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Temas 2 y 3
El motor Stirling es usado habitualmente para convertir calor en trabajo mecánico (y
después en electicidad) en plantas Solares Térmicas. El ciclo de Stirling ideal consiste en
4 procesos reversibles: comprensión isoterma (proceso 1→2) a temperatura baja T C, una
comprensión isócora a (proceso 2→3), expansión a T H (proceso 3→4), y finalmente
descenso de la presión a volumen constante para cerrar el ciclo. El motor trabaja entre
dos temperaturas (Tc y TH) y dos volúmenes (V1 y V2).
a) Dibuja el ciclo en un diagrama PV, indicando para cada proceso si el fluido absorbe o
emite calor y si realiza o no trabajo.
b) Asumiendo que el fluido consta de n moles de un gas ideal de calor especifico c v,
calcula (especificando el signo) el calor intercambiado, el trabajo realizado, y la energía
interna en cada proceso. Es decir, elabora una tabla como la que sigue:
Proceso Q Signo W Signo de ΔU
de Q W
(+ / -) (+ / -)
1-->2
2-->3
3-->4
4-->1
c) Deriva una expresión para el rendimiento del ciclo como una función de las
temperaturas y volúmenes. Compararlo con la máximo rendimiento posible entre estos
focos de temperatura.
d) ¿Sería el rendimiento diferente si, para una cantidad dada de calor absorbido y un
número de moles fijo, se utilizará un gas de gran calor especifico, como CO2 o H2O en
vez de N2 o O2? Justifica la respuesta.
Vf
W =−∫ P ext dV
Vi
∆U = Q + W
Vf V2
nRT V2
W =−∫ P ext dV =−∫ dV =−nRT ln
Vi V1
V V1
At this point, we can fill up the chart, using this formula and the First Law
C y D)
dividing by nRln(V1/V2)
T h−T c
η=
(T h−T c )
T h +(C v / R)
ln(V 1 / V 2)
According to this expression, if the heat capacity is larger, the efficiency would be smaller. But, also the difference
between the hot and the cold temperature would be smaller, and so the efficiency.
E2 - Julio 2015. Temas 2 y 3
Calcular el calor total necesario para elevar un mol de yodo hasta su temperatura crítica empezando
a temperatura ambiente (298K) y manteniendo constante la presión ambiental de 1 atmósfera.
Calcular también el cambio de entropía del yodo y del entorno a lo largo del proceso. Usar los
siguientes datos extraídos de www.webelements.com y chemwiki.ucdavis.edu. Nota 1. No es
necesario para la resolución de este problema usar todos los datos. Nota 2. Suponer que la
capacidad calorífica a presión constante (Cp) es independiente de la temperatura en cada fase.
a) Tenemos que calcular el calor proporcionado al sistema desde T=298K (fase sólida) hasta T=
546ºC (820 K), que corresponde con el punto crítico. A lo largo de este aumento de temperatura se
producen dos cambios de fase, teniendo que tener en cuenta que en cada fase es necesario utilizar
un valor distinto para cp.
Las formulas ha emplear serán para los procesos de aumento de temperatura en cada fase:
Q= n cp DT
mientras que en aquellos procesos donde se produzca cambio de fase (por tanto, a temperatura constante)
Q= n Dhf
en la fase líquida
Q3=0.5⋅36.9⋅( 184−113.8)=1.295⋅103 J
y en la fase gaseosa
7R 3
Q4 =0.5⋅ ⋅( 546−184)=5.27⋅10 J
2
En los dos primeros casos se ha tomado la capacidad calorífica a presión constante proporcionadas
como datos, mientras que en la fase vapor se ha tomado el vapor de cp del gas ideal diatómico. En
la fase líquida y vapor se ha considerado el hecho de que la molécula de yodo es diatómica, y que el
número de moles de moléculas será 0.5
Para el cambio de fase sólido-líquido
3 3
Q2=1⋅7.76⋅10 =7.76⋅10 J
Q= 3.52·104 J
Tf
δQ Tf nc dT Tf
p
Δ S =∫Ti =∫Ti =n c p ln
T T Ti
mientras que para los cambios de fase usaremos la fórmula
fδQ nΔh
Δ S =∫i =
T T
por tanto el cambio total de entropía del sistema será:
Para calcular la entropía del entorno debemos conocer como se ha producido el aporte de calor al
sistema. Vamos a suponer que hemos puesto el sistema en contacto con una fuente térmica a 820K,
calentándose el sistema hasta esa temperatura. Esto significa que los alrededores al sistema han
cedido un calor igual al tomado por el sistema, Q=- 3.52·10 4 J. Como para los alrededores el
proceso ha sido a temperatura constante, su cambio de entropía será:
−3.52 ·10 4
Δ S entorno = =−42.93 J / K
820
P= RT (n/V + B2 n2/V2 )
A partir de ella podremos calcular la entropía. Para ello utilizaremos la ecuación de Maxwell apropiada:
∂S n n2
( )
∂V T
=R( +B 2 2 )
V V
V n n2 V 2 1 1
S−S 0=R∫V 0 ( +B 2 2 ) dV =R(n·ln −n · B2 ·( − ))
V V V0 V V0
Para la distancia que la proteína habrá difundido mediante movimiento browniano obtenemos que
<R²> = 6 D t =7.9·10-7 , y por tanto <R> ~ (<R²>)1/2=0.00088 m.
(B) According to the definition of enthalpy and assuming that the heating process is reversible
T T T
δQ P c p(solid ) 2 3 3
Δ S (0 K →T )=∫ dT =n∫ dT =240 nR∫ (T /T D )dT =80nR(T /T D )
0 T 0 T 0
Since the entropy in the absolute zero is null (Third Law of Thermodyamics), the absolute value of
the entropy at a temperature T will coincide with ΔS (0 → T).
(C) (4 points) The enthalpy change is the same as the heat delivered at constant pressure. Hence,
4 3
Δ H =Q P =60 nRT /T D
The change in free energy can be calculated starting from the fundamental equation for G.
