1.2 Bioquímica Bàsica

PROPEDUTICO DE ODONTOLOGA
BIOQUMICA BSICA
Dagmar Stojanovic de Malpica Ph D
Escuela de Biologa, Facultad de Ciencias, U.C.V.
2012
Unidad I.II
Monmeros y Formacin de
Macromolculas
Estructura y Funcin de Carbohidratos,
Protenas y cidos Nucleicos
D. Stojanovic de Malpica, Ph D
PROPEDUTICO DE ODONTOLOGA, UCV
Nivel 4
La clula y sus organelos
Nivel 3
Complejos supramoleculares
Nivel 2
Macromolculas
Nivel 1
Monmeros
Cromosoma
ADN
Nucletidos
Aminocidos
Protena
Membrana celular
Pared celular
Celulosa
Monosacridos

Jerarqua molecular
Son unidades estructurales que contienen grupos
qumicos iguales o diferentes que se combinan entre
si para formar dmeros, oligmeros (pocos) o
polmeros (muchos)
Monmero Monmero
Dmero
Condensacin
Hidrlisis
Enzima A
Enzima B
Caractersticas de los monmeros
Los Monmeros: son las unidades estructurales
de las macromolculas
! Los monosacridos
! Los aminocidos
! Los nucletidos
Oligosacridos
Polisacridos
Protenas
cidos Nucleicos
CARBOHIDRATOS
Clasificacin de los carbohidratos
Disacridos
Formacin de disacridos
Son glucsidos o acetales formados por la
unin de dos monosacridos
tomo de carbono anomrico (C1 )
Formacin de un disacrido:
La Maltosa
Glc !1,4 Glc
Extremo
no reductor
Extremo
reductor
Azcar reductor
Formacin de un enlace O-glicosdico
La cebada
PROPEDUTICO DE
ODONTOLOGA, UCV
Condensacin
Hidrlisis
-D-Glucosa
Maltosa
Condensacin
-D-Glucopiranosil- (1-4)-D-Glucopiranosa
Azcar reductor
Lactosa (forma Lactosa (forma )
-D-Galactopiranosil (1-4)--D-
Glucopiranosa
Gal4Glc)
La Lactosa: el azcar de la leche
La Sacarosa: azcar de mesa
Azcar no reductor
Se produce en las hojas y races de las plantas
Fructosa
Glucosa
Enlace
2-1
Fru !2-1" Glc
La Celobiosa
Glc !-1,4 Glc
Azcar reductor
Producto de degradacin de la celulosa ( polisacrido de plantas)
Propiedades y funciones de los disacridos
" Algunos son azcares reductores
" Son necesarios en la dieta ya que son fuente de
energa.
" Para utilizarlos como fuente de energa, los
disacridos son hidrolizados por enzimas que
tapizan el intestino delgado
" La hidrlisis de los disacridos produce Glucosa,
Fructosa, Galactosa, que son la fuente de
energa inmediata para las clulas
Los oligosacridos
" Contienen de dos a diez unidades de
monosacridos
" Mayoritariamente se encuentra unidos
covalentemente a polipptidos
(glicoprotenas) lpidos (glicolpidos)
Polisacridos
Homopolisacridos
Heteropolisacridos
Ramificados No Ramificados

Dos clases de
Monmeros
Ramificados
Varios tipos de
monmeros
Ramificados
Clases de polisacridos
Polisacridos en plantas y animales
Tipo de
organismo y
clula donde se
encuentra
Nombre del
polisacrido
Unidad de repeticin
lineal y/o ramificado
Nmero de
residuos
de Glucosa
Funcin biolgica

