15/03/2013

Componentes qumicos de las clulas Mnica Brito

Los seres vivos son simples sistemas qumicos
La Qumica dictamina toda la Biologa
Siglo XIX : animus Siglo XXI: las leyes de la fsica y la qumica

Abundancia de algunos elementos qumicos en el mundo inanimado (la corteza terrestre) comparada con su abundancia en los tejidos animales

Los elementos qumicos que forman las clulas son pocos (bioelementos)

2 Diciembre 2010,

La definicin de la vida se acaba de expandir

Bacteria: cepa GFAJ-1 Aislada lago Mono California Condiciones extremas (alta salinidad, alcalinidad, arsnico) Sustituye el Fsforo por Arsnico Fosfato reemplazado por Arseniato

96.5%

CH, L, P, AN

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Bio-Elementos Bio-Molculas Inorgnicas Agua (70%) Simples (O2, CO2) Sales minerales Orgnicas Carbohidratos Lpidos c. nucleicos Protenas

Los compuestos orgnicos son las molculas derivadas del carbono.....

Enlaces qumicos

Enlaces qumicos y fuerzas de estabilizacin de molculas orgnicas Covalente No covalente

Intermoleculares Intramoleculares

C = 4 enlaces O = 2 enlaces N = 3 enlaces H = 1 enlace

Enlace covalente
Covalente Polar

Covalente apolar

Enlace Inico Puentes de hidrgeno Fuerzas de Van del Walls Interacciones Hidrofbicas

-O-H -N-H C-H

Nube electrnica desigualmente distribuida

Los enlaces covalentes son mucho ms estables y ms fuertes que las interacciones no covalentes

Se comparten electrones para formar molculas

Enlace covalente simple, mltiple (doble, triple).- Mas cortos, fuertes y sin rotacin

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No covalente: Enlace inico

No covalente: Puentes de Hidrgeno (H y otro tomo)

No covalente Dbil Enlace Hidrgeno Covalente polar

Se transfieren electrones (ganancia o prdida)

Carga elctrica, In, Anin, Catin, Sal

H2O H2O Intermolecular H2O Molcula 1 Molcula 1 Molcula 2 Molcula 1 Molcula 1

Intramolecular

Interaccin de las molculas con el agua

Hidrfilas: de la palabra griega hydros (agua) y philia (amistad) Molculas que contienen enlaces polares Molculas cargadas (iones) Forman muchos enlaces hidrgeno Se disuelven en agua Azcares, DNA, RNA, mayora de las protenas Hidrfobas: proviene del griego, donde se combinan las palabras hydros (agua) y fobos (horror) Molculas sin carga Forman pocos enlaces hidrgeno No se disuelven en agua Lpidos

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No covalente: Fuerzas de van del Walls

Inespecfica y dbil Cercana de tomos Diferencias de carga momentnea (x movimientos de e-) Polaridad momentnea Sumativa Asociacin enzima - sustrato

No covalente: Interacciones hidrofbicas

Ciertas molculas presentan partes hidroflicas y otras hidrofbicas Las zonas hidroflicas establecen contacto con el agua Las zonas hidrofbicas quedan resguardadas en el interior (adoptan en general una forma esfrica) Plegamiento de las protena Asociacin enzima - sustrato

Grupos funcionales importantes en molculas orgnicas

Bioelementos Biomolculas
Inorgnicas
Agua (70%) Simples (O2, CO2) Sales minerales

Orgnicas
Carbohidratos Lpidos c. nucleicos Protenas

Monosacridos (*) cidos grasos Nucletidos Aminocidos

Gran tamao Alto PM Funcin compleja Depende de estructura

Condensacin Hidrlisis

MACROMOLCULAS

MONMEROS

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Azcares, Hidratos de carbono o Carbohidratos

Monosacridos (CH2O)n n=3, 4, 5, 6 Unin por enlaces glicosdico (covalente)
Oligosacridos (2-10)
Disacridos

Maltosa Lactosa Sacarosa

Carbohidratos
Oligosacridos 2-10 unidades

Almidn Celulosa Quitina Glucgeno

Polisacridos >10 unidades

Monosacridos 1 unidad

Polisacridos o glicanos (hasta miles)

Energtica (glucosa) Reserva energtica (almidn, glucgeno) Estructural (celulosa) Reconocimiento celular y molecular (glicoclix)