Assuming reversibility and absence of other types of work, we have
dG=−SdT +VdP
As the process takes place at constant pressure, dP = 0, and the change of free energy is a
temperature integration of the entropy. We get then
T
3 4 3
Δ G (0 K →T )=∫ 80 nR(T /T D ) dT =20 nRT /T D
0
La presión de vapor de disoluciones saturadas de sal han sido medidas en función de la temperatura por
Apelblat and Korin (J. Chem. Thermodynamics, 1998, 30, 59-71). Estos son sus resultados para NaCl y
NaNO3:
NaCl
T(K) 278.15 288.15 298.15 308.15 318.47
PV(kPa) 0.660 1.322 2.392 4.233 7.322
NaNO3
T(K) 277.65 288.15 298.15 308.35 317.55
PV(kPa) 0.587 1.322 2.345 4.136 6.620
Datos: Entalpía de vaporización del agua pura: 40.88 kJ/mol. Presión de vapor para el agua pura a 100ºC:
1atm = 101500 Pa. Solubilidades aproximadas a 45ºC: 6.2 y 12.9 molal para el NaCl y NaNO 3,
respectivamente. constante de proporcionalidad de la Ley límite de Debye-Huckel, A=1.172 kg 1/2mol-1/2.
a) Suponiendo que el vapor es un gas ideal, podemos aplicar la Ecuación de Clausiyus Clapeiron como sigue
P Δ h vap. 1 1
ln
P0
=
R T0 T
−
( )
Sustituyendo el valor de la presión de vapor a 100º y la entalpía de vaporización:
P 40,88 ·10 3 1 1
ln
101500
=
R
−
373 318 ( )
Se obtiene que P = 10399,326 Pa=0,102 atm
Pi Pi
b) Usaremos la expresión γi = =
x i P 0i P idi
Con P⁰ , presión de vapor del agua pura a esa temperatura, calculada en el apartado anterior
i
NaCl == > xH2O = 55,56/(55,56 +6,2) = 0,8996 ==== > gH2O = 7,322·103 /(0,8996*10399,328) = 0,783
NaNO3 == > xH2O = 55,56/(55,56 +12,9) = 0,8116 ==== > gH2O =6,62·103 /(0,8116*10399,328) =
0,784
4,233 Δ hvap . 1 1
NaCl: ln
7,322
= − (
R 318,47 308,15 ) ====> Dh
vap
= 43354,4 J/mol
4,136 Δ h vap. 1 1
NaNO3: ln
6,620
= −
R 317,55 308,35 ( ) ====> Dh
vap
= 41651,2 J/mol
d) (Tema 7) Comenzamos calculando los factores de actividad de las sales. Para ello usamos la Ley límite de
Debye-Huckel
ln γ ± =−A|z+ z-|I 1/ 2
1
La fuerza iónica se calcularía con la formula I= ∑ c z 2 , pero teniendo que ambas sales son
2 i i i
monovalentes, la fuerza iónica sería igual a la molalidad. En consecuencia
1/2
NaCl; ln g = - 1.172·1·6,2 === > g = 0.054
NaCl NaCl
1/2
NaNO ; ln g = - 1,172·1·12,9 === > g = 0.014
3 NaNO3 NaNO3
Viendo estos resultados, vemos que ambas sales son claramente no ideales. Esto es consecuencia del carácter
no iónico de su interacción. El comportamiento menos ideal sería para el NaNO3, con un factor de actividad
más lejano de la unidad. Esto se explica por la mayor concentración de la sal. Desde el punto de vista del
agua los factores de idealidad son muy parecidos, no pudiendo establecerse diferencias claras
As we want to describe the reaction at equilibrium, we first calculate the equilibrium constant of this reaction
at ambient temperature. Following the usual procedure, we have
ΔHR0 = ΔHf0 (gly) - 2×ΔHf0 (CH4) - ΔHf0 (NH3) - 2×ΔHf0 (H2O) = +153.77 kJ/mol
ΔSR0 = S0 (gly) + 5×S0 (H2) - 2×S0 (CH4) - S0 (NH3) - 2×S0 (H2O) = -183 JK-1mol-1
This value indicates that the formation of glycine is a very unfavourable process from the
thermodynamic point of view. This conclusion is consistent with the equilibrium constant
−Δ G0R / RT −1 −1 −1
which is an extraordinary low value of the equilibrium constant. In fact, if we relate K with the activities
derived from the partial pressures (assuming ideality), we have
5 5
−37
a gly a H a gly×0.1
2.94 10 = 2
= =0.00011 a gly
a2CH a NH a2H
4 3 2 O 0.452×0.45×12
Solving for the activity of glycine, we get agly = 2.67 × 10-33, which means that we have an approximate
concentration of 2.67 × 10-33 mol/liter. Just by comparing this number with Avogadro's constant (~ 6 10 23
molecules/mol), it is easy to understand that not a single molecule of aminoacid is formed in 100 ml at
equilibrium.
We can speculate about how much energy would be needed to form at least one molecule. 1
molecule in 200 ml is a concentration of [gly] ~ (1 molecule / 6 10 23 molecules/mol) / 0.2 liter ≃ 8.3 10 -24
mol/liter. Substituting this value in the expression for the free energy, and using the standard value calculated
before, we get
0
Δ G R=Δ G R + RT ln (0.00011 [gly ])=+54.12 kJ / mol
E7 - Febrero 2015. Tema 5 y 7
La reacción global realizada por la fotosíntesis I y II en el proceso de fotosíntesis es
Los siguientes datos son conocidos a partir de medidas electroquímicas en condiciones de estándar
bioquímico (pH=7) y 25ºC:
A) Calcular el cambio de energía libre en condiciones de estándar bioquímico para esta reacción.
