Curso de Evolución 2018

Facultad de Ciencias Contexto: origen africano de los homínidos

Montevideo, Uruguay
http://evolucion.fcien.edu.uy/
http://eva.universidad.edu.uy/

21. El registro molecular de la evolución humana.

1 2

Contexto: posición filogenética

humanos
Visión pre-molecular

R
orangután

chimpancé
15-30
MA
gorila
chimpance Ramapithecus humano

3 4

1
 Contexto: posición filogenética Contexto: divergencia entre humanos y chimpancés
humanos
Visión pre-molecular
King y Wilson (1975)
R
orangután • similitud de 99% a nivel aminoacídico en proteínas
• estimada por electroforesis de proteínas
chimpancé • ampliamente confirmada por estudios de ADN
15-30
MA • sugerencia de diferencias en “genes reguladores”
gorila Estudios más recientes indican valores algo menores a nivel de
Visión de Sarich y Wilson orangután ADN (96-98%).

R
gorila
4-6 Datos moleculares sustentan hipótesis sobre el origen
MA humano geográfico de la especie humana moderna

chimpancé
5 6

Teorías sobre el origen de la especie humana El origen geográfico del hombre moderno
(Homo sapiens):
 Una cuestión que ha suscitado profundos debates desde hace varios
años, es si Homo sapiens se originó en un sólo lugar, o si por el contrario 2 teorías principales:
surgió en forma independiente en varias localidades.
 La Teoría Multirregional
 Hasta el momento, los hallazgos fósiles han permitido evidenciar que
(Wolpoff et al. 1984)
Homo erectus, habiéndose originado en África, habría alcanzado una
distribución geográfica más amplia que los homínidos predecesores,  Propuesta por paleontólogos y principalmente
llegando hace más de 1.5 millones de años, hasta parte de Europa y Asia. basada en el registro fósil
Por otra parte, fósiles de Homo sapiens se han encontrado distribuidos por
todos los continentes.
 La Teoría del orígen africano
 La evidencia fósil tiene varias posibles interpretaciones, dos de las (Cann et al. 1987, Stringer y Andrews 1988)
cuales se han convertido en las principales teorías sobre cómo y dónde
surgieron los humanos modernos: la teoría del origen africano y la teoría  Basada en datos genético-moleculares
multirregional. y en interpretaciones alternativas del registro fósil
 Evidencia amplia a su favor
7 8

2
 Las dos teorías se pueden representar la teoría del origen Africano postula los siguientes eventos:
esquemáticamente de la siguiente forma:
Modelo Modelo del 1 Africa fue el único escenario de la evolución
multirregional origen africano humana, durante los primeros 3 ó 4 millones de
presente reciente años de existencia de los homínidos. La primera
Europa Africa Asia Europa Africa Asia especie en abandonar Africa fue Homo
erectus, la cual llegó a tener una distribución
que alcanzó al este de Asia, norte y este de
Homo sapiens Neandertal? Africa y posiblemente Europa. Esta migración
tiempo

ocurrió hace más de 1.5 millones de años. La

teoría multirregional concuerda en este punto.
Homo erectus

2 Homo sapiens, también se habría originado en

pasado
El modelo multirregional propone que
Homo sapiens tuvo múltiples orígenes
fuera de Africa, lo que implica que los
humanos modernos evolucionaron
independientemente, en distintas
localidades, a partir de las distintas
poblaciones de Homo erectus.
La teoría del origen africano reciente
supone que Homo sapiens se originó
en Africa. Luego migró a otros
continentes donde desplazó a
poblaciones de Homo erectus que
previamente también habrían
migrado desde Africa a parte de
Europa y Asia.
Africa. Desde allí, se habría dispersado, hace
unos 150 mil años, desplazando a las viejas
poblaciones de Homo erectus, que terminarían
extinguiéndose. Luego, sucesivas migraciones
le habrían llevado a tener una distribución
mundial como en la actualidad, dando muestras
de su habilidad para colonizar nuevos hábitats.
La misma habría sido desencadenada por el
desarrollo cultural.
9 10

presente
Homo

0
H. neanderthalensis
H. sapiens Evidencias arqueológicas
0,5
H. heidelbergensis
H. erectus
tiempo en millones de años

39 KYA
1 40 KYA
47 KYA
H. ergaster
1,5
H. rudolfensis

H. habilis África
2

50 KYA
2,5

11 12

3
 Problemas
• evidencia de apartamiento de neutralidad del
ADN mitocondrial

• una barrida selectiva puede imitar un patrón de

expansión poblacional

• calibraciones de antigüedad de la “Eva

mitocondrial” con amplios márgenes de
incertidumbre

• significado de estimaciones lejos de ser

“evidente”