Segn grupo funcional

Segn n de carbonos

..osa Aldosas Ribosa (5C) Glucosa (6C) Manosa (6C) Galactosa (6C) Cetosas Fructosa (6C)

Triosas Aldosas Tetrosas Cetosas Pentosas Hexosas

GLUCOSA

Enlace glicosdico

RIBOSA 2 DESOXI-RIBOSA

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Otros monosacridos

Glucolpidos y Glucoprotenas
Glucosa Piruvato

Aminocidos
Glicoproteinas

Glicolpidos

Glucgeno

Peptidoglicano (mureina) Periplasma Proteoglicanos

Bacteria

Homopolisacridos: Constituidos por un slo tipo de unidad monomrica Ej: Almidn, glucgeno, celulosa. Heteropolisacridos Constituidos por dos o ms unidades monomricas diferentes. Ej: cido hialurnico (Ac. D-glucornico y N-acetil-D-glucosamina).

PROTENAS Y PPTIDOS, POLMEROS DE AA

ESTRUCTURAL TRANSPORTE ENZIMTICA HORMONAL DEFENSA RESERVA ENERGTICA

Aminocido: compuesto orgnico que contiene tanto un grupo amino como un grupo carboxilo unido al mismo carbono.-

Aminocidos Esenciales (9): deben ser incorporados por medio de la dieta, ya que nuestro organismo es incapaz de sintetizarlos Cules son????

Segn la naturaleza de R (radical o cadena lateral) existen 20 aa distintos que forman las protenas

Pptidos (di, tri, poli) Protenas Enlace peptdico

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Clasificacin de los aminocidos segn sus cadenas laterales

Nomenclatura de carbonos en aminocidos No polar
Aliftico Aromtico (*Tyr: polar)

R
Grupo ionizables cido Base Estructura depende del pH de la solucin

Polar
No cargado Cargado positivamente Cargado negativamente

Enlace covalente entre el grupo -carboxilo de un aa y un grupo -amino de otro. Se genera un grupo amida.- LINEAL

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CLASIFICACION DE LAS PROTEINAS

Protenas simples
Solamente aminocidos

Estructura de las Protenas

Protenas conjugadas (protenas ligadas a otras molculas)

Glicoprotenas Metaloprotenas

Funcionalidad asociada a estructura tridimensional

Estructura primaria

FORMACIN DE PUENTES DISULFURO

Estructura secundaria

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Estructura terciaria y cuaternaria

Estructura terciaria

Factores que regulan la conformacin proteica

Formacin de puentes disulfuro (-S-S-) entre cadenas laterales de cistena Interacciones no covalentes
Puentes de hidrgeno Enlaces inicos (atraccin electrottica) Repulsin electrosttica Interacciones hidrofbicas

INTERACCIONES Y ENLACES DE LA ESTRUCTURA TERCIARIA (CUATERNARIA)

PUENTE DISULFURO PUENTE DE HIDRGENO INTERACCIN HIDROFBICA ENLACE INICO

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Prdida de estructura = Prdida de Funcin Funcionalidad asociada a estructura tridimensional

1.CALOR: Rompe TODAS LAS INTERACCIONES DBILES. 2. pH EXTREMOS: CAMBIA LA CARGA DE LOS RADICALES DE AMINOACIDOS IONIZABLES, ALTERANDOSE LOS ENLACES EN QUE PARTICIPAN.

Las protenas son divididas en dos grandes clases basadas en sus estructuras tridimensionales:
Protenas fibrosas Protenas globulares

Denaturacion: Reversible Irreversible Total Parcial

Protenas fibrosas
Protenas fibrosas: contienen cadenas polipeptdicas organizadas de forma paralela al largo de un nico eje.
Consisten en cadenas muy largas Son mecnicamente robustas Ejercen importantes papeles estructurales.

Protenas globulares
Protenas globulares: protenas plegadas de forma ms o menos esfrica. Generalmente solubles en agua o soluciones salinas La mayora de sus cadenas laterales polares estn orientadas hacia el exterior e interactan con el medio por puentes de hidrgeno e interacciones inicas La mayora de las cadenas laterales no polares estn orientadas hacia el interior.. Ejemplos Mioglobina Hemoglobina

Ejemplos
Queratina del cabello y lana Colgeno de tejido conjuntivo presente en cartlagos, huesos, dientes y vasos sanguneos.

