Modelo para la estimación de las propiedades del suelo a través de Sensado

Multiespectral usando técnicas de Aprendizaje de Máquina.

Andrés Camilo Ángel Marín

Julián David Oviedo Pasuy

PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA

FACULTAD DE INGENIERÍA
DEPARTAMENTO DE ELECTRÓNICA
BOGOTÁ D.C. 2022
Modelo para la estimación de las propiedades del suelo a través de Sensado
Multiespectral usando técnicas de Aprendizaje de Máquina.

AUTORES:

Andrés Camilo Ángel Marín

Julián David Oviedo Pasuy

Director:
Francisco Carlos Calderón Bocanegra. PhD.

Codirector y Cliente:
César Augusto Vargas García. PhD.

Trabajo de grado presentado para optar al título de:

Ingeniero Electrónico

PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA

FACULTAD DE INGENIERÍA
DEPARTAMENTO DE ELECTRÓNICA
BOGOTÁ D.C. 2022
 Agradecimientos
Camilo Ángel: Quiero agradecer por medio de este trabajo de grado de manera especial a mis padres
Gustavo Ángel y Mónica Marín, a mi hermano David Ángel, a mi abuela Saris, mis tías, tíos, primos, primas,
y a mi abuelo Luis Ernesto que falleció este año y desde el cielo está viendo mi crecimiento personal y
profesional, este triunfo va para mi familia, mis amigos y compañeros, a aquellas personas que conocí
recientemente y todos a quienes conozco de tiempo atrás en la universidad, todos de alguna forma que han
presenciado mi crecimiento en los diferentes ámbitos: el personal, profesional y en uno como buen
compañero, amigo y colega, todos los presentes me han motivado a dar lo mejor de mí cada día, cada espacio
y cada momento porque son aquellos que me hacen afianzar todo lo que he logrado, son aquellos con quienes
he aprendido la importancia que para ser un buen ingeniero hay que ser una buena persona, bajo esta premisa
resalto que esto hace que uno como líder a futuro se encargue de potencializar su equipo, su gente y sobre
todo por brindar soluciones de tipo tecnológica e innovadora, porque gracias a ellos aprendí dos cosas
valiosas para mi vida profesional y personal, la primera que para esquematizar todo debo separar lo
importante de lo urgente, además de ello como segunda cosa que cada uno de ellos son mi impulso y motor
en todo lo que llevo de la carrera, porque gracias a todos ellos y cada circunstancia vivida, a través de este
trabajo de grado estamos aplicando y plasmando todo lo aprendido en la carrera, también agradezco a nuestro
director el Ingeniero Francisco Calderón y a nuestro cliente Cesar Vargas quienes contribuyeron en el proceso
para culminar este proceso alcanzando cada uno de los objetivos. Agradezco a la Universidad Javeriana,
porque desde el primer instante me permitió conocer grandes personas, en ello a estas personas que son mis
amigos, compañeros y futuros colegas quienes comparten conmigo esta travesía que consiste en ser grandes
Ingenieros Electrónicos para darnos a conocer a nivel nacional e Internacional, bajo estos principios de la
honestidad, equidad, respeto, compañerismo, liderazgo y perseverancia.

Julián Oviedo: A Dios y a mi alma máter, la Pontificia Universidad Javeriana, un lugar de formación
integral que me permitió reconocer el valor y sentido del conocimiento. A mi director de tesis Ing. Francisco
Calderón, al investigador César Vargas por ser nuestro cliente y en su nombre a Agrosavia por brindarnos
los espacios y las muestras para realizar nuestro proyecto de grado.
A todos los que estuvieron presentes en esta etapa e hicieron posible continuar y culminar esta meta, en
especial a mis amigos, compañeros y profesores quienes me inspiraron pasión por conocer, experimentar y
aportar soluciones a la sociedad.
 Dedicatoria
Camilo Ángel: Dedicó esta tesis de forma muy especial a mi familia, así como también agradezco a Dios,
a la vida y a la misma familia, mis compañeros de Carrera y amigos que he tenido en la Javeriana por formar
parte de este momento tan gratificante, es un momento donde muestro mi gratitud por ese proceso en el que
me apoyaron, me guiaron en esta carrera profesional llena de grandes retos y oportunidades, por la
preparación que conlleva, la fundamentación, porque gracias a todo ello, me motivaron a dar lo mejor de mí,
a conocerme más, a desarrollar nuevas habilidades, destrezas sobre todo a ver un poco más allá de lo que
tengo hoy en el presente, también agradezco a nuestro director de tesis por confiar en nosotros, en la
realización de un proyecto y adecuar mejoras en medio de ese desarrollo, por las asesorías y el rumbo sobre
el cual permitió llevar este año de trabajo, de igual manera resaltar que todo estos resultados y esta
investigación la dedicó a todas las personas que me vieron crecer en lo personal, en lo profesional, y en todo
sentido, porque gracias a todos los presentes puedo establecer nuevas metas para los próximos años de mi
vida profesional, incluso agradezco por tener la posibilidad de haber influido en el crecimiento de muchas
personas que estuvieron alrededor mío, así como también dedicó a quienes influyeron en mi vida personal y
profesional, generando grandes cambios positivos, de igual manera con esto quiero mostrar que todos los
sueños tienen grandes retos y que no hay imposibles, ni competencias, más que la competencia con nosotros
mismos por perseguir un sueño, y en este caso el mío es de ser un gran Ingeniero Electrónico, de ser un líder
que escucha, atiende, adapta y sobre todo que es capaz de llevar a su gente a lo más alto de la cima.

Julián Oviedo: A toda mi familia, en especial a quién construyo con amor la valentía para enfrentar cada
desafío, a ti Mamá, y a mi tía Laura (QEPD) que estaría orgullosa de saber que culminé una etapa desafiante
con éxito y con la sonrisa que me dejó para compartir con el mundo.
A mis hermanos Carlos y Laura Sofía, que aprenden y desafían al mundo con el amor que papá Guillermo
nos brinda con su ejemplo.
A mi mejor amigo y consejero, mi primo Jonathan.
A todos los que son parte de mi corazón y dejan como posdata una sonrisa.
A mi pueblo: Funes-Nariño.
Y donde te encuentres, a ti papá JHOP (QEPD).
Resumen
En Colombia varias organizaciones han contribuido en el crecimiento del sector agropecuario, entre ellas
Agrosavia que fue creada en 1993 con la finalidad de brindar un conocimiento y desarrollo tecnológico,
buscando esa mejora de calidad de vida de productor y consumidor, brindando soluciones de tipo sostenible
y accesible basados en tecnologías como la espectrometría de rango visible e infrarrojo cercano (VIS/NIRS).
[1]. La gestión del campo a través de tecnologías, sensores, radares y satélites para evaluar la calidad de
cosecha y factores climáticos es comúnmente conocido como la Agricultura de Precisión.
El análisis de suelos evalúa las condiciones de producción en cultivos y otras características, como la
salinidad, toxicidad y acidez excesiva. El espectro visible-infrarrojo cercano (VIS-NIR), brinda información
relacionada con componentes orgánicos e inorgánicos del suelo; la medida de la absorbancia sobre el espectro
en rango visible da como resultado medidas de: color de suelo, materia orgánica, pH (Ben-Dor et al., 1999)
y minerales como Hierro, principalmente hematita y goethita; también de minerales importantes en el estado
de fertilidad del suelo como el Calcio (Ca), Magnesio (Mg) y Potasio (K) (Sherman y Waite, 1985). Las
porciones del infrarrojo cercano (NIR) del espectro electromagnético están asociadas con el estiramiento y
la flexión de los grupos NH, OH y CH (Dalal y Henry, 1986; Clark, 1999; Viscarra Rossel y Behrens, 2010).

Al usar el sensor multiespectral de bajo costo (AS7341 de ams OSRAM) se realiza la adquisición de la
firma espectral para 90 muestras de parcelas agrícolas de diversos orígenes y cultivos; que han sido
previamente procesados en los laboratorios de Agrosavia usando técnicas de espectroscopia Vis-NIRS y para
los cuales se ha realizado el análisis de fertilidad en el laboratorio de química analítica de esta misma
institución. El preprocesamiento y análisis de los datos adquiridos usando algoritmos de aprendizaje de
máquina permitieron estimar variables por medio técnicas de regresión y clasificación que, tras validarse con
los resultados del análisis del laboratorio de química analítica de Agrosavia, ofrecieron predicciones en
clasificación para los rangos específicos de cada variable con una precisión y rendimiento mayor al 82 %
para pH, 74% para materia orgánica, 54,8% para Potasio (K), 56% para Calcio (Ca) y 56,2% para Magnesio
(Mg). A pesar de las limitaciones generadas por la cantidad de muestras, el control sobre las variables
externas que pudieron haber influido en la adquisición de la firma espectral, el rango y la resolución del
sensor, se pudo obtener un rendimiento comparable con los resultados obtenidos en [1], especialmente para
la estimación del pH usando clasificación.

Palabras Clave: Espectrometría, espectro visible-infrarrojo cercano (VIS-NIR), Agricultura de

Precisión, absorbancia, firma espectral, Análisis de Suelos, Aprendizaje de Maquina, fertilidad de suelo,
sensor multiespectral.
Abstract
In Colombia diverse organizations have contributed with the growing of agricultural sector, both of them
Agrosavia, that was created in 1993, with the purpose to bring technological development and knowledge,
searching this improvement of life´s quality of producer & consumer, allowing sustainable and accessible
solutions, that permit to based in solutions of spectrometry of near-infrared(NIRS). [1]. That interact with a
manage of countryside through technologies, sensors, radars and satellites, moreover of evaluate the quality
and climatic factors commonly known like Precision Farming. In other hand, the soil analysis evaluates the
production conditions in farming and another characteristic, such as salinity, toxicity and excessive acidity.
To Reference the Visible and Near-Infrared spectrum(VIS-NIR), that brings information related with organic
and inorganic components of soil, in that it’s talked about of absorbance in the spectrum in visible range,
measure of soil color, Organic Matter(Ben-Dor et al., 1999) and minerals like as iron, principally hematite
and goethite; also, of principal minerals in fertility status of soil like Ca, Mg, K (Sherman y Waite, 1985).
The portions of Near-Infrared(NIR) of electromagnetic spectrum are associated with the strength and flexion
of groups NH, OH y CH (Dalal y Henry, 1986; Clark, 1999; Viscarra Rossel y Behrens, 2010).

Due to the previously founded, it’s implemented a multispectral sensor AS7341 – ams OSRAM) of low
cost to estimate soil variables with Machine Learning Techniques, that it’s used such as an alternative to
decrease the costs and increasing the availability in the country, furthermore it’s acquired the spectral sign of
90 samples of different soil types, treated, analyzed and provided by Agrosavia, that resumes in prediction
results for classification in specific ranges split a precision for pH 82%, 74%: OM, 54.8% potassium,
Calcium: 56% and Magnesium: 56.2%. The limitations are caused by the control of extern variable and
affections in the spectral sign acquisition, ranges, resolution of sensor, etc. cause that performance is
comparable with the obtained results in [1], specifically for pH.

Keywords: Spectrometry, spectrum of Visible-Near Infrared (VIS-NIR), Precision Agriculture,

