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TELEDETECCIÓN (HTTPS://GEOINNOVA.ORG/BLOG-TERRITORIO/SECCION/TELEDETECCION/)
Una semana más volvemos con un nuevo ejemplo sobre las múltiples posibilidades que nos ofrece R
para la realización de análisis espacial automatizado, en este caso sobre el cálculo de tasseled cap con
imágenes Sentinel-2.
De un tiempo a esta parte, se ha hecho muy común, por ejemplo, el uso del Índice de vegetación de
diferencia normalizada, más conocido como NDVI, aunque se viene utilizando desde el año 1973. Este
índice es el más extendido y pone en relación los canales infrarrojo cercano (IRC) y rojo (R) para darnos
información sobre el vigor de la vegetación, independientemente de la cantidad de cosecha o la calidad
como en algunas ocasiones se vende.
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31/7/23, 00:04 Cálculo de Tasseled Cap para imágenes Sentinel-2 con R - Geoinnova
El índice NDVI se basa en operaciones algebraicas realizadas sobre sólo dos bandas espectrales, la
correspondiente a R e IRC. Sin embargo, Sentinel-2 es capaz de detectar información en 13 bandas, que
también contienen información de interés en el estudio de las cubiertas vegetales y que permiten
obtener más información.
Tasseled Cap
Kauth, R. J. and Thomas, G. S. (1976) pensaron en una transformación de la información contenida en
las bandas que generase nuevos ejes que maximizasen la información contenida para utilizarla,
inicialmente, en el campo de la agricultura. Se refirieron a dicha transformación como “Tasseled Cap”
(TC).
Vamos a crear una lista de todas las rutas que apuntan a las bandas disponibles de nuestra imagen a
través de la función list.files(). Indicaremos nuestra ruta a la carpeta descargada con los datos Sentinel
como path.
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Vamos a definir una búsqueda a través del patrón de caracteres “jp2”, a través del parámetro pattern
para que solamente se seleccionen los archivos con esa extensión. Vamos a preservar la ruta completa al
archivo a través del parámetro full.names = TRUE y vamos a indicar que realice una búsqueda recursiva
en las subcarpetas de nuestra ruta inicial con recursive = TRUE.
El objeto jp2_files va a contener las bandas de nuestra imagen. Sobre este objeto, que solamente
contiene la ruta a cada una de las bandas, vamos a utilizar la función raster() para leer la imagen en
formato raster. Para ello, debemos cargar previamente la librería raster:
library(raster)
Vamos a ayudarnos de la función subset() y grepl() para seleccionar la ruta a la banda específica que en
este caso contiene la cadena de texto “B02” y que corresponde con la banda del Azul. Y sobre esta
selección aplicaremos la función raster().
plot(B02)
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Vamos a repetir este procedimiento con cada una de las bandas que vayamos a utilizar de ahora en
adelante.
Para calcular nuestros Tasselled Cap, vamos a utilizar distintas bandas, en algunos casos, con distinta
resolución espacial. En ese caso debemos utilizar la función aggregate() o disaggregate() para convertir
nuestras bandas a una resolución mayor o menor, pero siempre común para poder operar nuestra
matriz de datos celda por celda. Una vez obtenida la resolución común para todas las capas vamos a
calcular nuestro Tasselled Cap con las siguientes fórmulas:
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Los coeficientes Tasselled Cap utilizados han sido obtenidos para datos de reflectancia Sentinel-2 y
combinación de seis bandas (azul, verde, rojo, NIR, SWIR1 y SWIR2). Los coeficientes obtenidos han sido
previamente comparados y validados con datos de Landsat-8 y MODIS (Shi y Xu, 2019).
Vamos a recordar de nuevo que estas ecuaciones son específicas para Sentinel-2.
Finalmente, vamos a crear un objeto ráster multibanda con la función stack() en el que vamos a incluir
las tres bandas de nuestro Tasselled Cap. Aplicaremos la función plot() para devolver el resultado de
nuestra composición multibanda Tasselled Cap (brightness – greeness – wetness).
Esta es sólo una pequeña muestra de la multitud de aplicaciones que tiene R para el trabajo con
imágenes satélite y Sistemas de Información Geográfica. No olvides echar un vistazo a los cursos que
impartimos en colaboración con nuestros amigos de RemOT Technologies que profundizan en el uso de
R:
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Bibliografía:
RemOT Technologies
RemOT Technologies es una empresa colaboradora de Geoinnova, especialista en
desarrollo de aplicaciones GIS para la web, cartografía y análisis espaciales
automatizados. Desarrolla visores web cartográficos, aplicaciones basadas en geolocalización y plugins y
personalizaciones de QGIS para resolver problemas de distintos ámbitos, como por ejemplo la gestión de
parcelas o la gestión de redes. RemOT ya ha trabajado en varios proyectos de desarrollo de la mano de
Geoinnova y, además, también ha participado, entre otros proyectos como en el desarrollo del Atlas
Nacional de España. Ha sido reconocida como una de las 100 mejores empresas geoespaciales del mundo
en el año 2019 por Geoawesomeness, una de las 50 Startup españolas de futuro por la revista
Emprendedores y posee el sello Pyme Innovadora del Ministerio de Ciencia Innovación y Universidades. En
la parte dedicada a formación, Lucía Martínez, Marcos Gimeno y Miquel Febrer, imparten diversos cursos en
la plataforma de Geoinnova.
Comentarios
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31/7/23, 00:04 Cálculo de Tasseled Cap para imágenes Sentinel-2 con R - Geoinnova
Hola,
Al calcular las componentes SBI GVI y WET se utilizan coeficientes con 5 decimales. Parece que el último
decimal sobra. Posiblemente este error se deba a la fuente de donde se extrajo la información:
https://www.indexdatabase.de/db/i-single.php?id=91 (https://www.indexdatabase.de/db/i-single.php?
id=91) El último número corresponde a la banda de Sentinel-2 que se debe utilizar, no es un dígito
propio del coeficiente.
Saludos,
S.M.
Responder
Hola Sergio,
Tienes razón, hay un error en la redacción del artículo y al copiar los valores se pasó eliminar esos
dígitos. Procedemos a corregirlo.
En cuanto a la segunda cuestión, decidimos seguir el planteamiento de
https://www.indexdatabase.de (https://www.indexdatabase.de) ya que el algoritmo está calculado
https://geoinnova.org/blog-territorio/calculo-de-tasseled-cap-para-imagenes-sentinel-2-con-r/ 7/9
31/7/23, 00:04 Cálculo de Tasseled Cap para imágenes Sentinel-2 con R - Geoinnova
para Sentinel-2, y decidimos no alterar la fórmula dada. No obstante, es una buena cuestión y en
este artículo utilizan la banda 11
(https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0303243418309462
(https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0303243418309462)).
Muchas gracias por tu aporte.
Responder
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