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Dpto. Ingeniera
Qumica
Ingeniera Bioqumica
Universidad de
Alicante
Tema 5
RUTAS METABLICAS Y ENERGTICAS EN LAS CLULAS
5.1. Rutas metablicas y de transferencia de energa
5.1.1. Fuentes de carbono y energa para la vida celular
5.1.2. Ciclos del carbono, oxgeno y nitrgeno
5.1.3. Catabolismo y anabolismo
5.1.4. Rutas catablicas, anablicas y anfiblicas
5.2. Principios de bioenergtica y ciclo del ATP
5.2.1. Convenciones de bioenergtica
5.2.2. propiedades qumicas del ATP, ADP y AMP
5.2.3. Reacciones de oxidacin-reduccin. Acoplamiento a travs del NAD
5.3. Fermentacin y metabolismo aerbico
5.3.1. Gluclisis
5.3.2. Fermentaciones anaerbicas
5.3.3. El ciclo de los cidos tricarboxlicos y la cadena respiratoria
5.3.5. Energtica de la respiracin y de la fermentacin
5.3.6. Reacciones de oxidacin parcial
5.3.7. Cintica de los procesos de fermentacin
Tema 5. Rutas metablicas y energticas en las clulas
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Tema 5
RUTAS METABLICAS Y ENERGTICAS EN LAS CLULAS
5.4. Fotosntesis
5.4.1. El proceso de fotosntesis
5.4.2. Pigmentos fotosintticos
5.4.3. Transporte electrnico fotosinttico y fosforilacin fotosinttica
5.5. Biosntesis y utilizacin de la energa del enlace fosfato
5.5.1. Sntesis de molculas pequeas
5.6 Transporte a travs de membranas celulares
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5.1. Rutas metablicas y de transferencia de energa. 5.1.1. Fuentes de carbono y energa para la vida celular
Reacciones
redox
Aerobios
Anaerobios
(obligatorios o
facultativos)
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5.1. Rutas metablicas y de transferencia de energa. 5.1.2. Ciclos del carbono, oxgeno y nitrgeno
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5.1. Rutas metablicas y de transferencia de energa. 5.1.2. Ciclos del carbono, oxgeno y nitrgeno
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Escalonado
Metabolismo intermediario
Metabolitos
ATP
Muchas etapas (adaptadas a ATP)
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G = H - TS
G y espontaneidad
Procesos exergnicos y endergnicos
A + B C + D
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ATP4-
Adenina
Ribosa
3 fosfatos
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5.2. Principios de bioenergtica y ciclo del ATP. 5.2.2. Propiedades qumicas del ATP, ADP y AMP
Capaces de ceder Pi
para dar compuestos
que estn por debajo
Intermediario
comn en
reacciones de
transferencia de Pi
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5.2. Principios de bioenergtica y ciclo del ATP. 5.2.2. Propiedades qumicas del ATP, ADP y AMP
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nicotinamida
adenina
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5.2. Principios de bioenergtica y ciclo del ATP. 5.2.3. Reacciones de oxidacin-reduccin. Acoplamiento a travs de NAD
NAD+ + H- NADH
El H- se adiciona a la cara A o B
del anillo de nicotinamida
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Respiracin
o
Fermentacin
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Gliceraldehido-3-fosfato piruvato
Con formacin de ATP
NETO
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Activacin
Se consumen 2
moles de ATP!
Isomerizacin
2 fosforilacin
Rotura
Se acaba con 2!
Isomerizacin
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Oxidacin
(
NADH)
Desfosforilacin
(
ATP)
Se forman 4 moles
de ATP!
Se forman 2 moles
de NADH!
Isomerizacin
Se forman 2 moles
de piruvato!
