Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
Profesor: Jos Manuel Cuezva; C-X 101. Sustituto Jos Mara Izquierdo.
Introduccin.
Las protenas son las molculas que hacen el ser, entendido en el sentido de que son el
fenotipo, que es lo que caracteriza externamente a un individuo. Estructuralmente son
polmeros formados por la unin de los monmeros llamados aminocidos, cada uno con una
estructura como la que aparece a la izquierda, es decir, tienen una funcin cida y una bsica
como su nombre indica. En estas molculas, como en los azcares, se puede apreciar un
centro de asimetra en el carbono (el C2, despus del carbono carboxlico), pero la diferencia
es que en los aminocidos la familia ms numerosa es la L. Se cuentan veinte aminocidos
proteinogenticos, cada uno de los cuales tiene una cadena lateral R distinta, y se unen entre
s formando pptidos mediante enlaces amida, por lo que el enlace se llama peptdico. Las
protenas son en realidad pptidos con un elevado nmero de restos (as se llama a cada
monmero que forma parte de una cadena), y pueden actuar solas o combinadas para realizar
la funcin propia de cada una de ellas, desde la visin (opsina) hasta la defensa del
organismo (anticuerpos), pasando por la contraccin muscular (miosina y actina), la formacin
de estructuras de soporte (citoesqueleto) y la catlisis a modo de enzimas como funcin ms
representativa (pero ya sabemos que hay molculas de ARN capaces de catalizar
determinadas reacciones, que son las ribozimas).
Las vas de la informacin.
Las protenas son molculas informativas porque son una copia codificada de la informacin
contenida en el ADN. Si observamos el mecanismo de sntesis se una protena desde que a la
clula llega la primera seal correspondiente (una hormona u otra seal de cualquier tipo),
ocurre que despus de la cascada de segundos mensajeros y reacciones intermediarias, en el
ncleo se activan uno o ms genes mediante la accin de unos determinados factores de
transcripcin (recordar que si la hormona es esterodica, el complejo receptor-hormona es ya
un factor de transcripcin). Estos factores se unen a los promotores y potenciadores de la
expresin del gen en cuestin gracias a unas estructuras especiales en la doble hlice de
ADN, y permiten que se sintetice una cadena de ARN mensajero tomando como molde una de
las dos hebras del gen. Sin embargo, los genes en el ADN no son continuos, y hay espacios
en los que no se dice nada con funcin estructural, as que el ARN recin formado tiene que
eliminar esas secuencias, llamadas intrones, para dejar una sola hebra en la que se puedan
leer los trozos de gen que tienen sentido estructural (los exones) sin saltos. Se utiliza la
palabra leer porque es eso realmente lo que hacen los sistemas de transcripcin, que es el
proceso que se acaba de describir: Se comienza a sintetizar el ARN desde un extremo y
nucletido a nucletido, reproduciendo fielmente lo que est en el ADN, como quien lee letras
una detrs de la otra y las transcribe en un papel, slo que aqu se tienen nicamente cuatro.
El ARN recin sintetizado en el ncleo pasa al citoplasma rpidamente para ser traducido, es
decir, hay que pasar la informacin contenida en una clave de cuatro letras, que son las bases
pricas y pirimidnicas de los cidos nucleicos, a una clave de veinte letras, que son los
aminocidos proteinogenticos. La maquinaria enzimtica encargada de la traduccin, que es
acin por la protena a la que se unan, como si fueran instrumentos tontos que pueden hacer
algo, pero que la protena les dice dnde y cmo. Adems la accin de las enzimas puede
verse modificada por distintas transformaciones covalentes como la fosforilacin,
palmitoilacin, DP-ribosilacin o unin a una cadena terpnica para trasladarla a la membrana
desde el citoplasma.
Definicin y caractersticas de las protenas.
El trmino protena viene del griego proteios (), que significa el primero, en la
preeminencia. Se les dio ese nombre por la creencia generalizada de que tena que haber
sido la primero molcula viva sobre la Tierra, dado que su funcin principal y de la que
depende toda la vida conocida es la de catalizar las reacciones celulares, incluida la
replicacin y la traduccin. Esto en principio plante la cuestin irresoluble de cmo haba sido
capaz el ADN de asumir las funciones de transferencia y conservacin de la herencia, siendo
una molcula tan montona y simple comparada con las protenas Cuando se descubri la
ribozima, la teora vigente hasta la fecha que postulaba que las protenas tenan que haber
sido lo primero porque si no, no habra replicacin, se cambi por la teora de el ARN antes,
pero sin embargo el nombre de protena ya estaba muy bien asentado. De hecho, sin las
protenas no se nos podra reconocer, porque son la expresin de la informacin gentica, es
decir, el fenotipo, y son tan importantes que representan el 50% del total del peso seco de una
clula.
Funciones de las protenas.
Como ya se ha dicho, la funcin ms importante de las protenas es la de ejercer como
catalizadores biolgicos de las reacciones que se llevan a cabo en la clula (recordar 1
Introduccin). Su eficacia es tal que como media aumentan un milln de veces la velocidad de
la reaccin sin catalizar. Otra funcin muy importante es la de actuar como transporte y
almacenamiento de iones, como la transferrina de la sangre y la ferritina del hgado. Adems
son el soporte y el mecanismo del movimiento coordinado, ya sea macroscpico, como la
miosina del msculo, o microscpico, como los filamentos de actina en la locomocin por
pseudpodos. Tambin son el soporte para la accin de estos movimientos, tanto dentro como
fuera de la clula: el colgeno de la matriz y los microfilamentos del citoesqueleto,
respectivamente. Tienen una misin muy importante relacionada con las dos anteriores, que
es el desplazamiento de los cromosomas a lo largo del huso acromtico durante la mitosis y la
meiosis.
Otras funciones desarrolladas por protenas son la transmisin del impulso nervioso (son los
receptores de los neurotransmisores en la neurona postsinptica), la regulacin y el control del
crecimiento celular mediante receptores y la modulacin de la expresin gnica a cualquier
nivel de sntesis o de degradacin. La ltima funcin en esta lista, pero no la menos
importante, es la defensa del organismo frente a infecciones, mediada tanto por los
anticuerpos como por los receptores de las clulas T. Hay ms funciones desarrolladas por
protenas; tantas como sean necesarias para llevar a cabo todas las funciones de un
organismo vivo.
Estructura qumica de las protenas.
Las protenas son polmeros lineales formados por la condensacin de veinte monmeros
llamados aminocidos mediante reacciones de condensacin por deshidratacin, como todas
las polimerizaciones en la clula. Pueden estar compuestas slo de aminocidos (protenas
simples), o bien llevar unido algn grupo no proteico, llamado prosttico, para dar numerosos
tipos de protenas conjugadas: nucleoprotenas con cidos nucleicos (ribosoma, histonas),
lipoprotenas con lpidos (LDL, HDL), fosfoprotenas con fsforo (casena), metaloprotenas
con tomos metlicos (citocromo oxidasa), glucoprotenas con oligosacridos (-globulinas;
ver 2 Glcidos). En todos los casos es la protena la que define la utilizacin de cada grupo
prosttico, que aunque es indispensable para la funcin que se tiene que llevar a cabo, slo la
parte proteica es capaz de utilizar el grupo prosttico como mejor convenga, como si fuera
una simple herramienta capaz de ser utilizada de distintos modos segn la mano que la coja.
De cualquier modo, todas las protenas simples y las partes no prostticas de las conjugadas
muestran una composicin media atmica de 50% C, 23% O, 16% N, 7% H y 3% S.
Aminocidos.
que salen lateralmente las distintas cadenas R de cada residuo, y que van a ser las que den la
funcionalidad a la molcula.
Tipos de aminocidos.
Hay varios tipos de aminocidos, segn la naturaleza de su cadena lateral R.
Aminoci
dos no
polares.
Alanina.
Cdigo
de tres
letras.
Ala
Cdigo
de una
letra.
Cadena lateral.
Observaciones.
-CH3
Puede encontrarse
tanto en el interior
como en el exterior
de las protenas, dado
su pequeo tamao.
Es prcticamente
inerte y es el
aminocido ms
abundante.
Valina.
Val
Leucina.
Leu
Suelen encontrarse
en el interior de las
protenas porque son
ms grandes que la
alanina. Son inertes
pero juegan un papel
importante en el
plegamiento porque
generan interacciones
hidrofbicas.
Es el primero en el
ARNm. El azufre
puede reaccionar
con metales y
formar enlaces de
coordinacin,
aunque es bastante
inactivo.
Isoleucina.
Metionina.
Ile
Met
-CH2-CH2-S-CH3
Prolina.
Pro
Fenilalanin
a.
Phe
Triptfano.
Trp
Aminocid
os polares.
Cdigo
de tres
letras.
Es un iminocido. Su
estructura rgida
interfiere mucho en
el plegamiento de
las protenas y
obliga a la
formacin de los
codos . No es
reactivo.
Sus anillos
aromticos son
extremadamente
apolares y estn
sepultados en el
interior de las
protenas. Dado su
tamao, sobre todo
el triptfano, se
usan como
espaciadores en la
estructura proteica.
Cdigo
de una
letra.
Cadena lateral.
Observaciones.
Es el nico que no tiene
estereoismeros. Est
muy conservado y se
puede encontrar en
cualquier sitio porque
permite todas las
conformaciones
normales y algunas muy
raras. Aunque la cadena
es apolar, la molcula
entera s es polar, por lo
que se incluye aqu.
Glicina.
Gly
-H
Serina.
Ser
-CH2OH
Treonina.
Thr
Asparagina
o
asparragina.
Asn
Glutamina.
Gln
Tirosina.
