1.

Define los siguientes conceptos:

a. Perfil: Un perfil gentico es un patrn de fragmentos cortos de ADN ordenados de acuerdo a su
tamao que son caractersticos de cada individuo. Dicho patrn es fcilmente convertible en un
sencillo cdigo numrico muy fcil de almacenar y comparar con un alto poder de discriminacin.
(Alonso Alonso, 2011)
b. Dominio: El dominio de la base de datos es el conjunto de los temas o entidades sobre los que
mantiene informacin la base de datos. Como todo dominio, puede definirse por extensin o por
comprensin. Por tanto, puede ser tan breve como el nombre de una o ms disciplinas cientficas.
(Revista Internacional Cientfica y Profesional, 1995).
c. Motivo: Los motivos o perfiles son pequeos fragmentos, trozos o zonas conservadas presentes en
un grupo de secuencias. Normalmente el motivo est asociado a una funcin y por ello de su
conservacin. En otros casos puede ser un elemento diferenciador de una familia de secuencias y su
presencia en una nueva secuencia permite asegurar que pertenece a la familia (patrones
diagnstico). (Trelles, 2007)
d. Parlogo: los genes parlogos estn presentes en el mismo organismos, a menudo como miembros
de una familia multignica reconocida y su ancestro comn puede anteceder; o no, a las especies en
las que ahora se encuentran los genes. Por ejemplo, los genes de la mioglobina y la -globina de los
seres humanos son parlogos: se originaron por duplicacin de un gen ancestral hace alrededor de
550 millones de aos. (Brown, 2008, pg. 149)
Los genes parlogos resultan de la duplicacin de genes, por lo que se encuentran en ms de una
copia en el mismo genoma. (Campbell & Reece, 2007, pg. 505)
e. Ortlogo: los genes ortlogos son aquellos genes homlogos que estn presentes en diferentes
organismos y cuyo ancestro comn antecede a la divisin entre las especies. Por lo general, los
ortlogos cumplen funciones iguales o muy similares. Por ejemplo, los genes de la mioglobina de los
seres humanos y de los chimpancs son ortlogos. (Brown, 2008, pg. 149)
Se refiere a los genes homlogos que se pasan en lnea recta de una generacin a la siguiente pero
que han terminado en diferentes acervos gnicos debido a la especiacin. (Campbell & Reece, 2007,
pg. 505)

2. Menciona un ejemplo de las bases de datos de dominios, motivos y perfiles.
Bases de datos de dominios: PFam
Bases de datos de motivos: BLOCKS, PROSITE
Bases de datos de perfiles: PROSITE, Hidden Markov Models (HMM) o modelos ocultos de
Markov.
(Abascal, s.f.)



3. Diferencias entre la estructura primaria, secundaria y terciaria de las protenas.

Estructura primaria: en el caso de una protena es la secuencia de aminocidos de sus
cadenas polipeptdicas y, en el caso de un cido nucleico, es su secuencia de bases.
Estructura secundaria: es la disposicin espacial local de los tomos del esqueleto de un
polipptido o de un cido nucleico, sin tomar en cuenta la conformacin de sus cadenas
laterales.
Estructura terciaria: se refiere a la estructura tridimensional de una cadena polipeptdica o
polinucleotdica completa. La distincin entre estructuras secundarias y terciarias es algo
vaga; en la prctica, el trmino estructura secundaria alude a conformaciones
estructurales fciles de caracterizar, como les hlices.
(Voet & G. Voet, 2006, pg. 170)

4. Menciona en qu consisten los sitios catalticos de una enzima.
El sitio activo de una enzima, tambin llamado centro activo, es la zona de la enzima a al cual se une el
sustrato, para que la reaccin se produzca. (La Gua, 2010)
Bibliografa
Abascal, F. (s.f.). Patrones, Perfiles y Dominios. Recuperado el 05 de Mayo de 2014, de
http://www.cbm.csic.es/bioweb/courses/MasterVirol2014/alignment/Patrones_perfiles_
dominios/teoria.html
Alonso Alonso, A. (2011). ADN forense, investigacin criminal y bsqueda de desaparecidos.
Recuperado el 05 de Mayo de 2014, de http://www.sebbm.es/ES/divulgacion-ciencia-
para-todos_10/adn-forense--investigacion-criminal-y-busqueda-de-desaparecidos_604
Brown, T. (2008). Genomas (tercera ed.). Buenos Aires: Medica Panamericana.
Campbell, N., & Reece, J. (2007). Biologa (Septima ed.). Madrid: Medica Panamericana.
La Gua. (2010). Recuperado el 5 de Mayo de 2014, de Sitio Activo de una Enzima:
http://quimica.laguia2000.com/conceptos-basicos/sitio-activo
Revista Internacional Cientfica y Profesional. (1995). Recuperado el 05 de Mayo de 2014, de El
Profesional de la Informacin:
http://www.elprofesionaldelainformacion.com/contenidos/1995/mayo/metodologa_de_c
reacin_de_bases_de_datos_documentales_parte_ii.html
Trelles, O. (2007). Bioinformtica Clsica. Recuperado el 05 de Mayo de 2014, de Tema 4:
Alineamiento Mltiple y Filogenias. Motivos y Perfiles:
http://www.bioscripts.net/col/Apuntes/Bioinformatica/tema4/04P-Motif-2.pdf
Voet, D., & G. Voet, J. (2006). Bioqumica (Tercera ed.). Buenos Aires: Medica Panamericana.