Enzimas

Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular

Especficas para un substrato particular (Estereo especificidad)

Enzimas
COO
-
C-H
H-C
COO
-

COO
-
H
3
+
N-C-H
C-H
2
COO
-

COO
-
C-H
C-H
COO
-

+ N H
3
+

Fumarato
(= ,trans)
Aspartasa
L-Aspartato D-Aspartato
Maleato
(= ,cis)
COO
-
H-C- NH
3
+

C-H
2
COO
-
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular
Especficas para un substrato particular (Estereo especificidad)

Aceleran reacciones especficas qumicas(10
3
-10
20
)
Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos


Enzimas
Pepsina 1.5
Tripsina 7.7
Catalasa 7.6
Arginasa 9.7
Fumarasa 7.8
Ribonucleasa 7.8
Enzima pH ptimo
Mamferos 37
Bacterias y algas aprox. 100
Bacterias rticas aprox. 0
Enzima Temp. pt.
(
o
C)
Bacterias en muestra de hielo antigua
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular
Especficas para un substrato particular (Estreo especificidad)
Aceleran reacciones especficas qumicas(10
3
-10
20
)
Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos

Son las unidades funcionales del metabolismo celular

Enzimas
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular
Especficas para un substrato particular (Estreo especificidad)
Aceleran reacciones especficas qumicas(10
3
-10
20
)
Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos
Son las unidades funcionales del metabolismo celular

Reacciones acopladas (catabolismo anabolismo)

Enzimas
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular
Especficas para un substrato particular (Estreo especificidad)
Aceleran reacciones especficas qumicas(10
3
-10
20
)
Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos
Son las unidades funcionales del metabolismo celular
Reacciones acopladas (catabolismo anabolismo)

Reguladoras de rutas metablicas (Oligomricas)


Enzimas
Enzima (gr). : fermento
Vitalistas

Mecanicistas
1926, James B. Summer Ureasa
1930s
Pepsina
Tripsina
Quimotripsina
Carboxipeptidasa
Enzima Amarillo viejo (flavoprotena NADPH)
1800s fermentacin del azcar por levaduras
Transformacin
de Alimentos
Fermentaciones
Quesos
Vinos
Medicina Transaminasas
Industria
Qumica
Penicilina
Agricultura
Rhyzobium
Estructura
globular
Hervir con HCl
Tripsina
Temperatura elevada
pH extremo
Funcionalidad Inactiva
E: PM 100000, 7 nm
S: PM 250, 0.8 nm
Cofactor
Orgnico:
Coenzimas
NAD,
FAD,
CoASH.
Inorgnico:
Fe
2+
, Mn
2+
, Zn
2+
,etc.
Grupo Prosttico








Apoenzima
Holoenzima
Enzimas que requieren
elementos inorgnicos
Citocromo oxidasa
Catalasa, peroxidasa
Fe
2+
, Fe
+
,

Citocromo oxidasa Cu
2+

DNA polimerasa
Anhdrasa carbnica
Alcohol deshidrogensa

Zn
2+


Hexoquinasa
Glucosa 6-fosfatasa
Mg
2+


Arginasa Mn
2+

Piruvato quinasa K
+
, Mg
2+

Ureasa Ni
2+

Nitrato reductasa Mo
2+

Coenzimas: Actan como transportadores eventuales de
tomos especficos o de grupos funcionales
Coenzimas Entidad transferida
Pirofosfato de tiamina .
Dinucletido de flavina y adenina.
Dinucletido de nicotinamida y de adenina
Coenzima A .
Fosfato de Piridoxal .
5-Desoxicobalamina (Coenzima B12)

Biocitina .
Tetrahidrofolato .
Aldehdos
tomos de hidrgeno
Ion hidruro (H
-
)
Grupos acilo
Grupos amino
tomos de H y grupos
alquilo
CO
2
Otros grupos
monocarbonados
Adenosine Triphosphate (ATP)
Coenzyme A (CoA)
Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)
Nicotinamide Adenine
Dinucleotide (NAD
+
)
Nicotinamide Adenine Dinucleotide
Phosphate (NADP
+
)
Coenzimas
VITAMINAS FUNCIONES
Enfermedades
carenciales
C (cido
ascrbico)
Coenzima de algunas peptidasas.
Interviene en la sntesis de colgeno
Escorbuto
B1 (tiamina)
Coenzima de las descarboxilasas y de
las enzima que transfieren grupos
aldehdos
Beriberi
B2
(riboflavina)
Constituyente de los coenzimas FAD y
FMN
Dermatitis y lesiones
en las mucosas
B3 (cido
pantotnico)
Constituyente de la CoA
Fatiga y trastornos del
sueo
B5 (niacina)
Constituyente de las coenzimas NAD y
NADP
Pelagra
B6
(piridoxina)
Interviene en las reacciones de
transferencia de grupos aminos.
Depresin, anemia
B12
(cobalamina)
Coenzima en la transferencia de grupos
metilo.
Anemia perniciosa
Biotina
Coenzima de las enzimas que
transfieren grupos carboxilo, en
metabolismo de aminocidos.
Fatiga, dermatitis