Cistena.
Tyr
Cys
Aminoci Cdigo
dos
de tres
cargados. letras.
-CHOH-CH3
Aminas derivadas de
aminocidos cidos.
-CH2-CO-NH2
Tambin forman enlaces
de hidrgeno y
aumentan la
CH2-CH2-CO-NH2 solubilidad.
Dbilmente cido
como el fenol (pKR =
10,46). Se encuentra
en centros activos.
Es el aminocido ms
reactivo. Forma los
puentes disulfuro
para estabilizar la
estructura de la
protena, dando un
aminocido doble
llamado cistina.
Puede ser cido (pKR
= 8,37).
Cdigo
de una
letra.
-CH2-SH
Cadena lateral.
Observaciones.
Todos se encuentran
siempre hacia el
exterior de las
protenas, porque su
carga les impide
estar en otro sitio a
no ser que se baje
la constante
dielctrica del
medio, como en los
centros activos (1
Introduccin).
Lisina.
Arginina.
Histidina.
Lys
Arg
His
-CH2-CH2-CH2-CH2-+NH3
La forma
desprotonada es
una base bastante
fuerte (pKR =
12,48). La forma
protonada se
estabiliza por
resonancia como se
ve a la izquierda.
Aminocido raro
que se suele
encontrar en el
centro activo de las
enzimas. El anillo de
imidazol protonado
se estabiliza por
resonancia entre las
dos formas
dibujadas a la
izquierda. El pKR es
6,0, con lo que a pH
fisiolgico y en
solucin acuosa hay
10 veces ms forma
desprotonada que
protonada, pero en
los centros activos
puede estar en
cualquier forma (ver
1 Introduccin).
Se encuentra en el
centro activo de las
enzimas ATPasas.
cido
asprtico.
Asp
-CH2-COO-
cido
Glu
-CH2-CH2-COO-
Tambin se
glutmico.
encuentra en algn
centro activo.
Son las cadenas laterales las que definen las caractersticas fsicoqumicas de los
aminocidos (polaridad, hidrofobicidad, aromaticidad, flexibilidad conformacional), pero sin
embargo hay equivalencias a la hora de influir en el plegamiento de las protenas, porque ste
es algo ms general y no depende estrictamente de cada uno de los aminocidos de la
secuencia, sino del equilibrio de fuerzas existente en el momento de realizarse el plegamiento.
Se puede hacer una lista con los aminocidos que son estructuralmente intercambiables:
Ala y Val.
Levorrotatorios: Leu, Met, Pro, Phe, Trp, Gly, Ser, Thr, Asn, Gln, Tyr, Cys e His.
Por esta capacidad de presentar al menos dos grupos ionizables se pueden comportar como
cidos o como bases segn las circunstancias, con lo que se son sustancias anfteras segn
la teora de los cidos y bases de Brnsted y Lowry porque pueden tanto aceptar como donar
protones. Al valorar un aminocido con sosa, por ejemplo, se obtienen curvas de valoracin en
las que se establecen dos o tres equilibrios, segn tenga el aminocido una cadena lateral sin
carga o ionizable, respectivamente. En cada caso se consideran como cidos dibsicos o
tribsicos, respectivamente. Cada uno de los equilibrios se caracteriza por una constante,
cuyo logaritmo negativo es el pK correspondiente. En el entorno de pK 1, el aminocido
tiene capacidad tamponante y se puede aplicar la ecuacin de Henderson-
Hasselbalch
. Otro parmetro caracterstico de los aminocidos es su punto isoelctrico, que es el pH en el
que todo l se encuentra sin carga neta, es decir, en forma de zwitterion. Este punto,
representado por pI, se halla experimentalmente de la media de los dos equilibrios que dan
origen al dicho ion dipolar y se encuentra en el punto de inflexin de la curva de valoracin
entre esos dos pK. Estas dos caractersticas se utilizan en el laboratorio para separar
aminocidos en cromatografas de intercambio inico.
En una protena cada residuo que lleve un grupo ionizable mantiene su pK, con lo que la curva
de valoracin de la protena se parecer ms a una pendiente, que variar su inclinacin en
funcin de la fuerza inica, pero que siempre pasa por un mismo punto que es el pI de la
protena.
Aminocidos modificados.
Despus de la sntesis enzimtica de la protena, uniendo los aminocidos correspondientes
en el ribosoma, se pueden dar modificaciones puntuales de los residuos y producir
aminocidos modificados.
Colina y etanolamina, que son derivados de la serina, y ella misma son segundos
mensajeros (ver 3 Lpidos).
Reacciones de los aminocidos.
Las reacciones tpicas de los aminocidos son todas las reacciones caractersticas de los
grupos que tienen. Se utilizan para identificar los aminocidos en los hidrolizados, hallar la
secuencia de una determinada protena, modificar determinados aminocidos para detectar
actividades enzimticas y permitir su variacin qumica y para la sntesis qumica de pptidos.
Entre ellas se resaltan las ms importantes.
Reacciones del grupo carboxilo.
Formacin de amidas.
Es la reaccin tpica de condensacin enzimtica por deshidratacin, en la que el grupo
carboxilo de un aminocido se combina con el grupo amino del siguiente. Este enlace se llama
tambin peptdico porque el polmero que se genera, es decir, la protena, tambin puede
llamarse polipptido o pptido a secas.
Formacin de steres.
Reaccin utilizada en la sntesis qumica de protenas para fijar y proteger el carboxilo del
ltimo aminocido, con etanol o fenol, y evitar que reaccione. De esto se deduce que la
sntesis qumica empieza al revs que la sntesis enzimtica, es decir, se empieza a
polimerizar por el extremo C-terminal en lugar de por el extremo N-terminal, que es lo que
ocurre en el ribosoma.
Tambin se utiliza esta reaccin para fijar una protena a un soporte y luego proceder a su
secuenciacin segn el mtodo de la degradacin de Edman.
Formacin de haluros de acilo.
Pptidos.
Un pptido es la unin de un nmero limitado de aminocidos, hasta cincuenta, mediante la
formacin de enlaces amida entre los grupos amino y carboxilo unidos al carbono . Tal y
como se sintetizan en la clula, se comienza por el extremo N-terminal y se acaba por el
extremo C-terminal, nombrando todos los aminocidos por orden cambiando la terminacin
-ina por -il, excepto la del ltimo que queda invariable. Adems por convencin siempre se
escriben de izquierda a derecha segn se nombran y se sintetizan. En el momento que un
aminocido forma parte de una cadena pasa a llamarse resto o residuo, para resaltar el hecho
de que est unido.
Sntesis en la clula.
La formacin del enlace peptdico es muy cara energticamente, pero sin embargo la
evolucin ha mantenido el sistema de sntesis proteica prcticamente invariable a lo largo de
millones de aos, con lo que debe suponer alguna ventaja aadida. Adems es uno de los
mtodos universales que, junto con el cdigo gentico y las bases moleculares de la herencia,
refuerzan la idea de que todos los seres vivos conocidos surgieron de un mismo antecesor
comn en el que ya se daban estos mecanismos, que tuvieron tanto xito que
automticamente eliminaron todo lo que pudiera haber habido. El mecanismo de sntesis
proteica sigue el dogma central de la Biologa y constituye el ltimo paso: la traduccin.
En la clula se sintetizan los pptidos gracias a una compleja maquinaria bioqumica diseada
evolutivamente a tal efecto: el ribosoma. ste es un complejo ribonucleoproteico (RNP) que
incluye en su composicin ARN especial llamado por esto ribosmico (ARNr). Este complejo
se puede descomponer en dos subunidades, llamadas grande y pequea, entre las que corre
una cadena de ARNm con la informacin de la protena que se va a sintetizar. Como se ha
visto anteriormente, el ribosoma se desplaza fsicamente a lo largo del ARNm a saltos de tres
en tres bases, correspondiendo cada uno de esos tripletes o codones a un aminocido,
merced al cdigo gentico. En procariotas es siempre la formilmetionina (fMet) el primer
aminocido que se incorpora en un sitio especial de la subunidad grande, llamado sitio P o
peptidilo, que est justamente sobre el codn de iniciacin AUG. El siguiente codn est
debajo de otro sitio en el ribosoma llamado sitio A o aminoacilo. Ni los aminocidos ni el
ribosoma son capaces de reconocer por s solos dnde se tienen que incorporar, por lo que
necesitan una molcula que haga las veces de cdigo para que el ribosoma, que es el
descodificador, pueda convertir el ARNm en protena. Estas molculas que son el cdigo son
los ARNt (transferentes, o tambin ARNs, solubles), y hay, evidentemente, al menos tantos
como aminocidos, a los que se unen especficamente gracias a enzimas al efecto que son
las aminoacil-ARNt sintetasas, que tambin son especficas de aminocido y de ARNt. As que
todos los aminocidos se incorporan al ribosoma como aa-ARNt, pero por simplicidad se
obviar en adelante.
Una vez estn la fMet y el siguiente aminocido en los sitios del ribosoma, se produce un
ataque nucleoflico por parte del grupo amino del segundo aminocido al grupo carboxilo del
primero (por el que se une al ARNt), con lo que se genera un dipptido en el sitio A, y el sitio P
se queda slo con el fMet-ARNt. Esta reaccin est catalizada por la peptidil transferasa, que
es una de las protenas de la subunidad grande del ribosoma. Despus de esto, el ribosoma
entero se tiene que mover exactamente tres nucletidos a lo largo del ARNm, con lo que el
pptido recin formado pasa al sitio P y se descubre de nuevo el sitio A con un nuevo codn
libre al que se tiene que incorporar otro aminocido. El ARNt del primer aminocido pasa a
otro sitio del ribosoma, llamado sitio E o de salida (del ingls exit), tras lo cual vuelve a
disociarse y a flotar en el citoplasma para ser cargado de nuevo con su aminocido especfico.
