lnLroduccln a la

Mlcroblologla Marlna
Beatriz Dez
Dpto. Gentica Molecular y
Microbiologa
Lab.
Ecologa Microbiana de Sistemas
Extremos
(56-2) 354 1863
bdiez@bio.puc.cl
or que esLudlar la MM?
LxLensln de los oceanos.
Los mlcroorganlsmos marlnos son responsables del 30 de la
producuvldad prlmarla de la 1lerra.
Ll plancLon marlno lleva a cabo el 43 de la resplracln de
oxlgeno en la 1lerra
lmporLancla en clclos blogeoqulmlcos
lnLeraccln de los ecoslsLemas marlnos con la aLmsfera y
relacln con el cllma
8elacln con evolucln, orlgen de la vlda
8elacln con acuvldades humanas (pesca, recreacln, salud,
eLc.)
Mayores cuentas marinas
- Pacfico, Atlntico, rtico, ndico
- Plataforma continental (10-100 m)
- Zona abisal (~4000 m)
- Fondo marino (5,000 - 10,000 m)
Qumica del agua de mar
- Salinidad 32-38 ppt
- pH 7.5-8.5
El ambiente marino
varlaclones en la 8adlacln Solar
1emperaLura lnvlerno
1emperaLura verano
Sallnldad
CorrlenLes superclales
ulsLrlbucln verucal de nuLrlenLes
nlLraLe 10
-6
mol/llLer hosphaLe 10
-6
mol/llLer slllcaLe 10
-6
mol/llLer
nuLrlenLes agoLados
en la supercle,
menos en zonas de
upwelllng
8eglones upwelllng cosLeros y ocenlcos
Aguas superficiales
Iluminadas, oxigenadas, clidas,
pocos nutrientes
Ocano profundo
Presin alta, oscuro, fro
Sumideros hidrotermales
Sedimentos
Aerbico/anaerbico, materia orgnica

Habitats marinos
!"#$%&'$
!)*+,) ,-./012
3, ./ 4/3,2/ /.*+,254*/
50% de la produccin
primaria
en el planeta
Field et al. (1999)
Science 281:237
6*73*8,)-*3/3 +/)*2/ +9:
3,-47274*3/;
+94<7- 7)=/2*-+7- />2
27 3,-4)*?7-
?/@721+*4/+,2?,
Dissolved
organic material
0.02
0.2
2
20
200
2000
20000
Virus
Femto
Pico
Nano
Micro
!m
lmporLancla de los mlcroorganlsmos
Bacterioplancton
- Apariencia similar
- Diversos (diferentes tipos de metabolismos)
- Difciles de cultivar (necesario uso mtodos
independientes de cultivo)
Para investigar hay que conseguir muestras:
cmo?
Giovannoni & Stingl 2005
Qu tipos?
Cmo se distribuyen?
Negro: ubcuo
Marrn: slo zona ftica
Azul: slo aguas fras
!
No cultivados
Como de abundantes son?
Muchos grupos no cultivados son abundantes
Cultivado
en 2002
Morris et al. Nature 2002
SAR11 cosmopolita y dominante
en la superficie del ocano!!
SAR11
Alta microdiversidad:
Clusters con hasta 99%
secuencias
idnticas
Bacterias adaptadas a diferentes nichos marinos:
superficie/profundidad
4 grupos marlnos Arqueas:
Crupo l y ll los ms abundanLes
desiertos
bajos macronutrientes
C, N, P
& micronutrientes
Fe
Ocanos
Gran importancia
autotrficos
Oligotrofa (DOM y nutrientes inorgnicos)
Synechococcus
Prochlorococcus
Trichodesmium
Importancia de cianobacterias marinas
! Produccin Primaria del Planeta en ocanos
2/3 cianobacterias
Cianobacterias marinas
! Chl a, ficobiliproteinas, carotenoides, algunas chl b
! Fotosntesis oxignica (H
2
O como electron donor):
aparato fotosinttico similar en estructura y funcin al de
los cloroplastos de los eucariotas fotosintticos
los ms abundantes
!"#$%&'%'%%()
!ohnson and SleburLh 1979
Ms abundanLes prlmeros 23 m del
oceano, donde la luz esL dlsponlble
para la foLoslnLesls
1odos slnLeuzan clorola a y uenen
plgmenLos accesorlos (caroLenoldes y
coblllproLelnas)
uos grupos:
1) Aguas cosLeras por lo general no
producen coerlLrlna, y son halo-
LoleranLes, pero no uenen requlslLos
elevados de sal para su creclmlenLo.
2) roducen coerlLrlna como la
prlnclpal proLelna de capLacln de luz,
uenen necesldades elevadas de sal,
abundanLes en mar ablerLo.
8lcos en
coerlLrlna
Mas abundantes
Aguas costeras
y mar abierto
oligotrfico
Menos abundantes
Zonas upwelling
+,'%&-','%'%%()
Chlsholm eL al. 1988
0.3- 0.7 m dlmeLro
Carecen de coblllsomas, comple[os capLadores
de luz uplco en Lodos las clanobacLerlas, y en su
lugar conuenen comple[os que conuenen dlvlnll
clorola a y clorola b, slgnaLura unlca de esLe
genero.
rochlorococcus
AbundanLes y cosmopollLas (excepLo zonas polares)
uomlnanLe en las reglones Lroplcales y subLroplcales
Ms abundanLes que !"#$%&'%'%%() y predomlnan a
profundldades mayores
AlLa mlcrodlversldad (dlferenLes ecoupos) que les permlLen
adapLarse a las dlferenLes condlclones amblenLales .
LL aislado (ms contenido
Chla habitan zonas menor luz
ms profundas)
HL aislado (menos contenido
Chla habitan zonas mayor luz
en superficie)
La luz regula la foLoslnLesls
y por LanLo el creclmlenLo de los dlferenLes ecoupos
6 x 10
9
pb
7,7 millones secuencias
Global Ocean Sampling
(GOS) Expedition I
(nW ALlnuco -
aclco 1roplcal)
Distribucin de Prochlorococcus en muestras metagenmicas
8usch eL al 2011
...muchas clanobacLerlas Lamblen [an nlLrgeno aLmosferlco (n2)