absorbance, spectral sign, Soil Analysis, Machine Learning, Soil Fertility and Multispectral Sensor.
Contenido
1. Introducción ................................................................................................................................................... 13
1.1 Problemática ................................................................................................................................................... 14
1.2 Objetivos ......................................................................................................................................................... 15
1.2.1 Objetivo General ................................................................................................................................. 15
1.2.2 Objetivos Específicos .......................................................................................................................... 15
1.3 Requerimientos............................................................................................................................................... 15
2. Concepción...................................................................................................................................................... 16
2.1 Estado del arte ................................................................................................................................................ 16
2.2 Marco Teórico ................................................................................................................................................ 19
2.2.1 Reflexión .............................................................................................................................................. 19
2.2.2 Refracción ............................................................................................................................................ 19
2.2.3 Espectro Electromagnético ................................................................................................................. 20
2.2.4 ¿Qué es un espectrofotómetro? .......................................................................................................... 20
2.2.5 Transmitancia y absorbancia ............................................................................................................. 21
2.2.6 Aprendizaje de Máquina .................................................................................................................... 21
2.2.7 Aprendizaje supervisado .................................................................................................................... 22
2.2.8 Aprendizaje No Supervisado .............................................................................................................. 22
2.2.9 Regresión.............................................................................................................................................. 22
2.2.10 Coeficiente de Determinación ............................................................................................................ 24
2.2.11 Reducción Dimensional ...................................................................................................................... 25
2.2.12 Regresión lineal Múltiple .................................................................................................................... 26
2.2.13 SVR....................................................................................................................................................... 27
2.2.14 Maquina Soporte Vector “Support Vector Machine” ....................................................................... 28
2.2.15 Perceptrón Multicapa ......................................................................................................................... 29
2.2.16 KNN – “K Nearest Neighbors”............................................................................................................ 29
2.2.17 Técnica de Conjunto: Ensemble ......................................................................................................... 30
2.2.18 Matriz de Confusión – Sensibilidad – Especificidad – Precisión - Exactitud “Accuracy” -
Métricas de F1 ..................................................................................................................................................... 31
2.2.19 Regresión Logística ............................................................................................................................. 33
2.2.20 Discriminante Lineal ........................................................................................................................... 33
2.2.21 Árboles de Decisión ............................................................................................................................. 34
2.2.22 Técnicas de Optimización Bayesianas ............................................................................................... 34
2.2.23 Regularización Ridge(L2) ................................................................................................................... 34
2.2.24 Interpolación........................................................................................................................................ 35
 2.2.25 Escalización.......................................................................................................................................... 36
3. Diseño .............................................................................................................................................................. 36
3.1 Diagrama de Bloques ..................................................................................................................................... 36
3.2 Estándares en Ingeniería ............................................................................................................................... 38
3.3 Validación del sistema ................................................................................................................................... 38
3.4 Estrategia y Mapeo de selección de modelos de regresión usando la herramienta del paquete de Matlab
Regression Learner App ......................................................................................................................................... 39
3.5 Selección de componentes .............................................................................................................................. 40
3.5.1 Sensor AS7341 ..................................................................................................................................... 40
3.5.2 Fuente de Luz ...................................................................................................................................... 41
3.5.3 Microcontrolador Raspberry pi Pico ................................................................................................ 42
3.6 Pruebas de Concepto ..................................................................................................................................... 42
3.6.1 PH ......................................................................................................................................................... 42
3.6.2 OM ........................................................................................................................................................ 45
3.6.3 Ca .......................................................................................................................................................... 47
3.7 Pruebas con Conjunto de datos para pH ..................................................................................................... 48
4. Implementación .............................................................................................................................................. 50
4.1 Caracterización .............................................................................................................................................. 50
4.2 Interfaz de Usuario ........................................................................................................................................ 58
4.3 Empaque ......................................................................................................................................................... 59
4.4 Protocolo de Pruebas ..................................................................................................................................... 62
5. Operación y Resultados ................................................................................................................................. 63
5.1 Análisis de Resultados ................................................................................................................................... 63
5.2 Análisis de Resultados Por Análisis de Componentes Principales (PCA) ................................................. 77
5.3 Resultados de Matlab para modelos de Regresión sin y con PCA. ............................................................ 78
5.4 Resultados de Clasificación usando Classification Learner ....................................................................... 89
5.5 Análisis de Resultados ................................................................................................................................... 92
6. Conclusiones y Trabajos Futuros ................................................................................................................. 94
6.1 Recomendaciones para trabajos futuros ...................................................................................................... 95
7. Referencias Bibliográficas ............................................................................................................................. 96
Lista de Ilustraciones
Ilustración 1. Reflexión de ondas. Tomado de [7] .................................................................................................... 19
Ilustración 2. Refracción de ondas. Tomado de [7] .................................................................................................. 19
Ilustración 3. Matriz de Covarianza.......................................................................................................................... 25
Ilustración 4. Support Vector Regresor. ................................................................................................................... 27
Ilustración 5. Representación de función Kernel de forma no lineal. [28] ............................................................. 28
Ilustración 6. Gráfica Representativa de Maquina Soporte Vectorial. .................................................................. 28
Ilustración 7. Perceptrón Multicapa ......................................................................................................................... 29
Ilustración 8. K - Vecinos Más Cercanos, Clasificación .......................................................................................... 30
Ilustración 9. Matriz de Confusión Binaria .............................................................................................................. 31
Ilustración 10. Diagrama de bloques sistema propuesto Fuente: Propia de los Autores...................................... 37
Ilustración 11. Diagrama de Flujo de Modelos de Regresión. ................................................................................ 39
Ilustración 12. Diagrama de Flujo de Modelos de Clasificación ............................................................................. 40
Ilustración 13. Responsividad de Sensor AS7341 ..................................................................................................... 41
Ilustración 14. Medición de PH, Graficas de Conjunto de Datos original y de predicción ................................. 42
Ilustración 15. Resultados de Predicción de Redes Neuronales Artificiales, Error residual, Grafica de Test,
Predicción Gaussiana .................................................................................................................................................. 44
Ilustración 16. Medición de Materia Orgánica, Graficas de Conjunto de Datos original y de predicción ......... 45
Ilustración 17. Gráfica de Predicción de Regresión lineal, Test de Predicción de Materia Orgánica, Error de
Regresión Gaussiana de Materia Orgánica .............................................................................................................. 46
Ilustración 18. Grafica de Predicción de Ca y Conjunto de Datos Original .......................................................... 47
Ilustración 19. Grafica de Predicción de Regresión lineal, Test de Predicción de Ca, Error de Regresión
Gaussiana de Ca .......................................................................................................................................................... 48
Ilustración 20. Resultados Grafico-numéricos de SVR, Regresión lineal múltiple y MLP .................................. 49
Ilustración 21. Gráfica de Intensidad vs Longitud de onda para caracterización del led de sensor AS7341 ..... 50
Ilustración 22. Grafica de Intensidad vs Longitud de onda para caracterización del led de sensor AS7341 sin
acetato. ......................................................................................................................................................................... 51
Ilustración 23. Tabla de Datos y Grafica de Intensidad vs Longitud de Onda, para color azul y anaranjado. . 51
Ilustración 24. Tabla de Datos y Grafica de Intensidad vs Longitud de Onda, para color azul y anaranjado en
medición sin acetato. ................................................................................................................................................... 52
Ilustración 25. Medición y caracterización de luz led de sensor AS7341 al someterlo con acetato, para
longitudes de onda entre 400 y 825nm ...................................................................................................................... 52
Ilustración 26. Caracterización de luz de sensor AS7341 sobre lamina de Acetato para longitudes de onda de
448 a 530nm. ................................................................................................................................................................ 53
Ilustración 27. Gráfica de Intensidad vs Longitud de onda para caracterización del led de sensor AS7341
suministrando caja de Petri........................................................................................................................................ 53
Ilustración 28. Tabla de Datos y Grafica de Intensidad vs Longitud de Onda, para color violeta y verde. ....... 54
Ilustración 29. Evaluación de Rango de Caracterización de luz led del sensor AS7341 ....................................... 54
Ilustración 30. Gráfica Espectral de Intensidad vs Longitud de Onda para caracterización de sensor AS7341
sin caja de Petri. .......................................................................................................................................................... 55
Ilustración 31. Grafica de Absorbancia con caja de Petri, para medición de Espectro. ..................................... 55
Ilustración 32. Absorbancia de caja de Petri en conjunto con luz led de sensor AS7341, medición entre colores
violeta al rojo, longitudes de onda de 425 a 608 nm. ................................................................................................ 56
Ilustración 33. Medición de Absorbancia en la caja de Petri, para análisis de Espectro por medio de led de
sensor AS7341.............................................................................................................................................................. 56
Ilustración 34. Medición de Absorbancia en lámina de Acetato, para análisis de Espectro por medio de led de
sensor AS7341.............................................................................................................................................................. 57
Ilustración 35. Medición de Absorbancia en lámina de Acetato, para análisis de Espectro por medio de led de
sensor AS7341, evaluando espectros con longitud de onda de 428 a 700nm. ........................................................ 57
Ilustración 36. Medición de Rango de Absorbancia para caja de Petri en longitudes de onda de 425 a 608nm.
....................................................................................................................................................................................... 58
Ilustración 37. Caracterización de luz led del sensor AS7341 ................................................................................. 58
Ilustración 38.Interfaz Gráfica de Usuario ............................................................................................................... 59
Ilustración 39. Estructura Interna - Diseño de caja empaque de Raspberry Pi Pico ........................................... 59
Ilustración 40. Diseño con Caja de Petri, caja Protectora, carcasa con tapa, Caja de Raspberry pi Pico,
ensamblado. ................................................................................................................................................................. 60
Ilustración 41. Diseño de carcasa estructura interna, soporte par caja de Petri y muestra................................. 60
Ilustración 42. Estructura de Diseño Parte Superior............................................................................................... 60
Ilustración 43. Estructura Parte Frontal .................................................................................................................. 61
Ilustración 44. Diseño Conjunto Separado, Ranura Caja de Petri, Case, Carcasa con Tapa y Caja de
Raspberry pi Pico ........................................................................................................................................................ 61
Ilustración 45. Diseño de tapa .................................................................................................................................... 61
Ilustración 46. Tendencia de ruido en espectro de muestra 1 ................................................................................. 63
Ilustración 47. Cuantización y análisis de tendencia y linealidad en espectro muestra 1..................................... 63
Ilustración 48. Histograma en muestra 1 .................................................................................................................. 64
Ilustración 49. Espectro según promedio para muestra 2 ....................................................................................... 65
Ilustración 50. Tendencia de ruido en espectro de muestra 2 ................................................................................. 65
Ilustración 51. Diagrama de Cajas por bandas de espectro (muestra 1) ............................................................... 65
Ilustración 52. Gráfica de Maquina Soporte Vectorial Optimizable sin Escalizar. .............................................. 66
Ilustración 53. Gráfica de Maquina Soporte Vectorial de tipo Cúbico .................................................................. 67
Ilustración 54. Gráfica de Proceso de Regresión Gaussiana, ajuste de funciones, Kernel y desviación estándar
....................................................................................................................................................................................... 67
Ilustración 55. Configuración de SVM tipo Cúbico, con errores graficados. ........................................................ 68
Ilustración 56. Grafica de Datos Verdaderos contra predichos para SVM Cúbico .............................................. 68
Ilustración 57. Gráfica de datos verdaderos, Predichos y errores .......................................................................... 68
Ilustración 58.Asignación de Etiquetas y Características para análisis de PH. .................................................... 69
Ilustración 59.Implementación de SVR por medio de Validación cruzada ........................................................... 69
Ilustración 60.Gráfica de SVR de datos de pH Predicho vs Validación. ............................................................... 70
Ilustración 61. Datos para Gráfica de SVR obtenidos con Matlab......................................................................... 70
Ilustración 62.Datos para Gráfica de SVR ............................................................................................................... 71
Ilustración 63. Grafica de SVR Predicho vs SVR Actual ....................................................................................... 71
Ilustración 64.Grafica de SVR Test ............................................................................................................................... 72
Ilustración 65. Grafica de SVR Test de 0.54 ............................................................................................................. 72
Ilustración 66. Datos obtenidos por Regression Learner con precisión de 0.64. ................................................... 73
Ilustración 67. Grafica obtenida por Regression Learner con precisión de 0.64. ................................................. 73
Ilustración 68. Grafica de SVR Test de 0.69 ............................................................................................................. 74
Ilustración 69. Grafica de SVR Test .......................................................................................................................... 74
Ilustración 70. Datos para Gráfica de SVR con resultado de 0.82 ......................................................................... 75
Ilustración 71. Grafica de SVR Test .......................................................................................................................... 75
Ilustración 72. Grafica de SVR Test de 0.82 ................................................................................................................. 76
Ilustración 73. Código de SVR con precisión de 0.82 .............................................................................................. 76
Ilustración 74. Análisis por PCA para Cantidad de componentes con 99% de varianza explicada. .................. 77
Ilustración 75. Obtención de Grafica de Variance Ratio vs Number of Components .......................................... 78
Ilustración 76. Gráfica de Predicción de modelo con Resultado de coeficiente de Correlación .......................... 78
Ilustración 77. Resultados de Regresión Proceso Gaussiano para Test ................................................................. 79
Ilustración 78. Medición GPR (test) con Reducción dimensional (PCA) ............................................................... 79
Ilustración 79. Conjunto de Datos para Predictores de pH. ................................................................................... 80
Ilustración 80. Métricas de Coeficientes de Correlación para Validación sin PCA para pH. ............................. 80
Ilustración 81. Resultados de Procesos Gaussianos por PCA ................................................................................. 81
Ilustración 83. Resultado de Regresión Lineal por PCA ........................................................................................ 82
Ilustración 85. Registro de modelos para Potasio sin PCA .................................................................................... 82
Ilustración 86. Modelos de regresión aplicando Reducción de Dimensionalidad (PCA) ...................................... 83
Ilustración 87. Pruebas sin PCA para modelos de Regresión para el Potasio. ...................................................... 83
Ilustración 88. Prueba de Modelos de Regresión sin PCA para Materia Orgánica ............................................. 84
Ilustración 89. Obtención de modelos aplicando PCA para Validación. ............................................................... 84
Ilustración 90. Obtención de modelos aplicando PCA para Test. .......................................................................... 85
Ilustración 91. Obtención de modelos sin PCA para Validación para Potasio...................................................... 85
Ilustración 92. Obtención de modelos sin PCA para Test. ...................................................................................... 86
Ilustración 93. Obtención de modelos con PCA para Validación. .......................................................................... 86
Ilustración 94. Obtención de modelos con PCA para Test. ..................................................................................... 87
Ilustración 95. Determinación del mejor número de grupos (k) usando coeficiente de silueta ........................... 88
Lista de Tablas
Tabla 1. Medición de PCA y Varianza. ..................................................................................................................... 43
Tabla 2. evaluación de Modelos sin PCA. ................................................................................................................. 44
Tabla 3.Medición de PCA y Varianza para Materia Orgánica .............................................................................. 45
Tabla 4.Datos de Medición sin PCA para Materia Orgánica ................................................................................. 46
Tabla 5. Datos obtenidos para cada Método de Regresión del Calcio.................................................................... 47
Tabla 6. Datos de Medición sin PCA para el Calcio ............................................................................................... 48
Tabla 7. Bandas Espectrales para Sensor AS7341 ................................................................................................... 77
Tabla 8. Primer Derivada definida por Bandas ....................................................................................................... 77
Tabla 9. Datos de Segunda Derivada por Bandas .................................................................................................... 77
Tabla 10. Tabla de Métricas de Regresión con Validación cruzada, analizando por PCA y sin PCA ................ 78
Tabla 11. Modelos de Redes Neuronales para validación y Test ............................................................................ 87
Tabla 12. Métricas de Regresión usando Matlab de los diferentes modelos para Materia Orgánica y pH ........ 87
Tabla 13. Tabla de propiedades y Rangos ................................................................................................................ 89
Tabla 14. Métricas Clasificación pH (Validación) ................................................................................................... 89
Tabla 15. Métricas Clasificación pH (Test) ............................................................................................................. 90
Tabla 16. Métricas Clasificación Materia Orgánica (Validación) .......................................................................... 90
Tabla 17. Métricas Clasificación Materia Orgánica (Test) ..................................................................................... 90
Tabla 18. Métricas Clasificación Potasio (K) (Validación) ..................................................................................... 91
Tabla 19. Métricas Clasificación Calcio (Ca) (Validación) ..................................................................................... 91
Tabla 20. Métricas Clasificación Magnesio (Mg) (Validación) ............................................................................... 91
Capítulo 1
Introducción
El desarrollo de estrategias y técnicas de análisis rápidas y eficientes para la agricultura exige la
implementación de estrategias de medición que permitan realizar manejos agronómicos orientados a
disminuir el costo de producción e impacto negativo ambiental, sin sacrificar el rendimiento y producción.
La estimación de características físicas y químicas del suelo es importante para las funciones y la
productividad, sin embargo, el crecimiento poblacional es el que exige tener alternativas para lograr una
seguridad alimentaria. De igual forma, resaltar el valor de la tecnificación en la producción con el objetivo
de lograr una amplia sostenibilidad es una de las tareas de la agricultura de precisión, encargada de obtener
una mejor gestión, prácticas y tecnologías aplicadas a la estimación de propiedades del suelo, toma de
decisiones en base al estado del cultivo y una mayor rentabilidad en cuanto a tiempo y costos se refiere.

La espectrometría NIRS o en inglés en su acrónimo Near Infrared Reflectance Spectroscopy, se

considerada como una técnica que busca realizar análisis de tipo cuantitativo o cualitativo partiendo de
diferentes parámetros, pues en este caso el eje transversal, son los estudios de suelos para diferentes tipos de
cultivos o terrenos, que permitan evaluar condiciones como pH, Nitrógeno, Carbono, Potasio, Magnesio, y
Fósforo entre otras propiedades importantes. Estas se encuentran correlacionadas con el espectro de
absorbancia a diferentes longitudes de onda, donde se encuentran en diferentes rangos: tanto espectro visible
como el infrarrojo cercano. En ellos se aplica diferentes tipos de modelos estadístico, como regresiones,
clasificaciones entre otros. [2].

En las últimas décadas, la espectroscopía de reflectancia difusa junto con el desarrollo de la quimiometría
representa una herramienta adicional para al análisis convencional de suelos dada su rentabilidad, facilidad
de manejo, rapidez y mínima preparación de muestras. La espectroscopía visible-infrarrojo cercano (Vis-
NIR) proporciona con un solo espectro una gran cantidad de información sobre la composición fisicoquímica
del suelo. La absorción en el rango visible proporciona una medida del color del suelo, materia orgánica
(Ben-Dor et al., 1999) y minerales de hierro (Fe), principalmente hematita y goethita (Sherman y Waite,
1985).

Todo lo relacionado con el agro, resulta en muchos casos algo natural y común, pero adoptarlo a
tecnologías y diferentes recursos implica aplicar un concepto que permite darle una plusvalía entre lo
tecnológico junto con lo agropecuario, este concepto se conoce como la agricultura de precisión, que es aquel
que permite tomar una consecución implementando diferentes dispositivos tecnológicos y electrónicos la
capacidad para evaluar y verificar como es esa calidad de cosecha así como también la influencia directa con
los factores climáticos, ya que este tipo de tecnologías permiten mejorar la calidad de vida de las personas
tanto productoras como consumidoras, buscando soluciones de tipo sostenible y accesible, todo ello por
medio de Espectrometría de Infrarrojo Cercano (NIRS). [1]. Resaltando lo fundamental por medio de los
análisis de Espectrometría se busca por medio de esos datos obtenidos establecer información fundamental
basada en cada una de las muestras de los cultivos, analizando cada una de esas propiedades físicas y
químicas, obtener cada uno de los datos, generar el procesamiento y establecer información útil para el
pequeño productor.

Realizar el análisis de suelos usando este tipo de alternativas al método químico permite establecer cómo
se comportarán diferentes semillas usando un método que no requiere de un compuesto de reactivo químico
pues es un proceso que puede estimar varios análisis en una sola medición, posee una alta repetibilidad,
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reproducibilidad y velocidad, pues permite una mejor optimización, en este tipo de análisis, hay quienes han
podido realizar estimación de aminoácidos, entre los más comunes la Lisina, Treonina y Metionina en
alimentos. [1]

1.1 Problemática
Como alternativa al análisis tradicional por química húmeda, Agrosavia cuenta actualmente con un
escáner con tecnología NIRS, sin embargo, aunque la técnica tradicional tenga una mayor precisión y
exactitud, destruye la muestra por completo, es más demorada y representa mayores costos debido al mayor
requerimiento de sustancias requeridas para su uso [20].

El uso del escáner como solución complementaria es muy innovador, pero se ha vuelto poco accesible
para algunos clientes de Agrosavia, esto hablando del costo elevado que puede generar el uso del dispositivo.
Además, el hecho de tener un solo sensor ha ocasionado una acumulación de muestras en largas filas de
espera debido a los largos tiempos en los cuales se debe realizar este proceso. Todo esto ha generado en
Agrosavia una disminución en el rendimiento de esta técnica, tanto por el número de muestras analizadas
como por el elevado costo de la misma.

El costo en el análisis de cada muestra es de aproximadamente COP 10000, sin embargo, por cada cliente,
se requieren entre 100 y 1000 muestras del suelo, por lo tanto, entre más preciso se quiera hacer el análisis,
más se sube este costo.

La problemática presentada anteriormente permite desarrollar un método relativamente rápido y

económico basado en la reflectancia en las regiones VIS-NIR para la estimación simultánea de varias
propiedades del suelo.

El suelo es un sistema no ideal, es química y mineralógicamente más complejo que los sistemas 'puros'
que a menudo se estudian utilizando procedimientos de laboratorio tradicionales. Los mecanismos de los
procesos del suelo son difíciles de comprender por completo y el vínculo fundamental entre la química del
suelo medida y los atributos o propiedades particulares del suelo puede ser complejo. Los procedimientos
químicos utilizados en la caracterización de suelos pueden, de hecho, complicar aún más la interpretación.

Los procedimientos de extracción pueden cambiar el equilibrio entre las fases sólida y de solución del
suelo y el analito como resultado de las interacciones del extractante en la solución y en la interfase solución-
partícula. Por esta razón, existe una tendencia creciente hacia el desarrollo de técnicas que preserven la
integridad básica del sistema del suelo (Janik et al. Kamrunnahar Islam, Balwant Singh y Alex McBratney).

Actualmente se están desarrollando tecnologías de detección y escaneo para describir y obtener

información más eficiente y económicamente precisa sobre la extensión y la variabilidad de los atributos del
suelo, que afectan el crecimiento y el rendimiento de los cultivos (Viscarra Rossel y McBratney 1998).

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1.2 Objetivos
1.2.1 Objetivo General
Implementar un sensor de bajo costo para estimar variables de suelo por medio de técnicas de Aprendizaje
de Máquina.

1.2.2 Objetivos Específicos

- Adquirir un conjunto de datos que permita el entrenamiento, la validación y prueba de los modelos
de aprendizaje de máquina.
- Realizar y reacondicionar un diseño de hardware que permita disminuir el costo de prototipo basado
en espectroscopia.
- Diseñar un software que permita realizar la estimación de las variables de suelo por medio de por lo
menos tres técnicas de Aprendizaje de Máquina.
- Evaluar la calidad de las predicciones y la eficiencia en cada uno de los modelos para la estimación
de las propiedades del suelo.

1.3 Requerimientos
- Permitir una interacción más cercana con el usuario final reacondicionando el hardware y software
(de manera amigable).
- Emplear una certificación IP50 que mejore y proteja el prototipo a desarrollar.
- Reducir el costo y el tiempo necesario para la estimación de las propiedades en el análisis de suelo,
respecto al dispositivo empleado en Agrosavia (NIRS DS2500).
- Uso de al menos tres métodos de aprendizaje de máquina que permitan estimar las propiedades del
suelo usando el hardware implementado.
- Evaluación del desempeño en las predicciones y la eficiencia en cada modelo para la estimación de
las propiedades del suelo.

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Capítulo 2
Concepción
2.1 Estado del arte
La espectrometría y lo relacionado con imágenes multi o hiper-espectrales han tenido gran influencia
además de una gran acogida en el desarrollo del sector agropecuario, en ello radica la importancia de la
agricultura de precisión que implementa diferentes tecnologías buscando la satisfacción de las necesidades
de los agricultores, puesto que se aplica al análisis de suelos para obtener el estado de sus propiedades físico-
químicas, conocer el terreno donde se desea plantar y a su vez la realización del monitoreo de las diferentes
fases de cultivo.

La finalidad de este estudio es la aplicación de técnicas de aprendizaje de maquina y técnicas de sensado

remoto para estimar el comportamiento del suelo. La adquisición de datos pertinente junto con el
procesamiento permite acelerar y automatizar procesos, en especial cuando se trata de realizar estudios de
estimación de suelo basados en espectroscopía (VIS/NIR). Esta recolección de datos espectrales (Firmas
Espectrales) correlacionados en varios estudios con las propiedades químicas del suelo optimizan los
procesos de predicción permitiendo tomar decisiones más rápidas y precisas que influyen directamente en
los tratamientos pertinentes para cultivos de suelo. Este tipo de alternativas se convierten en una herramienta
costo-efectiva, pues permiten reducir tanto costos como tiempos en los análisis de muestras de suelo.

Con base en lo anterior se detalla que tal medidor de beneficio decrementa cuando se requiere la búsqueda
de un mínimo conjunto de datos, sin embargo, dos características influyen en el desarrollo de estas
alternativas, una de ellas se centra en el avance en la quimiometría, puesto que juega un rol fundamental en
la obtención de un conjunto de datos robusto que luego es usado en encontrar patrones o funciones que
permitan a los modelos de aprendizaje de máquina estimar las condiciones y propiedades del suelo, como
minerales y contenido de materia orgánica, entre otras el nitrógeno, potasio, magnesio, calcio, niveles de
carbono y fósforo, factores primordiales para la evaluación de fertilidad del suelo. La segunda característica
refiere la cantidad de tiempo y volumen de muestras de suelo. Aunque el sensado remoto permite obtener la
información necesaria para evaluar condiciones de suelo por medio técnicas de técnicas de aprendizaje de
máquina, por mencionar algunas: las redes neuronales artificiales, bosque aleatorio “Random Forest”,
Regresión de soporte vectorial (Support Regression Vector “SVR”), se deben implementar diferentes
metodologías y estrategias para la recolección de datos, definición de rangos y clases para las clasificaciones;
sistemas de procesamiento que se encargan de los análisis de técnicas automatizadas para cada una de las
condiciones en los indicadores químicos y biológicos de suelo, de esta forma se correlaciona con los
nutrientes de las plantas para retener elementos químicos o compuestos que pueden ser dañinos para el medio
ambiente o los cultivos, el análisis de niveles de erosión, y la evaluación del PH que controla la
descomposición de materia orgánica, liderando la presencia de fósforo, manganeso, calcio, atributos
químicos que determinan información para proveer todo lo pertinente con la administración de fertilización.
[3]

Otra cuestión importante es resaltar como las técnicas de sensado remoto permiten establecer sistemas de
bajo costo e implementación, que permitan tomar un sistema centrado en el análisis de la absorbancia y
reflectancia en las bandas espectrales visibles 400-680 nm en bandas rojas, y mayores a 850nm en un sistema
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NIR maximizando aspectos que tengan una relación con las propiedades físico-químicas objetivo, así mismo
este tipo de sistemas buscan minimizar los costos de producción, el impacto ambiental y sobre todo contribuir
a maximizar los índices de producción.

