades, con una formacin
policistrnica,
aqu
se
tienen
elementos cis y trans pero aqu
poseen una subdivisin, donde
primero se tiene un elemento en cis
que son activadores, donde el
efecto es que esto se transcribe, por
otro lado tengo un segundo
elemento que se encuentra medio
encima del promotor, que se llama
operador, que es un sitio de unin
de represor, donde aqu el efecto
regulatorio se ejerce por un
elemento
fsico,
teniendo
una
protena que tapa el promotor,
entonces la la subdivisin sigma de
la RNA polimerasa no puede leer el
promotor. Y en ese caso el promotor
no funciona y no ha transcrito, esto
me permite generar un juego.
Donde se pueden combinar efecto

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de activadores y represores, y
comn un elemento cis, que esta
mantener o establecer distintas
localizado antes del promotor y es lo
opciones, donde se puede despejar
que se denomina UAS, uptin
el operador y el activaron teniendo
activator sistem; todos activan a
una expresin mxima, un modo de
elementos similares uniendo un
juego que permiten reaccionar y
elemento cis con uno trans, aqu en
adaptar un gen a las condiciones.
la UAS est pegado una protena
En el gen de la lactasa, con 3
que se llama GAL 4, entonces este
enzimas relaciones en un policistrn
es una protena activadora que
y se necesitan las 3 se ocupa un
cuando se une al UAS activa la
mecanismo que ces nados cosas,
expresin de estos genes; en la
los niveles de lactosa y glucosa.
situacin sin galactosa, estos genes
estn bloqueados, pero ocupe a
Una vez que se establece esta
travs de esta va, donde esta
situacin para bacteria, la segunda
protena GAL
tiene un dominio
situacin
es
de
mecanismo
donde se une una protena GAL80,
eucariotas,
donde
posee
una
entonces en esta situacin el GAL80
diferencia, donde en la bacteria los
que est unido a GAL4 no puede
3 genes que se van a expresar
activarse; entonces sin galactosa
simultaname
estn
en
un
donde no se quiere activador de
policistron, en levadura no existe
estos genes porque no sirven, ya
este ya que es eucarionte, si se
que son genes para meter galactosa
observa en este caso
a la va glucolitica, entonces se
ocupa GAL80 que es un represor
La
levadura
toma
glucosa,
esconde los genes GAL, cuando esto
transforma
piruvato
haciendo
se produce sube los niveles de GAL
glucolisis, y es su va favorita, pero
y aumenta la expresin de GAL3,
hay un montn de azucares que
este responde encontes de la
puede entra a otro nivel como la
concentracin de galactosa, este es
galactosa, esta entra por va
una protena quinasa, y tiene como
permitiva, a galactosa 6 fosfato,
blanco GAL80, entonces esta va y le
luego glucosa -fosfato y entra a la
pega glucofosfatos a GAL80, cuando
va glucolitica. La levadura como
se fosforila en ese instante se
casi todos los organismos vivos
suelta, activndose GAL4, que une
utiliza como fuente nutricional
una protena TFIID, capturando el
favorita la glucosa, a excepcin de
factor que inicia, y es el que tiene
los espermios que utilizan fructosa,
que unirse al promotor y reconocer,
esto es por supervivencia de
generando una induccin de los
especie, aqu las clulas de los
genes GAL expresando la protena; y
organismos no compiten con los
la galactosa se mete a la glucolisis,
espermios por la fuente nutricional.
bajando de nuevo los niveles,
Hay varios genes que se laman GAL
volvindose as al ciclo y estos
(1, 2, 7,10) todo en forma
mecanismo funciona porque existe
monocistrn, (promotor-terminador),
una competencia de FIID y GAL80
sea solo hay una protena codifica,
por unirse a GAL 4.
incluso todos estos genes estn en
genes diferentes, todo tienen en

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Como se observa se pueden tener
clula se activan un grupo de genes,
sutilezas,
pero
tambin
son
miles, y estos no son los mismos o
interaccin entre elementos en cis y
exactamente los mismo en las
trans dependiendo del organismo.
