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05 EC. Procesos para Un Estadistico
05 EC. Procesos para Un Estadistico
un ensayo clnico
para un estadstico
Adaptada de
Marco Pavesi
Statistics Manager
Almirall, S.A.
Ferran.Torres@uab.es
INTRODUCCIN
Qu es un Ensayo Clnico
(EC)?
Ferran.Torres@uab.es
Introduccin
The aim of any Clinical Trial should be to
obtain a truthful answer to a relevant
medical issue. This requires that the
conclusions be based on an unbiased
assessment of objective evidence rather
than on a subjective compilation of clinical
opinion.
(Stuart J. Pocock: Clinical Trials. A practical approach.
Wiley, 1983)
Introduccin
Un
Introduccin
El mtodo cientfico aplicado a un EC:
OBJETIVO DEL EC (hiptesis especficas)
DISEO DEL EC (protocolo)
DESARROLLO DEL EC (organizacin rigurosa)
ANLISIS DE LOS DATOS (tcnicas estadsticas)
CONCLUSIONES DEL EC (publicidad de los
resultados)
Ferran.Torres@uab.es
Personal
que participa en un EC
10
Core-activities en un EC
Actividades de importancia central, no siempre
externalizables:
Protocolo del EC
Diseo estadstico
Clculo del tamao muestral
Farmacovigilancia
11
Actividades externalizables
Actividades generalmente externalizables a una CRO en un EC:
Monitorizacin
Plan de anlisis estadstico
Gestin de datos
Programacin estadstica
Informe final
El personal interno del EC es responsable de los contactos
con las CROs correspondientes (interfaces).
12
Preparacin
Fase
Experimental
Reclutamiento
Tratamiento
Cierre
Base
Datos
- Resultados
preliminares
- Resultados
definitivos
Informe
Final
13
Ferran.Torres@uab.es
14
15
Protocolo de un EC
Responsabilidad:
17
Investigacin
Clnica
Apartados estadsticos
Protocolo
y de gestin de datos
del protocolo
Comit de
revisin
Aprobacin
- Estadstica
- Gestin de
datos
Preparacin
FE
18
Protocolo
Investigacin
Clnica
- Estadstica
- Gestin de
datos
19
con implicaciones
estadsticas
Apartados puramente estadsticos
20
21
Objetivos
Eficacia: Superioridad / Equivalencia / Noinferioridad
Seguridad y tolerabilidad
Determinacin del perfil farmacocintico
Biodisponibilidad relativa / bioequivalencia
Bsqueda de dosis
Eficacia y/o seguridad en determinadas
poblaciones
etc.
22
Caractersticas del EC
Fase del estudio: I, II, III, IV
Unicntrico / Multicntrico
Randomizado / No randomizado
Abierto / Sinple ciego / Doble ciego /
Evaluador ciego
Tiempo de duracin del tratamiento
Diseo
23
Diseo del EC
Paralelo
randomizado
Cruzado randomizado
Dosis escalonada
Paralelo randomizado a dosis escalonada
24
25
Randomizacin
Asignacin
aleatoria de un tratamiento
(secuencia) a cada sujeto.
Objetivo principal: evitar sesgo de seleccin
(un conjunto de sujetos con determinadas
caractersticas son asignados a un mismo
grupo de tratamiento).
Tener en cuenta: diseo del estudio, numero
de tratamientos, tamao del bloque, etc.
26
Poblaciones de anlisis
29
DEFINICIN ESTADSTICA
Mtodos Estadsticos
31
Mtodos / Modelos
La variable EGDP ser analizada mediante el
siguiente modelo de anlisis de la covarianza (ANCOVA)
(refs.):
donde,
yij
es el cambio respecto al valor basal (Y BASAL - Y 6 SEMANAS)
en la variable de eficacia (EGDP) del paciente i
tratado con el frmaco j
es la media global
j
es el efecto fijo del tratamiento j (j = 1, 2)
es el coeficiente del valor basal de la variable EGDP
Xij0
es el valor basal de la variable EGDP del paciente i
tratado con el frmaco j
eij
es el trmino del error [N(0, 2e)]
32
Preparacin de la fase
experimental
Ferran.Torres@uab.es
34
Preparacin de la fase
experimental
35
36
Date of birth _ _ / _ _ _ / _ _ _ _
D D M M M Y Y Y Y
Male
White
Sex
Black/Negroid
Female
Race
Oriental
Asian/not oriental
Others
Specify ___________
37
CRD anotado
DEMOG
DEMOGRAPHIC DATA
DOB
Date of birth _ _ / _ _ _ / _ _ _ _
D D M M M Y Y Y Y
SEX
Male
Sex
Female
White
RACE
Race
Black/Negroid
Oriental
Asian/not oriental
Others
1
2
3
4
5
RACEOTH
Specify ___________
38
Panel
Tipo
Descripcin
HEAD_21
DEMOG
Informacin demogrfica
HEAD_21
......
