Biologa

Celular

Unidad 2
Protenas: Clasicacin, estructura y funcin.

RdeA: Relaciona las protenas como componentes qumicos de los seres
vivos y de la clula, de acuerdo a su funcin.

Protena
Son polmeros de
aminocidos (monomeros).
ConsDtuidas por C,H,O,N y en
algunos casos por S.
Un grupo amino (-NH2) y por
un grupo carboxilo (-COOH).

Estructura de los 20 Aminocidos

Estructura bsica de un aminocido

Carbono
R
O

H
N

C
OH

H
H

Grupo
amino

Grupo
carboxilo

Los aminocidos Denen la misma estructura fundamental,

diferencindose slo en el grupo R o cadena lateral.

Ejemplos de Aminocidos con DisDntos grupos R

Polares sin Carga

Carga Nega<va

No Polares

Carga Posi<va

(Alberts B et all, 2003)

(Alberts B et all, 2003)

(Alberts B et all, 2003)

(Alberts B et all, 2003)

Los aminocidos se unen entre s mediante

enlaces pep?dicos
grupo amino (NH2) de un aminocido
grupo carboxilo (COOH) de otro aminocido

enlace covalente CO-NH

Enlace pepVdico
OH

enlace
pepVdico
OH

SH

CH2

CH2

H
H

(a)

CH2

H
C C

H O

H
C C
H

OH H

dipp<do

OH
DESMOSOMES

H2O
OH

DESMOSOMES
DESMOSOMES

CH2
H

H
(b)

Cadenas
laterales

enlace SH
pepVdico
CH2
CH2

OH

Amino terminal
(N-terminal)

H
C

OH

Carboxilo terminal
(C-terminal)

trippDdo

esqueleto

Una cadena Polipep?dica resulta de la repe<cin de un

Esqueleto Central y Cadenas Laterales Par<culares

Las protenas se organizan en cuatro niveles crecientes

de complejidad
Nivel primario, o estructura primaria: es la secuencia o cadena de aminocidos que
determina la protena; si vara el orden, el nmero, o el Dpo de aminocidos, cambia la
protena.

Nivel secundario o estructura secundaria: la cadena de aminocidos se dobla o pliega
adquiriendo una forma de lmina plegada o de hlice (como bucles) y como hoja
plegada .
Nivel terciario o estructura terciaria: la protena adquiere una forma tridimensional.
Formacin de nuevos plegamientos en la estructura secundaria hlice y hoja plegada

* Nivel cuaternario o estructura cuaternaria: est consDtuida por dos o ms cadenas de
aminocidos replegadas. Es la combinacin de dos o ms polippDdos originando una
molcula de gran complejidad

Protenas
brosas

Protenas
globulares

Puente de hidrogeno

Uniones qumicas que

determinan la estructura de las
protenas.

Niveles de Organizacin estructural en Protenas

Hoja plegada

+H

15

3N

Gly Pro Thr Gly

5
Thr
Gly

Leu
Met
Val
Lya
Val
Leu
Asp

Pro Cya Lya

10

Glu
Seu

aminocidos

R H
C
O C N H
N H
N H
C
O
O C
H C R H C
H C R H C R
R
N H O C
N H O C
O C N H
O C N H
C
C
R N
R H
N H

20
Ala Val Arg

Gly
Ser
Pro
25
Ala

Estructura
primaria

O H
H
O H
O H H
H R O
H
H R
R

C
C H
C C N
C C H
C C N C N C C N
C C N C
C C
C N
R
R
R
R
O H H
O H H
O
H
O H H


R
R
R
R
O
C H O
C H O
C
H O
C H
H
H
H
N
C
C N C N
C N H C N
H C N C N H C C
H
H O C
H O C
C
H O N
H O C
R

R
R
R H
C
O C

hlice

Estructura
secundaria

Estructura
terciaria

Estructura
cuaternaria

Estructura Primaria
Corresponde al polmero lineal de aminocidos
(monmeros), unidos por un enlace pep?dico.
Secuencia nica para cada protena.
ConDene informacin suciente para denir la
estructura 3-D de una protena y por tanto su
funcin.

H3 N

C
H

N
H

C
H

N
H

polypeptide

C
H

N
H

C
H

etc.