Otra vez se est en la situacin de partida, en la que hay un pptido en el sitio P y el sitio A
est vaco para que se incorpore el siguiente aminocido.
Por cada aminocido incorporado se hidrolizan cuatro enlaces ricos en energa:
lo que no hay diferencia sustancial en tanto a repulsiones estricas se refiere porque siempre
so muy altas. La prolina se incorpora en determinados sitios de la cadena polipeptdica que
necesitan un cambio brusco de direccin, porque la rigidez de este aminocido, unida a la
configuracin en cis y luego generalmente una glicina, que permite giros cerrados forman los
llamados giros o acodalamientos .
ngulos de enlace.
Como el enlace peptdico es plano y rgido, los nicos enlaces del esqueleto proteico que
pueden girar sobre su eje son los que unen el C con sus respectivos grupos amino y
carboxilo (excepto la prolina, claro). Los ngulos que pueden tomar desde un cero terico en
el que los dos enlaces peptdicos que flanquean un mismo carbono asimtrico se superponen
en un mismo plano, estn limitados por las repulsiones estricas que podran establecerse
entre los diferentes grupos cercanos. El investigador hind Ramachandran dedujo los lmites
mnimos y extremos entre los que se mueve el dimetro de cada tomo y observ que slo
haba una diferencia de 0,1 , por lo que la diferencia entre los radios mnimo y extremo de
Van der Waals (la zona de influencia de cada tomo) es de 0,05 . Sabiendo que el ngulo
es el que puede tomar el enlace C - N alrededor de su eje, y el ngulo es el que toma el
enlace C - CO alrededor del suyo, ambos contados en el sentido de las agujas del reloj si se
observan los enlaces desde el C, Ramachandran represent todos los pares de valores
tericos teniendo en cuenta los impedimentos estricos en un cuadro bidimensional /. De
esta representacin se dedujo que slo un 15% de todos los posibles valores estn permitidos
en las protenas, siendo todos los dems imposibles porque los grupos se estorbaran unos a
otros.
Mediante ensayos de laboratorio se ha comprobado la exactitud de las representaciones de
Ramachandran y su utilidad para calcular ngulos de enlace de estructuras tericas. Adems
se ha comprobado cmo la glicina puede formar casi cualquier ngulo de enlace salindose
de ese 15%, dado el pequeo tamao de su cadena lateral, y que la prolina restringe sus
ngulos de enlace a un puado de pares muy cercanos unos a otros.
Importancia de los ismeros en el enlace.
Ramachandran fue capaz de hacer la representacin de los ngulos de enlace porque slo
hay dos, es decir, porque slo hay -aminocidos en las protenas. Si en lugar de aminocidos fueran todos -aminocidos, habra tres enlaces alrededor de los cuales se
podran hacer giros, cada uno con sus propias limitaciones estricas, pero que en principio
haran un nmero al cubo de posibles conformaciones, en lugar de un nmero al cuadrado. La
conclusin terica a la que se llega es que, como en las protenas slo hay -aminocidos, los
-aminocidos han tenido que sufrir un proceso de seleccin contraria por el simple hecho de
que permiten tal cantidad de conformaciones, al alejar tanto los grupos grandes, que sera
imposible llegar en un tiempo biolgicamente lgico (unas horas) a una conformacin
mnimamente estable en una protena. Esto llevara a la imposibilidad de realizar la funcin
correctamente, porque adems cabran varias conformaciones estables a las que se podra
llegar por caminos diferentes segn cmo les haya dado por colocarse a los enlaces. La
existencia de -aminocidos responde a la necesidad de limitar el nmero de mnimos
energticos disponibles para una cadena polipeptdica porque desde un principio tienen
limitado sus ngulos de giro y, por tanto, los caminos por los que puede irse plegando la
protena.
Todas las protenas estn adems compuestas de L-aminocidos, y las vas principales de
sntesis y degradacin utilizan estos estereoismeros y no otros, salvo posteriores
modificaciones. No se sabe por qu esta seleccin, pero s se ha podido comprobar que los
polmeros hechos de una mezcla de D- y L-aminocidos son inestables, as que ahora la
pregunta es por qu se escogi la familia L. Realmente se cree que fue por puro azar la
primera que se utiliz y as sigui.
Propiedades pticas.
Todos los pptidos tienen propiedades pticas porque estn hechos de monmeros
pticamente activos. Cuando son cortos y la estructura es abierta, es decir, sin plegamientos,
la actividad ptica del pptido es la suma de las actividades de cada aminocido, pero cuando
la cadena se alarga y aparecen estructuras de orden superior, la actividad ptica deja de tener
una relacin con la secuencia de aminocidos.
Propiedades qumicas de los pptidos.
Los pptidos muestran bsicamente la unin de todas las propiedades qumicas de los
aminocidos que los componen, con la salvedad de que los grupos amino y carboxilo unidos a
los C no pueden reaccionar porque estn formando parte del enlace peptdico excepto los de
los extremos N- y C-terminales.
Propiedades cido-base.
Los pptidos tienen al menos los grupos ionizables de los extremos de la cadena, ms los de
las cadenas laterales, por lo que tambin pueden forman cristales de elevado punto de fusin,
y adems se pueden valorar como si fueran aminocidos. Hay que resaltar que los pKa de los
grupos -amino y -carboxilo libres, es decir, los de los extremos de la cadena, se van
suavizando respecto a los de los aminocidos libres a medida que la longitud aumenta porque
la mayor distancia evita los efectos electrostticos y de induccin que se dan entre esos
grupos de carga opuesta cuando estn cerca. Sin embargo esto no ocurre con los grupos
ionizables de las cadenas laterales, que mantienen los pK muy cerca de los valores del
aminocido libre.
Se puede determinar el pI de un pptido del mismo modo que el de un aminocido, slo que
ahora es ms difcil porque la curva de valoracin ya no presenta escalones tan marcados,
sino que se van suavizando hasta parecer una pendiente. En este caso es recomendable
valorar el pptido a distintas temperaturas, y en el sitio donde se crucen las distintas curvas
estar el pI.
Reacciones de identificacin.
Como las anteriores, son iguales o muy parecidas a las de los aminocidos. Tambin se
revelan los pptidos con ninhidrina despus de una electroforesis o de una cromatografa,
pero una reaccin que es tpica de pptidos y que con aminocidos no se da es la reaccin
del biuret, porque se necesita la interaccin con el enlace peptdico. Se basa en el
establecimiento de enlaces de coordinacin entre cuatro enlaces peptdicos consecutivos dos
a dos en dos cadenas (o dos partes de la misma) que se encuentren paralelas, todo esto en
medio bsico con sosa. Una tcnica parecida es la tcnica de Lowry, que utiliza el reactivo de
Folin (tungstato y molibdato de sodio en cido fosfrico y clorhdrico), pero es diez veces ms
sensible: 0,1 a 1 mg de protena/ml frente a 1 a 10 mg/ml. En ambos casos se forma el mismo
complejo que es coloreado y absorbe a 640 nm.
Pptidos no proteinogenticos.
Glutatin.
La frmula es -Glu-Cys-Gly, con lo que el enlace peptdico entre el glutmico y la cistena se
realiza mediante el grupo carboxilo en y no con el que sera corriente. Est presente en
grandes cantidades en las clulas de animales superiores (5 mM) y forma parte del sistema de
transporte de aminocidos al interior celular, catalizado por la -glutamil transferasa, que
adems acta como reductor de centros activos, activador de enzimas y como protector en la
oxidacin de lpidos.
Carnosina.
Es la -Ala-His. El residuo de alanina es un -aminocido. Es frecuente en el msculo.
Tirocidina A.
Es un pptido cclico y con algunos aminocidos en la forma D. Lo sintetiza una especie
de Bacillus y es bastante txico porque es un sistema de proteccin contra las peptidasas, que
las bloquea.
Hormonas.
Valimonicina, cclico.
Gramicidina.
Determinacin de la secuencia de aminocidos.
Actualmente se sigue el protocolo de Sanger establecido en 1953, aunque slo parcialmente y
adaptado a cada caso concreto. Sin embargo el descubrimiento del cdigo gentico y la
capacidad que se tiene hoy da para construir fragmentos de ADNc ha limitado esta tcnica al
papel de una comprobacin, ms que un resultado en s misma, de la secuencia deducida a
partir de los fragmentos de material gentico que se conservan en genotecas. Esto se debe a
que la tcnica no permite secuenciar fielmente pptidos de ms de 50 60 aminocidos, a
pesar de que el mtodo se ha automatizado totalmente y ya no se hace eterno, pero sigue
teniendo algunas limitaciones como se ver ms adelante, y que son los pasos que no se
realizan hoy da.
Actualmente, al purificar una protena, directamente se corta en pptidos que se separan en
HPLC y se secuencian automticamente, pero tampoco del todo. Si no se conoce la protena,
se fabrica una sonda degenerada (con inosina en el lugar de la base del tambaleo) que
localiza el ARNm del que se fabrica luego el ADNc, que se amplifica mediante una PCR. Con
el ADNc parcial se busca en una genoteca de ADNc el fragmento completo para determinar si
la protena se corresponde o por el contrario es nueva, porque sabiendo la secuencia del
ADNc se sabe tambin la de la protena que codifica.
anteriores para poder llegar a una secuencia coherente comn a los dos mtodos
de hidrlisis parcial. Puede que se necesite otra hidrlisis parcial diferente, si el
pptido es muy repetitivo, aunque en tal caso se hace realmente difcil.