En estimación de propiedades de suelo a nivel local se cuentan con 2 retos, el primero es relacionado con
resoluciones espaciales para muestreo e imágenes multiespectrales, analizando cultivos por área [4].
Partiendo de otras técnicas es importante delimitar un espacio que permita tomar la resolución espacial de
para mapear de forma precisa el estudio de texturas, vegetación y reflectancia que se limita al tiempo y
adquisición de imágenes y curvaturas, por ello se toma una predicción de propiedades del suelo por medio
de regresión del tipo (SMLR & PLSR); algunos autores implementan los métodos de redes neuronales
artificiales, también se implementan modelos de rendimiento para materia orgánica que van variando por el
coeficiente de correlación R2 pues permiten analizar el número de muestras en el campo en niveles de 0.5 a
0.9 en esta métrica (R2). Normalmente se toman las mediciones de texturas y propiedades químicas que
permitan usar la regresión lineal múltiple (MLR), tomando diferentes correlaciones de los modelos de
reflectancia pertinentes. [3],[4]

En [2] se toman 220 bandas, 82 de ellas se eliminan por no poseer señal, a un bajo SNR o por malas
líneas, de ahí se delimita a 138 bandas o características, y se sugiere un rango de óptica completa para trabajar
con (VIS-NIR-SWIR-TIR), en tal punto que permita mapear el estado de una forma más precisa, por medio
de un sensado remoto de suelos, que tome una resolución sensorial por medio de altos espectros basados en
estudios de espectroscopía en contraste con métodos de tradición lineal que no son fáciles de explicar y
visualizar de primera mano. En las mediciones se suele tomar contenido de materia orgánica, esto se mide
porcentualmente al peso de la muestra antes y después, es decir, antes del proceso de ignición la muestra
contiene materia orgánica, después de la ignición el mineral o lo que queda de allí de lo que se quemó
representa porciones de suelo, por ello se presenta en espacios de profundidad de 0 a 8 pulgadas de
profundidad, con rangos de materia orgánica del 2.1 al 5.3 %, en pocas palabras lo que se llama perdida de
ignición, por ello se mide por media, mediana o distribución oblicua.[2]

El estudio de cultivos es fundamental y la aplicación de técnicas de espectroscopía permite tomar

espectros a diferentes frecuencias de luz irradiada. El proceso de absorbancia que hace parte las técnicas
nombradas se da cuando la frecuencia de luz entra por medio de una frecuencia molecular de vibración en la
muestra, esa porción de luz se refleja y descompone en componentes de frecuencias diferentes de espectro
con magnitudes correspondientes, por ello el proceso de columnas de espectrometría de infrarrojo cercano
permite tomar datos y análisis de tipo matemático-estadístico, con la finalidad de garantizar la información,
y que tanto porcentaje de esa sustancia está presente en el traslape de absorción del suelo.[1]

La búsqueda de alternativas para análisis convencionales a los presentados en laboratorio muestra que las
técnicas basadas en espectroscopía sean un candidato potencial para monitorear las condiciones
fisicoquímicas del campo. A nivel laboratorio Vis-NIR permite realizar estudios basados en la absorción de
luz para diferentes materiales en espectros de 400 a 2500nm, por ello cuando es irradiado con luz visible la
frecuencia de luz corresponde a la frecuencia de vibración molecular, que se usa también en el aprendizaje
de máquina para estimar la materia orgánica, acidez del suelo, porcentaje de nitrógeno, entre otras. En
Colombia se han identificado 11 de 12 tipos de suelo, con escalas de 1:100000 para verificar y predecir
comportamientos, mapeando por medio de técnicas geoestadísticas en regiones de más de 5100 hectáreas. Se
han realizado estudios en el Rio Suarez límites entre la regiones de Boyacá y Santander, tomando muestras
entre los años 2015 y 2016, muestras adquiridas a una profundidad de 20 centímetros y por ende este estudio
se hace de forma reticular en 700 metros a tal punto que toma 4 submuestras que componen una muestra para
un total de 653 muestras, por otro lado una de las condiciones para en análisis mediante la espectroscopia

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VIS-NIR requiere de un proceso de humidificación que permite el secado a 40°C en un proceso de 2 a 4 días
que varía según el tipo de suelo con un diámetro anular de 50mm.[1]

Para definir las estrategias de medición que se usarán en predicción con regresión y clasificación, se
captura el espectro con las características informativas que siguen un patrón. Por medio de scikit-learn una
librería para Python, se emplean métodos de clasificación y regresión que usan álgebra, cálculo y estadística
junto con herramientas avanzadas de aprendizaje de máquina para estimar las variables objetivo. El conjunto
de aplicaciones de Matlab Clasification Learner y Regression Learner, permiten visualizar y analizar de
manera rápida y optimizada un coeficiente de correlación para tomar medición y comparación en los
modelos, una herramienta que permite establecer el mejor método tanto para regresión como para
clasificación en la predicción de las propiedades de suelo.

Normalmente el análisis de espectros se toma por medio de vectores, conceptos de primera y segunda
derivada y la comúnmente conocida transformada rápida de Fourier, por la cual se hace el proceso de
normalización en la cual cada muestra, toma una varianza concatenada con cada característica para ser
evaluados por medio de 3 modelos SVR, LR, y Validación cruzada. [1]

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2.2 Marco Teórico
2.2.1 Reflexión
Se define como el cambio de dirección de rayos de luz que se da en un mismo medio al incidir sobre una
superficie de un medio distinto.[7]

Ilustración 1. Reflexión de ondas. Tomado de [7]

2.2.2 Refracción
Cambio de dirección de rayos de luz sobre el cual al pasar de un medio a otro medio del cual se propaga
con velocidad. La refracción se caracteriza por poseer 2 principios fundamentales y característicos: [7][12]

- El rayo incidente el refractado y normal a su superficie a través de un punto incidente.

- Se da como cambio de dirección que experimenta una onda al pasar de un medio material a otro, y se
da si y solo sí, si el movimiento de la onda incide de forma oblicua a su vez que se genere una
separación de 2 medios sobre los cuales cuentan con índices de refracción distintos. [19]

Ilustración 2. Refracción de ondas. Tomado de [7]

En resumen y contrastando, se parte que la reflexión se da cuando hay una onda que se encuentra viajando
de un medio y su punto de encuentro se da en otro, por lo que a su vez parte de mostrar el retroceso de onda
regresando por el medio del que proviene y la refracción se da por medio de medios transparentes como aire
y agua, diferente a hablar de reflexión dado pues que se encuentra en materiales. [8][9]

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2.2.3 Espectro Electromagnético
Se define como la distribución característica de una radiación electromagnética de un objeto donde las
frecuencias bajas se utilizan en la radio, la radiación gamma cubre longitudes de onda a miles de kilómetros.
Planck lo establece como el límite de la longitud de onda larga tal como el tamaño del universo, también
como espectro de tipo infinito y continuo. (Pérez, s.f).

El espectro de radiación electromagnética se le considera como aquel que permite el flujo de salida de
energía partiendo de ondas electromagnéticas que se les conoce como radiación electromagnética, pues en si
el espectro electromagnético se considera como el conjunto de frecuencias a los que se produce la radiación
electromagnética. [13]

Se caracteriza por dividirse en regiones espectrales, y se clasifican según métodos necesarios para
detección de diversos tipos de radiación, por lo que son regiones que no cuentan con una frontera definida y
en ella se dan diferentes solapamientos. [13]

Son de baja frecuencia y poco energéticas, a su vez son aquellas que parten de corrientes eléctricas
oscilantes y se emplean en sistemas de microondas y sistemas de comunicación.[13]

2.2.4 ¿Qué es un espectrofotómetro?

Son instrumentos que permiten tomar la captura y dar evaluación de color, parte de un programa de
control de color, que es donde se da una marca especial, a su vez los diseñadores lo usan como medio para
dar especificación y comunicación sobre el color, fabricantes lo usan para dar supervisión a la precisión de
color en la producción.[14]

Se usa como medidor cuantitativo de propiedades de reflexión o transmisión de material en función de la

longitud de onda, por lo que tratar la espectroscopia electromagnética indica trabajar con espectrofotometría
que trata con espectro de luz visible, infrarrojo cercano, ultravioleta. Pues la espectrofotometría es la que se
encarga de generar el análisis de tipo cuantitativo de moléculas partiendo de la cantidad de luz absorbida
debido a compuestos coloreados, por ello la espectrofotometría usa fotómetros, que son aquellos que miden
la intensidad de un haz o rayo de luz partiendo del color(este se determina por la longitud de onda), en ellos
son importantes la medición del ancho de banda espectral, el porcentaje de transmisión de muestra, rango
logarítmico de absorción de muestra y el porcentaje de reflectancia. [14]

Otro concepto que se debe tomar la absorción de luz se da gracias a la interacción de la luz partiendo de
los modos de moléculas electrónicas y aquellas que son vibratorias, por ello cada molécula cuenta con un
conjunto individual de niveles de energía asociados a composición de enlaces químicos y núcleos, procesos
por donde absorbe la luz a diferentes a longitudes de onda, partiendo de los resultados de las propiedades
espectrales.[15]

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2.2.5 Transmitancia y absorbancia
Transmitancia es la cantidad de energía que pasa de un cuerpo a otro en un momento determinado de
tiempo, por lo que hay varios tipos según las consideraciones de energía, por ello cuando se habla de
transmitancia óptica hace referencia a cantidad de luz que atraviesa dicho cuerpo sobre una longitud de onda
establecida, por lo que una parte de luz absorbida por el mismo y otra fracción de un haz de luz que atraviesa
un cuerpo como transmitancia.
𝑰
𝑻=
𝑰𝒐

𝑰 𝒆𝒔 𝒍𝒂 𝒄𝒂𝒏𝒕𝒊𝒅𝒂𝒅 𝒅𝒆 𝒍𝒖𝒛 𝒕𝒓𝒂𝒏𝒔𝒎𝒊𝒕𝒊𝒅𝒂

𝑰𝒐 𝒆𝒔 𝒍𝒂 𝒄𝒂𝒏𝒕𝒊𝒅𝒂𝒅 𝒕𝒐𝒕𝒂𝒍 𝒅𝒆 𝒍𝒖𝒛 𝒊𝒏𝒄𝒊𝒅𝒆𝒏𝒕𝒆

𝑰
𝑻= ∗ 𝟏𝟎𝟎%
𝑰𝒐

Un haz de luz incide sobre un cuerpo de tipo traslucido, para una parte de luz absorbida por un cuerpo, y
un haz de luz que atraviesa ese cuerpo, por lo que, a mayor cantidad de luz absorbida, mayor será esa
absorbancia del cuerpo y en menor proporción se da esa cantidad de luz transmitida por ese cuerpo. Esta se
mide acorde a una longitud de onda como:

𝑰
𝑨 = − 𝐥𝐨𝐠 𝟏𝟎
𝑰𝒐

Partiendo de lo anterior la intensidad incidente y la transmitida pueden ser igual, y si ese porcentaje de
transmitancia indica el 100%, indica que la muestra no absorbe y evaluando logarítmicamente es igual a 0,
por la cantidad de luz absorbida depende de la distancia que atraviesa la luz por medio de una solución de
cromóforo y concentración que tenga este.[16] [15]

2.2.6 Aprendizaje de Máquina

Aprendizaje de Maquina o comúnmente proveniente del idioma inglés se le dice Machine Learning
(“ML”), parte de entenderlo una ramificación de la Inteligencia Artificial, por lo cual un sistema mecaniza
un sistema de aprendizaje de datos en lugar de aprenderlo por un sistema de programación explicita, pues de
por si parte de un algoritmo que requiere de datos de entrenamiento así como de unos datos de prueba, para
evaluar diferentes modelos con una precisión basada en los mismos datos, por lo que un modelo es el que se
encarga de brindar la salida de información que se genera cuando se genera un entrenamiento sobre el
algoritmo con ciertos datos, de igual forma después de realizar el entrenamiento, se proporciona un modelo
con una entrada a la que se la da la salida. [21]

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2.2.7 Aprendizaje supervisado
El aprendizaje supervisado se toma como demarcación inicial como una rama de lo que se conoce como
el aprendizaje de máquina, o comúnmente por su procedencia del inglés como el Machine Learning , es un
método que se encargar de crear modelos matemáticos que busca explicar etiquetas de entrada/salida
partiendo de un conjunto de características de entrada, por ello se dividen principalmente en: Clasificación y
Regresión. A su vez cuentan con sub-métodos como: Aprendizaje activo, “Similarity Learning” y
Recommender Systems. [22]

El aprendizaje supervisado cuenta con un conjunto de datos en los cuales se etiquetan para entrenar un
algoritmo para realizar diferentes tareas, por lo que se aplican modelos para predecir resultados, realizar
procesos de clasificación a partir de una imagen, de esta forma los datos de entrenamiento cuentan con el
procedimiento de definir si esta correctamente etiquetada la imagen o el elemento a procesar, de esta forma
los algoritmos cuentan con datos históricos o de entrenamiento donde se aplica a entradas desconocidas para
obtener una salida, de esta este tipo de aprendizaje se usa para arboles de decisión, bosques aleatorios y
Gradient Boosting Machine. [22]

2.2.8 Aprendizaje No Supervisado

El aprendizaje no supervisado a diferencia del anterior se basa en un modelo que busca explicar las
características de entrada sin contar con etiquetas. Estas se dividen en: Agrupamiento(algoritmos de
“Clustering”), Estimación de densidad(pdf) y Reducción Dimensional. El algoritmo se encarga de brindar
sentido a cada uno de los datos por medio de búsqueda de características y patrones, por lo que es un tipo de
aprendizaje que se encarga de utilizar agrupamiento, componentes principales y redes neuronales junto con
máquinas soporte vector. [22]

2.2.9 Regresión
La regresión en si consiste de un análisis partiendo del aprendizaje automático supervisado partiendo de
un proceso el cual consiste en establecer un método o proceso para relacionar un numero de características
con una variable objetivo continua. Por lo que la regresión se representa como un proceso estadístico para
estimar relaciones entre variables. El resultado de una regresión normalmente parte de ser un número y en
Aprendizaje de Maquina se da cuando se toma un valor numérico, en un conjunto infinito con posibles
resultados, pues de manera más precisa indica que una regresión es una forma de generar predicción de lo
que es una realidad de valores o etiquetas de salida, partiendo de valores de entrada algunos nuevos, y otros
de por sí que no parten de un conjunto de valores de entrenamiento. [23]

De esta forma la regresión lineal cuenta con una sola variable, esta es la hipótesis y se define de la
siguiente manera: ℎ (𝑥) = 𝜃 + 𝜃 𝑥 = 𝑦 [23]

Los parámetros del modelo se denotan como: 𝜃 , de ahí se puede establecer que se define una primera
instancia para mostrar una demora significativa en un proceso completo, que es donde hace uso de una

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función de costo J que permite seleccionar cada uno de los parámetros de modelo, partiendo de la siguiente
formula:

1
min ℎ 𝑥( ) − 𝑦( ) = min J(𝜃 , 𝜃 )
, 2𝑛 ,

Si la función de múltiples variables 𝐹(𝒙) es diferenciable en la vecindad del punto 𝒂, entonces 𝐹(𝒙)
decrece más rápidamente si se parte desde 𝒂 hacia una dirección dada por el gradiente negativo de 𝐹 en 𝒂,
−𝜵𝐹(𝒂). [23]

𝒂 = 𝒂 − 𝛼𝜵𝐹(𝒂 )

Para algunos 𝛼 ∈ ℝ y pequeños, 𝐹(𝒂 ) ≥ 𝐹(𝒂 ). [23]

La tasa de aprendizaje se define con la siguiente letra: 𝛼, por lo que si se toma en cuenta partiendo de lo
previo se llega a la siguiente relación:

( ) ( ) 𝜕
𝜃 =𝜃 −𝛼 J(𝜃 , 𝜃 )
𝜕𝜃

Realizando los reemplazos correspondientes se tiene lo siguiente:

( ) ( ) 1
𝜃 =𝜃 −𝛼 (ℎ 𝑥( ) − 𝑦( ))
𝑛

( ) ( ) 1 ()
𝜃 =𝜃 −𝛼 (ℎ 𝑥( ) − 𝑦( )) 𝑥
𝑛

Partiendo de todas las ecuaciones planteadas y lo mencionado, se tiene que se analiza una característica,
y de por sí, los datos hiperespectrales poseen gran cantidad de características, por lo que analizándolo desde
otro punto se puede ver que cuenta con diferentes variaciones para lo cual la hipótesis se define de otra forma:
ℎ (𝒙) = 𝜃 + 𝜃 𝑥 + 𝜃 𝑥 + 𝜃 𝑥 + ⋯ + 𝜃 𝑥

Precisamente, por la definición de la hipótesis se denotan cada variable en notación vectorial:

𝑥
𝑥
Χ= 𝜖𝑅
⋮
𝑥
𝜃
𝜃
𝜃= 𝜖𝑅
⋮
𝜃

Partiendo del análisis denotado de forma vectorial se cuenta con lo siguiente:

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 𝑥
𝑥
ℎ (𝒙) = [𝜃 𝜃 …𝜃 ] =𝜃 Χ
⋮
𝑥

Por lo que de esta forma se parte plantear la función de costo de la siguiente forma:

1
min J(𝜃 , 𝜃 , … , 𝜃 ) = 𝑚𝑖𝑛 ℎ𝜽 𝒙( ) − 𝑦 ( )
, ,…, , ,…, 2𝑛
Aplicando el método del descenso de gradiente univariado, se obtiene la siguiente solución:

( ) ( ) 1 ()
𝜃 =𝜃 −𝛼 (ℎ𝜽 𝑥 ( ) − 𝑦 ( ) ) 𝑥
𝑛

Cabe mencionar que el valor de la tasa de aprendizaje es arbitrario y su selección parte del rendimiento
del modelo. [23]

2.2.10 Coeficiente de Determinación

Se considera como una medida estadística que establece una proporción para la varianza en variables
dependientes que pueden ser explicadas por medio de una variable independiente. [24]

Ese coeficiente de determinación (R2), por lo que es una medición de tipo estadística que puede ser
establecida y determinada por un modelo de regresión que brinda una proporción de varianza en la variable
dependiente explicado por medio de una variable independiente, en palabras más sencillas, indica que el
coeficiente de determinación cuenta sobre como los datos, por ello este coeficiente permite realizar ajustes a
los modelos.[25]

Mientras que el coeficiente de determinación provee visiones útiles con respecto a modelos de
regresiones, no solo confiar en la medición de la asignación del modelo estadístico, eso en si no revela
información sobre relaciones de causación entre variables dependientes e independientes, por lo que no indica
la exactitud de un modelo de regresión, además del usuario que permita realizar conclusiones sobre modelos
de análisis de coeficientes de determinación junto con otras variables en modelos estadísticos, que el
coeficiente de determinación toma valores entre 0 y 1, por lo que es una métrica estadística frecuentemente
expresada en porcentajes. [24][25]

La interpretación más común con el coeficiente de determinación en como establece el modelo de

regresión se ajusta a los modelos de dato observados, hay casos en los que no siempre hay un coeficiente de
R2, no está bien por un modelo de regresión, por lo que la calidad del coeficiente depende de factores severos,
por lo que incluye unidades de medida de variables, por lo que la naturaleza de variables empleadas en
modelo, y se aplica a transformación de datos aplicados, por lo que a veces un coeficiente alto indica
cuestiones que permitan medir la unidad de variables, la naturaleza de las variables empleadas en el modelo
y transformación de datos aplicada, a veces un alto coeficiente indica cuestiones con el modelo de regresión.
[25]

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 El coeficiente de determinación establece que esos valores se encuentran entre 0 y 1. Si este valor es más
cercano al valor de 1, mayor es ese ajuste del modelo a la variable para el cual se aplica el caso en concreto,
por lo que se adquiere resultados cuando se acerca a valor 0, por lo que el ajuste de modelo a variable se
aplica y por ello el resultado es menos fiable. [24]

2.2.11 Reducción Dimensional

La reducción de dimensiones se encarga de reducir el número de dimensiones de un conjunto de variables
continuas, agregando una mayor varianza al tener menos componentes, por ello esto se conoce como análisis
de componentes principales (PCA) o un análisis discriminante lineal (LDA), por lo que las variables se
especifican partiendo de campos en una tabla y unos campos a su vez que demarcan las variables a guardar
en la tabla o clase de entidad de salida. [26]

PCA de por si se aplica para reducción de dimensión en un Conjunto de Datos que requiere un alto
número de variables, por lo que requiere de tener una mejor representación en términos de mínimos
cuadrados, para proyectar la varianza, pero a su vez se compone de componentes asociados a unos valores
propios, para reducir la dimensión partiendo de atributos del conjunto de datos, pues para el caso pertinente
se puede establecer que con una dimensión grande de datos, la varianza del PCA va aumentando o
disminuyendo según la cantidad de características y etiquetas, con las que se va analizar el sistema, entre
menos características y según las etiquetas relacionadas se requiere cierta reducción dimensional, pues para
este caso no se aplicó pero si se requiere una reducción no se agregan tantos datos. [26]

De por si la extracción de componentes principales de un conjunto de datos parte de extraer la matriz de

covarianza, pues está de por si se representa como µ que es la media de E(x) que representa el valor esperado
de x. [26]

Ilustración 3. Matriz de Covarianza

Posteriormente se extraen cada uno de los valores y vectores propios de la siguiente forma por ello parten
de λ partiendo de la siguiente ecuación característica:

det(Σ − 𝜆𝐼) = 0
Posteriormente después de eso se buscan cada uno de los componentes más representativos para hallar el
peso de cada 𝜆, por lo que una vez definiendo ese peso, se escogen cada uno de los porcentajes de varianza
para definir los componentes y se proyectan cada uno de los valores: 𝑧 = 𝐴(𝑥 − µ)

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Z es el punto nuevo
X el original
Media : µ
Columnas de A – vectores propios escogidos.