Deshidratacin
Desfosforilacin
(
ATP)
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Hay rutas alimentadoras que conducen los polisacridos de reserva y otros azcares
hacia la gluclisis
Hay otras rutas para la degradacin de carbohidratos
La ruta de las pentosas-fosfato, fosfogluconato o hexosas-monofosfato (HMP)
proporciona las pentosas para la sntesis de nucletidos:
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C6H12O6 2 CH3-CHOH-COOH
G0 = -47.0 kcal
G0 = 14.6 kcal
G0 = -32.4 kcal
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Oxidante
O2
SO42-
productos
H2O
H2O + S2-
Organismo
Bacterias del hidrgeno
Desulfovibrio
Muchas bacterias, todas las plantas y
animales
Compuestos orgnicos
O2
CO2 + H2O
NH3
O2
NO2- + H2O
Bacterias nitrificantes
NO2-
O2
NO3- + H2O
Bacterias nitrificantes
Compuestos orgnicos
NO3-
N2 + CO2
Bacterias desnitrificantes
Fe2+
O2
Fe3+
S2-
O2
SO42- + H2O
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Oxidante
O2
SO42-
productos
H2O
H2O + S2-
Compuestos orgnicos
O2
CO2 + H2O
Organismo
Bacterias del hidrgeno
Desulfovibrio
Muchas bacterias, todas las plantas y
animales
NH3
O2
NO2- + H2O
Bacterias nitrificantes
NO2-
O2
NO3- + H2O
Bacterias nitrificantes
Compuestos orgnicos
NO3-
N2 + CO2
Bacterias desnitrificantes
Fe2+
O2
Fe3+
S2-
O2
SO42- + H2O
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Littrofos Organtrofos
Organismo
Bacterias del hidrgeno
Desulfovibrio
Muchas bacterias, todas las plantas y
CO2 + H2O
animales
Reductor
H2
H2
Oxidante
O2
SO42-
productos
H2O
H2O + S2-
Compuestos orgnicos
O2
NH3
O2
NO2- + H2O
Bacterias nitrificantes
NO2-
O2
NO3- + H2O
Bacterias nitrificantes
Compuestos orgnicos
NO3-
N2 + CO2
Bacterias desnitrificantes
Fe2+
O2
Fe3+
S2-
O2
SO42- + H2O
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5.3. Fermentacin y metabolismo aerbico. 5.3.3. El ciclo de los cidos tricarboxlicos y la cadena respiratoria
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5.3. Fermentacin y metabolismo aerbico. 5.3.3. El ciclo de los cidos tricarboxlicos y la cadena respiratoria
Fases de la respiracin
1. Oxidacin a acetil-CoA y transferencia de e-
se
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5.3. Fermentacin y metabolismo aerbico. 5.3.3. El ciclo de los cidos tricarboxlicos y la cadena respiratoria
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5.3. Fermentacin y metabolismo aerbico. 5.3.3. El ciclo de los cidos tricarboxlicos y la cadena respiratoria
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Oxid. 2
Oxid. 1
Fermentacin
(anaerobios)
Red. 2
Respiracin
(aerobios)
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Gluclisis:
Oxid. 2
Oxid. 1
Fermentacin
(anaerobios)
Fermentacin:
Red. 2
Respiracin
(aerobios)
Red. 2
Red. 1
Oxid. 2
Para gluclisis
Tema 5. Rutas metablicas y energticas en las clulas
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Gluclisis:
Oxid. 2
Oxid. 1
Fermentacin
(anaerobios)
Respiracin:
Red. 2
Respiracin
(aerobios)
Red. 1 Oxid. 2
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10/03/2016
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Gluclisis:
Oxid. 2
Oxid. 1
Fermentacin
(anaerobios)
Respiracin:
Red. 2
Respiracin
(aerobios)
Red. 1 Oxid. 2
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Oxidante
6 (O2 + 4 H+ + 4 e- H2O)
Oxidante
Reductor
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100 x
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Relaciones especficas
Ejemplo
Formacin de producto directamente relacionada con el uso de carbohidrato
Etanol
Segn la relacin entre la formacin de producto y el consumo de sustrato
Formacin de producto indirectamente relacionada con el uso de carbohidrato cido ctrico
Formacin de producto aparentemente no asociada con el uso de carbohidrato Penicilina
Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
Simple
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con una proporcin estequiomtrica variable y
Simultnea
sin acumulacin
Segn
la evolucinde
deintermediarios
los perfiles de concentracin en funcin del tiempo
Consecutiva Los nutrientes se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
Los nutrientes se convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
Por etapas
en productos o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
preferencia
Tema 5. Rutas metablicas y energticas en las clulas
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Relaciones especficas
Formacin de producto directamente relacionada con el uso de carbohidrato
Formacin de producto indirectamente relacionada con el uso de carbohidrato
Formacin de producto aparentemente no asociada con el uso de carbohidrato
Ejemplo
Etanol
cido ctrico
Penicilina
Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
Simple
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con una proporcin estequiomtrica variable y
Simultnea
sin acumulacin
Segn
la evolucinde
deintermediarios
los perfiles de concentracin en funcin del tiempo
Consecutiva Los nutrientes se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
Los nutrientes se convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
Por etapas
