Ejercicios

Bio Edit
( Biological sequence alignment edit)
MEGA
(Molecular Evolutionary Genetics Analysis) 

Aidee Vanessa Escobar Rojas

Proteínas
Inicialmente se deben copiar las secuencias de las proteínas suministradas por la docente, en el Word se da copiar y
en el programa Bioedit, damos click donde dice File y allí seleccionamos la opción New from clipboard. Estás
como el portapapeles qué nos permite copiar en el programa las secuencias de las proteínas. Como vemos quedan
resaltadas en negro
Luego vamos a la opción Accesory Application y allí
seleccionamos ClustalW Multiple alignmemt
A continuación no sale este recuadro en el
cual debemos seleccionar estas opciones y
adicional debemos agregarle cuatro ceros o
tres ceros, y luego le damos Run ClustalW
Con este paso anterior nos va a salir está
ventana, y este ejercicio lo guardamos con su
respectivo nombre
Para poder realizar los árboles tenemos que
nuevamente seleccionar Accesory
Application
Y luego probar con estas opciones, el
programa tiene algunos errores por los cuales
no siempre van a salir los árboles de la mejor
manera. En mi caso las opciones que me
permitieron formar los árboles filogenéticos
fueron Fitch tree Output y Neighbor
Output
Neighbor Output
Fitch tree Output
DNA
Inicialmente se deben copiar las secuencias de DNA suministradas por la docente, en el Word se da copiar y en el
programa Bioedit, damos click donde dice File y allí seleccionamos la opción New from clipboard. Estás como el
portapapeles qué nos permite copiar en el programa las secuencias de las proteínas. Como vemos quedan
resaltadas en negro
Luego vamos a la opción Accesory Application y allí
seleccionamos ClustalW Multiple alignmemt
A continuación no sale este recuadro en el
cual debemos seleccionar estas opciones y
adicional debemos agregarle cuatro ceros o
tres ceros, y luego le damos Run ClustalW
Con este paso anterior nos va a salir está
ventana, y este ejercicio lo guardamos con su
respectivo nombre
Para poder realizar los árboles tenemos que
nuevamente seleccionar Accesory
Application
Y luego probar con estas opciones, el
programa tiene algunos errores por los cuales
no siempre van a salir los árboles de la mejor
manera. En mi caso las opciones que me
permitieron formar los árboles filogenéticos
fueron Fitch tree Output y Neighbor
Output
Fitch tree Output
Neighbor Output