2.2.12 Regresión lineal Múltiple

Se cataloga como un modelo de Regresión para evaluar todo lo pertinente entre una variable continua y
predictores, los predictores pueden ser campos continuos, categóricos o derivados, de tal forma que si hay
algo no lineal sea soportado, por lo que el modelo en si es lineal porque parte de los términos que suman en
cada termino y lo hacen que sea un predictor que se multiplica por un coeficiente estipulado, por ende una
regresión lineal permite generar conocimientos para gráficos con un mínimo de dos campos, ellos son el
destino y el predictor.[27]

Para probar el modelo se parte de los siguientes lineamientos:

- 1. Matriz de diseño que contenga una fila por cada fila de datos y una columna por cada parámetro
en el modelo de regresión
- 2. Calcular coeficientes de regresión.
- Paso 2.1 Multiplicar matriz de diseño transpuesta por sí misma.
- Paso 2.2 Multiplicar matriz de diseño transpuesta con vector de valores de destino.
- Multiplicar inversa de matriz de 2.1 por matriz de 2.2.

Con los valores de los coeficientes de regresión y el cálculo de valores de destino para cada fila, se
establecen cada una de las diferencias entre valores de objeto pronosticados y observados donde estos se
consideran residuos.[27]

Posteriormente se realiza lo siguiente:

1. Calcular cuadrado medio para varianza no explicada:

- Tomar el cuadrado de los residuos y añadirlos

- Dividir la suma de cuadrados para fuente de error por grados de libertad.

2. Calcular el cuadrado medio para modelo de regresión:

- Por cada fila restar media global de valor de destino previsto.
- Tomar cuadrado de cada uno de los resultados y añadirlos.
3. Dividir la suma de cuadrados para modelo de regresión acorde a grados de libertad.

4. Dividir cuadrado medio para modelo de regresión por cuadrado medio de fuente de error.

Todo lo anterior define el valor de significación, por lo que, si el valor de significación es menor que el
nivel de significación, los medios son totalmente diferentes.[27]

Otra cuestión importante es determinar el coeficiente de Determinación que es quien da la predicción del
modelo de regresión, por ello si se toma un nivel de significación en 5%, la predicción o potencia predictiva

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de modelo debe ser mayor al 10%, por lo cual esto permite establecer una condición de fiabilidad entre
destino y campo de entrada. [27]

2.2.13 SVR
En primera instancia es una variante de “Support vector Machine”, en este caso se usa este método para
clasificar, el modelo de vector soporte se utiliza como un esquema de regresión para predecir diferentes
valores.

Su principio fundamental parte que la salida es un número real, que no es fácil de predecir dado que
cuenta con muchas posibilidades para la regresión se maneja un margen de tolerancia cerca de un vector con
la finalidad de minimizar dicho error partiendo del error tolerado. [28]

Ilustración 4. Support Vector Regresor.

SVR se define de forma lineal por la siguiente ecuación:

𝑦= (𝑎 − 𝑎 ∗ ). < 𝑥 , 𝑥 > + 𝑏

Si el problema no es lineal la función Kernel transforma los datos a un punto que partan de una
característica de espacio dimensional alto para ejecutar dicha separación lineal. [28]

𝑦= (𝑎 − 𝑎 ∗ ). < 𝜑(𝑥 ), 𝜑(𝑥) > + 𝑏

𝑦= (𝑎 − 𝑎 ∗ ). 𝐾(𝑥 , 𝑥) + 𝑏

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 Ilustración 5. Representación de función Kernel de forma no lineal. [28]

2.2.14 Maquina Soporte Vector “Support Vector

Machine”
Se aplica como un conjunto de algoritmos de aprendizaje de maquina supervisado, para resolver
problemas que competen a clasificación y regresión partiendo de un conjunto de datos de entrenamiento y
con unas etiquetas, de por si es un modelo que permite tomar los puntos de muestra en el espacio, separándolo
por clases en 2 espacios amplios por medio de un hiperplano de separación, que es el vector entre 2 puntos
de 2 clases cercanos y por ello esto se conoce como vector soporte. [28]

SVM se caracteriza por construir hiperplanos o un conjunto de ellos para definirse en un espacio de
dimensionalidad alta o infinita para problemas de clasificación o regresión.

Los modelos basados en SVM se relacionan a su vez con redes neuronales por medio de una función
Kernel, que permite determinar un método de entrenamiento opcional para clasificadores de tipo polinomial
en función radial y perceptrón multicapa. [28]

Ilustración 6. Gráfica Representativa de Maquina Soporte Vectorial.

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2.2.15 Perceptrón Multicapa
El perceptrón multicapa parte de un perceptrón simple a su vez de integrar capas de neuronas ocultas para
funciones no lineales, de por si se compone de una capa de entrada, una de salida y n capas ocultas
intermedias, para diferenciarlo consta de dos fases: [29]

1. Propagación – es donde se calcula el resultado de la salida de la red desde los valores de entrada hacia
adelante. [29]
2. Backpropagation que es donde el aprendizaje se da sobre errores obtenidos en la salida del perceptrón
y se propagan hacia atrás con la modalidad de poder modificar esos pesos de conexiones para calcular
el valor estimado de red y este sea similar con valor real de igual forma partir de la función gradiente
del error. [29]

Ilustración 7. Perceptrón Multicapa

Capa de entrada: conecta red con exterior a su vez cada neurona se conecta con una de las variables de
entrada de red. [29]

Capa oculta: son una o varias capas acumuladas que cuentan con una activación de una salida a la cual
se le asocia una suma de activación de capa anterior conectada con otras, partiendo de que se le agregan
también los sesgos. [29]

Capa de Salida: parte de las capas ocultas más la salida de red a la que se le proporciona los resultados.
[29].

2.2.16 KNN – “K Nearest Neighbors”

Se considera un algoritmo de aprendizaje supervisado debido a que es un algoritmo de por sí que recibe
un conjunto de datos que se etiquetan con los valores de salida correspondientes dadas unas condiciones
sobre las que entrena y define un modelo de predicción, el de por si cuenta con una métrica importante,
debido a que su objetivo consiste en clasificar todas las instancias nuevas, en ello parte de un orden formado
por diferentes atributos descriptivos y uno especifico que es la clase. [38]

Para clasificar una nueva muestra z a partir del conjunto de entrenamiento 𝑥 .

1. Se hallan las distancias* de 𝑧 a todos los 𝑥
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 2. Se toman las menores k distancias.
3. Se selecciona la clase a partir del 𝑦 asociado a los 𝑥 de menor distancia con z .[39]

La selección puede hacerse a partir de la moda “el de mayor votación”

Ilustración 8. K - Vecinos Más Cercanos, Clasificación

- Solo es necesaria 1 muestra por clase para lograr un clasificador por KNN. [39]
- Se debe seleccionar cuidadosamente el k. [39]
- K no debe ser un múltiplo del número de clases. Por ejemplo: si hay 6 clases se puede tomar K=6.
- KNN es considerada una técnica No paramétrica en sentido estadístico. [39]
- KNN es clasificado como un “lazy learner” ya que no estima una función de frontera de decisión.
- Para 2 clases se debe tomar un k impar. [39]

2.2.17 Técnica de Conjunto: Ensemble

Es uno de las técnicas de aprendizaje automático con mayor poder, debido a que es un aprendizaje que
se establece por conjuntos, este a su vez implica el uso de varios modelos de aprendizaje automático para
brindar una mejor confiabilidad y precisión de las predicciones, por ende al ser el aprendizaje conjunto se
encarga de entrenar múltiples modelos de aprendizaje automático y combinar cada uno de los resultados,
partiendo de cada uno de los modelos como un pilar que busca crear un modelo predictivo óptimo, a su vez
parte de un conjunto diverso de modelos de aprendizaje automático individual donde puede buscar la mejora
de la estabilidad de un modelo general, por ende generar predicciones precisas. Finalmente, los modelos de
aprendizaje por conjunto brindan mayor confianza que cada uno de los modelos individuales debido a que
en una competición de Aprendizaje de Maquina automático, son las que brindan una buena métrica de
medición. [40]

Estos de por si generalmente pueden ser diferentes, debido a que pueden tener una operación en diferentes
muestras en un conjunto de datos, partiendo de diferentes técnicas de modelado y partir de una hipótesis
diferente. [40]

Hay algo que se puede establecer y es que cada modelo cuenta con cierto de grado de error, por ende los
errores de los modelos son diferentes a medida que estos son producidos por uno u otro modelo, esto en si
establece diferentes razones, en torno a ellas no hay un agrupamiento que dé una respuesta concreto debido
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a que se genera una dispersión en los datos, por ello si se puede establecer que en cada una de las situaciones
establece lo correcto de lo incorrecto, las agrupaciones se centran en relación a una respuesta correcta o no.
[40]

2.2.18 Matriz de Confusión – Sensibilidad –

Especificidad – Precisión - Exactitud
“Accuracy” - Métricas de F1
Matriz de Confusión
- También conocida como matriz de errores,
- Es un diseño de tabla específico que permite la visualización del rendimiento de un algoritmo, de
aprendizaje supervisado.
- A partir de esta pueden calcularse otras métricas puntuales que dan una idea del rendimiento del
algoritmo. [41]

Ilustración 9. Matriz de Confusión Binaria

Condición positiva (P)

El número de casos positivos reales en los datos. P=TP+FN

Condición negativa (N)

El número de casos negativos reales en los datos N=TN+FP [41]

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 Sensibilidad, recuperación, tasa de aciertos o tasa de verdaderos positivos (TPR)

“Sensitivity, recall, hit rate, or true positive rate” (TPR)

𝑇𝑃 𝑇𝑃
𝑇𝑃𝑅 = = = 1 − 𝐹𝑁𝑅
𝑃 𝑇𝑃 + 𝐹𝑁

Mide la proporción de positivos que se identifican correctamente. [41]

Especificidad, selectividad o tasa de verdaderos negativos (TNR)

specificity, selectivity or true negative rate (TNR)

𝑇𝑁 𝑇𝑁
𝑇𝑁𝑅 = = = 1 − 𝐹𝑃𝑅
𝑁 𝑇𝑁 + 𝐹𝑃

Mide la proporción de negativos que se identifican correctamente. [41]

La sensibilidad es la medida en que los verdaderos positivos no se pasan por alto,

• Por lo que los falsos negativos son “pocos” si 𝑇𝑃𝑅 →1

La especificidad es la medida en que los verdaderos negativos se clasifican como tales,

• Por lo que los falsos positivos son “pocos” si 𝑇𝑁𝑅 →1

El promedio del TNR y TPR se le conoce como la Exactitud Balanceada o “Balanced Accuracy” [41]

Precisión o valor predictivo positivo (PPV)

precision or positive predictive value (PPV)

𝑇𝑃
𝑃𝑃𝑉 = = 1 − 𝐹𝐷𝑅
𝑇𝑃 + 𝐹𝑃

Exactitud (Accuracy)

La Exactitud es la cercanía de las mediciones a un valor específico, mientras que la precisión es la

cercanía de las mediciones entre sí. [41]

𝑇𝑃 + 𝑇𝑁 𝑇𝑃 + 𝑇𝑁
𝐴𝐶𝐶 = =
𝑃+𝑁 𝑇𝑃 + 𝑇𝑁 + 𝐹𝑃 + 𝐹𝑁

F1 Métricas

Es una medida de la exactitud, puede calcularse a partir de la precisión y la sensibilidad usando la media
armónica de estas. [41]

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 𝑃𝑃𝑉 ∙ 𝑇𝑃𝑅 2𝑇𝑃
F1 = 2 ∗ = ,
𝑃𝑃𝑉 + 𝑇𝑃𝑅 2𝑇𝑃 + 𝐹𝑃 + 𝐹𝑁

También se conoce como coeficiente de Sørensen-Dice o coeficiente de similitud de Dice (DSC). [41]

2.2.19 Regresión Logística

La Regresión Logística consiste en predecir la presencia o ausencia de características partiendo de un
rango de valores de un conjunto de predictores, por ello es similar a una regresión lineal, lo que cambia en
sí parte de definir es que cuenta con una variable dependiente que cuenta con dicotomía, por ello se considera
que los coeficientes de regresión logística cuenta como la razón de probabilidad de cada variable
independiente de un modelo, por ello se aplica a un rango amplio de situaciones de investigación de un
análisis discriminante. [42]

2.2.20 Discriminante Lineal

El análisis por Discriminante lineal se considera como un método para clasificación supervisada de
variables cualitativas entre 2 o más grupos conocidos a priori y las observaciones que tienen ellos en función
de características, aplicando el teorema de Bayes, este método del Discriminante Lineal se encarga de estimar
la probabilidad de una observación partiendo de un valor preestablecido de predictores y pertenezca a una
clase según la probabilidad P(Y = k|X = x), donde se asigna la observación a la clase k para la cual esa
probabilidad que fue predicha sea mayor, es una opción alterna a una regresión logística, más si se cuenta
con nivel cualitativo mayor a niveles, por lo que esas extensiones de regresión logística para múltiples clases
cuenta con diferentes ventajas:

- Si cada una de las clases se encuentran en puntos bien separadas, los parámetros estimados en el
modelo de regresión logística son inestables. [43]
- El número de observaciones es bajo y distribución de predictores es normal en cada clase, es más
estable que la regresión logística. [43]
- Cuando se tiene un problema de clasificación cuenta con 2 niveles, se parte de métodos que cuentan
con resultados similares. [43]

El proceso de análisis discriminante se resume en 6 pasos importantes:

- Se cuenta con un conjunto de datos de entrenamiento donde se conoce a un grupo que pertenece cada
observación. [43]
- Las probabilidades previas parten de una proporción esperada de observaciones que pertenecen a un
grupo.[43]
- Determinar la matriz de covarianzas o la varianza parte de si es homogéneo en los grupos.
- La estimación de parámetros parte de las funciones de probabilidad condicional, partiendo de las
condiciones pertinentes para cumplir las diferentes características. [43]
- Calcular el resultado de la función discriminante, en el ese resultado parte de establecer al grupo al
que es asignado cada observación. [43]
- Por validación Cruzada se estima las probabilidades de clasificaciones erróneas.

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2.2.21 Árboles de Decisión
Los árboles de clasificación y regresión son métodos que contribuyen con cada uno de los modelos de
tipo predictivo y/o explicativo, se caracterizan por tener una representación gráfica mediante árboles, pero a
su vez cuenta con un formato compacto por medio de las reglas del lenguaje natural, por ello parte de las
técnicas de modelado, por medio de clasificación permiten explicar y predecir los objetos o individuos a una
clase respectiva, con respecto a la base de variables cuantitativas y cualitativas. En cuanto a regresión permite
generar un modelo explicativo y predictivo con respecto a una variable cuantitativa. [44]

2.2.22 Técnicas de Optimización Bayesianas

Las técnicas de optimización Bayesianas se considera como una alternativa estratégica para la búsqueda
de hiperpárametros, en si se encarga de crear modelos probabilísticos partiendo del valor de una función
objetivo, como métricas de validación de un modelo, por ello parte buscar y redirigir una iteración hacia una
región con mayor enfoque, a su vez consiste en reducir las combinaciones de hiperpárametros donde se evalúa
el modelo, donde permite comparar y elegir cada uno de los modelos con mejor precisión, por lo que una de
sus ventajas es maximizar el espacio de búsqueda si es amplio o si esa evaluación del modelo es lenta. [45]

2.2.23 Regularización Ridge(L2)

La regularización Ridge o L2 como comúnmente, por ello se mide la media del cuadrado del coeficiente
del modelo, por lo que, a diferencia de Lasso, se usa para medir la media del valor absoluto de coeficientes
del modelo, por lo que se aplica a Regresiones Lineales, polinómicas, redes neuronales, máquinas de vectores
de soporte, la formula presentada es para Lasso. [33]

1
𝐶= |𝜔 |
𝑁

El error cuadrático medio, se basa en el desarrollo de la siguiente ecuación:

1 𝛼
𝐽= (𝑟𝑒𝑎𝑙 − 𝑒𝑠𝑡𝑖𝑚𝑎𝑑𝑜 ) + |𝜔 |
𝑀 𝑁

Para el caso de Ridge L2, se mide como la media del cuadrado de coeficientes del modelo por lo que acá
se aplica matemáticamente obtiene la siguiente ecuación:

1
𝐶= 𝜔
𝑁

El error cuadrático medio para evaluar L2 se basa en la siguiente función:

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 1 𝛼
𝐽= (𝑟𝑒𝑎𝑙 − 𝑒𝑠𝑡𝑖𝑚𝑎𝑑𝑜 ) + 𝜔
𝑀 2𝑁

Lo anterior parte que para el modelo Ridge se debe entrenar el modelo, tener en cuenta las variables a
predecir, para hallar las métricas de perdida, y de ahí pasar a determinar el error cuadrático| por medio de las
técnicas de regularización. [33]

2.2.24 Interpolación
La fase de extracción y transformación de los datos va acorde con el uso para el que serán destinados, en
este caso, se quiere implementar métodos de reducción de dimensionalidad como PCA e interpolación
esperando obtener un mejor desempeño en la aplicación de las técnicas de aprendizaje de maquina en las
siguientes fases, para ello basado en el estado del arte, se han elegido métodos de interpolación como primer
paso para la transformación y preparación de los datos, esta interpolación se hará usando la librería Scipy y
diferentes métodos como lo es un ajuste de polinomios cúbicos por partes, dados los vectores de entrada (x
, y), proporcionando como resultado una curva suave y natural que pasa por los puntos de los datos. Una vez
realizado este proceso se pretende comparar el método del subconjunto de funciones con el Interpolador de
datos spline cúbico de la misma librería, obteniendo resultados que permitan concluir el mejor método
aplicado al caso de estudio. [34]

Para el caso de estudio que es la aplicación de datos para un mejor trazado, de una curva suave y natural
tal como se mencionó previamente se parte de una spline cúbica que parte de encontrar tal curva que conecta
esos puntos de datos con grado 3 o menor, por ello los spline parten de una referencia polinómica suave y
continua, parten de una primer y segunda derivada continua para unirse, ellos de por si toman un conjunto de
puntos [𝑥 , 𝑦 ] 𝑝𝑎𝑟𝑎 𝑢𝑛 𝑖 = 0,1, … , 𝑛 = 𝑓(𝑥), donde se expresa ese spline de tipo cubico en una curva
continua por partes, pasando por cada uno de los valores de la tabla, al tomar las siguientes características:

Para splines de grado K = 3, se toma lo siguiente:

- Dominio de una función s en intervalos [a,b]

- S, S’, S’’ son funciones continuas en [a,b]

𝑆 (𝑥), 𝑥𝜖[𝑥 , 𝑥 ]
𝑆 (𝑥), 𝑥𝜖[𝑥 , 𝑥 ]
𝑠(𝑥) =
⋮
𝑆 (𝑥), 𝑥𝜖[𝑥 , 𝑥 ]
Partiendo de 𝑠 (𝑥) se establece que el polinomio cubico se utilizara en un subintervalo de la siguiente
manera[𝑥 , 𝑥 ], partiendo a su vez que se tome un spline suave y continuo se parte de las siguientes
relaciones:

𝑠 (𝑥 ) = 𝑠 (𝑥 ) = 𝑓(𝑥 ) = 𝑦

O por una que pasa por 2 puntos finales:

𝑠 (𝑥 ) = 𝑠 (𝑥 ) = 𝑓(𝑥 ); 𝑠 (𝑥 ) = 𝑠 (𝑥 ) = 𝑓(𝑥 ) = 𝑦 = 𝑦

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 Si se toma como polinomio cubico se obtiene que al linealizarlo queda de la siguiente manera
𝑠 = (𝑀 − 𝑀 )/(𝑥 − 𝑥 ) 𝑞𝑢𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑡𝑒𝑛𝑒𝑐𝑒 𝑎𝑙 𝑐𝑜𝑛𝑗𝑢𝑛𝑡𝑜 𝑑𝑒𝑙𝑖𝑛𝑒𝑎𝑑𝑜 𝑝𝑜𝑟 [𝑥 , 𝑥 ]

2.2.25 Escalización
Está técnica se aplica en el momento que se realiza la normalización donde consiste en calcular la media
de cada característica µ, con matriz de covarianza, de paso se seleccionan los valores y vectores propios de
una matriz de covarianza, de ahí se parte que esto se implementa justo antes de implementar algún modelo,
pues en un conjunto de datos de por si se cuenta con muchas características y etiquetas, por ello se parte que
este algoritmo de por si indique las diferentes variables con las que se puede realizar las diferentes
comparaciones, por ello el algoritmo no se debe afectar en una medida por lo cual los valores son mayores
en magnitud a otro, por ello se usa una escalización estándar partiendo de una relación matemática que
comprende el proceso de estandarización y normalización:
𝑥−𝜇
𝑧=
𝜎
Capítulo 3
Diseño
3.1 Diagrama de Bloques
El prototipo o esquema de proyecto cuenta con 2 secciones fundamentales: el sensor AS7341 de ams-
OSRAM con 11 canales de espectro. En la segunda sección se encuentra el microprocesador o sistema de
procesamiento para adquisición. Partiendo de lo anterior lo primero que le entra al sistema es la luz o fuentes
de luz y las muestras de suelo a analizar, se toma como fuente primordial la luz emitida directamente hacia
la muestra del suelo, esto se mide con ayuda del sensor multiespectral que transmite los valores al
microprocesador integrado en la Raspberry pi Pico donde se capturan y almacenan temporalmente los datos,
por medio de una interfaz que usa el protocolo I2C. Como siguiente paso la comunicación serial mediante
USB entre el microprocesador y el host en el que se implementarán y operarán las técnicas de aprendizaje
automático, juega un papel fundamental pues mediante el uso de un firmware que permita virtualizar el puerto
USB se transmitirán los datos espectrales adquiridos en una escala correspondiente a los niveles de
conversión análogo digital del microprocesador. El preprocesamiento de datos recolectados se realizará
usando librerías y herramientas del lenguaje Python y la Ciencia de Datos. Así con modelos de Regresión y
Clasificación que permiten evaluar el valor de cada una de las propiedades a examinar, se estimarán las
variables objetivo que tienen una sincronización basada en la base de datos proporcionada por Agrosavia,
con bastantes características y etiquetas por analizar.

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 Ilustración 10. Diagrama de bloques sistema propuesto Fuente: Propia de los Autores
Gracias a lo anterior, se realiza el proceso de medición partiendo de los resultados obtenidos con el sensor
y los datos de Agrosavia, partiendo de esto se procede a realizar una breve explicación de cada uno de los
bloques del sistema:

Sensor óptico: Para obtener correctamente los datos necesarios provenientes de las muestras, se requiere
un sensor multiespectral con, al menos, 6 bandas espectrales, primando el espectro visible y el infrarrojo
cercano. Debe trabajar con un voltaje de alimentación de entre 3.3V y 5V ya que es el voltaje más común en
microcontroladores, con el cual se pretende alimentar. Dado su deseado uso en el campo, debe trabajar en
temperaturas de entre 5°C y 40°C, rango normal de temperaturas en el campo colombiano.

Para una adecuada distinción de cada una de las bandas espectrales, la anchura a media altura (FWHM)
de cada curva no puede ser mayor a 50 nm ya que se pueden confundir dos regiones dada su cercanía.

Microprocesador: Dada la alta dimensionalidad de los datos, se requiere una memoria mínima de
128Mb, lo cual le daría la capacidad de almacenar la información de unas cuantas muestras. No se tiene un
requerimiento en cuanto al tiempo máximo para proporcionar los resultados, por lo que no es crucial un
oscilador específico. En cuanto a los bloques correspondientes al aprendizaje de máquina, si bien no se
requieren características muy específicas ya que es un modelo muy sencillo, se tiene:

Preprocesamiento: Como se ha mencionado anteriormente, los datos multiespectrales se caracterizan

por tener una alta dimensionalidad, por lo cual, la práctica más común es someter a los datos a una reducción
dimensional por medio de Análisis de Componentes Principales (PCA).

Entrenamiento y modelo de regresión: Para estas etapas no es necesario más que dividir los datos en
un grupo de entrenamiento y uno de validación, evaluando distintos modelos para escoger el más apto.

Métricas de evaluación: Métodos de evaluación del rendimiento del modelo de modo que se pueda
escoger el mejor según la aplicación y proveer una medida de confianza a la estimación de las propiedades.

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3.2 Estándares en Ingeniería
I2C: El bus I2C es un estándar que facilita la comunicación entre microcontroladores, memorias y otros
dispositivos. Sólo requiere de dos líneas de señal como son SDA para los datos y SCL para el reloj además
de una línea común o tierra [16]. Es importante para este proyecto debido a su uso en el sensor espectral de
bajo costo usado en el diseño del prototipo.

UART: El UART (Universal Asynchronous Receiver Transmitter) es un protocolo de comunicación en

serie principalmente utilizado para el intercambio de datos de corta distancia, baja velocidad y bajo costo
entre ordenador y periféricos [17]. Este es usado como complemento al I2C en el sensor espectral a usar en
el prototipo de bajo costo.

IEEE 610.4-1990: Protocolos para procesamiento de imágenes y reconocimiento de patrones. En él se

incluyen distintos términos y especificaciones para el uso de estas metodologías. Es importante para el
proyecto pues es necesario realizar un modelo de regresión para poder determinar propiedades del suelo
como nitratos o nutrientes.

NTC 5403 Determinación de materia orgánica ICONTEC: “Esta norma cubre la determinación del
carbono orgánico en los suelos, en el laboratorio, a través de métodos de oxidación seca y húmeda y,
diferentes métodos de cuantificación. Las mediciones, objeto de esta norma pueden ser empleadas en campos
relacionados con agricultura, medio ambiente y recursos naturales. La valoración de la cantidad de carbono
orgánico sirve como índice de fertilidad del suelo y como orientación para la fertilización de los cultivos.
Además de los métodos presentados en esta norma existen otros que pueden emplearse previa validación de
los mismos frente a los aquí descritos. El criterio de selección de los métodos que cubre esta norma se basa
principalmente en su alto nivel de utilización a nivel nacional e internacional”. [18]

3.3 Validación del sistema

Las actividades específicas que se desarrollarán en el marco de diseño son:

Cumplimiento de requerimientos para cada elemento o componente desde las metas globales del sistema
y requerimientos aprobados por el cliente.

Diseño inicial: Se ha planteado una metodología básica para el diseño, implementación y operación de
los algoritmos de inteligencia artificial que se ven involucrados como solución dando seguimiento a las
recomendaciones del director del proyecto de grado.

Prototipos experimentales y set de pruebas en el desarrollo del diseño: El diseño se realizará con el
conjunto de datos brindado por el director de tesis y el cliente desde Agrosavia como fuente de soporte en
datos, que a su vez permitirá realizar una extracción de características principales PCA como una de las
técnicas de aprendizaje de máquina para crear modelos eficientes y de calidad a partir grandes volúmenes de
datos, en el caso presente se cuenta con alrededor de 2500 características. Segmentación del conjunto de
datos 70/30 para conjunto de entrenamiento y de validación de pruebas con el hardware. El procesamiento
se realizará inicialmente en el ambiente virtual Colab de Google.

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 Iteración hasta la convergencia: se probarán diferentes métodos (KNN, SVM), usando métricas de
evaluación y registrando los resultados obtenidos, en el entorno de desarrollo y de pruebas. Se generará
protocolos de pruebas.

Diseño final: se plantea una adecuación a nivel de hardware dando cumplimiento al objetivo general y a
los requerimientos del cliente.

3.4 Estrategia y Mapeo de selección de modelos de

regresión usando la herramienta del paquete
de Matlab Regression Learner App

Ilustración 11. Diagrama de Flujo de Modelos de Regresión.

La siguiente figura ilustra el proceso de entrenamiento y validación de datos: los modelos con los que se
va a realizar el proceso, y los diferentes softwares donde se va a realizar la medición de los datos, partiendo
de los conjuntos de datos obtenidos, así como la escogencia del mejor modelo para la regresión a aplicar.

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 Ilustración 12. Diagrama de Flujo de Modelos de Clasificación
La ilustración 12 indica que se tiene claramente 90 datos de espectro de VIS-NIR con mediciones
químicas, para este caso se aplica clasificación donde el análisis no se realiza en este caso por un
entrenamiento y testeo, sino por validación cruzada. Se toma un conjunto de validación del 30% en 30
muestras, de esas se toman para etiquetas de proceso quimio-métrico, por el otro lado al pasar por Validación
cruzada se cuenta con 4 pliegues para 5 modelos de Clasificación, SVC, Redes Neuronales, K vecinos más
cercanos, Discriminante lineal, y por ultimo un aprendizaje por conjunto, donde en este caso se aplican los
modelos usando la aplicación Clasification Learnen de la caja de aplicaciones y herramientas para
aprendizaje automático de Matlab, obteniendo los valores pertinentes a exactitud y matriz de confusión, que
son por los cuales se hallan los valores de precisión, recuperación, Métricas de F1; se valida cada uno de los
modelos estableciendo cuál de ellos presenta la mejor métrica y se realiza finalmente una comparación entre
cada una de las métricas.

3.5 Selección de componentes

3.5.1 Sensor AS7341
En primera instancia se escogió este sensor porque es un sensor de luz, que se encarga de hacer una
detección en cantidades de luz en diferentes longitudes de onda, pues de por si tiene una capacidad mayor a
la del ojo humano, por lo que puede detector 1 o varios colores presentes en el espectro, esto indica que el
sensor en dimensiones es de (3x2 mm) con 8 bandas de detección y separadas por cada luz de color, pues a

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su vez incluye sensores para luz blanca e infrarroja cercana, por ello detecta un parpadeo de luz en frecuencias
específicas. [31]

De por sí, el sensor indica que tiene 10 canales y uno que es un flicker de detección, en si el chip cuenta
con un Super MUX que es el que enruta la señal desde cualquier sensor a un ADC especifico, por ende,
cuenta con bandas de 415, 445, 480, 515, 555, 590, 630 y 680nm, a su vez con “CLEAR & NEAR IR”, y
una configuración de dirección I2C configurada por defecto en Hexadecimal como 0x39. Poniendo en
contexto la comunicación del sensor se indica claramente que el sensor para poder determinar la composición
de cualquier color, junto con una precisión y especificidad parte de contar con 6 canales ADC y 16 bits que
toma de medidas sin realizar el debido procesamiento y a su vez se convierte en valores digitales por los
cuales estos pueden ser leídos por I2C. [31]

El sensor de por si se alimenta a un microcontrolador, con un voltaje de alimentación o (Power Supply)

de 3.3V, se define de esta forma, ya que se va a usar un microcontrolador Raspberry Pi Pico. [31]

Ilustración 13. Responsividad de Sensor AS7341

La ilustración lo que muestra es una respuesta espectral, partiendo de cada uno de los canales en los que se
encuentra para cada color, dependiendo la aplicación, se puede ajustar para que se encuentre en los espectros
ultravioleta o infrarrojo, cuenta con canales donde se puede evaluar de 350 a 1000nm, o de 400 hasta los
700nm u 800nm. [30]

3.5.2 Fuente de Luz

El sensor AS7341 cuenta con un led blanco, para ello, pues se configura por medio de un comando que
está dentro de la librería de Python del sensor Adafruit, pues este led de por si es un led de luz blanca, el cual
permite evaluar toda la luz visible, o el rango en el que se encuentra el elemento a analizar.

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3.5.3 Microcontrolador Raspberry pi Pico
Se escogió en primera instancia debido a que cuenta 26 pines de Entrada/salida de propósito general de
3.3V, 23 pines GPIO y 3 con capacidad para ADC, una SRAM de alto rendimiento multibanco 264K, un
convertidor ADC de 12 bits y velocidad 500kbps, voltaje de E/S de 1.8 a 3.3V, 2 puertos de comunicación
UART, 2 de I2C, 2 de SPI, y 16 canales para hacer análisis de señales PWM, esto entre sus características
técnicas, entre otras también debido a que es económico, en primera instancia la comunicación con el sensor
es una de las razones por las que se escogió, la otra razón fue porque también se puede aplicar Tensor Flow
sobre la Raspberry, pues de por si Tensor Flow permite crear grafico de flujo de datos, estructuras de
descripción de datos, por medio de Python permite proporcionar diferentes abstracciones de alto nivel, así
como también la aplicación de Tensor Flow para desarrollo de redes neuronales y la implementación de
algoritmos, como una forma de concatenar la salida de una función con la entrada de otra función. [30]

3.6 Pruebas de Concepto

Se presentan los resultados respecto a métricas aplicando diferentes técnicas de regresión por medio de
Regression Learner App en el paquete de estadística y aprendizaje automático de Matlab.

Adicional a ello, se escogieron tres métodos basados en el estado del arte: Regresión Lineal, Redes
Neuronales, Regresión por Soporte Vectorial y Procesos Gaussianos para problemas de Regresión.

3.6.1 PH

Ilustración 14. Medición de PH, Graficas de Conjunto de Datos original y de predicción

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 PCA 97% Varianza +
Características

Modelo Test Validación

GPR 0.78 0.55

Lin.
Reg 0.01 0.01

Tree
Fine 0.77 0.15

SVM 0.02 0.47

Tabla 1. Medición de PCA y Varianza.
En primera instancia se tomaron unas mediciones por medio de Python y Matlab, pues en este caso se
parte que lo innovador de ello está en la implementación de procesos gaussianos que de por si es un método
de aprendizaje supervisado que permite resolver problemas de regresión y clasificación, tal como muestra la
tabla y al aplicar reducción dimensional se puede determinar que cumple con las siguientes características:

- La calidad de la predicción se da al interpolar cada observación. [32]

- La predicción al ser de tipo Gaussiana, permite calcular los intervalos de confianza y establecer en
base a ellos si se debe ajustar de forma lineal o adaptativo por lo que la predicción se da sobre una
región especifica de una región de interés especifica. [32]
Todo lo relacionado con GPR, permite especificar la media de datos de entrenamiento, la covarianza por
ende se especifica por medio de un Kernel, pues los hiper-párametros del Kernel para optimizar el ajuste
maximizando la probabilidad marginal de log-Marginal, por lo que cada ejecución varia, la primera se da por
los primeros valores de los Kernel, y posteriormente estos valores se ejecutan de forma aleatoria en un rango
de valores permitido, por ello cada hiper-párametro inicial se debe mantener fijo. [32]

Con respecto a regresión lineal, arboles de decisión y Maquina soporte Vector, da un ajuste mucho más
definido tanto para la parte de evaluación como para la parte de validación.[32]

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 Ilustración 15. Resultados de Predicción de Redes Neuronales Artificiales, Error residual, Grafica de
Test, Predicción Gaussiana

Modelo Validación Test

GPR 0.67 0.9

Tree Fine 0.33 0.84

ANN 0.64 0.7

LR 0.63 0.8

SVM 0.58 0.59

Tabla 2. evaluación de Modelos sin PCA.

Partiendo de este análisis sin PCA, se tiene cada uno de los resultados, donde está la predicción de las
redes neuronales, Predicción Gaussiana, error Residual y Grafica de Testeo, se puede ver que al realizar el
proceso sin PCA, los resultados numéricamente representan un cambio significativo en lo relacionado a
entrenamiento y test, puesto que para GPR se puede ver que en validación con PCA arrojaba 0.55 mientras
que sin PCA arroja 0.67, en cuanto a Test sin PCA es de 0.9 y con PCA es de 0.78, en resumidas cuentas el
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resultado numérico cambia en cuestión, debido a que al no realizar la reducción de dimensiones no se genera
tanta varianza, caso contrario que al reducir lo que se obtiene es un mapeo lineal de datos referente a un
espacio inferior de tal forma que esa varianza de datos en representación de las pocas dimensiones presentes
se va amplificando.

3.6.2 OM

Ilustración 16. Medición de Materia Orgánica, Graficas de Conjunto de Datos original y de predicción

|PCA 97% Varianza +

Características

Modelo Test Validación

GPR 0.32 0.92

Regresión
lineal 0.08 0.76

Tree Fine 0.01 0.82

SVM -0,11 0.6

Tabla 3.Medición de PCA y Varianza para Materia Orgánica

Para la materia orgánica se puede ver que el Proceso Gaussiano tiene un buen comportamiento, en cuanto
a Test y Validación con respecto a los otros métodos de Regresión, en primera instancia los resultados de la
tabla con una reducción de dimensiones del 97%, se refleja en la gráfica de predicción, pues allí se puede
denotar como hay una parte de test de 0.32, y una de validación o entrenamiento de 0.92, por lo que en
relación con los datos y comparándolo contra el pH, en si la medición varía bastante y al compararla entre
otros métodos, quien presenta el segundo mejor comportamiento es la regresión lineal.

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 Ilustración 17. Gráfica de Predicción de Regresión lineal, Test de Predicción de Materia Orgánica,
Error de Regresión Gaussiana de Materia Orgánica

Modelo Validación Test Observaciones

Kernel
GPR 0.71 0.92 Exponencial

ANN 0.66 0.76 10 neuronas

LR 0.66 0.82 0

SVM 0.59 0.66 Kernel Q

Tabla 4.Datos de Medición sin PCA para Materia Orgánica

Una vez más se observa que al no aplicar Reducción De Dimensiones se presentan mejores resultados,
pues en este caso al no trabajarlo con PCA, en primera instancia se le agrego un Kernel exponencial al GPR,
donde se obtuvo un mayor resultado en la parte de la validación y/o entrenamiento obteniendo 0.71, pues por
tal motivo se puede ver como entre lo que son redes Neuronales, Regresión lineal y SVM, se presentan buenos
resultados, por la cantidad de muestras y el comportamiento de la respuesta frente a lo estimulado.