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Ejemplo de protena globular. Hemoglobina

Hb tiene estructura cuaternaria

Globina + Hem

4 subunidades proteicas denominadas globinas, cada una con un grupo prosttico Hem Adulto : 2 x alfa + 2 x beta

HEMOGLOBINOPATAS
TALASEMIAS: Grupo de trastornos genticos en la sntesis de hemoglobina, en los que se forman cadenas globnicas de estructura normal pero se sintetizan a menor velocidad

Anemia falciforme o drepanoctica

La anemia falciforme es una enfermedad en la que el cuerpo produce glbulos rojos con un contorno anormal. Las clulas tienen forma semilunar o de una hoz. Estas clulas no duran tanto como las normales, lo que causa la aparicin de anemia. Las clulas falciformes tambin se atascan en los vasos sanguneos y bloquean el flujo. Generacin de Hb S.-

-Talasemias: Disminucin en la sntesis de la cadena .-Talasemias: Disminucin en la sntesis de la cadena .-

CANTIDAD DE PROTENA

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Hb A

Hb S

A. glutmico es sustituido por valina (aa6) Superficie de Hb Carga (-) a Carga (0)

Proceso espontneo de polimerizacin formando un gel cristalino. Estructura cilndrica insoluble y rgida Se rompe el citoesqueleto del eritrocito, adoptando este la forma caracterstica del drepanocito (forma de hoz) Proceso reversible, pero 5 y el 50% de de los eritrocitos falciformes no consiguen recuperar su forma original, siendo eliminados por el sistema mononuclear fagoctico. Drepanocitos exhiben una gran tendencia a adherirse al endotelio vascular favoreciendo la formacin de microtrombos y oclusiones vasculares perifricas.Codn 6 del gen beta de la globina A. glutmico es sustituido por valina (aa6) Superficie de Hb Carga (-) a Carga (0) ESTRUCTURA Y FUNCIN

Alzheimmer, otra patologa por alteraciones en estructura proteica

Manifestaciones clnicas de la anemia falciforme?
Enfermedad neurodegenerativa 1 teora: Depsito de placas neurticas (placas seniles) compuestas por depsitos extracelulares de beta-amiloide Degeneracin de las clulas nerviosas implicadas en la memoria y las funciones cognitivas superiores

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Mutaciones en la protena precursora del amiloide, APP

El gen APP est relacionado con la enfermedad de Alzheimer familiar Se han descrito numerosas mutaciones en este gen (Alzheimmer familiar, 4 - 8 % ) En estas familias, solo las personas que muestran estas mutaciones padecen la enfermedad de Alzheimer

Colgeno, un ejemplo de protena Protena fibrosa insoluble fibrosa Varios tipos de Colgeno ....
Colgeno I Triple hlice Compuesto por tres cadenas que forman una triple hlice Cada cadena de 1400 aa (1/3 es glicina) Otros aminocidos: prolina e hidroxiprolina (poco frecuentes en otras protenas) La presencia de estos aminocidos particulares permite que las tres cadenas se enrrollen una alrededor de la otra formando una fibra muy resistente. Adems, entre las cadenas se establecen puentes de hidrgeno que confieren al colgeno una gran estabilidad

Osteognesis imperfecta
La principal causa son mutaciones en los genes del colgeno tipo I COL1A1 y COL1A2 Transmisin de la enfermedad es autosmica dominante. Recientemente, tambin se han descrito en una minora de casos graves de esta patologa con herencia autosmica recesiva mutaciones en genes adicionales tambin relacionados con el proceso de sntesis de colgeno tipo I.

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Almacenan y transmiten la informacin gentica

CIDOS NUCLEICOS ADN y ARN

Manifestaciones clnicas de la osteognesis imperfecta?

Monmeros: Nucletidos y Nuclesidos

AGTC-ADN

El nucletido es la unidad formadora de ADN y ARN

Nucletidos de importancia biolgica

AGCU-ARN

ATP

Mono, Di, Trifosfato

NAD+ y NADP+: (nicotinamida adenina dinucletido y nicotinamida adenina dinucletido fosfato) FAD+ : (flavin adenin dinucletido)

AMPc

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Puentes H Enlaces H

ADN
Enlace fosfodiester

5-3 3-5

Antiparalelas

cidos nuclicos
Niveles estructurales
Estructura primaria: orden de bases segn la secuencia polinucleotdica. Estructura secundaria: conformacin tridimensional del esqueleto polinucleotdico. Estructura terciaria: superenrollamiento de la molcula

