Semillero de Bioinformática

e Inteligencia Artificial

Alianzas:
 Asesores:
Simón Orozco Arias
Reinel Tabares Soto
Rubén Darío Flórez Hurtado
Romain Guyot
Integrantes:
Johan Sebastian Piña Duran Alejandro Mora Rubio
Mario Alejandro Bravo Jorge
Ortíz Iván Padilla Andrés
BuriticáMauricio Buriticá Buriticá
Cristian Felipe JiménezCamilo
Nicolás Tobón Orozco Varón Andrés Ortega Pérez
Mariana Sofia Candamil Cortés
Carlos Alejandro
Alberto Cortés Buenaventura Burbano Jácome
Aguirre
Jesús Alejandro Alzate Grisales

2
Semillero de Bioinformática

Nicolás Tobón Orozco

Mariana Sofia Candamil Cortés
Johan Sebastian Piña Duran
Andrés Mauricio Buriticá
Asesor: Simón Orozco Arias
¿Qué hace un bioinformático?

4
Herramientas Utilizadas

5
Análisis de la influencia de los elementos
transponibles en la roya del café

Mariana Sofía Candamil Cortés

Asesor: Simón Orozco Arias
 Objetivos
 Realizar el ensamblaje del genoma de la roya del café, mediante el
uso de diferentes software de ensamblaje, realizando
comparaciones y obteniendo conclusiones a cerca de cuál es el
más óptimo.
 Estudiar la influencia que tienen los elementos transponibles en la
roya del café.

http://www.cesvver.org.mx/wp-content/uploads/Roya07.jpg https://www.buencafe.com/wp-content/uploads/2018/01/cenicafe-b
uencafe.jpg 7
Impacto y
Resultados

Repeat Explorer

REPdenovo Transposome

ReAs RED

Repeat Scout
8
Variación del tamaño del genoma debido a la
influencia de los elementos transponibles

Nicolás Tobón Orozco

Asesor: Simón Orozco Arias
 Objetivos
 Hallar la relación entre la influencia de los TEs (transposable
elements) en el tamaño del genoma y como se ven afectados por
las dinámicas de transferencia.

Enfoque de Investigación
Se quiere hallar relación entre la influencia
de los elementos transponibles en el Tamaño y dinámicas de transferencia
tamaño del genoma:

50% 20% 10
 Impacto y
Resultados Facilidad para el
entendimiento de datos
obtenidos en software
Comprender comportamiento
genético

http://bit.ly/2Zd2qD0
http://bit.ly/2PcmxN5
11
Alineamiento Gráfico en paralelo para análisis
genómico

Johan Sebastian Piña Duran

Asesor: Simón Orozco Arias
Dot plot

3 Gb 13
 Impacto y 365 Años
Resultados |
60 min
|
Avance proyecto
21 Min
16%

84%

https://bit.ly/2KEtv6Z
14
Análisis de inserciones de Retrovirus en el cáncer
de mama

Nicolás Tobón Orozco

Mariana Sofia Candamil Cortés
Johan Sebastian Piña Duran
Andrés Mauricio Buriticá
Asesor: Simón Orozco Arias
Retrovirus

https://bit.ly/3Ds34As

16
https://bit.ly/2KEAd3z
 Impacto y
Resultados
Determinar los
Avance proyecto lugares en el genoma
en los que se ubican
30%
los retrovirus que
70%
están relacionados
con el cáncer

https://bit.ly/2KEtv6Z
17
Clasificación de genes saltarines por medio de
técnicas de Machine Learning

Johan Sebastian Piña Duran

Asesores:
Simón Orozco
Arias
 Genes Saltarines

ADN Vegetal ADN en plantas Variaciones

Retrotransposones
Otros
20%

80%

https://bit.ly/2rsmxcD
https://bit.ly/2ht4zFZ Gypsy Copia
19
 Impacto y
Muestras: Caract:
Resultados 29.769 5.460

Exactitud del
modelo
https://bit.ly/2PeNIFA 96%

[PORC
ENTAJ
E]

https://bit.ly/2rqr9AB https://bit.ly/2KEtv6Z
20
¡Gracias!
Correo: simon.orozco@autonoma.edu.co
rtabares@autonoma.edu.co
Universidad Autónoma de Manizales

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