Urea
Arginina
Ureasa
Arginasa

Lis, Arg
Pepsina
Tripsina
Amilasa
Enzima Substrato
rec A

Protena de
choque trmico
Rec A

HSP70
gen
Caract.
Comit de la Unin Internacional de Bioq. y Biol. Mol. (IUBMB)
http://www.enzyme-database.org/ http://us.expasy.org/enzyme/
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/
EC 1.1.1.2
Accepted
name:
alcohol dehydrogenase (NADP
+
)
Reaction: an alcohol + NADP
+
= an aldehyde + NADPH + H
+

Other na
me(s):
aldehyde reductase (NADPH2); NADP-alcohol dehydrogenase; NADP
+
-
aldehyde reductase; NADP
+
-dependent aldehyde reductase; NADPH-
aldehyde reductase; NADPH-dependent aldehyde reductase; nonspecific
succinic semialdehyde reductase; ALR 1; low-Km aldehyde reductase;
high-Km aldehyde reductase; alcohol dehydrogenase (NADP
+
)
Systematic name: alcohol:NADP
+
oxidoreductase
Comments: A zinc protein. Some members of this group oxidize only primary
alcohols; others act also on secondary alcohols. May be identical
with EC 1.1.1.19 (L-glucuronate reductase), EC 1.1.1.33
[mevaldate reductase (NADPH)] and EC 1.1.1.55 [lactaldehyde
reductase (NADPH)]. A-specific with respect to NADPH.
Links to other da
tabases:
BRENDA, ERGO, EXPASY, IUBMB, KEGG, PDB, CAS registry
number: 9028-12-0

1. Oxidorreductasas

2. Transferasas

3. Hidrolasas

4. Liasas

5. Isomerasas

6. Ligasas


Clases de Enzimas:
ENZYME
Enzyme nomenclature database
ENZYME is a repository of information relative to the nomenclature of enzymes. It is primarily based on the recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) and it describes each type of characterized enzyme for which an EC (Enzyme Commission) number has been provided [More details / References / Linking to ENZYME / Disclaimer].
Release of 17-Jan-2008 (4063 active entries)


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ENZYME
Enzyme nomenclature database
ENZYME is a repository of information relative to the nomenclature of enzymes. It is primarily based on the recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) and it describes each type of characterized enzyme for which an EC (Enzyme Commission) number has been provided [More details / References / Linking to ENZYME / Disclaimer].
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ENZYME
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EC 1.1 Acting on the CH-OH group of donors

EC 1.1.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor
EC 1.1.1.1 alcohol dehydrogenase
EC 1.1.1.2 alcohol dehydrogenase (NADP+)
EC 1.1.1.3 homoserine dehydrogenase
EC 1.1.1.4 (R,R)-butanediol dehydrogenase
EC 1.1.1.5 acetoin dehydrogenase
EC 1.1.1.6 glycerol dehydrogenase

EC 1.1.2 With a cytochrome as acceptor
EC 1.1.2.1 now EC 1.1.99.5
EC 1.1.2.2 mannitol dehydrogenase (cytochrome)
EC 1.1.3 With oxygen as acceptor
EC 1.1.3.1 deleted, included in EC 1.1.3.15
EC 1.1.3.2 now EC 1.13.12.4
EC 1.1.3.3 malate oxidase
EC 1.1.3.4 glucose oxidase
EC 1.1.4 With a disulfide as acceptor
EC 1.1.4.1 vitamin-K-epoxide reductase (warfarin-sensitive)
EC 1.1.5 With a quinone or similar compound as acceptor
EC 1.1.5.1 Deleted, see EC 1.1.99.18 cellobiose dehydrogenase (acceptor)
EC 1.1.99 With other acceptors
EC 1.1.99.1 choline dehydrogenase
EC 1.1.99.2 2-hydroxyglutarate dehydrogenase
Search Search Search Search Search Search
EC 1.2 Acting on the aldehyde or oxo group of donors

EC 1.2.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor
EC 1.2.1.1 deleted, replaced by EC 1.1.1.284 and EC 4.4.1.22
EC 1.2.1.2 formate dehydrogenase
EC 1.2.2 With a cytochrome as acceptor
EC 1.2.2.1 formate dehydrogenase (cytochrome)
EC 1.2.2.2 pyruvate dehydrogenase (cytochrome)
EC 1.2.3 With oxygen as acceptor
EC 1.2.3.1 aldehyde oxidase
EC 1.3 Acting on the CH-CH group of donors

EC 1.3.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor
EC 1.3.1.1 dihydrouracil dehydrogenase (NAD+)
EC 1.3.2 With a cytochrome as acceptor
EC 1.3.2.1 now EC 1.3.99.2
EC 1.3.2.2 now EC 1.3.99.3
EC 1.3.3 With oxygen as acceptor
EC 1.3.3.1 dihydroorotate oxidase
EC 1.3.3.2 now EC 1.14.21.6

1. Oxidorreductasas

2. Transferasas

3. Hidrolasas

4. Liasas

5. Isomerasas

6. Ligasas


Clases de Enzimas:
Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin
que catalizan
Ejemplo

1

Oxidorreductasas


De xido reduccin
(transferencia de e-)

Deshidrogenasas
Peroxidasa
Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
Reduccin: ganancia de electrones (hidrgeno o prdida de
oxgeno)

Oxidacin: prdida de electrones (hidrgeno o ganancia de
oxgeno).

