Maritza Guadalupe Verdugo Molinares Bioquímica.

09/09/2021
Lizbeth Monserrat Coria Hinojosa Artículo de Termodinámica
Vicente Paul Armenta Pérez
Ricardo Ceballos Salazar

¿Cuál es el oligómero de ADN más estable

termodinámicamente, el dúplex o el mismatch?¿Por qué?
A partir de la información presentada en el artículo podemos determinar que el
ADN dúplex tienen mayor estabilidad en comparación de sus análogos con
mismatch en las condiciones evaluadas (baja y alta osmolaridad) dado que tienen
una energía de Gibss negativa mayor, lo cual se debe a que tras realizar las
mutaciones (mismatches), se pierden los puentes de hidrógeno que confieren
estabilidad al dúplex.
Por su lado, los dúplex cuentan con mayor presencia de puentes de hidrógeno. Por
ejemplo, los enlaces entre estos pares de bases presentan uniones más fuertes por
medio de 3 puentes de hidrógeno, los cuales favorecen una unión más estable.
Como se observa a continuación, el orden de estabilización es el siguiente TA a TG
< AT a AC = GC a GT < CG a CA. Por ende, el cambio de G a A es el más inestable
ya que ocasiona que se pierdan dos puentes de hidrógeno mientras que el cambio
de T a C y C a T ocasione que se pierda uno. Además, de los oligómeros dúplex, el
número X romano tiene más nucleótidos de Guanina y Citosina al tener la
secuencia 5 -(5meCG)-GCCG-ACTG-3. Los cuales, como se mencionó
anteriormente, confieren a la molécula una mayor estabilidad en diferentes medios
o concentraciones.
Además de eso, la posición en la que se realizó el mismatch también contribuye a la
desestabilización de la molécula, principalmente en los sitios 10 y 11.
Fuente:
Sheardy, R. D. (2021). Investigating the thermodynamics of conformational
transitions in DNA oligomers. The Journal of Chemical Thermodynamics,
158, 106442. doi:10.1016/j.jct.2021.106442