El carboxilo terminal se detecta hacindolo reaccionar con borohidruro de litio para formar un
alcohol primario, y luego realizando una hidrlisis total para detectarlo en una cromatografa.
Tambin se puede recurrir a una hidracinolisis, en la que la hidracina (NH2-NH2) rompe los
enlaces peptdicos formando un aminoacilhidracida de todos los aminocidos excepto del
ltimo (C-terminal), porque ste no formaba parte de ningn enlace peptdico. ste tambin se
detecta en una cromatografa. Otro modo de detectar el extremo C-terminal es utilizar las
enzimas carboxipeptidasas, que eliminan secuencialmente los restos de uno en uno
comenzando por ese extremo.
El ltimo paso del protocolo, pero que es el primero que se realiza actualmente, es la digestin
o hidrlisis parcial de la protena con unas enzimas llamadas proteasas o peptidasas, que son
capaces de reconocer enlaces peptdicos en los que interviene un aminocido concreto, y
cortar exactamente en ese punto la cadena polipeptdica. Estas enzimas se dividen en dos
grandes categoras segn corten enlaces internos o terminales en endopeptidasas y
exopeptidasas, respectivamente.
Endopeptidasas:
Dependen del primer aminocido del enlace, es decir, que cortan el enlace aa1-CN-aa2 segn cmo sea aa1. Se dice que cortan detrs de:
Tripsina: Corta detrs de Lys y Arg, es decir de aminocidos bsicos con carga, y
siempre que detrs no haya un prolina. Es altamente especfica y la imposibilidad
de cortar antes de prolina se debe a la cadena lateral ciclada. Se encuentra en el
estmago y es especialmente activa a pH 2.
Dependen del segundo aminocido del enlace, es decir, cortan el enlace aa1-C-Naa2 segn cmo sea aa2. Se dice que cortan delante de:
extremos que no sean Arg, Lys o Cys, y tampoco cortar si hay un resto de prolina
anterior.
Los mtodos de rotura parcial qumica se pueden resumir en los siguientes:
Primero se tiene que unir el ltimo aminocido mediante su extremo C-terminal a una resina
de poliestireno, con lo que queda anclado a ella (esto fue lo que dio el premio a Merrifield) y,
adems, se protege su grupo carboxilo. Previamente su grupo amino se ha protegido con
cloruro de terbutiloxicarbonilo (TBOC) para que no reaccione con la resina, pero ahora
interesa dejarlo al descubierto, con lo que se lava el aminocido unido a la resina con cido
tricloroetanoico para liberar el extremo amino. Este proceso se lleva a cabo sobre un filtro
porque la resina no puede pasar a su travs, con lo que es mucho ms cmodo que una
sntesis en fase lquida. Al lavar la resina se libera el TBOC como CO2 y metilbutano.
Una vez se tiene el aminocido fijado con su extremo amino libre, hay que ponerlo en contacto
con el otro aminocido. ste tambin viene con su extremo N-terminal protegido con TBOC,
pero su extremo C-terminal est activado con diciclohexilcarbodiimida, que al condensarse
con el amino del aminocido unido se libera en forma de diciclohexilurea. De este modo se
consigue un dipptido unido a la resina por su extremo C-terminal y con el extremo N-terminal
protegido con TBOC. Para continuar la sntesis se vuelve a lavar la resina con cido
tricloroetanoico y a repetir los pasos anteriores.
Este mtodo permite buenos rendimientos si no se sobrepasan los veinte aminocidos
sintetizados, pero baja drsticamente al aumentar el nmero, as como con la inclusin de
lisina, porque tiene otro grupo amino sobre el que se podra aadir el aminocido, en lugar de
sobre el grupo amino normal.
Plegamiento proteico.
Causas del plegamiento.
Las fuerzas que guan el plegamiento de una cadena polipeptdica son todas interacciones
dbiles debidas al reconocimiento intramolecular entre partes de la misma molcula. Para que
este reconocimiento se produzca debe haber complementariedad espacial y una unin de
fuerzas.
El plegamiento se realiza en un entorno celular.
Aunque la secuencia de aminocidos determina en gran medida el plegamiento y, por tanto, la
forma final de la protena, no hay que olvidar que sta se encuentra en un medio celular, en el
que tiene algunas facilidades y limitaciones.
Para empezar, en el citoplasma existen unas protenas que ayudan a la cadena polipeptdica a
comenzar su plegamiento y, en cierto modo, restringen el nmero posible de conformaciones
para un segmento concreto de la protena a unas cuantas que son rpidamente accesibles.
Con esto se consigue una necesaria rapidez hasta llegar a la forma definitiva y, adems, se
procura que los elementos de los que luego se vaya a componer la protena sean unos
cuantos, y no todos los posibles.
No podemos olvidar que el entorno de plegamiento es bsicamente agua. En ella la constante
dielctrica es cercana a ochenta, con lo que todas las interacciones de los grupos R entre
ellos y con el agua van a estar muy limitadas, si son inicas. Por esto el principal motor del
plegamiento proteico son las interacciones ms dbiles: fuerzas de Van der Waals, puentes de
hidrgeno e interacciones hidrofbicas.
Fuerzas de naturaleza entrpica y entlpica.
combinarlas para dar tablas de hidropata, en las que los valores negativos y positivos indican
el carcter apolar o polar del aminocido en cuestin.
De todo lo anterior se puede deducir si un resto va a quedar expuesto al agua o por el
contrario va a quedar dentro de la protena, as como la espontaneidad del plegamiento.
Mantenimiento de la estructura.
Las fuerzas que mantiene la integridad conformacional y, por tanto, funcional de la protena,
son cooperativas e intervienen en el interior de la protena una vez que se ha plegado. Esto se
comprueba en los diagramas de desnaturalizacin por calor, en los que se ve cmo al llegar a
una temperatura crtica de fusin Tm (de melting, fusin en ingls), se provoca la rotura de
algunos puentes de hidrgeno que hacen que el resto colapse como un castillo de naipes que
estaba en equilibrio y le quitan una sola carta del medio.
Puentes disulfuro.
Si despus de que una protena se haya plegado se encuentran cerca dos residuos de
cistena, entonces cabe la posibilidad de oxidar ambos tomos de azufre y unirlos
covalentemente, entrecruzando la estructura proteica entre dos puntos cercanos en el espacio
aunque distantes en la secuencia. La formacin de este puente disulfuro est a cargo de la
enzima proten-disulfuro isomerasa, que es uno de los llamados catalizadores del plegamiento
proteico y que se encuentra en el retculo endoplsmico, del que es un marcador. Esta unin
transforma los dos residuos de cistena en un residuo de cistina, que es el aminocido doble
que surge.
Elementos de estructura proteica.
Niveles estructurales en protenas.
Paso de rosca. Equivale a la distancia longitudinal que se tiene que recorrer sobre
la hlice para encontrarse en la misma situacin peridica: p = n d.
entre los tomos del esqueleto polipeptdico y a travs del eje de la hlice, como ocurre en las
hlices . La hlice 310 es una hlice dextrgira con tres residuos por vuelta en la que los
puentes de hidrgeno se establecen entre el carbonilo i y el amino i + 3, con lo que no estn
exactamente alineados. Son hlices cortas que generalmente aparecen en los extremos de
hlices , con pocos residuos que casi nunca pasan de la vuelta. Es bastante restringido el
nmero de restos que caben en una hlice 310, porque la estructura apila los grupos R unos
encima de los otros, y no al tresbolillo como en las hlices , con lo que si son muy
voluminosos se distorsiona la hlice.
Grupos lineales .
La estructura se puede asimilar a una hlice muy estirada de slo dos residuos por vuelta y de
slo 1 de radio. Con estos parmetros se consigue una estructura lineal en forma de lnea
quebrada en la que los grupos R se disponen alternativamente hacia arriba y hacia abajo del
plano terico que pasara por el eje de la hlice. Evidentemente. Los puentes de hidrgeno ya
no se pueden establecer entre tomos del mismo grupo lineal, sino que tienen que ser con
grupos lineales adyacentes. stos se pueden disponer de manera paralela o antiparalela,
siendo este ltimo el modo en que los puentes de hidrgeno son totalmente lineales. La unin
de dos o ms grupos lineales define una lmina , de la que alternativamente salen los
grupos R arriba y abajo del plano quebrado que se forma.
Los grupos lineales de los extremos de una lmina slo pueden formar la mitad de puentes de
hidrgeno, porque slo tienen un grupo lineal a su lado. En ese caso se establecen puentes
de hidrgeno con otra estructura se la misma protena, con el agua o con la misma lmina
cerrada sobre s misma. Esto ltimo puede ocurrir si se compone de al menos 8 grupos
lineales.
Dependiendo de la naturaleza de los residuos, puede haber lminas hidrofbicas o
anfipticas, segn cmo sea cada uno de los lados que se puede considerar. Cada grupo no
suele tener ms de siete residuos, y se pueden mezclar paralelos y antiparalelos en una
misma lmina, aunque no es muy frecuente.
Las explicaciones anteriores se refieren a grupos lineales y lminas totalmente extendidas
y rectas, en los que los ngulos de y se sitan en la misma lnea que va desde el centro a
la esquina superior izquierda de la representacin de Ramachandran. Sin embargo, lao
corriente es encontrarse con grupos lineales retorcidos, en los que se acumula una pequea
diferencia de giro entre el aminocido n y el n + 1, por lo que los grupos lineales se tienen que
asociar formando un ngulo de unos 25 para formar lminas, ya que si no, no se pueden
establecer puentes de hidrgeno entre ellos.