13 14

Cavalli-Sforza
• correspondencia general
entre árboles lingüísticos y
árboles genéticos

• pero los dos árboles

tienen problemas
(¡incluyendo la idea misma
(Fst) de aplicabilidad del
ordenamiento estrictamente
jerárquico!)
El árbol de las poblaciones del mundo basado en la similitud genética de 120
marcadores clásicos de un grupo de 42 poblaciones aborígenes de todo el
mundo, separa a los humanos en 9 grupos. Muestra que existe mayor • más recientemente (y con
diferencia entre las poblaciones africanas y el resto que entre dos otros métodos), Templeton
poblaciones no africanas cualquiera. Lo anterior es consistente con la propone DOS oleadas
hipótesis de que la especie humana moderna (Homo sapiens) se originó en migratorias de Homo sapiens
Africa y desde allí se propagó al resto del mundo (Cavalli-Sforza y cols.,
15 desde Africa (1.5 MA, 700KY, 100KY) 16
1994).

4
 Cromosoma Y: Haplotipos del cromosoma Y
más datos en favor del origen africano

90 (50 - 130) KYA, Hammer and Zegura

59 (40 - 140) KYA, Thomson et al. A B C D E F* G H I J K* L M N O P* Q R
90
69 (56 - 81) KYA, Hammer and Zegura
80 40 (35 - 89) KYA, Thomson et al.
70
KYA
60
50
40
30
20
10
0
A B C D E F* G H I J K* L M N O P* Q R
Y chromosome 17 18
Jobling & Tyler-Smith (2003) Nature Rev. Genet. 4, 598-612

A B C D E F* G H I J K* L M N O P* Q R A B C D E F* G H I J K* L M N O P* Q R

19 20

5
 Cambio demográfico

A B C D E F* G H I J K* L M N O P* Q R

• Evidencia de expansión
• Prueba D de Tajima: predominio de valores
negativos

21 22

Estructura genética fina (> 500.000 SNPs)

La diversidad genética humana es baja
(con respecto a otras especies)

938 inds. no relacionados, 51 pobl, >650.000 SNP

Consistente con hip. de efecto fundador seriales a
partir de un origen en África Subsahariana

23 Chimp
Li et al. 2008 24

6
 Estructura genética fina (> 500.000 SNPs, 3000 inds.) MC1R: un gen muy estructurado
(¿selección diversificadora?)

alelos ancestrales
alelos derivados

Fst = 0.004 La mayoría de los eventos de fijación de alelos han ocurrido fuerade África. Los procesos
neutrales (deriva, flujo, etc.) tienen un gran efecto sobre el destino y distribución geográfica
de los alelos seleccionados
25 Coop et al. 2009. 26
Novembre et al. 2008

Genes del hombre de Neandertal

chimpancé

neandertal

humanos
modernos

Apoya una de las dos teorías sobre

el origen de la especie humana
27 (entre paréntesis: antigüedad de los fósiles) 28

7
 Genoma nuclear de H. neanderthalensis:
Comparaciones pareadas
Similitud muy alta con H. sapiens (99.5% de los sitios en
de ADN mitocondrial el ADN), en línea con resultados anteriores basados en
genomas mitocondriales completos.

Las dos especies pueden haber intercambiado genes en

una proporción baja (5%), indicando que la mayor
similitud se debe a la cercanía del ancestro común a
ambas especies.

