ADN

DNA
Esta formado por dos cadenas de polinucletidos enrolladas una alrededor de otra para formar una doble hlice. Cada nucletido monomomero del DNA esta formado por: 1. Una base nitrogenada 2. Un azcar desoxirribosa 3. Fosfato

 La orientacin de las dos cadenas de polinucletidos permite que se formen enlaces de hidrogeno entre las bases nitrogenadas.
Hay dos clases de apareamientos de bases: - La adenina se aparea con la timina - La purina guanina se aparea con la pirimidina citosina

 Las dimensiones del DNA son: Una vuelta de la doble hlice ocupa 3.4 nm y esta formada por 10.4 pares de bases. El dimetro de la hlice es de 2.4 nm. La distancia entre los pases de bases adyacentes es de 0.34 nm.

 Enlaces no covalentes que contribuyen a la estabilidad de la estructura del DNA: 1. Interacciones Hidrfobas Minimiza sus interacciones con el agua, aumentado la entropa. 2. Enlaces de Hidrogeno El efecto acumulativo de estos enlaces mantiene las cadenas en la orientacin correcta.

3. Apilamiento de Bases Estabiliza las molculas por el efecto acumulativo de las fuerzas dbiles de van der Waals.
4. Interacciones Electrostticas El esqueleto azcar- fosfato posee grupos fosfatos negativamente cargados. La repulsin entre los grupos fosfato se ve minimizada por los efectos de pantalla de los cationes divalentes y las molculas policatinicas.

Estructura del DNA: Naturaleza de la mutacin

Su estructura es perfecta para almacenar informacin pero es vulnerable a fuerzas rompedoras. Por ejemplo: Colisiones de disolvente y fluctuaciones trmicas.

Estos y los xenobioticos pueden causar mutaciones y alterar la estructura del DNA.

 Las desviaciones tautomeras son cambios espontneos de la estructura de las bases de los nucletidos que interconvierten los grupos amino e imino y los grupos ceto y enol.

Mutacin de transicin
Se sustituye una pirimidina por otra pirimidina, o una purina por otra purina.

Algunos tipos de radiacin ionizante (como rayos UV y rayos X) pueden alterar la estructura del DNA. Los niveles bajos de radiacin pueden producir mutaciones, y los niveles altos pueden ser letales.

 Xenobioticos que daan el DNA: 1.Anlogos de las bases Pueden incorporarse de forma inadvertida al DNA porque sus estructuras son semejantes a las bases de nucletidos.

ADN: Del jardn de Mendel a Watson y Crick.

La estructura correcta del ADN la propusieron en 1953 James Watson y Francis Crick.

La investigacin que condujo a este notable descubrimiento es instructiva por diversas razones :

1. En primer lugar, el camino fue largo, frustrante y tortuoso. 2. Una segunda razn, el desarrollo de nuevos conceptos con frecuencia requiere la integracin de la informacin de varias disciplinas cientificas.

 La revolucion cientifica que finalmente condujo al modelo del ADN comenzo tranquilamente en el jardin de la abadia de un oscuro monje austriaco que se llamaba Gregor Mendel. Mendel descubrio las reglas basicas de la herencia cultivando guisantes.

 En 1865 Mendel publico los resultados de sus experimentos de reproduccin en el Journal of the Brunn Natural History Society. Su trabajo fue ignorado hasta 1900. En ese ao, varios botnicos de forma independiente redescubrieron la publicacin de Mendel y se dieron cuenta de su significacin.

 El descubrimiento de la nuclena que posteriormente se denomino acido nucleico, lo realizo Friedrich Meischer, un patlogo suizo, en 1869.Trabajando con los ncleos de las clulas de pus, Miescher extrajo la nuclena y descubri que era acida y que contena una gran cantidad de fosfato. Meischer creyo ( errneamente ) que la necleina era un compuesto de almacenamiento de fosfato.

 La composicin qumica del ADN la determino en gran medida Albrecht Kossel entre 1882 y 1897, y PA. Levene en los aos 1920 cuando se descubrieron las tcnicas analticas adecuadas.

 En 1928, mientras estaban investigando una epidemia mortal de neumona en Gran Bretaa, Fred Griffith realizo una serie notable de experimentos con dos cepas de neumococos. Una cepa bacteriana, que se denominaba la forma lisa ( o el tipo L ) debido a que estaba recubierta con una capsula de polisacarido, es patogena. La forma rugosa ( o tipo R) carece de la capsula y no es patogena.

 En 1944, Oswald Avery y sus colegas Colin MacLeod y Maclyn McCarty comunicaron su cuidadoso aislamiento e identificacin del ADN como el agente transformador de los experimentos de Griffith. No todo el mundo acepto esta conclusin debido a que su muestra de ADN tenia trazas de impurezas proteicas. Avery y MacCarty demostraron posteriormente que la digestin del ADN por la desoxirribonucleasa ( DNasa) inactivaba al agente transformador.