Estructura Secundaria
Es la organizacin espacial del polippDdo en una
conguracin repeDda.
Incluye: hlice y hoja plegada.
Denida por puentes de hidrgeno entre los tomos del
esqueleto de la cadena polipepVdica
Hoja plegada

aminocidos

C N
H

C C N

C C N
O H H

HC N

O
H

C
R

R
H

N
O

O
N

H C R H C
H

N
O

C
R

H
O
R

N
O

C
R

N
C

N H
C
H C R H C R

O C
N

C
H

O
R

C C N
O H H

hlice

C N
R

C N
R

R
O

O
R

C C N
O H H

H
H
N H C
C
N
H
C
O
R

C N
C C
O

R
O

R
O

C
H
H
N H C N
C
H
C
O
R

C
N
H

H C N
O

Estructura Secundaria: -Hlice

El -hlice es una estructura
secundaria comn en protenas, en la
cual el esqueleto polipepVdico forma
una hlice.
El -hlice est estabilizada por
puentes de hidrgeno entre un
grupo amino y el grupo carboxilo
de la siguiente vuelta de la hlice
del esqueleto, representado como:
N-H ---- O=C.

O
C

H
O
C C

N
H

peptide backbone H-bond

(H & R-group on -C omitted)

Recordemos: Los tomos H y O se atraen por la carga parcial posiDva del H (+)
y la carga parcial negaDva del O (-), debido al enlace covalente polar entre los
enlaces N-H y O=C.

Estructura Secundaria: -Hlice

La Alfa hlice (-hlice)

El -hlice est estabilizada por

puentes de hidrgeno entre un
grupo amino y el grupo carbonilo
de la siguiente vuelta de la hlice (4
aa distante)

Modelo de hoja plegada de protenas

Los grupos R de los aminocidos vecinos en

una hebra-b apuntan en direcciones
opuestas

Paralela
AnDparalela
Mixta
Hoja beta

Estructura Secundaria: Hoja plegada

Paralela
AnDparalela
Mixta

Los zig-zags de una

hoja-b tienen una
conformacin ms
extendida que en una
a-hlice.

Estructura Terciaria
Es la organizacin tridimensional de una cadena polipepVdica.
Generada por el empaquetamiento de elementos de estructura
secundaria.
Depende de la interaccin de los grupos R de la cadena
polipepVdica.
Dos Dpos fundamentales: globulares y brilares.
Interacciones hidrofbicas
y de Van der Waals
Puente de
hidrgeno

CH22
CH
O
H
O
HO C
CH2

H 3C
H 3C

CH
CH3
CH3
CH

CH2 S S CH2

O
CH2NH3+-O C CH2

Enlace inico

Esqueleto
polipepVdico
Puente
dislfuro

Los aminocidos que conDenen azufre, se unen a travs de

puentes disulfuro

Organizacin estructura terciaria protenas globulares

Cadenas laterales
polares

Cadenas laterales
apolares

Centro hidrofbico
contiene
cadenas laterales
apolares

Protena desplegada

cadenas laterales
polares
hacia el exterior
forman puentes de
hidrgeno con el
agua

Protena plegada en ambiente acuoso

Estructura Cuaternaria
Estructura que resulta de la agregacin de dos o ms subunidades
polipepVdicas
Cadenas
Cadenas

Colgeno

Hemoglobina

Al generarse las estructuras terciaria y cuaternaria, los aminocidos que estn

lejos en la secuencia pueden quedar cercanos y formar una regin funcional
como por ejemplo el si<o ac<vo de una enzima.

Estructura terciaria y cuaternaria

Terciaria
Formada por el
empaquetamiento de
elementos de estructura
secundaria en una o ms
unidades compactas

Cuaternaria
La protena nal puede estar
cons<tuida de varias cadenas
polipep?dicas

Estructura terciaria y cuaternaria

Origina dos categoras fundamentales globulares y brilares
Fibrosas ej: -queraDna

Globulares ej: Hemoglobina

Enlace Disulfuro

La estructura funcional de Insulina requiere de enlaces

Disulfuro intra- e inter-catenarios
NH3+
Gly

Cadena A
Glu Gln
Ile Val

Cys

Val

Cys
Asn Gln His Leu

Gln

Thr

Glu
Asn

Cys

Cys
Gly

Asn

Ser -OOC
His
Leu

Leu

Val
Glu

Leu

Ser
Tyr

Cadena B

Leu Tyr

Ile

Cys

NH3+
Phe

Ser

Ala

Leu

Val

Cys

Gly

Glu Arg

Gly

Phe
Phe
Tyr

Tyr

-OOC

Thr

Lys

Pro

Thr

Conformacin de una protena

La funcin de una protena es absolutamente dependiente de su
estructura tridimensional: CONFORMACIN.
Una serie de agentes pueden alterar la estructura de una
protena (denaturacin):
pH
Temperatura
Denaturacin
Agentes reductores
fuerza inica

protena
normal

Renaturacin

protena
denaturada

Dipp<do tripp<do
oligopp<dos. polipp<dos.

Propiedades cido-base
Al subir el pH se desprotona el
grupo ms cido, H de menor pKa,
formndose una especie neutra
llamada Zwikerin.

Cuando el aminocido se
encuentra en medios bsicos
pierde el protn del grupo
amino, dando lugar a la especie
desprotonada.