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Nucleosoma Histonas? Cromosoma

Carga de las Histonas? Lisina y Arginina

Niveles de condensacin del DNA

H2A (x2) H2B (x2) H3 (x2) H4 (x2) H1 (x1)

Dogma central de la Biologa Molecular

Tipo Rango Peso Molecular (g/mol) Nmero de nucletidos Porcentaje de RNA celular

.tres tipos principales de ARN (todos ellos participan en la sntesis de las protenas) ARN mensajero (ARNm) ARN ribosomal (ARNr) ARN de transferencia (ARNt)

mRNA

25,000 1,000,000

75 3,000

tRNA

23,000 30,000

73 94

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rRNA

35,000 1,100,000

120 - 2900

82

16

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ARN MENSAJERO (ARNm)

ARN RIBOSOMAL (ARNr)

Este tipo de ARN una vez transcrito, pasa al nucleolo donde se une a protenas. De esta manera se forman las subunidades de los ribosomas. Aproximadamente 2/3 partes de los ribosomas corresponde a sus ARNr.

molcula lineal de nucletidos (monocatenaria) secuencia de bases es complementaria a una porcin de la secuencia de bases del ADN las instrucciones residen en tripletes de bases a las que llamamos codones. son los ARN ms largos

ARN DE TRANSFERENCIA (ARNt)

Este es el ms pequeo de todos (75n) Se pliega adquiriendo lo que se conoce con forma de hoja de trbol plegada. Transporta los aminocidos libres del citoplasma al lugar de sntesis proteica. En su estructura presenta un triplete de bases complementario de un codn determinado, lo que permitir al ARNt reconocerlo con exactitud y dejar el aminocido en el sitio correcto. A este triplete lo llamamos anticodn.

Otros..
ARN PEQUEO NUCLEAR (snRNA)
En eucariontes encontramos un grupo de seis ARN que estn en el ncleo, el ARN pequeo nuclear, estos desempean cierto papel en la maduracin del ARNm.

RIBOZIMAS
Son ARN que tienen funcin cataltica, participan activamente en la maduracin de los ARNm.

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Lpidos
Biomolculas orgnicas insolubles en agua Solubles en solventes no polares (cloroformo, ter, benceno) Frecuentemente estn combinados con otras biomolculas (glicolpidos)
Componentes estructurales de membranas Energtica Cubierta protectora de superficie de diversos organismos Actividad biolgica propia (vitaminas, hormonas)

Clasificacin de los lpidos

Complejos: contienen cidos grasos como componentes Simples: no contienen cidos grasos como componentes

cidos grasos
Cabeza hidrofilica cido carboxlico Cola hidrofbica Cadena Hidrocarbonada

Quiebre

CIDOS GRASOS anfipticos

Saturados-Insaturados

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1. Acilglicridos o glicridos o grasas neutras

Esteres de cidos grasos y glicerina (glicerol) Principales componentes de los lpidos de depsito o de reserva en clulas animales y vegetales El glicerol tiene tres posiciones posibles de esterificacin: Monoacilgliceroles (monoglicridos) Diacilgliceroles (diglicridos) Triacilgliceroles (triglicridos)

2. Fosfolpidos o Fosfoglicridos o Fosfoacilglicridos

Componentes principales caractersticos de las membranas celulares ( Muy poca cantidad en otras localizaciones celulares) Uno de los grupos hidroxilo del glicerol esta esterificado por cido fosfrico (son esteres fosfricos de glicerol) Posee una cabeza polar adems de sus colas hidrocarbonadas no polares son lpidos anfipticos Habitualmente hay una AG saturado y otro insaturado

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3. Esfingolpidos
Su esqueleto esta constituido por esfingosina (aminoalcohol) Componentes importantes de las membranas de clulas animales y vegetales Presentes en altas cantidades en tejido nervioso y cerebral (solo en traza en grasas de depsitos) Todos contienen 3 componentes bsicos: 1 molcula de cido graso 1 molcula de esfingosina 1 grupo de cabeza polar

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LPIDOS SIMPLES
Estos lpidos no contienen cidos grasos. Se presentan en las clulas y en los tejidos en menor

cantidad que los lpidos complejos. Presentan diversas funciones biolgicas que incluyen vitaminas y hormonas Familias: Terpenos Esteroides - Prostaglandinas

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