Plantas
Cloroplastos
Almidn
("-amilosa)
Glc"1,4Glc, lineal 50-5000

Reserva de
energa
Almidn
(amilopectina
Glc "1,4Glc, lineal
con ramas "1,6Glc
cada 27 residuos ~
1.000.000
Animales
Citosol
Glucgeno Glc "1,4Glc, lineal
con ramas "1,6Glc
cada 10 residuos ~
50.000 Reserva de
energa
Plantas
Pared Celular
Celulosa Glc !1,4Glc, lineal 15.000 Papel estructural
Soporte y
Proteccin celular
El almidn y el glucgeno constituyen reserva
de energa
El Almidn
Estructura del almidn
" El almidn se encuentra
como grnulos en los
cloroplastos de las clulas de
las plantas
" Contiene dos clases de
polisacridos:
La Amilosa
La Amilopectina
" Constituyen una fuente
importante de reserva de
energa en plantas
Grnulos de Almidn
Cloroplasto
Estructura de la amilosa
Extremo
No
Reductor
Extremo
Reductor
Glc "1,4 Glc
Nmero de residuos de Glucosa: 50-5000
Polmero lineal
Estructura de la amilopectina
E
x
t
r
e
m
o
s

n
o

r
e
d
u
c
t
o
r
e
s

Enlace ! 1,6
Punto de ramificacin
Glc"1,4Glc, lineal con ramas "1,6 Glc cada 27 residuos
Nmero de residuos de Glc ~ : 1.000.000
Polisacrido ramificado
El Glucgeno
Grnulos de glucgeno
en el citosol de clulas
animales
" Se encuentra en el citosol de las
clulas (bacterias y animales)
" Cada granulo de glucgeno consiste
de un polisacrido ramificado que
contiene hasta 50.000 residuos de
Glucosa
" Es la principal reserva de energa en
bacterias, animales y en el hombre
" En las clulas humanas se encuentra
principalmente en hgado y msculo
Amilopectina Glucgeno
Un solo punto de
ramificacin
Un solo punto de ramificacin
Comparacin de la amilopectina y el glucgeno
Conformacin 3D de la amilosa, amilopectina
y el glucgeno
Enlace Glc1,4Glc
rota fcilmente
Forma compacta 3D
grnulo
La celulosa: polisacrido estructural en
plantas
" La celulosa se encuentra en el
tronco, en los tallos y en toda la
porcin leosa de las plantas
" Se encuentra en la pared celular
de las plantas
" El algodn y la madera estn
formados por celulosa; el papel es
celulosa
" Funcin estructural: proporciona
soporte y rigidez a las plantas y
proteccin a las clulas
Unidad de repeticin
Glc "1,4 Glc
(Celobiosa)
Haz de mircofibrillas
" El polisacrido de la glucosa es lineal e insoluble ; contiene 15000 unidades
de glucosa unidas entre si por enlace "1,4Glc; varios pares de polisacridos
forman lminas llamadas microfibrillas.
" Cada haz de microfibrillas contiene ~40 pares de polisacridos lineales
" El enlace "1,4 no puede rotar, por lo que los polisacridos son rgidos; forman
puentes de hidrgeno entre ellos y se hidratan fcilmente con agua
La celulosa
Digestin de la celulosa por los organismos
" En el aparato digestivo de herbvoros (ovino y
bovino) viven bacterias que contienen la enzima
celulasa que digieren la celulosa (rompen el
enlace "1,4), lo que permite a los herbvoros
nutrirse de ella
" Los humanos no pueden digerir la celulosa, no
obstante, proporciona fibra, que ayuda al
funcionamiento correcto de nuestro aparato
digestivo
,
PROTENAS
Estructura general de un aminocido
a pH 7

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D. Stojanovic de
Malpica, Ph D
PROPEDUTICO DE
ODONTOLOGA, UCV
El enlace peptdico
Formacin del enlace peptdico
" El enlace peptdico es un
e n l a c e a mi d a q u e s e
establece entre el grupo !-
carboxilo de un aminocido y
el grupo !-amino del otro
aminocido
" Todos los pptidos tienen un
grupo !-amino libre en un
extremo, a la izquierda, (N-
termi nal ) y un grupo !-
carboxilo libre en el otro, a la
derecha (C-terminal), que
p e r t e n e c e a l l t i m o
aminocido aadido a la
cadena.

