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TEMA 2

GENTICA DE POBLACIONES
Tema I: Objetivos
Conocer los diferentes mecanismos en la herencia
de caracteres en una poblacin
Entender las leyes de Hardy-Weinberg y su
aplicacin en el estudio de gentica de poblaciones.
Emplear las leyes de Hardy-Weinberg para hallar
frecuencias allicas, genotpicas y fenotpicas.
Gentica de Poblaciones
Estudia la composicin gentica de las
poblaciones y las fuerzas que provocan
sus cambios
Relaciona los procesos evolutivos con los
conceptos de la herencia gentica
Gentica de Poblaciones
Poblacin Natural: conjunto de individuos de
la misma especie que viven en una misma
rea geogrfica y que, por tanto, pueden
reproducirse entre ellos
Poblacin Panmctica: es un concepto
terico de poblacin con infinito nmero de
individuos en la que cualquiera de ellos tiene
igual probabilidad de cruzarse con cualquier
otro (panmixia)
La poblacin es la unidad de evolucin
Variabilidad Gentica
Sustrato de la Seleccin Natural
Tcnicas Moleculares para su deteccin:
secuenciacin, SNPs, RFLPs,
La Gentica de Poblaciones usa mtodos
de cuantificacin de esta variabilidad
Descripcin gentica de una poblacin: parmetros
Frecuencia allica: es la frecuencia relativa de
un alelo en una poblacin mendeliana
determinada.
Frecuencia genotpica: es la frecuencia de
cada uno de los genotipos posibles que
aparecen en esa poblacin mendeliana
determinada.
Frecuencia fenotpica: es la proporcin o
frecuencia de los distintos fenotipos en esa
poblacin.
Medidas de la diversidad gentica: Clculo de las Frecuencias
Medidas de la diversidad gentica: Clculo de las Frecuencias
Ejemplo: Estudio electrofortico de la enzima glucosa fosfato
isomerasa en una poblacin de ratones
G e n o t i p o
F / F F / S S / S T o t a l
N . i n d i v i d u o s 4 7 5 1 6
N . a l e l o s F 8 7 0 1 5
N . a l e l o s S 0 7 1 0 1 7
N . a l e l o s F + S 8 1 4 1 0 3 2
p
^
= f(F) =
4 + (1/2) 7
16
= 0,469
p
^
q
^
= 1 -
= 0,531
Frecuencia genotpica
Frecuencia allica o gnica
f(FF) = 4 / 16 f(FS) = 7 /16 f(SS) = 5/16
Ley de Hardy - Weinberg
Establece que las frecuencias allicas y las frecuencias
genotpica de una poblacin permanecen iguales por
generaciones.
Si ocurre algn cambio en la frecuencia indica que ha
ocurrido evolucin.
Enunciada por G.H. Hardy y W. Weinberg como el principio
relacionado con la frecuencia de los genes y de los genotipos homo
y heterocigoto en una pm.
No siempre los alelos dominantes son los ms frecuentes (es
decir no aparecen en la proporcin 3:1) y hacen a sus
portadores ms fuertes.
Los autores demostraron que en ausencia de fuerzas que afectan
las frecuencias gnicas, las poblaciones pueden tener cualquier
proporcin de caracteres dominantes y recesivos y la frecuencia
relativa del alelo tiende a permanecer constante de generacin en
generacin
Condiciones necesarias para mantener el equilibrio de H-W
Deriva gentica
Asume que no hay cambios en la frecuencia allica debido a fluctuacin al azar.
Asume que las poblaciones son grandes.
Seleccin
Asume que no hay seleccin.
Pero en la vida real algunos genotipos tienen mayor preferencia para
reproducirse que otros.
Mutaciones
Asume que no hay mutaciones
No es muy significativo ya que normalmente estas ocurren en el orden de 1x10
-5
o 1x10
-6
.
Migracin
Asume que no hay migracin.
Si ocurre migracin se pueden introducir nuevos genes a la poblacin, puede ocurrir
variabilidad.
Todos los individuos se cruzan.
Equilibrio de Hardy-Weinberg
Frecuencia cigotos (progenie)
Apareamiento Frecuencia
apareamiento
AA Aa aa
AA x AA P
2
1 0 0
AA x Aa 2PQ 0
AA x aa 2PR 0 1 0
Aa x Aa Q
2