Punto Isoelctrico

El pH isoelectrico se calcula como media de pKa,1 y pKa,2, es decir, la media de los

pKas de las etapas que forman y descomponen el Zwikerin.

Electroforesis

Conformacin de una protena

La funcin de una protena es absolutamente dependiente de su
estructura tridimensional: CONFORMACIN.
Una serie de agentes pueden alterar la estructura de una
protena (denaturacin):
pH
Temperatura
Denaturacin
Agentes reductores
fuerza inica

protena
normal

Renaturacin

protena
denaturada

Enfoque isoelctrico

Niveles de Organizacin estructural en Protenas

Hoja plegada

+H

15

3N

Gly Pro Thr Gly

5
Thr
Gly

Leu
Met
Val
Lya
Val
Leu
Asp

Pro Cya Lya

10

Glu
Seu

aminocidos

R H
C
O C N H
N H
N H
C
O
O C
H C R H C
H C R H C R
R
N H O C
N H O C
O C N H
O C N H
C
C
R N
R H
N H

20
Ala Val Arg

Gly
Ser
Pro
25
Ala

Estructura
primaria

O H
H
O H
O H H
H R O
H
H R
R

C
C H
C C N
C C H
C C N C N C C N
C C N C
C C
C N
R
R
R
R
O H H
O H H
O
H
O H H


R
R
R
R
O
C H O
C H O
C
H O
C H
H
H
H
N
C
C N C N
C N H C N
H C N C N H C C
H
H O C
H O C
C
H O N
H O C
R

R
R
R H
C
O C

hlice

Estructura
secundaria

Estructura
terciaria

Estructura
cuaternaria

Protenas conjugadas
Clase

Lipoprotena
Glicoprotena
Fosfoprotena
Hemoprotena
Flavoprotena
Metaloprotena

Grupo Prost<co (ejemplo)

Lpido (lipoprotena plasmDca)
Carbohidratos (Inmunoglobulinas)
Fosfato (Casena de la leche)
Hemo (Hemoglobina)
FAD (Succinato deshidrogenasa)
Fe (FerriDna)
Zn (Alcohol deshidrogenasa)
Ca (Calmodulina)

Hemoglobina
Es un tetrmero de dos cadenas y dos
cadenas
Cada cadena alfa es de 141 aminocidos
Cada cadena beta es de 146 aminocidos
Cada cadena conDene un grupo prostDco
heme (parte no proteica de una protena
conjugada). Cada grupo heme Dene un tomo
de ion ferroso Fe++ en el centro al que se une
el oxgeno

Hemoglobina: Transporte de oxgeno

La funcin de las protenas es absolutamente dependiente de

su estructura tridimensional

s
a
n

rote

compuestos
estructurales
transporte

colgeno , elas8na, quera8na

hemoglobina, protenas de membranas

inmunidad
funciones en los
seres vivos:

an8cuerpos (glicoprotenas especcas) anBgenos,

protenas presentes en el virus o la bacteria que
funciona como "idenDcador.

movimiento

ac8na y miosina

aceleran reacciones qumicas

coagulacin
regulacin
recepcin de seales

enzimas

bringeno y protrombina
insulina, glucagn
receptores

Trabajo en Equipos

1) Indique cuales
monmeros
(sub-unidades)
que cons<tuyen las protenas.
cidos son los
Neutros
Neutros
no
Bsicos
polares
polares
(1pto)
(hidroilicos) (hidrofbicos)

2) Describa la estructura de los aminocidos. (2 ptos)

aa el sgte cuadro descrip<vo (9 ptos)
3) Complete
4) Dena: Dipp<do, tripp<do, oligopp<do, polipp<do. (4 ptos)
5) Describa los puentes disulfuros. (1 pto)
6) Describa los enlaces pep?dicos. (1 pto)
7) Dena: Protena conjugada, Grupo prost<co. Ejemplique. (3 ptos)
8) Describa los dis<ntos <pos de uniones que determinan la estructura de las
protenas. (8 ptos)
9) Mencione dis<ntas funciones de las protenas en el organismo Humano. (5 ptos)
10) Dentro de los niveles de organizacin de las protenas describa: (8 ptos)
a) Estructura primaria, Indique la importancia Biolgica de esta.
b) Estructura secundaria, mencione las estructuras descritas en la literatura.
c) Estructura terciaria, Indique la diferencia entre las protenas brosas y las
globulares.
d) Estructura cuaternaria, ejemplique.

BIBLIOGRAFA
Biologa Celular y Molecular. Karp G. 2006.
Captulo 2: Las bases qumicas de la vida. Pg
54-80
Fundamentos de Biologa Celular y Molecular
De RoberDs, 2004 Captulo 2: Los
componentes qumicos de la clula. Pg., 35
-46.