29 30
Krings et al. (1997) Cell 90, 19-30

Sustituciones nucleotídicas inferidas de haber ocurrido en los linajes que conducien a los
genomas de los Neandertales, los humanos, y los chimpacés.
Identificación de cambios en genes codificantes de proteínas que probablemente se han
fijado recientemente (barra roja) en humanos luego de su separación con el Neandertal. Estas
posiciones deberían ser derivadas en todos los humanos actuales pero ancestrales pero
ancestrales en el Neandertal. (B) Distribución de la cobertura del Neandertal para ~14.000
sustituciones aminoacídicas encontradas en el genoma humano en comparación con otros
primates. Los mismos sitios fueron secuenciados en 50 humanos actuales.
De estos, 88 cumplen con las condiciones expuestas en A.

88?

R E Green et al. Science 2010;328:710-722

H A Burbano et al. Science 2010;328:723-725

Published by AAAS Published by AAAS

8
 Además, éramos mucho más que dos…
Evidencia a favor de teoría del “origen africano”

Huellas de selección positiva en el linaje que conduce a

humanos (genes vinculados al metabolismo, des. cognitivo
y del esqueleto).

Mayor semejanza entre Neanderthal y humanos de

Eurasia que con que de otras regiones.

Origen africano de H. sapiens y posible hibridación

temprana con Neanderthal
34
Green et al. 2010

La evidencia genética proporciona el mayor apoyo a:

Además, éramos mucho más que dos…
Máxima diversidad genética en África

Origen de Homo sapiens en África, con posterior dispersión al resto de

los continentes (al menos una oleada migratoria)

Reemplazo de las otras especies de homínidos previamente

establecidas allí

Posibilidad de hibridación con esas otras especies (bajo porcentaje)

Se descarta una teoría multirregional

Bases de datos:
• ADN mitocondrial
• cromosoma Y
• microsatélites
• gen del cromosoma X
de lo que conocemos por ahora…. • compilación de polimorfismos clásicos (120 loci)
35
• SNPs 36
• genoma completo

9
 Contexto: divergencia entre humanos y chimpancés
King y Wilson (1975)
• similitud de 99% a nivel aminoacídico en proteínas
• estimada por electroforesis de proteínas
• ampliamente confirmada por estudios de ADN
• sugerencia de diferencias en “genes reguladores”
Estudios más recientes indican valores algo menores a nivel de
ADN (96-98%).
Patrones de expresión diferenciales
en cortex cerebral
• unos 10.000 genes comparados en humano, chimpancé y macaco
• 163 muestran diferencias de expresión entre humanos y chimpancés
• 91 muestran cambios exclusivos en humanos, ~90% evidencian
aumentos en su expresión (hígado y corazón son más similares)

Pääbo y cols (2001)

• diferencias en patrones de expresión génica

• en particular en sist. nervioso
• evidenciada con microarreglos y estimaciones de ARNm
Aumentos de expresión Reducción de expresión
37
Cáceres et al. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 13030-13035 38

Comparaciones genómicas: Divergencia genética entre humanos y

principales resultados parientes cercanos: Fox2P

• 7645 genes (humano, chimpancé, ratón) Cambios sinónimos y no sinónimos

¿Selección positiva?
• Se buscan genes con dN/dS>1
• Principales categorías de genes con evidencia de Posible evento de sel.
selección positiva (1524 en humanos y 1538 en chimp.): positiva por encima de
– Olfacción efecto de expansión
– Metabolismo aminoacídico demográfica
– Genes del desarrollo
– Audición y vocalización

relación dN/dS aumenta significativamente en linaje humano (P<0.001)

Clark et al. (2003) Science 302, 1960-1963
39 40
Enard et al. (2002) Nature 418, 869-872

10
 Algunas diferencias entre Síntesis (y comentarios)

chimpancés y humanos • el estudio de la evolución humana ha avanzado en forma

sustancial
• tanto el registro fósil como la evidencia molecular se han
ampliado sustancialmente desde la década de 1960
• el acervo genético humano es producto de su historia
• el estudio del genoma humano y su diversidad
• representa enormes desafíos y oportunidades
• se nutre de los análisis genético-poblacionales
en particular y evolutivos en general
• la divergencia de base provee una referencia para
estudios de divergencia en genes específicos de interés
• los “genes reguladores” de King y Wilson eran una
conjetura; ahora son un enorme problema a nuestro
Carroll (2003) Nature 422, 849-857 alcance (actualmente existe un debate sobre su
41 importancia relativa en base a secuencias genómicas) 42

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