B) Consideremos ahora condiciones más realistas. Las algas realizan la fotosíntesis en medios
acuosos. En agua de mar la actividad del O2 está determinada por su presión parcial en la
atmósfera. El pH de agua de mar no contaminada es cercano a 8. Calcular la energía libre que debe
aportar la luz solar para reducir un mol de NADP+
Datos: Datos típicos (Plant Physiol. Jul 2003; 132(3): 1464–1474.) para algas en condiciones
aeróbicas, [NADPH]/[NADP] = 1.5. Constante Faraday F = 96500 C. Presión parcial del oxígeno
en la atmósfera: 0.22 atm. En este problema es necesario utilizar la expresión del tema 7 que liga
diferencia de potencial con energía libre de Gibbs DG=-nFDV, siendo n el número de electrones
intercambiados, F la constante de Faraday y DV la diferencia de potencial entre reactivos y
productos
(A) La reacción global es la suma de la primera reacción invertida, más la segunda multiplicada por
2:
Δ G R =Δ G + RT ln
R
2
a2NADP a 2H
+
2
O
Tenemos una disolución con este tampón a 25ºC en equilibrio con una atmosfera donde la presión
parcial del CO2 es de 40 mmHg. Calcular las concentraciones de todos las especies participantes en
la reacción a pH=7 y pH=9
Datos. Energías libres de formación en el estandard bioquímico: DG'f (CO2 (aq)) = -386.2 kJ/mol;
DG' f (H+) = 0 kJ/mol; DG' f (H2CO3)=-623.1 kJ/mol; DG' f (HCO3-)=-586.85 kJ/mol ; DG' f (H2O) = -
237.14 kJ/mol. Constante de Henry del CO2 a T=25ºC 0.03·10-3 mol·L-1 mmHg-1. Nota: Debido
a la referencia considerada, considerar la actividad del CO2 como aCO2= [CO2]/1M
La actividad del CO2 la calculamos usando la ley de Henry (asumiendo idealidad y aCO2=[CO2]aq)
De la segunda reacción (aH2O=1)
Para los H+, suponiendo idealidad y teniendo en cuenta que la referencia es el estandard bioquímico
Para calcular la energía libre en el estándar termodinámico (químico), debemos que tener en cuenta
que la diferencia entre ambas referencias es la actividad de los protones. En el estándar bioquímico
se toma pH=7, mientras que en estándar químico se considera pH=0. Con esto, la actividad de los
protones en el estándar químico, tomando como referencia el estándar bioquímico es
+ +
+ [H ] [H ] 1
a ( H )= γ i + ref ≈ −7 = −7
[H ] 10 10
Con esto tenemos
3 3
0 bio
a Br a H O bio
3
1 1
3
Δ G =Δ G + RT ln
R R 5
2 2
6
=Δ G R + RT ln 5 7 6
=56,85 kJ / mol
a Br a BrO a H
- -
3
+ 1 1(10 )
bio
a3Br a3H O 0.001 1
3 3
Δ G R =Δ G + RT ln
R 5
2 2
6
=296.33+ RT ln 5 -3 6
=450.28 kJ /mol
a Br a BrO
- -
3
aH + 0.001 0.001(10 )
La solución es una concentración de Bromo muy pequeña, como era esperable de una reacción muy
poco favorable, como sabemos del valor muy positivo de la energía libre que hemos obtenido en B
E11 - Febrero 2013. Tema 7
A ambos lados de una membrana biomimética se mantienen concentraciones de cloruro potásico de
0.01 y 0.5 M respectivamente a 25ºC. Se sabe asimismo que la permeabilidad de la membrana es
doble para los aniones que para los cationes. Calcular:
A) El potencial eléctrico esperable a ambos lados de la membrana en mV.
B) El número de moles de ATP necesarios para bombear un mol de cationes desde el lado negativo
al lado positivo de la membrana
C) El tamaño medio de la atmósfera iónica de los iones en ambos lados de la membrana en nm.
Datos: kB = 1.38 10-23 J K-1, carga del electrón: e = 1.6 10-19 C, número de Avogadro: 6.022136 1023
mol-1. Constante de Debye: κD = [8πe2I/(ε'ε0kBT)]1/2 . Constante dieléctrica del agua ε' = 80,
permitividad dieléctrica del vacío: ε0 = 8.85 10-12 F/m. Energía libre de Gibbs de la desfoforilación
del ATP en el estándar bioquímico: -30.54 kJ/mol.
μ −μ c −μ + 0.5
Δ V =V 2 −V 1 =−0.026 V μ+ +μ − ln 2 =−0.026V
( )
+ − c1 3μ +
ln
( )
0.01
=0.03V
B) La relación entre el potencial eléctrico y la energía libre a aportar, suponiendo el proceso reversible es
Teniendo en cuenta la energía libre de hidrólisis del ATP podemos calcular los moles necesarios para obtener
esta energía
E12 (Examen Julio 2014) a) Una membrana separa dos disoluciones coloidales con partículas de carga
Z=100e- de igual concentración de macropartículas. A un lado de la membrana se mantiene una
concentración de cloruro sódico a 0.1M, mientras que al otro lado tenemos [NaCl]= 0.01M. Suponiendo que
las concentraciones de los coloides es muy baja, pero que pese a ello no se puede considerar idealidad,
calcular la diferencia de potencial a ambos lados de la membrana,
b) A continuación se retira la membrana, obteniéndose una única disolución con concentración de cloruro
sódico 0.05M. Si la densidad efectiva de los coloides es 9000 gr/l y su radio es 200 nm calcular la diferencia
de potencial entre la parte superior e inferior de la disolución, separadas 10 cm.
Datos, constante de proporcionalidad de la Ley límite de Debye-Huckel, A=1.172 kg 1/2mol-1/2, Temperatura
25ºC, kB=1.38·10-23 J/K. Aceleración de la gravedad g=9.8 m/s
En este problema tenemos que utilizar la formula para calcular la diferencia de potencial entre dos
compartimentos separados por una membrana. Si asumimos que los iones no atraviesan la membrana, la
formula a usar es
RT a 2 RT γ c
V 2 −V 1=Δ V eq=− ln =− (ln γ 2 +ln 2 )
zF a 1 zF 1 c1
A)
ln(g1) =-1.172·1·0.1¹/²=-0.371
ln(g2) =-1.172·1·0.01¹/²=-0.117
B)
Al retirar la membrana los disolventes se igualaran, con lo que los factores de actividad serán iguales. Sin
embargo, debido a la gravedad se establecerá una diferencia de concentración de coloides entre la zona alta y
baja del recipiente. La relación entre estas concentraciones las podemos calcular con la relación de
Boltzmann:
c 2 −Ep −V ρh g
ln = = =−7187,1
c1 k B T k BT
siendo Ep la energía potencial gravitatoria.