distintas clulas,
ya que son
Tiene UAS Y URS. Como el de la
funcional
y
estructuralmente
exoquinasa que es activado en altas
distinta, no se activa el mismo
concentraciones de glucosa, con
programa gentico uno con el otro.
protena glucoliticas, convirtindose
En el ser humanos hay 30.000
en piravuta y este en etanol, cuando
genes distintos y todas las clulas
llega a concentraciones muy altas y
tienen exactamente la misma
hay baja concentracin de glucosa,
informacin genticas, pero son
se tiene un mecanismo de represin
diferente en estructuras y funciones
que impulsa reprimir la exoquinasa,
ya que no utilizan los 30.000 genes
que como da inicio a la glucolisis lo
solo una fraccin del gen, donde
corta de raz. Estos son juegos UAS
digamos utiliza 10.000, donde hay
que unen activadores y URS que
una parte entre las clulas que son
unen represores obteniendo aun
iguales, estos probablemente son
regulacin fina.
genes constitutivos, pero hasta ah,
EUCARIOTES
despus hay clulas que tienen
funcionales en una y otra, por
Aqu aparece la primera gran
ejemplo en la neurona la va para
dificultad,
que
es
que
los
neurotransmisores estn activos en
organismos
son
pluriceluares,
la neurona, no tienen porque
entonces
poseen
rganos
funcionar en un fibroblastos por el
especializados, que cumplen ciertas
otro lado el gen de fibronectina est
caractersticas
funcional,
en el fibroblasto y no en la neurona
apareciendo la diferenciacin y el
desarrollo, donde a partir de una
Entonces primera regulacin.esta la
clula, que es precursora, se
primera
regulacin,
pregunta
generan varias clulas hijas, sea a
Dnde estn su ropa de invierno?,
partir de una clula totipotencial,
esta guardada, porque no se van a
donde se generan muchos destinos.
usar, si hago esta comparacin
Estas van hacia muchos caminos
primero se tienen todo el genoma
distintos
y
estn
asociados
en una clula organizado como
programas de activacin, donde se
cromatina, entonces todo el genoma
activan
genticamente,
por
en cromatina est organizado en
ejemplo, si yo quiero ir hacia
fibra de 30nm o solenoide, esto
neuronas, tengo que desarrollar
significa que el DNA asociado a
determinadas
estructuras
y
cada cromosoma esta enrollado en
funciones, estas son determinadas
un cromosoma de histonas, esto
por protenas que estn codificadas
nucleosomas al lado del otro por
a un grupo de genes, si quiero ir a
histona H1 se organizan en fibras
fibroblasto estas son distintas a la
solenoide que es lo que se observa
neurona,
teniendo
protenas
como cromatina dispersa en nucle
diferentes que estn codificadas en
de una clula en interfase. Esta se
genes distintos y para llegar de una
separa
en
dos
formas,
una
clula precursora totipotencial a una
heterocromatina y una eucromatina,

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entonces la diferencia entre ella
La gracia es que depende del
est en que, supongamos que
estado de la clula se puede hacer
tenemos fibras solenoidal una a lado
que la heterocromatina forme
del otro, y si quiero transcribir un
eucromatina y tambin al revs. Un
gen primero para transcribirlo
mecanismo regula estos, este se
necesito que el factor TFIID se
llama remodelacin de cromatina.
pegue en un promotor, entonces
Este es un invento muy complicado,
como va a encontrar el elemento
con un montn de mecanismo
TAT de un gen que est metido all
dnde participan un montn de
de dentro, en cambio pueden haber
remuneradores de diferente tipo, y
varias con un organizacin similar,
esto
es
lo
que
se
llama
pero desprendindose hay una
remodelacin epigentica, que est
regin donde el DNA est desnudo y
sobre la gentico, aqu se puede
no forma nucleosoma, entonces el
modificar la cromatina y esta
primero
es
heterocromatica
o
genera cambio en el patrn de
cromatina cerrada o inactiva y la
expresin
gentica,
pero
no
segunda eucromaitnca, abierta o
modifican la expresin gentica,
activa,
en
este
hay
zonas
estos cambios son heredables, esto
regulatorias que permiten el acceso
cambia el estado de metilacin
a las protenas del DNA, entonces lo
cambiando el estado de actividad
genes que no se usan se colocan
de
la
cromatina
pasando
como
genes
inactivados
o
informacin de genes activado y
heterocromatina, no se expresan, al
reprimidos.