MEDICATION
Medicacin concomitante
39
Base de datos
STUDY
CENTRE INVNO
PATNO VISITNO
VISITID
PAGE SEX
RACE
HEAD_21 001
01
001
SCREENING
04
HEAD_21 099
10
089
SCREENING
04
HEAD_21 030
01
001
SCREENING
04
HEAD 21
030
01
002
SCREENING
04
HEAD_21 100
00
033
SCREENING
04
........
40
1.
2.
LQ
3.
4.
At visit 2 if one question or more than one are NO, then Screening
evaluation page should be completed, and reason for screening failure
should be NON-FULFILMENT INCLUSION/EXCLUSION CRITERIA
DEMOG
Q 5.
Q 6.
Q 7.
8.
41
42
Fase experimental
Ferran.Torres@uab.es
43
Fase experimental
Durante y/o una vez terminada la
monitorizacin:
Control de los cuadernos de recogida de datos
(CRF Tracking)
Entrada de los datos
Validacin de los datos
Queries y listados
Codificacin
Data Blind Review
44
Entrada de
datos
Doble entrada
Investigador
Queries
Validacin de
los datos
Correccin de
los errores
Cierre de la base
de datos
Papel
Anlisis
estadstico
Sistema informtico
45
Investigador
Validacin de
los datos
Queries
Cierre de la base
de datos
Correccin de
los errores
Verificacin
automtica
Anlisis
estadstico
Sistema informtico
46
47
Verde:
Blanco:
X:
INVESTIGADOR
001
001
001
001
002
PACIENTE
001
002
004
005
002
VISITA 2
VISITA 4
H1 H2 H3 H1 H2 H3 H1 H2 H3 H4
X
X
X
X
X
X
Hojas recibidas
Hojas pendientes de recibir
Paciente que ha abandonado el estudio
48
Entrada de datos
Primer entrador: entrada de los datos del
CRD
Segundo entrador (experto): entrada de los
datos del CRD
En caso de discrepancia, decide el segundo
Si hay discrepancias entre el primer y
segundo entrador, resuelve las mismas el
Gestor de Datos Clnicos (Clinical Data
Manager)
49
50
Queries
FILTRO
Q5: Edad > = 18 . Query si Edad < 18.
QUERY:
CENTRO
090
INVESTIGADOR
PACIENTE
VISITA
VALOR DE LA
EDAD EN EL CRD
010
010
16
VALOR
CORRECTO
Fecha:
51
52
Codificacin
Items a codificar
Diccionarios
Acontecimientos adversos
Medicacin concomitante
WHO-DRUG ((WHO-DD)
Historia mdica
MEdDRA / ICD-9-CM
Examen fsico
Generalmente no se codifica
(MedDRA / ICD-9-CM
53
Codificacin: ejemplo
Acontecimiento adverso reportado por el Investigador como Common cold
MedDRA
WHO-ART
Common cold
All term
Common cold
Preferred term
Nasopharyngitis
Preferred term
Rhinitis
Body system
Body system
54
Ferran.Torres@uab.es
55
Control de calidad
56
B io m e t r a
E s t a d s t ic a
r e a d e E s t a s s t ic a
r e a d e P r o g r a m a c i n
E s t a d s t ic a
G e s t i n d e D a t o s
D aClinical
t a B a s eData
A d m Manager
in is t r a t o r
(CDM
( D B A ))
C lin ic a l D a t a
C o o r d in a t o r ( C D C )
Blind Review
The
58
Patrn de Missings
Interaccin lugar*tratamiento:
Evaluacin
Asunciones estadsticas
59
Blind Review
DATA
(III)
3.2
3.3
4. STATISTICAL ANALYSIS
60
Blind Review
DATA
(IV)
6. CONCLUSIONS: PATIENTS
ASSIGNMENT TO ANALYSIS
POPULATIONS
Appendix I: Analysis Sets
Appendix II:
Patients
61
Description
Violation
Minor
Major
PV
PV
PPE
PV
PV
PPE
PV
Protocol
Violation (PV)
Per Protocol
Exclusion (PPE)
NA
PV
PPE
PPE
62
63
Ejemplo de SAP
1. Study personnel
2. Scope of the Analysis Plan
3. Software Methods
4. Study Design
5. Study Objectives
6. Justification of Sample Size
7. Randomisation Procedure
8. Diagram of Scheduled activities
9. Protocol deviations
10. Statistical Analysis
10.1
10.2
10.3
10.4
10.4.1
General Remarks
Analysis populations
Handling of missing data
Demographic and Background CharacteristicS
Treatment Compliance
64
10.5
Ejemplo de SAP
Efficacy Variables
10.5.1
10.5.2
10.5.3
10.8.1
10.8.2
10.6
10.7
10.8
Safety Variables
Pharmacokinetic (PK) parameters
Computation of Derived Variables
10.8.3
10.8.4
10.8.5
65
10.9
Ejemplo de SAP
10.9.1
10.9.2
variable
10.9.3
10.9.4
ECGs
10.10.2
10.10.3
Adverse Events
Vital Signs
10.10.4
Laboratory tests
10.10.5
66
Ejemplo de SAP
Changes to the planned analysis made
67
PROGRAMACIN
Ferran.Torres@uab.es
68
Programacin estadstica
Plan
69
Programas
Los programas de SAS se elaboran a partir de la
especificaciones del PAE
Proceso:
Anlisis y
traduccin a
SAS
PAE
Programas
70
Programas
Documentacin
Validacin
71
Programing Report
1.