" Tiene carcter parcial de doble enlace, el oxgeno del carbonilo
tiene una carga parcial negativa y el nitrgeno de la amida una
carga parcial positiva
" El enlace amida tiene configuracin trans ,es planar y rgido,
porque no puede rotar sobre si mismo
" No obstante, los pptidos y polipptidos pueden rotar
alrededor de dos puntos: los enlaces: C!-C y N C!
" Por lo que pueden adoptar adoptar diferentes conformaciones
(3D)
Caractersticas del enlace peptdico
Todos los tomos involucrados en el enlace
peptdico se encuentran en un mismo plano
Amino
terminal
Carboxi
terminal
Ejemplo de un pentapptido
N-terminal Ser-Gli- Tyr-Ala-Leu C-terminal
1 2 3 4 5
Secuencia
Los pptidos y polipptidos se ionizan a
diferentes pH
pH 7
N-terminal
C-terminal
Caractersticas moleculares de algunas
protenas
Protena Peso Molecular Nmero de
residuos de
aminocidos
Nmero de
cadenas
polipeptdicas
Citocromo c
(humano)
13.000 104 1
Mioglobina
(humano)
16.890 153 1
Hemoglobina
(humano)
64.500 574 4
ARN polimerasa
E. coli
450.000 4158 5
Algunas protenas son conjugadas
Clase Grupo*
Prosttico
Ejemplo
Lipoprotenas Lpidos Lipoprotena de
la sangre
Glicoprotenas Carbohidratos Inmunogloublina G
Fosfoprotenas Fosfatos Casena de la
leche
Hemoprotenas Hemo (anillo de
porfirina + Fe
2+
)
Mioglobina
Hemoglobina
* Pueder estar asociado no covalentemente o covalentemente a la protena
Estructura
Primaria
Estructura
Secundaria
Estructura
Terciaria
Estructura
Cuaternaria
Secuencia de
aminocidos
-Hlice
Plegamiento 3D
del polipptido
Consiste de dos mas
subunidades
Conformacin nativa a pH 7
Niveles de organizacin de las protenas
Niveles de organizacin estructural de las
protenas
" Los niveles de organizacin estn dictados por la
secuencia de aminocidos
" Se estabilizan por interacciones entre los grupos R de
la protena , pueden ser:
" No covalentes: puentes de hidrgeno, atraccin
electrosttica (puente salino) e hidrofbicas
" Covalentes: puentes de disulfuro entre otros
" Formacin de puentes hidrgeno entre los grupos
C=O y N-H

de los enlaces peptdicos (estructura
secundaria)
Estructura Primaria
Estructura primaria:
Secuencia de aminocidos de una
cadena polipeptdica
Se escribe del N- al C-terminal
N-terminal Ser-Gli- Tyr-Ala-Leu C-terminal
1 2 3 4 5
Pentapptido:
Secuencia
Estructura secundaria
" Es la conformacin local de secuencias de residuos de
aminocidos en un polipptido

" Se distinguen tres clases de estructura secundaria:
! Hlice
Lmina " plegada
Vueltas-"

" La secuencia de aminocidos determina la conformacin local

" La estructura secundaria se estabiliza por puentes de hidrgeno
entre los grupos carbonilo (C=0) y NH de los enlaces peptdicos
Amino terminal
Carboxi terminal
3,6 residuos por
vuelta
Puente de
hidrgeno
Estructura secundaria: ! hlice orientada a la derecha
Formacin de puentes de hidrgeno
en la !-Hlice