Sustituyendo en la formula del potencial
RT a 2 RT c
V 2 −V 1=Δ V eq=− ln =− (ln 2 )=18.4V
zF a 1 zF c1
E12 - Febrero 2013. Tema 9
Considerar la unión de una proteína P a un segmento de ADN. Asumiendo que solo existe un sitio
de unión para P en el ADN y que la concentración de P es muy grande, el mecanismo de unión
puede ser representado por:
k1 k2
P+ADN <=====> P-ADN ====> P-ADN'
k-1
Calcular:
d [ PDNA]
= k 1 [ P ][ DNA]−k −1 [ P− DNA]−k 2 [ P− DNA]≈0
dt
Knowing that [ DNA]0 =[ P− DNA ']+[ P− DNA ]+[DNA ] we find for the concentration of intermediate
Replacing this equation in the rate law for P-DNA' formation we would have a differential equation
for [P-DNA']. However, this could be cumbersome to solve. In this kind of cases, it is usual to
assume further approximations. For instance, if the concentration of protein is very large, then
Alternatively, we can assume that there is pre-equilibrium in the first two reactions (for instance, if
k2 is relatively small). In that case we have
Imposing again the approximation that [P] is very large, we reach exactly the same result as before
a) Calcular la dependencia de la concentración de NO 2 como función del tiempo (ley integral de las
velocidades), y derivar una expresión para la vida media de este reactivo.
Explicar que aproximación tiene que ser asumida en este mecanismo para obtener la ley de
velocidad experimental. ¿Cual sería ktotal en este caso? ¿Cual sería la velocidad neta de desaparición
de NO2 si, alternativamente, se aplica la aproximación de estado estacionario?
a) Es una reacción de primer orden. Por tanto la ley integral de velocidades y la vida media serán:
d [ NO 2] 2 d [NO ] 2 d [CO ]
=−2k 1 [NO 2 ] +k 2 [CO ][ NO 3 ] , =k 1 [ NO 2 ] , =−k 2 [ NO 3 ][CO ]
dt dt dt
d [NO 3 ] 2 d [CO ]
=k 1 [NO 2 ] −k 2 [ NO 3][CO ] , =−k 2 [ NO 3 ][ CO ]
dt dt
Este problema puede ser resuelto utilizando distintas aproximaciones. Por ejemplo suponiendo que
la segunda reacción es muy lenta, la evolución de la concentración de NO 2 vendrá dada por la
disociación en la primera reacción:
d [NO 2] 2
(k1 >> k2) ≈−2k 1 [ NO 2 ] . En este caso obtenemos una reacción de segundo orden, con
dt
ktotal = 2k1
Por contra, si suponemos que la primera reacción es la limitante (k 1<<k2), tendremos que la
reacción la podremos escribir como
NO2 +NO2 ==>NO2 +CO2 k1
d [ NO 2] 2 2 2
obteniendo que ≈−2k 1 [ NO 2 ] + k 1 [ NO 2 ] =−k 1 [ NO 2 ] , siendo ahora ktotal = k1
dt
Obteniendo que
d [ NO 2] 2 k1 2 2
=−2k 1 [NO 2 ] +k 2 · [ NO 2 ] =−k 1 [NO 2 ] , de nuevo encontramos que ktotal = k1
dt k2
E14 - Julio 2014. Tema 9 En una reacción enzimática entre una molécula de sustrato (S) y enzima
(E), un inhibidor (I) se une selectivamente al complejo ES impidiendo la formación de producto (P).
Las reacciones se caracterizan por las siguientes constantes de velocidad:
La reacción entre el inhibidor y el complejo se pude considerar que ha alcanzado una situación de
equilibrio y caracterizarla por la constante de equilibrio de la reacción de disociación del complejo
ESI, KI.
d [E]
=−k 1 [ E ][ S ]+ k -1 [ ES ]+ k 2 [ES ]
dt
d [S]
=−k 1 [ E ][ S ]+ k -1 [ ES ]
dt
d [P]
=k 2 [ES ]
dt
d [ES ]
=k 1 [ E ][ S ]−k -1 [ ES ]−k 2 [ ES ]
dt
[ ES ][I ]
Ki=
[ESI ]
Finalmente, tenemos una ecuación más con la conservación de la masa aplicada a la cantidad total
de enzima
d [ ES ]
=k 1 [ E ][S ]−k -1 [ ES ]−k 2 [ ES ]=0
dt
[E ] o [S ]
[ ES ]=
k -1 +k 2
+[ S ](1+[ I ] K −1
i )
k1
k 2 [E ] o
−1
[S ]
d [ P ] (1+[ I ] K i ) k 2 [ E ]o [ S ]
V= = =
dt KM −1
K M +[S ](1+[ I ] K i )
−1
+[ S ]
(1+[ I ] K i )
E15 - Febrero 2015. Temas 8 y 9. En fase gaseosa una molécula A se descompone en presencia de
un catalizador inerte M para producir un producto P. Para esta reacción se ha propuesto mecanismo
que consta de
a) Calcular la velocidad de formación del producto P como una función de la concentración del
reactivo A, del catalizador M, y de las constantes de reacción indicadas.
o
A+ M ==> A + M k
1
o
A + M ==> A + M k
-1
o
A ==> P k
2
d[A] o
=−k 1 [ A ][ M ]+k −1 [ A ][M ]
dt
d [ Ao] o o
=k 1 [ A][M ]−k −1 [ A ] [M ]−k 2 [ A ]
dt
d [P]
=k 2 [ A o ]
dt
d [ Ao] o o k [ A ][ M ]
=k 1 [ A][M ]−k −1 [ A ] [M ]−k 2 [ A ]=0 => [ A o ]= 1 =>
dt k −1 [ M ]+k 2
d [P] k 2 k 1 [ A][M ]
=
dt k −1 [M ]+k 2
Como estamos en fase gaseosa, significa que la concetración de todas las especies será alta.
Particularmente k-1[M] >> k2, entonces se llega a
d [P] k 2 k 1 [ A ]
≈
dt k−1
llegamos a la conclusión de que es una reacción de primer orden donde t1/2 = ln/k',
con k' = k2k1/k-1
Este apartado puede resolverse también viendo que en este límite la tercera reacción es muy lenta,
por lo que se establecerá un equilibrio previo en las dos primeras. Llegándose al mismo resultado.
