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Los comúnmente conocidos como vertebrados son cordados con cráneo o sus vestigios. No
todos presentan vértebras sustituyendo a la corda (mixines), por lo que serían un grupo
parafilético. Por este motivo, habría que llamarlos craneados. Existen diversas teorías sobre
el origen de los vertebrados, entre las que se pueden destacar las siguientes:
- Hipótesis de Garstang: propuso la relación evolutiva entre las ascidias y todos los demás
cordados a través de un proceso denominada pedamorfosis, es decir, el desarrollo completo
del gónadas y habilidades reproductivas en un cuerpo esencialmente juvenil. (Descartada
por análisis moleculares)
- Hipótesis de Jefferies: también conocida como la hipótesis de los calcicordados. A
diferencia de muchos otros autores, este interpretó a los carpoideos (Homalozoos) como el
grupo basal de equinodermos, cefalocordados, tunicados y vertebrados. (Descartada debido
a múltiples suposiciones erróneas)
- Existen un gran número de evidencias que apoyan la hipótesis de los cefalocordados
como origen de los craneados. Entre ellas podemos destacar el registro fósil, en el que
encontramos animales como Pikaia gracilens, del Cámbrico medio de Burgess Shale, y
Haikouella y Haikouichthys del Cámbrico inferior de Chengjiang y Haikou (China), que
pueden ser interpretados como formas evolucionadas de cefalocordados o formas primitivas
de vertebrados, según distintos estudios.
Todas estas características permiten una mayor capacidad locomotora, mayor facilidad a la
hora de alimentarse (bombeo faríngeo) y un intercambio de gases de elevada eficiencia.
Esta mayor eficiencia general, conduce a los craneados a un aumento progresivo del
tamaño.