C-terminal
N-terminal
" Todos los grupos C=O y NH de los enlaces peptdicos
participan en la formacin de puentes de hidrgeno, excepto
los que se encuentran en el extremo N- y C- terminal del
polipptido
" El puente de hidrgeno se establece entre el grupo C=O de
un residuo y el grupo N-H con el cuarto residuo del N- al C-
terminal
!-Hlice Conformacin " Vuelta "
Aminocidos que favorecen los distintos
tipos de estructura secundaria
Vista lateral
Vista
desde
el tope
Estructura secundaria lmina " plegada
Estabilizada por puentes de hidrgeno entre todos
los grupos C=O y N-H de los enlaces peptdicos
Estructura Terciaria
Niveles de organizacin de las protenas
Estructura
Primaria
Estructura
Secundaria
Estructura
Terciaria
Estructura
Cuaternaria
Secuencia de
aminocidos
Hlice
Cadena Polipeptdica Formada por dos mas
subunidades
Estructura terciaria
" Estructura 3-D de un polipptido
" Resulta del plegamiento del polipptido con sus
elementos de estructura secundaria en una
conformacin nica a pH fisiolgico, dictada por la
secuencia de aminocidos
" La estructura 3D nica es la responsable de la
funcin biolgica y se conoce como conformacin
o protena nativa
" Las protenas mantienen la conformacin nativa a
pH fisiolgico y a la temperatura del organismo
Fuerzas que estabilizan la estructura
terciaria
" Se establecen interacciones entre las
cadenas laterales R de los aminocidos:
" Pueden ser:
No covalentes
Covalentes
Cistena
Cistena
Cistina
Cistena
Interacciones covalentes: puentes de disulfuro
Estado reducido Estado oxidado
Estado nativo
biolgicamente
Activo

Estado desplegado
Inactivo

Estado nativo
biolgicamente
activo

Adicin de urea y
mercaptoetanol

Eliminacin de urea y
mercaptoetanol

Ruptura de la conformacin nativa

Aumento de Temperatura
Ruptura de enlaces no covalentes

Radiacin UV
Reacciones qumicas en las cadenas
polipeptdicas

Energa mecnica
Batir la clara de un huevo para hacer merengue o
hacer un souffle

Cambios en el pH
Produce cambios en las estructuras inicas de los
grupos R ionizables de los residuos de aa de las
protenas a pH 7

Compuestos orgnicos
Los detergentes, jabones, alcoholes y la urea
(NH
2
CONH
2
) interrumpen las interacciones de las
cadenas laterales de los "-aa

Sales y metales pesados
El Pb
2+
, Hg
2+
y Ag
2+
reaccionan con los grupos
SH de los residuos de cistena formando puentes
de disulfuro metlicos que alteran la
conformacin nativa
Desnaturalizacin de una protena
Tamao relativo de las conformaciones " y ! y de
las protenas globulares
Extendida Extendida
Acortada
Protena globular compacta
conformacin nativa (3 D)
a pH fisiolgico
Conformacin "
2.000 x 5
! Hlice
900 x 11
Forma globular
130x 30
EJEMPLOS DE PROTEINAS
GLOBULARES

La mioglobina
" Se encuentra en los msculos de
mamferos (delfines, ballenas) y en
el hombre
" Constituye la fuente de reserva de
oxigeno en los tejidos de animales
" Consiste de una sola cadena
polipeptdica
" Presenta un anillo de porfirina que
contiene un tomo de Fe
2+
" La estructura secundaria tiene seis
segmentos en !- hlice
" Se presenta la estructura terciaria o
conformacin nativa 3D
Grupo Hemo: anillo de porfirina
con un tomo de Fe
2+
en el centro
Protenas globulares con estructura secundaria " y !
Estructura 3D de protenas globulares
Protenas Solubles
Enzimas, Hormonas, etc
Protenas de Membrana
Mioglobina La aquaporina
Estructura cuaternaria
La hemoglobina
" Es una protena globular
" Esta formada por:
dos subunidades ! idnticas
dos subunidades " idnticas
" Cada subunidad presenta un grupo hemo con
un tomo Fe
2+
" La estructura cuaternaria, se estabiliza por
puentes de hidrgeno, puente salino e
interacciones hidrofbicas
" Se encuentra en los glbulos rojos
" Funcin: transportar el oxgeno molecular de
los pulmones a los tejidos
Protenas fibrosas
" Presentan conformacin extendida
" Por lo general contienen un solo tipo de estructura
secundaria
" Presentan poco estructura terciaria
" Presentan estructura cuaternaria
" Son insolubles en agua
" Tienen alto contenido de residuos de aminocidos
hidrofbicos
" Fortalecen los tejidos de los animales y
suministran proteccin externa
Ejemplos de protenas fibrosas
Tipo de protena fibrosa
Tipo de estructura
secundaria
Caractersticas
"-queratina
(Pelo, uas, plumas, en
los cuernos de los
animales)