Esta torsin genera que el plano de la lmina tenga concavidad y convexidad, y se pueda
hablar de un arriba y un debajo del plano. Adems, esta geometra de planos torcidos provoca
que la conectividad entre dos grupos lineales paralelos siempre se haga a derechas y por
encima del plano que definen.
De estos grupos lineales no suele haber ms de siete por lmina, y no ms de siete residuos
por grupo lineal, generalmente impares (3, 5 7).
Codos.
Son elementos de estructura secundaria que rompen la linealidad de los otros dos elementos
descritos anteriormente. Hay tres tipos de acodamientos, de los que el tipo III es un tramo de
una hlice 310, y los de tipo I y II son una distorsin de aqulla. En todos los casos la
estructura se estabiliza mediante un solo puente de hidrgeno entre el carbonilo i y en amino i
+ 3. La diferencia entre el tipo II y el tipo I es que el primero tiene el enlace entre n + 1 y n + 2
girado 180, con lo que se provoca el acercamiento del carbonilo i + 1 al grupo R del
aminocido n + 2. Esto se soluciona colocando glicina en la posicin n + 2, ya que su R es un
tomo de hidrgeno, y generalmente n + 1 es prolina, que con su ngulo fijado permite este
tipo de acodamientos. Viendo la secuencia de aminocidos se puede detectar fcilmente un
acodamiento si se lee PG, ya que es una combinacin muy poco frecuente y que slo aparece
en este tipo de estructuras. La frecuencia relativa de aparicin de cada tipo es:
I: 35%.
II: 15%.
III: 15%.
Una hlice : .
Un codo: Horquilla .
La unin entre los distintos elementos de estructura secundaria nunca se hace directamente,
sino que siempre hay unos cuantos restos de unin sin conformacin definida, y que
justamente son los crticos para la funcionalidad de la protena.
Los grupos envuelven un espacio hidrfobo entre el plano de la lmina y la hlice, por lo
que sta tiene que ser anfiptica. El carcter hidrfobo o anfiptico de la lmina depende de
lo que tenga por debajo de ella, ya que por encima al menos, la parte que se encara a la
hlice s tiene que ser hidrfoba. La sucesin modular de este motivo genera el
desplazamiento de Rossmann, que apoya la teora de la generacin modular de las protenas,
a base de ir uniendo elementos estructurales en entidades cada vez mayores.
La sucesin de grupos lineales en horquillas puede generar barriles , en los que la lmina
es anfiptica, o plegamientos ms complejos como el de las inmunoglobulinas.
La unin de grupos lineales paralelos mediante una hlice siempre se hace a derechas,
quizs por la propia torsin del grupo . Adems, siempre se hacen por encima del plano
porque es la manera te liberar tensin del grupo lineal. Dos grupos lineales antiparalelos
consecutivos siempre se unen mediante una horquilla.
Los elementos prximos en la estructura primaria suelen estar tambin prximos en la
estructura secundaria y supersecundaria, de la que surgen los dominios por agrupamiento.
Dos horquillas adyacentes se pueden unir entre s de doce modos diferentes, sin embargo, los
ms corrientes son la unin directa y la unin en greca, con frecuencias 50%, 25%, 25%.
Algunos autores sugieren que la greca ha surgido como una torsin en una sola horquilla larga
despus de que se hubiera producido una insercin.
Protenas fibrosas.
Suelen ser protenas simples y repetitivas destinadas a misiones estructurales.
-queratina.
Son ubicuas en mamferos. Se encuentran en el pelo, las uas y la piel. Su estructura es una
hlice tpica, que luego se enrolla con otra para producir una protofibrilla que se asocia con
otras y produce filamentos gruesos de queratina, que son el componente principal del pelo.
La diferencia en la dureza del pelo y de las uas depende del nmero de puentes disulfuro
que se establezcan.
-queratina.
Aparece en la seda y en las plumas de aves y las escamas de los reptiles. Es una repeticin
de GSGAGA y forma lminas que se apilan unas sobre otras encarando los lados iguales,
produciendo bandas estrechas y anchas.
Colgeno.
Es la protena ms abundante en los mamferos, donde forma el tejido conjuntivo y la matriz
extracelular. Est diseada para resistir grandes tensiones. Estructuralmente es una repeticin
de GXY y contiene mucha prolina, alanina y aminocidos modificados como hidroxiprolina
(Hyp) e hidroxilisina (Hyl).
Un solo polipptido no tiene estructura secundaria, por lo que necesita asociarse a otros dos
para adquirirla. De este modo una molcula de colgeno es un trmero en forma de hlice
dextrgira, en que cada monmero es otra hlice levgira y muy estirada, de slo 1,6 de
radio, 2,9 de paso de rosca y 3,3 restos por vuelta. La estructura se mantiene estable
gracias a que se conserva un resto de glicina cada tres aminocidos, justo donde contactan
los monmeros. Esto permite su acercamiento y el establecimiento de enlaces de hidrgeno
entre cadenas, que ataen al amino de la glicina y al carbonilo del aminocido X de otra
cadena.
Hay cinco tipos de colgeno segn las combinaciones de dos tipos de cadena, que son
producto de dos genes distintos: 1 y 2. Adems, hay cinco alelos de 1: I, II, III, IV y V, y dos
de 2: I y V. Hay muchas hidroxilaciones en el colgeno, adems de otras modificaciones
posttraduccionales como glucosilacin o el entrecruzamiento covalente. La finalidad de las
hidroxilaciones es aportar grupos capaces de formar enlaces de hidrgeno y, por tanto,
estabilizar la estructura. La variacin en la hidroxilacin tambin influye en el tipo de colgeno,
ya que el nmero de hidroxilaciones influye mucho en la dureza del tejido final.
Despus de la sntesis en el retculo endoplsmico rugoso, la prolina se hidroxila gracias a la
prolil hidroxilasa, que incluye oxgeno molecular a la vez que oxida -KG a succinato. La
reaccin requiere vitamina C como cofactor. La lisina tambin se hidroxila de modo parecido
con la lisil hidroxilasa. Los productos de ambas reacciones son 4-hidroxiprolina y 5hidroxilisina.
La falta de vitamina C provoca una falta de hidroxilacin, con lo que el tejido conjuntivo se
vuelve frgil y aparecen los sntomas del escorbuto: cada de pelo, encas sangrantes, dientes
flojos. Por esto los marinos llevaban en los barcos frutas frescas que tienen vitamina C.
La Hyl se glucosila en su paso por el Golgi, primero con Gal con una galactosil transferasa, y
luego con Glc mediante una glucosil transferasa. Con esto queda el oligosacrido Glc(12)Gal-N-Lys. No se sabe muy bien por qu se hidroxila as la Hyl, pero el hecho de que
ocurra en los extremos de las fibras de colgeno sugiere que tenga algo que ver con el
empaquetamiento de estas fibrillas.
Para aguantar la tensin los monmeros se entrecruzan covalentemente mediante puentes
entre lisinas. Para esto la lisil oxidasa realiza una desaminacin oxidativa sobre el -amino de
un residuo de lisina para formar allisina, que es su aldehdo derivado. sta forma una base de
Schiff con otra lisina cercana, que luego se reduce y queda un puente de lisina equivalente a
un puente disulfuro. Adems, tambin se da entrecruzamiento entre allisina y el enol-derivado
de la allisina mediante una condensacin aldlica (recordar 2 Glcidos). La falta de
entrecruzamiento provoca una enfermedad llamada latiguismo, que se sufri despus de la
Guerra Civil porque se coma harina de semilla de altramuz, que tiene -aminopropionitrilo que
es un txico muy potente para la lisil oxidasa porque se une a su centro activo.
La fibrilla de tropocolgeno, la triple hlice, slo tiene el 60% de los aminocidos codificados.
Esto se explica porque se eliminan los cien primeros residuos N-terminales y los trescientos
ltimos C-terminales. Esto se entiende porque los primeros residuos llevan el pptido seal
para dirigir la protena a excrecin, y no se necesitan en la protena nativa, pero el caso de los
ltimos residuos es curioso, porque tiene muchos residuos de cistena que establecen enlaces
disulfuro entre las tres cadenas para favorecer el comienzo de la adquisicin de la estructura
tpica del colgeno. Despus de que la molcula ya est formada, el extremo C-terminal no
sirve de nada y se elimina. En la matriz las molculas de tropocolgeno se ensamblan en
fibrillas en las que cada hueco entre molculas est ligeramente desplazado de respecto al de
la fibrilla de al lado. Esto origina un patrn de bandas claras y oscuras donde no haya o haya
material denso al paso de electrones y, por tanto, huecos.
El colgeno sigue la va exoctica con transporte cotraduccional, y despus de sintetizado se
hidroxila y al pasar al retculo endoplsmico liso se glucosila, pasando a ser precolgeno. En
el Golgi empiezan a unirse los monmeros y a entrecruzarse, y al ser secretado todava tiene
los extremos N- y C-terminales, con lo que es procolgeno. Despus de que las peptidasas de
la matriz lo hidrolicen se tiene tropocolgeno, o colgeno a secas. Es un ejemplo de
transformaciones posttraduccionales.
Elastina.
Tiene un alto porcentaje de glicina (30%), aminocidos hidrfobos como alanina y valina
(30%) y tambin incorpora prolina. Tiene muchas modificaciones posttraduccionales.
Es la excepcin a la regla de que las protenas funcionan gracias a una estructura fija, ya que
su funcin es no tener estructura. Tiene tal cantidad de glicina que no tiene una conformacin
estable, sino muchas y muy variadas porque nunca llega a un mnimo relativo de energa. Por
esto todas las molculas de elastina son distintas.