2.
3.
PROTOCOL TITLE:
SIGNATURE PAGE
TABLE OF CONTENTS
4.
5.
INTRODUCTION
EXECUTION OF SAS PROGRAM
3.1.
REPORT: VOLUME 1
3.2.
FINAL VERSION OF THE STATISTICAL ANALYSIS PLAN: VOLUME
2
3.3.
DOCUMENTATION ON THE VALIDATION OF THE STATISTICAL
PROGRAMS AND MACROS: VOLUME 3
5.1.
5.2.
GENERAL REQUIREMENTS
PATHS SETTINGS
5.2.1. Examples for running the SAS programs and how to modify the setting
macro variables:
5.3.
5.4.
5.5.
5.6.
5.7.
STRUCTURE OF DIRECTORIES
FILES: PROGRAMS, DATASETS, RESULTS
ORDER OF EXECUTION
FLOW CHART FOR PROGRAM EXECUTION
OUTPUTS OF THE PROGRAMS
72
6. PROGRAMS
6.1.
GENERAL SETTING FOR PROGRAMS
EXECUTION: INI.SAS
6.2.
GENERATION OF THE DATASETS
6.2.1.
6.2.2.
6.3.
File proceso.sas
Subroutines for Proceso.sas
6.2.2.1. Formats.sas
ANALYSIS
6.3.1.
6.3.2.
6.3.3.
6.3.4.
6.3.4.1.
6.3.4.2.
6.3.4.3.
73
7.
8.
9.
MACROS
VALIDATION
DATABASE DOCUMENTATION
9.1.
LIBRARY PATH:
9.2.
APPENDIX I: BASIC INFORMATION ON THE
DATABASE
9.3.
APPENDIX II: CONTENTS OF THE DATABASE
74
RESULTADOS
PRELIMINARES /
DEFINITIVOS
Ferran.Torres@uab.es
75
Resultados
definitivos
76
Resultados preliminares /
Ejecucin de los programas
definitivos
Programacin
- Tablas y grficos
- Listados
Biometra
Estadstica
rea de Estasstica
rea de Programacin
Estadstica
Gestin de Datos
Data
BaseData
Administrator
Clinical
Manager
(DBA))
(CDM
Clinical Data
Coordinator (CDC)
INFORME ESTADSTICO
Ferran.Torres@uab.es
78
Informe estadstico
Decripcin de los resultados del anlisis estadsticos
Apartados:
- Resumen
- Introduccin
- Metodologa estadstica utilizada
- Poblaciones del estudio
- Resultados
- Conclusiones
- Referencias
- Tablas, anlisis estadsticos y grficos
La interpretacin de los resultados es estadstica,
nunca clnica
79
INFORME FINAL
Ferran.Torres@uab.es
80
Informe final
Investigacin
Clnica
Clnica
+
Estadstica
Informe estadstico
- Anlisis estadsticos
- Tablas
Estadstica
Informe final
81
Seguimiento de la informacin
EECC
Seguimiento de la informacin
Supervisin independiente de un EC:
Seguridad de los participantes en el EC
Garantas de validez cientfica del EC
(anlisis intermedios).
Toma de decisiones sobre la
terminacin prematura del EC (por
seguridad o falta de eficacia)
83
Seguimiento de la informacin
Comits Indep.de Monitorizacin (Indep.
Data Monitoring Committees, IDMCs)
Criterios de composicin:
Experiencia en EECC
Conocimientos especficos
Ningn conflicto de intereses
84
Seguimiento de la informacin
Comits Indep.de Monitorizacin (Indep. Data
Monitoring Committees, IDMCs)
Composicin:
Seguimiento de la informacin
Comits Indep.de Monitorizacin (Indep.
Data Monitoring Committees, IDMCs)
Composicin:
Seguimiento de la informacin
Comits Indep.de Monitorizacin (Indep. Data
Monitoring Committees, IDMCs)
Actividades:
87