" -hlice

Fuertes
Varan en dureza y
flexibilidad
Fibra de la seda
(Gusano de seda)

Lmina ! plegada

Filamentos
Flexibles suaves

Colgeno
(Tendones)
Cadena " helicoidal
orientada ala
izquierda

Fuertes
No estirables
" Cada molcula de queratina consiste de una cadena polipeptdica, es una hlice
del N- al C- terminal, estabilizada por puentes de hidrgeno entre los enlaces
peptdicos
" La estructura cuaternaria consiste de dos -hlices estabilizadas por interacciones
hidrofbicas
" Las estructuras de rdenes superiores se estabilizan por interacciones
hidrofobicas y puentes de disulfuro
Queratina ! hlice
Dos ! hlice enrolladas

Protofilamento

Protofibrilla
Seccin transversal de un pelo
!-hlice
Dos !-hlices
Protofibrilla
Protofilamento
Clulas
Filamento
intermedio
La -queratina del pelo
El colgeno
Uniones covalentes entre los polipptidos
del colageno
Cadena lateral de Ala Cadena lateral de glicina
La fibra de la seda
cidos Nucleicos
Estructura de un nucletido
Nuclesido
Base
Nitrogenada
Purina o
Pirimidina
Pentosa
Fosfato
Deshidratacin
-H
2
0
Formacin de un dinucletido
Grupo 3OH libre
Grupo 5fosfato libre
Enlace fosfodiester 5-3
* A pH fisiolgico los grupos fosfatos estn ionizados
*
*
" Los nuclesidos 5monofosfatos tienen la
misma orientacin relativa
" Estn unidos entre si en enlace fosfodiester
5-3
" La cadena tiene direccionalidad 5-3
" En el extremo 5 hay un grupo fosfato libre
" En el extremo 3 hay un grupo OH libre
" La cadena esta formada por una estructura
covalente de fosfatos y pentosas que se
alternan
" En la estructura covalente las bases se
encuentran insertadas a intervalos regulares
" La estructura covalente interacta con el agua
mientras que las bases nitrogenadas se alejan
del agua por su carcter menos polar
" A pH 7 los fosfatos estn ionizados
presentando carga negativas (polianin )
" A pH 7 la cadena asume una estructura
helicoidal orientada a la derecha
Estructura del ADN y el ARN
Enlace
fosfodiester
5-3
5

3
5

3
ADN ARN
Extremo 5-P Extremo 5-P
Extremo 3-OH Extremo 3-OH
Niveles de organizacin de la
estructura de los cidos nucleicos
" Estructura primaria
" Estructura secundaria
" Estructura terciaria
Estructura primaria
" La estructura primaria de los
cidos nucleicos es la secuencia
de bases del extremo 5
al extremo 3

" La secuencia de bases se escribe
de izquierda a derecha:
" En el ADN es: 5 ATGCA 3
" En el ARN es: 5 UGCCA 3
" La identidad de un cido nucleico
esta determinada por la secuencia
de bases
Enlace
fosfodiester
5-3
5

3
5

3
ADN ARN
Extremo 5-P Extremo 5-P
Extremo 3-OH Extremo 3-OH
Estructura primaria: secuencias de bases en el ADN o ARN
Estructura
secundaria del ADN

Relacin numrica de bases en el ADN en diferentes
organismos y en distintas clulas de un mismo
organismo (multicelulares):
Reglas de Chargaff (1950)
% Molar:
A = T
G = C
A+G = T+ C
Demostraron que el ADN
de todos los organismos estn formados por una
doble hlice
Rosalind Franklin Maurice Wilkins
Patrn de difraccin de
Rayos X de una muest ra de
ADN de bovino
James Watson y Francis Crick: postularon la
estructura de la doble hlice en los aos 1950
Francis Crick James Watson Francis Crick James Watson

1950 2012
! Las dos cadenas corren en
direcciones opuestas: son
antiparalelas
! Apareamiento de bases
A=T
G =C