La Oxidacin y la Reduccin son reacciones acopladas (REDOX)




Si una molcula se reduce, tiene que haber otra que se oxide
1. Oxido-reductasas
( Reacciones de oxido-reduccin).



Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que
catalizan
Ejemplo

1

Oxidorreductasas


De xido reduccin (transferencia de
e-)

Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas

2

Transferasas

Transferencia de grupos

Kinasas
Transaminasas






2. Transferasas
(Transferencia de grupos funcionales)



grupos aldehdos
gupos acilos
grupos glucosilos
grupos fosfatos (kinasas)




Succinato Deshidrogenasa
Citocromo c oxidasa.
No. Clase Tipo de reaccin que
catalizan
Ejemplo

1

Oxidorreductasas


De xido reduccin (transferencia de e-)

Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas
Transaminasas

3

Hidrolasas
Hidrlisis, con transferencia
de grupos funcionales del
agua
Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa
Enzimas:
Transforman polmeros en monmeros.
Actan sobre:





3. Hidrolasas
(Reacciones de hidrlisis)


enlace ster
enlace glucosdico
enlace peptdico
enlace C-N
No. Clase Tipo de reaccin que
catalizan
Ejemplo

1

Oxidorreductasas


De xido reduccin (transferencia de e-)

Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas
Transaminasas
3 Hidrolasas Hidrlisis, con transferencia de grupos
funcionales del agua
Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa
4 Liasas Lisis de un substrato,
generando un doble enlace, o
Adicin de un substrato a un
doble enlace de un 2o.
substrato
(Sintasas)

Descarboxilasa
pirvica
Enzimas:




4. Liasas
(Adicin a los dobles enlaces)



Entre C y C
Entre C y O
Entre C y N
No. Clase Tipo de reaccin que
catalizan
Ejemplo

1

Oxidorreductasas


De xido reduccin (transferencia de e-)

Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas
Transaminasas
3 Hidrolasas Hidrlisis, con transferencia de grupos
funcionales del agua
Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa
4 Liasas Lisis de un substrato, generando un
doble enlace, o
Adicin de un substrato a un doble
enlace de un 2o. substrato
(Sintasa)
(Sintasas)
Descarboxilasa
pirvica

5

Isomerasas

Transferencia de grupos en
el interior de las molculas
para dar formas ismeras

Mutasas
Epimerasas
Racemasas
Enzimas:
5. Isomerasas
(Reacciones de isomerizacin)


No. Clase Tipo de reaccin que
catalizan
Ejemplo

1

Oxidorreductasas


De xido reduccin (transferencia de e-)

Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas
Transaminasas
3 Hidrolasas Hidrlisis, con transferencia de grupos
funcionales del agua
Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa
4 Liasas Lisis de un substrato, generando un
doble enlace, o
Adicin de un substrato a un doble
enlace de un 2o. substrato
(Sintasa)
(Sintasas)
Descarboxilasa pirvica
5 Isomerasas
Transferencia de grupos en el
interior de las molculas para
dar formas ismeras
Mutasas
Epimerasas
Racemasas
6 Ligasas Formacin de enlaces C-C,
C-S, C-O y C-N. Mediante
reacciones de condensacin,
acopladas a la ruptura del ATP

Sintetasas
Enzimas:


6. Ligasas
(Formacin de enlaces, con aporte de ATP)
Entre C y O
Entre C y S
Entre C y N
Entre C y C
E + S SE E + P
1. Actuacin global de la reaccin catalizada.
2. Utilizar un procedimiento analtico para la determinacin de S
que desaparece o los productos de la reaccin que aparecen.
3. Si la enzima requiere cofactores (ines metlicos o
coenzimas).
4. La dependencia de la actividad enzimtica con la [S] o sea K
M

del S.
5. El pH ptimo.
6. Un intervalo de temperatura en la que la enzima es estable y
muestra actividad elevada.

Cmo detectar una enzima?
Es la cantidad que transforma 1.0 mM (10
-6
M) de S /min
a 25
o
C, en las condiciones de medida ptima.
1.0 Unidad de Actividad Enzimtica
Es el no. de U de enzima / mg de protena.
Es una medida de la pureza de la enzima.
La Actividad Especfica
Catalasa de
Aspergillius niger
4000-8000 U/mg de prot.

100 mg $ 209.80 USD.

Catalasa de
Hgado de bisonte
2000-5000 U/mg de prot.

1 g $ 768.50 USD.

Es el no. de molculas de S transformadas / unidad de tiempo,
por una molcula de enzima
(o por un slo sitio cataltico, cuando la E, es el limitante).
El Nmero de Recambio de una Enzima
Anhidrasa carbnica
b-Amilasa
b-Galactosidasa
Fosfoglucomutasa
36 000 000
1 000 000
12 000
1 240
Enzima. Moles de S, transf./ min.
a 20-38 oC.