en productos o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
preferencia
Tema 5. Rutas metablicas y energticas en las clulas
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Relaciones especficas
Formacin de producto directamente relacionada con el uso de carbohidrato
Formacin de producto indirectamente relacionada con el uso de carbohidrato
Formacin de producto aparentemente no asociada con el uso de carbohidrato
Ejemplo
Etanol
cido ctrico
Penicilina
Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con una proporcin estequiomtrica variable y
sin acumulacin de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
Los nutrientes se convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
en productos o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
preferencia
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Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos
con una proporcin estequiomtrica variable y
Con crecimiento
sin acumulacin de intermediarios celular
Los nutrientes se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
Los nutrientes se convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
en productos o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
preferencia
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Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con una proporcin estequiomtrica variable y
sin acumulacin de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
Los nutrientes se convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
en productos o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
preferencia
Sin crecimiento
celular
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Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
Simple
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con una proporcin estequiomtrica variable y
Simultnea
sin acumulacin de intermediarios
Los nutrientes
se convierten
Consecutiva
Los nutrientes
se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
en productos
con
unase convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
Los nutrientes
proporcin
estequiomtrica
Por etapas
en productos
o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
variable preferencia
y sin acumulacin
de intermediarios
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Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
Simple
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con una proporcin estequiomtrica variable y
Simultnea
sin acumulacin de intermediarios
Consecutiva Los nutrientes se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
Los nutrientes se convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
nutrientes
se convierten
PorLos
etapas
en productos
o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
en productos
con
preferencia
acumulacin de un
intermediario
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Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con una proporcin estequiomtrica variable y
sin acumulacin de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
Los nutrientes se convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
en productos o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
preferencia
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Descripcin
Los nutrientes se convierten en productos con una estequiometra fija y sin acumulacin
de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con una proporcin estequiomtrica variable y
sin acumulacin de intermediarios
Los nutrientes se convierten en productos con acumulacin de un intermediario
Los nutrientes se convierten completamente en un intermediario antes de la conversin
en productos o los nutrientes se convierten selectivamente en productos con un orden de
preferencia
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5.4. Fotosntesis
5.4.1. El proceso de fotosntesis
La fotosntesis
Importancia de la luz solar como fuente de energa para todos los organismos
FASE LUMINOSA
FASE OSCURA
PROCESO
GLOBAL
Otros dadores de e- en vez de H2O (H2S S; isopropanol acetona)
Otros aceptores de e- en vez de CO2 (N2 NH3)
Tema 5. Rutas metablicas y energticas en las clulas
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5.4. Fotosntesis
5.4.2. Pigmentos fotosintticos
Clorofilas, caroteonides, ficobilinas
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5.4. Fotosntesis. 5.4.2. Pigmentos fotosintticos
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5.4. Fotosntesis
5.4.3. Transporte electrnico fotosinttico y fosforilacin fotosinttica
transporte electrnico fotosinttico: proceso de transporte electrnico inducido por la luz,
luz
desde el agua u otros dadores de electrones a los diversos aceptores electrnicos,
electrnicos mediante
el cual la energa luminosa capturada por el sistema de pigmentos se convierte en energa
qumica.
qumica
E0 (NADP+/NADPH) = -0.32 V << E0 (O2/H2O) = +0.82 V
e- tienden a ir desde NADPH hacia O2
En el transporte electrnico fotosinttico: e- van desde H2O hacia NADP+
Fosforilacin oxidativa: proceso por el cual se conserva la energa de la respiracin durante el
transporte electrnico en las mitocondrias mediante la formacin de ATP.