contrario loa genes que voy a usar
Esto se hace con el estado de
se dejan en estado accesible, estos
acetilacin de histonas, donde si se
se colocan en cromatina activa.
libera un nucleosoma, donde las
El caso ms tpico, donde si
protenas son extremadamente ricas
presenta a un cristiano infectado
en glicina y noseuqem as teniendo
con el virus Sb40 con un DNA de mil
muchas cargas positivas, donde
pares
de
bases
que
infecta
estos aminocidos bsicos estn
primates, monos y humanos, se
protonados teniendo carga positiva,
aloja en las clulas renales, si se
aqu el DNA esta enrollado con una
observa se ve que el cromosoma de
vuelta y media en el nucleosoma,
este
individuo,
el
nucle
se
esto es porque el nucleosoma es
encuentra como un collar donde el
postivo y el DNA negativo porque
DNA esta enrollado entorno al
est unido con enlace fosfodiester
ncleo y una regin suelta, todos los
con grupo fosfato en pH bsico
genes del virus se encuentra en las
estn desprotonados, teniendo as
politiars, son 5 genes, y en la regin
una interaccin electroesttica. Esto
suelta, est el poror LEFt y Rifht que
permite fcilmente enrollar el DNA
transcribe genes hacia los lados y
al
nucleosoma
y
tener
esto
entre medio el origen de replicacin.
compactado, y lo que se hace en
Estando este promotor accesible,
este caso es que se acetila o
esto
se
encuentra
en
la
desacetila
histonas,
y
en
la
eucromatina.
remodelacin de cromatina lo que
se hace es tomar un core con H3 y

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en menor medida en H4, que tienen
La regulacin comnmente no es de
colas que son lisinas con cagas
uno o dos genes, son miles, se
positivas y estas se relacionan con
activan regiones, entonces cuando
el DNA, ahora la lisina como tiene
est en un programa activador de
un grupo R y en la punta que
diferenciacin y desarrollo que va a
cuando
esta
protonados
se
diferenciar a una neurona se activa
encuentran HH+3, entonces lo que
entonces se van prendiendo y
se puede hacer es neutralizar la
apagando genes a medida que se
carga elctrica, colocando un grupo
est camino al desarrollo hasta que
acetilo, donde si yo tengo CH3llegan a un estado final donde se
COOH y se hace reaccin con esto
ocupan estos genes siempre.
se puede sacar el OH y uno den los
Al modelar la cromatina dejo una
protones, obtenido el grupo HH-COregin accesible acromatina, Cul
CH3, liberando agua, y la carga
ser?, algunos dicen el bloque TATA,
elctrica que haba aqu ya no
dnde la protena que accede es la
existe,. Supongamos que acetilamos
protena TFIID, pero en trminos
las
colas
de
las
histonas,
generales lo que se deja disponible
neutralizndola y no puede enrollar
es el elemento en cis. Entonces
el DNA que se pega con cargas
cuando se hace esta transicin lo
elctricas.
En
conclusin,
el
que se deja disponible es un
nucleosoma se desarma, pasando a
elemento es cis, que puede ahora
que sea eucromatica, para hacerlo
ser objeto de un elemento en trans,
necesitas un grupo llamado HAT,
generando una interaccin que la
histona acetil transferasa. As que
regulacin, si hay un activador se
como
este
se
puede
ir
a
hace una up-regulation y si se une
heterocromatina con un grupo de
un represor se va a hacer una downHDA, histonas deacetil, que hacen la
regulation,
reprimiendo
la
reaccin contraria sacando el grupo
expresin, sea finalmente igual se
acetil o poniendo del grupo amino,
llega a la interaccin entre estos dos
que vuelve a estar cargado y la
elementos.
cromatina se vuelve a enrollar. Aqu
hay un juego entre HAT y HAD, la
Esta regulacin viene del elemento
perima pasando de inactiva a activa
cis, ya que depende de si esta
y la segunda de activa a inactiva.