En la matriz hay una sopa de molculas de elastina que se entrecruzan cono el colgeno y,
adems, a travs de residuos de desmosina, formados a partir de tres allisinas ms una lisina.
Esto unido a la falta de conformacin de la elastina hace que se forme una malla
tridimensional extensible en dos y tres direcciones. Se encuentra en los vasos sanguneos y
otros sitios donde se requiere estiramiento. La desmosina tiene un heterociclo que le da color
amarillo.
Dominios.
Son cada una de las regiones globulares claramente diferenciadas en la estructura
tridimensional de una protena. Son regiones concretas que se distinguen en un mapa de
difraccin de rayos X. Es la unidad bsica del plegamiento independiente. Es una zona del
polipptido que origina una regin globular. Generalmente tienen una funcin caracterstica,
por lo que se pueden asimilar a una funcin biolgica definida. La disposicin en el espacio de
los dominios de una protena determina la estructura terciaria.
Los dominios son elementos estructurales discretos y sencillos que parecen surgir de un
origen comn, sugiriendo un origen modular de las protenas, cada uno con una funcin que
aporta una solucin estructural para un problema determinado y se unen para dar una
protena funcional y con el efecto deseado. Cada familia de protenas con una misma funcin
tiene siempre un mismo dominio comn. La evolucin fue diversificando las protenas a nivel
de recombinacin y unin modular de dominios en el ADN, desde la solucin estructural
simple hasta la unin de varios dominios en una sola protena.
Los dominios se clasifican segn los tipos y disposicin de los elementos de estructura
secundaria. Tambin se pueden clasificar segn el nmero de capas de protena y, por tanto,
del nmero de entornos hidrfobos que generan. Esta clasificacin hace hincapi en la
importancia de las interacciones hidrofbicas en el plegamiento.
Tipo I.
Slo tienen hlices , por lo que forzosamente son antiparalelas:
Con grecas.
Se encuentran en muchas protenas distintas, principalmente de transporte de molculas
apolares. Realmente la mayora de las veces son dos lminas que se unen en forma de
barril o de bocadillo. El barril permite disponer molculas dentro, por lo que los grupos lineales
son anfipticos para poder encararse al exterior. En este apartado hay que destacar la
importancia de la relacin entre forma y funcin. La protena que une retinol (RBP: retinol
binding protein, en ingls) y lo transporta en la sangre desde el hgado hasta donde haga falta,
es un barril antiparalelo. La -lactoglobulina de la leche no se saba qu haca, pero tena la
misma estructura que la RBP, con lo que se supuso que serva para llevar retinol a los
lactantes, y se vio que es as porque hay un receptor para ese complejo en el intestino, y
despus se comprob en ms estudios.
El segundo subtipo tambin puede formar barriles, pero no estn abiertos, sino que estn
tapados por los segmentos de conexin entre los distintos grupos lineales. Por esta razn no
sirven para transporte. Una vez ms el centro activo se encuentra en estos segmentos.
Estructura terciaria.
Cada dominio suele ser producto de una seccin nica de la cadena polipeptdica con
plegamiento independiente, pero tambin se generan por secciones no consecutivas en la
secuencia.
El centro activo suele estar en la interfase entre dominios porque cada uno realiza una funcin
definida. Si slo hay un dominio hay identidad con la estructura terciaria.
Estructura cuaternaria.
Se da por la asociacin de protena de la que surgen funciones, regulaciones y caractersticas
nuevas mediante el fenmeno del alosterismo, que es la modulacin de la actividad del
complejo entero por la variacin en la actividad de uno de los monmeros al haber unido algn
ligando o substrato, y que se transmite a los dems mediante las fuerzas de unin entre ellos.
Las interfases entre polipptidos suelen ser hidrfobas y se asocian mediante fuerzas de Van
der Waals y una necesaria complementariedad espacial.
La gran ventaja de agrupar protenas es que se pueden tener las enzimas de una sola ruta
todas juntas, y evitar que los substratos tengan que difundir.
Protenas globulares.
Mioglobina.
Monmero formado en un 80% por hlice . Constituye un dominio tipo I en greca o de hlices
cruzadas. Tiene ocho hlices (A a H) y siete tramos de conexin (AB a GH). Todo el interior
tiene restos apolares y el interior restos polares. Hay dos excepciones en dos histidinas E7 y
F8 cargadas y encaradas al interior, flaqueando al grupo prosttico hemo (Fe2+-protoporfirina
IX). Cuatro de las hlices se rompen por prolina y el resto porque el hidroxilo de serina o
treonina establecen puentes de hidrgeno con el amino del esqueleto polipeptdico.
Tiene tres exones, de los que el central es el mayor y parece el responsable de unir hemo.
Tratando la protena con clostripana, que corta por las arginina, se obtiene una miniglobina
que contiene casi todo el exn central y es capaz de unir hemo.
EL hemo es el ismero IX de la protoporfirina al que se une un catin Fe2+ estableciendo
enlaces de coordinacin con los nitrgenos del ciclo. Destacan dos radicales propinico que
sirven para tapar el hueco una vez instalado en su sitio. El anillo plano de hemo se introduce
en un bolsillo hidrfobo entre las hlices 7 y 8 de tal modo que el Fe2+ enlaza con la HisF8
(histidina proximal) mediante un quinto enlace de coordinacin, y la HisE7 (histidina distal)
est cerca de la sexta posicin de coordinacin pero sin enlazar con el hierro. El hueco que
deja es el justo para que una molcula de oxgeno entre y enlace formando un ngulo de 121
con el plano del hemo y el hierro quede totalmente sustituido. En ese momento el tomo de
desplaza y pasa de estar 0,3 por debajo a estar 0,2 por encima del plano, lo que provoca
un cambio conformacional en la protena.
El bolsillo hidrfobo evita que el Fe2+ se oxide, ya que si lo hace no funciona como transporte
de oxgeno, y los radicales propinico tapizan por fuera el entorno hidrfilo de la mioglobina.
La HisE7 evita que entre donde el oxgeno ninguna otra cosa distinta. Adems, disminuye la
afinidad del hemo por el CO de 25000 a slo 200 veces ms que la afinidad por el O2, porque
obliga al CO a formar un ngulo de 120, y no de 90, donde la interaccin sera mayor. Con
esto se consigue que el 99% de las molculas estn saturadas de oxgeno y que no unan el
CO que se produce endgenamente.
Hemoglobina.
Es un tetrmero 22, cada una de las subunidades con estructura idntica a la de
mioglobina. Hay varios genes de hemoglobina que cambian su expresin y combinacin
durante el desarrollo.
La actividad del tetrmero se regula con otra molcula, el 2,3-bisfosfoglicerato y que aparece
en la estructura cuaternaria como un elemento nuevo de regulacin.
Respecto a la mioglobina se conservan los residuos crticos, como las histidinas y los
comienzos y finales de las hlices, por lo tanto son los que ayudan a realizar la misin. Hay
restos invariados, conservados y variables.
Se puede hacer taxonoma molecular, que consiste en fabricar rboles de evolucin y filogenia
tomando como referencia los cambios observados en la secuencia de aminocidos. Cuanto
ms importante sea la protena menos cambios acumular a lo largo del tiempo y ms
fcilmente se podr asimilar su estudio a una evolucin especfica. Cuanto mayor sea la
diferencia, anterior tiene que haber sido la divergencia.
Introduccin
Las plantas ejercen gran influencia en todos los procesos que transcurren en nuestro planeta. Al realizar
la nutricin auttrofa, bajo la accin de la energa solar, transforman el dixido de carbono (CO2(g)), aguas y
sales minerales en complejos compuestos orgnicos.
Todo el ciclo complejo de la sntesis de compuestos orgnicos nitrogenados en las plantas comienza con el
amoniaco (NH3) y su degradacin termina tambin con la formacin de amoniaco.
La sntesis de aminocidos y protenas en las plantas se realiza a cuenta del nitrgeno que se absorbe
del ambiente exterior.
La absorcin ms intensa de las plantas y su utilizacin para la produccin de aminocidos y protenas tiene
lugar en el perodo de mximo crecimiento y formacin de los rganos vegetativos como tallos y hojas. En los
rganos crecientes ms jvenes predominan los procesos de sntesis de protenas, y en los ms viejos los
procesos de degradacin.
Aminocidos
Los aminocidos pueden existir libres en el tejido vegetal y animal o formando parte de los pptidos y las
protenas. Tienen diversas funciones biolgicas, forman parte de importantes compuestos biolgicos
como vitaminas, hormonas y algunos son intermediarios de ciclos metablicos.
Independientemente de las importantes funciones que tiene los aminocidos la fundamental es ser las
unidades estructurales que conforman los pptidos y las protenas.
Se considera que los aminocidos son los productos iniciales de la asimilacin del nitrgeno.
Experimentalmente se ha demostrado que siguiendo la asimilacin de nutrientes inorgnicos que contienen
N15 se ha puesto de manifiesto que en la mayora de los compuestos receptores iniciales del nitrgeno son
los ( cetocidos libres del citoplasma.
1.1 Estructura.
Los aminocidos constituyen una importante clase de compuestos orgnicos que contienen al menos
un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH). Veinte de estos compuestos son los constituyentes de
las protenas y se los conoce como ?aminocidos (a-aminocidos). Todos ellos responden a la siguiente
frmula general:
Como muestra dicha frmula, los grupos amino y carboxilo se encuentran unidos al mismo tomo de carbono,
llamado tomo de carbono alfa. Ligado a l se encuentra un grupo variable (R). Es en dichos grupos R donde
las molculas de los veinte ?aminocidos se diferencian unas de otras. En la glicina, el ms simple de los
aminocidos, el grupo R se compone de un nico tomo de hidrgeno. En otros aminocidos el grupo R es
ms complejo, conteniendo carbono e hidrgeno, as como oxgeno, nitrgeno y azufre.