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3.6.3 Ca

Ilustración 18. Grafica de Predicción de Ca y Conjunto de Datos Original

Modelo Validación Test Observaciones

Kernel
GPR 0.27 0.53 exponencial

ANN 0.11 0.14 10 neuronas

LR 0 0 0

SVM -0,03 -0,03 Kernel Q

Tabla 5. Datos obtenidos para cada Método de Regresión del Calcio

Los datos obtenidos de la tabla del calcio se dan para un análisis con Reducción de Dimensiones, donde
por supuesto una vez más se toma como referencia el GPR con un resultado de validación de 0.27 con
respecto a un test de 0.53, la predicción da un resultado un poco más robusto debido a que se usó un Kernel
de tipo Exponencial, efectivamente para el procedimiento a implementar se puede observar por ende que tal
como pasa con los otros componentes analizados previamente, al aplicar PCA, la medición es menor debido
a que en la extracción de características se presenta mayor varianza.

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Ilustración 19. Grafica de Predicción de Regresión lineal, Test de Predicción de Ca, Error de Regresión
Gaussiana de Ca

Modelo Validación Test Observaciones

Kernel
GPR 0.47 0.86 Exponencial

ANN 0.45 0.66 10 neuronas

LR 0.4 0.69 0

SVM 0.32 0.35 Kernel Q

Tabla 6. Datos de Medición sin PCA para el Calcio

Una Vez más se observa que al no aplicar Reducción De Dimensiones se presentan mejores resultados,
pues en este caso al no trabajarlo con PCA, en primera instancia se le agrego un Kernel exponencial al GPR,
donde se obtuvo un mayor resultado en la parte de la validación y/o entrenamiento obteniendo 0.47, pues por
tal motivo se puede ver como entre lo que son redes Neuronales, Regresión lineal y SVM, se presentan buenos
resultados, por la cantidad de muestras y el comportamiento de la respuesta frente a lo estimulado.

3.7 Pruebas con Conjunto de datos para pH

Como primer paso se realizó la implementación de los modelos para estimación de variable pH.
Empleando el conjunto de Datos “NIRSData” que cuenta con las características de entrada por absorbancia
de espectro Vis/NIR de muestras de suelo analizadas en el laboratorio de Análisis de suelo de Agrosavia se
obtiene lo siguiente:

 19 características que comprenden el rango de 451 a 604 nm con espaciado de 8,5 nm entre muestra
y muestra.
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  La etiqueta a predecir será pH, la que previamente se ha validado mediante pruebas quimio métricas
en laboratorio.

Los métodos a emplear fueron SVR(Regresión de soporte Vectorial), Regresión lineal múltiple y
perceptrón multicapa(MLP), por lo que todo el procedimiento consistió en eliminar las columnas que no son
necesarias o que por ende cuentan con NAN, por medio de la librería pandas, pasando de 6178 datos a un
total de 3285 muestras, por lo que 2893 cuentan con valores NAN en sus etiquetas, todo se basa en un
comentado por Agrosavia, todo cuenta con una regularización de datos de tal modo que permita mejorar el
procesamiento usando los métodos inicialmente mencionados.

Al implementar los modelos con las técnicas nombradas se cuenta con las siguientes métricas y graficas:

Ilustración 20. Resultados Grafico-numéricos de SVR, Regresión lineal múltiple y MLP

Partiendo de cada uno de los datos obtenidos se parte que los modelos de regresión se ajustan en base a
los resultados de las métricas base presente partiendo de la regresión por medio de GPR, procesos Gaussianos
asociados a regresión y redes neuronales, que permitieron, llevar un mejor análisis en la variable de
coeficiente de determinación de 0.92 y 0.76 respectivamente, mediciones considerables para aplicar por
medio de las técnicas de predicción de las propiedades del suelo.

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Capítulo 4
Implementación
4.1 Caracterización
Como primer paso se utilizan los dispositivos pertinentes para análisis de espectro, estos se componen
del módulo de sensor multiespectral AS7341 y uso del espectrómetro Thorlabs de referencia CCS200/M.
para caracterizar el espectro en absorbancia y reflectancia mediante pruebas en diferentes materiales,
obteniendo:

Ilustración 21. Gráfica de Intensidad vs Longitud de onda para caracterización del led de sensor AS7341

Esta figura de por si representa la firma espectral del Led en la longitud de onda de 451nm, con los
parámetros suministrados por el software del espectrómetro Thorlabs, se puede apreciar el primer pico sobre
451nm donde se aprecia un nivel de reflectancia en el espectro de color azul (ubicado sobre los 450nm), una
mayor reflectancia se ve sobre el color verde donde este espectro esta sobre 530nm aproximadamente, y baja
reflectancia en el color rojo cercano a 650nm.

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Ilustración 22. Grafica de Intensidad vs Longitud de onda para caracterización del led de sensor AS7341
sin acetato.
Esta figura al igual que la anterior la medición se realizó sin acetato, para evaluar no solo su aspecto
espectral, sino para verificar como es el comportamiento sobre una superficie oscura, donde sus picos están
sobre los 450 y 560nm, donde su espectro se encuentra entre los colores azul, verde, amarillo y naranja.

Ilustración 23. Tabla de Datos y Grafica de Intensidad vs Longitud de Onda, para color azul y
anaranjado.
En la siguiente tabla con grafica anexa de Intensidad vs Longitud de Onda, se puede ver cada uno de los
picos entre las longitudes de onda del color azul y naranja, donde se toma en cuenta en términos de la
intensidad y las diferentes distancias el rango de medición, así como el comportamiento espectral de los
diferentes picos.

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 Ilustración 24. Tabla de Datos y Grafica de Intensidad vs Longitud de Onda, para color azul y
anaranjado en medición sin acetato.
La ilustración presente indica de por sí parte de la medición de espectro del color violeta al rojo, dado
pues que en este caso tomo una cobertura de colores un poco más extensa que la figura anterior, las
mediciones tomadas se pueden observar que se dio en puntos donde no se presenten ruidos o perturbaciones,
donde esa intensidad se puede lograr detallar que se encuentra cercana a los 3 dB.

Ilustración 25. Medición y caracterización de luz led de sensor AS7341 al someterlo con acetato, para
longitudes de onda entre 400 y 825nm
Para este caso la medición se comenzó realizando ya no bajo una superficie oscura, sino sobre una
superficie que posteriormente pueda indicar la viabilidad para suministrar muestras, pues en este caso el
acetato al ser algo endeble o débil, muestra de por sí que es traslucido, pues en este caso con el software de
Thorlabs se puede ver que la gráfica cuenta con dos picos, el primero cercano a los 450nm y el segundo sobre
los 530nm, donde son los colores que van en el espectro del azul al verde.

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 Ilustración 26. Caracterización de luz de sensor AS7341 sobre lamina de Acetato para longitudes de
onda de 448 a 530nm.
Tomando las mediciones con el led del sensor, se busca al someter la lámina de acetato con la luz evaluar
con exactitud los rangos en los que se presenta reflectancia, que en ellos tal como indica la figura están sobre
448 a 530nm aproximadamente.

Ilustración 27. Gráfica de Intensidad vs Longitud de onda para caracterización del led de sensor AS7341
suministrando caja de Petri.
La ilustración 27 se ve a continuación, indica un mejor comportamiento cuando se realiza la medición
sobre la caja de Petri, respecto a la lámina de Acetato, pues de por si, al ser transparente y como es algo frágil,
muestra un mayor índice de luz, por lo que cuando se analiza el comportamiento de los picos se ve un
comportamiento espectral menos ruidoso, más definido a su vez no se presentan cotas sobre la gráfica, es
más definido para estar entre 450 y 540 nm, que es donde están los colores que se analizaron en las previas
mediciones con acetato y sin él.

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Ilustración 28. Tabla de Datos y Grafica de Intensidad vs Longitud de Onda, para color violeta y verde.
En base a la anterior ilustración se observa la cantidad de datos tomados sobre los cuales, se presentan
los diferentes picos, en los cuales se puede ver el cómo se comporta la intensidad respecto a la longitud de
onda, gracias a eso se puede ver como es el comportamiento espectral junto con los picos sobre los que llega
la gráfica, de igual forma se puede ver que se encuentra en los rangos de 450 nm a 530nm.

Ilustración 29. Evaluación de Rango de Caracterización de luz led del sensor AS7341
Para este caso lo que se evalúa es el rango en el que se caracteriza la luz del sensor, se presenta una cota
antes de los 443nm, y en el otro rango antes de cortar en 0 dB, se puede ver un pico cercano a los 530nm.

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 Ilustración 30. Gráfica Espectral de Intensidad vs Longitud de Onda para caracterización de sensor
AS7341 sin caja de Petri.
La medición al realizarse sin la caja de Petri, presenta variaciones un poco evidentes, pero pese a lo
anterior mencionado, se encuentra en el mismo rango, donde la reflectancia queda centrada sobre los colores
azul al verde.

Ilustración 31. Grafica de Absorbancia con caja de Petri, para medición de Espectro.
La figura 31 de por si establece que el rango de absorbancia en la caja de Petri para la medición de
espectro está entre los colores azul y rojo aproximadamente donde los colores que se reflejan allí van desde
el amarillo, naranja, rojo al violeta, por eso en términos de espectroscopia, lo que se busca es medir la
intensidad de color con respecto a una longitud de onda comparando sobre otra superficie que contenga un
mismo rango absorbente.

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 Ilustración 32. Absorbancia de caja de Petri en conjunto con luz led de sensor AS7341, medición entre
colores violeta al rojo, longitudes de onda de 425 a 608 nm.
Tal como se mencionó para la figura anterior, y en relación con la siguiente imagen, se puede observar
que cuando hay una incidencia de luz sobre un cuerpo traslúcido, esa luz se absorbe sobre la superficie con
la que se está midiendo, pues en este caso sobre la caja de Petri, donde se puede ver que tiene una mayor
cantidad de luz absorbida y esto a su vez indica que menos luz se transmite.

Ilustración 33. Medición de Absorbancia en la caja de Petri, para análisis de Espectro por medio de led
de sensor AS7341.

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 Ilustración 34. Medición de Absorbancia en lámina de Acetato, para análisis de Espectro por medio de
led de sensor AS7341.
De la ilustración presente, se puede indicar que, en la lámina de Acetato, cuando se toma diferentes
mediciones, se puede ver que la medición de absorbancia varía y por ende hay una mayor transmisión de luz
y una menor absorbancia, la razón se da preciso porque la lámina es traslucida y no le deja pasar tanta luz, el
espectro mostrado allí presenta una mayor transmisión y una menor absorción.

Ilustración 35. Medición de Absorbancia en lámina de Acetato, para análisis de Espectro por medio de
led de sensor AS7341, evaluando espectros con longitud de onda de 428 a 700nm.

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 Ilustración 36. Medición de Rango de Absorbancia para caja de Petri en longitudes de onda de 425 a
608nm.
Por medio del software de Thorlabs, se realiza un zoom a la imagen para poder ver el espectro de más
cerca, pues de por si la caja de Petri, es sometida a un espacio donde al ser transparente, muestra que hay
mayor incidencia de luz, por lo que hay una mayor transmisión de luz.

Ilustración 37. Caracterización de luz led del sensor AS7341

4.2 Interfaz de Usuario

La interfaz de usuario o GUI se define como el espacio de interfaz entre una persona y máquina, es una
herramienta informática que tiene como finalidad ser más interactiva con el cliente o usuario final, para la
actividad a realizar es importante dado que se requiere de trabajar con el módulo serial y diferentes comandos
preestablecidos, partiendo de las herramientas y mediciones proporcionadas por el sensor, donde se mostrará
a continuación la representación de la GUI para el sensor AS7341:

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 Ilustración 38.Interfaz Gráfica de Usuario
La interfaz de usuario (GUI), se debe Especificar la identificación de la muestra, el número de
mediciones, pues en este caso solo costa de dos botones para dar ejecución, en el primero se almacenan todos
esos datos y con el segundo que se encuentra definido previamente(empezar medición), se ejecuta de forma
serial la transmisión de datos del sensor, por lo cual se van guardando esos datos en una extensión predefinida,
y allí el archivo con la extensión que es de tipo CSV queda cargado en la hoja de ruta del sistema.

4.3 Empaque
Para poder realizar una medición más dinámica, como primera actividad se realiza un diseño 3D,
mostrando como es el empaque en dimensiones, con espacios para acomodar el módulo con que se toma las
mediciones, a su vez un espacio que se adecua para acomodar la Raspberry pi pico, por donde se va a llevar
a cabo la programación del sensor e incluso por donde se compilará el código donde se cargaran los datos
vía serial, también cuenta con un espacio donde se inserta una caja de Petri donde se depositará la muestra:

Ilustración 39. Estructura Interna - Diseño de caja empaque de Raspberry Pi Pico

La ilustración presente muestra el diseño donde se encuentra el espacio para la ranura de la Raspberry,
este diseño se realizó con la finalidad de poder realizar un sostenimiento de la Raspberry y el sensor AS7341,
para que este quede sostenido, y no presente mayores variaciones en las mediciones.

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 Ilustración 40. Diseño con Caja de Petri, caja Protectora, carcasa con tapa, Caja de Raspberry pi Pico,
ensamblado.
A continuación, lo que se muestra acá es cada una de las diferentes piezas ensambladas, todas en conjunto,
la ranura de la Raspberry, sostenida con la ranura que se adecuó para la caja de Petri, el case protector, para
que todo quede sostenido y finalmente la carcasa que lo protege de diferentes aspectos.

Ilustración 41. Diseño de carcasa estructura interna, soporte par caja de Petri y muestra

Ilustración 42. Estructura de Diseño Parte Superior

Para el caso presente se observa el diseño desde una parte superior y frontal, partiendo de las 2
ilustraciones presentes que es donde se muestra como son los muros, como estos a su vez van sosteniendo
todo el diseño planteado, con cada uno de los espacios y dimensiones previamente definidos
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 Ilustración 43. Estructura Parte Frontal

Ilustración 44. Diseño Conjunto Separado, Ranura Caja de Petri, Case, Carcasa con Tapa y Caja de
Raspberry pi Pico
La siguiente imagen muestra cada una de las piezas diseñadas por aparte, de tal modo que se pueda
visualizar de tal modo, como van, en qué dirección se colocan, cada una de las piezas, pues de por sí, se
muestran por separado, para ilustrar el diseño y el orden en que cada una de estas piezas se colocan para
realizar las mediciones posteriores.

Ilustración 45. Diseño de tapa

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4.4 Protocolo de Pruebas
Primero que todo se realiza un proceso de preprocesamiento de datos, de él depende la compilación de
todo lo referente incluso desde una buena limpieza de los datos, tarea fundamental para poder realizar
diferentes tipos de análisis y en la aplicación de los diferentes modelos de aprendizaje, en ello consiste
eliminar, corregir o cambiar algunas características que no permitan realizar dicho análisis, por lo que ello
cuenta con detectar las diferentes anomalías entre las filas y columnas, todo lo anterior se realiza por medio
de la librería de pandas, generando cada uno de los diferentes Dataframes, por lo que de esta forma se parte
de los datos que difieren significativamente de un promedio o rango observado del resto de datos, por lo que
se puede apreciar.

También se revisa la cantidad de datos nulos, los que no han introducido la información suficiente de
elementos de una variable, por ello parten de 2 cuestiones que no se estima bien la variable o por el contrario
algo que ocurrió externamente e inclusive genero impedimentos en la recolección de los datos, por ello la
razón no se pudieron establecer, por lo que de esta forma se puede generar una extrapolación para una
transformación por lo que para ello retomando en el caso de los modelos a aplicar, se eliminan o transforman
esos datos erróneos que no ayudan a que la información tenga un sentido, posteriormente se realiza la
detección de datos nulos, por filas y columnas por medio del comando isnull, posteriormente para esa
limpieza de datos se usa el comando dropna(), para eliminar las filas con datos nulos, y también para eliminar
ciertas columnas que no se usan, la limpieza con dropna(), parte de detectar los datos vacíos, y posteriormente
con describe() para establecer las estadísticas de cada uno de los datos, todo lo anterior también se hace con
ayuda de un diccionario, que permita eliminar cada dato que cuenta con vacíos, posteriormente se genera
cada archivo csv delimitado, donde por ende se establece cada una de las variables dimensionales(x,y) para
generar los procesos de entrenamiento y validación, de ahí cuando se defina lo anterior se realiza la
implementación de modelo si se trata de una red neuronal, una regresión lineal múltiple o un Soporte Vector
de Regresión, donde se establezca no solo el modelo, sino la precisión que brinda cada uno de ellos con un
modelo de regularización que para la implementación y operación se usa la regularización Ridge, finalmente
se realizan las diferentes graficas informativas de cada uno de los modelos para establecer el comportamiento
de la validación, de los valores predichos, entre otras.

Todo lo experimental y relacionado con la medición, parte de trabajar con un monto de muestras que son
brindadas por Agrosavia, de igual forma se cuenta con diferentes procedimientos para análisis, en primera
instancia después de recibir esas muestras se debe abrir el espacio donde está la ranura donde se colocará la
caja de Petri y se pone un poco de la muestra, por lo que posteriormente, cuando se realice eso se guarda la
muestra sobre el empaque, posteriormente se introduce la información de la Interfaz gráfica, los LED del
sensor así como el número de datos tomados para cada muestra, pues en sí cada proceso se realiza por
separado uno a uno, para cada muestra de suelo, se evalúan cada uno de los resultados obtenidos así como
también se unen posteriormente en una base de datos donde se observara la información espectral con todas
las características y etiquetas de propiedades a analizar, posteriormente se realiza una evaluación pertinente
con cada uno de los modelos pertinentes de regresión, con sus debidos parámetros, como preprocesamiento,
entrenamiento de datos, entre otros.

Con lo anterior, finalmente se toma cada uno de los resultados con los análisis realizados, partiendo de
comparar y evaluar cual es el modelo más acertado, adecuado y pertinente para la predicción de las variables,
de allí se toma un marco de referencia para sintonizar los datos dentro de la Interfaz de usuario y está, por
tanto, muestre los valores de la predicción en tiempo real, sincronizando cada uno de los datos tomados con
lo que se suministra vía serial.
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Capítulo 5
Operación y Resultados

5.1 Análisis de Resultados

Muestra 1

Tendencia Muestra 1

F1
F2
40
30 F4
20 F3
10
0 F5
-10 0 10 20 30 40 50 60
-20 F6
-30 F7
-40
-50 F8
-60

Ilustración 46. Tendencia de ruido en espectro de muestra 1

La gráfica presente muestra la tendencia de ruido de espectro de la primera muestra, donde se puede
observar una tendencia aceptable en las bandas F1 a F9, con excepción a F2 que es la banda del color Índigo
correspondiente a 445nm, pues se detalla que asciende y desciende por encima del promedio de las demás
bandas, indicando una discrepancia añadida al ruido por un factor no caracterizado, pero admitido como
influencia directa de los leds blancos fríos integrados en el diseño del fabricante del sistema (DFROBOT)
del sensor multiespectral AS7341.

Ilustración 47. Cuantización y análisis de tendencia y linealidad en espectro muestra 1

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 La figura 47 muestra la cuantización lineal del barrido espectral para la muestran. Esto permite analizar
la linealidad de las medidas obtenidas por el sensor y la posibilidad de que esa muestra se comporte de manera
normal o con tendencia gaussiana.

Ilustración 48. Histograma en muestra 1

Lo anteriormente establecido en cada figura planteado de las 46 a 48, se plantea por medio de un análisis
estadístico, que consiste en realizar como primer paso un análisis por momentos. Para esto se obtiene los
puntos mínimos y máximos de cada uno de los datos, la media o valor media para cada una de las bandas
junto con la desviación estándar. Posteriormente con esos datos obtenidos se procede a realizar un boxplot o
diagrama de cajas, donde se visualiza y compara cada una de las distribuciones pertinentes, junto con la
tendencia de cada uno de los datos por medio de cuartiles.

Lo anterior facilita el análisis descriptivo para establecer el comportamiento por medio de un histograma
y la distribución del espectro en la muestra, ya sea PDF o cdf, esto para establecer la probabilidad de
establecer variables aleatorias con un cierto valor o valores de pesos de llenado o la probabilidad acumulada
sobre un valor especifico, en este caso para cada una de las bandas.