Aa x aa 2QR 0
aa x aa R
2
0 0 1
Totales prxima generacin P Q R
P = P
2
+ 2PQ/2 + Q
2
/4 = (P + Q/2)
2
= p
2
igualmente se demuestra que Q = 2pq y R = q
2
Demostracin de la ley de Hardy-
Weinberg
P = f(AA)
Q = f(Aa)
R = f(aa)
.
Para sacar la frecuencia del alelo A
en la nueva generacin
p(A)= [p
2
+(2pq)] / (p
2
+ 2pq + q
2
)= p2
+ pq = = p (p+q) = p
Para sacar la frecuencia del alelo a
q(a)= [q
2
+(2pq)] / (p
2
+ 2pq + q
2
) = q2
+pq = q(p+q) = q
Consecuencias de la ley de Hardy-Weinberg
Los supuestos de la ley de H-W se aplican a un
locus individual
Una poblacin no puede evolucionar si cumple los
supuestos de H-W, dado que la evolucin supone
cambio en las frecuencia allicas.
Cuando una poblacin est en equilibrio las
frecuencias genotpicas estn determinadas por
las frecuencias allicas.
Una sola generacin de apareamiento produce
las frecuencias genotpicas de equilibrio.
Genotipo
MM MN NN
Total
N. individuos 1787 3037 1305 6129
N. alelos M 3574 3037 0 6611
N. alelos N 0 3037 2610 5647
N. alelos M + N 3574 6074 2610 12258
Prueba de ajuste a Hardy-Weinberg
Frecuencia allica M = 6611/12258 = 0,53932 = p
Frecuencia allica N = 5647/12258 = 0,46068 = q
Frecuencia esperada p
2
= 0,2908 2pq = 0,4969 q
2
= 0,2122 1,000
Nmero esperada 1782,7 3045,6 1300,7 6129
(Frecuencia X 6129)
84 , 3
04887 , 0
) (
2
. . 1 ; 05 , 0
2
2
=
=

