CURSO:

ECOLOGÍA DE
COMUNIDADES
MARINAS
CARRERA DE BIOLOGÍA MARINA
2020-II
• MODULO 04 –
VARIABILIDAD DE LAS
COMUNIDADES MARINAS

SEMANA 10
 PRÁCTICA 08:
ANÁLISIS COMUNITARIO
METODO DE CLASIFICACION
MÉTODO DE CLASIFICACIÓN
Que aprenderemos hoy?
- Análisis de clasificación multivariada: combinación
de análisis aglomeración (CLUSTER) y ordenamiento
(Escalamiento multidimensional no métrico - nMDS)

Ekofisk oilfield macrofauna Ekofisk oilfield macrofauna

Transform: Square root
Group average Resemblance: S17 Bray Curtis similarity
Transform: Square root
Resemblance: S17 Bray Curtis similarity 2D Stress: 0.11 Dist
20 D
Dist
D C
S37
C B
A
B
40
A
S10 S16
S29 S17
Similarity

60 S11 S20
S18 S7 S6
S2
S32 S4 S21 S1
S30 S24 S19
S31 S3 S33S27 S8S13
S36 S26
S23
S25 S9 S28 S5
80 S38S34 S22 S14
S39
S35 S15
S12

100
S1
S5
S21
S20
S7
S6
S11
S10
S17
S16
S36
S31
S35
S25
S3
S38
S29
S12
S15
S14
S39
S13
S18
S8
S2
S19
S32
S28
S34
S27
S26
S23
S22
S9
S4
S33
S24
S30
S37
Samples

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MÉTODO DE CLASIFICACIÓN

y √y

La transformación de los datos tiene como

objetivo reducir la sobredimensionalidad
de las diferencias entre los datos y facilitar
las comparaciones y detección de
patrones en la matriz.

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SEMEJANZA ECOLÓGICA
Cuan similares son estos objetos?
Objeto 1 Objeto 2 Iguales: 6
Atributo 1 1 0  Diferentes: 4
Atributo 2 0 1 
Atributo 3 0 0  6
Atributo 4 1 1  S  0.6
Atributo 5 1 1  64
Atributo 6 0 0 
Atributo 7 0 1 
Atributo 8 0 0 
Atributo 9 1 1 
Atributo 10 1 0 

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SEMEJANZA ECOLÓGICA
Cuan similares son estos objetos?
Tratando a los Ceros como no informativos
Objeto 1 Objeto 2
Compartidos: 3
No compartidos: 4
Atributo 1 1 0 
Atributo 2 0 1  “Indeterminados”: 3
Atributo 3 0 0 ?
Atributo 4 1 1  3
Atributo 5 1 1  S  0.43
Atributo 6 0 0 ? 3 4
Atributo 7 0 1 
Atributo 8 0 0 ?
Atributo 9 1 1 
Atributo 10 1 0 
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MEDICIÓN DE LA SIMILITUD
Coeficiente de Bray-Curtis (Bray & Curtis, 1957)
Desarrollado primeramente en ecología terrestre

Donde:
yij representa la abundancia de la especie i en la muestra j,
yik representa la abundancia de la especie i en la muestra k, y
n representa el número total de muestras.

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MEDICIÓN DE LA SIMILITUD

donde, yij representa la abundancia de la specie i en la muestra j, yik representa la

abundancia de la especie i en la muestra k, y n representa el número total de muestras.
Calcular la similitud de Bray-Curtis Similarity entre las muestras:
•X2 y X3
•X3 y Y1

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MEDICIÓN DE LA SIMILITUD

SX2 X3 = 100 1 - { 3+0+0+2+8

11+0+0+14+58
} = 84
SX3 Y1 = 100 1 - { 0+6+8+2+30
14+6+8+10+36
} = 38
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MEDICIÓN DE LA SIMILITUD
Indice de sobreposición de Pianka (Pianka, 1973)

Donde:
pij representa la abundancia de la especie i en la muestra j,
pik representa la abundancia de la especie i en la muestra k, y
n representa el número total de muestras.

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REPRESENTACIÓN GRÁFICA DE LA CLASIFICACIÓN
CLUSTER NMDS (MDS)
Dendrograma Plano ortogonal (factorial)

Ekofisk oilfield macrofauna Ekofisk oilfield macrofauna

Transform: Square root
Group average Resemblance: S17 Bray Curtis similarity
Transform: Square root
Resemblance: S17 Bray Curtis similarity 2D Stress: 0.11 Dist
20 D
Dist
D C
S37
C B
A
B
40
A
S10 S16
S29 S17
Similarity

60 S11 S20
S18 S7 S6
S2
S32 S4 S21 S1
S30 S24 S19
S31 S3 S33S27 S8S13
S36 S26
S23
S25 S9 S28 S5
80 S38S34 S22 S14
S39
S35 S15
S12

100
S1
S5
S21
S20
S7
S6
S11
S10
S17
S16
S36
S31
S35
S25
S3
S38
S29
S12
S15
S14
S39
S13
S18
S8
S2
S19
S32
S28
S34
S27
S26
S23
S22
S9
S4
S33
S24
S30
S37
Samples

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