Numerosas investigaciones que se han realizado han demostrado que los aminocidos que se encuentran en
las protenas vegetales son los siguientes.
Glicina, Alanina, Valina, Leucina, Isoleucina, Serina, Treonina, Fenilalanina, Tirosina, Triptfano, Cistina,
Cistena, Metionina, Prolina, Hidroxiprolina, cido Asprtico, cido Glutmico, Histidina, Arginina y Lisina.
Tabla No.1 Estructura de los aminocidos.
Nombre
Glicina
Estructura
Abreviatura
Gli
Alanina
Ala
Valina
Val
Leucina
Leu
Isoleucina
Ile
Serina
Ser
Treonina
Tre
Fenilalanina
Phe
Tirosina
Tir
Triptfano
Cistena
Trp
Cis-Cis
Metionina
Met
Prolina
Pro
Hidrxiprolina
Hip
cido Asprtico
Asp
cido Glutmico
Glu
Histidina
His
Arginina
Arg
Lisina
Lis
Cistena Cis
Los ( cetocidos son parecidos a los aminocidos, diferencindose por tener un oxgeno unido al carbono alfa
((), en lugar de tener un grupo amino (NH2). Se puede decir tambin que los aminocidos
son cidos aminados ya que tienen el grupo carboxlico (-COOH) y el grupo amino (- NH2).
1.4 Nomenclatura.
Si se tiene en cuenta el sistema oficial de nomenclatura (UIQPA) los aminocidos son considerados como un
cido orgnico con un hidrgeno de la cadena carbonada sustituido por un grupo amino (-NH2) y al
nombrarlos se considera el nmero del tomo de carbono donde se encuentra unido el grupo amino en la
cadena principal del cido, por ejemplo:
No obstante lo sealado anteriormente se debe considerar que para estos compuestos se utiliza
generalmente la nomenclatura comn.
1.5 Propiedades Fsicas.
Se ha demostrado experimentalmente que los aminocidos son sustancias cristalinas. Por lo general solubles
en agua y en soluciones acdicas o bsicas diludas.
Son insolubles o muy poco solubles en alcohol, son insolubles en ter, aunque algunos tienen
un comportamiento contrario. Por ejemplo: La cistena es poco soluble en agua, la prolina es soluble en ter y
alcohol.
Los aminocidos tienen un punto de fusin alto que sobrepasa los 2000 C y algunos los 3000 C. Aunque a
temperaturas por encima se descomponen, siendo muy difcil separarlos por destilacin fraccionada.
Propiedades pticas de los aminocidos.
Todos los aminocidos presentan actividad ptica. Esto se debe a que estos compuestos tienen
la propiedad de desviar el plano de vibracin de la luz polarizada a favor o en contra de las manecillas del
reloj es decir a la derecha o a la izquierda, ello se determina experimentalmente en un polarmetro.
La actividad ptica de los aminocidos se debe a que el carbono alfa de los mismos constituye un centro
estereognico, con la excepcin de la glicina.
Cuando se determina experimentalmente que un aminocido es dextrgiro, ello quiere decir que desva el
plano de vibracin de la luz polarizada hacia la derecha y se representa por el signo ms (+). Si la desviacin
se produce hacia la izquierda se denomina levgiro y se representa por el signo menos (-), conceptos
estudiados en el Captulo No I.
Se puede afirmar que los aminocidos que pertenecen a la serie L son aquellos que el grupo alfa amino (NH2) est orientado hacia el mismo lado que el OH del L Gliceraldehdo, es decir hacia la izquierda y los que
pertenecen a la serie D tienen la configuracin similar al D Gliceraldehdo, hacia la derecha.
Se debe tener presente que el poder rotatorio del aminocido dextrgiro (+) o levgiro (-) que se determina en
el polarmetro no tiene que coincidir con la serie D o L a la que pertenezca el aminocido.
Por ejemplo el a.a. L (+) cido Glutmico, es dextrgiro con un poder rotatorio especfico de 12,00 y pertenece
a la serie L, sin embargo la L (-) Leucina pertenece a la serie L y tiene un poder rotatorio especfico de 11,0O
es decir es levgiro.
Punto Isoelctrico de un Aminocido.
Se puede plantear que el punto isoelctrico es un valor del pH en el cual el aminocido presenta carga neta
cero y en un campo elctrico no migra ni hacia el nodo ni hacia el ctodo.
El punto isoelctrico es una caracterstica particular de cada aminocido. Por ejemplo para la glicina es de
6,0, para la fenilalanina 5,5, para el cido glutmico 3,2 etc.
En este punto isoelctrico el aminocido se encuentra fundamentalmente es su forma de in dipolar o
Zwitterin.
De acuerdo a la relacin entre los valores de pH del medio y del P.I. de los aminocidos, predominar una u
otra forma de sus posibles especies inicas. Y por tanto, la carga neta variar tambin en funcin de esta
relacin.
La misma puede considerarse para fines prcticos como se seala a continuacin.
S El amino cido. presenta
pH ( PI Carga neta positiva
pH = PI Carga neta cero
pH ( PI Carga neta negativa
Para los aminocidos neutros el P.I. ( 6
Para los aminocidos cidos el P.I. ( 6
Para los aminocidos bsicos P.I. ( 6
1.6 Propiedades qumicas de los aminocidos.
Los aminocidos manifiestan muchas de las reacciones caractersticas de los cidos carboxlicos y de las
aminas alifticas, tambin se ha demostrado que el grupo amino participa en diversas reacciones importantes
en la determinacin cualitativa y cuantitativa de los aminocidos.
Reacciones por los grupos carboxilo.
El grupo carboxilo de los aminocidos experimenta reacciones de descarboxilacin, formacin de sales,
formacin de aminas por descarboxilacin.
Descarboxilacin.
En los aminocidos al reaccionar con el hidrxido de Bario Ba(OH)2 en presencia de calor, se produce la
descarboxilacin y se forman las aminas bigenas, sustancias de gran importancia biolgica. En el organismo
esta reaccin ocurre por la accin cataltica de la enzima descarboxilasa.
Formacin de Amidas.
Los aminocidos forman amidas al reaccionar sus steres con el amonio o con aminas.
En el segundo caso se formar una amida. Este es el tipo de enlace que une a los aminocidos entre s para
formar los pptidos y protenas.
Formacin de Sales.
Los aminocidos forman sales debido a las reacciones tanto del grupo carboxilo como del grupo amino,
cuando se les adicionan bases o cidos respectivamente.
Esta es la reaccin que se utiliza para determinar el nitrgeno del grupo amino, se conoce
como procedimiento de Von Slyke y sirve para estimar los grupos aminos libres de los pptidos y las protenas
midiendo la cantidad de nitrgeno liberado.
c) Reaccin con el 1- Flor-2,4 dinitrobenceno (FDNB).
Los grupos aminos de los a.a. reaccionan con el FDNB (reactivo de Sanger) en solucin bsica y se forman
dinitrobenceno aminocidos de color amarillo brillante. Esta reaccin se emplea para la determinacin de los
aminocidos N-terminales de pptidos y protenas.
Esta reaccin se conoce como mtodo de Sanger por haber sido descubierta por Frederick Sanger (19451950) trabajo que lo hizo acreedor del premio Nobel y que culmin en la determinacin de la estructura
completa de la Insulina.
d) Desaminacin Oxidativa.
El grupo amino puede ser liberado de los aminocidos por oxidacin.
Los sistemas enzimticos de algunos tejidos catalizan la desaminacin oxidativa de los aminocidos,
convirtindolos en sus ceto-cidos correspondientes con eliminacin del amoniaco. Esta reaccin ocurre en
dos etapas.
Cuando la ninhidrina reacciona con el aminocido este se oxida a aldehdo y la ninhidrina se reduce a
hidridantina. Esta ltima reacciona con otra molcula de ninhidrina y con el amoniaco producido en la primera
reaccin, formndose un producto coloreado azul.
Esta reaccin es muy importante ya que es la base de un mtodo colorimtrico de valoracin de aminocidos.
1.7 Importancia.
Los ?-aminocidos son la base estructural de las protenas y sirven de materia prima en la obtencin de otros
productos celulares, como hormonas y pigmentos. Adems, varios de estos aminocidos son intermediarios
fundamentales en el metabolismo celular.
La mayora de las plantas y microorganismos son capaces de utilizar compuestos inorgnicos para obtener
todos los aminocidos necesarios en su crecimiento, pero los animales necesitan conseguir algunos de los ?aminocidos a travs de su dieta. A estos aminocidos se les llama esenciales, y en el ser humano son: lisina,
triptfano, valina, histidina, leucina, isoleucina, fenilalanina, treotina, metionina y arginina. Todos ellos se
encuentran en cantidades adecuadas en los alimentos de origen animal ricos en protenas, y en ciertas
combinaciones de protenas de plantas.
Aparte de los aminocidos de las protenas, se han encontrado en la naturaleza ms de 150 tipos diferentes
de aminocidos, incluidos algunos que contienen los grupos amino y carboxilo ligados a tomos de carbono
separados. Estos aminocidos de estructura poco usual se encuentran sobre todo en hongos y plantas
superiores.
Pptidos
Los pptidos son polmeros de aminocidos de menor masa que las protenas. Cuando contienen menos de
diez aminocidos se denominan oligopptidos, y los que tienen ms de diez, polipptidos.
Los pptidos se pueden definir a como aquellos compuestos que se forman por la unin de dos o ms
aminocidos mediante enlaces peptdicos liberando una o ms molculas de agua.