=
l g
esperado nmero
esperado nmero observado nmero
X

Estimacin de las frecuencias allicas con la


ley de H-W
si suponemos que una poblacin est en
equilibrio con respecto a un locus entonces la
frecuencia de homocigotos recesivos (aa) ser q
2
Por tanto la frecuencia allica es la raz cuadrada
de la frecuencia genotpica
q = q
2
(f aa)
Ejemplo
La frecuencia del albinismo en la poblacin humana
(considerando que esta en equilibrio) es de 1 entre
10.000. Calcula la frecuencia de individuos homocigotos
y la frecuencia del alelo para el albinismo. Y la
proporcin de individuos heterocigotos
Respuesta
q2= 1/10.000= 0.0001
q
=
0.0001= 0.01
Individuos heterocigotos =2pq=2 x0.99x0.01= 0.0198
- El equilibrio de H-W es til para estudiar la evolucin ya que describe
lo que pasa en una poblacin que no evoluciona.
- El equilibrio provee un punto de referencia del cual parten los
procesos evolutivos.
- Este punto de referencia permite comparar frecuencias allicas y
genotpicas de poblaciones con acervo gentico cambiante.
Ley de Hardy-Weinberg
Ninguna poblacin es lo suficientemente grande
No pueden evitarse los problemas de seleccin
No pueden evitarse mutaciones, etc.
Resulta sorprendente encontrar que muchos genes se
comportan dentro de los lmites estadsticamente
aceptables con las condiciones del equilibrio de H-W en 2
generaciones sucesivas
Estos cambios insignificantes pueden irse acumulando
durante muchas generaciones para producir alteraciones
considerables en la estructura gentica de las poblaciones
Conclusiones
Agentes Evolutivos I
Sistemticos (cambio de frecuencias en un
mismo sentido):
Mutacin
Migracin
Seleccin (eficacia biolgica)
Dispersivos (cambio de frecuencias al azar):
Deriva Gentica
Endogamia (consanguinidad)
Efectos de la mutacin sobre las frecuencias gnicas y
genotpicas
Fuente primaria de variabilidad
Altera las frecuencias allicas (unos alelos cambian hacia otros)
Normalmente su influencia en las frecuencias allicas es baja
Tasa de mutacin: numero de mutaciones nuevas por gen y por gameto
Unos genes tienen ms posibilidades de mutar que otros
La mutacin es un proceso de cambio lento dentro de las poblaciones
No produce cambios espectaculares en las frecuencias allicas por si sola
Sin tener en cuenta otros factores, un alelo originado en los inicios de la
humanidad tendra una representacin del 4%
Es la seleccin natural la que da relevancia a nuevos alelos
Mutacin
Carcter pre-adaptativo de la mutacin
La mutacin ocurre al azar, es aleatoria y sin finalidad alguna. Las
mutaciones no tienen ninguna direccin respecto a la
adaptacin, son como un cambio al azar de una letra por otra en
un texto. Suele producir una falta de significado, y por eso la
mayora de las mutaciones son deletreas.
Pero a veces ciertos cambios pueden introducir nuevos
significados, permitiendo nuevas funciones.
Una caracterstica es beneficiosa solo dependiendo del ambiente
Solo se manifestar si se dan las condiciones ambientales precisas
y acta la seleccin natural
Concepto de pre-adaptacin
Mutacin
Mutacin: cambio estable en el material gentico
-Fuente ltima de variacin gentica. Genera variacin de novo.
-Es aleatoria (independiente, no dirigida) de la funcin del gen
-Las tasas de mutacin espontneas son muy bajas,
~ 10-5, 10-6, y por ello no pueden producir cambios de frecuencias
(por generacin) rpidos en las poblaciones
Generacin 0: p
0
= 1; q
0
= 0
Generacin 1: q
1
= p
0
Generacin 2: q
2
= p
1
+ q
1
Generacin n: q
n
= q
n-1
+ p
n-1
q
n
= 1 - p
0
(1- )
n
= 1 - (1- )
n
A -> a