! Entre A:T se forman dos
puentes de hidrgeno
! Entre G:C se forman dos
puentes de hidrgeno
Adenina
Guanina
Timina
Citosina
Complementariedad de cadenas y apareamiento de bases
" En todos los organismos vivos el
ADN B es la conformacin
predominante del ADN
" Es una doble hlice orientada
hacia la derecha
" Tiene un dimetro de 2 nm
" Tiene 10,5 de pares bases por
vuelta
" Aumento en longitud por par de
base 3,4
" Presenta dos periodicidades: una
hendidura mayor (major groove)
y otra menor (minor groove)
Modelo de la estructura de doble hlice de
Watson y Crick
Fuerzan que estabilizan la doble hlice del ADN
" Los puentes de hidrogeno entre A-T y G-C
" Las interacciones de Van der Waals entre los pares
de bases vecinas apiladas verticalmente a lo largo
del eje de la doble hlice
" Los grupos fosfatos con carga negativa en el
esqueleto covalente son neutralizados con iones o
protenas con carga positiva
Modelo de replicacin semiconservativa del ADN
formulado por Watson y Crick
Cadena
nueva
ADN
parental
Cadena
nueva
Cadenas
hijas
ADN
parental
ADN
parental
D. Stojanovic de
Malpica, Ph D
PROPEDUTICO DE
ODONTOLOGA, UCV
Estructura terciaria:
Empaquetamiento del
ADN
El tamao y forma del ADN en bacterias
Un ADN de doble hlice circular
en el citosol de la bacteria

El tamao del ADN es gigante comparado
con el tamao de la bacteria

Las bacterias tienen enzimas especiales
para empaquetar el ADN
Caractersticas del ADN en eucariotas
" En clulas eucariotas el 99,9 % de la informacin gentica
se localiza en el ncleo
" Cada clula tiene un nmero caracterstico de cromosomas
" Cada cromosoma es una molcula de ADN de doble hlice
con forma lineal
" El ADN nuclear de una clula tpica de humano tiene una
longitud de 2 metros de longitud
" En animales y humanos el 0,1 % de la informacin gentica
restante se encuentra en las mitocondrias; el ADN
mitocondrial es una doble hlice circular
" En plantas, adems de un ADN mitocondrial, existe un ADN
circular de doble hlice en los cloroplastos
ADN
Cromosoma
Fibra de
Cromatina
Fibra 30 nm
Un asa
Una roseta
Seis asas
Una vuelta
30 rosetas
Empaquetamiento del ADN
en eucariotas x 10.000
veces:
Desde la doble hlice hasta