2.1 Estructura.
En los pptidos los aminocidos se hallan unidos por los llamados enlaces peptdicos entre sus grupos
carboxilo (COOH) y amino (NH2)
Experimentalmente se han demostrado las caractersticas de este enlace como se puede observar en la
siguiente figura.
La distancia entre el nitrgeno y el carbono en el enlace peptdico es de 0.132nm en vez de 0.147nm que
posee el enlace simple C-N.
Este acortamiento del enlace peptdico se debe a que el mismo posee cierto carcter de doble enlace
(aproximadamente un 5.0%). Este carcter de doble enlace determina que el mismo no puede girar libremente
lo que da lugar a dos consecuencias importantes para la estructura del pptido.
Los tomos del enlace peptdico se encuentra en el mismo plano.
Debido a la rigidez dada por este enlace, son posibles dos configuraciones (CIS Y TRANS) de las
cuales solo la TRANS se ha observado en los pptidos y protenas.
2.2 Clasificacin.
Los pptidos se clasifican de acuerdo a la cantidad de aminocidos que lo forman en:
Dipptidos, si contienen dos aminocidos.
Tambin para representar la estructura de los pptidos en forma simplificada se acostumbra a utilizar las
abreviaturas de los aminocidos constituyentes unidos por un guin cuando el orden sea conocido, o por una
coma cuando solo se conozca su composicin, en el caso representado Val-Ala-Gli.
Propiedades qumicas
Hidrlisis
Se ha demostrado que el enlace peptdico es un enlace fuerte en determinadas condiciones. Pero si se aade
una molcula de agua a un dipptido, se logra la ruptura de los enlaces peptdicos y la consecuente
separacin de los aminocidos contenidos en el pptido, por ejemplo.
Hidrlisis de la alanilglicina
Protenas
El trmino protena se introdujo por Mulder (1839) como la derivacin de la palabra griega Protelos (que
significa primero).
Las protenas como los pptidos son sustancias formadas por la unin de muchos aminocidos. Son
sustancias nitrogenadas que se encuentran en el protoplasma de todas las clulas animales y vegetales. Su
composicin varia de acuerdo a su origen, aproximadamente contiene carbono de 46 a 55%; hidrgeno de 6 a
9%, oxgeno de 12 a 30%; nitrgeno de 10 a 32%; azufre de 0,2 a 0,3%
Tambin pueden tener otros elementos por ejemplo fsforo las nucleoprotenas, hierro la Hemoglobina, etc.
Las masas moleculares de las protenas son muy altas y presentan valores que median entre 1500 y 20 000
000 para las diferentes protenas.
Las protenas son de naturaleza coloidal, con puntos de fusin caractersticos, aunque algunas se han
obtenido en forma cristalina. Todas son pticamente activas (levgiros).
3.1Estructura.
Las protenas son una familia muy heterognea debido a la alta masa molecular que presentan las molculas
proteicas y estn constituidas por una cantidad determinada de diversos aminocidos.
El estudio de las estructuras de las protenas, es fundamental para poder comprender la biognesis de las
mismas, su funcin biolgica y sus relaciones con otros componentes de la clula, independientemente de
tipo de protena, con el objetivo de analizar ms detalladamente su estructura, es conveniente establecer
determinados niveles de organizacin o estructuras.
3.2 Niveles de organizacin estructural: los niveles de organizacin estructural de las protenas son
estructura primaria, estructura secundaria, estructura terciaria y estructura cuaternaria.
Estructura Primaria.
Llamada tambin nivel de organizacin primario se caracteriza por el ordenamiento en que se encuentran los
aminocidos en la cadena peptdica, organizada por la repeticin de las molculas de aminocidos.
Solo un grupo de tomos integra la cadena peptdica, por ejemplo el nitrgeno amdico, el carbono alfa y el
carbono carbonlico. El resto de las molculas de los aminocidos se proyectan hacia fuera de la cadena y
constituyen los grupos R.
Como el enlace peptdico es un enlace covalente, toda la estructura de la cadena la forma un esqueleto
covalente, lo cual explica la estabilidad y resistencia de esta estructura.
caracterizada por una determinada secuencia, es decir, el orden en que se encuentran situados los
aminocidos es la cadena. Esta secuencia est determinada genticamente.
Se ha determinado que la cantidad de posibles secuencias es muy grande.
Por ejemplo:
Si una cadena peptdica tiene 100 aminocidos, podr dar lugar tericamente a 20100 secuencias posibles,
valor extremadamente grande.
Si se tiene en cuenta que existen diversas protenas con ms de 100 residuos, se puede concluir la gran
cantidad de molculas proteicas posibles.
Para determinar la secuencia de los aminocidos en las protenas se utilizan mtodos qumicos y fsicos.
Entre los mtodos qumicos se incluye la determinacin del grupo aminoterminal utilizando 1- Flor 2,4
dinitro benceno (FDNB) o con el cloruro de bencilo, y la determinacin secuencial de los aminocidos
a partir del grupo amino libre, mediante el reactivo de Edman o fenil Isotiocianato.
Para el fraccionamiento parcial de las cadenas peptdicas se utilizan enzimas proteolticas como la tripsina,
pepsina y otras. Tambin se utiliza como reactivo qumico el bromuro de ciangeno.
Existen mtodos fsicos utilizados para determinar la masa molecular de las protenas como la
ultracentrifugacin analtica, la medida de la presin osmtica o la filtracin de geles.
Adems para la separacin de aminocidos y pptidos se emplean los mtodos cromatogrficos de la capa
fina, papel y columna as como la electrofloresis.
La primera secuencia completa de una protena, la hormona Insulina, fue obtenida en 1953 por Frederik
Sanger y colaboradores. A partir de ese momento se han determinado las secuencias de numerosas protenas
como la Ribonucleasa, la lisozima, la hormona ACTH etc.
Estudios realizados de las diferentes secuencias que se conocen hasta este momento han permitido llegar a
algunas conclusiones generales.
Las protenas estn constituidas por L aminocidos unidos por enlaces peptdicos. Otros enlaces
covalentes son raros.
La composicin y el orden de los aminocidos es muy variable.
Las secuencias repetidas en una protena no son comunes.
Cada protena particular tiene una secuencia nica.
Los estudios realizados en cuanto a que las protenas particulares presentan una secuencia nica,
demuestran el hecho de que esta secuencia se establece genticamente, es decir, que son los genes los que
portan la informacin de la misma y la trasmiten de una generacin a otra.
Si se produce una diferencia en este mecanismo, que determine cambios en la secuencia de aminocidos y
de variantes anormales en la protena, se producirn anormalidades y enfermedades en los organismos vivos.
Estructura secundaria.
Se conoce tambin por nivel de organizacin secundaria y est dado por nivel de ordenamiento que presenta
la cadena peptdica a lo largo del eje, producido por la interaccin de grupos carbonilo y amdico por
interacciones por puentes de hidrgeno.
Se ha determinado que las interacciones por puentes de hidrgeno que se establecen cuando este elemento
se encuentra entre dos elementos ligeros y ms electronegativos. Se consideran enlaces relativamente
dbiles, aproximadamente de 9,3 a 19 kJ/mole. Gran nmero de estas interacciones pueden integrarse a
expensas de los grupos amdicos y cabonlios posibilitando la formacin de estructuras con gran estabilidad.
Las estructuras que se pueden formar se reducen a unos pocos tipos, ya que existen diversos factores que
condicionan o limitan las posibilidades existentes.
El conocimiento de esto se inici debido a los trabajos de Linus Pauling y Robert Corey al utilizar la tcnica de
difraccin de rayos x con amidas sustituidas y pequeos pptidos. Estos logran medir las distancias y ngulo
del enlace peptdico.
Los siguientes requisitos, postulados inicialmente por Pauling y Corey han sido demostrados
experimentalmente.
Todos los aminocidos pertenecen a la serie L.
Todos los tomos anexos al enlace peptdico estn en el mismo plano y en la configuracin "TRANS"
Estos planos solo pueden girar en cierta medida unos con relacin a otros en sus puntos de unin
constituidos por los carbonos alfa (()
Los residuos de los aminocidos no contribuyen a la estructura.
La formacin de los puentes de hidrgeno, solo se verificar cuando la distancia entre el hidrgeno y
el oxgeno no sea mayor de 0,28 nm y los tomos del enlace formen aproximadamente una lnea recta.
Las protenas globulares solubles tienden a estar mucho ms plegadas que las protenas fibrosas. Las
protenas fibrosas tambin tienen estructura terciaria; por ejemplo, los filamentos helicoidales ???de la ??
queratina est unidos entre s en una superhlice. Aun las superhlices pueden enlazarse entre s para formar
una estructura similar a una cuerda de siete filamentos.
Estructura cuaternaria.
Muchas protenas globulares de masa molecular superior a 50 000 poseen ms de una cadena y se conocen
como oligmeros.
El modo caracterstico en que las cadenas individuales encajan unas con otras en la conformacin nativa es
precisamente su estructura cuaternaria.
En la hemoglobina las cuatro cadenas se acoplan estrechamente formando un conjunto globular de gran
estabilidad, a pesar que no existe enlace covalente alguno entre ellas, sino que son fuerzas inicas o polares.
En muchas protenas oligmeras las cadenas individuales estn tan unidas que la partcula completa suele
comportarse en disolucin como una sola molcula. Todas estas cadenas componentes de las protenas
oligmeras son generalmente necesarias para su funcin.
3.1 Clasificacin.
Actualmente se conocen un nmero grande de estructuras y funciones que presentan las protenas, por ello
no es fcil clasificarlas a todas convenientemente.
Bibliografa