E+A <===> EA ; KA
EA+ B <===> EAB ; KmAB
EAB === > E+P+Q; kcat
Teniendo en cuenta que las primeras reacciones están equilibradas, tenemos las siguientes
condiciones de equilibrio:
A [ E ]·[ A]
K =
[ EA]
AB [ EA]·[ B]
KM =
[ EAB ]
AB A [EAB] AB [EAB ]
[ E 0 ]=K M · K · +KM · +[ EAB ]
[ A][ B] [B]
y finalmente
[ E 0 ][ A][ B]
[ EAB]= A AB
[ A][ B]+ K K M [ B]+ K M [ A]
d [P] k 2 [ E 0 ][ A][ B]
=k 2 [EAB ]= A AB
dt [ A][ B]+ K K M [ B]+ K M [ A]
E17 - Febrero 2016. Tema 9
En el siguiente mecanismo enzimático la formación del producto ocurre mediante una reacción
reversible:
k1 k2
E+S <===> ES <====> E+ P
k-1 k-2
en esta reacción ES es el intermedio de la reacción, k1 y k2 son las constantes de las reacciones que
van hacia la derecha y k-1 y k-2 son las constantes de las reacciones que van hacia la izquierda. S es
el sustrato, P el producto y E la cantidad de enzima libre
(A) Aplicando estado estacionario, calcular la variación de la concentración de P con el tiempo (v=
dP/dt) en función de la concentración total de enzima [E 0], de las concetraciones de sustrato [S] y
producto [P] y de las constantes cinéticas.
(B) Una vez alcanzado el equilibrio final, ¿cual es la relación entre las concentraciones de P y de S?
where we have introduced the total concentration of enzyme [E]0 = [E] + [ES]. To obtain [ES] we
apply the steady-state approximation to this intermediate
d [ ES ]
=k 1 [ E] [S ]− k−1 [ES ]−k 2 [ ES ]+k−2 [ E ][ P ]=0
dt
Introducing [E]0 = [E] + [ES], and solving for [ES] one gets
k 1 [ E ]0 [ S ]+ k −2 [ E ]0 [ P ]
[ ES ]=
k−1+ k 2+k 1 [ S ]+ k −2 [ P ]
d [P ] k [ E ]0 [ S ]+ k−2 [E ]0 [P ]
r=
dt (
=( k 2 + k −2 [ P]) 1
k −1+ k 2 + k 1 [ S ]+ k−2 [P ] )
− k−2 [ E ]0 [ P ]
Operating and reorganizing (note that several terms cancel out), it is finally obtained
(B) (5 points) Total net equilibrium means that the two intermediate reactions are at equilibrium.
Hence,
k 1 [ E ][ S ]=k −1 [ ES ]
k −2 [ E ][ P ]= k 2 [ES ]
[P ] k 1 k 2
= = K eq , 1 K eq , 2
[ S ] k−1 k −2
d [P ]
The same result is obtained if one imposes r=
dt
=0 , equilibrium, in the previously obtained
expression.
k1
BrO +2H <==>H2BrO3+
3- +
(equilibrio rápido)
k-1
k2
Br -- + H2BrO3 ==> Br-BrO2 + H2O (reacción lenta)
k3
Br-BrO2 + 4H+ + 4Br - ==> 3Br2 + 3 H2O (reacción rápida)
Para la primera reacción me informan que es una reacción que alcanza rápidamente el
equilibrio, entonces:
− 2 + + k1 − 2
k 1 [BrO 3 ][ H 2 + ] =k−1 [H 2 BrO 3 ]→[H 2 BrO 3 ]= [BrO 3 ][H 2 + ]
k −1
Donde hemos aplicado el resultado del equilibrio previo de la reacción 1. Esta velocidad de
producción del Br2 en la ecuación 3 es también la de la reacción global y la solución del problema.
Este problema también puede hacerse aplicando la aproximación de estado estacionario. Aplicando
esta aproximación al complejo Br-BrO2
d [Br−BrO 2 ] + + 4 − 4
=k 2 [ Br−][ H 2 BrO 3 ]−k 3 [Br−BrO 2 ][ H ] [Br ] =0
dt
+
k 2 [Br− ][ H 2 BrO 3 ]
De donde [Br−BrO 2 ]=
k 3 [ H + ]4 [Br− ]4
1 d [Br 2 ] + 4 − k 2k1 − 2 −
v= =k 3 [ Br −BrO 2 ][H ] [ Br ]= [BrO 3 ][ H 2 + ] [Br ]
3 dt k −1
Si tenemos agua pura, calcular el pH del sistema a 25ºC y a 75º C en el equilibrio ¿Que
trabajo mínimo sería necesario para conseguir pH= 7 a 75ºC?¿Habría que aportarlo o
sacarlo del sistema?
Datos: entalpías estandard de formación DH0H+ = 0 KJ/mol, DH0OH- = -229.94 KJ/mol,
DH0H2O = -285,83 KJ/mol, Entropías absolutas de formación: S 0H+ =0 J·mol-1·K-1,
S0OH- =-10.5 J·mol-1·K-1, S0H2O =69.91 J·mol-1·K-1
ΔHR0 = ΔHf0 (H+) + ΔHf0 (OH-) - ΔHf0 (H2O) = 0 kJ/mol + (-229.94 kJ/mol) - (-285.83 kJ/mol) =
55.89 kJ/mol
ΔSR0 = S0(H+) + S0 (OH-) - S0 (H2O) = 0 J·mol-1·K-1 + (-10.5 J·mol-1·K-1) - (69.91 J·mol-1·K-1)
= -80.41J/mol
Y con estos valores la energía libre de Gibbs en condiciones estándard a ambas temperaturas:
T=25ºC ΔG 0 = ΔH 0 – 298 K × ΔS 0 = 79.85 kJ/mol
R R R
K 25ºC=e −Δ G R / RT
=9.9110−15 K 75ºC =e−Δ G R / RT
=2.54 10−13
a H · a OH
+ -
+
[ H ]·[OH ]
-
K= = =[ H + ]2 y pH =−log 10 ([ H ])
+
aH 2O
1
Entonces
T=25ºC, pH=7.002 T=75ºC, pH=6.298
(b) Si a 75ºC forzamos al sistema a tener pH=7, estará fuera del equilibrio
Una masa de aire está en condiciones ambientales a nivel del mar(1 atm, 298K) y
repentinamente se eleva hasta 1000 metros de altitud, con la consiguiente reducción de
la presión. (A) Si el proceso se realiza de forma adiabática, calcular la nueva
temperatura. (B) Repetir el cálculo si por contra el proceso se produce de forma
cuasiestática (es decir, adaptando la presión de la masa de aire a la de la atmósfera a
cada altitud) y adiabática. Datos: Asimilar el aire como una mezcla de moléculas
diatómicas O2 y N2, de peso molecular 29 g/mol y densidad 1,22 kg/m³. Información
Extra: Recordar (Física, 1er curso) que la presión atmosférica desciende con la altitud
como P(z) = P0 – rgz, o dP = - rgdz, con r la densidad del aire, g la aceleración de la
gravedad, z la altitud y P0 la presión atmosférica a nivel del mar.
