La película se trata del Sacerdote español Gabriel, quien
trata de establecer una misión en la jungla cerca de las catataras de Iguazú para convertir a los guaraníes al cristianismo. Gabriel también logra convertir a Rodrigo Mendoza, quien era comerciante de esclavos y mató a su hermano por un amor no correspondido, el percibe la reducción jesuita como un santuario, el Sacerdote y los guaraníes le han enseñado una manera de hacer penitencia.
Rodrigo y Gabriel tratan de defender a la comunidad guaraní
contra los portugueses, Gabriel sin más armas que su fe y Rodrigo con la ayuda de su entrenamiento militar. La misión que estaba bajo la protección española ahora está en manos de los portugueses quienes están decididos a esclavizar a los guaraníes. Además los jesuitas reciben una orden del emisario papal, de retirarse de este territorio.
Termina con el dolor humano de los guaraníes, su inocencia y
belleza. Uno vez que los pocos defensores de los guaraníes, pagan con su vida para defender a su comunidad jesuita.