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Reporte 3 – DNA Fingerprinting

Parte 1

Se ha recuperado cuatro colmillos de elefante, y se cree que pueden pertenecer a uno de los 10
elefantes encontrados muertos sin sus colmillos (del Caso 1). Los genotipos de los 4 colmillos
recuperados para 5 STRs está en la Tabla 1. En la Tabla 2 están los genotipos de los mismos 5 loci de los
10 elefantes muertos.

Tabla 1. Genotipo de los cinco STRs del colmillo recuperado

Locus FH19 FH60 FH67 FH71 FH129


Colmillo A 193 147 97 62 152
193 147 103 62 160
Colmillo B 189 147 95 62 152
193 147 105 62 156
Colmillo C 187 145 91 62 152
193 147 97 64 154
Colmillo D 193 147 91 62 152
193 147 105 64 152

Tabla 2. Genotipo de los cinco STRs de los 10 elefantes muertos

Locus FH19 FH60 FH67 FH71 FH129


Elefante 1 189 147 97 62 152
193 147 97 64 154
Elefante 2 185 147 95 62 152
193 147 103 62 152
Elefante 3 193 147 91 62 152
193 147 105 64 152
Elefante 4 187 145 95 62 152
187 147 95 64 160
Elefante 5 187 145 91 64 152
193 147 97 64 160
Elefante 6 193 147 97 62 152
193 147 103 62 160
Elefante 7 193 149 97 60 156
193 151 97 62 160
Elefante 8 183 147 95 62 152
185 147 97 64 162
Elefante 9 193 147 97 62 160
193 147 97 62 160
Elefante 10 189 147 95 62 152
193 147 105 62 156
1. ¿Los colmillos encontrados pertenecen a alguno de los elefantes muertos? ¿A cuál?

Colmillo ¿Pertenece a uno de los 10 ¿Cuál?


elefantes?
A
B

C
D

2. Se corrió un gel del fingerprint de dos colmillos. Identificar a qué Colmillo corresponde cada
patrón de bandas:

Patrón Colmillo
i

ii
3. Para esta pregunta, se analizará el Colmillo D.
a. Completar la Tabla 3 con la frecuencia de cada alelo del Colmillo D genotipado usando
los datos de la Tabla 2.

Ej. Locus FH19 es homocigoto en el Colmillo D, tiene dos copias del alelo 193. En la Tabla 2, 12 de los 20
alelos son de 193bp. En la tabla está resuelta la frecuencia del alelo presente en el locus. Completar la
tabla 3 según el ejemplo.

Tabla 3. Frecuencias alélicas del Colmillo D en 5 loci

Locus FH19 FH60 FH67 FH71 FH129


Nº de copias del alelo 1 12
(Tabla 2)
Total número de alelos 20
(Tabla 2)
Frecuencia alelo 1 (12/20)=0.60

Nº de copias del alelo 2 12


(Tabla 2)
Total número de alelos 20
(Tabla 2)
Frecuencia alelo 2 (12/20)=0.60

b. Usar las fórmulas para calcular la probabilidad de que otro individuo tenga el mismo
genotipo en cada loci individual. Llenar en la Tabla 4.

Si la muestra de Colmillo D es homocigota en el locus, la P probabilidad de que otro individuo tenga el


mismo genotipo en el locus es:

P=(frecuencia de alelo 1)2

Si la muestra de Colmillo D es heterocigoto en el locus, la P probabilidad de que otro individuo tenga el


mismo genotipo en el locus es:

P=2 x (frecuencia alelo 1) x (frecuencia alelo 2)

Tabla 4. Probabilidad de que otro elefante de la misma población tenga el mismo genotipo en cada
locus individual basado en frecuencias alélicas de Tabla 3

Locus FH19 FH60 FH67 FH71 FH129


Fórmula reemplazada (0.60) 2
con frecuencias alélicas
Probabilidad 0.36
c. Determinar la probabilidad de que otro individuo tenga el mismo genotipo en cada
uno de los 5 loci (el mismo fingerprint). Para ello, multiplicar todas las probabilidades
individuales de la Tabla 4.

¿Cuál es la probabilidad? ______________

4. Se colecta 30 muestras más de elefantes y ahora se tiene los datos de frecuencia alélica
basado en 80 alelos en 16 loci STRs (en lugar de 5).

Tabla 5. Tamaño de alelo y frecuencia para 16 loci STR en una muestra de 40 elefantes.

Locus FH19 FH60 FH67 FH71 FH129 FH39 FH40 Fh48


Alelo 1 193 147 91 62 152 239 242 170
Frecuencia 0.28 0.66 0.36 0.51 0.39 0.31 0.68 0.05
Alelo 2 193 147 105 64 152 243 242 172
Frecuencia 0.28 0.66 0.10 0.20 0.39 0.41 0.68 0.38
Locus FH94 FH102 FH103 FH126 FH127 FH153 S03 S04
Alelo 1 225 177 149 94 247 169 141 154
Frecuencia 0.65 0.64 0.13 0.18 0.04 0.011 0.55 0.8
Alelo 2 225 181 151 110 247 171 143 154
Frecuencia 0.65 0.14 0.61 0.11 0.04 0.08 0.39 0.8

a. Comparar las frecuencias alélicas para los loci FH19, FH60, FH67, FH71 y FH129 que
completaste en la Tabla 3 con los valores de la Tabla 5. ¿Por qué los valores son
distintos?

b. Calcular la probabilidad de que otro individuo no emparentado tenga el mimso


genotipo en los 16 loci STR usando el mismo procedimiento que la pregunta 3.c.

5. ¿Es suficiente usar 16 loci STR para asegurar que no se trata de otro individuo de la población?
Justificar la respuesta.
Parte 2

Se encontró nuevamente tres colmillos de elefante siendo transportados ilegalmente. Se quiere


determinar de qué población se originó cada colmillo. Se cree que los colmillos se originaron de
elefantes de Tanzanía, Camerún o Zambia. Se genotipó los colmillos con cuatro loci y se obtuvo lo
siguiente:

Tabla 6. Genotipado de 3 colmillos con cuatro loci STR

Colmillo FH39 FH67 FH103 FH129


Colmillo 1 239 95 145 144
241 95 151 160
Colmillo 2 239 97 151 154
241 97 153 160
Colmillo 3 243 95 147 152
249 97 151 160

Adicional, se tiene la frecuencia alélica de los distintos loci de las tres regiones en la siguiente figura:

Figura 1. Comparación de las frecuencias alélicas de los elefantes de Tanzanía, Zambia y Camerún
6. Según el genotipado y la figura, ¿de qué países africano proviene cada colmillo encontrado?
Explicar el razonamiento.

ANEXOS FOTOS:

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