 A principios de los aos 1950, estaba claro que el ADN era el material gentico. Linus Pauling, Maurice Wilkins y Rosalind Franklin y Watson y Crick se pusieron todos a trabajar con este objetivo. Considerando la forma en que la comunidad cientfica respondi a otros conceptos que sealaban al ADN como el material gentico, su aceptacin de la estructura de Watson y Crick fue particularmente rpida. En 1962, se concedio el Premio Novel de Qumica a Watson, Crick y Wilkins.

La informacin que se utilizo para construir este modelo a escala fue el siguiente:

1. Las bases quimicas y las dimensiones moleculares de la desoxirribosa, las bases nitrogenadas y el fosfato. 2. Los cocientes 1:1 de adenina: timina y guanina: citosina del ADN aislado de una gran variedad de especies que habia investigado Edwin Chargaff entre 1948 y 1952. (Esta relacion se suele denominar reglas de Chargaff)

3. Los soberbios estudios de rayos X realizados por Rosalind Franklin que indicaban que el ADN es una molcula simtrica y probablemente una hlice. 4. El dimetro y el paso de la hlice calculados por Wilkins y su colega Alex Stokes a partir de otros estudios de difraccin de rayos X.

5. La demostracin reciente hecha por Linus Pauling de que las proteinas, otra clase de molculas complejas, podrian encontrarse en una conformacion helicoidal.

ADN : Variaciones sobre un tema. Propiedades estructurales seleccionadas de ADN B, A y Z:

ADN B (Estructura de Watson y Crick ADN A ADN Z

Dimetro 2.4 nm de la Hlice Pb por 10.4 nm vuelta de Hlice Rotacin 3.4 nm por pb Rotacin de A derechas la hlice

2.6 nm 11 nm

1.8 nm 12 nm

2.5 nm A derechas

4.5 nm A izquierda

 La forma A del ADN se observa cuando se extrae con disolventes como el etanol. El significado del ADN A en las condiciones celulares es que la estructura de los duplex de ARN y los duplex de ARN/ADN que se forman durante la transcripcin se asemejan a la estructura del ADN A.

REPLICACION DEL DNA

Se da antes de cada divisin celular. Tras separarse las dos cadenas, cada una de ellas se utiliza como molde para la sntesis de una cadena complementaria, este proceso se denomina replicacin semiconservadora. Sus replicones son bidireccionales.

SINTESIS DE DNA
Puede ser en clulas procariotas y eucariotas. La Sntesis del DNA en las clulas procariotas: 1. Desenrollamiento: se lleva a cabo por las enzimas helicasas que catalizan el DNA. 2. Sntesis del cebador: formacin de segmentos cortos de RNA necesarios para la replicacin del DNA catalizada por la primasa.

3. Sntesis de DNA: est catalizada por la DNA polimerasa. La DNA polimerasa 3 es la principal enzima que sintetiza DNA en procariotas. La caracterstica esencial de la sntesis del DNA es la formacin de un enlace fosfodiester 5-3 DNA y un dNTP. 4. Unin de los fragmentos del DNA: cuando se complementa la replicacin del DNA, une los extremos del DNA recien sintetizados.

5. Control del superenrollamiento: la DNA topoisomerasas evitan el enmaraamiento de las cadenas del DNA rompindolas y unindolas. Las topoisomerasas de tipo I producen roturas transitorias de cadenas sencillas del DNA y las topoisomerasas de tipo II producen roturas transitorias de cadena doble

Sntesis de DNA en las clulas eucariotas

1. Momento de la replicacin: perodo especfico que se denomina fase S. 2. Velocidad de replicacin: Es ms lenta que las procariotas, debido al complejo de cromatina. 3. Replicones: utilizan multiples replicones para comprimir la replicacion de grandes genomas en periodos cortos .

Las enzimas de replicacion en las eucariotas son de 5 tipos DNA polimerasas.

Reparacion del DNA

1. Existen 3 tipos de reparacion : Reparacion por fotoreactivacion o reparacion inducida por la luz : en presencia de luz visible , la DNAfotoliasa rompe el dimero dejando intacto el enlace fosfodiester.

2. Reparacion por escision : el proceso comienza con la deteccion de un segmento daado por medio de la enzima nucleasa de escision o escinucleasa , esta corta el DNA daado y elimina una secuencia de una cadena de 12 o 13 nucleotidos.

3.Reparacion recombinatoria : elimina determinados tipos de secuencia daadas del DNA que no se eliminan antes de la replicacion.