visible o no, si esta FIID o cualquier
cosa, pero el elemento en cis no es
Blablabl ver en grabcion.
accesible no hay transcripcin. La
Volviendo a lo anterior dicho la
regulacin por trans primero fue
neurona que necita en gen de
encontrado en el virus Sb44, este
acetilcolina
probablemente
este
estaba al lado del ori. Y es que este
activa y en el hepatocito este gen
virus funciona ms o menos as.
va a ser inactivo y esto quiere decir
Lo voy a marcan con un enhancer
la fraccin de cromatina activa e
que significa aumentador, este
inactiva entre dos clulas distintas
fsicamente es una secuencia de 73
es diferentes; y yo puedo mandar o
pares de bases que estn localizada
hacer transiciones.
a una determinada distancia del
promotor, derecha o izquierda y lo

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que hace es unir un activador y
cuando se tienen una situacin de
efecto desactivador es que la unin
liberacin de grupo glucocorticoide,
del
TFIID
se
de
aumentada
se produce la blaabl si como osn
notablemente, teniendo un cambio
sifunioor vas sanguneas , llega a
en la conformacional de DNA,
una clula que va a resonar,
afectando en la estructura de la
supongamos el hepatocito que
doble helice, como por ejemplo yo
responde por el receptor y el
tengo B-DNA que es dextrgiro y
receptor de glucocorticoides
tiene 10 pares de bases por ciclo,
As o hay enhancer que pasan de
puedo hacer que sea Z-DNA donde
OOF A ON, hay en eucariota
ahora es levgira y tiene 12 pares
elemento que se llaman silencers,
de bases por vuelta, eso hace el
que hacen el efecto contrario de ON
virus, y esta regin entera que pase
a OFF, que se une a determinado
de B a Z, se llama as porque queda
sitio.
como un zigzag, generando un
cambio conformacional en el DNA.
Si se analiza la estructura de los
Producto de esto se une con ms
genes se va a ver que los enhacner
eficiencia el TFIID al promotor, con
estn muchas veces sobre juntos
ms velocidad o menos TFIID. Esta
con los silencers, entonces se tiene
es al gracias de los enhancer y lo
una situacin enhancer y silencers,
que lo hace diferente a un UAS es
el tema es que si yo tengo un
que la UAS se localiza entre 300 y
represor instalado lo que se tiene es
500 pares de base rio arriba es
una protena puesta sobre le
uptin pero poco uptin, en cambio el
silencer, y en este estado un
enhancer en general pueden ser
activador nunca va a poner
10.000 pares de base en algunos
anclarse, la regulacin consiste en
casos 50.000, lo que quiere decir
una
guerra
entre
represores
que el elemento cis enhacner puede
unindose al silencer o activadores
estas localizado a distancia enorme
unindose al enhancer, y esto
del gen que regula, adems se
finalmente
lo
determinan
la
puede localizar downstrign (20.000),
cantidad
de
activadores
y
sea puede estar rio arriba o rio
represores
en
un
momento
abajo, por lo tanto este funciona a
determinado
largas distancia, balab me perdi
En regulacin no se puede hablar de
estos son especficos para un grupo
un evento, sino que son redes
determinado de gen
regulatorias, entonces se tienen
El elemento cis revisa un notacin
diferentes jerarquas, si se quiere
demo RE, este es un enlace, un
pasar de un estado de OFF a ON, se
elemento
cis
pero
bajo
tienen varias opciones uno pude ser
denominacin
directa,
es
un
el uso de un activador, que hace la
elemento
de
respuesta,
un
transicin y un represor impide que
enhancer es un GRE, elemento de
eso ocurra, y cuando se artiuccin
respuesta al grupo glucocorticoide,
redes regulatoria la parte del
ya que un organismo eucariota se
activador es poco frecuente, siendo
acvnpor repsues ta trusncudcion de
el aoyrtidro el de un facto de
eseales, hay una coordinacin,
transcripcin
que
reprime
el

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represor,
obtenindose
una
activacin.