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Descubrimiento de Viernes

antibióticos 16 de abril de 2021


mediante 16:30h (hora española)
computación.
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centro:

Dr. Cesar de la
Fuente
Presidential Assistant
Professor at UPenn

Ciclo de webinars
‘Sabiduría juvenil. Una
salud: pandemias y cambio
climático’.

Con el apoyo del Centro de Supercomputación de Galicia (CESGA)


Dr. Cesar de la
Fuente
Presidential Assistant
Professor at UPenn
@delafuenteupenn

/cesardelafuentenunez/
Resumen

Las máquinas tienen el potencial de superar a los humanos y revolucionar nuestro mundo. En esta
charla, describiré nuestros esfuerzos por utilizar máquinas para desarrollar enfoques computacionales
para el descubrimiento de antibióticos, así como diagnósticos rápidos de bajo coste. Los ordenadores
ya se pueden programar para el reconocimiento de patrones sobrehumanos de imágenes y texto. Para
que las máquinas descubran nuevos antibióticos, primero deben capacitarse para clasificar las
diferentes características de las moléculas y determinar qué propiedades deben retenerse, suprimirse o
mejorarse para optimizar la actividad antimicrobiana. Dicho de otra forma, las máquinas deben poder
comprender, leer, escribir y, finalmente, crear nuevas moléculas. Discutiré cómo entrenamos un
ordenador para ejecutar una función de aptitud siguiendo un algoritmo darwiniano de evolución para
seleccionar estructuras moleculares que interactúan con las membranas bacterianas, produciendo los
primeros antimicrobianos artificiales que matan bacterias tanto in vitro como en modelos animales
relevantes. Mi laboratorio también ha desarrollado algoritmos de reconocimiento de patrones para
extraer el proteoma humano, identificando en todo el cuerpo miles de antibióticos codificados en
proteínas con función biológica no relacionada, y ha aplicado herramientas computacionales para
reprogramar con éxito venenos en nuevos antimicrobianos. También describiré el desarrollo de
biosensores de diagnóstico para COVID-19, lo que demostrará aún más el emocionante potencial de la
bioinformática. Los diseños e innovaciones generados mediante ordenadores en la intersección entre
las máquinas y la biología pueden ayudar a reponer nuestro arsenal de medicamentos efectivos y
generar diagnósticos novedosos, proporcionando soluciones necesarias a los problemas de salud
globales causados por enfermedades infecciosas.

Con el apoyo del Centro de Supercomputación de Galicia (CESGA)


Dr. Cesar de la
Fuente
Presidential Assistant
Professor at UPenn
@delafuenteupenn

/cesardelafuentenunez/

Biografía

César de la Fuente es profesor asistente presidencial en la Universidad de Pensilvania, donde lidera el Machine
Biology Group, cuyo objetivo es combinar el poder de las máquinas y la biología para estudiar, prevenir, diagnosticar
y tratar enfermedades infecciosas. Las áreas de aplicación actuales en su laboratorio incluyen el desarrollo de
enfoques novedosos para el descubrimiento de antibióticos, la construcción de herramientas para la ingeniería de
microbiomas y la creación de diagnósticos de bajo costo. Específicamente, fue pionero en el desarrollo del primer
antibiótico diseñado por una computadora con eficacia en animales. Diseñó algoritmos de reconocimiento de
patrones para el descubrimiento de antibióticos, reprogramó con éxito venenos en nuevos antimicrobianos, creó
nuevos materiales antimicrobianos a prueba de resistencia e inventó diagnósticos rápidos de bajo costo para COVID-
19 y otras enfermedades infecciosas. De la Fuente es un investigador NIH MIRA, un joven investigador de BBRF, y ha
recibido reconocimiento y financiación para la investigación de muchos otros grupos. El profesor de la Fuente fue
reconocido por MIT Technology Review en 2019 como uno de los principales innovadores del mundo por "digitalizar
la evolución para fabricar mejores antibióticos". Fue seleccionado como el receptor inaugural del Premio Langer
(2019), Líder emergente en Química de ACS Kavli (2020), y recibió el Premio Nemirovsky (2020), el Premio AIChE’s
35 Under 35 (2020) y el ACS Infectious Diseases Young Investigator Award (2020). Además, fue nombrado Boston
Latino 30 Under 30, Wunderkind de 2018 por STAT News, Top 10 Under 40 de 2019 por GEN, Top 10 MIT Technology
Review Innovator Under 35 (España), 30 Líderes emergentes en las ciencias biológicas y recibió el Premio al Joven
Investigador de la Sociedad de Ingenieros Profesionales Hispanos de 2019, además del Premio al Joven Innovador en
Bioingeniería Celular y Molecular 2021 y el Premio a la Estrella Rising Star de la Sociedad de Ingeniería Biomédica
2021 (BMES). Sus descubrimientos científicos han producido más de 85 publicaciones revisadas por pares, incluidos
artículos en Nature Communications, PNAS, ACS Nano, Cell, Nature Communications Biology, and multiple patents.

Con el apoyo del Centro de Supercomputación de Galicia (CESGA)


Dr. Cesar de la
Fuente
Presidential Assistant
Professor at UPenn
@delafuenteupenn

/cesardelafuentenunez/

Dr. Cesar de la Fuente

Presidential Assistant Professor at UPenn

Leader, Machine Biology Group

Institute for Biomedical Informatics

Institute for Translational Medicine and Therapeutics

Penn Institute for Computational Science

Depts. of Bioengineering and Chemical & Biomolecular Engineering, School of Engineering and Applied
Science

Depts. of Microbiology and Psychiatry, Perelman School of Medicine

University of Pennsylvania

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