formar un cromosoma
" Cada Nucleosoma contiene ocho Histonas:
2 H2A, 2 H2B, 2 H3 y 2H4
" Entre cada nucleosoma se encuentra la Histona H1
" Cada nucleosoma contiene dos vueltas de ADN enrollado en sentido
contrario a la direccin de rotacin de la doble hlice (participan 146 pb)
" En el ADN que existe entre los nucleosomas hay aproximadamente 50 pb
(pares de bases)
Nucleosoma
(Histonas)
Segmento de ADN
Enlazante
Fibra de cromatina
Fibra de cromatina vista
por Microscopia Electrnica
Unidad estructural de empaquetamiento del ADN
en eucariotas: nucleosomas
Cada clula diploide consiste de pares de cromosomas (autosomas) que van desde el 1
al 22 ms un cromosoma X e Y (varn)
La clula diploide de la mujer contiene dos cromosomas X
Cada clula haploide contiene un cromosoma de cada tipo ms un X
o un Y
Cromosomas humanos en clulas diploides
(somticas) y haploides
N
o
de cromosomas en algunos organismos*
Bacterias 1 Zorro 34
Mosca de las
frutas
8
Gato 38
Guisante 14 Ratn 40
Maz 20 Humano 46
Olivo 46 Pollo 78
*N
o
de cromosomas diploides en el caso de las clulas eucariotas
Lo que determina que cada especie sea nica, no es el nmero
de cromosomas, sino la informacin que se especifica en los genes
Nmero de cromosomas en algunas organismos
Los genes
" Los genes estn arreglados linealmente sobre cada
cromosoma.
" En trminos genticos un gen es la unidad fundamental de
la herencia
" En trminos estructurales, un gen es la secuencia de ADN
que codifica para un componente estructural (una cadena
polipeptdica o ARN) y la secuencia de ADN adyacente al
extremo 5 que regula la expresin de ese gen
" Cada gen en una clula diploide tiene un gen similar
ubicado en el cromosoma homologo
" Estas dos versiones de un mismo gen se conocen como
alelos ( uno del padre y el otro de la madre)
El ARN
" Est formados por una sola cadena de ARN
" Existen tres clases de ARN:
ARN mensajero (ARNm)
ARN transferencia (ARNt)
ARN ribosomal (ARNr)
Estructura y funcin del ARNm
" El ARNm: presenta estructura
primaria y secundaria (hlice
orientada a la derecha).
" No tiene estructura terciaria
cnsono con su papel de molde
para la sntesis de protenas
Anticodn
Sitio unin del
aa
Estructura terciaria
Estructura secundaria
en forma de hoja de trebol
Brazo T#C
Brazo del aminocido
Brazo
Anticodn
Brazo D
Anticodn
Estructura primaria, secundaria y terciaria
del ARNt
Funciones del ARNt
" Una enzima especfica efecta la unin covalente de un
aminocido particular a un ARNt especfico en el extremo 3
Aminoacil ARNt : ARNt
aa
" Existe por lo menos un ARNt para cada uno de los aminocidos
estndares (20 ARNt)
" Los ARNt
aa
transportan los aminocidos al sitio de sntesis de
protenas (los ribosomas)
" Los ARNt
aa
son los traductores del lenguaje gentico al de
protenas:
" Tienen una regin (anticodn) de tres bases con una secuencia
de bases especfica que reconoce una secuencia de tres bases
especfica (codn) en el ARNm
El Ribosoma
" La estructura del ribosoma es
semejante en procariotas y
eucariotas
" El ribosoma consta de dos
subunidades:
Una subunidad grande
Una subunidad pequea
" Cada subunidad tiene una
composicin particular de
protenas y de ARNr
" Es el sitio donde ocurre la sntesis
del polipptido en presencia del
ARNm
El ARNm
Estructura del Ribosoma
ARNr 5S
(120 nucletidos)
ARNr 23S
(3200 nucletidos)
36 Protenas
ARNr 5S
(120 nucletidos)
ARNr 23S
(4700 nucletidos)
ARNr 5.8S
49 Protenas
ARNr 16S
(1540 nucletidos)
21 protenas
ARNr 18S
(1900 nucletidos)
33 protenas
Comparacin de la estructura de los ribosomas en procariotas y
eucariotas
D. Stojanovic de
Malpica, Ph D
PROPEDUTICO DE
ODONTOLOGA, UCV
Estructura y funcin de los ARNr
" Presentan estructura primaria,
secundaria y terciaria
" Estn asociados no
covalentemente a las
protenas de las subunidades
del ribosoma
" Un ARNr especfico (ribozima)
es el responsable de la
formacin de los enlaces
peptdicos en el polipptido
Replicacin
Transcripcin
Traduccin
ARNr, ARNm, ARNt
Flujo de la informacin gentica
Protena
" El ADN (cido desoxirribonucleico) como material hereditario cumple
con las siguientes caractersticas:
" Posee capacidad de autorreplicacin, estabilidad y variabilidad, es decir,
el proceso de replicacin asegura la conservacin de la informacin
gentica y a la vez permite cambios de la informacin (mutacin) que
hacen posible la variabilidad fenotpica y la evolucin
" Controla el metabolismo y la expresin de los genes a travs del control
de la sntesis de las enzimas y todas las protenas requeridas por la
clula
Bases del dogma central de la biologa molecular
Gen
ADN ARNm Polipptido
Amino
terminal
Carboxi
terminal
Cadena molde
Expresin gentica: relacin entre ADN, ARNm y Protena
" Se observa una relacin lineal entre
el ADN, ARNm y el polipptido
" La correlacin lineal entre ADN y
ARNm es vlida solo para bacterias
" En eucariotas la relacin ADN/
ARNm no es lineal debido a la
presencia de intrones en el gen , que
interrumpen la secuencia del gen; el
ARNm, producto de la
transcripcin y maduracin
contiene la secuencia del gen sin
interrupciones
" En eucariotas la correlacin
ARNm/Polipptido es igual que en
bacterias
Primera letra
del codn
Extremo 5