A -> a

A <- a

q
n
= q
n-1
+ p
n-1
- q
n-1
q =q
n
- q
n-1
= p
n-1
- q
n-1
q = 0
q = /(+ )
^
p = /(+ )
^
Equilibrio mutacin-retromutacin
Migracin
Trasvase de genes entre poblaciones
Evita la divergencia gentica entre las
poblaciones
Aumenta la variabilidad gentica dentro de las
poblaciones
Depende de:
Tamao de la poblacin migratoria
Frecuencias allicas de las dos poblaciones
Tamao de la poblacin receptora
Migracin
Migracin: movimiento de genes entre poblaciones
-Si las poblaciones difieren en frecuencias allicas, la migracin puede
producir cambios importantes en las frecuencias allicas
-El movimiento de genes de una poblacin a otra se denomina flujo
gentico
- Los cambios en frecuencias allicas son proporcionales a las
diferencias de frecuencia entre la poblacin donadora y receptora y a la
tasa de migracin
Efecto global de la migracin
- Produce gran similitud entre las poblaciones
- Agrega variacin gentica a las poblaciones
q
t+1
= mq + (1-m)q
t
q = m(q - q
t
)
Donadora Receptora
m
q
t
q
m = Tasa de migracin por generacin
q = Frecuencia alelo a en problacin donadora
q
t
= Frecuencia alelo a en problacin receptora en generacin t
m
1-m
t+1
El aumento natural de variabilidad gentica (que contrarresta el
efecto de la deriva gentica) en una poblacin se debe a:
Flujo gnico: Migracin de individuos entre poblaciones
Evita perdida heterocigosidad
Permite homogenidad entre poblaciones
Por ej., basta que llegue tan slo un individuo nuevo cada
generacin a una poblacin aislada de 100 individuos para que los
efectos de la deriva gentica sean insignificantes.
- Mutacin normal de genes
Las tasas de mutacin normales en la naturaleza (entre 1 por cada
1000 y 1 por cada 10000 por gen y generacin) slo bastan para
contrarrestar la prdida de alelos en las poblaciones grandes, no en
las pequeas (<100 individuos).
- Recombinacion meitica
Seleccin natural
Variacin fenotpica
Relacin entre la variacin fenotpica y la aptitud
biolgica
La variacin es heredable
Elementos SN (2)
Eficacia biolgica (w)
Reproduccin diferencial de los individuos
Los alelos presentes en la poblacin
presentan distinta Eficacia Biolgica
(fitness) (w)
Eficacia biolgica: Es el xito reproductivo
relativo de un genotipo frente a los otros
genotipos. Vara entre 0 y 1
Definicin de Seleccin Natural
Tres condiciones:
Existe variabilidad entre individuos en algn carcter o rasgo
Existe relacin directa entre ese carcter y la eficacia biolgica relativa
El carcter es heredable.
Si esto ocurre entonces la frecuencia de ese carcter cambiar de dos
formas
I - Dentro de generacin ms de los esperado exclusivamente por
procesos ontogenticos
II - Entre generaciones de forma predecible hasta que se alcance un
equilibrio.
Seleccin Natural es la reproduccin DIFERENCIAL de genotipos.
La seleccin natural no puede predecir el futuro.
Solo puede mejorar la estructura en el contexto
de su utilidad actual
El entorno es crucial para la seleccin natural
Los lmites del entorno son los que determinan que caracteres son
los beneficiosos
Los cambios en el entorno tanto en espacio como tiempo traen
consigo cambios en los caracteres de los organismos
En el espacio, dentro de una especie: produce gradientes
En el tiempo, dentro de un linaje: evolucin, cambio
morfolgico.
El entorno incluye otros organismos:
Un nuevo competidor, depredador, patgeno, constituyen nuevos
factores del entorno para ser tomados en cuenta
Componentes de selecci
Componentes de selecci

n
n
Seleccin sexual
Supervivencia
Deriva meitica
fecundidad
w1 w2
Definicin de eficacia biolgica: Es la medida
de la capacidad de los individuos de sobrevivir y
reproducirse para transmitir sus genes a la
prxima generacin
Ejemplo efectos SN: resistencia a insecticidas, mosquitos,
ace-1 (acetilcolina-esterasa), cambio de GGC, glicina a AGC (serina),
la misma mutacin en todos los linajes resistente a los
organofosfatos...
Ejemplo de clculo eficacia biolgica (w) y coeficiente de
seleccin (s)
Primero: clculo eficacia biolgica w
La w es la proporcin relativa, que se obtiene dividiendo las w
s
absolutas entre la w absoluta mayor ms alta...).
Genotipo N inic. N final W abs. W rel. Coef. (s)
AA 100 80 0.8 1 1-w = 0
Aa 100 64 0.64 0.8 1-w = 0.2
aa 100 48 0.48 0.6 1-w = 0.4
El coeficiente de seleccin (s)
s = 1-W
Modelo general de seleccin natural
EJEMPLO DE SELECCIN NATURAL
Genotipo Total
AA Aa aa
Frec.
genotpica
p
2
2pq q
2
1
Eficacia
biolgica (W)
w
AA
1-s
1
w
Aa
1
w
aa
1-s
2
Prop. tras
seleccin
p
2
(1-s
1
) 2pq q
2
(1-s
2
) 1-s
1
p
2
-s
2
q
2
= w
Frec.
genotpicas
tras seleccin
p
2
(1-s
1
)/w 2pq/w q
2
(1-s
2
)/w 1
Modelos sencillos de selecci
Modelos sencillos de selecci