dU = δQ + δW
As this is an adiabatic process, δQ = 0. Knowing, in addition, that the internal energy of an ideal
gas is a function of temperature of the form U = n cV T, we can write
dU = δW → n cV dT = -Pext dV
where cv is the specific heat capacity of the gas at constant volume. Air can be considered a diatomic
ideal gas. Therefore
n(5/2)RdT = -Pext dV
(1) in the first situation the external pressure at which the gas equilibrates is the pressure at 1 km of
altitude. To calculate this we substract from P0 = 1 atm the hydrostatic pressure of a column of 1 km
of air, that is, 1.22 kg/m3 ∙ 9.8 m s-2 ∙ 1000 m = 11956 Pa = 0.12 atm. The final pressure would be
then 0.88 atm.
The final temperature would be obtained from this equation (written for 1 mol of gas)
1 mol × (5/2) 0.082 atm l mol-1 K-1 (Tf – 298 K) = - 0.88 atm (Tf × 0.082 atm l mol-1
K-1 / 0.88 atm – 24.4 l)
where 24.4 l is the molar volume at ambient temperature. Solving for the final temperature, we get
Tf = 160 K
(2) If the process occurs quasi-statically we have to bear in mind that the pressure should always be
defined by the equation of state as the gas is ascending
n cV dT = -PdV (1)
where P is the equilibrium pressure, given by P = nRT/V. The problem with the resulting
differential equation is that we have to integrate over V, whereas the pressure here varies with the
altitude according to P(z) = P0 – ρgz. Thus, dP = ρgdz. To convert to an equation defined in terms
of pressures, we differentiate the equation of state
where M is the molecular mass (remember that the hydrostaic pressure is written in terms of the
mass density). From this equation we obtain
dT g
=
dz (C V + R) M
This equation is known as the atmospheric lapse rate (the rate at which dry air cools down as it
ascends in the atmosphere). Substituting data for air one can obtain the famous 9.8 K/km. Hence,
the air decreases its temperature by almost 10 K when it ascends adiabatically and quasi-statically
1000 m.
ΔG = ΔG' + RT ln([ATP][H+(dentro)]³/[ADP][Pi][H+(fuera)]³)
The system must at equilibrium to keep the conditions given. Another way to pose the problem is to
assume that the free energy needed to make an ATP molecule should come from the proton
concentration difference, so that the free energy changes of the two reactions should be equal. In
any other case we arrive to the following equation
ΔG = ΔG' + RT ln([ATP][H+(dentro)]³/[ADP][Pi][H+(fuera)]³) = 32.55 103 J/mol +8.31 J K-1 mol-1 298 K
(ln(100/0.01) + 3 ln([H+(in)/[H+(out)]) =0
(A)
The experimental rate law is
dc c dc t
− =kc → ∫c =−∫0 k dt → c(t )=c0 exp (−kt )
dt 0 c
dc 2 c2 t
− = kc=k c0 exp(−kt ) → ∫c dc 2 =−∫0 kc 0 exp(−kt)dt →
dt 2,0
(B)
v = 2d[O2]/dt = k4[ClO]2
which demonstrates that the reaction is first-order with respect to N2O5 and zero-order with respect
to Cl2O. Identical result would have been obtained just assuming that the rate-limiting step is the
unimolecular splitting of the N2O5 molecule with rate constant k1.
Note: an additional step can be though of, which would be the formation of the O2 molecule from
two O atoms formed in step 4. Application of the steady-state approximation to the O intermediate
would have lead to the same conclusion.
Imagina que un coche usa ATP como combustible. (A) ¿Cual es el calor desprendido en
kJ por la hidrólisis de 1000 moles de ATP a presión constante? (B) ¿Cual será el cambio
de entropía en condiciones estándar del combustible cuando esos 1000 moles son
hidrolizados a temperatura ambiente?
La energía aportada por la hidrólisis del ATP es usada como fuente de calor en un motor
térmico basado en un fluido que recorre un ciclo entre la temperatura ambiente (a la cual
ocurre la hidrólisis del ATP) y 800ºC (C) Si el coche pesa 1500 kg, ¿Cual es la máxima
altura a la que podemos elevar el coche con los 1000 moles de ATP en condiciones
estándar? (D) Repetir este cálculo en caso de que se mantenga la relación entre
molaridades [ATP]/[ADP]=2 y que [Pi] = 1mM. Datos: Para la siguiente reacción ADP + Pi
→ ATP + H2O, ΔHº = 20 kJ/mol, ΔSº = 34 J/(K mol), T=298K
(A) El calor liberado a presión constante puede ser obtenido del cambio de entalpía en la
reacción de hidrólisis del ATP. Teniendo en cuenta que el dato que se proporciona es el
cambio de entalpía molar en la formación del ATP
(B) El cambio de entropia del ATP es calculado de forma similar del dato proporcionado
ΔGº = ΔHº – TΔSº = -20 kJ/mol + 298 K × 34 10-3 kJ K-1 mol-1 = -9.868 kJ/mol
Que es equivalente a 3.013 ×107 J para 1000 moles de ATP. Desde el punto de vista del ciclo este
trabajo es el calor que entra en el ciclo desde el exterior (suma de calores positivos). El máximo
rendimiento del ciclo puede estimarse suponiendo que es un ciclo de Carnot. En este caso
Tc 298
η=1− =1− =0.722(72.2 %)
Th 273+ 800
Lo que significa que solo 9.868 ×106 × 0.722 = 7.12 ×106 J pueden ser usado para producir trabajo
mecánico en un ciclo térmico. Para un coche de 1500 Kg esto significa que la máxima altura a la
que podemos elevar es h = 7.12 ×106 J / (1500 kg × 9.8 m s-2) = 484 m.
= 484 m.
(D) Si la combustión del ATP ocurre en condiciones no estándar, entonces con las concentraciones
dadas tenemos que
ΔG = ΔG0 + RT ln([ADP][Pi]/[ATP]) = -9.868 kJ/mol + 8.31 10-3 kJ K-1 mol-1 × 298 × ln (10-3 / 2) =
-28.69 kJ/mol
Esto corresponde a .869 ×107 J para 1000 moles de ATP. Repitiendo el cálculo anterior, se obtiene
que la altura máxima sería 1409 m en estas condiciones.