A
Segunda letra del codn

El cdigo gentico
Caractersticas del cdigo gentico
" Es un diccionario, sus palabras se llaman codones
" Los codones son los tripletes en el ARNm: consisten de una secuencia
de tres bases en la direccin 5-3
" Esta formado por 64 codones:
61 codones codifican para los aminocidos estndares
Uno solo codn codifica para la metionina (AUG)
Existe solo un codn de iniciacin (AUG)
Existe un solo codn para el triptfano
Existen tres codones de terminacin (UAA, UAG, UGA)
" Es degenerado, un trmino matemtico, que indica que un aminocido puede
tener ms de un codn (codones sinnimos)
" En la mayora de los codones sinnimos la especificidad del codn reside
en las dos primeras bases
" Es universal: es idntico para todos las especies: bacterias, plantas
animales, animales y el hombre; no obstante, existen algunas excepciones
Aminocido Nmero de codones
Degeneracin del cdigo gentico
Primera letra
del codn
Extremo 5
A
Segunda letra del codn
Ile
El cdigo gentico El ARNt
El ARNt es el traductor del lenguaje de los cidos
nucleicos al lenguaje proteico
Sntesis de protenas
" El mecanismo es similar tanto para procariotas
como eucariotas
" Se describe a continuacin el mecanismo de sntesis
de protenas en bacterias
Primer paso en la sntesis de protenas: formacin
del complejo de iniciacin 70S
" Asociacin del ARNm a la subunidad
50S , con el posicionamiento del
codn de iniciacin en el sitio P del
ribosoma
" Unin del ARNt
fMet
al ARNm
(r econoci mi ent o del codn de
iniciacin con el anticodn del
ARNt
fMet
)
" Asociacin de la subunidad 30S,
completndose la formacin del
complejo 70S, que representa el
ribosoma funcionalmente activo
" Se requiere GTP y varios factores
proteicos para formar el complejo de
iniciacin 70S
ARNt
1
fmet
Desacetilado
Dipeptidil
ARNt
2
Sitio E Sitio P Sitio A
Sitio E
Sitio P Sitio A
Formacin del enlace
petdico
ARNt
1
fmet
desacetilado

Dipeptidil
ARNt
2
Aminoacil-ARNt
2
aa
femt-ARNt
femt

Segundo paso en la sntesis de protenas: formacin
del enlace peptdico
" Incorporacin del segundo ARNt
aa
en el
segundo codn del ARNm sobre el sitio A
del ribosoma (reconocimiento codn-
anticodn)
" Formacin del enlace peptdico por la
ribozima (ARNr 23S de la subunidad 50S)
" El dipeptidil-ARNt
2
queda sobre el sitio A
" El ARNt
femt
desacetilado (sin el fmet)
queda sobre el sitio P
" El prximo paso es la translocacin del
ARNm por un codn
Movimiento del ARNm por un codn en la direccin 5-3

ARNt
1
fmet
desacetilado
Dipeptidil
ARNt
2
Translocacin
Aminoacil-ARNt
3
aa

entrante
Segundo paso en la sntesis de protenas: la translocacin, movimiento
del ARNm sobre el ribosoma por un codn en la direccin 5-3
D. Stojanovic de
Malpica, Ph D
PROPEDUTICO DE
ODONTOLOGA, UCV
Factor de
liberacin
Hidrlisis del peptidil-ARNt

Disociacin de
componentes
Tercer paso: terminacin de la sntesis de protenas
" El segundo paso de la sntesis de
protenas (incorporacin de los
ARNt
aa
y translocacin) se repite
hasta alcanzar el codn de
terminacin
" Unin de un factor proteico al sitio
A para liberar el polipptido
" Hidrlisis del peptidil-ARNt
" Se libera el polipptido
" Disociacin de los componentes

1.2 Bioquímica Bàsica

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