n
n
Seleccin a favor del heterocigoto
q =
pq(s
1
p-s
2
q)
w
= 0
(s
1
p-s
2
q) = 0 q =
^
s
1
s
1
+ s
2
Seleccin a favor del heterocigoto:
Anemia falciforme (Hbs) y malaria (paludismo) I
anopheles
Anemia falciforme (Hbs) y malaria (paludismo) II
Nivel Gen: ADN
distribucin del alelo de la anemia
falciforme (Hb
S
)
distribucin de la malaria falciparum
(causada por Plasmodium falciparum)
Anemia falciforme (Hbs) y malaria (paludismo) III:
ddistribucin alelo y enfermedad
Tipos de seleccin natural a nivel fenotpico
bacterias resistentes a antibiticos
insectos resistentes a pesticidas
Biston betularia negras
aumento del cuello de la jirafa
velocidad de huida
crecimiento de colmillos en tigre d. sable
seleccin natural direccional
seleccin natural estabilizadora
seleccin natural dispersiva
Los resultados de la S.N. son evidentes pero
difciles de observar:
Los cambios evolutivos son extremadamente lentos
Cambios significativos en frecuencias gnicas toman ms tiempo
que el ciclo de vida del hombre
Este es el mayor obstculo para el estudio de la evolucin y
entonces la mayora de nuestro entendimiento sobre la evolucin
viene de argumentos tericos y matemticos
La directa observacin del proceso evolutivo es muy rara. Cuando
se observa es por que:
la fuerza de la seleccin es tan grande que ocurre muy rpido
los organismos tienen un tiempo de generacin muy corto
El resultado final de la Seleccin Natural es:
Eliminar uno u otro alelo (sin considerar mutacin)
Mantener un polimorfismo estable con dos o ms alelos
El resultado final de la Seleccin Natural es:
1. Eliminar uno u otro alelo (sin considerar mutacin)
2. Mantener un polimorfismo estable con dos o ms alelos
Casos:
- Seleccin contra homocigotos recesivos
- Seleccin contra dominantes
- Seleccin sin dominancia
- Seleccin a favor del heterocigoto
- Seleccin en contra del heterocigoto
- Seleccin dependiente de las frecuencias
Agentes Evolutivos II
Dispersivos (cambio de frecuencias al azar):
Deriva Gentica
Endogamia (consanguinidad)
Deriva Gentica (error de muestreo)
Es la fluctuacin aleatoria de las frecuencias allicas de generacin en
generacin, como consecuencia del tamao finito de las poblaciones
naturales
- debida a que en cada generacin, hay un muestreo al azar de los
gametos para formar la generacin siguiente (equivalente evolutivo al
error de muestreo)
- no tiene direccin
- reduce la variabilidad gentica de las poblaciones. Provoca la prdida y
la fijacin de alelos (su efecto ltimo es la fijacin de uno de los alelos en
la poblacin)
- intensidad (tasa de fijacin) inversamente proporcional al tamao de la
poblacin
- casos extremos: cuello de botella y efecto fundador
Deriva Gentica
Tamao efectivo de la poblacin (Ne): nmero de progenitores que
contribuyen a la generacin siguiente
La probabilidad de que se fije un alelo por deriva es igual a su
frecuencia
Generaciones que se tarda en fijar un alelo = 4Ne
Estima de la magnitud del cambio por deriva, conocidos N, p y q mediante
la varianza en las frecuencias allicas entre las poblaciones