Fotofosforilacin: proceso por el cual se conserva la energa luminosa capturada por los
sistemas fotosintticos.
Fosforilacin a nivel de sustrato: proceso por el cual se conserva la energa en ausencia de
aceptores de electrones externos en los procesos de fermentacin.
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Ingeniera Bioqumica
Fosforilacin fotosinttica
Queda con
deficiencia de e
Transfiere
e- a P700*,
que vuelve
a P700
Acoplado a
fosforilacin
de ADP a ATP
Cede e a
cadena de
transporte
NADP+
recibe e- y
se reduce
a NADPH
Absorbe h
El etransferido
procede
de H2O
Tema 5. Rutas metablicas y energticas en las clulas
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Fosforilacin fotosinttica
Cede e- y
libera O2
Procede de
ADP + Pi ATP
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Fosforilacin fotosinttica
Se necesitan 2 fotones para movilizar un electrn
4 e-/molcula de O2 (H2O 0.5O2 + 2H+ + 2e-)
6 molculas de O2/molcula de glucosa (6CO2 + 6H2O C6H12O6 + 6O2)
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Ingeniera Bioqumica
Eliminados o
liberados al
entorno
Determinado por
la velocidad de
biosntesis
No favorables termodinmicamente: acopladas a hidrlisis de ATP
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Ingeniera Bioqumica
4 ribonucletidos
4 desoxiribonucletidos
20 aminocidos
15 monosacridos
Aprox, 20 cidos grasos y precursores de lpidos
Metabolitos
intermedios
centrales
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4 ribonucletidos
4 desoxiribonucletidos
20 aminocidos
15 monosacridos
Aprox, 20 cidos grasos y precursores de lpidos
Metabolitos
intermedios
centrales
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Alicante
5.5. Biosntesis y utilizacin de la energa del enlace fosfato. 5.5.1. Sntesis de molculas sencillas
CO2 glucosa
(vegetales)
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5.5. Biosntesis y utilizacin de la energa del enlace fosfato. 5.5.1. Sntesis de molculas sencillas
Gluconeognesis
Piruvato
Lactato
Aminocidos
Intermediarios del TCA
Glucosa
Monosacridos y derivados
Polisacridos de reserva
Componentes de paredes y cubiertas celulares
Mucopolisacridos cidos
Mucoprotenas
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5.5. Biosntesis y utilizacin de la energa del enlace fosfato. 5.5.1. Sntesis de molculas sencillas
Gluconeognesis
Piruvato
Lactato
Aminocidos
Intermediarios del TCA
Glucosa
Monosacridos y derivados
Polisacridos de reserva
Componentes de paredes y cubiertas celulares
Mucopolisacridos cidos
Mucoprotenas
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5.5. Biosntesis y utilizacin de la energa del enlace fosfato. 5.5.1. Sntesis de molculas sencillas
Ejemplo: sntesis de
aminocidos a partir de
glucosa
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5.5. Biosntesis y utilizacin de la energa del enlace fosfato. 5.5.1. Sntesis de molculas sencillas
Ejemplo: detalle de la
sntesis de prolina y
arginina a partir de
glutamato en las bacterias
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Ingeniera Bioqumica
Energa qumica
Transporte activo
Movimiento a travs de una
membrana en contra de un
gradiente de concentracin
Membranas: impermeables a
compuestos polares
Transporte activo
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(permeasa)
(pasiva)
G<0
G>0
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Ingeniera Bioqumica
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Tipos de
transporte
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5.6. Transporte a travs de membranas celulares
Tipos de
transporte
Protenas
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Universidad de
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Cambios
energticos
asociados al
transporte
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5.6. Transporte a travs de membranas celulares
V = volumen celular
A = rea superficial externa de la clula
ce = concentracin externa
ci0 = concentracin inicial interna de sustrato
ci(t) = concentracin interna de sustrato a un tiempo t
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Na+K+ATPasa
Na+
K+
3Na+interior + 2K+exterior + ATP4- + H2O
3Na+exterior + 2K+interior +ADP3- + Pi2- + H+
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Transporte Glucosa-Na+
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