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Vocabularios, Terminologías,

Taxonomías y Ontologías en
Salud

José Fernando Flórez A MD MS PhD


Esquema
Definiciones
Justificación
Utilidad
Ejemplos
Definiciones

Vocabulario: Listado de palabras
controladas.

Terminología: Palabras controladas por su
significado

Taxonomía: Conjunto de términos
clasificados jerárquicamente

Ontología: Conjunto de términos
clasificados por relaciones semánticas
Utilidad

Sistemas de seguridad de paciente

Salud pública
− Vigilancia epidemiológica
− Estadísticas morbilidad y mortalidad

Gestión administrativa

Investigación

Soporte a la toma de decisiones
Justificación del uso de
códigos en salud

Siempre la medicina ha tenido la
necesidad de clasificar

Se requiere poder intercambiar datos,
información y conocimiento.
− Solución: estandarizar
CIE 10 (ICD-10)

Clasificación Internacional de
Enfermedades y Otros Problemas de
Salud 10 revisión

Vocabulario taxonómico Publicado por la
OMS/OPS en 1994.

Usada para estadísticas de morbilidad y
mortalidad

Adoptada en Colombia 1 enero de 2003
CIE 10 (ICD-10)
CIE 10 (ICD-10)

Consta de 22 capítulos

Organizados por sistemas

Más de 16000 códigos

Disponible
http://www.who.int/classifications/icd/en/
− En línea
− Libro
− CD
− Bajable
CUPS

Códigos únicos de procedimientos en
Salud

Vocabulario de 6898 códigos

Invento Colombiano

Adoptado por resolución del Ministerio de
Protección Social en 2000

Múltiples revisiones desde la Resolución
1896 de 2001
CUPS
471100 APENDICECTOMÍA SOD Resolución 1896 de 2001
471110 APENDICECTOMÍA POR Resolución 1896 de 2001
LAPAROSCOPIA §

471200 APENDICECTOMÍA POR Resolución 1896 de 2001


PERFORACIÓN, CON DRENAJE DE
ABCESO, LIBERACIÓN DE
PLASTRÓN Y/O DRENAJE DE
PERITONITIS LOCALIZADA SOD

471300 APENDICECTOMÍA CON DRENAJE Resolución 1896 de 2001


DE PERITONITIS GENERALIZADA
SOD
CUPS

Disponible en
− http://www.pos.gov.co/Paginas/cupspos.aspx


Se usa para facturación y Registros
Individuales de Prestación de Servicios en
Salud (RIPS)
ATC/DDD

Clasificación Anatomo Terapéutica de
Medicamentos/Dosis Diarias Definidas

Estudios de consumo de medicamentos

Desarrollado por un centro colaborador de
la OMS para metodologías de estadísticas
en salud

Se incluyen los medicamentos en el
sistema por requerimientos

Se adoptó parcialmente en Colombia
ATC/DDD
  N NERVOUS SYSTEM

ANALGESICS
  N02 

OTHER ANALGESICS AND ANTIPYRETICS


N02B

  N02BE Anilides

DDD Unit Adm.route Notes

  N02BE01  3 g P
paracetamol

  N02BE01  3 g O
paracetamol

  N02BE01  3 g R
paracetamol
ATC/DDD

Sistema jerárquico de clasificación

Cinco niveles
1 - 14 grupos principales (por
sistemas)
2 - Subgrupo de indicaciones
terapéuticas farmacológicas
3 y 4 Subgrupos terapéuticos
químicos
− 5 sustancia química
MeSH

Taxonomía de términos (sub
encabezados) en medicina

Creado por la National Library of Medicine
(NLM) de los EEUU

Usado para indización de 5200
publicaciones biomédicas (Medline)

http://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/mesh.html
MeSH
MeSH

Consta de 25186 descriptores

Con más de 160000 términos de
controlados

Disponible en
http://www.nlm.nih.gov/mesh/filelist.html
− XML ~ 260MB (14 MB zipped)
− ASCII ~25MB
− MARC
SNOMED CT

Nomenclatura Sistematizada en Medicina
– Términos Clínicos

Es una colección de terminología médica.

Permite consistencia en
− Almacenamiento
− Recuperación y
− Agregación
− De información clínica
SNOMED CT

Su objeto es homogenizar el
procesamiento de información

Contiene más de 1'000.000 de
CONCEPTOS médicos

Hay múltiple jerarquía con relaciones IS-A

Los conceptos pueden tener ROLES

Algunos conceptos son PRIMITIVOS

DESCRIPCIONES son los sinónimos
asignados a los conceptos
SNOMED CT

Los niveles superiores incluyen
− Procedimientos
− Medicamentos
− Hallazgos y desórdenes
− Eventos
− Anatomía
− Organismos

Usa lógica descriptiva para construcción
de expresiones
SNOMED CT

Quemadura entre los dedos de los pies

284196006|Burn of skin|:
246112005|Severity|=24484000|severe,
363698007|Finding Site|=
(113185004|Structure of skin between
fourth and fifth toes|:272741003|
Laterality|=7771000|left)
SNOMED CT

Se usa para intercambio de información.

Es el modelo de referencia de información
para HL7

Versión en Español publicada en 2003

Licencia de IHTSDO, The International
Health Terminology Standards
Development Organization
UMLS

Sistema de Lenguaje Médico Unificado

Creado por la NLM

El objeto es desarrollar sistemas que se
comporten como si “entendieran” el
lenguaje biomédico

Consiste en fuentes de conocimiento y
programas
UMLS

Fuentes de conocimiento
− Metathesaurus:

vocabulario múltiple propósito, múltiple
lenguaje.

Se construye de las versiones
electrónicas de los vocabularios mas
comunes
− Semantic Network
− SPECIALIST Lexicon

Acceso libre
UMLS

Aplicaciones
− Procesamiento de lenguaje natural
− Recuperación de información
− Clasificación
− Abstracción de información
− Servicios de vocabulario

Ventaja
− Control de ambiguedades
UMLS
Terms (LUIs) Strings (SUIs) Atoms (AUIs) ** RRF only
Concepts (CUIs)

C0009264
cold L0215040
cold
 S0288775
cold
 A0318651


temperature temperature temperature
cold
temperature
(from
CSP)
L0009264

Cold

 S0007170

Cold A0016032
Cold
Cold

(from
MTH)
S0026353
Cold A0040712
Cold
(from
MSH)
C0009443

 L0009443

Common
S0026747

Common
A0041261
Common Cold Cold Cold
Common
Cold
(from
MSH)
L0009264

Cold

 S0007171

Cold A0016033
Cold
Cold
(from
MTH)
S0026353

Cold A0040708
Otras

DSM-IV

CIE-O

CIE-9

LOINC

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