Faplicada = xv, ====> meg = xv ====> v = meg/ x =3.45·10-8 m/s =34.5 nm/s
b) Con esta velocidad, la bacteria tardaría en recorrer la longitud del vial un tiempo
En este tiempo, la distancia recorrida mediante movimiento Browniano puede estimarse como
r ~ (6Dt)0.5 = 0.0026m
c) Si la partícula fuera una esfera, según la ecuación de Stokes tendríamos x= 6phR. Igualando al
valor obtenido antes, llegamos a
Sea el siguiente mecanismo de reacción enzimática EA + S <==> EAS == > E+A+P, con
constantes de velocidad k1, k-1 and k2 para formación reversible de EAS y para la segunda
reacción respectivamente. Para que esta reacción ocurra, la enzima debe ser activada
previamente por un activador. Esta activación ocurre en la reacción reversible E+A <==>
EA (constantes de la reacción hacia la derecha y hacia la izquierda k A y k-A
respectivamente). Suponiendo que el proceso de activación es mucho más rápido que el
resto de los procesos (k A y k-A >> k1, k-1 y k2), y que k2 >> k1 y k-1, calcula la velocidad de
formación de P como función de las constantes de velocidad del problema, la
concentración de sustrato [S], la concentración total de enzima [E] 0 y la concentración del
activador libre [A]
d [EAS ]
=k 1 [EA ][S ]−k−1 [EAS ]−k 2 [EAS ]=0 (2)
dt
reordenando
KA[A]
[EA ]= ( E −[EAS])
1+ K A [ A] 0
sustituyendo en (2)
K A[ A ]
k 1 [S ]( ( E −[EAS ]))−k −1 [EAS ]−k 2 [ EAS]=0
1+ K A [ A ] 0
K A [ A]
definiendo γ= y despejando llegamos a
1+ K A [ A ]
γ k 1 [S][E 0 ] [S ][ E0 ]
[EAS]= =
γ k 1 [S ]+k −1 + k 2 [S]+ K ' M
d [P] k 2 [S ][ E0 ]
=k 2 [ EAS ]=
dt [S ]+ K ' M
E26. Febrero 2019. Tema 5 y 7.
Sabiendo que la variación de la energía libre de Gibbs para las siguientes reacciones a
25ºC y en el estándar bioquímico son
N2 + 3 H2 → 2NH3 -16 kJ (2)
ATP → ADP + Pi -30.5 kJ (3)
H+ + e- → 1/2 H2 +40.4 kJ (4)
(a) Es fácil comprobar que reacción (1) = (2) + 16 × (3) + 8 × (4). Conociendo el cambio
de energía libre en el estándar bioquímico de las otras reacciones podemos calcularlo
para la reacción (1) aplicando la ley de Hess
(b) Asi que como ΔG = -nFV, se obtiene que V= 0 0.23 V (n=8 electrones)
(d) Mirando la tabla, y sabiendo que el potencial total (suma del de oxidación y reducción)
debe ser positivo para que la reacción sea favorable, teniendo en cuenta que los
potenciales se dan en el sentido de la reducción, y al estar buscando una reacción de
oxidación debemos darle la vuelta a las reacciones de la tabla y cambiar el signo de los
potenciales, el potencial neto resultante será positivo en todos los casos. Por tanto todas
las especies reductoras de la tabla serían adecuadas para que la reacción fuera
favorable.
Uno de los problemas a los que se tienen que enfrentar los buceadores es el incremento
de la cantidad de nitrógeno en sangre cuando se sumergen (mal de Caisson). (a) Estimar
la molaridad del nitrógeno en la sangre a nivel del mar y a 100 metros de profundidad. (b)
¿Cuantos litros de nitrógeno en fase gas a condiciones normales (1 atm y 25ºC) pueden
ser disueltos en 1 litro de sangre en ambos casos? (c) Sabiendo que entalpía de
disolución del N2 en agua es -10.3 kJ/mol, estimar la constante de Henry a -10ºC. Datos:
Constante de Henry para el N2 en agua a 25ºC KH = 1600 atm L mol-1, fracción molar del
N2 en aire 78%. 1 atm =101325 Pa. Ayuda: La presión atmosférica aumenta 1 atm por
cada 10 m de inmersión.
(a) Vamos a calcular la presión a 100 metros de profundidad. A nivel del mar la presión es 1
atmósfera. Como bajamos 100 m, a esa profundidad será 11 atmósferas (aumento de 1 atm por 10
metros de profundidad)
(Esto se puede estimar con más precisión por la formula hidroestática
P =P 0 + ρ g h=101325 Pa+ 1000 kg / m3×9.8m/ s 2 ×100 m=1081500 Pa≈10.7 atm. )
Podemos calcular ahora la presión parcial de nitrógeno en cada caso. Sabiendo que la fracción molar
es xN2 = 0.78 y empleando la ley de Dalton (Pi = xiPtotal), las presiones parciales serán a nivel del
mar y a 100 metros de profundidad 0.78 atm y 8.58 atm, respectivamente.
La concentración en sangre podemos calcularla usando la Ley de Henry, asumiendo que la constante
de Henry es igual para agua y sangre:
(b) Using the ideal gas law, it is straightforward to predict that 0.012 and 0.131 liters of normal
nitrogen would be dissolved in 1 liter of blood at the surface and under water at 100 meters deep,
respectively.
(c) Para estimar la dependencia de la constante de Henry con la temperatura debemos fijarnos que
esta constante, con las unidades dadas, es equivalente a la inversa de la constante de equilibrio de
esta reacción
N2 (g) → N2(aq) K = aN2(aq)/aN2(g) = [N2](aq)/PN2 ( = 1/KH)
Podemos aplicar la ecuacción de van't Hoff's para ver el cambio con la temperatura de esta
constante de equilibrio
K2 Δ H R 1 1 K 2 −10300 J /mol 1 1 K2
ln
K1
=
( −
R T1 T2 ) → ln = ( −
K 1 8.31 J K −1 mol−1 298 263 ) →
K1
=1.74
Es decir, la constante de equilibrio es 1.74 veces mayor a 10ºC que a 25ºC. Esto es lógico
puesto que la reacción es exotérmica, y al enfriar favorecemos la reacción. La constante
de Henry será por tanto 1.74 veces inferior a 10ºC. Es decir, KH(10ºC)=929 atm L mol-1.