Finalmente se realiza un análisis de tendencia restando el dato obtenido en cada una de las bandas entre
la media, esto se hace para identificar discrepancias en la huella espectral de la muestra.

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 Muestra 2

Ilustración 49. Espectro según promedio para muestra 2

Ilustración 50. Tendencia de ruido en espectro de muestra 2

Ilustración 51. Diagrama de Cajas por bandas de espectro (muestra 1)

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 Las figuras 49 a 51 al igual que para la muestra 1, se encargan de detallar el análisis descriptivo del
espectro obtenido así:

Como observación fundamental se parte de lo siguiente: que el espectro obtenido y graficado en la figura
49, demuestra una tendencia normal o gaussiana con una desviación atípica en la banda de 445 nm,
caracterizada por el mayor pico que presenta el espectro de los leds que influyen directamente en la
absorbancia de la luz emitida y reflejada en el material.

Ilustración 52. Gráfica de Maquina Soporte Vectorial Optimizable sin Escalizar.

Para establecer un análisis de datos más exhaustivo y completo, se debe realizar un buen
preprocesamiento, en esta etapa comienza a establecerse 3 pasos fundamentales: escalización, normalización
o estandarización, en este caso se toma cada uno de los 90 datos obtenidos de cada una de las muestras y se
establece un proceso donde se escala cada una de las características en un rango determinado, y esa escala se
traduce de forma individual partiendo del conjunto de entrenamiento, pues en este caso, se realiza el primer
análisis para observar el comportamiento gráfico sin realizar un proceso que implique un escalizado con la
función MinMaxScaler, para este caso se usa el error cuadrático medio para evaluar un conjunto de datos,
comparando el valor predicho contra el observado, en este caso se hace para los valores de validación para
poder establecer una relación entre cada uno de los datos.

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 Ilustración 53. Gráfica de Maquina Soporte Vectorial de tipo Cúbico
Cada una de las gráficas representan un estándar de datos que varía según el análisis y modelo a analizar,
en este caso, el análisis sea toma con un SVM de tipo Cúbico para una sesión de test, sirve para entender la
desviación estándar de la varianza inexplicada, y entender cada una de las propiedades partiendo de una

respuesta indicando cada uno de los valores bajos, mostrando un mejor ajuste.

Ilustración 54. Gráfica de Proceso de Regresión Gaussiana, ajuste de funciones, Kernel y desviación
estándar
Acá varía un poco debido a que lo que se busca es evaluar los Hiperpárametros de optimización para un
proceso Gaussiano, donde en primera instancia los procesos Gaussianos de por si parten de una distribución
de probabilidad sobre funciones aleatorias, partiendo de colecciones infinitas de funciones sobre un
subconjunto de variables aleatorias finitas, en este caso parte de un método genérico de aprendizaje
supervisado para resolver problemas de regresión y clasificación, en este caso la predicción interpola cada
una de las observaciones, la predicción probabilística de por si es Gaussiana que puede calcular diferentes
intervalos para establecer los datos que tan confiables son, así como también en base a ellos realizar los
ajustes pertinentes, de por si tiene un cálculo computacional alto, pero de igual forma, es uno de los
procedimientos que en su gran mayoría dan buenos resultados. [36][37]
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 Ilustración 55. Configuración de SVM tipo Cúbico, con errores graficados.
Para este caso se analiza gráficamente cada uno de los datos predichos, verdaderos y de error, donde se
configura cada uno de los hiperpárametros, se resumen con unas constantes y configuraciones según el
modelo, partiendo en primera instancia de una suavización del contorno y partiendo a su vez la función
Kernel que se implementa en el sistema.

Ilustración 56. Grafica de Datos Verdaderos contra predichos para SVM Cúbico

Ilustración 57. Gráfica de datos verdaderos, Predichos y errores

Las ilustraciones 56 y 57, muestran respectivamente cada uno de los datos para un SVM de tipo Cubico
y un Proceso Gaussiano de Regresión optimizable, el comportamiento en referencia con cada uno de los 90
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datos para cada uno de los diferentes modelos, los diferentes comportamientos con referencia a RMSE, para
establecer una precisión en cada uno de los datos obtenidos para el análisis pertinente de características y
etiquetas con referencia al pH.

Ilustración 58.Asignación de Etiquetas y Características para análisis de PH.

La ilustración 58 indica la importación del conjunto de datos, pues se establecen los datos en un
Dataframe de ahí pasar a definir la ubicación para PH, en este caso con la función iloc se establece sobre el
corrimiento hasta 9, y para Materia Orgánica en 10, por lo que de allí se procede a evaluar el sistema por
medio del modelo pertinente para este caso se realiza con un modelo de Vector soporte de Regresión donde
en una primera instancia se tiene un resultado de 0.53 que se encuentra en un rango aceptable.

Ilustración 59.Implementación de SVR por medio de Validación cruzada

De allí se puede establecer que se realiza un procedimiento de SVR, donde lo primero que se establece
son las etiquetas y características, donde en x se tiene los datos por donde van las bandas, para el eje y se
tiene los datos de pH, donde posteriormente sobre cada uno de esos datos lo que se hace es un proceso de
entrenamiento de 75%, por ende infiere que el proceso de testeo es de 25%, por ello se define el proceso con
el que se va realizar el SVM, que va contar un Kernel de tipo RBF , que es el que se encarga de mapear el
espacio de entrada en un espacio dimensional infinito, una variable de Box Constraint o “C” valor 1000, de
ahí se define un valor de Gamma 1 y un épsilon de 0.1674, estos valores se basan en un rango para obtener
una estabilización de un sistema de regresión, que fue previamente implementado en Matlab por medio de
Regression Learner, donde se obtienen cada uno de los hiperpárametros optimizados y los que se
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recomiendan implementar para obtener un buen trazado lineal, estas gráficas se muestran posteriormente,
para el caso de la figura que se está mostrando se tiene un resultado en MSE de 1.43, en rpd de 0.44 y la
precisión de modelo de 0.6939, un rango estable para tener un entrenamiento y testeo definidos previamente.

Ilustración 60.Gráfica de SVR de datos de pH Predicho vs Validación.

La siguiente gráfica plasma cada uno de los datos predichos con respecto a los de validación y para el
caso a evaluar, indica que se presenta un sesgo entre cada uno de los diferentes datos, por lo que para ello
esta gráfica se obtiene partiendo de los datos obtenidos previamente.

Ilustración 61. Datos para Gráfica de SVR obtenidos con Matlab

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 Ilustración 62.Datos para Gráfica de SVR
La siguiente gráfica que se está mostrando a continuación indica claramente cada uno de los datos
obtenidos para el PH, pues para el caso presente se obtiene un resultado de precisión de 0.69, por lo que al
encontrarse en un rango de 0.5 a 0.75 se encuentra en un rango aceptable, de por si este rango indica que, si
hay un sesgo, pero es bajo.

Ilustración 63. Grafica de SVR Predicho vs SVR Actual

La gráfica de por si indica un sesgo sea por la línea verde con la regresión lineal esperada e incluso con
los datos Predichos por medio de Regresión lineal(Grafica Azul), independientemente de los datos sesgados
y los que se encuentran un poco alejados, en el punto donde interceptan cada una de las rectas se puede ver
que hay una precisión un poco relativa en cuanto a la cantidad de datos sobre la cual se realiza el proceso, si
se puede evidenciar una proximidad entre cada una de las rectas de igual forma se puede establecer un mejor
desempeño, partiendo del porcentaje de testeo y los resultados de precisión obtenidos, para el caso presente
se tiene un resultado de precisión de 0.53.

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 Ilustración 64.Grafica de SVR Test
La gráfica de por indica que cada uno de los puntos obtenidos forman parte del resultado del testeo, pues
esta grafica refleja cada uno de los puntos obtenidos para cada uno de las muestras, presenta sesgo entre cada
uno de los datos, pero igualmente estos datos obtenidos Validación son los que se encargan de indicar la
relación de precisión de 0.53.

Ilustración 65. Grafica de SVR Test de 0.54

La gráfica indica que cada uno de los puntos obtenidos forman parte del resultado del testeo, pues esta
grafica refleja cada uno de los puntos obtenidos para cada uno de las muestras, presenta sesgo entre cada uno
de los datos, pero igualmente estos datos obtenidos Validación son los que se encargan de indicar la relación
de precisión de 0.54.

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 Ilustración 66. Datos obtenidos por Regression Learner con precisión de 0.64.
En primera instancia lo que se hace es tomar cada uno de los datos, y se ponen en una tabla en Matlab,
de ahí se importan esos datos del Conjunto de datos a Regression Learner, de ahí posteriormente lo que se
hace es escoger cada uno de los modelos con cada uno de los hiperpárametros y se procede a evaluar cada
uno de los datos, por lo que posteriormente se escoge SVM y el software toma cada uno de los Datos
pertinentes de coeficiente de correlación, de ROOT MEAN SQUARE ERROR(RMSE), entre otros para evaluar
el modelo sea por train o test, dependiendo del análisis que se vaya a realizar e incluyendo a su vez el modelo
con el que se va a realizar.

Ilustración 67. Grafica obtenida por Regression Learner con precisión de 0.64.
Cada uno de los datos obtenidos son cada uno de los puntos del SVR por medio de Regression Learner
software de Matlab donde allí se procede a mostrar como los puntos reflejan un buen coeficiente de
correlación, dado que se toma con respecto al número de mediciones y bandas, para el caso presente pudo
darse un resultado mejor, debido a que se presentó un sesgo entre cada uno de los diferentes datos, pero dado
lo anterior, se indica claramente que se encuentra en el rango de medición de 0.5 a 0.75 donde la medición

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del coeficiente de correlación y precisión del modelo indican que se obtiene 0.64 un resultado ampliamente
bueno.

Ilustración 68. Grafica de SVR Test de 0.69

Con respecto a las anteriores gráficas se obtiene un resultado ampliamente bueno, primero dado que se
evaluó bajo diferentes pruebas de test(de 0.25 a 0.4), se puede ver que hay mayor número de puntos sobre la
línea verde que es donde se espera que haya una mejor precisión con respecto a la predicha, pues de por si es
importante recalcar que al evaluar el SVR por medio de validación cruzada se obtiene que las predicciones y
cada una de los puntos de las gráficas establecidas y obtenidos indica una buena estabilidad con el modelo
implementado.

Ilustración 69. Grafica de SVR Test

La gráfica de por sí indica que cada uno de los puntos obtenidos forman parte del resultado del testeo,
pues esta grafica refleja cada uno de los puntos obtenidos para cada una de las muestras, presenta sesgo entre
cada uno de los datos, pero igualmente estos datos obtenidos Validación son los que se encargan de indicar
la relación de precisión de 0.69.

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 Ilustración 70. Datos para Gráfica de SVR con resultado de 0.82
La siguiente gráfica que se está mostrando a continuación indica claramente cada uno de los datos
obtenidos para el PH, pues para el caso presente se obtiene un resultado de precisión de 0.82, por lo que al
encontrarse en un rango mayor a 0.75 se encuentra en un rango excelente y óptimo para el modelo con de
Regresión a evaluar, de por si este rango indica que el sesgo presente es muy mínimo, y presenta una mejor
estabilidad sobre el modelo, por lo cual es una de las medidas con mejor resultado de precisión.

Ilustración 71. Grafica de SVR Test

La gráfica de por sí indica que cada uno de los puntos obtenidos forman parte del resultado del testeo,
pues esta grafica refleja cada uno de los puntos obtenidos para cada uno de las muestras, presenta sesgo entre
cada uno de los datos, pero igualmente estos datos obtenidos Validación son los que se encargan de indicar
la relación de precisión de 0.82.

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 Ilustración 72. Grafica de SVR Test de 0.82

Partiendo de cada una de las mediciones implementadas en Python se puede ver que al tener estas gráficas
de predicha vs esperada, se puede ver un mejor resultado y por ende la figura que se está mostrando junto
con la siguiente que es la que indica cada uno de los parámetros a implementar sobre código en software, se
puede ver la precisión con la que se comporta el modelo y sobre todo que los datos obtenidos parten de tener
un K-fold de 5, para una excelente validación por medio de Validación Cruzada.

Ilustración 73. Código de SVR con precisión de 0.82

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5.2 Análisis de Resultados Por Análisis de
Componentes Principales (PCA)

Ilustración 74. Análisis por PCA para Cantidad de componentes con 99% de varianza explicada.
La gráfica de análisis por PCA parte en primera instancia de definir uno de los componentes sobre el cual
se va realizar el establecimiento de características y etiquetas, para eje x, se toma como referencia cada uno
de los componentes que en este caso son las bandas, con los cálculos de la primer y segunda derivada, en las
cuales se obtienen 24 componentes, y para el eje Y lo que se define es la etiqueta de pH, de ahí se parte de
escalizar cada uno de los datos con un entrenamiento, posteriormente se establece que el análisis se realiza
con el 99% de la varianza explicada donde se establece como parámetro óptimo para realizar la reducción
dimensional, con lo que posteriormente el procedimiento a realizar consiste en establecer un entrenamiento
con los datos escalizados y de ahí definir un proceso donde se realiza la transformación, de ahí se toma como
base fundamental cada uno de los parámetros por donde se va a realizar el plot de la gráfica tomando cada
uno de los datos del radio de varianza explicada, en este caso se define un cut-off o región donde se realiza
el corte de la varianza.
Radio de Varianza Explicado para Análisis de Componentes Principales
Bandas Espectrales sensor
0 1 2 3 4 5 6 7 8
0 0.849096 0.103681 0.035542 0.0057540 0.0031627 0.0017015 0.0005431 0.0003507 0.0001674
6
Tabla 7. Bandas Espectrales para Sensor AS7341
Primera Derivada
9 10 11 12 13 14 15 16
5,93E-05 4,27E-05 3,72E-05 2,56E-04 2,41E-04 1,41E-05 1,14E-04 9,95E-06
Tabla 8. Primer Derivada definida por Bandas
Segunda Derivada
17 18 19 20 21 22 23
7,99E-06 6,03E-06 5,87E-06 5,05E-05 3,82E-06 3,36E-05 2,72E-07
Tabla 9. Datos de Segunda Derivada por Bandas

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 Las tablas de las mediciones implementadas en Python, son resultado de un vector de varianza explicada
por cada dimensión, esto se da gracias al parámetro (pca.explained_variance_ratio_), de por si al ejecutar
este comando da una matriz donde cada uno de los componentes, y uno de ellos se encarga de explicar la
varianza total del sistema a analizar.

Ilustración 75. Obtención de Grafica de Variance Ratio vs Number of Components

La gráfica de la ilustración presente parte de realizar el análisis por PCA, obteniendo cada uno de los
datos de la varianza explicada y a su vez esta se obtiene de analizar la relación matemática, partiendo de un
retorno de un vector que parte de la relación matemática de los eigenvectors con respecto al total de
eigenvalues.

Tabla 10. Tabla de Métricas de Regresión con Validación cruzada, analizando por PCA y sin PCA

5.3 Resultados de Matlab para modelos de

Regresión sin y con PCA.
Magnesio

Ilustración 76. Gráfica de Predicción de modelo con Resultado de coeficiente de Correlación

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 La gráfica de Predicción de modelo con resultado de Coeficiente de Correlación para Validación se tiene
de 0.46 para validación, para el Magnesio.

Ilustración 77. Resultados de Regresión Proceso Gaussiano para Test

La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para test, donde el
resultado obtenido es con 0.97, validación de 0.55, y un RMSE test de 26.5

Ilustración 78. Medición GPR (test) con Reducción dimensional (PCA)

La medición presente se le agregó el componente de reducción dimensional, donde se define de acuerdo
a las 9 bandas del sensor, teniendo como resultado un coeficiente de correlación(R 2) de validación de 0.61 y
de test en 1 con un RMSE de 6.145.

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 pH

Ilustración 79. Conjunto de Datos para Predictores de pH.

La presente sesión de Matlab, en Regression Learner, toma como etiqueta o Respuesta al pH, de allí se
escogen las otras características sobre las que se evalúa el conjunto de datos, partiendo del cual a su vez se
realiza una validación cruzada con 5 k-folds.

Ilustración 80. Métricas de Coeficientes de Correlación para Validación sin PCA para pH.
La mejor relación métrica que se puede obtener al realizar el proceso por validación cruzada sin aplicar
reducción dimensional parte de una regresión por procesos Gaussianos de ahí se obtiene un puntaje de
precisión para un coeficiente de correlación de 0,01.

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 Ilustración 81. Resultados de Procesos Gaussianos por PCA
La regresión por Procesos Gaussianos por medio del análisis de PCA, toma como resultado reduciendo
las dimensiones un coeficiente de correlación de 1.0 para todo lo relacionado con Test, esto se hace por medio
de un proceso Matern 5/2 GPR y un Kernel isotrópico.

Calcio

Ilustración 82. Resultados de Regresión lineal para Test sin PCA.

La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para test, donde el
resultado obtenido es con 0.59, validación de 0.26.

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 Ilustración 823. Resultado de Regresión Lineal por PCA
La Regresión lineal se implementa por medio de reducción de dimensiones obteniendo un resultado de
coeficiente de correlación de 0.52 para test y validación de 0.31, tomando como referencia que solo se reduce
a las dimensiones en las que se encuentra cada una de las bandas del sensor.

Potasio

Ilustración 83. Registro de modelos para Potasio sin PCA

La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para test, donde el
resultado obtenido es con 0.67, validación de 0.44, teniendo como el modelo más optimo sin aplicar la
reducción de Dimensiones el modelo de Maquina Soporte Vector para Regresión.

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 Ilustración 84. Modelos de regresión aplicando Reducción de Dimensionalidad (PCA)
La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para test, donde el
resultado obtenido es con 0.51, validación de 0.22, teniendo que al aplicar Reducción de Dimensiones o PCA
que el modelo más óptimo para análisis de modelos es el modelo obtenido por SVM.

Ilustración 85. Pruebas sin PCA para modelos de Regresión para el Potasio.
La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para test, donde el
resultado obtenido es con 0.57, validación de 0.44, sin aplicar la reducción de dimensiones se tiene que el
modelo más óptimo para análisis de modelos es el modelo obtenido por SVM, más específicos el modelo
cuadrático.

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 Ilustración 86. Prueba de Modelos de Regresión sin PCA para Materia Orgánica
La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para Validación, donde
el resultado obtenido es con -0.02, sin aplicar la reducción de dimensiones se tiene que el modelo óptimo
para análisis de modelos es el modelo obtenido por GPR, más específicos el modelo exponencial.

Ilustración 87. Obtención de modelos aplicando PCA para Validación.

La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para Validación, donde
el resultado obtenido es con 0.07, aplicando la reducción de dimensiones se tiene que el modelo más óptimo
para análisis de modelos es el modelo obtenido por árboles” tree”, más específicos el modelo ” coarse tree”.

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 Ilustración 88. Obtención de modelos aplicando PCA para Test.
La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para Test, donde el
resultado obtenido es con 0.13, aplicando la reducción de dimensiones se tiene que el modelo más óptimo
para análisis de modelos es el modelo obtenido por árboles” tree”, más específicos el modelo ” coarse tree”.
Además de contar con un resultado en validación de 0.07.

Regression Learner MATLAB Muestras Universidad

Potasio

Ilustración 89. Obtención de modelos sin PCA para Validación para Potasio
La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para validación, donde
el resultado obtenido es de 0.26, sin aplicar la reducción de dimensiones se tiene que el modelo más óptimo
para análisis de modelos es el modelo obtenido por redes neuronales.

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 Ilustración 90. Obtención de modelos sin PCA para Test.
La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para Test, donde el
resultado obtenido es de -1.78, sin aplicar la reducción de dimensiones se tiene que el modelo más óptimo
para análisis de modelos es el modelo obtenido por redes neuronales.