s = pq/2N
Efectos de la deriva
1 Produce un cambio en las frecuencia allicas
2 Reduce la variabilidad gentica dentro de las
poblaciones
3 Las poblaciones con el tiempo divergen entre s
CUELLO DE BOTELLA
Cuando una poblacin es muy
pequea, los alelos menos
comunes se pierden, lo que
origina una disminucin del
nmero de alelos y de la
heterozigosidad. Esto ocasiona
una disminucin de la eficacia
biolgica de los individuos.
EFECTO FUNDADOR
Se produce cuando unos pocos
individuos se separan de una
poblacin grande para establecer
otra nueva. Es un caso especial
de cuello de botella.
La nueva poblacin posee
menor variabilidad gentica que
la poblacin original grande y
tiene, por lo tanto, menor
capacidad de persistir.
efecto fundador
(y cuello de
botella):
distribucin grupo
sanguneo ABO
cuello de
botella:
guepardo
(Acinonyx
jubatus)
Endogamia
El cruce de individuos emparentados (endogmicos) da
lugar a la consanguinidad
Da lugar a un incremento en la homocigosis y una
reduccin en la variabilidad gentica
Disminuye el valor adaptativo de los individuos
El coeficiente de consanguinidad mide la probabilidad
de que un individuo herede dos copias idnticas del
mismo alelo procedente de uno solo de sus
antepasados comunes
Poblacin no
consangunea
AA p
2
Aa 2pq
aa q
2
Poblacin
consangunea
F
AA p
Aa -
aa q
Total
p
2
+ pqF
2pq - 2pqF
q
2
+ pqF
F =
H
e
- H
o
H
e
Consanguinidad
=
2pq (2pq 2pqF)
2pq
Consanguinidad
Clculo del coeficiente de consanguinidad
coeficiente de consanguinidad (F):
probabilidad de que un individuo reciba, en un gen dado, dos alelos idnticos
por descendencia. diagramas de trayectos o anlisis de va
consanguinidad en hijos de hermanos
F = 4x()
4
= (1/4)
F = 2x()
3
= (1/4)
Diagrama de trayectos o anlisis de va
consanguinidad en hijos de primos hermanos
p(11) = ()
6
p(22) = ()
6
p(33) = ()
6
p(44) = ()
6
F = 4x()
6
= (1/16)
F = diversas vas (1/2)
n pasos-1
Ejemplo clculo coeficiente de
consanguinidad individuo x
El nivel de polimorfismo de una poblacin depende
de su tamao efectivo y de la tasa de mutacin
1 2
2
+
=
u N
u N
H
e
e
Conclusiones
La deriva gnica (cambio aleatorio de la frecuencias
allicas de una generacin a la otra) ser mas fuerte en
poblaciones pequeas o con tamao efectivo reducido
Teora neutralista
El nivel de polimorfismo de una poblacin depende
de su tamao y de la tasa de mutacin
Equilibrio mutacin - deriva
- Misma probabilidad de dejar descendencia
- Tamao poblacional constante
- Mutaciones neutras y apareciendo a tasa constante
) 1 ( 2 1 2
2
H u
H
N
Nu
Nu
H

=
+
=
0
50 000
100 000
150 000
200 000
250 000
300 000
350 000
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
H
N
Efectos de las fuerzas evolutivas sobre la variacin dentro
y entre poblaciones
p = f(A)
Deriva gentica
Seleccin natural
Mutacin
Migracin
F u e r z a V a r ia c i n d e n t r o
p o b l a ci o n e s
V a r i a ci n e n t r e
p o b l a c i o n e s
E n d o g a m i a o
d e r iv a g e n t i c a
- +
M u t a ci n
+ -
M i g r a c i n
+ -
S e le cc i n :
D ir e cc i o n a l
E q u i li b r a d o r a
I n c o m p a t i b l e
-
+
-
+ / -
-
+
La endogamia mat a los Austrias
Consanguinidad y heterosis
Lneas autgamas y su hbrido F1 en el maz

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