ue vlda llbre y en slmblosls
- ms compeuuvos
- vlLal para la supervlvencla de oLros organlsmos
Diversidad
Distribucin
Funcin
s
Fijador de nitrgeno ms importante en los ocanos
Trichodesmium
(Capone et al. 1997)
! 50% del N global es fijado en ecosistemas marinos tropicales
! 40-200 Tg/ao (Karl et al. 2002)
Suelos: ! 90-130 Tg/ao
(Galloway et al. 1995)
Unicellulares grupo A, B y C
(Zehr et al. 2001)
Heterocistos simbiticos-Richelia
(Carpenter et al. 1999)
Descubrimiento nuevas cianobacterias marinas
fijadoras (vida libre y en simbiosis)
Colonial
! 25
o
C
! 5-50 "m
blooms > 100 000 km
2
puff
tuft
.,/%&'0$)1/(1 el ms importante fijador de nitrgeno en Ocanos
Diaztrofos marinos muy desconocidos
en sistemas polares
Farnelid et al 2011
n
2
n
2
!"#$%&'()(*+
!-./01203.+
45-67+
8597:0+
859710+
n
2
nC
2
-
8"8;(
!<;
="&'(><=(
=?&'"<=&<* ="&'(><=#!(*
=?&'"<=&<*
="&'(><=#!(*
nP
4
+
nC
3
-
n
2
23456378
89:
45-67+
8597:0+
859710+
Salmuera hielo
34%
nifH-Cluster
I
nifH-
Cluster
III
Agua de mar
34%
100%
nifH-Cluster I
47%
Diferente comunidad diazotrfica (genes nifH)
en agua de mar y salmuera en hielo
Fotosntesis oxignica
Fotosntesis anoxignica
Bacterias fototrficas marinas
Roseobacter
(alfaproteobacteria)
Representa el 10% de la comunidad en aguas abiertas
y hasta el 25% en costa
Solo uene 8Chla
Slempre se habla pensado que los
mlcroorganlsmos marlnos absorblan la
energla de la luz por medlo de la clorola/
bacLerloclorola.
MeLagenmlca descubrlo uno de los
plgmenLos ms abundanLes que absorben
la luz en la supercle de los oceanos:
)737A-*2/.
LsLa proLelna de membrana conuene
reunal (bacLerlas y reuna verLebrados),
que cuando absorbe un foLn, produce
camblos conformaclonales en la proLelna,
que resulLa en la Lransferencla de
proLones (P+) al exLerlor de la celula. LsLa
energla en forma de gradlenLe de
proLones se Lransforma luego en energla
bloqulmlca (A1).
Simbiosis de bacterias y arqueas con esponjas
Picoeucariotas
Mlcroorganlsmos en el mar profundo
8egln fuca (hasLa 300m)--foLLrofos
PasLa 1.000m se uene acuvldad blolglca
Mar profundo: LemperaLura ba[a, presln alLa,
ba[os nlveles de nuLrlenLes
(1aLm por cada 10m---a 3.000 m 300 aLm)
Se sabe que la presln afecLa la slologla y la bloqulmlca
celular
LxlsLen M.C. baroLoleranLes y oLros baronllcos (requleren
alLa presln) son adems pslcrlos
CreclmlenLo lenLo por las ba[as LemperaLuras
RESPIRADEROS HIDROTERMALES
Mananuales Lermales de aguas profundas llberando agua
rlca en sulfuro
Suttle, 2005
ulversldad
8eclenLe descubrlmlenLo