Ilustración 91. Obtención de modelos con PCA para Validación.

La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para Validación, donde
el resultado obtenido es de 0.67, aplicando la reducción de dimensiones se tiene que el modelo más óptimo
para análisis de modelos es el modelo obtenido por redes neuronales, específicamente las redes neuronales
medias.

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 Ilustración 92. Obtención de modelos con PCA para Test.
La gráfica presente indica los resultados con el mejor coeficiente de correlación para Test, donde el
resultado obtenido es de -1.21, aplicando la reducción de dimensiones se tiene que el modelo más óptimo
para análisis de modelos es el modelo obtenido por redes neuronales, específicamente las redes neuronales
medias.

Todo lo anterior explicado de las previas 4 ilustraciones, se explica por medio de la siguiente tabla:

Modelo R2 Validación R2 Test (Muestras

Universidad)
ANN SIN PCA 0.26 -1.78
ANN con PCA 0.67 -1.21
Tabla 11. Modelos de Redes Neuronales para validación y Test

Métricas de Regresión usando Matlab PCA 99%

R2 (CV=5) SVR GPR Tree LR
pH -0.52 0.02 0.03 -0.11 Sin PCA
0.00 -0.01 0.00 -0.05 Con PCA
Test pH -0.27 -0.14 -0.55 -0.50 Sin PCA
0.00 0.02 -0.02 -0.03 Con PCA
OM -0.12 -0.02 0.00 -0.86 Sin PCA
-0.13 0.00 0.00 -0.03 Con PCA
Test OM -0.55 -0.18 -0.02 -0.53 Sin PCA
-0.40 -0.02 -0.13 -0.02 Con PCA

Tabla 12. Métricas de Regresión usando Matlab de los diferentes modelos para Materia Orgánica y pH
La tabla 12 muestra los resultados obtenidos por medio de Regression Learner en Matlab, indica cada
uno de los diferentes resultados obtenidos por cada uno de los modelos al evaluar las condiciones de
validación y test, al aplicar y no aplicar la reducción dimensionalidad, allí se pueden evidenciar cada uno de
los resultados, y sobre todo la comparación entre cual modelo es el óptimo.
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 Debido al bajo rendimiento usando los modelos de aprendizaje supervisado para regresión, se decide
realizar un análisis no supervisado de los datos, con el objetivo de determinar si existen subgrupos
homogéneos dentro de los mismos, donde estos a su vez, permitan decidir sobre la posterior clasificación de
las muestras. De esta forma, se implementa el método de K- medias usando la librería Sklearn, para
determinar el mejor número de grupos, k, y verificar de manera visual la posibilidad de encontrar grupos de
datos, se hace uso del método de silueta obteniendo:

Ilustración 93. Determinación del mejor número de grupos (k) usando coeficiente de silueta

Se observan dos grupos definidos, el cual permite concluir, analizar y determinar la viabilidad de usar
métodos de clasificación para predecir en rangos o clases las variables de pH y Materia Orgánica,
principalmente; añadiendo también la estimación de las bases intercambiables correlacionadas con el rango
espectral (Vis) a analizar, Potasio (K), Calcio (Ca) y Magnesio (Mg).

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5.4 Resultados de Clasificación usando
Classification Learner
Se definen los siguientes rangos para cada clase, correspondiente a intervalos en las propiedades objetivo
de fertilidad en el análisis de suelo:
Propiedad Rango
pH Corrección por
acidez <6
Ninguna Corrección
>6-7.3
Corrección por
alcalinidad
OM Bajo < 1.5 %
Medio 3-5 %
Alto > 5 %
K Bajo < 0.2 cmol/kg
Medio 0.2-0.4
cmol/kg
Alto > 0.4 cmol/kg
Ca Bajo < 3 cmol/kg
Medio 3-5 cmol/kg
Alto > 5 cmol/kg
Mg Bajo < 1.5 cmol/kg
Medio 3-5 cmol/kg
Alto > 5 cmol/kg
Tabla 13. Tabla de propiedades y Rangos

Una vez se realiza la clasificación usando validación cruzada de 4 pliegues, con cada uno de los casos
para las muestras de Agrosavia, se obtienen las métricas y modelos de aprendizaje de máquina con los
mejores resultados y se consolidan de la siguiente manera:
Modelo/Métricas Exactitud Precisión Recuperación F1 (%) PCA 0.99
(%) (%) (%)
KNN 82.1 84.2 93.7 88.7 Si 2/24
Características
Ensemble 78.6 78 100 87.5 Si 2/24
Características
SVM 77.4 77 98.4 86.7 No
Regresión 76.2 83 85.7 84.4 No
Logistica

Tabla 14. Métricas Clasificación pH (Validación)

Las métricas presentadas en la Tabla 15 corresponden al resultado de las predicciones para pH, usando
las técnicas de clasificación presentadas en la misma tabla, se detalla el porcentaje que representa el total de
valores correctamente clasificados, tanto positivos como negativos. Para devolver una medida de calidad más

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general del modelo, se utiliza el valor de F1 métricas, siendo esta una de las métricas que se ajusta a indicar
cuál es la mejor técnica para estimar la variable especifica. Para este caso se determina con base en las
métricas obtenidas tras realizar la estimación de pH, que el mejor predictor es KNN o conocido también
como K vecinos más cercanos con una métrica de rendimiento mayor al 87% para clasificar las muestras
basadas en las clases o rangos que se han definido anteriormente en la Tabla 14.

Para realizar la validación del modelo en entrenamiento se usó la técnica de validación cruzada. Después
de entrenar los modelos, se realiza una evaluación del usando los espectros adquiridos a partir de 30 muestras
proporcionadas por el proyecto GAT [53] de la Pontificia Universidad Javeriana obteniendo:

Modelo/Métricas Exactitud Precisión Recuperación F1 (%) PCA 0.99

(%) (%) (%)
KNN 76.7 83 85.7 84.4 Si 2/24
Características
Ensemble 76.7 76.8 84.1 80.3 Si 2/24
Características
SVM 70 77 98.4 86.7 No
Regresión 76.2 75.1 100 85.7 No
Logística
Tabla 15. Métricas Clasificación pH (Test)

Cabe resaltar que las 30 observaciones no se encontraban sobre el conjunto de datos, dado que se
entrenaron cada uno de los modelos, por ello, se evidencia un alto rendimiento mayor al 82% para el modelo
escogido, que es KNN, como el predictor de la variable pH. Para materia orgánica se obtiene:

Modelo/Métricas Exactitud Precisión Recuperación F1 (%) PCA 0.99

(%) (%) (%)
Discriminante 67.9 90.3 75.8 82.4 No
Lineal
SVM 67.9 96.1 68.5 80 No
Ensemble 67.9 90.4 74.6 81.7 No
KNN 63.1 96.1 63.3 76.3 No
Tabla 16. Métricas Clasificación Materia Orgánica (Validación)
Modelo/Métricas Exactitud Precisión Recuperación F1 (%) PCA 0.99
(%) (%) (%)
Discriminante 50 90.3 75.8 82.4 No
Lineal
SVM 46.7 96.1 68.5 80 No
Ensemble 53.3 90.4 74.6 81.7 No
KNN 80 96.1 63.3 76.3 No

Tabla 17. Métricas Clasificación Materia Orgánica (Test)

Al igual que para la variable pH, la clasificación que se realiza en base al rango definido en la Tabla 14
para Materia Orgánica tanto en entrenamiento con validación cruzada de 4 pliegues, como para la evaluación
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con las 30 observaciones correspondientes a las muestras del proyecto GAT, se observa un buen rendimiento
en las técnicas de aprendizaje supervisado listadas en las Tablas 17 y 18, en especial las métricas para el
método de Discriminante Lineal superan un 74% en evaluación, determinando a esta técnica como la mejor
para predecir la Materia Orgánica.
Las siguientes métricas para la estimación de bases intercambiables solo se presentan para validación
pues el conjunto de datos de evaluación contiene una escala diferente por lo que no es posible supervisar su
estimación, de esta forma se cuenta con la tabla que se va a mostrar a continuación:

Modelo/Métricas Exactitud Precisión Recuperación F1 (%) PCA 0.99rr

(%) (%) (%)
KNN 57.1 52.6 55.5 54 No
Ensemble 54.8 55.2 53.8 54.5 No
Naive Bayes 54.8 44.7 56.7 50 Si 2/24
Características
SVM 53.6 39.5 55.5 46.1 Si 2/24
Características
Tabla 18. Métricas Clasificación Potasio (K) (Validación)

Modelo/Métricas Exactitud Precisión Recuperación F1 (%) PCA 0.99

(%) (%) (%)
Ensemble 50 72.2 46.4 56.5 No
SVM 45.2 77.8 44.4 56.6 No
KNN 45.2 58.3 46.7 51.8 No
Árboles de 44 61.1 50 55 No
decisión
Tabla 19. Métricas Clasificación Calcio (Ca) (Validación)

Modelo/Métricas Exactitud Precisión Recuperación F1 (%) PCA 0.99

(%) (%) (%)
Ensemble 50 72.2 46.4 56.5 No
SVM 45.2 77.8 44.4 56.6 No
KNN 45.2 58.3 46.7 51.8 NO
Árboles de 44 61.1 50 55 No
decisión

Tabla 20. Métricas Clasificación Magnesio (Mg) (Validación)

La clasificación realizada para las variables Potasio, Calcio y Magnesio presentadas en las Tablas 19,20
y 21 se basan en la correlación de las bandas espectrales en el rango visible presentadas en [1]. Bajo
validación cruzada usando 4 pliegues se establece una calidad aceptable en estas variables superior a: 54,8%
para Potasio (K), 56% para Calcio (Ca) y 56,2% para Magnesio (Mg).

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5.5 Análisis de Resultados

5.5.1 Regresión
La predicción por técnicas de Regresión no funciono adecuadamente generando nuevas hipótesis en la
que se plantea: la influencia directa de luz fría de los leds en el sistema de adquisición hardware sensor-fuente
lumínica, puesto que contiene mayores pico de intensidad en 2 bandas específicas del sensor, la primera es
sobre el color índigo, y en algunas mediciones a parte de la banda de 445nm, también se da sobre las bandas
de color verde y amarillo, en ello no solamente se da por la luz e incluso por cuestiones de diseño, sino
también debido a que las muestras al estar almacenadas por largo tiempo, recolectan humedad y hacen que
la medición varíe de manera no controlada. Se alcanza a evidenciar incluso que en el espacio de adquisición
de los datos debido a que no todas las muestras tenían el mismo tiempo para realizar el proceso de adquisición,
y cada muestra variaba de acuerdo si el color de la muestra era más clara u obscura.

Por otro lado al analizar las métricas, como el coeficiente de correlación por medio del software de
Matlab, se puede ver claramente que se presenta un sesgo grande, que al evaluar cada una de las métricas de
validación y entrenamiento, dadas las muestras, la cantidad de datos adquiridos, y la evaluación frente a cada
una de las características, se puede ver que los modelos de regresión no fueron los más óptimos, ni los más
estables, e incluso cuando se intenta evaluar por el método de regresión por mínimos cuadrados parciales
(PLSR) buscando generar nuevos espacios que entre las variables predichas y las observaciones se
encuentran limitaciones en la densidad de los datos, es decir, debido a la dimensión de los datos de
reflectancia, pues como se presentó en la primera sección de resultados, el análisis y la estimación de las
propiedades con espectros de alta resolución, partiendo de las bandas consecutivas y la variedad espectral
contenida por el conjunto de datos brindado por Agrosavia, se ve que cuenta con un ancho de banda espectral
8.5nm, característica que al tomar en cuenta con respecto al sensor usado en la implementación del modelo,
no tiene la misma separación entre banda y banda provocando que se genere un sesgo entre cada uno de los
datos al no poseer información que permita al modelo generalizar de mejor manera.

A pesar del uso de la interpolación por característica o bien llamada interpolación polinómica de Hermite
como estrategia de aumento de datos y de que se consiguió mejorar la métrica en la predicción luego de
aplicarlo al modelo, no se alcanzaron resultados aceptables en la regresión, detalle que da paso para realizar
un análisis de los datos usando técnicas de agrupamiento y clasificación como alternativa de estimación
usando aprendizaje de máquina.

5.5.2 Clasificación

La aplicación de técnicas de clasificación para la predicción en rangos o clases de las variables predichas
está explicada por la Ilustración 95 y la Tabla 13 que presentan la evidencia de una clara separación de los
datos o agrupamiento usando la técnica del coeficiente de silueta, gracias a ello se observaron dos clases bien
definidas; precedente que permite generar en base a [1] los rangos para las variables a predecir (Tabla 13)
basados en la disponibilidad que muestran los nutrimentos esenciales en las muestras de suelo.

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 Una vez se realiza la clasificación usando la aplicación de Matlab, Classification Learner, que nos
permitió evaluar los métodos disponibles y visualizar la matriz de confusión correspondiente, obtuvimos las
métricas que nos permitieron decidir en base a su rendimiento los mejores métodos de clasificación.
Alcanzando como es evidente en la sección precedente (5.4 Resultados de Clasificación usando
Classification Learner) resultados altamente aceptables y comparables con los alcanzados en [1] en especial
para la predicción de pH y materia orgánica que fueron evaluados también con muestras del proyecto GAT
[53] obteniendo buenos resultados en las métricas de rendimiento para la predicción mediante técnicas de
clasificación usando aprendizaje de máquina.

Lo anterior, brinda en perspectiva una alternativa en desarrollo que promete convertirse en una
herramienta complementaria al manejo agronómico cumpliendo los objetivos propuestos junto a las
limitaciones que se presentan en la concepción de este sistema-modelo, una luz frente al desarrollo de
soluciones en el país para mejorar la disponibilidad y optimizar factores como tiempo y accesibilidad para
los actores principales del sector, los agricultores.

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Capítulo 6
Conclusiones y Trabajos Futuros
Este estudio permitió encontrar mediante un experimento preliminar una alternativa al análisis de suelos
tradicional, buscando reducir el costo y aumentar la disponibilidad en el país de este tipo de soluciones costo-
efectiva, funcionando como una herramienta complementaria al manejo agronómico en campo.

Los resultados obtenidos sugieren diferentes grados de exactitud en la predicción de las propiedades de
importancia agronómica usando la técnica de espectroscopía VIS/NIR. Aplicando las técnicas de
clasificación los resultados pueden contrastarse con los obtenidos en [1]; con una precisión y rendimiento del
82% para estimar pH, 74% para Materia orgánica, 54.8 % para Potasio, 56% para Calcio y 56.2% para
Magnesio, logró demostrarse que el uso de diferentes métodos reportados en el capítulo 5, en especial los
basados en la densidad y distancia entre las observaciones, permiten la clasificación de las propiedades del
suelo dentro de un rango aceptable. Mientras que la predicción que usó los modelos de regresión no arrojó
buenos resultados, comparando las métricas basadas en el coeficiente de correlación R 2 se logró un valor de
0.17 que determina la no posibilidad de estimar las propiedades usando este sistema preliminar.

En total se analizaron las métricas donde los coeficientes de correlación para regresión no presentaron
los mejores resultados, tal es el caso de una red neuronal artificial, que después de definir las etiquetas y
características del sistema se evalúan las métricas de entrenamiento se tienen resultados de métricas de -
0.073, de coeficiente de correlación -0.37, ya con métricas de pérdida de 0.42 y regularización de 0.34, de
esta forma se puede ver que los resultados por regresión no son los más estables y se presenta demasiada
dispersión, evaluándolo por un modelo de regresión lineal basado en predictores usados y basados en
divisiones previas se puede observar que toma la forma de un árbol de decisión, pero este por ende arroja un
resultado de 0.23, resultando que no es muy óptimo para evaluar un sistema de regresión, al evaluar PLSR
con validación cruzada no da resultados óptimos debido a que la distribución de los datos no es uniforme, el
comportamiento de reflectancia no lineal indica que PLSR presenta limitaciones, tanto que en una alta fuente
de dimensión de datos, los datos de reflectancia son aquellos que poseen un espectro de alta resolución
partiendo de las bandas consecutivas de longitud de onda y una variedad espectral, por ende esa reflectancia
se aplica directamente a la relación entre transformadas de primer derivada y los datos espectrales.

Los resultados alcanzados pueden verse afectados por varios factores entre ellos: la acumulación de
humedad en las muestras de suelo, al no tener control sobre el almacenamiento de estas, la falta de calibración
estandarizada para el sensor generó un mayor porcentaje de varianza en la adquisición de las firmas
espectrales, así mismo, la limitación en rango y resolución de este último derivó en la consecución de errores
en el proceso de sensado.

El software y hardware diseñados, implementados y usados en este estudio preliminar permitieron tener
un sistema apto para la adquisición, preprocesamiento y análisis de datos espectrales. Partiendo de cada una
de las herramientas disponibles en el medio, se realizó la adaptación del ambiente de adquisición, usando una
caja de Petri de poliestireno se realizó la caracterización de la absorbancia del material y se decidió como la
mejor opción en referencia a las propiedades ópticas ofrecidas dentro de las limitaciones del sistema
implementado, que en comparación con el equipo usado en el artículo base [1] que usa el cuarzo como
material óptico para la adquisición, indica una limitante sobre el experimento dadas las condiciones de

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optimización de absorbancia espectral del material en el rango de trabajo del sensor, es decir, en el rango
visible VIS.

El análisis de datos y la predicción usando modelos de aprendizaje de máquina, fueron evaluados usando
validación cruzada de 4 pliegue debido a la cantidad de datos, y solo para pH y Materia Orgánica validados
con muestras de suelo del proyecto GAT [53] de la Universidad Javeriana, brindando así resultados
considerables para clasificación de estas propiedades.

Las diferentes limitaciones conducen al análisis de los errores causados por diversos factores convirtiendo
al sistema desarrollado en un estudio preliminar, que permitirá ser optimizado o considerado como alternativa
a las herramientas que se dispone dentro del desarrollo de la técnicas de análisis y medición rápidas y
eficientes que permitan realizar manejos agronómicos costo-efectivos en producción e influyentes en la
disminución del impacto negativo ambiental, sin que se sacrifique el rendimiento.

6.1 Recomendaciones para trabajos futuros

Basados en los resultados y conclusiones generales del trabajo realizado y presentado se recomienda:

Realizar pruebas diseñando un experimento con el uso de una luz halógena y cálida ya que suministran
una banda de absorbancia de espectro más amplia, reduciendo de esa manera la saturación de las bandas
espectrales y proporcionando quizá una mejor medición sobre cada una de las muestras. Esta hipótesis surge
por la necesidad de reducir la ganancia de conversión análoga digital y disminuir el ruido que puede alterar
la distribución que se presenta al adquirir la huella espectral. Así podría aumentarse la posibilidad de obtener
mejores resultados en la estimación de las variables correlacionadas con el nivel de absorbancia en el espectro
visible.

Cabe aclarar que, aunque se logró realizar las estimaciones de las variables de suelo, y la evaluación de
calidad de predicciones por medio de las métricas de cada modelo como se presentó en la sección de
resultados y análisis es considerablemente aceptable, debe tenerse en cuenta características y requerimientos
más específicos del área, es decir, este tipo de estudios deben tomar en cuenta aspectos biológicos y químicos
de las muestras, como la afectación del tiempo de almacenamiento y no homogeneidad de las muestras.
Adicionalmente se recomienda realizar una calibración mucho óptima y precisa que la realizada en este
estudio preliminar, teniendo en cuenta las soluciones del mercado frente a este tipo de alternativas, así como
también revisar la posibilidad de mejora en la adquisición con el uso de un lente corrector de coseno que
permita reducir los errores de medición de manera efectiva.
Finalmente se recomienda continuar el desarrollo de la solución como Open Source para dar continuidad
a los objetivos y proyecciones de mejora de alternativas que aporten al país.

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