La descomposición del N2O5 transcurre según la reacción N2O5 ==> 2NO2 + 1/2O2 . La
velocidad de reacción encontrada experimentalmente es de primer orden en la
concentración de N2O5. Para los siguientes tres mecanismos de reacción y basándose en
la información proporcionada. Calcular en cada caso la velocidad de la reacción global,
indicando la relación de la constante de velocidad de la reacción global con las de las
reacciones elementales. Justifica la aproximaciones utilizadas. Indicar que mecanismos
son coherentes con la información experimental proporcionada.
Mecanismo 1
Mecanismo 2
Mecanismo 3
2 N2O5 ==> 4NO2 + O2 k1
Mecanismo 1
Por equilibrio en la primera reacción
Mecanismo 3
d(NO2)/dt = 4 k1 (N2O5)² ==> k = 2k1
No es coherente con observación experimental por ser una reacción de segundo
orden
(A) Asumiendo que el gas es ideal, y teniendo en cuenta las condiciones iniciales y finales
V1 = nRT/P = 4 ·103 mol × 0.082 atm.L mol-1 K-1 × 353 K / 10 = 11.6·103 L =11.6 m3
V2 = nRT/P =4 ·103 mol × 0.082 atm.L mol-1 K-1 × 298 K / 1 = 97.8·103 L = 97.8 m3
(B)
(B1) La presión del punto intermedio (final de la isocora y principio) de la isoterma será el
correspondiente a un estado de V=V1= 11.6·103 L y T=298K
Pi= nRT/V = 4 ·103 mol × 0.082 atm.L mol-1 K-1 × 298 K / 11.6·103= 8.42 atm
En el primer tramo (la isocora), no se realiza trabajo. En el segundo tramo (la isoterma)
V f
V2 3 97.8 3
W =−∫ P ext dV =−nRT ln ( )=−4 ·10 ·8.31 · 298 ln ( )=−21.12 ·10 kJ
Vi
V1 11.6
(B2) La presión del punto intermedio (final de la isocora y principio) de la isoterma será el
correspondiente a un estado de V=V1= 97.8·103 L y T=353K
Pi= nRT/V = 4 ·103 mol × 0.082 atm.L mol-1 K-1 × 353 K /97.8·103 = 1.18 atm
En el segundo tramo (la isocora), no se realiza trabajo. En el primer tramo (la isoterma)
V f
V2 97.8
W =−∫ P ext dV =−nRT ln ( )=−4 ·103 ·8.31 · 353 ln( )=−25.02· 103 kJ
Vi
V1 11.6
(C)
(D) Se nos pide el cambio de entropía de los alrededores (no del sistema). Para los
alrededores siempre podemos suponer que el proceso es cuasiestático e isotermo (en
este caso a T=298 K). Por tanto
−Q sistema
Δ S=
T alrededores
ΔU = Q+W → Q = ΔU – W
Con lo calculado hasta ahora se obtiene que, para los 120 kg de biogas
Y por tanto el cambio de entropía será -0.077·103 kJ/K and -0.064·103 kJ/K para los
caminos B1 y B2, respectivamente
E30. Julio 2019. Tema 5
(A) Calcular para ambas reacciones el cambio de energía libre en el estándar bioquímico.
Discutir cual de las dos vías es más eficiente para que las células obtengan energía.
Supongamos ahora una disolución con concentración 2 mM de lactato, 10-5 M de CO2. , y
condiciones débilmente básicas (pH=7.8) (B) Calcular el cambio de energía libre para
ambas reacciones en las condiciones de la disolución indicada, dejando si fuera preciso el
resultado en función de las concentraciones de glucosa y de oxígeno. (C) Determinar para
que concentraciones de oxigeno en disolución será dominante la reacción (1) sobre la
reacción (2). Datos: Energías libres de formación en estándar bioquímico. DG’f(glucosa) = -
426,71 kJ/mol, DG’f (lactato) = -313,70 kJ/mol, DG’f (CO2 aq,) = -386,2 kJ/mol, DG’f (O2 aq) =
16,40 kJ/mol, DG’f (H2O aq) = -237,2 kJ/mol, DG’f (H+) = 0 kJ/mol. T=25ºC
De las energías libres de formación podemos calcular las energías de ambas reacciones en
condiciones del estándar bioquímico aplicando ley de Hess
DG’1 = 6·DG’f (CO2 aq,)+ 6 DG’f (H2O aq) – DG’f(glucosa)-6 DG’f (O2 aq) = -6· 386,2- 6· 237,2+
426,71-6· 16,40 = - 3412,09 kJ/mol
Para la segunda reacción, teniendo en cuenta que la energía libre de formación de protones en este
estándar es 0
En otras condiciones distintas de las del estándar, las energías libres serían
La reacción más favorable será aquella que tenga una variación de energía libre mayor. Igualando
ambas para encontrar el caso límite
Simplificando
a pH=7.8
No debe haber prácticamente oxígeno para que la segunda reacción sea dominante.
A+ X => 2X k1
X+ Y => 2Y k2
Y => B k3
d[X]
=k 1 [ A] [X ]−k 2 [X ][Y ]
dt
d [Y ]
=k 2 [Y ][ X ]−k 3 [Y ]
dt
d[A]
=−k 1 [ A][X ]
dt
d [B]
=k 3 [Y ]
dt
(i) Una situación en la que se podría cumplir la condición de estado estacionario sería si los
procesos de destrucción de los intermedios fueran más rápidos que los de creacción. De esta forma
se tendrían concentraciones de X e Y pequeñas y constantes a lo largo del tiempo. Esta condición se
cumplirá si k3 > k2 >k1.
d[X] k1
=k 1 [ A] [X ]−k 2 [X ][Y ]=0 →[Y ]= [ A ]
dt k2
d [Y ] k3
=k 2 [Y ][ X ]−k 3 [Y ]=0→[ X ]=
dt k2
d[A] k1 k3 d [B] k 1 k 3
=− [ A] = [A]
dt k2 dt k2
Por tanto, en estas condiciones, la reacción global será de primer orden, con una constante global
k = k1k3/k2
[A] = [A]0·exp(-k·t)