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El amonio, primer compuesto estable del proceso, es asimilado por los fijadores libres o
transferido al correspondiente hospedador en el caso de la asociacin con plantas. Aunque
el amonaco (NH3) es el producto directo de esta reaccin, se ioniza rpidamente a amonio
(NH4). En diaztrofos de vida libre, el amonio de la nitrogenasa es asimilada en glutamato a
travs del ciclo de sntesis glutamina sintetasa/glutamato.